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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00067363 ID=TCONS_00067363|Name=TCONS_00067363|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2694bp TAGAATTGAGCAACAAAGTTGACCAGCTATCAATGGAATCAAAATCTGTA AAGGACCTAACAAAGACACATTGGAACTTGCCAGAGCCTGTTTCCATCTT CTTTGGACGAGAAAGTTTGATTAAATCCATTCACTTGAAACTTCAACAAA ATCAAGCAGTTGCTTTGAGTGAAATGGGAGGTGTGGGGAAAACACAAACC GCTGCAAAGTTCGTTCAAATACACAAGGATGAATATCAGAAGATATTTTG GATTTCTGCTGTCAGCCTCAAGAGATCTCTGAACGAGATTTTGTGTGCAT TTGGTTGTAAACAACTAATACCTGATGAACCTTCGATGGAAACTCTTGCT TTCATTTTCCTCTCTAAGATTTGTGAAGGCTCCCAAGGATCGCTAGTTGT ATTGGATGACGTCACTGAGGTCACAAAAGACGTCACTTCATTCATTCGaa atgtgaaagaaaaaatcagcTTATTGTTGACATCTCAATTGAGGGATTGG GAAGATTATGATTTGATTCAAATTGCTGTTCCATGTTTCCAAGAACAAGA ATCCATGGGCTTCTTACAGAATGAACTTTCTTCAGCCAGCCAACATGACA TCTCCTTTTTAGCGAGTCGTTTACAATCATTACCTTTAGCCCTTCACCAA GCCATTTGTTACATCAAGAAACATAAAGTTCCTCTACACAAATACATCGA ACAATTCGAAGTTTGCAGAGAAATTGTTTTGGGAATGAAAATCAATTCTT TTACTGAATATGACAAAACATTGTTGACAGTTTGGGATTTGGCTTTTGAG AAAATTCGGGTCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGTTCTTGGGAATGATGGC TTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagacaTTCAGCTATTTTGATA AAGTTGACGAATTTGAATTAAATGANAAGAATGCTCTTTTGATCTTGGGA ATGATGGCTTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagacaTTCAGCTA TTTTGATAAAGTTGACGAATTTGAATTAAGTGAAATCATCAATCTGCTTT GTCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAACGAATATTTAGAAATTCACAGT CTTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTATTGAACAAAAACAATTTGTTAA GGACGAATGTCCGTTGACACTTCTTGAAGGTGTTCTTTTGAAAATCAAGT CTTCTGTTGCGGTTTTGGGATTAAATGCTGACTGTGAAGATTTATGGTAC ATCCATGTTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCACTCAAAACTATCAACTT TGATGTTTCCCTTGTGTTAAATATCGCCATAGGCAGAATGGAGATGGAAA ACTTTTACCAAATTTCTGAACttcttttaaaagttttgtttaaaCAATAT AGGTTGTTTCGAGATGTGGAAACTTTTCACACGTTGTTGCTTGTTCATCA TCGTTTCATAAACGCGTCAATTAATTTAGGTTTGCTTAATTTGAATGaga tttttgcttttgaagAAGAGTTTTCCTCAGAGCTTGAAGAACattttgaa gaagtttaccAGTGGAAGCTACAGCAAGCTGAGGTATATAATGTACATGG ACGAGTGTCGTTATTCAATGATATCGTTCGAAATTTATTTAATGAACTTG TCAAGAAGAAAGGATTTGataatattaaattaaaattggcGAGACATCTC ACTGCAAGGGATGTTGAAGTTTTGTTGATTTCCGTTGACACAAATAATCT CAGTGACGAGGAATTTTTGATGTATTATGATGCAAAATGTTCTTTATACA TCCAGAATGGTTGCTTTGATTTAGCTGAACAAACCATGAACGATTGGAAA GAACATATACAAAGACAAACATTTTCTCGAATATGGCACTTTAACTTGAC AAAAAGGAATTGCTTTTTACTTTACAAGAAAGGAAATTACAACGAAGCGC TTCTTGCATGCGATGTTCTTAAACCAGACATTGTTTTTACTGGTGCAAAT GTTTTCATTTGGGAAGCAttgattttgatcaaattaGGAAAGTTCAACGA TGCAGAAGTGTTACTTGATGACCTTGACCAACACAATAAGATTACCATTG AAATCAGTTCATACCTGAAATTTCGAAAGCATGACTTTGAAGCAGTAGAA AATTTCCTAATCGATGGGGAAGATGAGCGTCagtcaaatcttttgttttc ggTAAAGGAATATGCGAAACTGCATCGACAACTCAAAAATAATAAATCGA AAGAATTGGTTGAACAATGTCTGCAAATGAAGAAAAGTATAACTAAGTTC TTTGAAGAAGATTTAAATTCGATTCGTTTTTGAAATGCAATTTTATCAAA TTGTGATTAGAATCGCATGTTTGGGAATTACTCCAActtttggctaaaat ttttaACTGACTGCAATGTAATTGTTGTATTGACTTGGCCTGGAAAAGCA GAAATGgaagtgtttttattttaattatgaAAATATTCTAAGGGGtgttt tcagggggtacccgattccgccaTTCGGTCTAAATTTTGTCCAATTTCTG TCACACCGTCAAGTTCAAGTCTGAAATTCCACCACCGAAAATTTCCAATG AAATTGAttcttttctccaaaattccagaattttgactttttggtgTAAA TTCCGAAATTTCGAACGATTATTTGCCAAATTCCATTTTTTCGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_469:540596..552172+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00067363 ID=TCONS_00067363|Name=TCONS_00067363|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11577bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_469:540596..552172+ (Clytia hemisphaerica) TAGAATTGAGCAACAAAGTTGACCAGCTATCAATGGAATCAAAATCTGTA
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ATTATTTGCCAAATTCCATTTTTTCGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1491911889:540596..540649 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1491911889:540596..540649 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1510915933:540596..540649 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1510915933:540596..540649 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1575043694:540596..540649 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1575043694:540596..540649 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1491911889:549533..552172 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1491911889:549533..552172 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1510915933:549533..552172 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1510915933:549533..552172 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1575043694:549533..552172 | TCONS_00067363-exon-scaffold_469-1575043694:549533..552172 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_469 | supercontig | scaffold_469:540596..552172 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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