TCONS_00060318 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060318
Unique Name	TCONS_00060318
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2327

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_340:328496..338467+

transcript sequence

>TCONS_00060318 ID=TCONS_00060318|Name=TCONS_00060318|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2327bp
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ATGTGAGCGACTGGCAAAGATTTACNN

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_340:328496..338467+

Legend: exon

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>TCONS_00060318 ID=TCONS_00060318|Name=TCONS_00060318|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9972bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_340:328496..338467+ (Clytia hemisphaerica)
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TCAATTCGTACATTTGCCAGCAACAAAAGACAAGGAGGTAAGAATATATA
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GGTTATATGATTGCTAATTACATACCACCATTTATCAACAACGCAGTACT
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AAACGTCACGAGGAGAAAGTCTTTGAATTCGTCAAAGAGTTTGTTAAGCA
GCTACCAACGGATGAATGCTGCAATTTCTTACGCTTTGTTACTGGATGTG
AGCGACTGGCAAAGATTTACNN

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_037949	XLOC_037949	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_340	supercontig	scaffold_340:328496..338467 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.0384541	0.0939971	0	0	0	0.49751	0.28109	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.301872	0.124799	0	0	0.353094	0.793364	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060318 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060318 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00060318 (transcript) - C. hemisphaerica