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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00066525 ID=TCONS_00066525|Name=TCONS_00066525|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=611bp
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GTCGGCTCCCT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_456:759644..776034+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00066525 ID=TCONS_00066525|Name=TCONS_00066525|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16391bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_456:759644..776034+ (Clytia hemisphaerica)
gtttttatatattttcttttaaaacatgttgatttatgaaaatatgaaaa
aagcattttccaaaatttaatcCGAAAGCTTTGTTTTTCTCCCTTTTTAC
ATACACCCTTTACGATGCACTTcgaaaaacctgaaaaacgtAGAGTATCC
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aattttcaaaacaaaaattgatttcaaatatgcGCATATCTAACAAAACT
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GGGAGAGTTCCCATTAGCGACGTGTATTGAACATTGATCGTTGTTAGAAA
CAAAGTATTCTCAAGAGAAAATTTTCTATTCCCACTGATATAATTACATT
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ACAAACAGCcctaaacaaaacaaaattagtCTGTACTCCTAAAGCTACCA
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GAGGGGGTTTCAATCGACTTTGCTAATCATAAAGAGTAAAACAATATAGT
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GAGGAATCATTTTAGGTAGTATAAGTAGGGAAAAAGTATAGAAAGCAGCT
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TGTAATTATCTGCGATTTAGATTAGAAAGAAGTGAGTTATATTTCAGGCA
CCTATCTTGAGTGGAACTTGAGTAGAATCGTGCAATTTTATGTTGAATAG
TTTGACTATGTTATTATTGAATtctttaaatcttaaaattctttatcggc
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TGATGGCTAATACTGTACTCTCTACATAGATTTAATAcgcaaatacacgt
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ATGAAGAAATCCCAATTATTCATATCATGGTTTCCTCCTTGACTGCCTGT
AGAAACCTGTTTGGATGAGCCATGTTTTGAATGGTGATGTTTTGAATGGT
GATGACGTCTATGTCTCCTAGTAGAGATGAAAATAAGTGAAAATCTCGAA
TCTTAACTGTCCTATCAAgccaatagaccttatcggagttttttattttt
ctaaaacagcgatgcattgtgggattgtttcgggagtattacagtagaat
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GACCCAATCGAATTTATAAATGCCGATTTTACATATTGTTAAACCATCCA
TCTGGTTTGATCACACTGGTCACACCTTTTGTTAATACCCTTGTTAGTCG
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TTCAAGAAAGTAGTTGCTACAAGTAAAGACATGGTCATTTTGAGGCTTAA
AAGTGAACCACTTACCGCCACCTTGATTCAACGATGGCCAAGACAGCCAA
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TGAAAAACAGAGAATTAATACATAAATACAAAACCAATACTAActctgaa
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CACCCcgttctcacagacccggtaggattttttcagccagtggggatgaa
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tggctggggatttcaattcttttgttttcaagtcagagataattcagtgg
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tattttcagtggggacgaaaattggaggataatttgccaccggggacgat
attttgacaatttttttcagtgggtctgtgaggaGTGTAGTAAATAATCA
TTTGTTATTCGATGAAAAATGAGTTACAAGTTCATCTGTGTGACGAATGC
TAAAACTGCTTCTAAAATGTATACAACTGttgcaaattttctttttggag
TATTCACGAATACAGGATTCGTAAAACGGTGAAGAATTCATTTCTACTGA
AGCAAGCCTTAGTAAGTTAAAAGATGGTACTTACCTTACCGTACTTATCA
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TATAATTTGCGTTTACTAAATTTATATGAATTTGTATCTCAGACAGACAA
CCATAAATTTGACAGAACCTAATTTTAAACAATGAACTTGTCTAGTAAAA
ACAATAGCGAAGGCNACCATAAATTTGACAGAACCAAATTTAAACAATGA
ACTTGTCTATTAAAAACAATAGCGAAGGATTAATTAGAGTTAAATGAGAC
ACGTGGCATTTATCAAATAATAGAACGTCTTGAAATCAAGCTGCGTCGAA
ATACAATTTGACAGAACCTAATTTTAAACAATGAACTTGTCTAGTAAAAA
CAATAGCGAAGGCTTAATTAGAGTTAAATGAGACACGTGGCatttatcga
ataatagaacgtcTTGAAATCAAGCTGCGTTGAAATACAAACAAAAGAAC
GTTGAAAAGTCAgtctttttttacttaaaatctaTGAGAGCGTCTAGAAA
AGTCTCGTACATGACCCCCTTGTGAGACAGTTTTTCCGGGGGCTTTATAG
AGCTGATATTTCTAATGCTCAAACAGTTTTTAAGAAGGTTGAATTAATAC
TTTTACAGGGGGTTGATGCCCTGCAACACATGTACATTTTTTTGGAGAAT
TCAAATATTATACCAATATTTGACATTGATTGTCTTAAGCAAAACACGAG
GACGAgcatatctttgtttgctagATGTCTAATATTGatattaagcaaaa
attttccGCTTTCACCGAATCATATCATACACGCTAAAGAggatgaaaaa
tatttgatgtcaTATTATCTTTATAACTTGAAAATCTTATCGAAATAGTC
TTTAGAATTgtacttttgaaattttgaaaaaaatatttacaaaaatccat
aaaaatttggaagttctagaaatggaaaaaatatataacaaatTTAAAAG
CTTTTATACACCCTAACTGGGTGTTTTCACACCCAAACTGGGTGTTTTCA
AACCCAAACTTGGTGTTTTCGTCTCACATTTATATCCCCTTAAACACGtg
tattccaaaaaaaaaattctagggAGTGGTCCGAAAGTATCTGAGGGGTG
CTATAGATTCTTTCCACCCTTAGGGGGTGGGGtctcaaaaaaattcatgt
cTTTAGGGGGGTTCTATATTAGGAGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATATATTGACTGGTTAGGGGGGAGCTT
TAACTTTTTGAGACTATCAAGGGATCAAGGAGGGGgtcgatttttttttg
gaattattaAAAACATCCTCCACCCTACACTAGTAGATATTTTTGACCAC
TCCCTTAGACCACACGTTGAAGAAGCGAAGAAGCAATATTTTCTGTTCAC
GGAGAAGAATAACCTTAAATATTTTCGCTAAGTCTCTTAGAAATAAAAAT
TCAGAGGAGAATTTAATAATGTCATATATAATCTCCAAGATGTGCAATCA
ACCTCTGAAATTTCGACAAAAATCCAGGAAATCACAATCCAAAAACGACC
TCTTCGTTCAacataggtaaaattttcttaaatcaaCCTAATTGCGAAGT
GATAATATATGTTTCTAATGNaaaggtaaaattttcttaaaacaacCTAA
TTGCGAAGTGATAATATatgtttcgaatgtttttcttacACACCATCTTT
AGTTCATTGGTTGATAGTAGACAGCATCGTTATCATAGCATTCTTGTTCA
CAATAAGGACAATCAATCAATTGTAAGGATTTGCTAAGACATACGGTAGT
GCTCATCAATACGTACCCATCAACACCCTTGGAAAAGATAATCGAAAATT
CATGAATTTACCGACATTTCTGTTGATTTTTCCAACAGATGTTGTTTTTG
TCAAAGGAGAAAAAACGCTCTCTAAGACTATGTTCGCATGTAACGGTTCC
GTTTCGGTTCCGTttcggttccgtttcgctccgaaacgaaatgaaaccAT
Tcgattggttagaagtgacgtaaaattgaatttaaccgaaagaatggctt
catttcatTTCGgggcgaaacggaaccgtagcgtGTGAACAAGGTCTAAT
AATGTAAGGGAAATTAGATTTTATCCAAAACGGGAACGTATCGAAAAGTG
GGAATTTTCCCTGATTCGATAATCACGAGGTCAATATCGAACTATTGAGt
ccagaaataaaaactttatcTTACAAAATTATGAGTCCCCACAATTTATT
TTCTATAAAACTAGAGCCAAATGAATGGATCAACAAGACAAACTCTATCG
CCAGAACAAGAAAGTAAACGACATTAAATTTAGAAAGGTTTCTAAGAGAT
TTTAATAATATTTGGAAATTTGTTAGTCTTAAACGCGTGTTTTCATCGAC
GAAGTCTATTTGCAAGGATTTCACaattttgaagtaataaaatgtTTATC
TCAGACTTTATATatctgaattttaattaactGAGTACTTAACTCATTGT
AGAATTGATGCTAACCCTAAACTgctgaaataaatttttgtagAGCCAAT
ACTAATTTACCTTACATTCAAAGCTGGCTGGCACAAGACGTTTAACGTTA
AGTTGCAATTAAGATGATAATTTTTTAAGCAATCTTTCTGTTCCCGTGCC
ACTCACTTTCAAAGACTCACCCTCTTTCTATCTTAAAAACGCCCTGAGAG
TGTGTATCTCGACAAACCTTGACTTTCTGGCAAGTCGCACATCCCTTTTT
CGTCAGCCCATTGTCGATTGCTTTTTTCACGTCGGCTCCCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_456 | supercontig | scaffold_456:759644..776034 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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