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transcript sequence >TCONS_00064543 ID=TCONS_00064543|Name=TCONS_00064543|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2696bp ggaaaaattaaaaaaaatccacGTTTTTGTTGGATTAATTGTTTGGTATT GGTggaataattcaaaaaataaaacaaaatagatATAATATAATCTGACT GCagtaaaaaaatgaaagaattatcATTGACACCTGATTCGTTGCTAGAT GGTGAAGATGACATTACGTCACTGGCAGACGCCGACATCGGAGTTGATCG TACTACGCAGAAACGTCGATATAGCCGACTGTCGGATGGTTATGAACGTT TAAAGTCAGTTTTACCAACCGTCAAAGATAAACGTCGTGTATCAAAAGCA CGAATATTAGATGAAGCTATCAATTACATTCAAAGGTTGGAATCGATCAC GAGTGTACTCAAACGAGAACACGaaAAACGACTGAGCATGCTGAATGGAA CGAATGGCTTTTTCCCAGATTACACCGTGCAACCTTACATGAGATCGATA TTCCAGAAGCAGATGTACCCAACAGGTAGCAATTCCAAAATGTCTAATTA CTCAAAAATGAACTCGCCAACCTCCACCGTACCAAAGTCACCACGAATGA AACAATACAATCAATCATCATACTCCTCACCTTCCTCAATGTCGGTCAGT GCTGGAAGCACGGGTGGTAATGGTTCTGCCAACATGACGGGCGGTGGCGC CCTCGATTATAATTACAATAACATCGGAAGTACGTATAATACCGCGTCAT CAATGTACAATCAGCAACCAACCAATGGTGGTTCAGATCCAAATCAAATG CTGAACGGTGATTCGTCACCTATCAATAATGCATCACCTTACAGCGCATG CTCCCTCTCCCCAGGTTCTACACCGACTACATATCAAAATGGCAGCACGA GTAGTGTGGTAAACAATTCATGGCCATATCAAGGTGCTGGCATGAGTTAC AATGATGCCAGCTCACAATTGGCCTCATCTTATAACCCGAACAGACAAAG CCCAAACAGCACATACAATAACTCAAATCCCTACTCCAGTTTGAACAGCG GCATGTGGGGCACTATGGGGTCAACAGGTGGGGGCGTGGCTGACCAATCA TCACATATGGCTCAAAACGCGGCCGCAACTGCTGAACACTCAATGAAAGT TGCATAATATTGTCTcctaaaataaaggaaaaagacCGGATCCAGTAACA GATCTTTTGGTTTTAGCCTGTATACAGATTAAGATAGAATTGAAAGAACA AGTATTGACAGTTGACAGTTCTAGCCCCaattaataaatatttcaatgat AAAGATTCCATGGATTTGATCGAAATCGATTACAGACATCGATATTGCCA AAGCTTGGTATCCCACAAGGACATCCAACATTCTGGAAGTTATAAATTTG AACTATGGCTTTTAAGTAAGTAAAAGTTTGGACAATATGTGTATTTTTAC TGATGAACTTATGAGTTACTGTATGGCAATTTTATGCCTTTTTTAGAAAC AAAAGCTTTGTTTGGTTTTGGCATGaacaaaaaacgttgtttgccGGAGT GAGATATAAATGGCTACgtatttgttttaaaaaaaatcaaaaatgttgat ACTATAAGATATTGTATGAACTAAAAAACTATTATAAATaaatacaaatt ttattttctatctattctcattacacgcttttttttataagaatggtgtt tttcatcatgaatattcttaactttttgggaacaattatcctgaaatatt cttaaggtATTCTTAGGTTTAGATCCAAGATCGAGCATGTAGCACATACC TCAAgcaaaaatttagcatttttgtGGAACCTTTTAACATTGCTGGGTAT AGTGATTGCCAATTAAATGGTAAAATATTCTataatggcattcttagctt cagttaccaaattccatgatggtggtattcttagcatattcttaattttt tggccaattccatcataaatattcttatgaagtatattcttataaaaaaa gcgtgtactgtaATATTATTGGTCTTAAACTTTCAAATTGAAATCTAGGC TTGAAATTTGCGACGACTGATAaagcttaaaatgtttttgtatCTATGAA AATACATACCGTACTTACCTTACTTAACAATCAAAAGCGCCAAAATACAT ACCGCACTtgtaacaatccaaaagttcccttGACAATCAAAAGCGCCGAA ATctcaaaaattcaaatattactgcggtatattcactttttttgcgattt tgacGCTTTTAATTGTTaagggaacttttggattgtcATAGGTAAGTaca catccccttctcacagacctggtagaattttttcagccagtggggataaa agtaacggactgaaactcgatggagattgatatCCTCATATTCTTTATAA CTGGGagtttcaaatctttgttttcaagtcagaaagttCAATGGGCTGGG GAGAAAAGCATGATATTTTGCAgggaggattggtttatttgaatattttc agcggggacaaaatttggaggatgattttccaccagggacgaCTACGTTG GCCActttttccagtggaaaggggttccagtgggtctgtgagaagggggt gtgagTACGGTACAATTCGTTTGTTTAGAAGAACAAGAAACTTTGGAAGA AgcgtttgaaaatatttaactatGAAACTCTCATATTTTTTTCATCGTGA ATTTTCCAAAGAAACAACGGtgattttcttcaacttttcatGTGCT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_419:132643..145991+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00064543 ID=TCONS_00064543|Name=TCONS_00064543|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13349bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:132643..145991+ (Clytia hemisphaerica) ggaaaaattaaaaaaaatccacGTTTTTGTTGGATTAATTGTTTGGTATT
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TTGGCCActttttccagtggaaaggggttccagtgggtctgtgagaaggg
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AGAAgcgtttgaaaatatttaactatGAAACTCTCATATTTTTTTCATCG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:132643..132790 | TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:132643..132790 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1575043694:132643..132790 | TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1575043694:132643..132790 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:135280..135504 | TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:135280..135504 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1510915933:135280..135504 | TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1510915933:135280..135504 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_419 | supercontig | scaffold_419:132643..145991 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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