TCONS_00067390 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00067390
Unique Name	TCONS_00067390
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3263

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_469:269595..286501-

transcript sequence

>TCONS_00067390 ID=TCONS_00067390|Name=TCONS_00067390|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3263bp
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AGGACTAAAGCAAAGAATTGCTTGTGTTTGAATGGAGGTGTTTGCGTTGC
CAATAACAACACGACAACAACGACGTCCGAAATGCAATGCGCATGTCTGG
ACGGTTACACTGGAAAGTTTTGCGAGACGGAAATCAACCATTGTGAAAGT
GCACCCTGTTTGAATGGCGGAGTGTGCTTCAATAATGTCAATGGTTTTTC
TTGCGCATGTGCAGAAGGGTTTGGCGgGAAAAAATGTTCGACTGATCTTC
AAGAACGTTGCAAAGAAATGTGTGTCCACGGTCTGTGTGAAAAAGGTGCT
TGTGAGTGTCACCAAGGGTGGAGTGGCCTCACTTGCCAGGATGAATCATG
CCCTTCTGAATGTAATCAGCAATTCAGCGAGTGTAACCAGGCATGTAATA
TACCACAATGTCAGTTTGACCACTATCGATGCACCCTAGGAATTGACCCT
TTCAAAGGCTGTCGTAAAACGTCTTGCCGTCAAGCTACGGGCGACGGACG
TTGTGATGTTGAATGTAATATTGCGGAATGTCTTTTTGATGGTGGAGATT
GTCGTAACAGAAGCACGTGTGATTTGGAGGAAAAGTGTTCGATTCAATAT
GGTAACCAGAGATGTGATAAGGAATGTGACAATGCTGGATGTGGGTACGA
TGCGTTGGAATGTCGTTCGAACGTCACTAAGAATCTGCTTCCTGGTAAAC
TTGTTCTTGACATCTCCTCCAATCAGAATCAAACCATTGAAGAAATTTCC
ATCGAAAGATCGCTGAGCATCCTGTTAAATTCGCGCGTGAACGTCGTGGA
GATCCGAAGAGGAGGAGAAGAAACGGTGAATCGGCGAAAACGAAATGTCA
AGAGCTCCGATCGTCAAAGtgtttcACTAAGAACGACATTAGACAACGGA
GGCTGTATGCGCGATTGCTTCCACACTGTGAACCAGGCGGCCAGATACAT
CGCTTTCAAGGCCAGTAAACAACAACTTGATCATTTACCTTTCAAAGTAC
GATCGGTTGCAGTAGAAAAAGACAGCGCGCAGAAGgaggatgacgtcatc
aataaaTATTTATGGCTTTTCACACTTTTTGTGATTGCTATTGTCTTGAT
GTTTGGGATTTGGTATCAGAGAAGGCAGAAAGGAACCTCACTCTGGGTAC
CTCCTACCCTCACTGAGCTCGCCAACTCACCCCGTAACGAAACATCGAGT
GCTGTACCAAGGAAAATGTGTAAAGAAATCAGGCCGTCTCACATGCCAAT
TCTCCACAGCGACGATGAAGACCTGGAAAAAGAAAGTTGCCTACCATCAT
CGAGTGCCAACGAGGATGAAGGGACAGACTGCGACCATAAAGAAAagata
atAAAAGATAATCCATATATTCTACATTTTGCTATACACTATGGCTTCAT
GGATCTCTTCAAAGAGCAGCTAGATGACCTGAAGAATATCAATCTTCAAG
ATCACAATGGGCGGACACCACTTCATGTAGCGATCGCTTTACAACGTCAT
GAAATGTTCGAAGAATTAATAGCAGTAAAAGGAATCGACCTCAATATAAG
GGATGGGAACGGAGAAACACCTCTCATGGAAGCTTGCAATGCTTATTCCA
CAGACCAGGTGCAAAAGCTGTTGAAAGCTGGAAGCAAAGCAACTTTGACT
AATCGGCAAGGGAAAACGGCATTGCATGTTTCGGCACAAATTGATAACTA
CCAAGCAGTCAGATTGTTAGTGGAAGTCAACTCGAATGTTAACAAACAAG
ATTCAATGgGACGAACACCTTTACATTTGGCCATCCTTGAAGATTCAGAG
CAGTCCACCATCATTCTCCTTCAGAGTGGTTCTAATACGTCGATCAGAGA
TACGGACGGACTAACGCCTCTTGCGTTATGTCAAATATCGAAGAATGAGA
GATTGGAAATATTACTTCGCGATCATGAAGAGAAAAAGGGTTCTGATGAT
GATTTATTGCCGCGTCAGCAGAAAGTTAAGAAAAAGGTCGAATCGCATAT
GACGAAAAAAGACACAAAGCCGAAAAAGAAAGATCGCAATCAGCGAACTG
TGGACAAACGAGCAAGACTCTCCCGTAAACGTAAAAAGCTTGATAGTGTT
TGCTCTTCAAGTACACTTAATGATAGTCTGTGTAGCCTTTCACCTGAGAT
TAAGCTACCTTTTTGCGAGAGTGCACACCAAGAGACGAGGAAACGACAGT
GGAGTGAAACACATTCAAATATAACGCATGGTTACACATCAGATGAATGT
TCACCATATAAAGAGATGAATGGAAACAAACTTTTACGAAACCATGACAA
CAAGTCTGAAAACAACTCGTCGAGTCAGGAAcccaaaaaaatgacaaaaa
aatgtaaaattaacACAAAGCGGAAACAATTTCCGAGTGTTGATTGTTCT
ACGGATGGTTTGGAGAGCCCGACGAATCGCTTTGATTTTGGTTTCAATCT
TTCTTCAATGATGAATAAATCTTTGATTGATAATGATAGAATGTTTGAAG
ATGATGTCTTTGTTGGCAGCAATGTCCTTCACCAAGCGTTGACCTGTTTG
ATTGACCCTTTACCAACATTAACGACATCCTCATGGTCGACTGATGCACA
TAGCCCCATTTCTGACACTTCCTTTTGAGCATTTTTGGAAATAAGAAAAT
GACATCTCTGATGGTATATTCTTGTTTTACTCACGAAGATCATCACTTGA
TCATTGACTAATATGACTACAAGATGTTCTTaagaagaaaatcattttca
tatgCTCCTGCATTCATTCAATCAGTGAGATTTTAATTTGGATGTTAATC
CTCCTATTTCTGGCTTAAGGGCTCATAGTGAAAAagcaatttcagaattt
gaagataaaaccttatgttttcgcttctttgacatgtttaagaaaacaca
aaaaagcctaatctccttgggcaaatcattttattgtttcaaactttttt
taagttaatgagaaataatttctttatttagatttttccggaaaaatttt
ctatttggctacatcccaagttatagctgttttcgtatggaaatttagtg
gagaaaattgccaaaaatgagtttttttggagattttaaaggaaagatac
ttccacaaaaaatttccgaaattgtatttttagatactaaatagatacat
cacctgaaccaaaaataattccaaaatgtttgatttttaccgagattagg
gctttgaaaggtg

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_469:269595..286501-

Legend: exon

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>TCONS_00067390 ID=TCONS_00067390|Name=TCONS_00067390|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16907bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_469:269595..286501- (Clytia hemisphaerica)
AAATGGTGTATTTGTATGTTTTGTTGGTGTTTCTTTCTGCTTCACACTCA
AGGACTAAAGGTAAGTTTTTCTCAGGTTTTCTTCTATGTTTTCTGAGAAC
CTTAGAGGGCCATGAAACACTTGAAGGGGGAGGGGTAGACAGGTTACCAT
GAGGTAACAGCTACAAAAGCTACCTTACTTTTCCAATTTCTTAATTTATG
GCCAAGTAGGAGGAAGCGTATTATCTAAGCCCAAAAATATTGCGGCATTG
TTTTCATACTTCGTGCGTCGAATGTGGTCAAAATGCTCAATCTTAAAATT
GATGTGAGATGCTTCTCTTAAACCTCAACTATCAGAAAAATGGTCAAAAA
GTAGAGTTAATCGGTCCCTTAATTCCTACTCTTAACACCTACGCTCGTTT
TATGAGGATAAATTTATAAGAACACGAGGCTGAAATTTGACCAAAACCTA
AGAACAAATTAAGAACAACAACTTGAACTTTAGTCTTTAAATTGAAAATC
ACTGATTTTTATGAACAATTAAGTGTACACTCTCCACGTACATCACACTC
GTCTATTAATTTCACATAGTGAAAATTTCTTAGTCGAAAAAATATGAAAT
TCTTTAACCCTTAATTTCTTCATTTGATAAATAATTTAAAATAGTATAAT
TCTTAACTTATTTTCTTCACTTTTAACGATGCTTAGAGTATATTTCTTTT
ACATTTCATCTTTTTGGTATTAAAAAAACACATTTTGATGGAAACACCGA
GGTCTCTGTTTAAAGGTAGTGAAACTAAGAAAACGGGCTTAAAAGTTTAG
GGGTTTGAAGTCAAGTTGAGCGTAAAATTTGCTGATAAGTGGTTTTTTAA
GAATTGTTTGTACTTATATCCTCATTTCTTTTAATTTCAAACTTTCAAAC
TAATTACCTAAATATTAAAGCTCTAAACTTTTTAAGGCTGGAGAAGAACC
CTTTTGTAAGCGTTGGTATATCAGTTTGTTTGTTTAATTTATCTCTCACT
CTTTTTTATCATGTCATGTTCTTATCTTTGCAGCAAAGAATTGCTTGTGT
TTGAATGGAGGTGTTTGCGTTGCCAATAACAACACGACAACAACGACGTC
CGAAATGCAATGCGCATGTCTGGACGGTTACACTGGAAAGTTTTGCGAGA
CGGAAATCAACCATTGTGAAAGTGCACCCTGTTTGAATGGCGGAGTGTGC
TTCAATAATGTCAATGGTTTTTCTTGCGCATGTGCAGAAGGGTTTGGCGG
TAAGTCAGCCTTGTATCTAATGTATTGTAAGTTTTCTGGCTTTGACAATA
TTGATTCTAGAATTCTTTCCGATCAATAACTTATGTATATGATGATACCC
AAAATTATATCATTAGCCATTGACTTACGATTTTTAACCACTATNGTGAA
TGGGCTTTTTCACTTGTGTGAATGCGTGAAAATTAAAACAAAATTGCGCG
AATGTGTGAATTGAAGGTTCGCTGGGGGGGGGGCTTCGTGTATCTCTGAA
TGCTTATTTTAATCAATAAAGTTGATAATCAAGTTAAGTTAATGTAAATA
GTTGCTTGTAAATATTTTTTGTTCAATTTCATACATTTTAAAGACAGCAT
GCATGATTATTAATTGTTTAGATAACTTATTTTAAATCGTTAACTTATGT
AATTGCTCGAATTTTAAATTTTAAACAATAAACAAGTTTTTAATAAAAAT
ACATAGTTCGAATTAACATTTAAACTATTAAAATTTTTGTGATATGTAAA
ATTTAGAATAAACTTTTCCAACTCCTAAAGAGATCTGAGGATTAGTCTTT
TAGTTTCTTTAAAATCAGCCTCGATAATTGAATATCAGCGTTTACGTGGA
AGCAATGGTATCCTCTTAGATGGTATAAATTAAGGAGATTTTTGTTGTAT
ATAATACTGTCCAATCAAATCACTGCTTCATCATAACAACACCAATCAGA
ACCGTTTACTCCATAGCAACTAACGTCGCAACAGGTATTTGAATAAAAAA
AACTGGCAACAATCATTAAAATGAATCAGTGAATTTAAATTAGGTGTAAT
TATACTCATCATAAAGAGGAGGGCTTTATCAATGAATTGATAAGAAGGAC
AAAGATGACTTCACTCTTGTCGTACACTTCCCTTTGGTATAAACCTTCAT
CGAAAACTTTGAATGAAATTATTATAAACTAGTTGAATGAAATGGTGTAT
TTGTATGTTTTGTTGGTGTTTCTTTCTGCTTCACACTCAAGGACTAAAGG
TAAGTTTTTCTCAGGTTTTCTTCTATGTTTTCTGAGAACCTTAGAGGGCC
ATGAAACACTTGAAGGGGGAGGGGTAGACAGGTTACCATGAGGTAACAGC
TACAAAAGCTACCTTACTTTTCCAATTTCTTAATTTATGGCCAAGTAGGA
GGAAGCGTATTATCTAAGCCCAAAAATATTGCGGCATTGTTTTNGACGGT
AAATCAGCACTTTCACCGTCTTCGGGGTCAGAAGTGCGGGTTATTCCAAA
TCGCTTCAGTCACTTTTACCGTCCTCAAAAGAAAAAATGCATAAACTCGC
TTTTTATTACGCCATCGGCTGAAAATAAATTATCCTAACAACTTTCTTCA
ATCCTTGTTTCTTGTAGTGACTTCTTTAACAGCAGAGGAGGTGGCAGGAG
AAAAGGTACTTATTCAATTGTTCCCAGATCCCTTTACATCATGTCATGGG
TATATTTGCATAATAAACACTTGTTTACCTCCCGCGAAGTATTTTCAACA
CGTGCTCACTTCTTTGAGAAATTTTTTCCTCTCTTTGATAAAGACAATGA
TTCTTCTGTCTGTGATTGCTTTCCCGGCTTAATTTGACCTAAAATATGTG
TCCTAAATAAGATACTTGACTTGGATGACATCAAAACTTTAAGGTTTTTA
CTTTTTTAATAATGCACCGTATTTGAAACCTTTTTGTTTCCATTGTCTTC
GTTTTCAGATTCAGCAGAAGTGAAGTTTTACAATAACGGAGGTTATGATA
ACGTGGAGGACTGGACCCGATACACACGTCAAAATATCGGTACCGTAATT
TTTGACAATTATTTTTCTCGTTGAAATATGGTAGCCTAGCAGGGCTTCCA
AATTGTAATAAAATGAGGCTTTCCTTTATTATCAATGAAAGAAGATGAAT
AAAACATTCTCTTCGTGGAAAAAAATTGTAAAGGACACCTATAAAACACT
CACTAATTTCTTAGAAGGTTCACTTCAAAGTTTAATTTTTCAAAGTTCGA
ATTTCTTTCTCAGATGACGAAGAAGAGGAATCGATGTACGGCAGTCAAGA
TATGTTAAACGATACGCCCGACTCCGCCCGTAACCCGCCCTCTCAACAAC
AACAATCGTCGCCGAATAAAGTAAACACGACACCACGTGCCAACGCCGCA
CGACATGTCGAAGAAATGACAAGTGATATGGGTTCCGACACACCCATCAT
GCTGTGAAAAGGTGCAATGGTAACAGTAATGGTTAGCTCTATTTGGAAAA
TAGTGCTTTGAGGTTTCCTTTATTGTATAGGTTTTTGTACGGATTGAAGA
AGATGAAATTTCTAAGAAAGCTTTGAGTTTCCAAACAGGTCGGATGTGGA
AACTAAAACTTTTTGTTTTCTTCAAACTTTTTCATTACTTTGCATTTACG
ATGTATGGGCCCCCAGCAGTTTGCGTGAATGNAATCTTAAAATTGATGTG
AGATGCTTCTCTTAAACCTCAACTATCAGAAAAATGGTCAAAAAGTAGAG
TTAATCGGTCCCTTAATTCCTACTCTTAACACCTACGCTCGTTTTATGAG
GATAAATTTATAAGAACACGAGGCTGAAATTTGACCAAAACCTAAGAACA
AATTAAGAACAACAACTTGAACTTTAGTCTTTAAATTGAAAATCACTGAT
TTTTATGAACAATTAAGTGTACACTCTCCACGTACATCACACTCGTCTAT
TAATTTCACATAGTGAAAATTTCTTAGTCGAAAAAATATGAAATTCTTTA
ACCCTTAATTTCTTCATTTGATAAATAATTTAAAATAGTATAATTCTTAA
CTTATTTTCTTCACTTTTAACGATGCTTAGAGTATATTTCTTTTACATTT
CATCTTTTTGGTATTAAAAAAACACATTTTGATGGAAACACCGAGGTCTC
TGTTTAAAGGTAGTGAAACTAAGAAAACGGGCTTAAAAGTTTAGGGGTTT
GAAGTCAAGTTGAGCGTAAAATTTGCTGATAAGTGGTTTTTTAAGAATTG
TTTGTACTTATATCCTCATTTCTTTTAATTTCAAACTTTCAAACTAATTA
CCTAAATATTAAAGCTCTAAACTTTTTAAGGCTGGAGAAGAACCCTTTTG
TAAGCGTTGGTATATCAGTTTGTTTGTTTAATTTATCTCTCACTCTTTTT
TATCATGTCATGTTCTTATCTTTGCAGCAAAGAATTGCTTGTGTTTGAAT
GGAGGTGTTTGCGTTGCCAATAACAACACGACAACAACGACGTCCGAAAT
GCAATGCGCATGTCTGGACGGTTACACTGGAAAGTTTTGCGAGACGGAAA
TCAACCATTGTGAAAGTGCACCCTGTTTGAATGGCGGAGTGTGCTTCAAT
AATGTCAATGGTTTTTCTTGCGCATGTGCAGAAGGGTTTGGCGGTAAGTC
AGCCTTGTATCTAATGTATTGTAAGTTTTCTGGCTTTGACAATATTGATT
CTAGAATTCTTTCCGATCAATAACTTATGCATATGATGATACCCAAAATT
ATATCATTAGCCATTGACTTGAGATTTTTAACCACTTTTCGATGGATACG
TTCTTAACCTCTCTTAAAACCAACACTAACTCACATTAACAGTGGCAATA
TGTCAAAGTAATGAGGGAGTTCTTGTTGGGAAATTTGCGACATTCTATGT
TTTGAAAAAAGTAACTTTAAATCCTTGGTTTATTCTCTCTTACCTCGAAG
AATTGAGTTTCCAAATCTTTGAAATTTTAATTTCAGGGAAAAAATGTTCG
ACTGATCTTCAAGAACGTTGCAAAGAAATGTGTGTCCACGGTCTGTGTGA
AAAAGGTGCTTGTGAGTGTCACCAAGGGTGGAGTGGCCTCACTTGCCAGG
ATGAATCATGCCCTTCTGAATGTAATCAGCAATTCAGCGAGTGTAACCAG
GCATGTAATATACCACAATGTCAGTTTGACCACTATCGATGCACCCTAGG
AATTGACCCTTTCAAAGGCTGTCGTAAAACGTCTTGCCGTCAAGCTACGG
GCGACGGACGTTGTGATGTTGAATGTAATATTGCGGAATGTCTTTTTGAT
GGTGGAGATTGTCGTAACAGAAGCACGTGTGATTTGGAGGAAAAGTGTTC
GATTCAATATGGTAACCAGAGATGTGATAAGGAATGTGACAATGCTGGAT
GTGGGTACGATGCGTTGGAATGTCGTTCGAACGTCACTAAGAATCTGGTG
AGTTGTCGAACAACAAGCAAAGAAAAATTCATTCTTAGTTTCGAATATTT
GTCAAAAATATATTTCCGCTTTACAGTCGACTCTCTCTAATTCGACTTTC
AAGGGGAATTAGATTTCATCGAATAAGGGAGCGTCTCGAAAAGTAGAGTG
TCGTTTATGAGACTTTTTTGTTGATGGTGATTTTCAATATTATCGAATAG
TAGAAAGTCGAATTAGAGAGCGTAAATTGTGTGTGCCGTAGGGTCTGAAT
AAATATTTTTACCTTATTTTTACCTTTATCTTATTTTAAGCCGACAATTT
GTTTTCGTAGCTGTCGCGCAAATTTGAAATGAAATTTGAAATGAATTATA
AAATTTCTGTTCCAGCTTCCTGGTAAACTTGTTCTTGACATCTCCTCCAA
TCAGAATCAAACCATTGAAGAAATTTCCATCGAAAGATCGCTGAGCATCC
TGTTAAATTCGCGCGTGAACGTCGTGGAGATCCGAAGAGGAGGAGAAGAA
ACGGTGAATCGGCGAAAACGAAATGTCAAGAGCTCCGATCGTCAAAGGTT
TACTCATCTTCCTTTTTTTTCTTCTAGTATATTTTGCTAACGATACCTTC
CTGTTCCCAGCGTGTTTTCTGCTTTCCAATGTATCTCCGGCGTCTATCAG
CAACGTAAATAAAGCCAGAGATGTATAGGGATGTAGTTGACCTTCAATTA
CTAAGTAAAAGACAAACGGCTTTTTTAGAATACCTTCAATGACATGAAAA
AAGTAATATTTTACATACTTTTGACCTTTGGTCTGATTTGTAGACCTCTT
TAGATATACTTTCTTTATTTCCTAAAATTATTCGTTATATGATGAGCAGA
AGCCTATTTTATATTCGGTTTATCTATATTCGGCTTTTTCTGAAAACAGG
TCTTTACTAAACTCTATCATAATTTCGCATGTTTAAGATCAATTTCTAAC
GATTGAAGTTGGGCTATTCAAATGATATACTTGGCATAAAAGACCACCTT
AGCAGGCAGTCTATAAAGCATTAAACTAGAGCTTAATTAATTAGCTAATT
TTGTTAACATTGCCAATTTTCAGACCCCGTAATTAATCCACAAATTCTCT
TTGTTTTCGAAACCTGTTACTACAGATATGTAAACAACAAATCCAGGCCA
TCAATAGTTAATTCAACATAACCCTAAAGTCTTGCTTGCTATTTTTTCAA
TTTCAAAGTAAAACTTCAATTTTAACATATCATATACCGTTGAAAAGATA
TCGAAGCATTGTTTGGGAAATGTCAAGCAAAACAAGACTTGGCCTTACCA
AAAGAAACTTGGCCTTACCAACCTAGCCCTGAAACTGAGTATGAACAGGG
AAAGCAGCCAAAAATACCTGAAAAGAGGCGTTTTCGGCTTTACTTGGAAT
TAAAATGTGTACCAATGGTATTTGAATACCAAATTTGAGGTATTTTTGAC
ATAAAATGAGACAAAAAGCCAAGATTTTTGAAGTTGCTGGGCATATTTGG
CTCAAAATCCATACTGTAAGCAACTTTTTGGGTGAAATCCGGAAAGTCTT
TAGTAACTCTAGCCCTGAGCCAAAAATTGGGGTTGCTTATAAAAAAAATT
ACATGCGATGGAACCTTTCGCGATAGCGTTAGAAAATATAGTGCTAGGAG
TGGCTACACGCTTTTTTTTATAAGAATACACTTTATAAGAATGTCCATGA
TGAATATGGCCAAAAAATTAGGAATATGGTAAGAATATCACCATCATGGA
ATTTAGCAATTGAACCTAAGAATGCCATTTTAATGCATTTTAACCTGTAG
ATTGCCAATTTCGATCTTAACCTAAGAATACCATAAGAATATTTTTGGAT
AATTTTCGCCAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGAAATGAAAAAACATCA
TTCTTATTTAAAAAAAAAGCGTGTATGTTTCCACCAGTGTGATATATCAA
AATTTGAAGCTCAAAGAGCCGTAAGGCGTGGTTTCCACCAAATATTGTAG
TGTAGTGTGTATAGATTCAAAGACACAAATAAAACAAAATATTTTTCTCG
AAATGTTGGAGGCATTAGCGGCTTTCTTTGAGGATAAGTTTTGTACCCAT
ATCCATCGCACTGTGCGATGGAAGCTATTGCACAGCATTTTTTGAGCTAA
GAAAATCATCGCTATCGCAGTGTAGTTTCCATTGCTATCGCACAGCCCAA
CCGCACAGTGCGATAGTAGGTGGAAACCGCACAGTGCGATAGTAGGTGGA
AACCACGCCTTAAAGCAAATGGACTTTAGGTACCTAAATTTCTTCAAGTG
AGCATGAGGGAAATTTTGAATTCAATTTTAAATGATTTTCGTTTTGGATA
AAGTGATTGAGGAGTGGTTTAGCCTATTCTGTACCATAGAATGTACCTTA
TCGGGAAAACTTCGTCGGGGGAAATTTTCATCGGGGAAAAATATTCGTCA
CTTGGCCAGAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGG
TATCTCACATATAACGGTAAGGAATTTTCGTCTGTTTACAAATGTAATGT
AATGGTCACAAAGGGTACCGATATCATTCGTAAACAAGTGAATAATAGAA
AGATAACAGGAACAACCTTTACCTCTTTGAAGACATTTAACTTCCCGCTT
CTCCGCCCACCTTACTTTATTTTTTCTTTTCTTGCTTTTCGTTGTAGGGA
AATTAATTCACTAAAATTTTGTAACCGTTTGCGGATCAGAAGTGAGCGAA
AAAGTTAGATAATGCGATGCTGAAAGTAATCTAAAAATGGCGGTCTGGGG
ACTTGGAAAGGGTTTCACCACCAGAAGATCACCTTCCAAAACGTGTTTTG
CAAGGAAGAGTACTCTCACTACCATTCCCGCTATTTTATAAAAACCCGGT
CTGTAAGGCTTCTGTTTCTTTCTATGGTTTTAAGAGTTTAAGCTTTAGTT
TTAAGTTTCTTCATACAAAAAAGTACGGAAGTGGGTGATAAATATTTTAC
ATTACAAGGCTGGGGCTATTTATAATAGTGCCGTAGGATGCATTTTGATA
TTAGGGGGGTTAAAGTTTAGTGAAAAAATATTTGGTACCTCAATACACTA
AAAAAGCAACAATTGATTAAAAAAGGACATAAAAGAGTCTATAAATGACA
ACATAGGGAAAACTTGGGAAAAAGGATCCCAGTAGCTACGACACCTTATA
ATGACTATATTGATTATATTTTAAATAAAGTATTTGAAAATGTCAAGCAA
AAGATTGATGAAGCGAGAACTTACCAAAAAGTTTTTGTCTAAAATTCATT
GGACGCTAATCAGCAAAAATCTTATTGGCCGCAATATTGAAGTGACCCCT
CATTTGAAAGGTATTTTCATACTTATTCAAAAAAATAGTAAACATTTTGG
CTTAGGAATTGAAGAAAGGCTATAAAAAGTCTTTAAAATTAATTAAAGGA
TTAGTCTTTGTGGCATGCCATACTTCAAGAGAAAGGGAGAAGGAATATAA
ACTTTCGGTATTGCTAAATATCGAAATATCAAACCGACTGATGTTCTCTT
CTCATGGTTTTTTACTGAAGGTTTCGCAAGATTTGGCATGATATTCTTAA
TTCTACTTGCCAAGATTTTTGATATCAAAAATAACTAAGTTCAGCGAAAC
CTTTTGTTCCTCAAAGATTGATAAAAAGGTACTTAGGCAGGAGTTTATGG
AGAAAGCTTTGGATTTTTTTACGAGCTGAAAAACGATTGGTTATGACCTA
AAACAGAGAAAAAGTTAGAAGGTTGTAAAGTGTATATTTTTCAGCAAATA
GAAAATTGCGTAATTCAGTCAGTGAGACAACATTAGTAGAACTTATTAAT
TAGTTTAATTGTAGCGTGAAAATGAGCTAATTATAGATCGTCTTCGAAGG
TAGGTTCACTTGTCTGAACAGAAAGTCTTTCAACCCTGCAAAGATAAGAA
TATTCATCTGCTTATCAATTTTTGATCGTTGCTGCTTTTGAGTCATACTG
CGCATGCGTCTTGAGCATAGATAGATAAGAGAAATAAACGTCTAGATACC
TGCAACTGTTTCTTTTCGTCTTGATCAACAAGATGCTTGGAAGGTGGTTC
GAAAACTTTTCCTGAAAAAATATTTTACAACGAAAAAGTTGCGTTTGCAA
ATTGTGGTTGAAGGAAAAAAAGTTTACTTTTTCACATTGAAGATAGTGAA
ATACCTTTTTAATATAACTTATAAATCGGAATCCGAATGGCTTCGGAGAC
ATACTAACGTCTGTTCGCTAATTTCACGGACTTGGTGTTTCTAGGTGGTG
GCTATTTCCCCTTAAATACGACTTAAAGAGCTTGAATTTTGCATTTCGCG
AAGAAAAAAAACTTGATTTGGACTTTTCCAAATATCTTGCACCAAAATGT
TTCAACTTTCGGCCTATCAGAATTTTTCTTGGGGTTGACTCTCTCGCGAA
GTTTCTGCAAATTGGGTGATCAAGACCTTGCTTACAATGTCATTCCGTTA
GATAAATGCAAAAACTCCTTTGCGACCAACAGAAAATAGTTATAGAACGC
AGGGCCAATAGAATAGTTGGCCAATAGAAACTCTGGAAATTACCGGAAAT
TTTAGCATAGTCATAACAGCGAGTCAATTTAGTTTAATTTATAATAATTT
TACATGCAGTTTTCCTATTGAAAATCTGATGACCCGCATTGATAATAGTG
ACGATATCAGAGTACCACTTTTAAAAAAAGTATTTGGTTGCTTAACTGAC
CGACTGTTCTATTGCCGACTTTCTACTAGTCTAGCAAGCTAGACGACTAA
TCTATACATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATGAATGGAAGAATTTTAG
TCGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAACTCCAAACAAAAGAAAAGTGTCAAT
ATTTGCGATTATAATTTTTTCATGCTCAAAATAATTCTTGAGAAAAAAAA
TTTGTGTGGATTTGTGTATTGAAAGTTTTTCATTTGAGTTGATTTCGTTT
TGAGAGTTTGTTGTTGCTTGATAAATTGTTTTCTCGCTACGCAAGTTTCT
GCGTAGCTAGCCCCTGTATCTATAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAGT
CGTTTATACAAATTAAATCCCGTATTATTATTATTAGTATTGGTATTATT
AGTATTACATGCATTATAAACGACTCCAGTCTAACTTTCTACCTTCCCTT
CTCAAAAATGGAAGATATCCGTATATTTTCGATATCCGTTTCGAACCTTT
TTCGAAAGTTTTTTTAGTTTTGCGTTACTTTTTTTGGAGCTACTTTTTCT
TTTTGTAGAGTAGTAGCGTAGGCATCAACTGAAATTTTCTACGAACTCGT
CATTAGAATAATCTTATTTTTTGGTATTTTAGTGTTTCACTAAGAACGAC
ATTAGACAACGGAGGCTGTATGCGCGATTGCTTCCACACTGTGAACCAGG
TAAGCTAATCTTTTTTGCTTGCTTTCTACAAAATAATTTCTTCATTTTGC
AACCATACATAGCTCAGTCAATAGAACATTCATCTTACATTTCATGGGTT
GTGAGTTTGAGCCCCAGTCACCACCAACTCAGTGAATGATTAGCTTAGAT
GGGGCAATCTGATCAAGGTGGTGAGTTACTGGGAGCAGAGTGCAGTTGTT
GCTTCAGCATTTGTTCTCCCACGTCTAGCGCAAATAGGTTAACCAGTTAA
GCTAATTTTTTTCGCTTGCTTTTTTACAAAATAATTTTCGCTTATGTCAG
CAACCCTTATCACGCCATCACGTATTTCGAGAATCGACAAAATTTGTCAT
CCCGTAAAAAATAGCCTAAAGATTATGTTTTACGTTAACTTTAATGGGTT
TCGGAAAAAATATTTACAGTAAGGTAAGAGAGATTAAGAGAGATTAAATC
TCCGCCTTTCCTTCTTCGTGACGCAAAGTTGTATTATTTTTCTTCTTCTC
TCTCCATATTAAGTGAAGATAGGAATGAGACTGTTACACGCTCTTTCTAT
AAGAATAATTTTATAAGAACATGAGTCTCATCCTAAATAAATAAATTTAA
ATTTATTTTGTAAAATTCGAATTTGGAAGTTAAAGCCAATTTTAGATAAC
AAAAGATTCTTCAGCTCAGCCCCCTTAAAATAACATGGAGGCCGTTAAGA
CAAAATCCAGCATCAAGCTCTTCAACGATTTGTTGTGGTTTTCAAATATT
CTTGCTCTTTTCTCAATTTTCTTCTTTATTTATAAATAACCCAGGTAGTA
TTTTCTTGGTCATAAAATCAAAGGGTCAGATTGTCTTGTTCTTCTAAAAA
CTTTCCCGCCTCAGGCTACTGTTGGTTGGCGGCTAGTTTAATAACAAGAG
TCTTCGTAATGATAAATTTCTTCTTCCCTCCGAACAGGCGGCCAGATACA
TCGCTTTCAAGGCCAGTAAACAACAACTTGATCATTTACCTTTCAAAGTA
CGATCGGTTGCAGTAGAAAAAGACAGCGCGCAGAAGGAGGATGACGTCAT
CAATAAATATTTATGGCTTTTCACACTTTTTGTGATTGCTATTGTCTTGA
TGTTTGGGATTTGGTATCAGAGAAGGCAGAAAGGAACCTCACTCTGGGTA
CCTCCTACCCTCACTGAGCTCGCCAACTCACCCCGTAACGAAACATCGAG
TGCTGTACCAAGGAAAATGTGTAAAGAAATCAGGTAATGTAACAACTTGT
CGTTTAATAATTTTACCCTCTCAAAATACCATCGAGTTTTTTATTTCCCT
ATTTTAATACGTCATTAGTTTATGTAATTTGGCTTAACAGTCAGTCAAGT
TTTTATTGAAAGGTCTTACGTGGTTGGAAAAAGAAACATTGCAATATTTT
CACTAGACTGTCATCTAGTTAGAAATTTTTTTTTTGCAACCATGCACATG
CGAACGGTGTGGCCGGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCATTCACCTTACAGTC
CAAGGGTTGTGGGTTCGATCCCCAGTCACCGCCAACTCAGCAAATGATGA
GTAGCTTAATAGTTAAGATACTAGGAGCTTGGCGCTCTACTTCTCCCACT
TGCTCAAGTAGAAAAGAGGATAGACTTTCTCACTGCCGGCCCCGCCGACA
GCCACCAGATGAATATACTTAATATACTTACACGTGAACTGTAACAATGA
GATGAGAAGTAAGGAATAACATCCTGAATATGGTGCCGATTCCAAACGCA
ATACCTTCATGAACACACACGGCTCTCGCTGCTCAAGCCGGATGAAGATA
TGATAGTGTAGTTTCCCGTAAATCACCGATTAAGCGCCTGGTACATGTTT
TGGTGAATATTACTCCTTCGTAGCCTTCCTACCCTCGCATCACTCCCTGT
CTAGAACGTATGATTGCTGACTGGGTTCTCGGGGGTATTGCAGACCTTAA
ACCCCGAATAAAGTTAAATCAAATTTTACTCCTACAATTTCTCATACAGG
CCGTCTCACATGCCAATTCTCCACAGCGACGATGAAGACCTGGAAAAAGA
AAGTTGCCTACCATCATCGAGGTGTCTAATCAATTCTTCTTCAGAAATTG
TCTCGCTTATTCAACATCTACTACAGAATCTCAAGGGTTCATTTTATGAT
CAAAATGTACATCATTGTACTGTCTGGTCTTTAATGAGCAATTCAATTTT
ATATCCATATAAATGGTTGGGCAAACATTTCCAGGGGGTATCTCAAGAAG
AATTTCCAGGGGGTCTAAAGGGGTGTTTTTTTTTAATTTTCATGAGAGTA
AAAGACTGATTTTAGTTCGTGTAGCTTTTCTATAAGGCATGAAAAGAATT
TTTCCAAGGGTTTTGTGCAAATTTTACCATTTTCCAGGGACCCTCCACAC
ATTTCCAGAAATCTTTTCGACTCGAAAAGGTTCGCCCAATGATATTTTAG
TTTCCAAATAGCGTTGGTGTAAACTCTACAATACAATTCTTTTGATAATG
ACAATCTGGTTACAGTATTGATTTGGAGTTTTCTTTAAGTTTAGATTCTG
TTCATTTATAATTTCTGTTTTTTTTTTCTACTAGTGCCAACGAGGATGAA
GGGACAGACTGCGACCATAAAGAAAAGGTAATTTTCAAAATAAAGCCTCC
GAAAGTACACTCTCTCTCTTTATACTCAATTCTTTGCACTGTTTCAACAA
AATATGATTATAATGATTTTTGCCTCGTTTATTTTTTTTCGTGAAATGAT
ACAAAAAATAGGCACTGCAATCATTCTATAAACAAAAGCCTTTTAATGTT
ATAAAAACTCCGGAATTACACAGAATTTGCCGCCCGTGTCTACGTTCTGG
AAATTATATCTTAAAAATCAAATTTTTCGCACTTTCTTTTTTCAGATAAT
AAAAGATAATCCATATATTCTACATTTTGCTATACACTATGGCTTCATGG
ATCTCTTCAAAGAGCAGCTAGATGACCTGAAGAATATCAATCTTCAAGAT
CACAATGGGCGGACACCACTTCATGTAGCGATCGCTTTACAACGTCATGA
AATGTTCGAAGAATTAATAGCAGTAAAAGGAATCGACCTCAATATAAGGG
ATGGGAACGGAGAAACACCTCTCATGGAAGCTTGCAATGCTTATTCCACA
GGTTGGGAATTATTTTATGGTAGATCTTCATTCTGAACTTCAGTTGAGCT
ATATAATCAAACAATGAGTGTCTGTGTGTCACAAAAACTTTAGGGTAGCC
TGGAGACCTCAAAAATGGTCGGTTTTGGCTGAAATTCGGCACCATTGTTC
CTTGGGTGAATATGTGGCGGTAATTTTTTCAAGTTTCAAAAATTTTGATT
TTTGGGACCTAGGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTTAAACTTTGAA
GCAGCCTGGAGACTTAATAAATGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACAC
TTGTTTCTTAGTATTTGAGCATCTACAATTGGGCCTTTATGACGTGTGTT
TTGTTTTTTATTTTTGCTCTCATATTCTTTTAACGCCCCAGCTGACAATT
AGGCTAGGCTAGACTTACCTCTTTTCTCTGTCCTATTCCAACAATACATT
GCTTACAAAGTTGACACATAAAACACATTGACAGAAGTATTCCCCATGCA
ATGTTTGTATCGAATCTACCATAAAAACGAAAGTGGTCTCTTCTTCTCAG
TGGCTTCTGTTAGTCGCTTCATCGAAAAGGCTTTTTAAGATTTCAACCAA
TGATTTCAATGATCTATCCCTGGACATTTCGATTTTTTATCCCCTGAACA
CGCGTTTTACCCGGAAACAAGCATCAAATCGACCCTCTGGACAAAATTTA
CCACATGGACATGGCAGTTTTTTATGATTCTTCAATACCACTGGACAATA
TATCCTCAACCCCCTATGAACGGTTCTTTTCTGGAAGAGCACAATTGTAC
CTTGGAAACGAAAACGTTGAAAATGTTTCATGATGTTTTTTTTAATTTCC
GAATTTCAGACCAGGTGCAAAAGCTGTTGAAAGCTGGAAGCAAAGCAACT
TTGACTAATCGGCAAGGGAAAACGGCATTGCATGTTTCGGCACAAATTGA
TAACTACCAAGCAGTCAGATTGTTAGTGGAAGTCAACTCGAATGTTAACA
AACAAGATTCAATGGTAAGGCTGATAAGATTTTTAGATCTCTGGTTTTTA
TTTTGGGTCTTTGTTGATTGGTGGTGTTTGCAATGTGTGTCAACTGAGAA
GTAGTTCTTCATTCAACTATCAGTATCACCAAGCAAGAGAAACAAAATAA
ACATGACAATGACAATATTCAGTGAGATTCTCGTGATTTCATTGGCTAAA
AGATATCACGTACTCAAGAGTCTAAATATGGTTTTTAGTGATCCCTGTAT
ATTCTGTATCCCAACTCAAAAGATCATCCATTATATTTTGCAACCAATCT
TGAGCTCATTATATCTTATTAAGCTGGCATCTTTTCCACGTGTTAGCAAA
AAGGTACGAATACCTAAAGGGCGAATAGACTTTAATTTAATTTAATTTTT
AGGGACGAACACCTTTACATTTGGCCATCCTTGAAGATTCAGAGCAGTCC
ACCATCATTCTCCTTCAGAGTGGTTCTAATACGTCGATCAGAGATACGGA
CGGACTAACGCCTCTTGCGTTATGTCAAATATCGAAGAATGAGAGATTGG
AAATATTACTTCGCGATCATGAAGAGAAAAAGGGTTCTGATGATGATTTA
TTGCCGCGTCAGCAGAAAGTTAAGAAAAAGGTCGAATCGCATATGACGAA
AAAAGACACAAAGCCGAAAAAGAAAGATCGCAATCAGCGAACTGTGGACA
AACGAGCAAGACTCTCCCGTAAACGTAAAAAGCTTGATAGTGTTTGCTCT
TCAAGTACACTTAATGATAGTCTGTGTAGCCTTTCACCTGAGATTAAGCT
ACCTTTTTGCGAGAGTGCACACCAAGAGACGAGGAAACGACAGTGGAGTG
AAACACATTCAAATATAACGCATGGTTACACATCAGATGAATGTTCACCA
TATAAAGAGATGAATGGAAACAAACTTTTACGAAACCATGACAACAAGTC
TGAAAACAACTCGTCGAGTCAGGAACCCAAAAAAATGACAAAAAAATGTA
AAATTAACACAAAGCGGAAACAATTTCCGAGTGTTGATTGTTCTACGGAT
GGTTTGGAGAGCCCGACGAATCGCTTTGATTTTGGTTTCAATCTTTCTTC
AATGATGAATAAATCTTTGATTGATAATGATAGAATGTTTGAAGATGATG
TCTTTGTTGGCAGCAATGTCCTTCACCAAGCGTTGACCTGTTTGATTGAC
CCTTTACCAACATTAACGACATCCTCATGGTCGACTGATGCACATAGCCC
CATTTCTGACACTTCCTTTTGAGCATTTTTGGAAATAAGAAAATGACATC
TCTGATGGTATATTCTTGTTTTACTCACGAAGATCATCACTTGATCATTG
ACTAATATGACTACAAGATGTTCTTAAGAAGAAAATCATTTTCATATGCT
CCTGCATTCATTCAATCAGTGAGATTTTAATTTGGATGTTAATCCTCCTA
TTTCTGGCTTAAGGGCTCATAGTGAAAAAGCAATTTCAGAATTTGAAGAT
AAAACCTTATGTTTTCGCTTCTTTGACATGTTTAAGAAAACACAAAAAAG
CCTAATCTCCTTGGGCAAATCATTTTATTGTTTCAAACTTTTTTTAAGTT
AATGAGAAATAATTTCTTTATTTAGATTTTTCCGGAAAAATTTTCTATTT
GGCTACATCCCAAGTTATAGCTGTTTTCGTATGGAAATTTAGTGGAGAAA
ATTGCCAAAAATGAGTTTTTTTGGAGATTTTAAAGGAAAGATACTTCCAC
AAAAAATTTCCGAAATTGTATTTTTAGATACTAAATAGATACATCACCTG
AACCAAAAATAATTCCAAAATGTTTGATTTTTACCGAGATTAGGGCTTTG
AAAGGTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042096	XLOC_042096	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_469	supercontig	scaffold_469:269595..286501 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.200443	0.167571	0.122414	0.0842293	0.358933	0.179368	0.322921	0.339466	0	0.27469	0.326607	0.0645856	0.135882	0.461886	0	0	0.0596348	0.302125	0.0847667	0.0988804	0	0	0.013738	0.063431	0	0	0.186023	0.135688	0.148331	0.147735

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00067390 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NOTC2 (Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo sapiens GN=NOTCH2 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 145.976 bits (367), Expect = 4.257e-35
Identity = 172/691 (24.89%), Postives = 294/691 (42.55%), Query Frame = 3

Query:  138 CACLDGYTGKFCETEINHCESAPCLXXXXXXXXXXXXS---CACAEGFGGKKCSTDL-QERCK--EMCVHGL------------CEKG---------------------ACECHQGWSGLTCQ-----DESCPSECNQQFSE-------CNQACNIPQCQFDHYRCTLGID-PFKGCRKTSCRQATGDGRCDVECNIAECLFDGGDCR-NRSTCDLEEKCSIQYGNQRCDKECDNAGCGYDALECRSNVTKNLLPGKLVLDISSNQNQTXXXXXXXXXXXXX---------XNSRVNVVEIRRGGEETVNRRK-----RNVKSSDRQSVS---LRTTLDNGGCMRDCFHTVNQAARYIAFKASKQQLDHLPFKVRSVAVEKDSAQKEDDVINKYLWLFTLFVIAIVLMFG-IWYQRRQKGTSLWVPPTLT---ELANSPRNETSS--AVPRK-MCKEIRPSHMPILHSDDEDLEKESCLPSSSANEDEGTDCDHKEKIIKDNPYILHFAIHYGFMDLFKEQLDDLKNINLQDHNGRTPLHVAIALQRHEMFEELIAVKGIDLNIRDGNGETPLM---------------EACNAYSTDQVQKLLKAG-SKATLTNRQGKTALHVSAQIDNYQAVRLLVEVNSNVNKQDSMGRTPLHLAILEDSEQSTIILLQSG-SNTSIRDTDGLTPLAL 1928
            C C   +TG+ CET ++ C   PCLNGG C    N      C C  GF G +C +   Q +C+  E CVH              CE G                     +C+C   +SG  C+       + P+ C  Q+         C++ACN   CQ+D   C+L ++ P+  C          + +CD  CN  ECLFD  +C+ N  TC  ++ C+  + +  CD+ C++  CG+D L+C ++  +NL  G LV+ +     Q +++                    +S+  ++     GE++   +K     R++     Q V+   +   +DN  C++D  H         A  AS      L + + SV  E  + ++   +   YL    + +I  +++ G I  +R++K  SLW+P   T   + +N  R E     AV  K +  ++  +++    + +  ++ E   P     EDE    +  + I +                 + +Q  +  +I       RTP   ++AL   +  +E   V  +D+N+R  +G TPLM               E     S + +  L+  G S    T+R G+ ALH++A+     A + L++  ++ N QD+MGR PLH A+  D++    IL+++  ++   R  DG TPL L
Sbjct: 1290 CVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAGSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLL---YLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRP---------------WTQQHLEAADIR------RTP---SLALTPPQAEQE---VDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLIL 1950

HSP 2 Score: 99.7525 bits (247), Expect = 6.501e-21
Identity = 57/160 (35.62%), Postives = 83/160 (51.88%), Query Frame = 3

Query: 1422 LHFAIHYGFMDLFKEQLDDLKNINLQDHNGRTPLHVAIALQRHEMFEELIAVKGIDLNIRDGNGETPLMEACNAYSTDQVQKLLKAGSKATLTNRQGKTALHVSAQIDNYQAVRLLVEVNSNVNKQDSMGRTPLHLAILEDSEQSTIILLQSGSNTSIRD 1901
            LH A  Y   D  K  LD   + N QD+ GR PLH A+A     +F+ LI  +  DL+ R  +G TPL+ A        V +L+   +     +  GK+ALH +A ++N +A  LL++  +N + QD+   TPL LA  E S ++  ILL   +N  I D
Sbjct: 1881 LHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD 2040

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00067390 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00067390 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1

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x 1

POSITION

0


Match Name	E-value	Identity	Description
NOTC2	4.257e-35	24.89	Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00067390 (transcript) - C. hemisphaerica

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