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transcript sequence >TCONS_00069168 ID=TCONS_00069168|Name=TCONS_00069168|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=649bp TCTGAATCAAAATTCATTCTCAAAAGAACATTTAGAGAGAAAACATTTGC ttcagaaaaatctttaaaatggcTGGAGCTATCAAGATTATTTTTGCATT AGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTGAAGCTGCAACATGCACCG ACAAAATGGCAGGCAATCTTTGCCAAAACTTGGTGACGAAACATCAATGT AAAACAAACGATTACGTCCAAAAACAATGTCCAAAATCATGTTTCAACTG TGGGCCCCCACCACCAAaACCATGTCAAAACACATCACACAAGTGTGGTT CATGGAAGAAATATTGCCGATCCATTGGTAACGTCCGTAAAATGTGTCCT TATTCGTGTGGAATGTGTCGAAGCCAAGCTGTTTGATAATAATCGTCTGG TGTAATCATTCTCGGAAGATTGGACTATTTCATTTTTAAGCCATAAAGGG GTATTGATGAACTTTcccagattttccaaggggtttaattgtttttgaaa atttctaaggGGGATTATTGATATTTTCCAGGGGATCAGAGTAACTTAAA GAGAGTTTTCCAGGACCTAATTTAAGGAATTCAGTAAAAAACCCATAAGA TTTTAATTTCCAGGGAGCTTGTAGCTCAATTTCCAGCTGATATTGGAAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_495:128047..161890- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00069168 ID=TCONS_00069168|Name=TCONS_00069168|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=33844bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_495:128047..161890- (Clytia hemisphaerica) TCTGAATCAAAATTCATTCTCAAAAGAACATTTAGAGAGAAAACATTTGC
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TTTTTGCTTAATTCATTCCCAGAATTCCATGCAAGGAAAATGGTGACCGT
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ATATCAGTCGAAAGCTCTCGAAAAACGATATCGATTACCCAACGTAACTC
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TTGTCGTTTGCACAAATTTCAAGAAATATTTTGTTTAAATTCTGCGTTAT
TAGAAATACTTTGCATATCATCAAAAATAAAAACTCTAAACTTACTGTTT
GAATGTCTTATTGTCAATGATGAACAGTGTATGAAGTCGGTATTCGTTTA
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GTGAAAACATATAAAAAAAATTTTGTGAAACTTTCAGAAATCCGTGGTAG
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TTGCAATATCAAAGTCTTTTACCTTAGCAACTTCTTTCTGTTCTTTCTTA
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GACTAATTTGACCTGGGAAAGGCAGTGCTTCGATGGCAAGCTCGCACTGT
GTGATATAATGTATAATATGATGTGAATATAATGTGATATAACTTTTGAA
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GACGGTTTCAGAAGTCCGACTATTTCAATCCATCCATACATTGCGAGCTT
GCCGCTTCGGGGTACATATTTCTTTTGGTTCCAGGGAAAAATTTTCAATT
TCTAAACCTTTTGCTTTAAAGTCAAACCTGGTCCCTTAAAGTTGATGACC
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TGCCAGCTGGGAATACAAAGTCATAAGTTGAAAAGGCTATTGTTAAGAAG
TTAATTGTCATACCGCTTCAATAGCTGAAGGAGAAGGTGTTAACCAAGGA
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TAAAAACACACTTTTTTAGGTTTTTTTACATTATGTACCTAACATTACAG
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CACTCAAAACATGTACAGAGAGGGCCAAGGATTCAAAACTGAAAGATAAC
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TCTTTCGACCAATTAATGGGAAGAAACTTTCCCGTCAACATTGCATACAA
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AACTGAAAAATATAATGAAGGAGAAGAATTCTTATACACCGTCTATTAAA
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CTTATACACCGTCTATTAAAAGCAATTATTAAATTTTGTTCAATTCAATC
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GAATAAATCGGCTCATCAAACAGGTCAGATCTACATCACAAAATAGAGGT
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ATTAGCTTACAAGCTCCACATGTCTGCTTTGAAGGGGTCGTATGGCGTGT
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TATTATCTAAGTATTTTAATTACCCAGGCACACAACGCTGTTTCAACGTT
TATCTAACATTCACAACGTCCATATAACGTTAGGTTAACGTTTAAACAAC
GTCGTGTGCCTGCTGGGAACCTCCAGTAGGTTTCAGACCTCTATCAAAAA
AATATTCATAAACGCTTCNCCCTAGTCCCCCCCCCCCCCGGGGCTGGGAG
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TGTAAAATTTGTAAAATTTATCTATTCCCAAGGTCAACATTCTTTACCGG
TTCGTTCTACTACCACATCAAGTATATTTGTACCAGTCAGATTCGTGGTA
CTTCCGATACTACACATTGTATACTCACAATTGACAGCTGTGTATTAACC
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AAAAAATTTGGCCAAAATTTCGTCCCAGTTGGGAAATTGACTTTGACCTC
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AACTGGTTTTTTAGTGAAACAACACTAGAAGTTTTATCCAAATTGGAATC
TTTGATAGAAAGTTTTATATCGATTGGCGAAGAAAAAAATTTCCACCAGG
GCTGTTAGACAGGGGTGTAAAATTGATTCTAAATGACACCCAACATTTTA
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TATCAACTGGCGATATGTGTGGCGAAAAAATGGCTTTTAGAATCAAAATC
GGTGAAATTCATACCCTTACAGTGCATTTTTGCAAATTTTAAACTCTTTT
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AATTTGCCTTAATGCCCCCCCCCCGGGGTAAACTTTATCCAAAGAAGATC
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AAGGTTGTCATCAGGTCTTCTTTGCAGAGCTCCATTACTAGGTAGCAATG
ATTTTCTCCTTGAAAGAAATCCAGCATCTGGACCTATAGGAACATAAAAA
GTGTGAATCGTCTTATATCTAGGTCGATGCGTGACAACGATGATCTAATA
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TCAGCTTTCTAGAGGAGCTGAAATTTTAGGGTATTTTCTCCCAACGGAGA
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TTTGAGAATTTATTTATTTGATAGCGCGACTTTTAATAAAAAATATGAAA
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AATAGAGCGTCGAATTAGAGATCGTTAACGCTATGTAAATCCTGAAACAA
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ACATCCAAATTTTTTGAAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTATTTTTACC
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TGTTTTCAAATATTCTTAACTTGTTCTTAACATTTCGACCATCGAAACCT
TATGTTCTTTTTTAGTTTGTTCTTATAAAAAGCATGTATATAATGAAATC
ATTTGAAACAGGGTCTTGTCAATACTACTTAGTAGTCACTCTCGAAAAAA
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CGATCCTAACCTAAGAATACCATAAAGATATTTAAGGATGATTTTTCCCG
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GCTCCGTCCCAGAACAAAAACATGCTGTAANCAACATAAACTTACTTGGT
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CCTTCGAGCGTCTATTCTCAAAGGTGGGTCGAAGTATGATGATTTTTTCG
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TTCCTACGGACTTCTACGCCATCAACCTAAATTAAACCTATGTAATACAG
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CGAAATGGGCGAAATCTTTAATTGCACACGCAACGAACGAAGTGAATGAA
GAGGCACTCATAGCTTCACGCTTAAATATTGGACTGGAATCTCAAAAAAT
GATTTTGATTATAAGTTGATCTAACGTTAAGAACCTATGGACACGACTGG
GCTGGCAGTATATTGACGATTTAGATGTTAACAGCTTTGAACTGCCATAT
TTGACATATTTGATAAAAAATACTACCCGGATGTGGGACAGTGAGCATTG
ATTGGCTAAACTGAATGTTTTGATCACGTGTTCATGGAACACAGAATGCC
TGCAAAAAAAANTTTAAATTTTATTTGACGTCAAAATATATTTTTCTTAT
TAAATACGTCAATTTTCCACAAAATATGGTAGCGAGATACACGCCCAAAC
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TTATTTTGGATCAGTGGAATAAGAAAACGTTCAGCGACCAAAGCCCCCGA
GCCATGAGCCATGTTCGCCGAACATAAAATGCTGAGTGAGTAGCGACCTT
CAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCGGAAGGCTTCAAAACTTTTCGATGTT
CTTATAAAAAAGTAAAGCTTGTAGTTAATTAGTGAGGCTTAAGACGATCT
TATTGTCTATAAGAACGACGTCAATTTAGGGAGTATAATTTAGGAAGTAG
ATTTGGCTAAGGTTTGGTTGAATGGTTGAGTGAGGTATTGATTTGACACG
TAATTTGCTTAAAACCCCGTTGTTCTATGTCTAGCGTTGAACTGCTTTTA
CTTTTTAGTTTGTAATAAGGCTCAACTTAAACAATATTTATTGCACAAAT
AGAAAGAATGTAATTCATTCGTTTTCAAATAATTGTAAAAAGCTGCTTAA
AAGAGAAGTGCAAATATTTTATGGTTATCATATATTTCGATTGTTGTAAA
CTCTTTATACTATTATAGTTCTAAAATAACCGAATACATTACACAGTAGG
CAACCTAATTTAACGAAACAAATTTGAAATGATTGTTTTGCTGCTTCAGT
AAAAACAATCACCCCTAATCAACCCCGACACAGATTCCGAGTTTAGCCTG
CCAAGCCAAACGCGGTGGGTCATTTTGCTTGGTTACGGCTTTAGACCTTC
CCTACAGCCTTTAGAAGAAGTAACAACTCCTAAAATTGGCTTTCAATTTC
CGCATTTAGCCTACCAAGCCAAACGCTCTGGATCATTTTGCTTGGTTAGG
CCTTTAGACCTACCCTACAGCGTTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATT
GGCTTTCAATTTCCGTGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCAGTGGGTCATT
TTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCGTTTAGAAGAAGTACC
AACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTCCGTGTTTAGCCTGCCAAGCCAAAC
GCAGTGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCCTT
TGGAAGTAGTACCAACCCCTAAAATTGACTTTCAATTTCCGCGTTTAGCC
TGCCAAGCCAAACGCGGTGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCT
ACCCTACAGCGTTTAAAAGAAGTACCAACTCCTAAAATTGGTTTTCAATT
TCAGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCGGTGGGTCATTTTGCTTGGTTA
GGCCTTTAGACCTACCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAA
TTGGCTTTCAATTTCCGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCGGGGGGTCA
TTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTA
CCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTCCGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAA
ACGCGGGGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCC
TTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTCCGCGTTTAG
CCTGCCAAGCCAAACGCGGGGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGAC
CTACCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAA
TTTCCGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCGGGGGGTCATTTTGCTTGGT
TAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCCTTTGGAAGTAGTACCAACCCCTAA
AATTGACTTTCAATTCCCGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCGGTGGGT
CATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCCTTTAGAAGAAG
TACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTACGCGTTTAGCCTGCCAAGCC
AAACGCAGTGGGTCATTTTGCTTGGTTAGTCCCTTAGACCTTCCCTACAG
CCTTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTCCGCGTTT
AGCCTGCCAAGCCAAACGCGGAGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGACTTTAG
ACTTCCCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTCCCAACCCCTAAAATTGGCTTTC
AATTTCTGCGTTTAGCCTGCCAAGCCAAACGCAGTGAGTCATTTTGCTTG
GTTAGGACTTTAGACTTCCCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTCCCAACCCCT
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GTCATTTTGCTTGGTTAGGACTTTAGACTTCCCCTACAGCCTTTAGAAGA
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GAGTCATTTTGCTTGGTTAGGACTTTAGACTTCCCCTACAGCCTTTAGAA
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GTGTGGAATGTGTCGAAGCCAAGCTGTTTGATAATAATCGTCTGGTGTAA
TCATTCTCGGAAGATTGGACTATTTCATTTTTAAGCCATAAAGGGGTATT
GATGAACTTTCCCAGATTTTCCAAGGGGTTTAATTGTTTTTGAAAATTTC
TAAGGGGGATTATTGATATTTTCCAGGGGATCAGAGTAACTTAAAGAGAG
TTTTCCAGGACCTAATTTAAGGAATTCAGTAAAAAACCCATAAGATTTTA
ATTTCCAGGGAGCTTGTAGCTCAATTTCCAGCTGATATTGGAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_495 | supercontig | scaffold_495:128047..161890 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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