TCONS_00072973 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00072973
Unique NameTCONS_00072973
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1373

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00072973 ID=TCONS_00072973|Name=TCONS_00072973|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1373bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_86:1391780..1399008+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00072973 ID=TCONS_00072973|Name=TCONS_00072973|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7229bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1391780..1399008+ (Clytia hemisphaerica)
TGACGACAAGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAGGATA TACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGATGGGA TTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAAAAAC CGATACCGTGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaagttattctaaat tTCTTCAACGCGTTGTGACCGTTAAACTTCGTTCCTGCGTTGGATATTAT AATTACGAGCAGCTTTGTTTTTATCCAGATGttggttttcttcttcataC AATCGAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTATCGACCTTTATG GTTATCACATTATTAATTGGTTTGAAAAGAACCGGAACAACATTGAATTG TGTATGGATCTTAAACCCTCTCCTGATTTAAGTCTGACGTGTGCCAGTGA ATTTAGATTTCTAAGTTATCACAACCATAATATCATTGGAAACAATATAA AACTTATCATTTCAGCATTTTCTCAACGAACAGTTGATGAAGCTAACGGC CCTTCACTCGTATCATATCGATGtttatgtttggattttttAAACATCGA GCTACATCaaataaagcaagaaaaaagaCTGGTAATAGAATTAGACAGAC CGttggaaaattcttttgtttttcgatATTTTACCAAGCATAAGATCTAT TTTGAAAGGATCGATAACAAACACAATACCATTAAGTCAACAATCTTAGA ATATGATTACTCGGGTAAATTTTTATATTCATATTCCATTGATTATTCCG ATTCATTTGTAAAGCATTTCGAATGTATTAGAAATTCAAacttaatattt ttatatttttaccccAGAAAAACTAAACCTGAGGATCTTGAAATACGAGT TATGAAATTGGAAAGAGGTAAAGCTGAGATTGTTAAAGaagttaaaaata 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045263XLOC_045263Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1391780..1393120TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1391780..1393120Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1391780..1393120TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1391780..1393120Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1398977..1399008TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1398977..1399008Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1398977..1399008TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1398977..1399008Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_86supercontigscaffold_86:1391780..1399008 +
Expression
No biomaterial libraries express this feature.
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00072973 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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