TCONS_00060818 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060818
Unique Name	TCONS_00060818
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2643

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_349:66284..85631-

transcript sequence

>TCONS_00060818 ID=TCONS_00060818|Name=TCONS_00060818|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2643bp
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TCGTAAATCTAAACtaaaaaacgagaaaaatagttttgaaatatggttTA
TTCTTGATACAACATGATTCAAAATGTAGTTGCTTGTgATTTGATACAGA
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AATCCGCCCAAAATTGAAGTCAAAGATGTCAATAATAACAAACCAGAACT
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GAAGTTAAACCTATTACAGACAGTTCTGATAAAAAGTCGGAACGAAAACC
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AAGAATGGCTGGTCACACTCTCAGCTCTTGATGCCGATGATATCGAATAT
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AGAgGGTTGTGAATACATTATAGCATTGACACACATGCGAGTACCAAATG
ATACACGACTCTTAGAAGCTGATATTggaattgatttgattttgggaGGA
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GAGTGGTACTGATTTCAGAGAGCTGTCGGAAATCACAATCGATTTTGCGA
ACGGTAACAAGGTGAAAACGAAACGACATGAGATTAACGCCGacattgaa
gaaaatgaagaaattaagAAAGAGTGCGAGAAATACATGGTGATCCTTGG
TCAAAAGATGGAAGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGGC
GTTTCTCAACTGTCCGAACTAAAGAATCGAATCTAGGAAATTTCATCACC
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TAGCTTACGTTCTGATTGCATTCATCCAACTGGTCCGTTCAAAATGAAGG
ATTTGGTATCTGTATTACCGATGGTTGATATGCTggttgtcattaaaatg
acTGGTCAACAGGTCATTGAAGCGCTGGAAAATTCCGTATCGCAATATCC
AAAGTTCGAAGGAAGATTTTTACAGGTTTCTGGTATTCGATTTGCTTTTG
ATCCTGACCAACCAGAAGGTGATCGAGTTGTGAAAGAAACAGTCATGGTT
CACGATAATATACCTATCAACCTCGAATATGAATATAAAGTGGTAACCAA
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CTGTTTTGGTTGATGCGGAGAATGGACCAGTACTTTTGTCCATCGTTGAA
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CTGAAAGGAGACCCTGAAGTGCTATCTCCTACTTTCGTCCGCCGTAAATC
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CGTTAGGCGCTATCTCCGAAGATGAAGGAGGCGTACAGAGTGGTGAGAGC
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GGCGGTCGATTCTAAAGGAGAGATGGCGGAAGAAGTGGATGATGAAGATG
ATTCGGATATCGAGTCTGTCATGACTCATGATGATAATCTTGAGCAAGTA
AATGATGATGACCGAATGAGAATGTGGGAAGCTGTTGGCATTGATGATGT
TGAAAAATTATCAGAAATCGTACATGGAAGAAATTTGGATTTCAGATTTT
GGATCATGGAAAAGACAATCCTTCATCATGCTGCCCAACACAATTCGGTC
AAAtGTTTAGAATATTTGTTGAAAGAATCAAACTTGAAAGTGGATGTTCG
TGATCAAATTTTGAAGaGTTCAGCATTGTATTATGCATCAGAA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_349:66284..85631-

Legend: exon

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>TCONS_00060818 ID=TCONS_00060818|Name=TCONS_00060818|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19348bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_349:66284..85631- (Clytia hemisphaerica)
GCGAGGGAGTGAGAGTGTAAAAACGAAAGTGGTGAAGTGAACAGTGCCCC
TCGTAAATCTAAACTAAAAAACGAGAAAAATAGTTTTGAAATATGGTTTA
TTCTTGATACAACATGATTCAAAATGTAGTTGCTTGTGTAAGTATTGGAC
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GAAGGTCTGTTCCCTTGTCTAGTGAACTGCTGGGAGTGGGAAATGCAGGG
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TCTTTTCATAGGATTTGATACAGAATGGGATGTGGTGGTTCAAAACAAAC
CAAAGTTGTTAAATTTAAAGAGCCCACTGATGGATCACCTTCAAATAAAG
CCAAAAATCAAACATCAGCACCTTCTCCAGCAAAAGACGTAAACGCCCAA
CCTGAAAAATTTACCACCCCTCCGAATCCGCCAAAAATTGAAGTCAAAGA
TGTCAATAATAACAAACCAGAACTAACCCCCGTCATTGAGCTACCGAAAA
ATGAAGCAAACGTAGAATCAGTACAAGAATCAGGGGGTAACGTTGCATCG
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TGATAAAAAGTCGGAACGAAAACCTATATTAAACGGAACTTTAGAAACTC
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TTAGACAAACCGTCAGATGTGTTACGGATAATCCATTTTAACGACGTTTA
TAATATCGAACCAAGAGAACAGGAGCCCGTTGGAGGAGCAGCCCGATTCG
TAACTAAAGTCCGTAGTTTTGAGAATGAACCCATGGTTTTGTTTTCAGGA
GATTTACTTAACCCCTCACTTAGTAAGTTTTTAACAGNCTACGTTAAGCA
AGGCTAATAACGCTCTACCGTTACCTTATCACTGGCTGCAGGTCAACCTT
TGGTCATTTGGCCGTCTAGAAAGTACGCAAGGCAGTAAGATTCACATTTT
TCTTTTCATAGGATTTGATACAGAATGGGATGTGGTGGTTCAAAACAAAC
CAAAGTTGTTAAATTTAAAGAGCCCACTGATGGATCACCTTCAAATAAAG
CCAAAAATCAAACATCAGCACCTTCTCCAGCAAAAGACGTAACCGCTCAA
CCTGAAAAATTTACCACCCCTCCGAATCCGCCCAAAATTGAAGTCAAAGA
TGTCAATAATAACAAACCAGAACTAACCCCCGTCATTGAGCTACCAAAAA
ATGAAGCAAACGTAGAACCAGTACAAGAATCAGGGGGTAACGTTGCATCT
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TGATAAAAAGTCGGAACGAAAACCTATATTAAACGGAACTTTAGAAACTC
GAAATACAGTAATCAACTCGAAAATAAGTCGTGTTTACTCACCAACAAAA
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TAATATCGAACCAAGAGAACAGGAGCCCGTTGGAGGAGCAGCCCGCTTCG
TAACTAAAGTCCGTAGTTTTGAGAATGAACCCATGGTTTTGTTTTCAGGA
GATTTACTTAACCCCTCACTTAGTAAGTTTTTAACAGTGTATATGTTTTT
TTAACAGAATATCTTACATTCAATTTCGTCTGATATCTTTTCGAAAACCT
ATTCTCGCTGAACTCGCTAGCCTTTTCAAGAGAATAAAGTATGAGAACCC
GGCGGGGGCGGACTGACCTGGATGACTTCTCGCTGGAGTTTGAAAGGTTG
ACCCTGTCAGAAATGAATGTTTGTTCTAAATTTGGGACCCTCTCAGAACG
AAAATTCGAAAATTTTACCTATTTTCACCCAGAAAGGTGGCAAAAATGAC
TTATAGTAAACAAAAGATTTTAAATTTCCACCCTGAAAATTGTCCAATAT
AACTAATAGTCGACCCTGTCAGGTTCACATCTTGAAAATAAGCAAATATG
GGACCAGCTGCTAGATATCTTATGGGCTCTTATGGGACCCGGCACGTCTC
CGTATCAACTTCTCTGCTTTTTAAATGCGTAAGAAGCGCTGAAACCTAAC
TGGATGGTCAAAAAACACTTTTCATTTGCTTATTCTCGTTTCAGTGAGCA
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CATACTGCAGTCTATGGCAATCACGATTTTGGTAAGATTGTCACCATTGT
ATTCATAACGTAATATTTTATACAGAAGCTTAAAAAAGGCCGGGTGTTTA
CCACTAATTTTGAATTTTTAACAATAAAACTAGTGGCAAACGTCCGATCT
TTTTGGGTGCTTCAGTTTAAAACATTATGTCGTGAATATCATCCACGAAT
TGTTATGTGTTTACGCCATGAACCCTTTTTTTTTTGGATGCATCAATTTT
AAATTTATAAAAAAGGGAAGCAGAATATTGGGAGAATTTTTTACCAATGG
CGTTCTGAAATTTAGAAGGCCCTGTATTCCCCTTGTGCATTGTGTACATT
ACCGAAATGTTTCAAATCGTCGTCAATCACCGGTTGCATAAATTTATATC
CTTCCTTAGAGCAGAAATCTCTCCTCTGAATACCTAAGGCTTTTAATATT
ACAACTGTTTTTGAGACTGAAGAAACCCGAAAGACGTTTATGTATTTTCG
TTCACTTTTCTAATTCAATTTAACTGATATATAACTGATATCGATTTAAA
ATGTTTACCTATATTCTTTCTGTCAGATTTTGGCGTTGACGAACTCATCG
ATTTCAAAAACAATACAAAGTTCCCATGGCTAATGAGTAACGTTCAAGAT
AAATTGACTCAAACACTTCTTGCTGATGGTGTAGAAAAAGTGGTCGCTGA
ATGGCACGGGCATAAGGTATGATAGTGGAGTCTCTTTAACTCAAACCTCT
ATAACTCGAGATTTCCTTAACTTGGACAAATTTGCGTTCCCCGTGCATTG
ATTCTCTGTTTCTTAGATTACGGTATAAAAGTATAGTTTGGATCTTTATG
ACTAGACTATTTTTAAGTCCCCCGCGAAGAACTTCAATTATTAGTGTTTT
GCGAGTGAACATTTTTTTTCAATGTTCACATATCTGTCATAAAAAGACAC
CTTCTCTTTAAATCTATTACGTGATTAGCAGTCAATTCTCTAACTCGAAC
TTCTTTTATTCGAATCTTTCTATAATCCGAACTAAAATCTTTGTCAATCT
CAGCTGTAAAGTGGTTTTAATTACACTTTGTAATTTGACTCTTTCTATAA
TTCGAAGAAAATTTTTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGAGTCAACT
GTATACTCATCTTTAGATTGGTATCATTGGTTTGGTAGAGAAAGAATGGC
TGGTCACACTCTCAGCTCTTGATGCCGATGATATCGAATATACTGATTTC
ATCGATTCTGGACGTGCTCTGGCTACATCACTACGCGAAGAAGAGGTATT
TTATCATATTTTTACGACAATTAGTCTATTATGTTTAACTCTTTTTTTTC
TATGAAGAAGCTGTAAATTAGCTATTATAGCCTCTGCTAAATGCACGTTC
CACTCAACGCGAAATAAAGAAAGAACCATATGGCGAAAAATTTTATAAAA
CAAAATCATTATGTCGGCCATAACACAAGCCAATCATAGAAAATGTTATC
AATAAGGATGAAGATAGGGATGTCACTTTTAAACGTTAGAACATATTTTT
TTTACCTAAGTCATTATATTGTTTAAACAATCACTTTATTTTCTTTTTTT
TCTTCCACAGGGTTGTGAATACATTATAGCATTGACACACATGCGAGTAC
CAAATGATACACGACTCTTAGAAGCTGATATTGGAATTGATTTGATTTTG
GGAGGACACGACCATCATTATGAAGTGAAAGAGGTATAAAACAATATAGC
TCTATTTAAAGGGACATAAAAGTAGTAAAATGTAAACATTGCGCGAACCA
CGTGTAATTAAAGAACAAACTTGTAAAACAATTGAAAAAATCATTTTTTA
TTTTGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATCTCGCTGCATACGGTTT
GTTTACAAATTTCGTCACTACTTTTATGTCCCTTTAAATATGTCTATTAT
GGTCATTTCAGTCTTTGTTTTAGATTAGATTCTTTTTATCATTGTTTTAA
GGACTTAAGAAATTTCAATAAATAACGCCAGTATAGGCCGGCGGCAAAAA
AGGGCCGATACCGTATTCAAACCTTCGTCATTTTCTTTGAACAGCATGGC
AACAAGGTGTTGGTGAAGAGTGGTACTGATTTCAGAGAGCTGTCGGAAAT
CACAATCGATTTTGCGAACGGTAACAAGGTGAAAACGAAACGACATGAGA
TTAACGCCGACATTGAAGAAAATGAAGAAATTAAGAAAGAGTGCGAGAAA
TACATGGGTATGTATATGACGAACAAAAAGTAGAATCAACTGTTTTTTCT
AGCCCGGGGGAAACTTATAGCTTTTCGATAGACTGGTGGCGCTGATAAGT
GACCTGGTTGTATATGGTAGTATGCTTTTGCTTATTTTAGTTGCTTTTGG
TAGTTAAAAATAGGGTGAAGCAATGCTTTTATTTGAAAATAAAGGATTCT
AGATCTGTTATCGATGTTTGCTTCTCATTCTTATTTATATTTTTCAACTC
TCAAGTATTAGTTATAATTATTACTTATATAAGTTCATATTTGGAATTTT
CGTGTGTTTCTTTCATAATGGCGCCCTCTTCAAATGCTCCTAGTCTACTT
AACTCCTAGCCGGGTCATAACAAAGACTTTGAATTTAGTTGAGCAATCGA
GGGAGTGGCGCTCTCCTCTACCTTCGGGTAGATAACTATCAAAGGAGGAG
CCTTCGGGTCGCCTCTGACTGCGGTCGCAGACTTGGCTCTAGTTTAGACG
GCCCACTTTTTGCCGCAGTCTATTCTAATTGTGAATTTAAGTAGGCATAA
AGTAGGCTGTCTAAAGTCAATGCATAGCCTTCTTTTGACGTCAATGCAGT
GTCTTCTTTCAAACTTTTCAAAGCAAAAACTAGAGCTTTCTTATTTTTAC
TTTACACGTTTCTTATAGGTTGCAGACTTACTTACTACTTTTCTAATGAC
TCTCGGTGGAACCTTTTTTTAAAATTCTTTTCCCAGTGATCCTTGGTCAA
AAGATGGAAGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGGCGTTT
CTCAACTGTCCGAACTAAAGAATCGAATCTAGGTAAATATTACTTTTATT
TTCAATTTCAATAATGTTTGTGTCTTTACATTTTGTTCATAATCACTTCT
TGACGCCCAGTTTTGCAATTTTTCCCGTCTAGCTCATATACCATTTACCA
AATACTGTTTTTCTGCATCTACGTTATGCTATCACGAGGAATTTATGTTA
ACAGTGCTAGGAAACCAAACATTTATTATGATTTGCGATCAGATTGACAA
AGCATAGCGACTTCAAGGTGCCAAAACCTAAAAGCTAGATTACAGTCTTT
GAGATGTTAATAACACGTCATGTTTCAGAATATTCAAGGTTTCAGCTCTC
AAGATTCCAGCTCTCTCAAGATTCACTCGTTCACCCTGCTCTTGCGGTGA
ATGGTCAATGAAGACCCTGAAAAAAGTTTACTTTACTGTTTAACAAAATT
CAACACTTCATTTTTTTAGAACTTTAAGTTTCATGCGAACATGAGAAATG
AAGTTTTGTATTTTTGTTATAAGGCTCCTTCTAGTAGAGCACTTCTAGTT
GTTGCTGTTTTAAACACACAACTTTGACCTTATTTGATACTTTACTCTTT
TTATTTTTTTTATATCAGGAAATTTCATCNCTCTTCAAATGCTCCTAGTC
TACTTAACTCCTAGCCGGGTCATAACAAAGACTTTGAATTTAGTTGAGCA
ATCGAGGGAGTGGCGCTCTCCTCTACCTTCGGGTAGATAACTATCAAAGG
AGGAGCCTTCGGGTCGCCTCTGACTGCGGTCGCAGACTTGGCTCTAGTTT
AGACGGCCCACTTTTTGCCGCAGTCTATTCTAATTGTGAATTTAAGTAGG
CATAAAGTAGGCTGTCTAAAGTCAATGCATAGCCTTCTTTTGACGTCAAT
GCAGTGTCTTCTTTCAAACTTTTCAAAGCAAAAACTAGAGCTTTCTTATT
TTTACTTTACACGTTTCTTATAGGTTGCAGACTTACTTACTACTTTTCTA
ATGACTCTCGGTGGAACCTTTTTTTAAAATTCTTTTCCCAGTGATCCTTG
GTCAAAAGATGGAAGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGG
CGTTTCTCAACTGTCCGAACTAAAGAATCGAATCTAGGTAAATATTACTT
TTATTTTCAATTTCAATAATGTTTGTGTCTTTACATTTTGTTCATAATCA
CTTCTTGACGCCCAGTTTTGCAATTTTTCCCGTCTAGCTCATATACCATT
TACCAAATACTGTTTTTCTGCATCTACGTTATGCTATCACGAGGAATTTA
TGTTAACAGTGCTAGGAAACCAAACATTTATTATGATTTGCGATCAGATT
GACAAAGCATAGCGACTTCAAGGTGCCAAAACCTAAAAGCTAGATTACAG
TCTTTGAGATGTTAATAACACGTCATGTTTCAGAATATTCAAGGTTTCAG
CTCTCAAGATTCCAGCTCTCTCAAGATTCACTCGTTCACCCTGCTCTTGC
GGTGAATGGTCAATGAAGACCCTGAAAAAAGTTTACTTTACTGTTTAACA
AAATTCAACACTTCATTTTTTTAGAACTTTAAGTTTCATGCGAACATGAG
AAATGAAGTTTTGTATTTTTGTTATAAGGCTCCTTCTAGTAGAGCACTTC
TAGTTGTTGCTGTTTTAAACACACAACTTTGACCTTATTTGATACTTTAC
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CCCTAATTTAACGCCGGCCCCTTTTACGCCGGCACTTATTACGCCACAGC
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TAGAATGGCTCTTTATGCTTCAATTTACATTAAAATATCATTTTTCAGTA
GTAAACTGTGGAAAATTCCATTGAAAATCACTGATTTTTGCAAAATTTTA
GATATTGAGTAAAACAATGGATAATTTTTCGTCTTCGAATTATACATAAA
ATCCTTAAAATAGAGAAAAATGGTCAAAAGTTATCGCCACTGTTAAGTAA
AATTTGCAAAATTTTGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCCC
TTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGTCCTTTTA
ACGCCGGCCCTTATTACGCCAAAAGTCTAAAAATAACACCAATAAGGGCC
GTAAAAAGGGCCGATAAGGTATTCCAATACAGTGGAGTCTCTATAACTCG
AACCTGCACGGGAAGCACGAATTTGTTCGAATTGAAGAGACTCTACTGTA
GTATTATTTTGACGACCTGAATCTAACATTACTGCCTTAAAAATTAAGAT
TCTTGAAAGGAAATTATACAACAGCTGATTGGTCGCGCCATATTGAAAAG
GAAAAACTAGAAAAGGTATATAATTTCGTGTAGTCATTCATTGAAGTGGT
GGATTCCTTAAGCGTAAAAAATTGATCGGTCGTAAAAATTCCTCAGTAAA
AGATTTTCTCACAAAGGGATTTTTTGTCACTTTTTACCAAATAATTTTCT
ACTGTAAATGTATCACGTATTTTGAAATACTACGAGTTTTAAGTTAATTT
CATACTGGAAGCTTCAAGACGTCCAGCTTGAAATACTGTACGTTTTAAAT
AATGGATTTATACTTTAAGCGTACAAACTTTCGCGAACAGAAACTATTTT
CGCGAATTTTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTGAAAATTCTTGG
AAGGGCCATTCACGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAATTCTTGAAAAAAATA
GAAAATCTGTAAAACTTTGAATAAAATGTAACATTTATGGCAATTTCTAG
CCTTTTTAAAGCCTAATGATTCAAAAGACAAAAGTTCCAAGCCTATTAAA
GAAGTATTTGTCCATTTTTTCACGTGAAGATTTTGATTTTTACGTCTTGA
TTCGCGAACAATTATGCTCGCGAAAAAGATTTTTCCGTCAAATTCGCGAA
AGTATATGTTTTTAAATTTCGTGATTTTTCGACCTCGCGAAAATTTCTGC
TCGCTAAAGTATTTGTTCNATCAGGAAATTTCATCACCGACATTATGCGA
GCTGCGACACAAACCGACATTGCGTTCTTGAATAGCGGTAGCTTACGTTC
TGATTGCATTCATCCAACTGGTCCGTTCAAAATGAAGGTAGTTAATGATG
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GCCCTAATTTAACGCCGGCCCCTTTTACGCCGGCACTTATTACGCCACAG
CCTAATTTTGGGCTTACGCCAATTAAGGCTGTAAATAACGCCAAAATATG
TTAGAATGGCTCTTTATGCTTCAATTTACATTAAAATATCATTTTTCAGT
AGTAAACTGTGGAAAATTCCATTGAAAATCACTGATTTTTGCAAAATTTT
AGATATTGAGTAAAACAATGGATAATTTTTCGTCTTCGAATTATACATAA
AATCCTTAAAATAGAGAAAAATGGTCAAAAGTTATCGCCACTGTTAAGTA
AAATTTGCAAAATTTTGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCC
CTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGTCCTTTT
AACGCCGGCCCTTATTACGCCAAAAGTCTAAAAATAACACCAATAAGGGC
CGTAAAAAGGGCCGATAAGGTATTCCAATACAGTGGAGTCTCTATAACTC
GAACCTGCACGGGAAGCACGAATTTGTTCGAATTGAAGAGACTCTACTGT
AGTATTATTTTGACGACCTGAATCTAACATTACTGCCTTAAAAATTAAGA
TTCTTGAAAGGAAATTATACAACAGCTGATTGGTCGCGCCATATTGAAAA
GGAAAAACTAGAAAAGGTATATAATTTCGTGTAGTCATTCATTGAAGTGG
TGGATTCCTTAAGCGTAAAAAATTGATCGGTCGTAAAAATTCCTCAGTAA
AAGATTTTCTCACAAAGGGATTTTTTGTCACTTTTTACCAAATAATTTTC
TACTGTAAATGTATCACGTATTTTGAAATACTACGAGTTTTAAGTTAATT
TCATACTGGAAGCTTCAAGACGTCCAGCTTGAAATACTGTACGTTTTAAA
TAATGGATTTATACTTTAAGCGTACAAACTTTCGCGAACAGAAACTATTT
TCGCGAATTTTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTGAAAATTCTTG
GAAGGGCCATTCACGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAATTCTTGAAAAAAAT
AGAAAATCTGTAAAACTTTGAATAAAATGTAACATTTATGGCAATTTCTA
GCCTTTTTAAAGCCTAATGATTCAAAAGACAAAAGTTCCAAGCCTATTAA
AGAAGTATTTGTCCATTTTTTCACGTGAAGATTTTGATTTTTACGTCTTG
ATTCGCGAACAATTATGCTCGCGAAAAAGATTTTTCCGTCAAATTCGCGA
AAGTATATGTTTTTAAATTTCGTGATTTTTCGACCTCGCGAAAATTTCTG
CTCGCGAAAGTTTGTACACCTAAAGTATTTGTTTATGTTCTGTTTTTTTC
CATAGGATTTGGTATCTGTATTACCGATGGTTGATATGCTGGTTGTCATT
AAAATGACTGGTACGTTCGTTATTATTTTGTGTGTCGACTCTCTAATTCG
ATTTTCATGGGACCATAAGTTTTCTTTGACTTACAGAGAATATATTAAGC
CATTTTACAACCAGCGCTGTGGGGACCAATATTTTAGTTCAGATTACAGC
AAGATTCAAATAATAGAGGCATAATAACAAAGCAGCGCTTGCCGAGTGGC
CAAGGTATCAGCGTTTCAATAAAATGACATGAGTACTCTATGCTAATTTG
TCATTCATTCATGTCTGAGAAGAAAAGCTTTGCTACTGTTTTAAAGCTTA
TTGGACCTAACTGGAGGTCCTATAAATTAACCCGTGTTCGTCCGTCCGTC
CGTCTGTCCGTCCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGA
ATCTTTTGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAATGGTAGTGGCCAAAATGTG
ACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAATTCTTTTGGGCAAATTTAGGCTAAA
AAAAGGCTAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAA
TTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTATGCTAACATCATTGGTAAAAGAT
GGGCAGATTTTCGCAAAAAAATTTTGTTGGCTCAAAAAACGCATGTTTAT
CTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTA
CTCAATTTTTTTATGAGATAGATGGTTTTTTTGCTCATGAGGGGTTACTT
TTGAAGAATATGTGTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTT
TTATAGAAAAACTGGCCAAATTTGATATTTTTCTATAAGCACATTAGCAA
TTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGAT
TTTTTGCACAAAGATGCACATAACTATAAACCCTTGAATGTGACGGAGCT
CGATTTTTTGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAGGCAGATTTTTGTA
AAAAAAATAATTTTTCAAGTCAAAAAACGCATCTTTTTCTATAAGAATCA
CTATTAAAAAGCATACATCAATGATCTTAGCCAAATTACTCAATTCTTTG
ACGAGAAAGATGTTTTTTTGGTCACAAAGTCTTGAATATGAAAGAATATT
TCAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTCAACGTTTTCTTTATAAGAAACAAA
CGACTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAC
AGTTTACAATTTTGGTTTCTCAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAACGACT
AATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTACAGTCA
TCCTGACGTAGATATCAATTATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTC
TATAAAAGTATCACTTGTTTAGTTTTATTATTAGTGGTTGCATTTGATAC
TTCTCTCTCAAATTTTCGGAACGAATAACTTACTCATAACTATTTTTCTT
TCGTTTTAGGTCAACAGGTCATTGAAGCGCTGGAAAATTCCGTATCGCAA
TATCCAAAGTTCGAAGGAAGATTTTTACAGGTTTGTAAGCCTCTTAGGAA
ATTTTCCAATTTCATTGTTAAAGCAACATATCTCATGAGAAAATGCTATT
TGAATATGGACGTTATCATTTTTAAAGTGCCACTGGAATTAGGTAGGTAG
GGGCGCTTAGTTGGGGGGTGAATATGCATATGAAATCAAAAAATTGTTGA
AAATTTGAGTTTATTACTGAATGATAACAATATAGCGCTTTTAAAAATAA
CATGACAATTTTTAGTGATAGCCTGTTGATAATTTTCATACCAAAAAATA
TTTTTATTCTAACATTTCATATTAATCATGTTCAACAGGTTTCTGGTATT
CGATTTGCTTTTGATCCTGACCAACCAGAAGGTGATCGAGTTGTGAAAGA
AACAGTCATGGTTCACGATAATATACCTATCAACCTCGAATATGTAAGAA
TTTTTAAATATTTATGTCACTTTTATAGTAATTCAATCCCCNAACCTCGA
ATATGTAAGAATTTTTTAATATTTATGTCACTTTTATAGTAGTTCAATCC
CTGGACCAAGTTACTCAATGTCGACCAAGCAAAATATTATGGTCGGAGTT
TTTTTGAAATTGGTACCCGCGGAGAGAACGCTAGATCTAGTTTTGCATGT
ACACTAATGATGTAGCGCCGTTTGTCGTTAGGTAAAGTTTCAATCACTAC
AATGACTTCTTTGCGGGTACCAATTTTCAAAAAACTTGGATCAAAGATGG
CGGATATAGTTTAGTCCAGGGATATATAAAGGTCAGTGAGTTCAACCCTA
AGATATTCATTTTCGACATTTCTGAACCATCCTGTTGGCTTGGTATTTAA
GTCCGAGATTTTTTGAGCCTCAAACATTCCAATCCTATGCGGTAAATTGT
ACATTATGATAAATGATTTTGTAATTTGGGATTAAATTCTTGCAAATTAG
TGAACTGTGACTAGCAGATAGATATTATAGCAGCGTTGGTCTTTATCGCC
AGATATCGAGCCATGATTTTGCAGTCATTGAATTGATTTTTCATGAACAA
ACAATCATTTTCACTTTACTAGTAGCTCCTTTTTCTTCAGTGTAATGACC
AGCACTGCATGGATACTGTGTGGAAGATTCCGTTTTTTGCGGACAATAAT
TTTTTGCACCATTTGGAGTTTAGTTTAATTTCACTGATAGACTGACTCTT
TTTTTTCCTTATTTGACAGGAATATAAAGTGGTAACCAAAGAATACTTAG
CGCGTGGTAAAGATGGCTTCGATGTACTCAAAGATTGTCCTGTTTTGGTA
TGTTTTTAACAAAATGGTCACAAGATAAGAAAAACTATCCAAAATATACC
ATGTCCGAACCTTTATTGACCGTAATTGGTACTGTTGCCAATTATCAATT
AAATTCTCATCTGCATATAGATATTTTTTGGGACGACCAGCTCTAAACAG
GCCCAAAGTTTGAATAATAATCTCCCTCACTTTGTTACTACTCGCAGATT
CATTTATTCATTGAATTTTGTAAAGTAAAAATAGACTCTAAATAAGTTTG
ACTTTATCGACATGGAAATTTACCGTGGCTTCACGAGAGTACGTTTGGCT
ACGTTTTGGAAGATTCTTCTCCCATCAAATATTCTCATCATACCAATGTA
TTCGCACCATTAGGTTGATGCGGAGAATGGACCAGTACTTTTGTCCATCG
TTGAAAATCACTTTGAATCCATTCGTATTTACAAAGGAAAGAGGAAGAGT
GTTTCTGGCCATCGACAGAGTATCACTGTGTATGTTGTTCTATCTTTTTC
TCGTATTTTTCAGTCTGACACCCCCTTCTCACAGACCCTGTAGGATTTTT
CAGGCAGTGGGGGAAAAAATAACGGACTGAAACTCGATGGAAATTGATTT
TCCATGTTTTTTTATGGCTGGAGATTTAAATTCCATTGTTTTCAAGTCAG
AAAACTCTGTGTGGATGGGAAAAAGAGCATGATATTTTGCAGTGAGGAAT
GATTCATTTGATTGTTTCCACTGGGGACAAAAATTGAAGTATAATTTTCC
ACTGGGGACGATATTTTCGCTAATTTTTCCAGTGAGAAGGGTTCCTAGTA
GGTTTGTGAGAAGGGGGTGTTTACTGCTTCGTCATTTCTTTTAAATAGAT
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CTTTAAGGTATGATCTTTCCACTTTGTTACCTTTTCAACGTTCATATCAA
CCAGTTTTATTAATTTTGATTTGTTATTTACTGCACGTGTTGTTTAAGAG
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GGGGGGGTACTAGGGTTGCGAGCTGACGGGGGGTGCCGCCCGACTTTCGA
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GGCGGTCGATTCTAAAGGAGAGATGGCGGAAGAAGTGGATGATGAAGATG
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GTCATTGAGGGCAATTCAGTCACTCAGTCACTTAGTCAACGGCTCATCCA
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TTTCGATCGAGTCCGATCGATTGAGATGCCTTGGAGTTATTACAAGATAC
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TGACTTTTAGAATCGCACCCTTAAAGTGCATTTCTGCTACCTTGAAAATC
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CGACCTACCTTAGAAAGTTCCTATAAATTAACCCATACCCGTCCGTTCCA
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AAAAAGATAATCATTTGGGTAAATTTGGGCCAAAAAGTTCCTAAGATTTT
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GGAAATTTTCACCATTATTGAAGTAAATGAAGCGACTCCTTACACAAATC
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GGTACGTTACGTAATACTTTATTTAAATGGCGAACGCTCTCTCTAATTCG
AACTTCTATTATTCGAATCCTTCTATAATTTGTCAAGGAGAAAACAGCTC
TGTAATTCAAACAAATTAGACATCCGTTTGGATTCGAATTAGCGAGAGTC
GGCTGTATTGTTCTTGTTTCTCAAAGATTCAATCCTGGAAACGAGAAAAG
TTACTACAAGTTCAATGGACAACGGCCAAAACAATTTTTATCCAGATACC
GCATTTCCTACTTTAGGCACCGCCCTCTCATAAGCGCCACACATAAATTT
TGAGTTTTGAAATAACCGCCTTCCTCTTATAAGCGCCACACACTCAAAAG
TGGCACTTTCTTCCTTATTACTTACCCCCAATAGATCTCATAAATTTCGT
AGAGAGAACCGCCTCTATAAAAATATAAACTCATCAGTCGATCAAATTTG
TAGAACTGGTAAAAACTTAAGAAACTTGGAAACTTGAATTTCGAAATAAA
CGCCGCCCTCTATTAAGCGCCACCCTCTTTCAAGCGCCGCCCTTTAATAA
GCGCCACACCAAAAATCACGAAAATGGCTGCGGCCCTTATTTGAGGTTAA
TACGGTATTGCCTTATACGGTAAATGCCTTAAAAGTTTATTTGATGGAAA
ATCAAAATTTTTGTTTTGTAGAGTTCAGCATTGTATTATGCATCAGAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038198	XLOC_038198	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_349	supercontig	scaffold_349:66284..85631 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.000542691	0	0	0	0	0	0	0.122436	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0248668	0.00727431	0.00203171	0	0	3.40525	13.5148	2.40943e-09	0	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00060818 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: 5NTD (5'-nucleotidase OS=Homo sapiens GN=NT5E PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 93.9745 bits (232), Expect = 8.947e-20
Identity = 114/401 (28.43%), Postives = 178/401 (44.39%), Query Frame = 1

Query:  820 GNHDFDFGVDELID-FKNNTKFPWLMSNVQDK--LTQTLLADGVEKVVAEWHGHKIGIIGLVEKEWLVTLSALDADDIEYTDFIDSGRALATSLREEEGCEYIIALTHMRVPNDTRLLEADIGIDLILGGHDHHY---------EV----------KEHGNKVLVKSGTDF-RELSEITIDF-ANGNKVKTKRHXXXXXXXXX--XXXXXXXXXYMVILGQKMEEELGLMHVDLDGRFSTVRTKESNLGNFITDIM--RAATQTD--------IAFLNSGSLRSDCI-HPTGPFKMKDLVSVLPMVDMLVVIKMTGQQVIEALENSVSQYPKFEGRFLQVSGIRFAFDPDQPEGDRVVKETVM-----VHDNIPINLEYEYKVVTKEYLARGKDGFDVLKD 1896
            GNH+FD GV+ LI+      KFP L +N++ K  L   +    +   V       +GI+G   KE      +    ++ + D I + +     L+       IIAL H     D  + +   G+D+++GGH + +         EV           + G KV V     F + L  + I+F   GN + +  + I  +        IK +  K+ + L     +ELG   V LDG   + R +E N+GN I D M       TD        +  LN G +RS       G    ++L +VLP      ++++ G  + +A E+SV +Y +  G FLQV GI   +D  +  GDRVVK  V+     V    P+ ++  YKV+   +LA G DGF ++KD
Sbjct:  116 GNHEFDNGVEGLIEPLLKEAKFPILSANIKAKGPLASQISGLYLPYKVLPVGDEVVGIVGYTSKE--TPFLSNPGTNLVFEDEITALQPEVDKLKTLN-VNKIIALGHSGFEMDKLIAQKVRGVDVVVGGHSNTFLYTGNPPSKEVPAGKYPFIVTSDDGRKVPVVQAYAFGKYLGYLKIEFDERGNVISSHGNPILLNSSIPEDPSIKADINKWRIKLDNYSTQELGKTIVYLDGSSQSCRFRECNMGNLICDAMINNNLRHTDEMFWNHVSMCILNGGGIRSPIDERNNGTITWENLAAVLPFGGTFDLVQLKGSTLKKAFEHSVHRYGQSTGEFLQVGGIHVVYDLSRKPGDRVVKLDVLCTKCRVPSYDPLKMDEVYKVILPNFLANGGDGFQMIKD 513

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060818 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060818 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
5NTD	8.947e-20	28.43	5'-nucleotidase OS=Homo sapiens GN=NT5E PE=1 SV=1	[more]

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TCONS_00060818 (transcript) - C. hemisphaerica