TCONS_00065605 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00065605
Unique Name	TCONS_00065605
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2194

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_440:264966..289236-
coding sequence from alignment at scaffold_440:264966..289236-

transcript sequence

>TCONS_00065605 ID=TCONS_00065605|Name=TCONS_00065605|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2194bp
ATGCGTGGAATGTTATTGAATAACGACTTGCTGAAGGCTGGATTTTGATC
AGAACATAAGAAAACATCTATTAAAGTAAATACCCATAATAACCAAAAGA
ATTGAATGCAAGATGGTTTCACTAAAATTACTATTCACAGTGGCTTTACT
ACACATTGTTATTGAAATGTGTTATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTG
GTGGGAAATTAAAATGTTGCacaaagaaagattcgaattgttTTGTCAAA
GTGAATAATTCAAGAAGACGTGGAAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGA
TGATTATTGTAAATTCACAAATGATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCA
AATCACTATGCAGAAGACAGGCTAAAAACTGCGAAGTATCATCCTGGCAA
GCGTGGGGCAAATGCAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAAC
ACGAAGAATCTTACAAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCC
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ATAACGTCCAATCAGATTACATCAATAGACCCACATATTCATATTGTGTA
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TGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCGTTGTCATGGTGATTGGATCCGTCTCGG
TGATATCATTCCAAATTGCACgtgtaaagaaaagaaattcgccaattttg
tttttgtgtaagGAAAAGATTTTGAATAACATCAACAATAGTTTCTAGAT
TTGgtttagtttttttagaatATGACTTTGACCAAATGAAATTGTTGCTT
GGTGAATTTTTAACACAGGAACAGTAAATATTGTATGGATGATAATGGCT
GGTTAAAGTGTTCCATGAAAAAGAATAATTAGACTGGAGATTAATGAGCC
GAAACGGAGCTTCagatgacagattgaatctagctaCCGAGAGAGGCAGA
CACACCAAGTATCAGGTTTTCTAATCCTGGCCGAAACAATGTCCATTTAA
CGTCCATGACATCCAAAAAGCGTttaatgaacgttgaaacaacatcgaga
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aaaaagttttatttttacaaaataacatTTACtatattgaaattaaaaaa
gttaacaaaTTTATTCTTTAAACTAAATCTTTTCTCACTGACATACCTTA
AATTTTTCAACCCTGGAGCGTTTTGCTCCAATTCAGCTTTAATATTTGTT
ACACCAAAGTCTTCCAGTAGACTAAGATTAGTCTTGAATTAAAAAGATGC
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GAAAAATATACTTTTCATatgtttttagaaattttcagtcGACTTTGATA
GTTCTTCTTAGCtttacacacccctgtctcacagccccggtgggacttgt
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AGGTCTGAAGAACTTATATAATGAAAAAACCATGTTTTAAACACCTCGCT
GCAcagaaaaaaatgcttttaaaaatacttttttcggggggggg

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00065605-protein

>TCONS_00065605-protein ID=TCONS_00065605-protein|Name=TCONS_00065605-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=282bp
MVSLKLLFTVALLHIVIEMCYGMCDQRPFGGKLKCCTKKDSNCFVKVNNS
RRRGNQNTICYCDDYCKFTNDCCSDVSKVKSLCRRQAKNCEVSSWQAWGK
CSAKCGIGFMKRTRRILQTPENGGESCPVLRQTRGCNVNRCDNTKNKYKA
AIVLPINFRREKFGDYGYENILPAINENDNNVQSDYINRPTYSYCVHYRH
SYKRDACQNTWAASFQTSVPVCVECQSRVMNGGHCRGEGAIGVRTRWKAL
GVARCHGDWIRLGDIIPNCTCKEKKFANFVFV

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_440:264966..289236-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00065605 ID=TCONS_00065605|Name=TCONS_00065605|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=24271bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_440:264966..289236- (Clytia hemisphaerica)
ATGCGTGGAATGTTATTGAATAACGACTTGCTGAAGGCTGGATTTTGATC
AGGTATTTTTCGTATAATTCAATGTCTTTGTTTATATTTTTTGTTCTTTT
TGCGAGACATAAACGATCATCGATGGATCATCCACAAATCTATAAAGCCC
GAAGCGCTATATAGAGTGCTTTGGCTGAAAAATGTACTGTGGTTAGGTAG
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GGTATAGGTTTTTAACAGATTTTTAAAATCGATGACAATCTATGAATAAT
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TATTTTAGCTATCTATTATCGGTTGTAGACCATTTCCAAGCCATCGATAA
TATTGATAAAATAATCTGGCGTTTGACAAGCTAGATTATTTAAGTCTTAG
AACTTGGGAATTAAATAACTAAACTGTATTTTATAAACAGTTACGATTTA
AAAAAAAGTTAAAACCTCAACATTTTAAGTTCCTAATCTCTTGTAAGTTA
ATAAGTTTTTCGTAAAACTCGTAAAGGGAATTTGAGCTCAGTGACTTATT
CACACTTTGGACTAAAATATTTCACACCGGATGCATAAGGATATCAAGAT
TTACATTATATAATAGGGTTATATAAGATTTCATTTCAATAAATATATGA
TTCAGTTGATACCAAAGTATTACTAGGAGATTTTCACCTCGTTTGTAGTG
GAGACTTATGGATATGATGATATTTCCTGTTCTATTAAATTTTATTTTAT
GTTTTCACGATCAGTTGACCTTTCCAAGGCTCCTCTTCACGGGCTTCTCA
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CGATAAGTGTGCGCACTCTTTTTCATTTAAACCAATAACTTTTGAAGGAA
TTCCTCAATCTTTATAAATTTGGCATCGTTGGAAAGATATTTGTGAGTGG
AACAATTTGAAGTAAAAAGTCTTTAAAAAAATTCTAAAAACGAAGATGAT
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TTTTCACTGAAGAGATTCTTTGATCTTAGGAGGTCATCACTGTGAAGAAA
TTTCACTAAAATATTTATTTAATATAAAGTTATGATACAAAGTTAATAAG
TGATTGACTCCAAAAAACAGCAGAAAAAAGCAGAAAACAGCGTTTTTAGA
CGTCAATTATCTTTTGACTGAATGATTATTTTTGATAAATTTTTTTCACA
TGGCTTTCGTATTATTGGTAGAGAAGTATCATAGTTTGAAAATTAACGGA
GAAAGTTTCTCAGTGATACTCCCCTTTGTCACGGTGAAAATAAGAGCTCT
ATCAGGGTGTCTACGGGACCTTGGAAACCTTGAAAACCTTGAAATCTATC
AATTTTCTGGGAAAAACCTTGAAAACCTTGAAAAGTAGTTCTTCGTATTC
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ATCTTACAAACTTATCTGAGAGCAGGGATCTTATTTTAGCCCGGTGAATG
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ATTCCCTGGTCTTGAAAATCTATTCGCCGGTCGATGAAATTTAGCTGCTA
ACTTATTTCTATCCATTCATTCAAAAAGTAAGAATAAATACTTTCCTAAA
CTGTTTGTCATGGGGAAATTTCCAAAAATCGTCTGCAGTGCTAAATTTTT
ATAACATTTAGAGAATTCTATATTTACATGTTTCTGTTGCGATTCTGTCT
CAAGGAATGCAACATATTATTTTATCATTAGCTGAGTTTTTGAGTTTCCC
AATTTTCTTCAGGGCCATTATTTCATTCATATTATATCACGTTACGCTAT
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CGTTTATCCTTAAAATTTCAAGCATCGAAAATAATTTCCTTAAAACAACA
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AGGTCACTGTAAACATTTGGTTTTTACTTCTAATTCTTTATTTCAACAGT
TGGAAAGACTAGGTAGCTGGAGTAAAAATGTGGTATATATCGTTCTCGAG
AGGGAGATAGGAATTTAACTGTGGAAATAATTCGCAGGCTGCCAAAAGCC
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TTTGAGTTTTAAGCCGAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTGACTAC
ATTTTCTTAAGAAATAGAGTCTACAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTAT
TCTTAACATTTTGGCTATCGAAGCCTTATGTTCTCATATAGTTTGTTCTC
ATAAAAAAAACTGTATTGATTGACAAGTTTATGTAATTGTTGTGATTCTG
ATTCAGGATACACGTTTATCAATAGGGATTTCGAGCTAAGGGCATGATGA
TATGCTATAGATTTTCCAATAACATTTTTTTCCAAAGAGATCTTAACAAA
GCCGTCAATTTATTTTTGATACCACATAAAACTCGGGGCACTCAGTCAAA
ATTGAAGACAACGTGGCATAGGTAGCCTCTAGAGTTTTTTTATCATTTGA
CCAAATTGTCTTCTTTAGGCCCTTTAGGGTCAAATAAGAGAAAAATGCAC
GGGCAAATAATGCCATGTCTTTTATTTTGCTTCAGTTTTAGGGTTAAAGT
TAAAATCAATCCAAGCTCTGAAGGTATTTTCGGGTATTTTACATTCTCTC
CAAAATAAGCTTAGCTAGGTACTACTGAGAGTGTGTTTTTAACTTCAAAA
GGCTTAATAAATTTATTTTTTTCAAAGACCCATATTCAAAAATTATGACA
TTTAAAAAGGTGTAAAAAGGTAGTATAACATAACGTATAAAAAGTTATGT
CTTTAAAGACGTTAAGAAGGTCTTTCCGTAATAACAATTTTAAACCGATT
TTAAAGTGTAAAGGTTATACATAACAAAACACTTGAAAAGCAGGACAAGC
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ATGTATCATAACAAATTTTGCAAATGCACAGTGTGATTTGTGAGAGCTCC
TTCTCTCTGCAGCATAGCAAGTGAAGTTCACGTTACAACGGTTCAAGCAA
GAGTGGTATGTATGTATCTATATGCTGAGATATCAATATTTTATCTTCAC
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AAGGCTTCGATAGCCAAAATGTTAAGAACAAAATAACGTTTTAAGGCTTT
GTGGATTCAAAAACACCATATTTCTTAGGAATAATTTCTTATGGTCAAAA
TAAGTACTAGTAATAACATGGTTTAGAGGGTGATTTGGGATTAATAACCC
GAGGGGTTATTAATCCAAGGTTATCAATCCAAAATCACCAGAGAATACCA
TGTTATTCCGCGTTAATTATATGGTCAAAAAAGAATTGAAGAACACTCAA
TCGCTATTCTTTTCGAAACTTATAAAAACATTCGAAACTATAAAAAAACA
TTCGACTGACACTCTTATTTTGATTGGCTTAAAAATTTCGTACGATCGTA
CTTTTCTTTCAACCAATAGAAATTTTAAAGATTTATCGCCCCGCTCGTCC
GTTACAAATCTAAGCTAAATGTAATCAACCATATAATTAGAAAATTAAGA
ACATTTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATTCGAAGGCTTCAA
AAATGTTGGATTTCTTATGAAAAAACGTTTTTCAGACCAGTAACTTTACA
GAAATTTTACTTCGGCTGCCTGTTTCTAGGACATAACGGAACGTGTTATT
GACACTCCACTCAAGATTCACCCAAATATTTGTTTTATGTAACTTAAACC
TTCATTAAGGAACAAACTTGTCCTGATTGCTTGTTTGTTTTTTCATTTCC
TTTATTGGACCTGGCGGCTGACATCTGCAGTTTGGCCTTGGCACCAATTC
TGTCATCTTTAACTGTGCAACAAATCTTTTCGGCTGTTTGACTTGGACAA
TCGGTTATACAACCCCCTCTCTATAACACTTACAAAGGCTCATTGGAACG
TAAATTTGTTTGACCTATGGAGAGCTTGGGTACTAAATTTCCGAGCAAAA
TGACAGGAAAATGTGTTTAAGTTGTCTAAAAAATTTGAAGGTTAAGATTA
TACTTTCTCATAGAAGGTTTCCCCTCGATATGTCGTTAAAAGACCTTTTT
AGAAGACTGGATGCTTCTTCCGTCCGAAAATAAGAATACACTACAAACAT
GCCCAGAAGCGGCCGTAGTGCAAAGGAAAAGCGTTGACTGCAATCTCCGG
CTTGGTCATATCAAGTACTTCGCACTTAGTAAAAAATGGTACATGATACC
TATTTACTTGGTTTTTAGTAATTAAGTGAAGGATAATGGGTAAGTGGAAT
AATCCATTGAAAAAAATTGCCCCCCTCTCCTACCTTCGGGAGAATAGCTA
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GGGGGTCCTATAGCTGTTTGCGTGATGTCGTGATAGGAACTTTTTCCAGC
GTGATTACGTGATTTGGAAATTTAAAACGTTAAGAGTCTAAAACGTGATC
GTGATTTGAAAGATTAGCCGGGATGCGTGATTTGGACTTTTCCAAAGGGA
TGCGTGACTATCCAATTTTTTTGCTGTTTTACGTGATCGTGGTTGAAGAC
AAAAAATTGCGTGATATCGTGATCAGAGTTACCGCTGGGGGAGCTTCCTT
AAAGGAAGCCTATAAAAGTATCATCTCCGCGATCAACAGACTTTTCACTG
ATTTATTAGTCTAACATTATTCCCCTACTGTGTTTTCTCCAGTTATGTAA
ATAAATTTGAGATCATCACAGAGAAAGAAAAAATATTGAATTTCTGGCAC
GAGCTGGGAATGGAAATATTTTTTTCTGATCAACTTAAGTATCTCCTTAA
AAACATGATCCCGCCTGTTTCCTTCTTTGTCATAAAACTCTACTTTTTGT
AAGCAATGTGACAAGAGATGCAACTATTCTATTGACAAACTAACCAAGGA
GATTTAAAACGCACTTAGATTTTATTAATCGAAAAAAGTTATCATTTGTA
TCTTCCTAGTAAAATACTCATATAAGCTTTTTCTATATCTATATCTATCT
TTGAATTTTGAAGCCAGGAAATTGCTTTCTTTGTTTTGTGGGAAAACGTT
CTTTGTATTTTTAAAGGGAATTCTTGGGAAATCATTCGTTTTATTATTTT
TGAAAGAAAATCATTTGTGTATTTTTGAAGGAAAATCCAATTCAACAATT
GATTTTTTTAAGGGAACTTTCTAATAAAACACCATAAATAATATGAACAT
GAATTATTTAAGTATTGATTGACACTATAAACATACCTTGTTTAAGAACC
CCATACTTGAAAAGATATTTTCAAGTGCTCTGTTTCTTGTGTGTGCTTTT
TACAGAAAGATTGCTTATATTTTCATCACGATTTTTGTAGTTGTTAAGAA
ATGTTGAGGGTTGCAAAAAACAGAGGTTTGAAATCTGCTTTCAATAGGGT
AGGTTACTTATACGTTTGGTCTTGAAATTGTTTGTAGGGAACGTGTTCTG
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TTCGTGAGAAAATATCATTAATTTACTCTCCTCGCAAATATTGGCCTTAG
AAACGTGTTTATCGAGAAAATAAAACACCCTGAAATGCTCAATCTGCAAA
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ATAATTTTAGGCTAATTTTTTGACATGTGAACCCTCTGAACTGCAGTTTA
AAGTACAGATAATCTTAGCTTAAAACCCCAAGGAAATATGTATGCTATTT
TCGAAACTAAATTGTTAAAATAGAGAAGGGACTGCCTTCTTTTCTATTAA
GAATGTAATTCTGGAAAATTAAGAAGTAGTAGTTGAATTTTGGACCTACT
GACATACGTAACGTTGTTTTAACGCCTATTGAACCTTCTATGTATGTTAT
ATGGAACATTGTGAGTCTATTGCGATTAAAAATGACGTGGTTGAATTTAT
GGTTTGGCAAAAATAGTTGCTGATGTACAGGAAGTTTAAGAATTAAATAA
TTTTTAATTTTGAACAAAGTCTTTTTAAGTATTGATGCCAATAAATCTTA
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GAAATGTTAAGTGTTTGTTTACATTTAAAACAAAAACTTTTTGTTTTAAA
AGCAACTTTAACATGTCATCTTTTTGGCACACGGACTTTGACGTACTTAA
AATAACTAACATATTTTTAACGTAAGCATCTCTTAAAAACAGTATCTATT
TCTAGATTTCCGTTAGATTATTGAAGATATATCAAGACCTTTTGTTAACC
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TTATTGACAAAATAAACGTATTTGAATATAGTCAACTATTGGCAGACTTG
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TATGTAAGGTCATTTCTTTCCGGTCCAATGTGTGTCTGTGTTTGTTCTCT
AGAATTCTTAAAGCTGGCACACAACAACAAAAGCCATTGCAAATCATAAT
TGAAAATGACTTTGATGGTGAATTGCCCTTCATTTAGATTTCAAATCTAC
CTCGTTTAGCTCTTTTAGTAGGATTAATTTAATCTTATTATAAAATGGAT
GCCTGGAATGGATTTCATCTCTTAGCTGGTGCGTAAAGTTGTTTCCACGT
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ATCTGGTACAGGATTTGTATGTATGTTATTCATAATGGGGAGCATATGGG
GTTTGCGATTTCCGAAATACCAAATAATTTTGCTCAAATTTCCGAAAATC
CGTAAAAAATTACTTGCGATTCCAATACCGATTTTTTAGGGGTATTTTCC
CTCATTTTGACTAATTTTCCATCAAATTTGATTTTTCATAAAGAGGATAA
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TTATCCGGTGATTAATCAAGATAGGTAACTTTTGATACTGCACTGCACCA
ATTACTATAATTATGGGTAAAATTTGACATATTGTTATAGATAAGGGTTA
GATATTTACTCTAAATTTCCTTTAAACCAAGAGTTATTTTAGAATTTATA
TCTGTTCAATTCTATCTATGTTGGTACTTTTTCTTTCATTGCAAATCTTT
TTTGAGCTAAATGTACTCTCCTACCACCCCCTCTCCCACAGTGTTTAAAT
GTTAAAACTTTTTCAGTACAAATCTTGAAGTTTATCAAAATCCGTTATGT
AAATCTGCCCTAATTTTTACGAGTATGTGAATTCGATGGGTTTTTATAAA
TAAGGTGAATCACCCCATGTCTACATCCGATGAATGGATAATAAGAGGGC
TTGTGTGACAAAAACCTTTGACCGTTATGTTAATCGAAGTCCAAGTCGGA
TTCCCACTTGTTCGTGAAAACAACGTTGATTCTAATTAAACGTTTCCTTC
AAATTGAATTTTTCACCCTGTTTTTAAGGAACCCAGACATAGCAGTTATA
TTTGCGTGGGTTGATTCACACTGGCTAAAAACAGCAGAATCTCCATGTCA
TGACGTGTCAGGGGTGGGCGTTATACGGATAAATGTACGGATAATGGGTC
CTATGACCTTTTAGTACAAAATATATAAATAGATAGATAGATAGTTGTTT
ATCATAGCAAATAAGTGCACATTATATTCAAATATCTCGATCAGGTACGT
TTTTTGCCTTCAATAGCCCATATTCAGATCGAGGTACTTTCCCCTAAGGC
AAGCCTCGTGTGAAGAGTTATTTTGAACTACAATCCTAGCATTATTGCGT
TGATATTGCGCCACCCCTCTAGTCCAAATGAAAAATCTGTCTAATTTAAG
AGCTGGACAACTTTGTTTGCGCAAGTAATCAAGAAATAGATCAAAGAGCT
GTATTGTCCAAAGAAATGAAACAAAGAAGGGCGGTCTGTGAGATCTTTCG
AGTGGGTTGCTCTAAACAAAAAAGAGAGGATACACTTAAACAACTGATGA
TGATTAAGTGTTTACTTTGAAAGCAAGAGGGTCATTTTTTATGGATCTTG
ATTTTGTTTGGAGGTTTTCATCATAAACTAACAATACTTGACACTTATTC
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TACTAACGAACATCAAGTAATAGCAGATTTCAAATGAGATTTATCGAGAT
TTATGAGGGAGAGTGTTTCATTCCCTGTAAGGAAATATTGATAAAAAATC
ACTATGTTTTATTTTTGACCCTCTGGCTCCTCTGATATCGTTAATGGAGT
ATTGTCCATTTAGCAGCTACATATATTTACCTATCTTTAGATGTTGCCGA
CCTATAAAGGGGCCAAGTGCCATCTCCTACATGATGAATGTTATAGAAGT
AATTATCCTGATTCGAATCAGTTAGGAGTATTGTTTCAGTGCGGATACAT
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GCCTAGTAGACAACGTTGCTGTATAGCCGATGTAATGATTCATGGGAAGT
TGTTGGCGTAGGATGAATGTAGTTTAACGTTTTAAGTCAATAGTTAAGTA
ATGATGGCTTCTGCTTCAAATGGAATAGTTCTACACCCCTGTCTCAAAGC
CCCGGTGAAACCTTTTCCTCAGTGGGGATAAAAAATTTCTATTGAAATCT
TAATGGGATAGAGATTTCATTGTTCCATGGTTAAAAAATTCAATGGGGAT
GATTTTGGAATTCAATTTTTAAACATTGGATCTCGAATGGGGATAAAATC
AAAGTCAAATTCCCAGTCGGGCTGAAATTCTAGGGTATTTCCCCACCGGG
ACGAAATGTTTGCCAAAATTTTCCAGTAGGGCTGGTGTCCCAGCGGGTCT
TTGACACAGGGTGTGTTTTTACATTAAATAGATTTTTTATGATATAAAAT
TCGTGACAATTAAAAAAAGTTAAATAGTTTCTAATTAACCTATGTATTAA
CCCTAACGCTACACAAGGATTGAATCCGAGTTTGCCGTGTTTTAAATGTC
GTAAAAATCCTCTATATCCCGATCAATTCTTGGTCAACCCGGTCAAAATC
GAACAAGATCTGGTAAAATACCTTTTCATAGTCACCCCGGTGGGTTTTAA
AACTTAATCGACTTACTGAGACAGGGGTGTTGATCTTGTATTAAGGTTGC
ATTATATATGACACACCAGACAATTTGTAATGGTCAATGTAACACTTCTG
CTGCTACATTTATTAATTTCGCTTAGCGAAAGTATTACGATAGCCTTTCT
GCGGCGGCGGCGGGGGAGAATTTTTTTGGGGCGAAGATTATGGCGTTGGC
GTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGTAAAGTAGATTTCAGATTA
GCTTTAATCTCTACTTCTTCTTTTTCCCATGCGGTTCAAATTCTAGGCGA
AATTTTCGACTTCATGTCGTCTTGTTTCGTTTTAAATGAGTCAGCAAGTT
CAATTTAACGTTCATGGAACGTTATTTGAACCATAGAAGGACGTTGGTAC
AATGTTATGTGTCAGGTGGGCAGGATGAGCTGTCATCCTTCTATCAACAA
CCAAAACACAATTGTTCATTTCATGTCAATGTTATTGATGCTTGACCAAA
ACCACTGAACAGGATATAGTTGGCTGGAGAGATCTGTTTCTATAAGAATA
ACAAGATTTCGGTTTATTCTTCAAGTCTATTCTTATTTTTTTCAGGAATC
TCATGCTTGTTTTCGTGAAATTCTGGATAAATTACCCTCGGTCAAATTTC
GAAATGTTTTAAATTTCCCTCGTTGCACTCGGGAAATTTCAAAAAATTTC
AAAATTTACCTCGGGAAATTTATCCCGAATTTCCCTCATAACCATGAGAT
TACTAGTACAAATTGCCTCATTTGCTTGAAACATTACAAGAAAATTCCTT
GTTAATTTTTGTTCTTCTTTTGACAAAAATTTCATATTTTCAACCATTTT
TTAGCCATCAATAAGCTCCACTTTTAAGAATTCTAAGCCTCGTTGTAATA
TTGTACCTGTTCTTATAAATCACAGAACATTAGACAGCAGGATACAAGAT
CTCAAATGAAACTCTAATATGAACACTTTAAGTCGATTTCAATTTATGAA
GAAATCTTAAGTTGATATTTCGTCCCACAAGTTCTCACAACCTTCTTAAA
AGCATGTTACTGTTTTTTATGGTAATTGTAAATACACTTAGATACTCCGG
TAAAGAATCTACAAAAATGCAGCAGTACATGTATTGAGTCCTTGAGACTA
TTTCAAGAAGATAATTTTGAAGCTCTTCATCTCAGAGATTTTTCTTGGTT
CAAAATCTCCGTCACGTTAAATGTTTGGATTAGAACTGAAACAATAGTTT
GTTGTTCATAATTGACAATGTGTGACATTGGTATAAAATCGCAATGGGTT
TTGTATAAATTTTCAGATCACTTTGGTCTTTGATCACGTTAATCTATCAT
TTTATTTTCCGTATAACTTTTGTATAGTGTTGTAGTGATGGATTGGAATG
ACATTTTTAATGGTTAACTTTTGCTGACTACTTAAGGTAACAAAAACCAT
TGGGAATTTATTGAAAAGAATTCTGGGGACCAGGGCGGCTGATTGACCTC
ACTCAATTAAGAGAATTTTCAGAGTTGTTTAATTTTAGTTAAATTTACGA
AGTTTTCCCTACCTAGCTGGTGCGTATAACGTCGCTAAATGGGCGTCAAA
ACAACGCAGCTAGGTCCCTGGTAACGCCAGCGCTGACCCCTTTTTCAAAA
TCACAAGACTTTAGCAAAGAGAAAAATCATCAGTAAATCCTAATTCCGGA
TCAACCCTTCCTTATATTTTCTTCCACTTAATAATTACAACTAAGAGCTA
ATCTAAAGAGACTTAAAAGTGATTAATTAATTAAGGATAAAGCTCACTTG
GAAATTAAGTGTTCTAATTCATTCTATATTCTGTTATCAATCAATCGAAA
GTTTGAATGAGAATTTAAAAACAATTAATCACTGCCTTTTACACCTATAC
ATTCAAATAACTCTTAGGTCATAATACCTCTATTGATCAGTGATTAGTAC
AGTCTTATCATTGCTTAGCATCAATTAATACCCTCTAGGTGGTAGACCCG
GAAGCTCTTTCATCTAACATACAAGCCTCTAGTTATAAGAACAGTGAAAA
AGTTATACTCTCAAATTTTGGAATTCTTGGAACAATGGTTTATTGAATGT
ACCCGTTTTTAACCCATTAAATTGGACACATCCCATGGTCCAAAGTCAAT
ATGTGTTACTAGAGGCTATGTGATGAATTTGTTATTGCGTAAATTTTTAT
TCAGAGTTCTTAAGAATTAAAGCTTTTTAGTTTCAGGCATACTACATTTA
GACGCTAAACACCAATGTCATAGTATGACTCGTCTAAACAAGGAATCAAT
GGCACCGTGTATTATATTACAATGTGATCTATATAAAAGTTGTGCTATTT
TGCCAGGAAAAACTTAAGTTATTGCGTGCTATTCTGGTATCTCAGTTTGA
CAAAGAGATCTAAAGTTTGAGCCGTCTGTAGGTTTGATGTGTTACCTAGC
TGGACTATTTTTTTTTTTCTACGTTTTTTCTTCCTCTCTGAGTTATCCCA
TAATTAATTACTTGATAATAGGTAGTACACCCATTTCCAGGTTCTTTGAG
AAAAATCATAATACGAGAATGAATAGTCTTGTATGAATTCATTTTAAAAG
ATCTGCATGCTACCGAAATTCACATAAAGAGTCCTATTCATATAATCAAA
TATCAAACGGAGATGAGTTACCCGAAGGGAGGAAATCCTGTTAGTATATA
AAGGAGAGACAGGACCAACTCTCTATCTTAAAAACGGAAGTTTAGTTAGT
TTACACATGAAAACTTTAGATGAATAACATTGTTTAGACAGAGTATATAT
AACGTGAATTGTAACCAACAATGATGTCTTTTGGTGATTACAAGATTGAC
TTGTGATGTGTTCATTTCATAAGTGTTTGTTAACACATAATTACAGTAGA
CAAGTTAACCATTCTTCTACAAATGAGATTAGTGTACGTTACATTTTGTA
AAAGTTATGAATTGGTGATACTGTATATTTTGTAGAATTGAACGTNTGTT
ACATTTTGTGAAACTTATGAATTGGTGATACTGTATATTTTGTAGAGTTT
TGTAGTTGGTTCTGGTTTTACATTAAGACAGGGAACTAACCTACACAACG
CCACTTTGATTACATGGCTCCTAGTGGGTAGAACATGTCTTAGAGACCCA
AGGCGCAAGAGAGTTACTAGCCAGCAGTGGGGATATAACGAACGAACAAA
TTAAATACCAATGGCTAAAATGATCTCTTGTTTATGGATAGGAATTATAA
ATTTAAAGCACTTTAATGTTTGAATAATCTCAAAATTACAATGACAGTTT
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AGTATTTTGGCCGATCTTTCTAGGATTCCAGCGTCTAGAGGGTCTTGTCG
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AAGCTGGATCTTTGCTTTGCTTGGAGATAACTTTGATGTATAAAAACTTG
ACTACATTTTCATGCAGATTTAAGGTATTTTTTTATGATATGGAAACGAG
GCGAGGTGCGCCTCTATGCTGACAAAGCAGAATTTGCTCAGTCTTCTGCC
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GAGATTTCTTTTTCTTTCTTATAGCTTACATTACAGATTCTTAATTCTTT
GACATGTTGGTCACGCGTACTCAGCTGATCTATGTCATTATTAATAGACT
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TATCAGTAAAAAAAGGAGCAGTGGAGCAGTGTTAATAAGTGCTGCCGATC
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ATAAATGACCTTTTTGGTTGATTGATTTTTTCCTCCTGTGTTGATATCTT
AGAAAATGATTCTATAATATTTTTGTTTTGGAAACTGTATTTTGATTGAC
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ACTAGCTATATATAAAGATACGAACAAGAAATATTGTTATTTTTGTTCGA
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GATTTGAGTTTAGTTCGTTTTAGACTGTTTGTTGTTTCAGAAATGGCTCA
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GGAAGTGTTGAGGATCAAGAAGAGGGGCTTTGCAAGCAATTCAAAAACAG
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TTTTTAATATCCCCTGTGCCATATACCTGTTGGGACTCCAATTTCCGATT
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GATCTACTATCCCTATTGGGGTTTCGAAAAAAATGTTCATCCCAACTGTG
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GAGATTAAGTTCATGAAGTTGTGTTAAAAAATTAGGATTGTGTCAGTCTT
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ATCTTTACATATGACATTTCATTATAATAATCTTGAGCCTCAGTTACAGA
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AATCTGGGTTTTCTTTTCTAAAACCCTATATCATATTACTTAAAAAAATC
TCATGTAGAAAAAAACCCCTCCTCTATGGTGTTTTAGTCTGCTTATTTTC
ATTGACTTGACTGTTAGTTACTTGACCTTTAGTGAAACTCTTATGATTTT
TTTGTATTTTGCTTGGAAAGTTACGTGCTTGAAATAAGAGTGTTTTCTAT
CAAGGGCGTGGTTTAAGGTTGCTTGAAGATACCTGGCTTATATGACGGTG
CCAGCAGTCTGGAAAGAAGGGAAATTTTACGCCGGAGCTGCGCCAACTTA
ACTGGAAAAAATTGAAGTCAGCAGATCAAATCTCAAATCTACGCCGGAGA
TATCCGGTGCACAAGCCGCAATTTCCAGACTGCAGGCCAGCTTGATGTTT
CAATATGATTAACGTTTTTTTTGGGTTGTCAGCTACTACAATGCGTCAAA
ACCGTGTCAATACACGTATGTGCATATAATGATTGATGAAAGTATAAGTA
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TTCCAGTCCCTAAGTTTGCTTTTTTATGATTTTGTAGCGAATTTGCCTTT
TATGATTCTGTAGCGCTCACTAAATTGTAGCTGGGCACGAAATTAGACAA
AAAGAGCTTTTATACCTTATCGGGGGGACAAATAAGTCGGGGTTTTAATT
TCTCAGGTAAAAACGGCAACGTGGAAAAATTTTGTCGCCTAGAGATAATT
CCGTCACTTTTCCCCGATCAATATTTCAAATTCATCATCTTTCCCCGAAT
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TTAAATCTTAGCTAAGCTACAGCAAAAACTAACAAAAGGCTGTCAGGAAG
CTCAACCTAGATTTTTGCTTCTGTGTTTGAAGACTTATCGTCCATCAAAA
TGTTTATTTATTTGATGAATTTTAGTCAGTGGGTGAATTTTGGACATCCT
CCATCAATTATGCACAAATTTAAACCAAGTTTGAGCGTTTTTAAATGCAG
CAGAGTTTGAAAAATGGCGGATTTTTTCAAAGTGGTTTACTCCAAAGAAA
AGTGTGAAATTTAGATATTATTCAACCTTTTTGTCCCTGTAAGGGTCGGT
TGTCGGAGCTCAAGATTACTCGACTGTATCGACATCATCAAATTAGCTTA
AATCTACTTCAAACGGGTCGAAAAAGGGTTTTTCGACTTTGTCAAAAAAA
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TGGGACTAAAATCAGCATGCTGGCTTTTAACAAAAAATGTTAAAGAATTA
AAGACCTGGTTTTTTGTTTTTTCAGACAACTTTACTTTTCATTTATGTAA
ATTAAGATTGTGTTATATAGTTTGTTTATTTGGAGACCCAATAATCTTTA
CTTTTCACTGCCGTATATGACGCAGGGTAAGGGAACATAAGTCGGAACCG
TTACACCATTATCGATCGGCAGTGTTACGGGTGGAGGAGAAGTGGAGGGG
CTAAAGGCTTAAAATGAGAATTCGCCAGGAATCTAAGAAAAAAGTCTATT
TTGAGCCTCCCTGCTTCGGTCAGGCCTGTTTTATGAGTTTTTCAAGACGT
AAACCATCGCATGCATAAAAGATCTTGAATCTGTCTTGTAATCNTCGGCC
AGGCCTGTTTTATGGGTTTTTCAAGACGTAAACCATCGCATGCATAAAAG
ATCTTGAATCTGTCTTGTAATCTACTATAAACCCATCAAAAAAATGATCA
CCCAGTCAGTTTAAGAATGGGATGTCTTTTTGTTTTGTTTTGTCAACATA
ATGACGAGACAGACTTTCCGTTAGGTTTTTTTCATCGAGAGCAAACAATC
GCGAAAAAAAACAGCAAAAAAAAAGACTAAGGGAGAAAAAAACATGTACC
CTTGAACTTCAAAATATTTTATATCTCGATGTACTTTTTCCTTTTTGTTT
TTATGACATACACGTTTTTTTATATAAGAACATCCAAAACTTTTGAAGCC
GCCGACGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAATGTTCTTAA
CTTGTTCTTAACCATCGAAGCCTTATGTTCTTATCGACCGCCGGAGGCGG
TTTCTTTCATAGTGGTACTTTGTCTACCATATACTTTCGGTTTTTTTAAC
TAGATTACCCAGGTGTTTCTCTTTTTTTTCGCTGAATGTCTTTTATTCGG
AATTGAATAATCGAGACATGAAAAATGACTATATTGTAATCTGTTTTCAA
TGAATAATCTAAAATGTACTGGAGATGACATGTAGGCGTCAATAATGTGC
GCCCGCTCTTTCGCGAGCGTGATGCGTGATGGAAGGCGGTCGTTTCAGTG
TGGTTTACATGGGCACTGTGACCTAGTATAGTTTTTTCTTATAAAAAAAG
CATCTAGGGTGTTTTGTCAAACAGCTAAAACCATATCGGACTTTGTGCAT
TTTTGTCTTTATTTTTTCTCGCTCTTCTTTCTCCGTTCTTTTTTGTCCGT
TCGTTCGTTTTATTATTTTGTGTCAATATAAGAAATTGACTTATCAAAAC
ACCCTCTTCAAACACAAGATCTGGGGTGTATCAATCGTGTTTTTTTGTAC
AAATATTTCATTCAGAGACACCTTCAGTAACGGTCACTCGAAAGAGAAAT
TACTGTTTTTGAAAACTTATATATTTTTTTGTGGTTACGAGACTTTAGAT
CAAAATACTTTACGGTTTCTGAAAATTGTTCTCGATTCTTGTTTGTGTTT
GACCAGTCAGTGTGGTGGCATGTAAAACATATCGCAAACAAGTATTTCGT
AACCCCTTAACTTTATAATGCAAATTGTAGTAAAAAAAATACGCGAGCGG
AGAAATACCTGTATAATTTTCCACATCCCTATCTCGCAGCTTCGATGGAA
CTTTTTCCCACAGGAGATGGTTTTGGAGTGCAATTTTTTCCGTTAAAATT
CAAGTGGAGATCAAAGTCAACTTTCCAGTGGGTCTGAGATTGTAAGGCAT
TTTCCCATCGGGGACGAAAACTAGGGCAAGTCTTTAAGGTGGGGCGGGGA
TCTCACCGGGCCGACACAGGGGTGTATTTTCTTCTTTCTCTTTTTAACTC
CTATTTCGATACGCAAAATAAGAAAGGTGCCAAAATTAGTGATCAGAGAA
GCCTGACAGACGCCTAAATTGATCCGCCAGACACGACGGATGCGGATATC
TGATATGGTGAATGAGGAAACTCAAGCGATCTCGCAGCGATTTTCCCGAC
GAAGAGGAAAATTTCGGGAGTTTTTGTGAAAATCTGGTGCGGCGGCCGCC
GTACCTGCTGTACCCGTTGCGTCGTGTCTGCCTTTAATTGAATCTTAATT
CTTATACCTATTTTCTATTTTCATTGTAGAACATAAGAAAACATCTATTA
AAGTAAATACCCATAATAACCAAAAGAATTGAATGCAAGATGGTTTCACT
AAAATTACTATTCACAGTGGCTTTACTACACATTGTTATTGAAATGTGTT
ATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTGGTGGGAAATTAAAATGTTGCACA
AAGAAAGATTCGAATTGTTTTGTCAAAGTGAATAATTCAAGAAGACGTGG
AAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGATGATTATTGTAAATTCACAAATG
ATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCAAATCACTATGCAGAAGACGTAAG
TACCCCTTTTTTATGAGGACAAACTATACAAGAACATAAGGCTTCGATGA
CCAAAATCTTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTAAGGCTTTGTGGACTCTA
AAAACACCCAATTTCTTAGGAAAGTGGAACAAAATACTGACAAAATGGTG
AAATTAAACATGTTAAAAACATTTTTAGGCTTAAAATTTAAAAAGTTGAG
AACATCCAAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAATATGTA
TATGGTTTGCCTTAAACCACAGAGTGAATCAAATTTTTTGGAGTTTTGAG
TTAACATTTGTTTTGCAATTCCAATTGCATTTGAGAACTATTTAATGTAC
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AATATAGAATCAAATTTCCCGGGCATTTTCCTAGAATCTCACACCGTGCT
CTAAAAGGGACGCGGTGAATGTGACGTATATTCTCTTACGAAGCAATGAC
CTTTAGAGTTAATACATGCCTTACGTAGAGTAGAAGAATCTGCTTGGCAA
TTAGCAAATTTTCATCTCTATTTAAACTGAGCTCTTTTACCTCATCATCT
GCCTAAAAAATTCCGACCATGTGAATCAAACGAATAATACTTCTTTGTTT
TCTACAGAGGCTAAAAACTGCGAAGTATCATCCTGGCAAGCGTGGGGCAA
ATGCAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAACACGAAGAATCT
TACAAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCCTCCGGCAAACA
CGCGGATGTAATGTCAACAGATGTGATAACACCAAAAATAAATGTAAGTT
GTCTCACATATCTCCACTGATTAATACACAAGGTTGTTGTTAGCTGATTC
ATGTAAAAAGTCACGAAAAAACGTCGAGTAAAAGTGTCGGTAGACTAATT
TCTCAACTGATTAATGAATTTGAAATACTCTAGTGGTCAGCTTGTATCTC
CCGAACTCCTTGAACGCCCTTCGATGATTTTGGCTGATCTTGAGTGCAAA
TAATTCCCCGCTTATGTGAATAAGGAATACCTTAGAACGTGCATTATTTG
ATGTCATATTTCAGGGTTTTGAGTTATACCGAAACTCTTTCTGACATTGT
ACTTCATATTGTAACCAATTTGGGATATTTAGCAGTGGCTTAAGTTATTA
TGACAAACTATTTATTTAATTTTTTATGTTTTCTAGATAAGGCAGCTATA
GTTTTACCAATCAACTTTCGCCGTGAAAAATTCGGTGATTACGGATACGA
AAATATTTTACCAGCTATCAATGAAAATGATAATAACGTCCAATCAGATT
ACATCAATAGACCCACGTGAGTAAATATGATGTAATTGGAGATTGCTTTA
ATAAAATCTAGCTCAGTGAATTAGACAAACAAGGATAGTTTGGCGAAGCA
TTGATTTTTTTTTTAACCAAGGATAATGTAAATTGAAAAGTTCAAAGCTT
AGGTCGTGTTCAGACCAAAGTTTAAAGCAATTAGGTCTACATGTTTCTTT
TATATTCCTTTTGTATCTAACGGCACGCTCCTCATTAGTTAAACCAAAGT
TTGAAAAGGAATCACCCTCTGGTTTTTACGATTTCGTTACAGTTTTCTGA
ATAGACGTAATCAGAATTCGCAGAAAAAAGAGCGTGAAATTTATGACTTA
GAGACGCTCGGAGCATCTCTAGCAGTAATGGCTTAAACGAACACGAATTA
GTGTTTTGCAGAGGGATTCCCTGAAATCTGTTTTGTTTCAAAGTATCTCA
AGAGAGAAGATGACATGATTTCAAGTTAGGAAAGGAGATTCCTCGAGATC
GCCAATCGATGATGACAAAAGAAAAGTGATTATAATTGAATTCCCATATC
AACAAAGTACTACTTAAACCTTAAACTTAAACTTTCAGGTCTGAACACGA
CCTTATTTGAAGGTTTTGACATTAAGTTTTTTGAAGTGTCCAGGGAAGGG
AAACGAGGGAAGGAGACAAAGAATTTGAAAAATCAAGTTTCATCGAAAGA
TGTAAGCATTCAAATGTTATAGCGCGGGAAAATATCCTGTTAAATCAGTT
TTGAACGAAAACTTTAGCATCGTTGAAAAGCTTGTATTGAATTTCTACCT
TTTCTTTTCAGATATTCATATTGTGTACACTACCGTCACTCATACAAAAG
AGATGCCTGTCAAAACACGTGGGCAGCCTCGTTTCAAACCTCGGTTCCAG
TCTGCGTTGAGTGTCAATCACGTGTCATGAACGGAGGGCATTGTCGAGGT
GAGGGTGCTATTGGCGTTCGCACCCGGTGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCG
TTGTCATGGTGATTGGATCCGTCTCGGTGATATCATTCCAAATTGCACGT
GTAAAGAAAAGAAATTCGCCAATTTTGTTTTTGTGTAAGGAAAAGATTTT
GAATAACATCAACAATAGTTTCTAGATTTGGTTTAGTTTTTTTAGAATAT
GACTTTGACCAAATGAAATTGTTGCTTGGTGAATTTTTAACACAGGAACA
GTAAATATTGTATGGATGATAATGGCTGGTTAAAGTGTTCCATGAAAAAG
AATAATTAGACTGGAGATTAATGAGCCGAAACGGAGCTTCAGATGACAGA
TTGAATCTAGCTACCGAGAGAGGCAGACACACCAAGTATCAGGTTTTCTA
ATCCTGGCCGAAACAATGTCCATTTAACGTCCATGACATCCAAAAAGCGT
TTAATGAACGTTGAAACAACATCGAGAGAAGAAAATGATTGAATAGTATC
ACAAAGTGAATATTCAGATAGATGTTTTGAATGCTTGCTAAAGACATTTT
GCTATATCTCAGCAAGAATTTTCTCTGAAAAAGTTTTATTTTTACAAAAT
AACATTTACTATATTGAAATTAAAAAAGTTAACAAATTTATTCTTTAAAC
TAAATCTTTTCTCACTGACATACCTTAAATTTTTCAACCCTGGAGCGTTT
TGCTCCAATTCAGCTTTAATATTTGTTACACCAAAGTCTTCCAGTAGACT
AAGATTAGTCTTGAATTAAAAAGATGCAGCCTTGAGATCAAATTATAACT
TTCTAAATAGCATTTTTTTATAAAAAAATTCATATTTTTGTGTATAGACC
AAAAAAAAATTATTTTGTAATATAGTTTCAAACTCCACTTGTATCTTAGA
GAATGTTTTATAACCCATATTGTGTTTGAAAAATATACTTTTCATATGTT
TTTAGAAATTTTCAGTCGACTTTGATAGTTCTTCTTAGCTTTACACACCC
CTGTCTCACAGCCCCGGTGGGACTTGTTTCCTCAGTGGGGATAAAAATTC
CTATTGAAATTCCAATGGGGATAGCAATTCTATTGTCCAAAGGTTAAATA
ATCAGCAGGGTTTGTTTTGGAGTACAATTTCTAACACTGAATTTCGAATG
GTGATGAAATCAAAGTTAATTTTCCAGTGGGGCTGAAATTTCAGGCTATG
ATTTTTCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGTGCGGGTCTGTGACACAGGGGGTT
TTTTTACTTTAGAATGAATTTTAAGTAAGGTCTGAAGAACTTATATAATG
AAAAAACCATGTTTTAAACACCTCGCTGCACAGAAAAAAATGCTTTTAAA
AATACTTTTTTCGGGGGGGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_440:264966..289236-

>TCONS_00065605 ID=TCONS_00065605|Name=TCONS_00065605|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=3396bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_440:264966..289236- (Clytia hemisphaerica)
ATATTCATATTGTGTACACTACCGTCACTCATACAAAAGAGATGCCTGTC
AAAACACGTGGGCAGCCTCGTTTCAAACCTCGGTTCCAGTCTGCGTTGAG
TGTCAATCACGTGTCATGAACGGAGGGCATTGTCGAGGTGAGGGTGCTAT
TGGCGTTCGCACCCGGTGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCGTTGTCATGGTG
ATTGGATCCGTCTCGGTGATATCATTCCAAATTGCACGTGTAAAGAAAAG
AAATTCGCCAATTTTGTTTTTGTGTAAATAAGGCAGCTATAGTTTTACCA
ATCAACTTTCGCCGTGAAAAATTCGGTGATTACGGATACGAAAATATTTT
ACCAGCTATCAATGAAAATGATAATAACGTCCAATCAGATTACATCAATA
GACCCACAGGCTAAAAACTGCGAAGTATCATCCTGGCAAGCGTGGGGCAA
ATGCAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAACACGAAGAATCT
TACAAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCCTCCGGCAAACA
CGCGGATGTAATGTCAACAGATGTGATAACACCAAAAATAAATATGGTTT
CACTAAAATTACTATTCACAGTGGCTTTACTACACATTGTTATTGAAATG
TGTTATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTGGTGGGAAATTAAAATGTTG
CACAAAGAAAGATTCGAATTGTTTTGTCAAAGTGAATAATTCAAGAAGAC
GTGGAAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGATGATTATTGTAAATTCACA
AATGATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCAAATCACTATGCAGAAGACA
TATTCATATTGTGTACACTACCGTCACTCATACAAAAGAGATGCCTGTCA
AAACACGTGGGCAGCCTCGTTTCAAACCTCGGTTCCAGTCTGCGTTGAGT
GTCAATCACGTGTCATGAACGGAGGGCATTGTCGAGGTGAGGGTGCTATT
GGCGTTCGCACCCGGTGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCGTTGTCATGGTGA
TTGGATCCGTCTCGGTGATATCATTCCAAATTGCACGTGTAAAGAAAAGA
AATTCGCCAATTTTGTTTTTGTGTAAATAAGGCAGCTATAGTTTTACCAA
TCAACTTTCGCCGTGAAAAATTCGGTGATTACGGATACGAAAATATTTTA
CCAGCTATCAATGAAAATGATAATAACGTCCAATCAGATTACATCAATAG
ACCCACAGGCTAAAAACTGCGAAGTATCATCCTGGCAAGCGTGGGGCAAA
TGCAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAACACGAAGAATCTT
ACAAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCCTCCGGCAAACAC
GCGGATGTAATGTCAACAGATGTGATAACACCAAAAATAAATATGGTTTC
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GTTATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTGGTGGGAAATTAAAATGTTGC
ACAAAGAAAGATTCGAATTGTTTTGTCAAAGTGAATAATTCAAGAAGACG
TGGAAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGATGATTATTGTAAATTCACAA
ATGATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCAAATCACTATGCAGAAGACAT
ATTCATATTGTGTACACTACCGTCACTCATACAAAAGAGATGCCTGTCAA
AACACGTGGGCAGCCTCGTTTCAAACCTCGGTTCCAGTCTGCGTTGAGTG
TCAATCACGTGTCATGAACGGAGGGCATTGTCGAGGTGAGGGTGCTATTG
GCGTTCGCACCCGGTGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCGTTGTCATGGTGAT
TGGATCCGTCTCGGTGATATCATTCCAAATTGCACGTGTAAAGAAAAGAA
ATTCGCCAATTTTGTTTTTGTGTAAATAAGGCAGCTATAGTTTTACCAAT
CAACTTTCGCCGTGAAAAATTCGGTGATTACGGATACGAAAATATTTTAC
CAGCTATCAATGAAAATGATAATAACGTCCAATCAGATTACATCAATAGA
CCCACAGGCTAAAAACTGCGAAGTATCATCCTGGCAAGCGTGGGGCAAAT
GCAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAACACGAAGAATCTTA
CAAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCCTCCGGCAAACACG
CGGATGTAATGTCAACAGATGTGATAACACCAAAAATAAATATGGTTTCA
CTAAAATTACTATTCACAGTGGCTTTACTACACATTGTTATTGAAATGTG
TTATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTGGTGGGAAATTAAAATGTTGCA
CAAAGAAAGATTCGAATTGTTTTGTCAAAGTGAATAATTCAAGAAGACGT
GGAAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGATGATTATTGTAAATTCACAAA
TGATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCAAATCACTATGCAGAAGACATA
TTCATATTGTGTACACTACCGTCACTCATACAAAAGAGATGCCTGTCAAA
ACACGTGGGCAGCCTCGTTTCAAACCTCGGTTCCAGTCTGCGTTGAGTGT
CAATCACGTGTCATGAACGGAGGGCATTGTCGAGGTGAGGGTGCTATTGG
CGTTCGCACCCGGTGGAAGGCTTTGGGTGTTGCCCGTTGTCATGGTGATT
GGATCCGTCTCGGTGATATCATTCCAAATTGCACGTGTAAAGAAAAGAAA
TTCGCCAATTTTGTTTTTGTGTAAATAAGGCAGCTATAGTTTTACCAATC
AACTTTCGCCGTGAAAAATTCGGTGATTACGGATACGAAAATATTTTACC
AGCTATCAATGAAAATGATAATAACGTCCAATCAGATTACATCAATAGAC
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CAGTGCAAAATGTGGCATCGGTTTCATGAAGAGAACACGAAGAATCTTAC
AAACACCGGAGAATGGGGGAGAGTCGTGTCCAGTCCTCCGGCAAACACGC
GGATGTAATGTCAACAGATGTGATAACACCAAAAATAAATATGGTTTCAC
TAAAATTACTATTCACAGTGGCTTTACTACACATTGTTATTGAAATGTGT
TATGGCATGTGTGACCAGAGACCTTTTGGTGGGAAATTAAAATGTTGCAC
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GAAACCAAAACACGATTTGCTATTGTGATGATTATTGTAAATTCACAAAT
GATTGTTGCTCAGATGTTTCGAAAGTCAAATCACTATGCAGAAGAC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041099	XLOC_041099	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00065605-protein	TCONS_00065605-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_440	supercontig	scaffold_440:264966..289236 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000884	TSP1_rpt

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00065605 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SBSPO (Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein OS=Homo sapiens GN=SBSPON PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 86.6557 bits (213), Expect = 1.898e-18
Identity = 66/257 (25.68%), Postives = 105/257 (40.86%), Query Frame = 2

Query:  212 KCCTKKDSNCFVKVNNSRRRGNQNTICYCDDYCKFTNDCCSDVSKVKSLCRRQAKNCEVSSWQAWGKCSAKCGIGFMKRTRRILQTPENGGESCPVLRQTRGC---NVNRCDNTKNKYKAAIVLPINFRREKFGDYGYENILPAINENDNNVQSDYINRPTYSYCVHYRHSYKRDACQNTWAASFQTSVPVCVECQSRVMNGG--HCRGEG--AIGVRT-RWKALGVARCHGDWIRLGDIIPNCTCKEKKFANFVFV 958
            +CC  +D  CF +     R       C+CD  C+FT DCC D  +        A+ C V  W  W  C+ +C      R R + Q P+NGG  CP L +  GC   +  +  +  + Y  A +    F +E+       +   + +  D     ++       +C        R      W    +    VCV+CQ   MN     C G+G  + G +T  W+A+G  RC G W ++  +   C+C      +F+F+
Sbjct:   27 RCCPGRDPACFAR---GWRLDRVYGTCFCDQACRFTGDCCFDYDRACP-----ARPCFVGEWSPWSGCADQCKPTTRVRRRSVQQEPQNGGAPCPPLEERAGCLEYSTPQGQDCGHTYVPAFITTSAFNKERTRQATSPHW--STHTEDAGYCMEFKTESLTPHCALENWPLTR------WMQYLREGYTVCVDCQPPAMNSVSLRCSGDGLDSDGNQTLHWQAIGNPRCQGTWKKVRRVD-QCSC--PAVHSFIFI 264

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00065605 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00065605 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SBSPO	1.898e-18	25.68	Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-con...	[more]

You are here

TCONS_00065605 (transcript) - C. hemisphaerica