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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00065022 ID=TCONS_00065022|Name=TCONS_00065022|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2325bp GTTGTGGACTCCTTTCTTCGTCAATTCAATATACGCTTTTCTCCAAGTTG AAAAATGCTCTAGACATTGACCAAAAGGGCATTTCTTAAGTTGGTTCGAC CCAAATAATGTTAAAGCATTTTTAGTCTTGAAATAAAGGTGTGGATGCTC GATACCAAATTTATCAATAGTGATTGATATCGTTTCTGGTTTTGTGATCA AAATTTCTTGGTGAAAAGACACTTTTAGAGTTGTTCCTGTGACTTTAGAT TCTAAAAACCCTGAAGATTTGCCAGTATTAGAATCTAAATTTTGGATGTA TTCGAATGTTCTGACGTTTGTTTTTACGCTTGTTTTCAGGTATATGAAAT ATCTGCCAGGGATGATGGAAGCAATGTTGTTGGAATCAAGTTCTATCTGT CCAAGAACGATACCAGAGTTTACAAAGACTTTGAAGATCATTGTCGGCCA TGATTCGATAGCACTACTATCCACAAAACGTCTTTTATCCCATGTTGGAC AATGACTTTGCACATTCGAATATAAAAGATCCATTGGAAAGCAACTTGGT GTTACAGCTACATCAAAGGATAACTACACGGGTTATTGAACTCTTGGAAA TTCACCTTTAAGTCACACCGTGCTCTTCCTTCACACCGATGTAATATACT TCCTTTGACATCAGCTACACATCTCACAAAAACACGTGCTCTGCTACCAC AAGCTTGACTCTGTTGTTGACTATCTCGTCCAAGCAATGCACTTTCGACA TGTATTCTTTGATTTGGTGGGCATTGAATGTGGTATGTCTTTGGTATGCA TATTGGAATCAGATGTGATGACCCATATGTTGGGGAAACTATgaataatt tttaaacatgtttaCATAAGTCAGATAAATGAAATCTAGTTCAGTTGAAT TCATTCTTCAAATGGATTGCCAACATATGTGGCAGGTATATGTTAAAGAT TAAAGGTCAAATTCACCGTGTTATGCAGGGGAAGAGTAAGACCTTATCCA AAGATATATAGCTATTTCTAGCTCCTAATGTTTATCACCTTCATGGTTTT GCTGTATTGTCTTTGGGCTAGCTTACCGAAATGAGTCAAAAACACCCTTt ctcttaggaaaatggtcaaaaatactcacaaaatggtcaaaataagaaca tgtttaggcttaaaactcaaaaagttaataacatccgaaggctttaaaaa ttttgggtgtgtttataaaaaaagcgtgtagtatgAAGCTTACcttttaa aatgataaaaagcaCAATCCAGTAAACGATATATCTCGATTTTATTAAGA TTAATGACAAATCCATAACCAAATTCAATTGAGCTGGTAAAACTTTTCTT ATATTACCGAATCAAATAAGACAAGGATTTCAGTCCCCTCAATCAAGAAA AATTCCAACAAAATTTTATGTCTTGGTTAACATATGCGGTTCATCTTTAG TCCTTAGACTCTTTTTTATAGTGAATTCCAAGttcctttttcaaaacttt tcttgAGACTATCTTTCAATTCTATTTGTACTTCTTCTTAAATTATTTTG TGAAGGTGTTTTATTAGCAGTTTTTCTATTCGTTATTTGCTAGTCGTCTT TCGCTGGTCGACGCAATAAAAgcttttatttgttttgtttctttgagATC TCTTTGGCGAAAGTTTATTTAACAACATATTCTTATTAACTACCAAAATC AATATAGAAGCTTGATTAGCGGCAAGAGAAAGATGATTAGAACAAATATT ACAGACTCATATATCCCTTCCTTACACAATCGCTAACATTAACGTTAAGA CCTTTTCTAAATTCCAATAAGATTTTCTCTCCATTTTTAACCTTCTACTT TCCGCTATTCCTCGGAGGCCCCCCCCCCTACAAGGGTTAGAAAATGTCGG GTATTTACGGACCGGGCCTCTCGAAAATGTAAATTCTTGcagaatctttt ttataagaacatccaaattcttgaagccttcggatactcttaactttttg tttcAAGTCAGAAATTGTTCTTAATACACTAATTCTCGCCatttttttga gttattttgTCCATtgttctaagaaattgggtgtttaaagccttaaaatg ttcttaacttgttcttggccatcgaagccttatgttcttatatagtttgt tcttatattaaaaacgTGTAGAGAGAGACAAAATCAGCGAAACTGACCTT TAGTAAGACTTTTCGACTTTTTGTAGCTTTTAAAGAGATTTGGGAGACCT tttaaaaaagtgaccctttacgactgcacatacccagcacatgcaccctt ttttataagaatactgtactttggc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_428:439711..446703+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00065022 ID=TCONS_00065022|Name=TCONS_00065022|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6993bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_428:439711..446703+ (Clytia hemisphaerica) GTTGTGGACTCCTTTCTTCGTCAATTCAATATACGCTTTTCTCCAAGTTG
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AAGAGATTTGGGAGACCTtttaaaaaagtgaccctttacgactgcacata
cccagcacatgcacccttttttataagaatactgtactttggc
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1491911889:439711..440278 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1491911889:439711..440278 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1510915933:439711..440278 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1510915933:439711..440278 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1575043694:439711..440278 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1575043694:439711..440278 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1491911889:444947..446703 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1491911889:444947..446703 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1510915933:444947..446703 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1510915933:444947..446703 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1575043694:444947..446703 | TCONS_00065022-exon-scaffold_428-1575043694:444947..446703 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_428 | supercontig | scaffold_428:439711..446703 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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