TCONS_00060817 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060817
Unique Name	TCONS_00060817
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2635

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_349:66284..85623-

transcript sequence

>TCONS_00060817 ID=TCONS_00060817|Name=TCONS_00060817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2635bp
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CTAAACtaaaaaacgagaaaaatagttttgaaatatggttTATTCTTGAT
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agaaattaagAAAGAGTGCGAGAAATACATGGTGATCCTTGGTCAAAAGA
TGGAAGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGGCGTTTCTCA
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ATCGAGTCTGTCATGACTCATGATGATAATCTTGAGCAAGTAAATGATGA
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GAAAAGACAATCCTTCATCATGCTGCCCAACACAATTCGGTCAAAtGTTT
AGAATATTTGTTGAAAGAATCAAACTTGAAAGTGGATGTTCGTGATCAAA
TTTTGAAGaGTTCAGCATTGTATTATGCATCAGAA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_349:66284..85623-

Legend: exon

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>TCONS_00060817 ID=TCONS_00060817|Name=TCONS_00060817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19340bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_349:66284..85623- (Clytia hemisphaerica)
GTGAGAGTGTAAAAACGAAAGTGGTGAAGTGAACAGTGCCCCTCGTAAAT
CTAAACTAAAAAACGAGAAAAATAGTTTTGAAATATGGTTTATTCTTGAT
ACAACATGATTCAAAATGTAGTTGCTTGTGTAAGTATTGGACCTTTTTAT
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ATAACAAACCAGAACTAACCCCCGTCATTGAGCTACCGAAAAATGAAGCA
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GTCCGTAGTTTTGAGAATGAACCCATGGTTTTGTTTTCAGGAGATTTACT
TAACCCCTCACTTAGTAAGTTTTTAACAGNCTACGTTAAGCAAGGCTAAT
AACGCTCTACCGTTACCTTATCACTGGCTGCAGGTCAACCTTTGGTCATT
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TAGGATTTGATACAGAATGGGATGTGGTGGTTCAAAACAAACCAAAGTTG
TTAAATTTAAAGAGCCCACTGATGGATCACCTTCAAATAAAGCCAAAAAT
CAAACATCAGCACCTTCTCCAGCAAAAGACGTAACCGCTCAACCTGAAAA
ATTTACCACCCCTCCGAATCCGCCCAAAATTGAAGTCAAAGATGTCAATA
ATAACAAACCAGAACTAACCCCCGTCATTGAGCTACCAAAAAATGAAGCA
AACGTAGAACCAGTACAAGAATCAGGGGGTAACGTTGCATCTAAACTTAT
TGACAAAAGCAATGTAGAAGTTAAACCTATTACAGACAGTTCTGATAAAA
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GTAATCAACTCGAAAATAAGTCGTGTTTACTCACCAACAAAATTAGACAA
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AAAATTTTACCTATTTTCACCCAGAAAGGTGGCAAAAATGACTTATAGTA
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TGCTAGATATCTTATGGGCTCTTATGGGACCCGGCACGTCTCCGTATCAA
CTTCTCTGCTTTTTAAATGCGTAAGAAGCGCTGAAACCTAACTGGATGGT
CAAAAAACACTTTTCATTTGCTTATTCTCGTTTCAGTGAGCAATGTAACC
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GTTTACGCCATGAACCCTTTTTTTTTTGGATGCATCAATTTTAAATTTAT
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AATTTAGAAGGCCCTGTATTCCCCTTGTGCATTGTGTACATTACCGAAAT
GTTTCAAATCGTCGTCAATCACCGGTTGCATAAATTTATATCCTTCCTTA
GAGCAGAAATCTCTCCTCTGAATACCTAAGGCTTTTAATATTACAACTGT
TTTTGAGACTGAAGAAACCCGAAAGACGTTTATGTATTTTCGTTCACTTT
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CTATATTCTTTCTGTCAGATTTTGGCGTTGACGAACTCATCGATTTCAAA
AACAATACAAAGTTCCCATGGCTAATGAGTAACGTTCAAGATAAATTGAC
TCAAACACTTCTTGCTGATGGTGTAGAAAAAGTGGTCGCTGAATGGCACG
GGCATAAGGTATGATAGTGGAGTCTCTTTAACTCAAACCTCTATAACTCG
AGATTTCCTTAACTTGGACAAATTTGCGTTCCCCGTGCATTGATTCTCTG
TTTCTTAGATTACGGTATAAAAGTATAGTTTGGATCTTTATGACTAGACT
ATTTTTAAGTCCCCCGCGAAGAACTTCAATTATTAGTGTTTTGCGAGTGA
ACATTTTTTTTCAATGTTCACATATCTGTCATAAAAAGACACCTTCTCTT
TAAATCTATTACGTGATTAGCAGTCAATTCTCTAACTCGAACTTCTTTTA
TTCGAATCTTTCTATAATCCGAACTAAAATCTTTGTCAATCTCAGCTGTA
AAGTGGTTTTAATTACACTTTGTAATTTGACTCTTTCTATAATTCGAAGA
AAATTTTTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGAGTCAACTGTATACTC
ATCTTTAGATTGGTATCATTGGTTTGGTAGAGAAAGAATGGCTGGTCACA
CTCTCAGCTCTTGATGCCGATGATATCGAATATACTGATTTCATCGATTC
TGGACGTGCTCTGGCTACATCACTACGCGAAGAAGAGGTATTTTATCATA
TTTTTACGACAATTAGTCTATTATGTTTAACTCTTTTTTTTCTATGAAGA
AGCTGTAAATTAGCTATTATAGCCTCTGCTAAATGCACGTTCCACTCAAC
GCGAAATAAAGAAAGAACCATATGGCGAAAAATTTTATAAAACAAAATCA
TTATGTCGGCCATAACACAAGCCAATCATAGAAAATGTTATCAATAAGGA
TGAAGATAGGGATGTCACTTTTAAACGTTAGAACATATTTTTTTTACCTA
AGTCATTATATTGTTTAAACAATCACTTTATTTTCTTTTTTTTCTTCCAC
AGGGTTGTGAATACATTATAGCATTGACACACATGCGAGTACCAAATGAT
ACACGACTCTTAGAAGCTGATATTGGAATTGATTTGATTTTGGGAGGACA
CGACCATCATTATGAAGTGAAAGAGGTATAAAACAATATAGCTCTATTTA
AAGGGACATAAAAGTAGTAAAATGTAAACATTGCGCGAACCACGTGTAAT
TAAAGAACAAACTTGTAAAACAATTGAAAAAATCATTTTTTATTTTGACA
TGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATCTCGCTGCATACGGTTTGTTTACAA
ATTTCGTCACTACTTTTATGTCCCTTTAAATATGTCTATTATGGTCATTT
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GAAATTTCAATAAATAACGCCAGTATAGGCCGGCGGCAAAAAAGGGCCGA
TACCGTATTCAAACCTTCGTCATTTTCTTTGAACAGCATGGCAACAAGGT
GTTGGTGAAGAGTGGTACTGATTTCAGAGAGCTGTCGGAAATCACAATCG
ATTTTGCGAACGGTAACAAGGTGAAAACGAAACGACATGAGATTAACGCC
GACATTGAAGAAAATGAAGAAATTAAGAAAGAGTGCGAGAAATACATGGG
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GGAAACTTATAGCTTTTCGATAGACTGGTGGCGCTGATAAGTGACCTGGT
TGTATATGGTAGTATGCTTTTGCTTATTTTAGTTGCTTTTGGTAGTTAAA
AATAGGGTGAAGCAATGCTTTTATTTGAAAATAAAGGATTCTAGATCTGT
TATCGATGTTTGCTTCTCATTCTTATTTATATTTTTCAACTCTCAAGTAT
TAGTTATAATTATTACTTATATAAGTTCATATTTGGAATTTTCGTGTGTT
TCTTTCATAATGGCGCCCTCTTCAAATGCTCCTAGTCTACTTAACTCCTA
GCCGGGTCATAACAAAGACTTTGAATTTAGTTGAGCAATCGAGGGAGTGG
CGCTCTCCTCTACCTTCGGGTAGATAACTATCAAAGGAGGAGCCTTCGGG
TCGCCTCTGACTGCGGTCGCAGACTTGGCTCTAGTTTAGACGGCCCACTT
TTTGCCGCAGTCTATTCTAATTGTGAATTTAAGTAGGCATAAAGTAGGCT
GTCTAAAGTCAATGCATAGCCTTCTTTTGACGTCAATGCAGTGTCTTCTT
TCAAACTTTTCAAAGCAAAAACTAGAGCTTTCTTATTTTTACTTTACACG
TTTCTTATAGGTTGCAGACTTACTTACTACTTTTCTAATGACTCTCGGTG
GAACCTTTTTTTAAAATTCTTTTCCCAGTGATCCTTGGTCAAAAGATGGA
AGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGGCGTTTCTCAACTG
TCCGAACTAAAGAATCGAATCTAGGTAAATATTACTTTTATTTTCAATTT
CAATAATGTTTGTGTCTTTACATTTTGTTCATAATCACTTCTTGACGCCC
AGTTTTGCAATTTTTCCCGTCTAGCTCATATACCATTTACCAAATACTGT
TTTTCTGCATCTACGTTATGCTATCACGAGGAATTTATGTTAACAGTGCT
AGGAAACCAAACATTTATTATGATTTGCGATCAGATTGACAAAGCATAGC
GACTTCAAGGTGCCAAAACCTAAAAGCTAGATTACAGTCTTTGAGATGTT
AATAACACGTCATGTTTCAGAATATTCAAGGTTTCAGCTCTCAAGATTCC
AGCTCTCTCAAGATTCACTCGTTCACCCTGCTCTTGCGGTGAATGGTCAA
TGAAGACCCTGAAAAAAGTTTACTTTACTGTTTAACAAAATTCAACACTT
CATTTTTTTAGAACTTTAAGTTTCATGCGAACATGAGAAATGAAGTTTTG
TATTTTTGTTATAAGGCTCCTTCTAGTAGAGCACTTCTAGTTGTTGCTGT
TTTAAACACACAACTTTGACCTTATTTGATACTTTACTCTTTTTATTTTT
TTTATATCAGGAAATTTCATCNCTCTTCAAATGCTCCTAGTCTACTTAAC
TCCTAGCCGGGTCATAACAAAGACTTTGAATTTAGTTGAGCAATCGAGGG
AGTGGCGCTCTCCTCTACCTTCGGGTAGATAACTATCAAAGGAGGAGCCT
TCGGGTCGCCTCTGACTGCGGTCGCAGACTTGGCTCTAGTTTAGACGGCC
CACTTTTTGCCGCAGTCTATTCTAATTGTGAATTTAAGTAGGCATAAAGT
AGGCTGTCTAAAGTCAATGCATAGCCTTCTTTTGACGTCAATGCAGTGTC
TTCTTTCAAACTTTTCAAAGCAAAAACTAGAGCTTTCTTATTTTTACTTT
ACACGTTTCTTATAGGTTGCAGACTTACTTACTACTTTTCTAATGACTCT
CGGTGGAACCTTTTTTTAAAATTCTTTTCCCAGTGATCCTTGGTCAAAAG
ATGGAAGAAGAGTTAGGTTTGATGCATGTTGATCTGGACGGGCGTTTCTC
AACTGTCCGAACTAAAGAATCGAATCTAGGTAAATATTACTTTTATTTTC
AATTTCAATAATGTTTGTGTCTTTACATTTTGTTCATAATCACTTCTTGA
CGCCCAGTTTTGCAATTTTTCCCGTCTAGCTCATATACCATTTACCAAAT
ACTGTTTTTCTGCATCTACGTTATGCTATCACGAGGAATTTATGTTAACA
GTGCTAGGAAACCAAACATTTATTATGATTTGCGATCAGATTGACAAAGC
ATAGCGACTTCAAGGTGCCAAAACCTAAAAGCTAGATTACAGTCTTTGAG
ATGTTAATAACACGTCATGTTTCAGAATATTCAAGGTTTCAGCTCTCAAG
ATTCCAGCTCTCTCAAGATTCACTCGTTCACCCTGCTCTTGCGGTGAATG
GTCAATGAAGACCCTGAAAAAAGTTTACTTTACTGTTTAACAAAATTCAA
CACTTCATTTTTTTAGAACTTTAAGTTTCATGCGAACATGAGAAATGAAG
TTTTGTATTTTTGTTATAAGGCTCCTTCTAGTAGAGCACTTCTAGTTGTT
GCTGTTTTAAACACACAACTTTGACCTTATTTGATACTTTACTCTTTTTA
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GGGCTTACGCCAATTAAGGCTGTAAATAACGCCAAAATATGTTAGAATGG
CTCTTTATGCTTCAATTTACATTAAAATATCATTTTTCAGTAGTAAACTG
TGGAAAATTCCATTGAAAATCACTGATTTTTGCAAAATTTTAGATATTGA
GTAAAACAATGGATAATTTTTCGTCTTCGAATTATACATAAAATCCTTAA
AATAGAGAAAAATGGTCAAAAGTTATCGCCACTGTTAAGTAAAATTTGCA
AAATTTTGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACA
CCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGTCCTTTTAACGCCGGC
CCTTATTACGCCAAAAGTCTAAAAATAACACCAATAAGGGCCGTAAAAAG
GGCCGATAAGGTATTCCAATACAGTGGAGTCTCTATAACTCGAACCTGCA
CGGGAAGCACGAATTTGTTCGAATTGAAGAGACTCTACTGTAGTATTATT
TTGACGACCTGAATCTAACATTACTGCCTTAAAAATTAAGATTCTTGAAA
GGAAATTATACAACAGCTGATTGGTCGCGCCATATTGAAAAGGAAAAACT
AGAAAAGGTATATAATTTCGTGTAGTCATTCATTGAAGTGGTGGATTCCT
TAAGCGTAAAAAATTGATCGGTCGTAAAAATTCCTCAGTAAAAGATTTTC
TCACAAAGGGATTTTTTGTCACTTTTTACCAAATAATTTTCTACTGTAAA
TGTATCACGTATTTTGAAATACTACGAGTTTTAAGTTAATTTCATACTGG
AAGCTTCAAGACGTCCAGCTTGAAATACTGTACGTTTTAAATAATGGATT
TATACTTTAAGCGTACAAACTTTCGCGAACAGAAACTATTTTCGCGAATT
TTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTGAAAATTCTTGGAAGGGCCA
TTCACGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAATTCTTGAAAAAAATAGAAAATCT
GTAAAACTTTGAATAAAATGTAACATTTATGGCAATTTCTAGCCTTTTTA
AAGCCTAATGATTCAAAAGACAAAAGTTCCAAGCCTATTAAAGAAGTATT
TGTCCATTTTTTCACGTGAAGATTTTGATTTTTACGTCTTGATTCGCGAA
CAATTATGCTCGCGAAAAAGATTTTTCCGTCAAATTCGCGAAAGTATATG
TTTTTAAATTTCGTGATTTTTCGACCTCGCGAAAATTTCTGCTCGCTAAA
GTATTTGTTCNATCAGGAAATTTCATCACCGACATTATGCGAGCTGCGAC
ACAAACCGACATTGCGTTCTTGAATAGCGGTAGCTTACGTTCTGATTGCA
TTCATCCAACTGGTCCGTTCAAAATGAAGGTAGTTAATGATGAAATTTTT
CTCTCTTTCTTTTATATTACCTTATCGGTCCTTTTTACGCCGGCCCTAAT
TTAACGCCGGCCCCTTTTACGCCGGCACTTATTACGCCACAGCCTAATTT
TGGGCTTACGCCAATTAAGGCTGTAAATAACGCCAAAATATGTTAGAATG
GCTCTTTATGCTTCAATTTACATTAAAATATCATTTTTCAGTAGTAAACT
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AGTAAAACAATGGATAATTTTTCGTCTTCGAATTATACATAAAATCCTTA
AAATAGAGAAAAATGGTCAAAAGTTATCGCCACTGTTAAGTAAAATTTGC
AAAATTTTGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAAC
ACCGGCCCTTTTAACACCGGCCCTTTTAACACCGGTCCTTTTAACGCCGG
CCCTTATTACGCCAAAAGTCTAAAAATAACACCAATAAGGGCCGTAAAAA
GGGCCGATAAGGTATTCCAATACAGTGGAGTCTCTATAACTCGAACCTGC
ACGGGAAGCACGAATTTGTTCGAATTGAAGAGACTCTACTGTAGTATTAT
TTTGACGACCTGAATCTAACATTACTGCCTTAAAAATTAAGATTCTTGAA
AGGAAATTATACAACAGCTGATTGGTCGCGCCATATTGAAAAGGAAAAAC
TAGAAAAGGTATATAATTTCGTGTAGTCATTCATTGAAGTGGTGGATTCC
TTAAGCGTAAAAAATTGATCGGTCGTAAAAATTCCTCAGTAAAAGATTTT
CTCACAAAGGGATTTTTTGTCACTTTTTACCAAATAATTTTCTACTGTAA
ATGTATCACGTATTTTGAAATACTACGAGTTTTAAGTTAATTTCATACTG
GAAGCTTCAAGACGTCCAGCTTGAAATACTGTACGTTTTAAATAATGGAT
TTATACTTTAAGCGTACAAACTTTCGCGAACAGAAACTATTTTCGCGAAT
TTTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTGAAAATTCTTGGAAGGGCC
ATTCACGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAATTCTTGAAAAAAATAGAAAATC
TGTAAAACTTTGAATAAAATGTAACATTTATGGCAATTTCTAGCCTTTTT
AAAGCCTAATGATTCAAAAGACAAAAGTTCCAAGCCTATTAAAGAAGTAT
TTGTCCATTTTTTCACGTGAAGATTTTGATTTTTACGTCTTGATTCGCGA
ACAATTATGCTCGCGAAAAAGATTTTTCCGTCAAATTCGCGAAAGTATAT
GTTTTTAAATTTCGTGATTTTTCGACCTCGCGAAAATTTCTGCTCGCGAA
AGTTTGTACACCTAAAGTATTTGTTTATGTTCTGTTTTTTTCCATAGGAT
TTGGTATCTGTATTACCGATGGTTGATATGCTGGTTGTCATTAAAATGAC
TGGTACGTTCGTTATTATTTTGTGTGTCGACTCTCTAATTCGATTTTCAT
GGGACCATAAGTTTTCTTTGACTTACAGAGAATATATTAAGCCATTTTAC
AACCAGCGCTGTGGGGACCAATATTTTAGTTCAGATTACAGCAAGATTCA
AATAATAGAGGCATAATAACAAAGCAGCGCTTGCCGAGTGGCCAAGGTAT
CAGCGTTTCAATAAAATGACATGAGTACTCTATGCTAATTTGTCATTCAT
TCATGTCTGAGAAGAAAAGCTTTGCTACTGTTTTAAAGCTTATTGGACCT
AACTGGAGGTCCTATAAATTAACCCGTGTTCGTCCGTCCGTCCGTCTGTC
CGTCCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAATCTTTTG
ATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAATGGTAGTGGCCAAAATGTGACGGAGCC
CGATTTTCGAAAAAAAATTCTTTTGGGCAAATTTAGGCTAAAAAAAGGCT
AAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCT
GATTTTTTGCATGAAAGTATGCTAACATCATTGGTAAAAGATGGGCAGAT
TTTCGCAAAAAAATTTTGTTGGCTCAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGA
ATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTT
TTTTATGAGATAGATGGTTTTTTTGCTCATGAGGGGTTACTTTTGAAGAA
TATGTGTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAA
AAACTGGCCAAATTTGATATTTTTCTATAAGCACATTAGCAATTACTTAG
GTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTTGCA
CAAAGATGCACATAACTATAAACCCTTGAATGTGACGGAGCTCGATTTTT
TGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAGGCAGATTTTTGTAAAAAAAAT
AATTTTTCAAGTCAAAAAACGCATCTTTTTCTATAAGAATCACTATTAAA
AAGCATACATCAATGATCTTAGCCAAATTACTCAATTCTTTGACGAGAAA
GATGTTTTTTTGGTCACAAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGAGC
ATGAAATTTTGGTTTCTCAACGTTTTCTTTATAAGAAACAAACGACTAAT
TTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTACAGTTTACA
ATTTTGGTTTCTCAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAACGACTAATTTTAA
TAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTACAGTCATCCTGACG
TAGATATCAATTATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCTATAAAAG
TATCACTTGTTTAGTTTTATTATTAGTGGTTGCATTTGATACTTCTCTCT
CAAATTTTCGGAACGAATAACTTACTCATAACTATTTTTCTTTCGTTTTA
GGTCAACAGGTCATTGAAGCGCTGGAAAATTCCGTATCGCAATATCCAAA
GTTCGAAGGAAGATTTTTACAGGTTTGTAAGCCTCTTAGGAAATTTTCCA
ATTTCATTGTTAAAGCAACATATCTCATGAGAAAATGCTATTTGAATATG
GACGTTATCATTTTTAAAGTGCCACTGGAATTAGGTAGGTAGGGGCGCTT
AGTTGGGGGGTGAATATGCATATGAAATCAAAAAATTGTTGAAAATTTGA
GTTTATTACTGAATGATAACAATATAGCGCTTTTAAAAATAACATGACAA
TTTTTAGTGATAGCCTGTTGATAATTTTCATACCAAAAAATATTTTTATT
CTAACATTTCATATTAATCATGTTCAACAGGTTTCTGGTATTCGATTTGC
TTTTGATCCTGACCAACCAGAAGGTGATCGAGTTGTGAAAGAAACAGTCA
TGGTTCACGATAATATACCTATCAACCTCGAATATGTAAGAATTTTTAAA
TATTTATGTCACTTTTATAGTAATTCAATCCCCNAACCTCGAATATGTAA
GAATTTTTTAATATTTATGTCACTTTTATAGTAGTTCAATCCCTGGACCA
AGTTACTCAATGTCGACCAAGCAAAATATTATGGTCGGAGTTTTTTTGAA
ATTGGTACCCGCGGAGAGAACGCTAGATCTAGTTTTGCATGTACACTAAT
GATGTAGCGCCGTTTGTCGTTAGGTAAAGTTTCAATCACTACAATGACTT
CTTTGCGGGTACCAATTTTCAAAAAACTTGGATCAAAGATGGCGGATATA
GTTTAGTCCAGGGATATATAAAGGTCAGTGAGTTCAACCCTAAGATATTC
ATTTTCGACATTTCTGAACCATCCTGTTGGCTTGGTATTTAAGTCCGAGA
TTTTTTGAGCCTCAAACATTCCAATCCTATGCGGTAAATTGTACATTATG
ATAAATGATTTTGTAATTTGGGATTAAATTCTTGCAAATTAGTGAACTGT
GACTAGCAGATAGATATTATAGCAGCGTTGGTCTTTATCGCCAGATATCG
AGCCATGATTTTGCAGTCATTGAATTGATTTTTCATGAACAAACAATCAT
TTTCACTTTACTAGTAGCTCCTTTTTCTTCAGTGTAATGACCAGCACTGC
ATGGATACTGTGTGGAAGATTCCGTTTTTTGCGGACAATAATTTTTTGCA
CCATTTGGAGTTTAGTTTAATTTCACTGATAGACTGACTCTTTTTTTTCC
TTATTTGACAGGAATATAAAGTGGTAACCAAAGAATACTTAGCGCGTGGT
AAAGATGGCTTCGATGTACTCAAAGATTGTCCTGTTTTGGTATGTTTTTA
ACAAAATGGTCACAAGATAAGAAAAACTATCCAAAATATACCATGTCCGA
ACCTTTATTGACCGTAATTGGTACTGTTGCCAATTATCAATTAAATTCTC
ATCTGCATATAGATATTTTTTGGGACGACCAGCTCTAAACAGGCCCAAAG
TTTGAATAATAATCTCCCTCACTTTGTTACTACTCGCAGATTCATTTATT
CATTGAATTTTGTAAAGTAAAAATAGACTCTAAATAAGTTTGACTTTATC
GACATGGAAATTTACCGTGGCTTCACGAGAGTACGTTTGGCTACGTTTTG
GAAGATTCTTCTCCCATCAAATATTCTCATCATACCAATGTATTCGCACC
ATTAGGTTGATGCGGAGAATGGACCAGTACTTTTGTCCATCGTTGAAAAT
CACTTTGAATCCATTCGTATTTACAAAGGAAAGAGGAAGAGTGTTTCTGG
CCATCGACAGAGTATCACTGTGTATGTTGTTCTATCTTTTTCTCGTATTT
TTCAGTCTGACACCCCCTTCTCACAGACCCTGTAGGATTTTTCAGGCAGT
GGGGGAAAAAATAACGGACTGAAACTCGATGGAAATTGATTTTCCATGTT
TTTTTATGGCTGGAGATTTAAATTCCATTGTTTTCAAGTCAGAAAACTCT
GTGTGGATGGGAAAAAGAGCATGATATTTTGCAGTGAGGAATGATTCATT
TGATTGTTTCCACTGGGGACAAAAATTGAAGTATAATTTTCCACTGGGGA
CGATATTTTCGCTAATTTTTCCAGTGAGAAGGGTTCCTAGTAGGTTTGTG
AGAAGGGGGTGTTTACTGCTTCGTCATTTCTTTTAAATAGATAAGAAGGG
TGTGTAAGTTGAGTTTGCTATCTACTAACTGGGCCTCCTTAGGATGGGCT
TCTGGACAATTTTAGATCAATTTATTCAGCCCCCCTTCGTATCTTTAAGG
TATGATCTTTCCACTTTGTTACCTTTTCAACGTTCATATCAACCAGTTTT
ATTAATTTTGATTTGTTATTTACTGCACGTGTTGTTTAAGAGTCTGATTC
TCGTTTTGTAAAAATTTGGATAATAGGTGTACAAAAATCATTAAAAAGTA
ATTGAGTATGTAAGGGTTAAATTACGAAAACCAAAAATCGATTACCTCAA
AGGGTCATAAATCCTTAAAATTTGGACTAAAATTTGAAAATTTAGGCTAA
AACTTTATAGAAATGGTCTCTCTAAGGAGGGCAAAAACGTCAAAATATGG
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CTGATTTATCTTTAAAATTCCTTTTTCAGAAAACACGACGAGCAACAGAC
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AAGGAGGAACGATAAAAATATACTGCCCTGAAACAAAGAACAGGTTAAGA
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CCAAAGTTATCGATGTTATTATAAAAAACCTGTACAGGTTTGTATCATTT
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CTTCCTTAAACAATCATCTTCATTTTCTTTTACTCCCGAGGGGGGGGGGT
ACTAGGGTTGCGAGCTGACGGGGGGTGCCGCCCGACTTTCGAACTTTGGA
CCCTTACCAGGACTTAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAATTTTGGGAATTTT
ACGACCCTTAGCGGGACAAATTCGACCAATTCGAATCAATTCGAATTCTA
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CTTTGGATGATGTCGATTACGGTCGATCACTGTCAATTACTGTCAATTTT
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GTGGTAAGACTGACGGACTGACTTTTAAAGACAATAATTATTCCCAAAAC
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AAATAAGAACTGAGAATCAGTCCAAACTACCTTGCTTATAATGCGAATCA
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CATTTAACGTTAGATTAACGTTGAAACAACGTTGTGTGCCAGTTGGGGTT
CTTTATTTTCTAAATGTTCCTGTCTCATTTTTTTCACCAGCTATCTCCTA
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ATTTTTTCACCAGCTATCTCCTACTTTCGTCCGCCGTAAATCCAAACTTC
GTGCTATCACGCCCGCCCTAAACCAAGGCGTATCAACTGGTACGTTAGGC
GCTATCTCCGAAGATGAAGGAGGCGTACAGAGTGGTGAGAGCATAGTAAT
TCAATCGGTTGAGGGTGGAGAAAATGCAGAGCCGGGCGTTGTGGCGGTCG
ATTCTAAAGGAGAGATGGCGGAAGAAGTGGATGATGAAGATGATTCGGAT
ATCGAGTCTGTCATGACTCATGATGATAATCTTGTAAGTATGTTCTTTTA
CCGGAGCTTCGCTTGTGAAGACTAAATTGAAATTTTAGTTCTCGTACTGT
GAAACCTTATAAAAAAGTTTAGGGGCTGTTTATATTGAAGCCAGTGAGGT
GGGATGGATTTTCGAACGTTACGTCACTGTTTTTGACGAATCGAATGGAT
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GATAATGTAAAAACAATCAGGTTTTTGTGATCTTCAAATGTAGGAGCAAG
TAAATGATGATGACCGAATGAGAATGTGGGAAGCTGTTGGCATTGATGAT
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TTTTTGTTTTTTGTCAACTTTGAAATCTAGATTTTTGGCTGGGAACCCCC
TTAGCTTAAAAAAGGGAGCTTCTGTTTCTTAAGTTTAGGGGTTAAGTTTC
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GGAATTACTTAACGGTCAATCCTTAGGAACCATTTCAAAATTTAATCGTT
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GAGTCCGATCGATTGAGATGCCTTGGAGTTATTACAAGATACTTCACTGA
TTGGTCATTTAAAGTGATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGTAATAA
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GGGTAGTGGTTTACCAACTGACGGTATGTGCGGCGAAAAGATTGACTTTT
AGAATCGCACCCTTAAAGTGCATTTCTGCTACCTTGAAAATCATACCCTT
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TCTTCCATAACGGCGGAAGTTACGTAACCTCTAAATATTGATTTCTCAAT
CACAGTAACTACTACATTTTCGCTTATCCTTCACTTACACTCAGTATTTG
TTCTTTATTCTTCTTTCTTCTCTTTTTTAGTGTTTAGAATATTTGTTGAA
AGAATCAAACTTGAAAGTGGATGTTCGTGATCAAATTTTGAAGGTACGTT
ACGTAATACTTTATTTAAATGGCGAACGCTCTCTCTAATTCGAACTTCTA
TTATTCGAATCCTTCTATAATTTGTCAAGGAGAAAACAGCTCTGTAATTC
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TGTTCTTGTTTCTCAAAGATTCAATCCTGGAAACGAGAAAAGTTACTACA
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TACTTTAGGCACCGCCCTCTCATAAGCGCCACACATAAATTTTGAGTTTT
GAAATAACCGCCTTCCTCTTATAAGCGCCACACACTCAAAAGTGGCACTT
TCTTCCTTATTACTTACCCCCAATAGATCTCATAAATTTCGTAGAGAGAA
CCGCCTCTATAAAAATATAAACTCATCAGTCGATCAAATTTGTAGAACTG
GTAAAAACTTAAGAAACTTGGAAACTTGAATTTCGAAATAAACGCCGCCC
TCTATTAAGCGCCACCCTCTTTCAAGCGCCGCCCTTTAATAAGCGCCACA
CCAAAAATCACGAAAATGGCTGCGGCCCTTATTTGAGGTTAATACGGTAT
TGCCTTATACGGTAAATGCCTTAAAAGTTTATTTGATGGAAAATCAAAAT
TTTTGTTTTGTAGAGTTCAGCATTGTATTATGCATCAGAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038198	XLOC_038198	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_349	supercontig	scaffold_349:66284..85623 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0405098	0	0	0	4.66044e-10	0	1.69805e-09	2.57642e-08	0	0	0	0	0	0	0	0	8.33558e-10	0	1.8128e-09	0.000704119	6.98363e-06	0.134709	0	0	6.09539	1.29908	2.19857e-07	0	1.13868e-09	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00060817 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: 5NTD (5'-nucleotidase OS=Homo sapiens GN=NT5E PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 93.9745 bits (232), Expect = 8.895e-20
Identity = 114/401 (28.43%), Postives = 178/401 (44.39%), Query Frame = 2

Query:  812 GNHDFDFGVDELID-FKNNTKFPWLMSNVQDK--LTQTLLADGVEKVVAEWHGHKIGIIGLVEKEWLVTLSALDADDIEYTDFIDSGRALATSLREEEGCEYIIALTHMRVPNDTRLLEADIGIDLILGGHDHHY---------EV----------KEHGNKVLVKSGTDF-RELSEITIDF-ANGNKVKTKRHXXXXXXXXX--XXXXXXXXXYMVILGQKMEEELGLMHVDLDGRFSTVRTKESNLGNFITDIM--RAATQTD--------IAFLNSGSLRSDCI-HPTGPFKMKDLVSVLPMVDMLVVIKMTGQQVIEALENSVSQYPKFEGRFLQVSGIRFAFDPDQPEGDRVVKETVM-----VHDNIPINLEYEYKVVTKEYLARGKDGFDVLKD 1888
            GNH+FD GV+ LI+      KFP L +N++ K  L   +    +   V       +GI+G   KE      +    ++ + D I + +     L+       IIAL H     D  + +   G+D+++GGH + +         EV           + G KV V     F + L  + I+F   GN + +  + I  +        IK +  K+ + L     +ELG   V LDG   + R +E N+GN I D M       TD        +  LN G +RS       G    ++L +VLP      ++++ G  + +A E+SV +Y +  G FLQV GI   +D  +  GDRVVK  V+     V    P+ ++  YKV+   +LA G DGF ++KD
Sbjct:  116 GNHEFDNGVEGLIEPLLKEAKFPILSANIKAKGPLASQISGLYLPYKVLPVGDEVVGIVGYTSKE--TPFLSNPGTNLVFEDEITALQPEVDKLKTLN-VNKIIALGHSGFEMDKLIAQKVRGVDVVVGGHSNTFLYTGNPPSKEVPAGKYPFIVTSDDGRKVPVVQAYAFGKYLGYLKIEFDERGNVISSHGNPILLNSSIPEDPSIKADINKWRIKLDNYSTQELGKTIVYLDGSSQSCRFRECNMGNLICDAMINNNLRHTDEMFWNHVSMCILNGGGIRSPIDERNNGTITWENLAAVLPFGGTFDLVQLKGSTLKKAFEHSVHRYGQSTGEFLQVGGIHVVYDLSRKPGDRVVKLDVLCTKCRVPSYDPLKMDEVYKVILPNFLANGGDGFQMIKD 513

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060817 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060817 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
5NTD	8.895e-20	28.43	5'-nucleotidase OS=Homo sapiens GN=NT5E PE=1 SV=1	[more]

You are here

TCONS_00060817 (transcript) - C. hemisphaerica