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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00060918 ID=TCONS_00060918|Name=TCONS_00060918|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7951bp CCTGAATCTTGTTTCGATTTTCGTTTCTGTTTGAGATCGATGCTCTCGGT GGCCGAATCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAATATctcttct tcttttgttttttcgtNCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAAT AtctattcttcttttgttttttcgtgGAAGAAACAGTGACTGGTTCACTA GCTGGTTTAGTGACATTCTTCTTGGTTAGATCagcttttgatttttgaag agCAATCTGATCGAAGATGTTTAGAGGGACTTCTTTGTAGGTAGGCGGTT GGTTGCTGGATGTTCCTGCCATTTGCTTTGAAGGGAGTACTGCAACATCG TGCAAAACAACTTTACTTTTCTTGAGATGAAAAGCGGCGCTTGATGACGG TAACTGGTTGTCGGGGTGTGACTTGGCGGTTAGAGATGCTGATTTTGTTG GGTGGCTATTGGTAAGCGTTGAAGAAGGCGATACGGCTTTGTTTTGATCG AGCGTTTGTTGGGATGACGTTGGAAGTGAACTGAGGATACGAAGTTCTGC ATTCGGATTATTCATCCATTTTTGGATCCTTTGAACATCAACAATTTTAA TATTTGCTTTCTTAAAGTTCGTCTGATTCGTGATCGGGATATTACTGATG GCTTCTGCCAATTTCGACGCAACTGTCGTTGGGTTCACACTTTGTGGTTT AATGGTAAAAGAGCTGATTACTTGTCCAGCTTGTTGAGTTGGCGAgactg gtttgttttgattggaggTATTAGGGATATTCGAAGAAGCCTTTAGTTGT CCGCTATTCGATGTATAGTTAATTGAAGGGTACGCCGTACTGGTGATAAC 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ACAGGATTTGTGAGAATCTCTGGAATGGATTGGTTTTTAGTTTGCTTGGC AAATTGTTGGATTGTATTACCAATACTTTGCAGAGCAGCTTCAAAGACAG CTTGATTATTACTTTGTCCAGGAGATTGAATGTCAGGGAGTTGTGATGAA ACGTTTGAGATGAGGTTTGTTAGGAATTGTGCATTGAGTTGATGCTGTAG TGAAGGTTCTGGAGTTTTAGTTTCGGAGATTTGTCGAGAATACTTGACAT CGTGATCAATTCCTGGATGTTGAGGGACTCTTGAATCATTCAGATCACGA TCGAAACTTGGTGATACGCTTGTCTGAGTTTTCAATTCAGCATTCGATTG CTTATTCTTTTGCTGGTAAAATCTATCTCTTGGTGAAGCTAGCTTCACTT TTTCCGTTTTACTTGGTCGGCGTTTCCCTTTGGAGGAGGTCTTGGTGGCT GATGAGTCAAAATCTGAAGCGTCATGTTCACTGGAGGAGAGAATTCGTTT CAAAATCGAATCGTTGTCAGTTGACGGTGTATGAGGAGGCTGTAAGGCCA CTTTGTGTGCATTCTGTGTTGCACCACTATCCCAATCAGTAGGAGGAGCG GGtaatttcgttttctttttccgCCTGACAGGTGACTTCTTGATGACAGA CGCTCGATTCTGTTGTTTACTTTCCGCTTGTTGTCGACGGGTTTTCATAA ATTCTTCGATCAATTTTTGATATTCCTCTTGAACGTCACCTTCACATTTC TCACCGTCTGATGATTCCAGAAAGCTGGTGTTCGAATCACGTATTGATCT CTCTTCTGTTGCACTGTATTCTGACATCTGTGAGCCCTGGGAATCGTACC CCGCTTCTGGTTCATTGCCTGGTTGCCATTGCAACGAGGTTGTGGTCGCT AGATCCTTGTTTGCAGGCTCGTTAAAGTAAACGTGCTTTGGCTCTTTGAT 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ATTGAAGAGAGTTGAACGTCGTCTCATAGCTGTTAGCGTCGATCAAAGCT TTGTCTTTTGGAGTCTGAATGTTATTTGGTTGCAAAGCTTTTGAATGTTG TATTTCTGTTGGTTGGATAGGAGGTGGAACAATATGCAAGCTTCTGGCGA AATGCTCATCTGGTGTTGATTGTGCTTTCCAATCTATTGATTTGATGGAT GTTTTGTGACTTTGTTCAAAGGGCTGGTAGAGACCTAAGGAGCcagtatt tgaaatatttttctctgtaAGTCTTTCAGTATTCTCTTTAGATGGGTCTT TGTTCGTCTTCAGACTTAGGTTTTGAGGTTCTTTTTTAGTTTCAGCATGT TTCCTTTCATGGCCAGTCTTCTTTTTCGAGTCTTTCAAGTTTCTGTCAGG TGGATTTTGATTTCCCATTTCATTTTGCTTTCGAATCTTCTCAGCCAACC ACGATTCAGCGGTGGCAGCATCTGGTACCTTTTTGAGTAAGTCTTCATTC TGCCAACATGTACGCTTTTTGGTCAAATTATTGGAGCTGGAAGCTTGCAT TGTTTGAGAAGTAGAGGAAGAATCATTAGCAGATTTTCTTGGCGGTTTCT TTTTCATTGTAAGGTCTTGCAGTTGTTGCTGGGCCTTGAGATAACGTTCA GATTCCTCAAGTGCTGACTTTCCTTTCGCTTCCGGTTGTTGAGATTGCAA TGAAAATACTGGGTTGTCCACTTTTCTCGAATGCTCTTGacaattttcag ttttaataGTTACTTCAGTTTCAGTTGACCCAGTCTTTGGCTTAGCATGG TGCTGCCTTTTCTTTGATTCAGCAGTAACAGTAGAAGAGAAGGCCGATTT TTCAACTTGTTTCAGCGTTGCATCGTGTATCGAATGGTGTGCCGgttgga ttttcaaaaaatttgagatGTTTTGTATTTGATTCAATAGCGCTTCTTTC TCGGCGTTGTCTTTGTTGTGCTTCAGGGTTATAGTCTGGATGGAAAGATT TGCTTTTGCTAACGATTCGTCGAGTGAAGTAGGGGCAGAGGCTGTCGAGG ATGATTTTTGCTTTGAATGACTTTTAGGGGGCGGCGGTGCGGATGAAGTT GATCTGTGCGAAGGCTGCATTGCTGCTTGGTTCGAAGAATCAAGACTTTT GAAGTCAGCTTTCATAGGTGTGATAACTGATTTTCGCTCATGGGAAAGCT GTTGGTAATGATTTGTCGGTTCCTTATCAAGATGACAGGCTTGCCATTGA ACCTGTTCGGATTGTGCCTGTATAGATGATTTGTGTTTTGTGTTTGAGTT TCCCGTTTGATTCAAACTTGCAGTGGCTTGGACGACTTGTATGAGCAGCT TTTCGTCAATAAATGATACGTCACCGGTAAGTTTCGTTGGTTTTGGTGGT TCAGCTTTATGGTTATCTTGACGAGATTGTGGTCTTTGGTGGCTTGTATC TGGTTGAGAACTCTGTTGTTGGATTTGTGTATTATTGAGCTGGTAGTTTT CATTGAGCTGGTTGTCGATGGTGTTTGGATGAGACATTGACCGCTGAATC TTGTTTGGTGTAACCGAGGAGGAGTGGACTTCGTATCCATTGCAAGACAT GGTTCTGTTCAATGAACCTTGTGATCCTTGTTGGAAATGATATCCGGTGG GAAGGTAAGAGCTGATTCCACTCAAATTCACGTTACTGTTGGATGACTGT GGTTGTTGATGTGGCTGACCATACACTGCATGTTGTTGACCAGTGTGGTA AGCCTGTTGCGACTGATGTTGTCCATGTTGTGAGACCTGTCTATTTTGTT GGTACAATTTCTTAATATTCTGCGCGGTGGCCAAACATTCGTCCACGAAT TTGTGGAGCTTGAGATATATGACATTCCATTGTAAGGACTGGTCGCCTAC 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GATGTTGTCCATGTTGTGAGACCTGTCTATTTTGTTGGTACAATTTCTTA ATATTCTGCGCGGTGGCCAAACATTCGTCCACGAATTTGTGGAGCTTGAG ATATATGACATTCCATTGTAAGGACTGGTCGCCTACATCAAAGAGGGAAT GTGGTTCATCTCTTTGCAGTGGTATCTGATACACCAAAGACAATGCGTTG TCAAAGAAGCTTTGATTGGAAGTTGACATCTTTCGTTTGACATCGTCGTA AGTGTGGAACTTGTAGGTGATGAAATTCTGTAAACAGACAATGGATTCGA AAGCAGCATCCCCTTGTTTGGTGTACAAAACGTGTTGGAATTCGTATTCT TGAAAGGGCGTCAGTGATGATTGATGGTGATGGTTAGAGTGGTGATTTTG CTTTCTAGATGCATGTTTTGATACCTGATGATATAATATGAAATGATTTG A Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_35:46308..54310+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00060918 ID=TCONS_00060918|Name=TCONS_00060918|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8003bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_35:46308..54310+ (Clytia hemisphaerica) CCTGAATCTTGTTTCGATTTTCGTTTCTGTTTGAGATCGATGCTCTCGGT
GGCCGAATCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAATATctcttct
tcttttgttttttcgtNCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAAT
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CTGTTGTTGGATTTGTGTATTATTGAGCTGGTAGTTTTCATTGAGCTGGT
TGTCGATGGTGTTTGGATGAGACATTGACCGCTGAATCTTGTTTGGTGTA
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GGCTGACCATACACTGCATGTTGTTGACCAGTGTGGTAAGCCTGTTGCGA
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TAATATTCTGCGCGGTGGCCAAACATTCGTCCACGAATTTGTGGAGCTTG
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ATGTGGTTCATCTCTTTGCAGTGGTATCTGATACACCAAAGACAATGCGT
TGTCAAAGAAGCTTTGATTGGAAGTTGACATCTTTCGTTTGACATCGTCG
TAAGTGTGGAACTTGTAGGTGATGAAATTCTGTAAACAGACAATGGATTC
GAAAGCAGCATCCCCTTGTTTGGTGTACAAAACGTGTTGGAATTCGTATT
CTTGAAAGGGCGTCAGTGATGATTGATGGTGATGGTTAGAGTGGTGATTT
TGCTTTCTAGATGCATGTTTTGATACCTGATGATATAATATGAAATGATT
TGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1491911889:46308..48960 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1491911889:46308..48960 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1510915933:46308..48960 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1510915933:46308..48960 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1575043694:46308..48960 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1575043694:46308..48960 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1491911889:49013..54310 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1491911889:49013..54310 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1510915933:49013..54310 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1510915933:49013..54310 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1575043694:49013..54310 | TCONS_00060918-exon-scaffold_35-1575043694:49013..54310 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_35 | supercontig | scaffold_35:46308..54310 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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