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transcript sequence >TCONS_00061790 ID=TCONS_00061790|Name=TCONS_00061790|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2670bp ttcttatatagtttgttcttataaaaaacgtgtatggttATAATTAGGAT ATCTTGAAACTgcggcattttttcaaaatttcaccgAAAACCTTGCTGCC CTTTATCGCCTTAAGGAACATTGATAAAATGTTGAAGTTAATCAAAGGCG GAGAAATTTAATAATTGATAGACAAATTTAGTAACTTGAATATGTGAATT TTTCCTTGATTTAAATACGAGGCTGGACTCCCGACAATTCTTTATTCATT AACCGCTAGCTGTTCAATTCATCATTCATAATTATTTTGCGTAGTTTAGT TTTGTTATTtcatgtttttcctttttttttcagttggaattctcaaaatt ataaaaaagaaaaattaacgaACAAAGTTAAAGTAGTTATCATcagCATA CTGCCATCTAGATGAATTGGTTTTTGCCCAACCGTAAGAAGTATGTCAAG GAAAAACAGATTCAGACATCAAAACAAATGGTTGTTCAACCAATGGCATT TAGTTCAATCGAAGCCGCCCATCAGAAGGGTGAGGGCGGGAACATGATAA ATGACATCCTTCAAAAGATACAACAAAGCAGCAAAGAAACTTGTCTATGG GGAAAACCCTGCCTCGAAGAGAAGCGAACGGATTGTAGCGAAACAGTTGA TAAACAAACAGTGCTGAAAAATATCGAAGCCAAAGACAGTTTTCATTTTG ATGACTTTTGGGAAGAATTAGCCTTACTTGATAACGAGGCTAGTGTAGAT GATGACGTCAACAATAATAATTTCATCGATCAAGGTTTATATTCGATGTG TCTAGAGCCTAACGATGAGTTACCAATAAAAACCGAAAAACGTCGAGGAA CGAGACTTGTTCGCCGACAATCTTCGGTAGATAGTGGAATCGTCGTTCGC ACACCGAGTGAAAGTTATCAAGATCGATTAGCGCTTGTCAAGTCCCGAGT TAAACGATGCAAAACAACAGATAATACCCTGTCTACATTACAAAGATCAA ATTCGCTTCCTAACCTGAAGGATATAGACTTGAATAAATTTCAAACGATC AAATTTAAAGACTTTGAAGCAtacaaaaaagaacaacaagATAGTAAAAT AGCTGCTGAGTCAGCGAAAAGACATTCAGAAGCGAGAAAGAAACATAAAG ACTTATTCAGTATTCGAAATTACACTCGTGGAAAATACCGTAAAACAAAA CTCTCAGAATTGATCACCAGGAATAATACGTTCTCGATGGGTGAAGGGCG TATGCCGCCACATAAATTGAATGGGCGACCTCTATTTGAAGACTCGCTTG AAGAGAACTATGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGC GATACTTGTTTACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCG ATATCTCTTGAAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaac taCTCCCTATGGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCC CATGCAACTATCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAA TAATATTTCGTCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAAATATGGTTAA GATTTAAAAGTCTTTAATACTTCGTAGAttcttttttattaatttaagtT TGTTAGCCAGAGCTGTGGAAGGATTTATTCGAGATTTAAGGTATAATTAT AAGCGGTAGGAAATGTATAATTCAATCAAACTTTGATTAGTTGTAattgg tacacaacgttgtttgaatgtctATCGAACGTCCAAATACCATTAGATGA TTTTTGAAATAGTCTAGTATTATAACGGTCTAATCCTCCTACTGGTCTAT ATAGACTAAAGGCTATGAGNACCTCTATTTGAAGACTCGCTTGAAGAGAA CTATGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGCGATACTT GTTTACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCGATATCTC TTGAAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaactaCTCCC TATGGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCCCATGCAA CTATCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAATAATATT TCGTCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAAATATGGTTAAGATTTAA AAGTCTTTAATACTTCGTAGAttcttttttattaatttaagtTTGTTAGC CAGAGCTGTGGAAGGATTTATTCGAGATTTAAGGTATAATTATAAGCGGT AGGAAATGTATAATTCAATCAAACTTTGATTAGTTGTAattggtacacaa cgttgtttgaatgtctATCGAACGTCCAAATACCATTAGATGATTTTTGA AATAGTCTAGTATTATAACGGTCTAATCCTCCTACTGGTCTATATAGACT AAAGGCTATGAGATCATTTTCCGGTTAAACTACCGGGTTAGACAAGAACT TTTTCTcccttgaaaaattcaaaatagtttGACCgcctcaattttaaaat aactttattttttactttaataactttaaattttattaaattttgtatAT ATTGTAAAAATTTTCAGTATAATGTCgtaaaattattttctattCTTGGG AATTACAATAAAGATTACAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_360:165060..183602+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061790 ID=TCONS_00061790|Name=TCONS_00061790|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18543bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_360:165060..183602+ (Clytia hemisphaerica) ttcttatatagtttgttcttataaaaaacgtgtatggttATAATTAGGAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:165060..165452 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:165060..165452 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:165060..165452 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:165737..165802 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:165737..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:165737..165802 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:165737..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:165737..165802 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:165737..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | TCONS_00061790-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_360 | supercontig | scaffold_360:165060..183602 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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