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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072973 ID=TCONS_00072973|Name=TCONS_00072973|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1373bp
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ctatttgggaattgaaaagtgaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1391780..1399008+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072973 ID=TCONS_00072973|Name=TCONS_00072973|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7229bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1391780..1399008+ (Clytia hemisphaerica)
TGACGACAAGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAGGATA
TACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGATGGGA
TTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAAAAAC
CGATACCGTGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaagttattctaaat
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gtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagt
tttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGA
TATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGA
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TTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgac
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TTGACtatttggaaattgaaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggat
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ATTCAAGCTGTTTCCTTGAATTGGAACAACGAAGAAATTGCAATAATGAT
TTCTTTAAACGATGAGGAATATCTATTTGGCTTGGGAATGAAAAGTGAAA
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GTTCTTCCACACTGGTAAATATTATTTGATCCTacaagaagaaaaggaag
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CACAGTCGAATAATTATCAGCTTACCAAAAACTGAACTAGATGGTCACcg
agaaaatgttttcaattcaACCAGTGGTGTATTGGTTCATATCATACAAA
CATACCCAACAAACGAACGTCATGAAACTGTAATGGATCTTTATAATTAC
AACATTGTTGATCTTTTTGACGAGCTTAATggcaaagatttaaaaattcc
TGAATCAACTGAACCAGAATCACCACCAAGAACACCAACATTTTATAATC
CTGAGGATTTTTCAGAACCCCAAAATTCACCAGATCTATCTTTTATGGCT
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ACCTACATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAATCACAAAGTCAAAATCTAA
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TTGCAGCATCATGattcaaaaattgatgacgaAGCATCCACTCCAGATCT
GTCTTTGACATATGATCAATTATTCAACTCGATAACTTGTAAATATGCAG
AATTTCTTGGCCACGAGAATCCCACTTTACTTATAAGCAGTTATTTTACT
AAGTATTATGAGAGTAACCAGGACGAGAAATACAACTATCTGGATTTTAT
CAAGATACAAAAAGATCAACTTTGTCACGAGAGAAGATTGGTTATAGATT
TCGAAACCGCTGGTGGATCAGTATTTGCGAGAAGGGAATATACTaaggac
aaaatatttttctttaaaaggtcttATATTGAAGATAGTGAAGATATGAT
AAACCTAAAGATCATTGAATGTGATTATTCCGGTAATTTCTTATATTCGT
ATGATTTGGAATACATTGAATCGTGGATGTTGTTTAATGTTGTTGATCTT
AAACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGCTATGGCGAATTAGAGGA
CCTTGAATTAAGAGCTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCGTTTGTCaataa
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GGAAGGGACTTCAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGATCGCCTTGT
TATGCCACTTTACTGTGCCACAAAGGATGTATTTCACCCTGAATTTTACA
TGGCAATTGATTTATCTACTATAGAAGTTGTTCACCAAATTATTTCTCCT
GAAAATTCACATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAAGAAATTGG
GATGACTTTTCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACTTGGACCGT
TATGTTTTAAAATGGCTTGCAATAATATTGAAAGGAAAGAAGAAAtgaaa
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TCGTAAGTTTCGGTTGTTCCCCAGGGGacggggtactacccttgtcgact
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CTAACTTTATTGCTTTCAACTTAGCagttattgtaaaaaaaaaggacATT
GTTTGActatttgggaattgaaaagtgaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1391780..1393120 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1391780..1393120 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1510915933:1391780..1393120 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1510915933:1391780..1393120 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1391780..1393120 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1391780..1393120 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1398977..1399008 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1491911889:1398977..1399008 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1510915933:1398977..1399008 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1510915933:1398977..1399008 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1398977..1399008 | TCONS_00072973-exon-scaffold_86-1575043694:1398977..1399008 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1391780..1399008 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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