TCONS_00068739 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00068739
Unique Name	TCONS_00068739
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3567

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_49:58681..75772+

transcript sequence

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>TCONS_00068739 ID=TCONS_00068739|Name=TCONS_00068739|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17092bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:58681..75772+ (Clytia hemisphaerica)
CATAACTATTATAACTGATGAATTGGTTTTGAAAATCGTTTTTTCTTAGC
AAGTGCAAGAAACCTAGAAAAAGACGTGATAATAAAAAACCCTTCTTTGA
CACTGGTCTGTTAGAccaaacaagaaaataagaaactcttttcttgttcg
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GAAATTGAACTTTCGATGTCTTCTCCAATAGCTCAAAAACTCCGCATCAG
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AAAAGTGTTTGGCAAGTCAGGTAGTTTATTGTAGTGATCAAATATAGTTc
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TTCCTGATTTGATCATTCTACCATCACCTAAAAGTCCGGCACCGACCACC
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GTCTATGTTCGACGAGAAAGACAGCCCGCGCGGAGGAGCCGGTTCGCCTG
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TGAACCGATATCAGATACAACTGAGAAACCGTCTAAAAGCAATATTCCGA
GAACACAAAGCCAAAATTACGGTCGCCGAACAGAGGAGCAAGGTGAAGCG
AGTGTACCAAGGCGACCAATGGGACGATCGCAAACTATGACACGTGCTGC
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tgctgaattttttttcatcctttactactcaaaatctttgaagtcATCAA
TTTTTATTATCTTACGTCCTATACATTTTAGATTTAACATTTTaatcttt
ttcataacttttttttaccacaagtTTGAGGAGTTTCTTATCGTCATCTT
GTTGATATCAATCGCTATTTCCTTTAACCTTTAACCATCCCAAAATTGAC
TTTATTCATAACTTTcgcatttgtatttttttctactCTGGTGTTATCTC
TTGATTTGCTTACACTGTCAGCTTTTGGACCATTGTATGACTCGGGCTTT
GGTTGCAATTTTACTTCAATCCGAGTTCTTGTACGATAAATgattaagac
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042876	XLOC_042876	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_49	supercontig	scaffold_49:58681..75772 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.977981	0.516262	0.000646153	0.381544	23.974	18.77	33.6735	27.1393	14.6409	22.9808	14.8386	14.5185	13.9931	14.4216	4.26534	9.77222	12.516	12.5746	5.33622	6.55889	9.36634	13.5563	4.073	6.53081	12.8593	9.7324	20.7256	10.9577	11.3701	9.79318

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00068739 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00068739 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00068739 (transcript) - C. hemisphaerica