TCONS_00070245 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00070245
Unique Name	TCONS_00070245
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1736

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_516:302255..351143-
coding sequence from alignment at scaffold_516:302255..351143-

transcript sequence

>TCONS_00070245 ID=TCONS_00070245|Name=TCONS_00070245|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1736bp
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AAATGACAGAAAGGAAGTTTTTTTATTAACTATGCAAGCAATCAATAGGT
ATAAGGAAAGGACGACAAGAAAACATAGTTGGTGAGTTGTTGGCTATCAT
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CATTCTTCATCGACGTCGTCATTACCAGAACTCGAAGCGTACAGATTTGG
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aagcaaaaagtcttggaattctattcctatcaccttgagttaatagttta
taacaaaaaattaacattacatataaaaattttcgc

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00070245-protein

>TCONS_00070245-protein ID=TCONS_00070245-protein|Name=TCONS_00070245-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=337bp
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MKNKISAQESRRRKKEYVDALELKMKQRDQEKRLLTEKVTELEDRVRQLV
DQLFHAKQNNRENTSSTMTDTEPFVRRRTTDAGTQTGICLECYLQTPSKV
LLTERQIKHETEEEFPSNELTNEKELDPTDCLNHQTSTQTSPYKKTFIDG
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DRDLRQNSMVLPPQATFRRISNASPPSAEKMIPYSKY

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_516:302255..351143-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00070245 ID=TCONS_00070245|Name=TCONS_00070245|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=48889bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_516:302255..351143- (Clytia hemisphaerica)
TTCGAAAAAACGCGGCAGAAATTTTTAAACAGCATGGTTTGCAAATGGAG
AAATGACAGAAAGGAAGTTTTTTTATTAACTATGCAAGCAATCAATAGGT
ATAAGGAAAGGACGACAAGGTATAAATTAAACACTAGTACTTTAACCTTT
TTTATTCCATTTGATTGCATTCATTTTTAGATATTCTGTAGGACACCCAG
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ATTTATTCCCGCCCGAATATCGGGAGTAATTTAACATGCAGAACAATAGG
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CACATATCGTAAGTGGTCCTAAATCTGATGGGGTCTTTCAAAGATACAAA
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TCAACCAAACTGAGAAATTTGATACACTGAACTCAATAACAATAATTCTT
TATTACAAAATTGTCCGAATTGTTAACGTTAAACACAAGCAACGGACTCA
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CAAAATATAATTGAATACAATCAAACGTAATCCAAGCAATTGTACGGCTA
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GAGAAATAAGGAACTGCAGGCTCGGAAACAAGTTAAGGTTATTAATATTG
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CTGATTTGATTTTGCTGCAATGGCAGATTAATGTCTCATACACTCTTTTT
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AATGGAAAACAATAATAAAACGAAGCTGAGCTGGGATAGCTGTTTTTTAG
ACTGACACAGGGTCAAACTACACGCTTTTTTATAAGAACATCCAAAATTT
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CTTAAGAAATTGGCCGTTTTATAGTCCACAAGGCATGTTCTTAACTTTTT
GGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTG
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TTTAATGCTCAAATCGAAACGAGGTATTATAAGAACAACCAAGCCTTGGA
GTTTATTGGTTCTTATAAAGAAAAAGTGTATTTCTAACCAACTAAATTCA
GTTTTGTAATAAAGATACCCTTTTTATTAGAACAATTTTTATAAGAACAA
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TCATCTTGAATTTTGGGCAAGTTAAAGGTATCAAGCCAGAAATAACCTAA
AGTTTGTCTTGAAAATTAGAACAGGATAATACACATAGTTTCCTCCCCTC
TAAATTTAGAGGTCTTCAAATTCTCAGACAACCCTGTAAGGGGGGGGGGT
CAAAAAAGCCTTAATTAATAGGGGAGTTTGGCCTTTAGTGGGGGGTTTGG
TTATATAGTGGGGTTTCAAACTTTTTAACCAATTAAATTTATTATTCAAA
ATTTTATCCCAGGCTTCATGACCTTGGTTTTTAAGAGGGGGTCTGAGAAA
TTTATGTATAGGGGGGTTTGGTCTTTAGGGGGGGGGGGGATTATTATAGA
GGGTTTTGAACCACCCAGGAAACTATGTTACAATTTGAGGATAAAAGTAA
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CATTGATAATTATACATTCATGAAATCGTTAGGCAAATCAATTTTTGAAG
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TCTTTTTGATTTGGTACTTTTCGAAAAGTGAGTTTTGGCTTTTACAAACC
CAGTAGTGTGTCAGTTAAAAATTGACAGCTCTTATTTAAATTACTGTGGG
ACATCTACTAATTATATGAAAATATTTCGAAAGAGAGTTTTTTAGATATA
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AGGGACTTCAAGTTTCTTTGTGGTGTTATTGCCATGAACAATTTAATTTT
GACTTTGATTAAATTGTAAAACCATTATACCCAGTCTGGTATACGGCTAG
ATATACGATTTGCTGTTTATTACATTGACAATTCAGTCCAACTGATTTTA
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TTCTTAACTTTTTGGATTCTAAGCCTAAAAAGTTCTTAACATATTCTTAT
TTTCGCCATTTTTTGAGTACTTTTGCCCATTTTCCTAAGAAATTCGGTAG
TTTAGAGTGCGTAAAGTCTTTAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAACATTTT
GGCTATCGAAGCCTTATGTTCTCATATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTA
TATAGAATAGTAAAACAACAAAAGAAATCCACAACTCCACAAACAAACTA
TAAAAATGCATACGCACCCCGGTTTTGAATTTTTTTTTTTTTCGAAAAAG
GAATCTATGGTTTTATAGATCTGCTACAAGCTCAAAACAAAAATTGATGG
CTAACAAATTACACTAGATCATTATCCTGCCTGCAGGCTACTTATACCAC
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GGTGACTACAATTTTCATTTCCAAATAGTNTATACCACGGTATTTGTTTT
TTTTCTAATTGAAATGTTTACGTCAACGCTTAAAAAGGTGACTACAATTT
TCATTTCGAAATAGTTCCAACTTTCAGAGTTTCTCATCACCCCTCCCACA
ACCTTTAAAAATACTTATCCCCAAAGATTTTGGACAAAAATAGCAAACAA
ATGTATGTGAAATATCTTTAGAGACAGAAAGCAAAAAGCAAAATAATAAA
CTTCTTTCTTCTTTTTGACTCAGACTACTCTAACAGAAAACTTCCTATCA
AGAAGACCAAATTTCATAACGGTGCTTGAAAATAATTTACAATATATATG
TAAGCTCCCCCTCTTAAACCCCCCCCCCCTTCCTTGCTATCCCCCCTTAT
TCATGAAAATTTCTGACACCCCCGTTCTTCATTTTTTCGGAAGGTGTCAT
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TACATGATTGCGTAAATTAATTATCTAATACAGCTCTTAGCTAAATCATG
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TATTACTGTAAAGTAATAGAGTAATTGATTTGATGCCAACATTTGGAAGT
TTTTTCCAATCAATCAGATATCTTGATTATCTAAAACATTAACTTGGTTT
CCTTTTGAAGTTAGGTTTAAATTATTTGTTTTTTAAGACGTAACGGTTTT
TACAGTGCACCTCATTATCTAATACTTTCTTATCTTTACTCCGTTAAAAT
TTATAAGAAAAAATAAGCTAAAAGTGCCGACTATCCCAAACTGTTAATAA
CTAAATCATTTTATTTTCTCTGTAATTGAAGATATCTACTACGCTTAGTT
TCGCTCATTATCTCAACCCCCGGCTGGGAGGGGGTACTAGGGTTGGCAGA
AGACGGGTATGTCTGGACGGAACCTCCTAAAACTAACCTTTAGAGACCAA
ATTTTAGAGAGACATTCTTTCTTCCACACTTAAAGGGACTTTAAATTACA
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ATCTTCTGATTTTTGTAACCCCTAGAGAACCTTTGTAAGGTGAAAAAACC
GAACCTTTTCTTCCGCACATACTCAGCACCAATTTTTGCCTAAGTACCTC
GGGCTCAAACCTTAGTATTTATCATTAAAGAAAGATATACGCAAGAAATT
TCAGTTCTAAGGATTTCAAAATAAATCATTCCGGAAATGATTTTTCAACC
CGCTTCCATAAATCTAACTCAGCAAATTTTAATCCCAGATACATCATAAG
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TAATTTATTCTATCAAGACTAATTAAGAAATTTAATTACAAAAATGACGT
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GAAAAATTGGATCATTAACTTTTTCTGATTTTTTTTGCATGAAAGTAGGG
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AATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTATTTAATGGTCACATCA
CGTAGATATCAATTATATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATA
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ATCTTCCGAAAACCTGTTGTTTTGTTTGGTTAAAGATACACCTTCTGGCG
CAAAAAAAATTTCAAAACGTTTGTTCTTCGTCAAAAATAAGGTTTTCAAA
GTTGAAATACTGCCCTTCGTAAAAGTCTTCATTTTCTTCTTCATTAAATT
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CTATATTTTGTACATGACAAATATGAAAAATTCACTATGGTCAGAACCCT
TAAGATTATTTCGTAGGTTCGTAAAAGTTTTCGCAGACACCCAGGAGGAT
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GATTTTTAATCGCATGGAATTAGATTTTTTTTTATAAGCTACAACATTTA
GGTATATTTTGCCCGACTTTAGTGGAAAAAATAGCTTGGGACTTTGAATT
TCGATCTAAGAAAAATATGAGTACATTTTGAATTTTGGGTGGAAAAACAA
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TGATACTTTTTGAAAATTAGAGAAATGGTCTTTTTAAACTATGACAACTG
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GTGCCAAAATAAGCTCTCACCAAAAATTAAGTATCGTAATCATCTTCTAT
GAAATCTCCTAATGATTTCTAAAAAGCTAAGGTTTAGGCAAAAAGGCAAC
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AATAAGTTCTCGTCGGAACTCAATTTCTCATGTTTTTTGTTGCTCGCCAA
AATTACATGGCAATTTGAGACTAAAAAGAGAGCATTTGGCTTTCGTAATC
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CTGTCTTTAATTAAAATGATATTTTATGCAATTCTTAAACCTTATAGTTA
TATCATTATCGGAAATTTTTGTGTTTATTAGAAAATTACAAACCGCAATG
GGGTAGTTAGGTGATTTATGATCGTAAAGTCGGTACTTTTGAGTTTGTTT
CAAGTTCCGTTTTCTCAGCGCCAAGAATACAATATAAACCCCACCCGTTC
TGACCTTGAAGCTAGTTATACCCTTAATTAGCGGCTGACAAAGATTATAT
CGTAATTTATGTATCCAATAAAATACTTACCAAACAATTTTTTCCGTTTA
TGAAAAATTTCCTTGGGTAAAAAATGATATCTTATGACGTACATTGTGAG
TTTCCTGTTCTAATTGGAAATCCTCTTTTATTACGTGCTTTACAAATACC
GACGTTTTCAAAATAAAAAATTCAAAATGGTAGACATTTTGTAGAAAATC
GTATTGTCTGTACTCATTGTATTTGTAATTGGGGCACGGCGAAGAGGACA
GACGCACCGGTTGTATTGTCTTGTGTATATTGATAGTTCTTTTGATCTTA
ACCTTAACTTTGATGCGGAGGTGTCTCAAAAGCTTGCTGCAGATTAACCA
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TTTTTTACAAAGGTAGGGGAAATCTTTTTTTGGCACAGATTTTAGCTTTT
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ACACCAATCGAGAACTCGTACATGATTAGAAAGCTTTTTCAATGATGCGC
GCAGAACATACTACAAAATATCCAAACTTTTCGAGGAAAGTACCAAACTT
TACGAGCTTAAATTTTTATCCGGTCGCAAAATCAGATTTTAAATCGAAAT
GTTTTCAAGGCTTTACAATTTGTAAGTTTTTGTTACCACTTTTGTTTACA
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TTTCTTCCTATTTTCTATTTTATTCACCAGATAGTTTCCTATTGCAAATA
TTCCCTTTCCAAAAATTTCTCCTTAAACTCCGTGTTTAAAAGCCATAGTA
CTGCTCTCAATATCTCTCAATTTCTCTACAATGTTGACGTGTTTTTAAAT
CCTTAACAATTAGGCTATCAGTGATAACACGTCATTTAAAAGGTGAAATT
TATCATCCAGTCATTTTAAGTACAATATTGTTTTCCTGGCCATTTTACTT
TTTGATACTTTAAAACGTTTTTGGACAAACTCTAAATATACAGTACTGTT
TCCACTGACACGTTTGTTGTTTGTTTATTTTTATCACGTGATCTAAAATG
GCCGCTTAATTTGACTGCGTCTGTGATACGTGTCTGTGTTTGCTAGACCG
GATTAGGTAGGTTATGTAATTTTGAGGCTATTTCTTTGACCAACCAACAA
CAAAGATAAAAATAAAATTAATTAATTAAAAGGGGGAGTTAAGTGATTTT
TTAGGGAAAGTGTTTTTGCCTTGAAATAAAGTCTTAATATCATAACATTC
ATGAAGCCCTATACATTAATGTCTCATCAACGTGTCATTATCTTTGAGTT
TTCAAAATTTAAATATTTTCCAGAACTTTAGATGTATAACGACCTGGGAA
CCAAATAAGAATATTATACAAAAATATGTGAAAGATTATTATTAAAACTT
TCCAGCTAAAGTTAGCGTTTCTGTCAATAAACTTTGAATAATATGTTTGA
TGATATTTGTGNTTCAAAATGGTAGACATTTTGTAGAAAATCGTATTGTC
TGTACTCATTGTATTTGTAATTGGGGCACGGCGAAGAGGACAGACGCACC
GGTTGTATTGTCTTGTGTATATTGATAGTTCTTTTGATCTTAACCTTAAC
TTTGATGCGGAGGTGTCTCAAAAGCTTGCTGCAGATTAACCAAGTCCAAG
TCTTAATCAATCAAGAATCCATCAAAAGTCCATCAAAAGAAATTTTTTAC
AAAGGTAGGGGAAATCTTTTTTTGGCACAGATTTTAGCTTTTGTCAAACA
TCATTTATGACGAAATCCATCAAAATAAGAAAAATCAAGATTTAGGTTAT
GTAAGCAAAAAGATTAATCGATTTTTAGTCTAACTTTTTATCACACCAAT
CGAGAACTCGTACATGATTAGAAAGCTTTTTCAATGATGCGCGCAGAACA
TACTACAAAATATCCAAACTTTTCGAGGAAAGTACCAAACTTTACGAGCT
TAAATTTTTATCCGGTCGCAAAATCAGATTTTAAATCGAAATGTTTTCAA
GGCTTTACAATTTGTAAGTTTTTGTTACTTTTGTTTACAACGGTGAACTA
GAAGAAACATTGAAATTTACTCTTAAAATACCATAAAACTTTCTTCCTAT
TTTCTATTTTATTCACCAGATAGTTTCCTATTGCAAATATTCCCTTTCCA
AAAATTTCTCCTTAAACTCCGTGTTTAAAAGCCATAGTACTGCTCTCAAT
ATCTCTCAATTTCTCTACAATGTTGACGTGTTTTTAAATCCTTAACAATT
AGGCTATCAGTGATAACACGTCATTTAAAAGGTGAAATTTATCATCCAGT
CATTTTAAGTACAATATTGTTTTCCTGGCCATTTTACTTTTTGATACTTT
AAAACGTTTTTGGACAAACTCTAAATATACAGTACTGTTTCCACTGACAC
GTTTGTTGTTTGTTTATTTTTATCACGTGATCTAAAATGGCCGCTTAATT
TGACTGCGTCTGTGATACGTGTCTGTGTTTGCTAGACCGGATTAGGTAGG
TTATGTAATTTTGAGGCTATTTCTTTGACCAACCAACAACAAAGATAAAA
ATAAAATTAATTAATTAAAAGGGGGAGTTAAGTGATTTTTTAGGGAAAGT
GTTTTTGCCTTGAAATAAAGTCTTAATATCATAACATTCATGAAGCCCTA
TACATTAATGTCTCATCAACGTGTCATTATCTTTGAGTTTTCAAAATTTA
AATATTTTCCAGAACTTTAGATGTATAACGACCTGGGAACCAAATAAGAA
TATTATACAAAAATATGTGAAAGATTATTATTAAAACTTTCCAGCTAAAG
TTAGCGTTTCTGTCAATAAACTTTGAATAATATGTTTGATGATATTTGTG
TATTTTGATTGACTTCTTCCCATTTTTTGTCATGCAAGCTTGTTGTATAT
TTGTTTCAATTTCATCGTGATATAAATTCATTTTATCAATGTACATCCCT
TCAATGTAGAAATAATAAAAAAATATTCATTTTATTGATGATATTATTAG
AACAAGACGATTTAAGAACTTCACATTTTAAAGGAATCGAAATGTTTGGT
CCAAACTTTGACGAACAGAGAATGTTAATAAAGAAAATATAAAGAAAATG
CATGCATCACACCCAAGCCAAATTATTTGTTATTTGAGTTGATTTAAAAA
TGTTTTTCAATTGCAAATTTCAAAATTGTAAAATGCAAAAACCATGTAAA
TGCTTTTAAACTGAGATAAAAGTACAACTTAAAAATCTATTGAAATATTT
TTTTCATTGACTTTGAAATTATTTTAATTCAGTAATAATTTCTTTCTCCG
TTTACGTCTCATCGGAAAATTGAAAATGAAAAATTACGAAAAGAAACCTA
ATTGTCACCTTTATAAATTATATTTTTTATGTTCCCATTTTTCTGTATAC
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CAGTTTATAATGTTTGACAGACCATGTGCATTTATTCTGTTGTACTTTCT
AAGGAAAATCACCTAAACAATTTTCTTATACCCCTAAGTCATGGGAAATA
AATATCTTTATCTTTATATATATAGTATATAAAATAACTGGCATCTCATT
TCTCCAAAGGAATTAGTCAGCAGTCTTTTTAAAGAATAGTTTTATGGGAA
TTTTTTTTTACTGACTTTGAGAACAATCAACTGCAGAAATTCTTATAAAA
TCTGGCGTGAGGAAATAAAGGCCAATTGATAAAATTCATCACTATAAGAA
ATTATGTAAATACAAAATTTTGATTAGCCATGTAAATTTATTCGTTGCAG
GTAGAAATACACAGTTGAAAGTTTTTGAGGATTTGATGCACTTGATTTTA
AACAATTGCCCTTTATTGTTATTTTTGACAACCAAAATTATAGAAAGCAT
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GTTTCCAGAAGAAGTTCTTCAACCACATCCAGTGAAAACATGATGATTGG
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GTTTTCAAGGATTTTAAGTATATAGAAGTCTGAACAATTTATTACACCCT
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TTTGGATTTGAAATATTCTCAATAATTCCTTGGGATTTTAAGTAATTTCA
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GGGATTTGAAGTATTTTTAAGAATTCATTGGGATTTGAAGTACTTTTAAG
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AAGACTTCATTTGGATTTGAAGTATCTTCAAGACTTCATTTGGATTTGAA
GCATCTTCAATAATTCATTGGGATTTAAGTATTTTCAAGACTTCATTTGG
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GGGATTTTAAGTATTTTCAAGACTCCATTCGGACTTTAAGGATTTTCAAG
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TGTTGGGATTTGAAGTATTTTTAAGAATTCATTGGGATTTTAAGTATTTT
CAAGGATTCATTGGGATTTATAGTATTTTCAATAATTTGTTGGGATTTGA
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AGATTCAACGTATTTTCAAGGATCGATAAGGATTTTCAAGGAGTCTTTGG
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AGTCTACGAATACTTTATCGGACTGCTTCAAAAATACTAGATGTAGCTCA
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GTTCGTACCAATTCTTTGCAGGTAAATGAAAACGGTTCTACTAAGTAACT
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GCAAATTCAGTATATATAACTCTTGTGGAGTTGCTAAATTGATAGTCCCC
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TAGAAGAAGCTTATAAAGTTATTGCGATTTTCTGTCAAAATACTAAGGAA
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TCACCCAATTAACAAATCATTCATTTTTCTACGTGTTATCCTTATTTGCG
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GTTGTATTAGATGCTATGCATTATAAGTGTATATGTCCAAGTACTCAAGC
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TAGAGAAGGATCTCTTGGGTGGTAAATGAAGCCAAATAGGACCAGTATTA
TTTACAATCTGAGTAAAAACGGTCTTTTGTCTCTGATGAAAATTTCCTGT
CGAAATGTTTACAACTTTCATTCACTGACAGGGCCATATTAAGATTCAAG
CCATTCCACACAGTCAGTCAGTCAATCAGTACGTGATTTTATCCTAATTT
ATATTTTGGTCTGTAAAATACCAACTTAATAGGCAATCAGATCTAACTTT
TTGCAAAACTTGATTATTTGCCACTGGTCAAAAGTTAAATAATTTCTAGT
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ATATAGTTCTTATAAAACATTTTTATTTCTGTATCATTGGTGACGTGTCT
GTCTTCCTTGAAACCAAGGTGTAGAGAAAGTTTCGTTAATTGCATTCTAA
TTGCTCTAATTATATAAGACTGGAATAGAATTAGTCATTCTTGGACCTTT
AGTCATGGGTGAGGTCAATTTATAGTTTTGGGGAGCAAACACTGGCCTGT
GAAAAATGCTGGCTCAAAATTTTGAAAATAACCTAGGCATGCAATAATAT
CACACGACAATGACTTGATGGATTTTATACCGCCCATTATTTGTATAAGC
TAACTTGCATTATTCTGCCAATTTTTCTCACATCATTCTATTTTTACGTG
ACCGTGACTTATTATACATGGCGGAATTGTAATATTTTTAATAGTGCACT
CTTGACCCTGCCCGATTTCTAGGCATGTCAAATTTCAAATAATAAATCAA
TAATAATTGATTAGTAATCCATTAATTTTATCCGTACAAAAAATGATCAA
ACGGACCAATTAAATCAAGCTGCAACTAACAGGGTTTGTCAGGATGACAA
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TCCTTACCTGTTAATTATTCTCCTTAGTACGGAAAATGTGTTTTTAATTA
TTTTCTGACCTCAAATTATTGAATTTGGTCGAAGTTCTACTTACTTTGTA
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ACATAGGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCAGGACAGC
GTCTGCCTATTGTTAGATTATGCTGATATACTTTAATCGTAGAAATTTTA
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AAAATGTTTATTTTTTCCTCTTTCTGACAATCTTGCTCCACATCCGTGCC
AATCCAATGTGAAAAATTGATGAGTAAGCAAACGATATCACTCTTATTTA
AAAATAAAACCTTTAATTTGAGCTAATGATATGATAGGCTTTCCTATTAC
TTTATGGACTTAATATAATGTGCTCCTGCACCAAAATGAGCGGCTGATCT
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AAAATACTCTCAGGTACCTAATAGCTGGGGGTTTGGAATAAGCAGGGAGA
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AATGCCCTGAGTGGAAAATTTTCGAAAAGGAGGCTAATACAGCAGAATTA
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GGGGTGGAATAAAAATGTCCTGGATGGAAAATTTTCGAAAAGGAGGCTAA
TACAGCAGAATTAGGGCAAAAAATTTCAAAAAAATCAATAAGCGGGGGGG
GGGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGATGGAAAATTTTCGAAAAGGAGGCTA
ATACAGCAGAATTAGGGCAAAAACATTCAAAAAAAATTCCCAAAAATTAA
AATAAGCGGGGGGGGTTGAAATAAAAATGTCCTGCGTGGAAAATTTTCGA
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TAAGCGGGGGGGGGTGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGGTGGAAAATTTTC
GAAAAATTAATTAGCGGGGCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTACTCA
ACAAATGGTGAAAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTCAGACTTAAAGCT
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CTTATAAAGAAAACATGTACCTAATCCTCAAATATTTTCAGCCAGGAAAT
TTGAAAAATATTATATGATCGTGGTTCTCATAAAGTCCTCCTAAGAAAAT
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ATAGAAGACATTGCAAAAATACTCGACAAATGGTGAAAATAAGAACATGT
TAAGGATATTTATTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAATACCCGAAGG
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CACATACGGGCTGACTTTTCAAGTTAATTATTTTCAGGGTGTGTTATCCC
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GATAATCTTCTATTGCTTTCTGTCACAAAAAAGTCAATTATGGAATCACG
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AATTACAATTACCTCGGCCAGTATTAATACTGATGACTTCTAATGAGTTT
CAGCCCCAATTTCAGCAAGGTTTCTTGTTCAATTATTTTCATCTCAAGCG
AGTGGGACAAGGAACAAATGATTAAAGTGATGACCGGAATACTTATGTTT
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GCTACAAAATTTATCAAGGTTTCCATGGCCTTTTTTAGCACAAACTATAT
CCTATGTGATGATGATATTATGAGCCCTCCCCATGGGGAATGAGTCCTAC
TCCTTACGAAGTAGGAATTCCTCCTCTTTTAAGTAGGAATGCATAGCGCT
GCCCTTGCACCGTTGGTTCTGTGCACGCGAGATACAGATACCATGATGCA
TAGTGGTGACACTCGAACTGCCCTGGAGAGTACATAGCTCGTCGCAGGTA
CAGAACGGGTTGAGTGACATCACATACCACAATGTCTGGCATATCAGCCA
CACTCTTTTATCAGAGTTTTGTCAAGTTGCGAGCTAGCACGAACTATTTT
GCTTCCCTTTTGTGAGTTATTTATGATTTCTAAAAATTGACTTTTCAAAG
TTCTATTACACGCTTTTTTTATAAGAATGGTGTGAACCCATTTCATCATG
GATATTCTTAACTTTTTTGGGAAAATCATCCTAAAATATTCTTACTGCAT
TCTTAGGTTAGGATCCTAATTCAGACTAGATTTAACAATTAGTACATACG
TCTCAAGCATAAAATTACATTTTTGTGAAAGGAGTGAGCTTTACTTGGGG
GTAATTAACAATTTCTAATTGAAAATGCTCTAAAAATGTCATTTTTAGCT
TGCTTAGCAAAAATCCATGATGGTAATATTCTTAGCATATTCTTAATTTT
TGGCCATTTTCATCATGGACAATCTTATAAAGTGTATTCTTATAAAAAAG
CGTGTAGCTAACAAAAGTAAAGGGTTGTGTTCTTCTATTCAACTCGAATG
TTTCTTTCTCCTTTCAACAGGGAGCAGATGATGAAGAAATGAAACGAGCT
CGACGAAGGATGAAGAATAAGGTATGGATGCCATTGATTGAGATAGGCTA
TGAAAATATCTATCCGTCCTTCTTTCTGTGTGTTTTCCTGTCCGCTAAAA
GATATGGTACTTTGGTCCTTGGTTAAGCTCTTCAGCTTTTTTTAAATTTT
TGGTTCTTTAGATTTGCACCAAAACGTACCATGAGTATCATTTTCGGGAT
TTAACCTGTGGAGACGGACTATAAGACTTTTATTGCGCATGTCTCAATCA
CGTTACTATTCAAATAATCGAAGATTTAAAGCAAATATACTTCTGTTATG
TTTTAAGCTGGCTCCCCTTTCATCGAATGTTTTTTACGTTTCTTAATAGT
GGTTTTGATTGGTACGGCCTTCATCCGTGTTCCTGGATGATTGCTTTGGT
ATTTTTTGTACTCACTGAGTGCGCGCTGAATAGAATCCTTATTTTTCGTC
ACAGTGTAATATTCATGACGGTAGCACCGTAGCCAAAACGAGGTTAAAAA
CTTAAGCCAGCCTGGGGACTTCAAAATGAACATACGAGTAAAGCCGATAT
CAACTTTGGGTTTGTGAGGTTCAACATTTCTTGTAAGACCTGTGGTCAGG
CTGGAGCTAAGGTTATTTTTGTTCCTTTTCCCTCCTTTAGATCTCGGCAC
AAGAAAGTCGCCGTCGCAAGAAAGAATATGTTGACGCCCTTGAATTAAAG
TAAAGATAATTTTTTTAACTTTTTTTGATAATCTTTCTTTCACTTCTTCA
TCAATAAACATAGACGATGCTATCGTCCGTAAACTATATTATATTATCAT
TATATAACAATAGTTTGTATATTATAAAACGTAATATGTTGCGCGGCGGA
AAATAGAGTCTGTGTTTACGACAACAGCTACCCCCCCCCCCCAAAAAAAA
AAAACTCCTTTTTTCGCGCGTTTTCCTCTTAGATGAAATTCGTCTTAGAC
TATAGCATAGNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAACT
CCTGTCTTCGCGTTTGTTCCTCTTAGATGAAATTCGTCTTAGATTATAGC
ATAGTCTACAATAAACATAATTTTTGTCACATACTATGAGGCCTAGAGGT
ATAATTTACTACATTTTTGAAACAATGAATATGATCGAATGTACCACTTT
ATGATTTTTATCTTCTGCGTTTCTTCTTTTGCAGAATGAAACAACGAGAC
CAAGAAAAACGCTTATTGACAGAAAAAGTGACCGAACTTGAAGATCGAGT
CAGGTATAGTTTACGCATGTGTTGTTTTCCTTTTTTGAATTTCTATATAG
TCAAAATAAAATGTAGCGAGAAAGACTACTGTTAATAATTAGGATAATTT
GATAACTAAAAAACACTTTCCTCAAATTTTGTGAAATTAAGGCAAATTTT
TCCAACGGTCACATAGGTCACCTTTTATATATAGTTTGACAAAGTAACAA
TAAAATCCATTTTCTCTCCTTAGACAACTTGTCGACCAACTCTTCCATGC
AAAACAAAACAATCGCGAGAATACTTCCTCTACAATGACCGACACTGAAC
CTTTCGTCAGACGAAGAACCACCGATGCTGGTACACAAACTGGTATATGT
TTGGAATGGTAAGATTTTTGTGATTTCTTCCGGGCTTTTTCGTGGCCCGA
TTCCGTCATTTTCACTAACGGTCAGTCATTTTTTTAAGAATTGTCACATC
ATTTTAGGGTGAAATTTATGTCAATTAGGAATAGCAGATTGAGGTTTTGT
TTGAAGATAGTTCCTGTCTTTTTTTAATAGTAAAAATATGTCCCTTTATT
ACTAATAACTGAAATTCTACCCGAAACCCAATACCACTGAAGTAATCATT
CCTTGAAAAGTTTTTTGGAAAAAACTTAGAATTCTTTAATTTATTATAGC
TATCTACAGACACCGTCAAAAGTTTTGCTCACTGAAAGACAAATCAAGCA
CGAAACTGAGGAAGAATTCCCTTCAAACGAGCTGACCAACGAAAAAGAAC
TCGACCCCACTGATTGTTTGAATCATCAAACCTCAACACAAACCTCACCG
TATAAAAAAACTTTTATTGATGATTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCA
TCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACC
GTATAAACAGAGAACATTATCGAGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTC
CGAGAAATTGCTGATTTTCAGGAAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTC
GTCTTTATCTTACCAACCCAGCGAAAGTCACCGACGATCTTCGGTCAGTT
ATCCTAAATCACCGGAAAGATACTCATCACCTCACATGGCAAGATATTCA
CCAACTACAAACAGGTCGGCCTCTCCGAGCCACGTCAGTGATCGAGCGCC
CACTAATCCAAATTTAGACCGTGATCTGCGTCAAAACTCAATGGTTCTCC
CTCCACAGGCTACTTTCCGTCGCATATCAAACGCCTCACCGCCTTCAGCT
GAGAAAATGATCCCTTACTCGAAATATTAGATTATTTAACTCCCTTATGA
AAGCTTCTGTTTTAAGAAGTTACAAACCATTACCATAATCAACCATTTCG
ATGATCTATAGATTTTTATTCAAATTTTATATGTAGATAGTTTATTTGAA
ATTGAAAAAAATGAAATTCTGAATATAAAAAAATAGATTGAGACTTATNA
AAAAAGCAAAAAGTCTTGGAATTCTATTCCTATCACCTTGAGTTAATAGT
TTATAACAAAAAATTAACATTACATATAAAAATTTTCGC

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_516:302255..351143-

>TCONS_00070245 ID=TCONS_00070245|Name=TCONS_00070245|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=7098bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_516:302255..351143- (Clytia hemisphaerica)
GTTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACCGTATAAACAGAGAA
CATTATCGAGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTCCGAGAAATTGCTGA
TTTTCAGGAAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTCGTCTTTATCTTACC
AACCCAGCGAAAGTCACCGACGATCTTCGGTCAGTTATCCTAAATCACCG
GAAAGATACTCATCACCTCACATGGCAAGATATTCACCAACTACAAACAG
GTCGGCCTCTCCGAGCCACGTCAGTGATCGAGCGCCCACTAATCCAAATT
TAGACCGTGATCTGCGTCAAAACTCAATGGTTCTCCCTCCACAGGCTACT
TTCCGTCGCATATCAAACGCCTCACCGCCTTCAGCTGAGAAAATGATCCC
TTACTCGAAATATTAGCTATCTACAGACACCGTCAAAAGTTTTGCTCACT
GAAAGACAAATCAAGCACGAAACTGAGGAAGAATTCCCTTCAAACGAGCT
GACCAACGAAAAAGAACTCGACCCCACTGATTGTTTGAATCATCAAACCT
CAACACAAACCTCACCGTATAAAAAAACTTTTATTGATGACAACTTGTCG
ACCAACTCTTCCATGCAAAACAAAACAATCGCGAGAATACTTCCTCTACA
ATGACCGACACTGAACCTTTCGTCAGACGAAGAACCACCGATGCTGGTAC
ACAAACTGGTATATGTTTGGAATGAATGAAACAACGAGACCAAGAAAAAC
GCTTATTGACAGAAAAAGTGACCGAACTTGAAGATCGAGTCAGATCTCGG
CACAAGAAAGTCGCCGTCGCAAGAAAGAATATGTTGACGCCCTTGAATTA
AAGGAGCAGATGATGAAGAAATGAAACGAGCTCGACGAAGGATGAAGAAT
AAGATGGTTTCCAGAAGAAGTTCTTCAACCACATCCAGTGAAAACATGAT
GATTGGCAACAACTCGAACAATAATACTCAAACCTCAATGGAAGACGATA
AGAAGTTCCAAATGGTTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACC
GTATAAACAGAGAACATTATCGAGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTC
CGAGAAATTGCTGATTTTCAGGAAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTC
GTCTTTATCTTACCAACCCAGCGAAAGTCACCGACGATCTTCGGTCAGTT
ATCCTAAATCACCGGAAAGATACTCATCACCTCACATGGCAAGATATTCA
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AAGTTTTGCTCACTGAAAGACAAATCAAGCACGAAACTGAGGAAGAATTC
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AGACCAAGAAAAACGCTTATTGACAGAAAAAGTGACCGAACTTGAAGATC
GAGTCAGATCTCGGCACAAGAAAGTCGCCGTCGCAAGAAAGAATATGTTG
ACGCCCTTGAATTAAAGGAGCAGATGATGAAGAAATGAAACGAGCTCGAC
GAAGGATGAAGAATAAGATGGTTTCCAGAAGAAGTTCTTCAACCACATCC
AGTGAAAACATGATGATTGGCAACAACTCGAACAATAATACTCAAACCTC
AATGGAAGACGATAAGAAGTTCCAAATGGTTTTCATCCTGAAAATGAACG
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ATCGGGATCGATTCCGAGAAATTGCTGATTTTCAGGAAAACCGAGAACAT
GTTCGTTATTCGTCGTCTTTATCTTACCAACCCAGCGAAAGTCACCGACG
ATCTTCGGTCAGTTATCCTAAATCACCGGAAAGATACTCATCACCTCACA
TGGCAAGATATTCACCAACTACAAACAGGTCGGCCTCTCCGAGCCACGTC
AGTGATCGAGCGCCCACTAATCCAAATTTAGACCGTGATCTGCGTCAAAA
CTCAATGGTTCTCCCTCCACAGGCTACTTTCCGTCGCATATCAAACGCCT
CACCGCCTTCAGCTGAGAAAATGATCCCTTACTCGAAATATTAGCTATCT
ACAGACACCGTCAAAAGTTTTGCTCACTGAAAGACAAATCAAGCACGAAA
CTGAGGAAGAATTCCCTTCAAACGAGCTGACCAACGAAAAAGAACTCGAC
CCCACTGATTGTTTGAATCATCAAACCTCAACACAAACCTCACCGTATAA
AAAAACTTTTATTGATGACAACTTGTCGACCAACTCTTCCATGCAAAACA
AAACAATCGCGAGAATACTTCCTCTACAATGACCGACACTGAACCTTTCG
TCAGACGAAGAACCACCGATGCTGGTACACAAACTGGTATATGTTTGGAA
TGAATGAAACAACGAGACCAAGAAAAACGCTTATTGACAGAAAAAGTGAC
CGAACTTGAAGATCGAGTCAGATCTCGGCACAAGAAAGTCGCCGTCGCAA
GAAAGAATATGTTGACGCCCTTGAATTAAAGGAGCAGATGATGAAGAAAT
GAAACGAGCTCGACGAAGGATGAAGAATAAGATGGTTTCCAGAAGAAGTT
CTTCAACCACATCCAGTGAAAACATGATGATTGGCAACAACTCGAACAAT
AATACTCAAACCTCAATGGAAGACGATAAGAAGTTCCAAATGGTTTTCAT
CCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACCGTATAAACAGAGAACATTATCG
AGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTCCGAGAAATTGCTGATTTTCAGG
AAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTCGTCTTTATCTTACCAACCCAGC
GAAAGTCACCGACGATCTTCGGTCAGTTATCCTAAATCACCGGAAAGATA
CTCATCACCTCACATGGCAAGATATTCACCAACTACAAACAGGTCGGCCT
CTCCGAGCCACGTCAGTGATCGAGCGCCCACTAATCCAAATTTAGACCGT
GATCTGCGTCAAAACTCAATGGTTCTCCCTCCACAGGCTACTTTCCGTCG
CATATCAAACGCCTCACCGCCTTCAGCTGAGAAAATGATCCCTTACTCGA
AATATTAGCTATCTACAGACACCGTCAAAAGTTTTGCTCACTGAAAGACA
AATCAAGCACGAAACTGAGGAAGAATTCCCTTCAAACGAGCTGACCAACG
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TTCCATGCAAAACAAAACAATCGCGAGAATACTTCCTCTACAATGACCGA
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CAAATGGTTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACCGTATAAAC
AGAGAACATTATCGAGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTCCGAGAAAT
TGCTGATTTTCAGGAAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTCGTCTTTAT
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AAACAGGTCGGCCTCTCCGAGCCACGTCAGTGATCGAGCGCCCACTAATC
CAAATTTAGACCGTGATCTGCGTCAAAACTCAATGGTTCTCCCTCCACAG
GCTACTTTCCGTCGCATATCAAACGCCTCACCGCCTTCAGCTGAGAAAAT
GATCCCTTACTCGAAATATTAGCTATCTACAGACACCGTCAAAAGTTTTG
CTCACTGAAAGACAAATCAAGCACGAAACTGAGGAAGAATTCCCTTCAAA
CGAGCTGACCAACGAAAAAGAACTCGACCCCACTGATTGTTTGAATCATC
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TTGTCGACCAACTCTTCCATGCAAAACAAAACAATCGCGAGAATACTTCC
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TGGTACACAAACTGGTATATGTTTGGAATGAATGAAACAACGAGACCAAG
AAAAACGCTTATTGACAGAAAAAGTGACCGAACTTGAAGATCGAGTCAGA
TCTCGGCACAAGAAAGTCGCCGTCGCAAGAAAGAATATGTTGACGCCCTT
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AAGAATAAGATGGTTTCCAGAAGAAGTTCTTCAACCACATCCAGTGAAAA
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TTATTGATGACAACTTGTCGACCAACTCTTCCATGCAAAACAAAACAATC
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GAAGTTCTTCAACCACATCCAGTGAAAACATGATGATTGGCAACAACTCG
AACAATAATACTCAAACCTCAATGGAAGACGATAAGAAGTTCCAAATG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043738	XLOC_043738	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00070245-protein	TCONS_00070245-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_516	supercontig	scaffold_516:302255..351143 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR004827	bZIP

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0003700	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated
molecular_function	GO:0003700	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00070245 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00070245 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00070245 (transcript) - C. hemisphaerica