TCONS_00063640 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00063640
Unique Name	TCONS_00063640
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2742

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_397:151755..170299+

transcript sequence

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transcript from alignment at scaffold_397:151755..170299+

Legend: exon

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>TCONS_00063640 ID=TCONS_00063640|Name=TCONS_00063640|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18545bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_397:151755..170299+ (Clytia hemisphaerica)
CAATCAGGGGGTGATTCGTGCTAAGTGGAAGTTTAGGTAGGTTTATTTCG
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AATACAAACTTATTTTGAAGATAAAAGCCATTGTTTAGTTGTATCCCGAA
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GTCTTCTCAAGCCGACAAGATTTGCTCAACAAacagaagaaattcaaaga
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TTCCCTTAAATTTTTCACGTGTCTTGTCAACGTGTGTTAGAGTGATGACT
TTTGTTTCATTTCTCTAATACTCACTCATTCAATTCAGTCAATTTTTTCC
GAATTTATTCCGAAGAAGTTTCGTAGCAGTTAGAAGATTTAATATGCGAg
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ATATCttcttcatcattttcattattttaggTTCCCCAAAGGTTTCAAAC
CAGGTCATAAATTGATTGGAACAGTTAGCTTCTCGTCAACTGCCGATAAA
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ACATCTTCTGCCATTTTCTTACACAACATTATGGCTGTTTCGTTTAATAT
TATCCAGACAGGGGTGAAAGAACTTTTTAAGGCCAAAGAAAGTTATTGAA
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TTATTAACTTTTTGTAATATTATACCAATTCTAATTTTCAGAGCAAATAT
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ATTGTTTTCGATTGAAATAATATGAGATCGCCTAATGTTTGCAGTCCATT
ATCGGTAGTTCTGGACCTAGGACCCATACCACCCTGTGCCTTACCCTGCC
CGAGTCCAGATTGGCATTTATTTTTTAGTTTGGGCTTGTACGtgcatttg
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GGgctaaaaagttaattttttttggagttTGTCTTTCTAACGTTCTTCTT
TACCATTTTACTATCTTCGTTGAACATTTTGGTAATTTAGATTTTCTtat
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ATTCTTCGCGCAATGGTTCCCTAAGTAAGTCTCTCAGTAAACAGattatt
aaaaatgaaatacattttctataaagaatatccaaaatttttaaagcgtt
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agatatctgAGGGTCCATGCGAAAAGTCTCCGATAAAGCTTTCCTTTATT
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CGGCTCGTTGACTGCTCAAGAAGCTGTATTGAATGCACTCGACTCCTCTA
AAGTAAGCATAGCTTGCCCTGGTCGTATACTTTTCTATCTGTTATTCGTA
CCCTTCTTTGAAGTTTAGGGACTTTTGACTTCAAAAAACAAGTGGATAGA
GCTGGCTATATATGGCTAAAATACATAGGaggaattgaattttcaatCAG
GAAAAAAAGGGAAACGTAGTATGCGATCACAGTACATTTGATTGCGTTGG
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AGGTTAATTATTCATTCTAAAGTAAAAGTGGCTGCCAGGGTTGTTTATTG
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taatgtataatagctctaaattcaagttagagcatcctttatacaataaa
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aaacctgtatactttttggacctacctccgggtaccccggtggaggttct
ataaattaacctatgtccactccgttcgttcgttcgtccgtccgcccgtc
tgttaccagcttttctcaggattggctcattagttttttctgattttttg
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TACACTAAATCCtcttattgaaaaatatataattttcagGTTACTTTCAT
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ATATCAATGCAACTTATAAATTGGTAAGCTCCCATTCAAGAATATATTAA
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TTGAGATGCTCAAGCACATCAACAATGCGCAAAAATCGTAGAAtgaatat
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TGTCCTGAGGTTTTACTGTACACGTAGTTGATGGACTTCAACTTAACTTT
TCTAGGGACTGGCAATATCAGATGGGTTACTTGAAGCAAGACAATCAGGT
ATGTCAATAAATATTCCTTccaaaggaaaacaaaattatACAAATGTCTC
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TGATTTGATTAATATATCTGGGACTTGAGTAAAAAATAGCAAACCTATCT
CAAGAGTGAaatatatttgatatttttgggaCCCCTAGAATttcttccaa
aatttgggtcagTTTTGACTAAGTTTTAGTCTTGTTCTGGGTCTGGTCTG
GATTTTGTAAAATCGTAACCGTTTGAATTGAAAAGTATTTGGGAATCTTT
CAGAGAGTGAGTTTAATTTTATAACCCTGAAGGAGATTAAGAGGAAAAGA
GTACTCTGTCGCTCGCCAATAGTCTCATCATTCAAAGTTCActccttttt
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AATATTGGTTTCATGTGTTCTTTTCTAGTCGAACGGCTGAACGAATGTTA
TCATAATTTGGCGAAGTTTGTTGATTCGTCTGACGCTAAGGTAGGCTTTT
CCTACGATTTACTATTCATTGGGTGTTTTGATTATGCTGCCAAAGCAGTG
AGTCAGAAAACAGTAAGAGTATGAAATTTAGTCCCCAAAATGTGACGATG
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GAGCGTGTACTTTGAGCTTTATGCAAATAAGTTCTTGTAGTTGATAGTTT
AGTAGTTTAGATCTTCTTTTTAATTTCCTGCACAAAGACGCACAGTCGGA
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GACCtccaattttctttttacaagGTTTCTACTATGTTACGTGTTTTATA
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AATTATTTTAAGATGTTTAAAAATGCAAGTTTCACAAAAGAAGTTAAAGT
GTAGTTGGCTGTTGGTGGTtgaattaaagttgaacgaaacAATTTGTTTA
TATCTACGGATAAATGAATTATAACAACTGTCGGTGCATCAAAATGATGC
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GCTGTAATTTTGTAGCTAATCTCAGCAAGCAAAAACAATTTGTTGCTAAC
TAGAAAAGATAATTGAgaataaattcaaatttaagATGAAAAGTA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_039890	XLOC_039890	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_397	supercontig	scaffold_397:151755..170299 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.24996e-07	2.65751e-06	3.10045e-09	3.48353e-06	0.0689842	1.2877	0.000262358	1.26504e-06	0	0.756272	0	0.431236	0.000326286	3.52576e-10	1.54833e-05	1.97008e-07	1.88642e-10	3.60991e-08	0	0	9.97892e-08	2.00802e-05	0.00658084	4.32748e-09	0	0	0.00103986	0	0	0.00183673

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00063640 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TPP2 (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens GN=TPP2 PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 478.789 bits (1231), Expect = 6.145e-150
Identity = 264/785 (33.63%), Postives = 437/785 (55.67%), Query Frame = 2

Query:   35 SIRRALENTASKIDGLSNLVQGYGLLQVEKAFEFMKEWVAADKCANHIFYQIRTMEGKRGLYLREYKDHNIPEKQTVIITPKFHKNTDNNLKIEFNLNLSLVATQSWVICPAHLNLQNKERGLVIEVRKAGLTQGVHYAEVHAFDTENINMGPVFRIPVTVVIPENINRLLPTTTEFDLG--KLSYRPGQRLRKFFFVPHGATWAELVLSSDEKETDFRYIVHAVQLMADTAFIAYEFDKFLTVKANGTDNKMIFKVKGGSTMELCISRYWNLPGDSTLEGKLSFHGLKPDCGRIHMDGNQNYCRLNVTNEMSMEQISPKATLTHHVIPVAPKENVIRPLGEQDLLPDNEQIYSLEMTYNFNMAKAGEIIPMAPQFHDLLYENKYESQLWMLYDSNKYLIRSGDAFPIKYNYTCKVDKGDHVLRMQIRHSDLPSLEALKDMPIHLQVKLASNISCDVFSSRQDLLNKQKKFKEMTLNKEAFQPVYIAAPAEDKFPKGFKPGHKLIGTVSFSST-----ADKQSKYPFSMSAP-QSKNSAEKKE--NKPEKSLEEQYANGMDEFFAQWFPKLLDSAMEKDIMERFTGSLTAQEAVLNALDSSKERMKNLKKITEAAQKILADIDSEKLLSYFGAKAHQTDEQIKLKEQMDKEKASYINATYKLGLAISDGLL------------------EARQSVERLNECYHNLAKFVDSSDAKMQLLSARHGVAHGHYGRALKALLNHIDENGHTKEMASKVIEMVQKLGFAHIEEYLNKWQQVRFPNSYELF 2305
            S+RRALENTA K D +    QG+G++QV+KA++++   V     AN + + + T+   RG+YLR+      P    V I P F +NT+N+ KI   L+L+L +  SWV CP+HL L N+ R + I V   GL +G+HY EV  +D  + N GP+FR+P+T VI   +N     ++ +DL    + ++PGQ  R F  VP GATWAE+ + S   E   ++++HAVQL+   A+ ++EF KF ++   GT  +  F V GG  +E CI+R+W    D  ++  +SFHG+     ++++  ++   R +V + +  E ++P  TL + V  + P     +PLG +D+LP+N Q+Y + +TYNF+  K+GE+ P  P   +LLYE++++SQLW+++D NK  + SGDA+P  + Y+ K++KGD+ +R+QIRH  +  LE LKD+P  +  +L++ +S D+  +    L  +KK   +TL  +  QP ++ +  +DK PKG  PG  L G+++ S T     AD    + + +  P ++KN ++ KE  ++ EK L+E++   + +   QW  KL  S +  ++ E +   L    A L+ LD+ KERMK L +I +AA  +++ ID   L  Y   K     +   +K  MDK+K++ ++A  + G A++D LL                  E    ++ L E +    K+ D  D K+   + +H + +  YGR LK     ++E   TKE     I++++ LG+ H   +   W  + +P  Y +F
Sbjct:  477 SVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYL---VQNTSFANKLGFTV-TVGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPVFPENTENSEKISLQLHLALTSNSSWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPNAGPLFRVPITAVIAAKVNE----SSHYDLAFTDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEA-FPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKNWVQTLRPVSAKTKPLGSRDVLPNNRQLYEMVLTYNFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYP--HQYSLKLEKGDYTIRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHENHSFALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKIPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLIPPPTKTKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKETYPNYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVDAANAVISHIDQTALAVYIAMKTDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLLHTQAQDGAISTDAEGKEEEGESPLDSLAETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRGLKFATKLVEEK-PTKENWKNCIQLMKLLGWTHCASFTENWLPIMYPPDYCVF 1249

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00063640 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00063640 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TPP2	6.145e-150	33.63	Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens GN=TPP2 PE...	[more]

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TCONS_00063640 (transcript) - C. hemisphaerica