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transcript sequence >TCONS_00061789 ID=TCONS_00061789|Name=TCONS_00061789|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2667bp ttcttatatagtttgttcttataaaaaacgtgtatggttATAATTAGGAT ATCTTGAAACTgcggcattttttcaaaatttcaccgAAAACCTTGCTGCC CTTTATCGCCTTAAGGAACATTGATAAAATGTTGAAGTTAATCAAAGGCG GAGAAATTTAATAATTGATAGACAAATTTAGTAACTTGAATATGTGAATT TTTCCTTGATTTAAATACGAGGCTGGACTCCCGACAATTCTTTATTCATT AACCGCTAGCTGTTCAATTCATCATTCATAATTATTTTGCGTAGTTTAGT TTTGTTATTtcatgtttttcctttttttttcagttggaattctcaaaatt ataaaaaagaaaaattaacgaACAAAGTTAAAGTAGTTATCATCATACTG CCATCTAGATGAATTGGTTTTTGCCCAACCGTAAGAAGTATGTCAAGGAA AAACAGATTCAGACATCAAAACAAATGGTTGTTCAACCAATGGCATTTAG TTCAATCGAAGCCGCCCATCAGAAGGGTGAGGGCGGGAACATGATAAATG ACATCCTTCAAAAGATACAACAAAGCAGCAAAGAAACTTGTCTATGGGGA AAACCCTGCCTCGAAGAGAAGCGAACGGATTGTAGCGAAACAGTTGATAA ACAAACAGTGCTGAAAAATATCGAAGCCAAAGACAGTTTTCATTTTGATG ACTTTTGGGAAGAATTAGCCTTACTTGATAACGAGGCTAGTGTAGATGAT GACGTCAACAATAATAATTTCATCGATCAAGGTTTATATTCGATGTGTCT AGAGCCTAACGATGAGTTACCAATAAAAACCGAAAAACGTCGAGGAACGA GACTTGTTCGCCGACAATCTTCGGTAGATAGTGGAATCGTCGTTCGCACA CCGAGTGAAAGTTATCAAGATCGATTAGCGCTTGTCAAGTCCCGAGTTAA ACGATGCAAAACAACAGATAATACCCTGTCTACATTACAAAGATCAAATT CGCTTCCTAACCTGAAGGATATAGACTTGAATAAATTTCAAACGATCAAA TTTAAAGACTTTGAAGCAtacaaaaaagaacaacaagATAGTAAAATAGC TGCTGAGTCAGCGAAAAGACATTCAGAAGCGAGAAAGAAACATAAAGACT TATTCAGTATTCGAAATTACACTCGTGGAAAATACCGTAAAACAAAACTC TCAGAATTGATCACCAGGAATAATACGTTCTCGATGGGTGAAGGGCGTAT GCCGCCACATAAATTGAATGGGCGACCTCTATTTGAAGACTCGCTTGAAG AGAACTATGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGCGAT ACTTGTTTACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCGATA TCTCTTGAAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaactaC TCCCTATGGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCCCAT GCAACTATCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAATAA TATTTCGTCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAAATATGGTTAAGAT TTAAAAGTCTTTAATACTTCGTAGAttcttttttattaatttaagtTTGT TAGCCAGAGCTGTGGAAGGATTTATTCGAGATTTAAGGTATAATTATAAG CGGTAGGAAATGTATAATTCAATCAAACTTTGATTAGTTGTAattggtac acaacgttgtttgaatgtctATCGAACGTCCAAATACCATTAGATGATTT TTGAAATAGTCTAGTATTATAACGGTCTAATCCTCCTACTGGTCTATATA GACTAAAGGCTATGAGNACCTCTATTTGAAGACTCGCTTGAAGAGAACTA TGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGCGATACTTGTT TACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCGATATCTCTTG AAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaactaCTCCCTAT GGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCCCATGCAACTA TCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAATAATATTTCG TCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAAATATGGTTAAGATTTAAAAG TCTTTAATACTTCGTAGAttcttttttattaatttaagtTTGTTAGCCAG AGCTGTGGAAGGATTTATTCGAGATTTAAGGTATAATTATAAGCGGTAGG AAATGTATAATTCAATCAAACTTTGATTAGTTGTAattggtacacaacgt tgtttgaatgtctATCGAACGTCCAAATACCATTAGATGATTTTTGAAAT AGTCTAGTATTATAACGGTCTAATCCTCCTACTGGTCTATATAGACTAAA GGCTATGAGATCATTTTCCGGTTAAACTACCGGGTTAGACAAGAACTTTT TCTcccttgaaaaattcaaaatagtttGACCgcctcaattttaaaataac tttattttttactttaataactttaaattttattaaattttgtatATATT GTAAAAATTTTCAGTATAATGTCgtaaaattattttctattCTTGGGAAT TACAATAAAGATTACAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_360:165060..183602+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061789 ID=TCONS_00061789|Name=TCONS_00061789|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18543bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_360:165060..183602+ (Clytia hemisphaerica) ttcttatatagtttgttcttataaaaaacgtgtatggttATAATTAGGAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:165060..165452 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:165060..165452 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:165060..165452 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:165060..165452 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:165740..165802 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:165740..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:165740..165802 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:165740..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:165740..165802 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:165740..165802 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | TCONS_00061789-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_360 | supercontig | scaffold_360:165060..183602 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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