TCONS_00064543 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00064543
Unique NameTCONS_00064543
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2696

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_419:132643..145991+

Legend: exon
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>TCONS_00064543 ID=TCONS_00064543|Name=TCONS_00064543|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13349bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:132643..145991+ (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040480XLOC_040480Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1575043694:136351..136420TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1575043694:136351..136420Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:143739..145991TCONS_00064543-exon-scaffold_419-1491911889:143739..145991Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_419supercontigscaffold_419:132643..145991 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.121783 0 0 0 0 20.6024 19.2787 9.58403 8.79384 3.99956 7.81687 1.60521 2.17347 0.90732 1.91494 3.79441 5.01624 5.35047 5.39897 7.03044 5.14818 0.457399 0.931358 2.03446 2.62502 0.21953 0.0343056 0 0.0533738
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00064543 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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