TCONS_00068107 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00068107
Unique NameTCONS_00068107
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length6875

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00068107 ID=TCONS_00068107|Name=TCONS_00068107|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6875bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_48:94727..121328+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00068107 ID=TCONS_00068107|Name=TCONS_00068107|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=26602bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_48:94727..121328+ (Clytia hemisphaerica)
aagaaaggGAAAATTCAAGTATCAATAACTTAatgaatttaaaagatttt aagttcgttcttttttcaatatttttgtttctatcAGAACTTtcctatgt aaaaaaatgaagtACATGAATTTTCTGACATTAGATCCCCTTTTAAAGAT TTCTTATGTGATTTCACGAGTGGTATTATTATTGAGGTGCTCAGTGATGA AGGGATGTGTTTCGAGTGAAATATTCTATTGATAAGTTTGGTTAGATAGT CATTAAATATATCGCTTGTTGCATATTTATAATGTTCTGATAGCAGTTGA AAAGGGTCACGTGACTTTCCAAGTTGTAGTTTATTGATGACTGAGATAAT TTCATGTTGAGATATGTAAAGATCACTTGAATCTATGTCTGTTTGTAGTT CGTGTAATAGGTTTTTAAGTTCTTCATTCGATTGGTTATTGTCGATTGTG TCAATTCTTGGTGTGTTTAGGAGTCTATCAAAGTGTTCTCCAAATTCATT TGATATGTCACTTTTGGTGGATTTGCCGTTCACTGTAAATagtttatgtt gtttttttcttattgaGAAGATTAACTTTTGTCCAGTAAGAGGATTGGTT cacatttttcagcttttcaacATTGACATAGTGTTCTACTGTGACTTGGT GCTTTGCACGTTTAACTAATGttcgaaaaatttttctggaaaatttatAC CGGTTGTATGATACTTCAGATTCAGATTTTGGGAATTGATTGTCACGCCA AAGGTTGAAACACAGTTGTAAGTTCCTTTTGGCTTTTGTTAACTCATCAT TCCACCAATTCTTGGCTGGAAATTCATAAAAGTCCTTCTTGAAAGTTGTA TAACACTCAGATGCAGATGAGTGCAGTATGTCGTTGAGGTTGTTTATCAT TGATTCAATATCAGAGTCACTTGTGTTGTTAGCAATTTTCTCTGCTACCT 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_48supercontigscaffold_48:94727..121328 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.000773988 6.56878e-09 0.0589987 2.18318e-06 0 0 0 0 0 0 0 0.0140274 0.00895181 0 0.06532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.149827 0 0.0279216 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00068107 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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