TCONS_00060207 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060207
Unique Name	TCONS_00060207
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	6025

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_337:77645..87579-

transcript sequence

>TCONS_00060207 ID=TCONS_00060207|Name=TCONS_00060207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6025bp
AGattCTTCACTATCTAATGACATTGACATGGGCATTGCTGATGAAGAAC
CAATTGTGTCATCTTCGgaagACCCCTCAACATATCCGCCATCAACAAGT
ACACGACACGCAGATGCCATGTTTCGGGAAGGTATCAACAATTCAACATT
AATCGCCTCtgacaaaataatcaaaacgaGTGAAGCATGCCATCTTATCC
ACTCTATAGATGAGAAGTTGGAAGCTGCTTCTCACAAAAGCTATCTGAGT
TTGTTGTCGTGTGAGCAGAGTCTTCTTAACTTATCCAGCTGCGATGAAAC
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TACGGCGAAGCTTTAATAAACAACAAACTGGAATGTAGGACattgtcatt
gaaatcatttaaCGCTGCTGATGTCGCGAACGACCGACTAAGAAAAGATA
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CCTCTGCTCTGCTCCAGCAGTATTTTCTAACCTCCGCATCTATTAGAGAT
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GCTAACTTTTACTTTTATGAAGATAAGGTTTTAAaggctaaaaaaagttt
tttgacatATATTATTGATGTCATATCTAATAGGACGATTTATAAGTGTA
TTTTTCAGATTACAACGTTTTTTGACAGTTAcaaaatttgctttttatac
ttttttctttgaCACATGACATATTATGACACCTTACGTTACCTACGAGA
CATTTTACACAACAGACATCCCGTTTTTGGTATTTGTCGAGCCAGAGAGA
CTTCGATCAAGGCATCGATTGGGAAGCAAGTCTTGTTGCTTATAAGCTCC
AAAATTTAAATTCATCCGAAGAAGCGGAATCAATATTCCAGAAAAGTAAT
TATACGGGTCCATTGTCTCTACAAGAGCAATTAGACATTTTATCTGAGAT
ACCAAACAATCATTATTATCTTTGGTCGCTGGCCAAAGATCCTGCTGAAC
AACAAGTTAAATTTGCTCAACGCTTTTCCACGTCTACGAAATACCCGTGT
AGTTCGCCAAGAAACAGAATTATAAATACCGTTGTGTTTAACGCAACACC
TAGTAATATCATTAATGCCCTTCATGTTATGCTTGATTTATACAATGATT
CTGATGTCAAAGGCCCACCTTCGAAGAGAAGAAAGTGCGTGTTTGACAAA
AAGAAAAGAGTCGTCGTTGACACTCCATACATTTGTAACCACCTTGGTAT
TGACGAGGAGGAAGTCTTAGAATTATCCAAAAACATCTCTTCAATCGCAA
CACAGAAAAACAAAGACGAGAAACTCTATCTGCATTAcgtggaaaaactt
ttttcatcagGCTGTTTGAATTGGAGAGTATTAAAGGCTCCATCTCttca
aataattttaatgaACAACATTGATCCGATGACTGGTGAATTTAAGGTAA
GTCAGTGCTGAGCAGGATCTTGGGCTCTTTTTATGGGAATCCAAGCCGAT
AAGCCCAAGGGACTTCGAATGGATTTTTGTGTATTTCGTTTTTTTGGATA
AAGATTTTGTGCACGTGACAATCAAAGGAACGACGACAGGTCCAATCATC
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AGATGTAAACGGTTCAGTGGGTTTTCGAGGCTTGAAATGCTGTCATTCTC
GGCTCGCAGAAGATTTACTCGTCCTCAAACCCATGAATTTCGTGCCGAAT
GAACTTGAGGAAACTTCAATAGGGAGACATTATTTTAATGCAGATTCAAT
TTCCAAGGCAGAGGAATCCGTTAATATGCCAATCCTACAGCTACCTGGAA
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CTGATTACGATTTGCAGGAATAAAAAGGGACACAACACAATAACGTGTCA
CAACTCCTATTGCcgttcaaaaatttccaaggagCGGTACTTGGATACGT
TCCAAAAATCTGATAACCTTTGCCCACACCTTGAGTTTCTAAGGAGTTCT
TTTGATGTGACCACCCTGAGGTTCACAGAAGGTGTGCAggacgaagatga
aaatgaaaatgaaaatgaaaacaacaacgacaacgacaTGGAATGTGATG
ATTTTGTATCCGACGCTGAACCTATTGAGTGGGAAAAGGTGTTCGACGAA
GATACTGGTCGATGGAAATTCCATGAGAAAGCTCCAAGCGTTTGGCGCGT
CAGCGATAAGAGGGACGAAATTTATCAAGAAAACATCAAAAGGCGGGCAA
TACAAATTTTACTTGGTCAGGAAATCAAACTCATTCCATCAAAGAATGGT
AATTGTGGATGTGAGGTAAGCTTAATTTACGTTTTTCCAATGTCAATGTA
ATCAAATCAAAGTTAGTTATAAAATCTATGAAAATCTTGTGGATTAAAAG
TTAActgatttgattttattttaatgcAAAAGAACCAATTGTTGTGTCGA
CAGCCTATTGCGTGATACCATTTTTTATAAGCGCAGTCATATCATATCCA
CTTCCATGAAAGTCATTCTAACATTTCATAACAAGTTTTATCTTGTTTAT
TTAGGGTGGATGGTACAACGAAGAGAATCCAGACGGTCATATAATGCCTC
GCGGGGAAACTATCGTTTACTCTACCATGGGTGCAGCCAAAGGTCGACTT
TACGAGCGAGCGTGTATGGGTGGCAGCTGCTTTCGGGACTATGACGGGTC
TGAAGACAGTTTGTTTCGATCTAGCACAACAGTTGCCTGCGGGTACGAAA
TAGGCTGGGAGTTCGTGGACAGCGTAATGACCagcaaacaaacattttca
GGGTTTGTCAAGGTTGTCAAAAATAGGTACACAGACTACCAGTCTCCATG
TGAATTTATGTCCAGGAACACTCTGATCAAGTGGTGGTTCAGCTGGGCTT
CAGCAATGGATCTGGACTTTGTTAAAAAATGTCCGAGTTGTGGATCAGAT
CCAAAGTACCTGGCCGCCGATGCCACAAAGATCGGAATTACATTTAAGCA
GATTAATGTGACGCCAATTGAGCAGCCTGTCGGAGATTCTTTTCCTACAA
AAAGAAGGAGATATGACCGAACCTTCATTAACAACCGCAACAGTAAATCA
AGAATAGTCGTCAACGAGGctctaaatttaatttcaagACATTTTTGTGG
CAAAGTCAAGGCCAGTAAAGAAGATTTAGAAGTAGCGAAAAAAACACTGA
TGAGATCAGAAATCCCTGTGGTGCGTTTAGTGACAGAAAAACTCTTTGAG
TGTGATATCTCAACTCTCGAAAGAACATCATTGAGTAAATTAATAGTGAT
ATTAACCAAAGATACAAGTTTAATTAATCTAATTCCAAAAAGATACCTAC
CTCAATTTGAAACTTTGAACACTTTATTGGCGTCGGTGAATGCAATCGAA
GAGAACAGTGATCTGTGGCGAGTTGTAGAAGAATTCCATCGGTCTTCAAA
GTTCTTCTTTCCTGAGCTCGGTGATTGGCTGTTCATCGTAACATCTCTCT
CCAAAGGATCTGCACCTAAAACATACGGAGTTGAATTTCTTAGATATCTT
TTTCTTCTAAGAAAAGAGATAATGGATGATGAGGTTCCCCCTGAAGATCC
AAGATTAGTCAAGAAATATAATCCTCCAAGAGACGGGAGAGCGTACTATT
TTCATGATGGGGACCAGATTCGGGAAACGAGAAAGTTTAGCGCCGACAAA
GACAACAAAAGGTTGGACAACTTTGACGATCTTCCTGACAAAGACGtttg
ttcaaagatttttccaacTGCCAAAGGCAGATCCTATTTGTTTTTGTGGT
TTTGCCCAGCACACGGGCACTGTTACGGATATCATATAATTCCCCACGCA
GAAGGCCGAAAGGATGCTGCAGCGCCTCTATACGCTTTCTTGAAAAAGGC
ACcatatgaaattttttatgactttgCTTGTTCATTGGAGGAGTATGGTA
GGAACAGGGAAAGTGGTTTCTTCCAAGACACCCGCTTTTTCCACGATATC
TTCCATGGATATGGACATAAATGTTCTGATGTGTTCAAGTCAAACAGATT
GCTTGGATTCAACGGCTTGAACACATCCATTTGCGAGCAGTTTAACAGTT
TTCTGCAGTGCATCAAGACATCAGGGAAACTGATGACACAGGAGCATTTC
ACCTTTTATGTCCAATTTTTCATTTACCAATGGAATCTGGCTCGAAAAGA
CTCGTTTGCAAAAAGAATTGCTGTTGCAATCGCCTGCACCAGATAAAGTT
ATTTTTATAGCTACATTCCTTGTAAAACAATTATTTTTATAGCTACATTC
CTTGTATCCTTGTAAAACAGTTATTTTTATAGCTACATTCATTGTAAAAC
AGTTATTTTTGAATCTActttaatgtcaaaaattttcgcggTCAGAAAAT
CTTTGTTATTTCGCGAGAATTTTATTTCGCGCATTTGACTTAATGAAATA
TTTCGCGTTGTGTGTCATTTTCGAATCatgaagaaaaagtttttgcctgg
tttttcttataaagtggAAAGTGAAAGTATTtgtttttgctctttttttt
attttttcaaaatattatcacCACATGTTCTATACATGCAATCAAATAGT
AATTTAGTACTTTAAGATGGGtgtcaactgaaaaaaaaataagttcgTCG
CAAATACCTGTTAACAAAAGATAAATCCAGACATATGTATGGAATTAAAA
ATCTATTGTTGTCTTTTACGGCAAATTAGAAATAATAAACGATATATGGA
ATGAAaacgtttttcatttttcatcgctTATTTTTTTCGCCCTATcgcaa
ataaaacaataggttTTTAATTTCAgacgtacatgtttttttttataatc
atacaaaaatccgaaaacaggctcagagatgcttaggtcgaaagcttaat
aaggctgaaaaatgcttgagggaatgcttaaatctaaagcataaatttag
ggaaatactaaaaatccgtaaaattccagccaaaaaaagccgaaatcagg
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ttccccttatctgagcctagatatgcttataagtgcaatgcttataaaaa
aaagtttatcgTCGCTTTAAGTTCTCTTATATTGGTAGTATTGGACATAA
GGCACTCTTATTTTACAGCGACGATATAAGGGTGGAAATAAGAGTGCCTC
ATGTCAAATACTACAAACATGAGAATACTTGAACTGCTATTTCCTCAAGA
TGTCAAAAATGGACATAAGGCACTCTTATTTTACAGCGACGATATatgtc
tggatttatttttgGCGACAAACAAATTCGCGACGATCTTATTTTTCCGA
TAGACACCAAGCTTTAGTGATCTAAAGACTTTCGCGAGTCAGCAATATTT
ACTTTTTTCGTGACCAGTTAGTTTCGCGAATCGAAGCAAATTCCTTAAAA
TCGCAGGAATTTCAAGCTGCAAAACTTTTGACGTCAAAGTAAATCCCATG
TAAGACAGTTTCTATTATAAACAGT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_337:77645..87579-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00060207 ID=TCONS_00060207|Name=TCONS_00060207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9935bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_337:77645..87579- (Clytia hemisphaerica)
AGGTAATACTTAATACAACAGGATTCAATCCTGGANGTCATGATGAGACA
CATCTCTGCTTAAACAGATATTTTTAATAGAATTATTAATAGTTTGTTAA
ATTTTTAATTAATGGTTTGTTCAAAATCAATACAGCTCTGCAATGTTGGA
ACCAATCAAATCATTGACATCAGGTAATACTTAATACAACAGGATTCAAT
CCTGGAATGAAATTTGATTCTTAAGATTCAATCCTCATCCCTATCCTATC
TTAGAAAAAGTTGTGCATTAATATCATACTTTGAAGATTTTGTAAATCGT
AATCAGTTGCCTTGAATTCATCAGTTCATATAAAAACTTTTTCACAACTT
TTGTGTGAATTTAGCATGATTATATCTAATTATCAGAATTCAGTTGAATA
TAATTGACCAGCTGTTGATAGATAAAATGAAAGACGATCCTCCTGCGATG
TCAAGTTATATATTTTTTAGATTCTTCACTATCTAATGACATTGACATGG
GCATTGCTGATGAAGAACCAATTGTGTCATCTTCGGAAGGTATTTTTCAA
ATTTTAGTGACAGAGTTGATCTCAGTTGATATAAATAAGGAATCATAATT
AACTATTGATTTTATCTGTTTTTGATCTGGAAATTTCCCATTCATTTCTC
TAGACCCCTCAACATATCCGCCATCAACAAGTACACGACACGCAGATGCC
ATGTTTCGGGAAGGTATTCCAACTGTTCATATTCTGTTTACACTTGTTTC
GTTCGCAATTATTTTTTTCATTATTTTATTTCTCAATTTTAAGAGTTAAA
ATTCAAAAGTCATTTTTGCCAGGTAGATACTAATAAGACACAAACTAATT
TTAGCAATTTGTATTTCACTCTTCAATTTTTTTCTTGAAAACATTAATTC
ATATATTGTTTTTATGTTTAATCACACAAAGGTATCAACAATTCAACATT
AATCGCCTCTGACAAAATAATCAAAACGAGTGAAGCATGCCATCTTATCC
ACTCTATAGATGAGAAGTTGGAAGCTGCTTCTCACAAAAGCTATCTGAGT
TTGTTGTCGTGTGAGCAGAGTCTTCTTAACTTATCCAGCTGCGATGAAAC
GGGTGGACTATTTTTTGCTTGCACGTTCGAATTAATCAAAGAAAAAACTA
TAATGACGCGTTATCTTGAGCATGGCTCCTACTCTGGCTACTACAGGTAA
CTTTGATCCCTCTTTTGGAAACCCCTAGCGTATTAATGATATTTATTACA
AAAATAAAATCAGAAAATAACCATGAAATTGAAATAACTATTAGCCGTAT
AACTATGTTCAAATATCGAATTAGTTTAGCTTCTTTACTAAATGTTTGTA
GTAATGCTTCTGTTTCTTTATTGTTTTTCGTTTTAGAAGTTACGGCGAAG
CTTTAATAAACAACAAACTGGAATGTAGGACATTGTCATTGAAATCATTT
AACGCTGCTGATGTCGCGAACGACCGACTAAGAAAAGATATGATACGAAA
GAAATTGAAAAAAACTAAAGGTATAATTTTCTTCTTACTTAATTCTTTTA
CTATTTAGATCAAAATGATTTCTTTTAGCAGCTAAAACATTTGTGAACTT
ATTTCAAAAACTTATAAAGGGAGGGAGGGTTTCGTTCTTTGCAGAATATC
CCCGAGAATATCTTATGATTTCTTTTTAACACAATGGGCATTACTGGTTC
TAGTACCAAGATGGATCAAGAATAATGCATGAGTCGGTTACTTACTTGAT
TCTTTTAGGATCCTCAAGACAGCGTGGGTATTATTCCAACAATTTAAGGA
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GAGGCTTCGAGTGAAATCCGAACTATTGGCTGTGTCGTACTAGTGGATAA
GGCAACTACAAAAACAAATGATTCCGACAACAGGTAATTTTATTGATTAA
TCATATTCAATTTTTTATTAAATATTAAAAAATAATTTACAACTACTGAT
ATATCCTGATACGATTAACCGCTTTCTGGTCTGTCATAGGTTTTTTGTTA
GTTAGTTTATGGAATCATCATCAATATTCCTCTGCTCTGCTCCAGCAGTA
TTTTCTAACCTCCGCATCTATTAGAGATCAGAAATTAGATATTCGTATCA
GTACAAAACAGTGACTGCTACTAACTAAAACGCCATTATACCAACAGTTA
TTCTCTATGATGATCTTTTGGACAGCAGGCTAACTTTTACTTTTATGAAG
ATAAGGTTTTAAAGGCTAAAAAAAGTTTTTTGACATATATTATTGATGTC
ATATCTAATAGGACGATTTATAAGTGTATTTTTCAGATTACAACGTTTTT
TGACAGTTACAAAATTTGCTTTTTATACTTTTTTCTTTGACACATGACAT
ATTATGACACCTTACGTTACCTACGAGACATTTTACACAACAGACATCCC
GTTTTTGGTAAGTTCTACAGTTAAATATCTTCAATTTCTTATTTGAACGA
TGTACTTCAACAGTACCTTTTAATCATCTGAAATACATTCATTCAAATTG
AAATGCAAACTACTCCGTGTTGCTTATTCTTTCCTATTCCTATCACGATT
CCAACAATTTTAACTATTCTTGTTTGTCAAGCCGGAGAAGTTCTCGACCG
TATCACTTTAAGATATACCCTATTTCCTGAATATTCGCCGAATAGAATTT
TTAGAATATAGAATGAACAAAATATCTGACATCTGTTTTCGANTGAATAT
TCGCCGATGAATAGAATTTTTAGAATATAGAATGAACAAAATATCTGACA
TCTGTTTTCGAAATTTTTGGGGAATTTTTGGCTATTTAACTTTTGACCTG
AAATCCACATCAAAGTAATTTCTAATCAAACCTATAGTGTCCGGTGTGTG
AGGATTGAACCGACAAATTGACTGTTGTGATTTGTATTTCTTGTCCTTGA
TCCTTGAGCATCAATAGTAGAAGCTCCAAGACACGGGATAACATTTAGCC
TTGTTACCTTTTAACATTTAGCATTTTAATAAGCGCTTATAACGCTTATA
AGCATATGAAGGTTTAGATTTGCAGAATTCCTAAGCATAGCATAATCTTA
TATATCAGTCTGAAACATTTTGTTGTCATTTTTTTATCTGTTGAAAAAGG
TTTGGTAGAGGTCAAGTAAAAAATAAGACATTCCACGGCTAGCTACATTC
CACCGCTCCCAAAAACTGAACAAACTTTTACAAAATTTCTGAAAATTCAC
TAAAAACTTGGCTCGGGGTGATTCATAAGGATATAATAAGCTATGCATGG
ATGCTTTGAGAACTTAAGCATACACGAGCCTGACCAAGGGGCTTACACTT
GCTTATAAAAAAACATGTACATAAAAAGTGAATAATTAAGTCGAAAGAAC
CTATTTTGATAAACTATTCTATGGCAGGTTGAAAACTCTGCAGTATTATG
TGCCCGCCCAACGCAAACCGCAAACCCCCGTTGTGTATAATACAAGCAAA
AATGAATTTTGATAATAGTAGATTGAATTAAATTTAGCGTGGATTAATTT
TCCCGATTTCGGAGAAATGTAGTCCTCGCGAATAACTTAAAATCCGAGTT
TTGGCCAAAACCCCTAGGAAAATGAAAGAAATCATACAAAAACTAACCCA
CTTAAGGTACATATTTTAACAGATACATTTAAGGTACAAGTTTTTGGTAA
CGAAACAATGATCTCTATTGATTAAGAACAATAGAAAGTTAAGCAAATAT
AATCCGAGCCCTAATTAGGGGTAGACACATTGTATTTGTAGTGCGCAAGG
GAAAAAATAGTAGGCATACTTATTTTTGCATAATTCGTCATCTACGTAGT
TCTCGGTTCACTTGCACCGTAAAAAACGTACAACCTGTCGGTAGTTTTAC
GATTCATGGTTTTACCAAAGAAACAACAACATTTAAAATACATCTTGAAT
AATGAAGTGTCGATCTTTTCTTATTCAGGTATTTGTCGAGCCAGAGAGAC
TTCGATCAAGGCATCGATTGGGAAGCAAGTCTTGTTGCTTATAAGCTCCA
AAATTTAAATTCATCCGAAGAAGCGGAATCAATATTCCAGAAAAGTAATT
ATACGGGTCCATTGTCTCTACAAGAGCAATTAGACATTTTATCTGAGATA
CCAAACAATCATTATTATCTTTGGTCGCTGGCCAAAGATCCTGCTGAACA
ACAAGTTAAATTTGCTCAACGCTTTTCCACGTCTACGAAATACCCGTGTA
GTTCGCCAAGAAACAGAATTATAAATACCGTTGTGTTTAACGCAACACCT
AGTAATATCATTAATGCCCTTCATGTTATGCTTGATTTATACAATGATTC
TGATGTCAAAGGCCCACCTTCGAAGAGAAGAAAGTGCGTGTTTGACAAAA
AGAAAAGAGTCGTCGTTGACACTCCATACATTTGTAACCACCTTGGTATT
GACGAGGAGGAAGTCTTAGAATTATCCAAAAACATCTCTTCAATCGCAAC
ACAGAAAAACAAAGACGAGAAACTCTATCTGCATTACGTGGAAAAACTTT
TTTCATCAGGCTGTTTGAATTGGAGAGTATTAAAGGCTCCATCTCTTCAA
ATAATTTTAATGAACAACATTGATCCGATGACTGGTGAATTTAAGGTAAG
TCAGTGCTGAGCAGGATCTTGGGCTCTTTTTATGGGAATCCAAGCCGATA
AGCCCAAGGGACTTCGAATGGATTTTTGTGTATTTCGTTTTTTTGGTGCG
TTTTTATTTCTTGGGCTCTTTTAATGGGAATCCGAACCGATAAGCCCAAG
GGACTCGAATGGGTTTTTGTGTATTTCGTTTTTTTAGTGCGTTTTTATTT
CTTGGGCTCTTTTAATGGGAATCCGAACCGATAAGCCCAAGGGACTTCGA
ATCGATTTTTGTGTATTTCGTTTTTTTGGTGCGTTTTTATTTCTTGGGCT
CTTTTAATGGGAATCCGAACCGATAAGCCCAAGGGACTTCGAATCGATTT
TTGTGTATTTCGTTTTTTTGGTGCGTTTTTATTTCTTGGGCTCTTTTAAT
GGGAATCCGAACCGATAAGCCCAAGGGACTTCGAATCGATTTTTGTGTAT
TTCGTTTTTTTGGTGCGTTTTTATTTCTTGGGCTCTTTTAATGGAAATCC
GAGCCGACAAGCCCAAGGGACTTCGAATGGATTTTTGTGTATTTCGTTTT
TTTGGTGCGTTTTTATTTCTTGGGCTCTTTTAATGGGAATCCGAGCCGAC
AAGCCCAAGGGACTTCGAATGGATTTTTGTGTATTTCGTTTTTATTTCTT
GGGCTTAACTACTCTATGGGAATCCGATACCATTAGACCATGCAGGGAAG
AGTTGTCTTTTATTTCTAATCTTTTTTACTTTAGGATAAAGATTTTGTGC
ACGTGACAATCAAAGGAACGACGACAGGTCCAATCATCACTTGCTCCTGC
GCAGTGTTCGACCTCCTGCAGTCCACAGTAAACGAAGAAGATGTAAACGG
TTCAGTGGGTTTTCGAGGCTTGAAATGCTGTCATTCTCGGCTCGCAGAAG
ATTTACTCGTCCTCAAACCCATGAATTTCGTGCCGAATGAACTTGAGGAA
ACTTCAATAGGGAGACATTATTTTAATGCAGATTCAATTTCCAAGGCAGA
GGAATCCGTTAATATGCCAATCCTACAGCTACCTGGAAAAATAAACGTTT
TCAGGTTCGCTGTAGTAATCGAAAACAATGAGGCGGAACTGATTACGATT
TGCAGGAATAAAAAGGGACACAACACAATAACGTGTCACAACTCCTATTG
CCGTTCAAAAATTTCCAAGGAGCGGTACTTGGATACGTTCCAAAAATCTG
ATAACCTTTGCCCACACCTTGAGTTTCTAAGGAGTTCTTTTGATGTGACC
ACCCTGAGGTTCACAGAAGGTGTGCAGGACGAAGATGAAAATGAAAATGA
AAATGAAAACAACAACGACAACGACATGGAATGTGATGATTTTGTATCCG
ACGCTGAACCTATTGAGGTACTGCTCGCTTTACAAACTTTAAATCTTAAT
TACAAAATACACTAAGGTCAAATAAAGGGCTGAATATGATAAAAAAAAAC
ACAATATTGATATTAATAACAAAATAACCAAATCTGGGTGTCTAATCCAC
ACACTATCATAGTGTAACCATAGAACTATCATCAGATAGAATAAATACAA
GCTTTTTTCCTCAAAATGAAGCGTGTCTATAAGGGGTCCCTTAGCTGCAA
TGGGAATTCTATTATACGCGTGTAATAATAATTTCTTTGTTGCTATCGTA
TATTAATTACATATTTTCACATTCTTGATCAGAACATAATTTGATTATTT
TCAAATGGAAATTTAGGGCACATCGGTCTCATCAGTAAAAATAAAAATTA
TGTATTCGAAATCAGCTACTTTCATAGATTCATCAGTGGTGAAAACTATT
TGAAAACGCACTCCTTAGGAAAGAAATCTAGCTGTCAAGTTTTCACCTAA
ATTAGTCATTCCTTCCGNCGTTATTCCATCTCATTTTAGTGGGAAAAGGT
GTTCGACGAAGATACTGGTCGATGGAAATTCCATGAGAAAGCTCCAAGCG
TTTGGCGCGTCAGCGATAAGAGGGACGAAATTTATCAAGAAAACATCAAA
AGGCGGGCAATACAAATTTTACTTGGTCAGGAAATCAAACTCATTCCATC
AAAGAATGGTAATTGTGGATGTGAGGTAAGCTTAATTTACGTTTTTCCAA
TGTCAATGTAATCAAATCAAAGTTAGTTATAAAATCTATGAAAATCTTGT
GGATTAAAAGTTAACTGATTTGATTTTATTTTAATGCAAAAGAACCAATT
GTTGTGTCGACAGCCTATTGCGTGATACCATTTTTTATAAGCGCAGTCAT
ATCATATCCACTTCCATGAAAGTCATTCTAACATTTCATAACAAGTTTTA
TCTTGTTTATTTAGGGTGGATGGTACAACGAAGAGAATCCAGACGGTCAT
ATAATGCCTCGCGGGGAAACTATCGTTTACTCTACCATGGGTGCAGCCAA
AGGTCGACTTTACGAGCGAGCGTGTATGGGTGGCAGCTGCTTTCGGGACT
ATGACGGGTCTGAAGACAGTTTGTTTCGATCTAGCACAACAGTTGCCTGC
GGGTACGAAATAGGCTGGGAGTTCGTGGACAGCGTAATGACCAGCAAACA
AACATTTTCAGGGTTTGTCAAGGTTGTCAAAAATAGGTACACAGACTACC
AGTCTCCATGTGAATTTATGTCCAGGAACACTCTGATCAAGTGGTGGTTC
AGCTGGGCTTCAGCAATGGATCTGGACTTTGTTAAAAAATGTCCGAGTTG
TGGATCAGATCCAAAGTACCTGGCCGCCGATGCCACAAAGATCGGAATTA
CATTTAAGCAGATTAATGTGACGCCAATTGAGCAGCCTGTCGGAGATTCT
TTTCCTACAAAAAGAAGGAGATATGACCGAACCTTCATTAACAACCGCAA
CAGTAAATCAAGAATAGTCGTCAACGAGGCTCTAAATTTAATTTCAAGAC
ATTTTTGTGGCAAAGTCAAGGCCAGTAAAGAAGATTTAGAAGTAGCGAAA
AAAACACTGATGAGATCAGAAATCCCTGTGGTGCGTTTAGTGACAGAAAA
ACTCTTTGAGTGTGATATCTCAACTCTCGAAAGAACATCATTGAGTAAAT
TAATAGTGATATTAACCAAAGATACAAGTTTAATTAATCTAATTCCAAAA
AGATACCTACCTCAATTTGAAACTTTGAACACTTTATTGGCGTCGGTGAA
TGCAATCGAAGAGAACAGTGATCTGTGGCGAGTTGTAGAAGAATTCCATC
GGTCTTCAAAGTTCTTCTTTCCTGAGCTCGGTGATTGGCTGTTCATCGTA
ACATCTCTCTCCAAAGGATCTGCACCTAAAACATACGGAGTTGAATTTCT
TAGATATCTTTTTCTTCTAAGAAAAGAGATAATGGATGATGAGGTTCCCC
CTGAAGATCCAAGATTAGTCAAGAAATATAATCCTCCAAGAGACGGGAGA
GCGTACTATTTTCATGATGGGGACCAGATTCGGGAAACGAGAAAGTTTAG
CGCCGACAAAGACAACAAAAGGTTGGACAACTTTGACGATCTTCCTGACA
AAGACGTTTGTTCAAAGATTTTTCCAACTGCCAAAGGCAGATCCTATTTG
TTTTTGTGGTTTTGCCCAGCACACGGGCACTGTTACGGATATCATATAAT
TCCCCACGCAGAAGGCCGAAAGGATGCTGCAGCGCCTCTATACGCTTTCT
TGAAAAAGGCACCATATGAAATTTTTTATGACTTTGCTTGTTCATTGGAG
GAGTATGGTAGGAACAGGGAAAGTGGTTTCTTCCAAGACACCCGCTTTTT
CCACGATATCTTCCATGGATATGGACATAAATGTTCTGATGTGTTCAAGT
CAAACAGATTGCTTGGATTCAACGGCTTGAACACATCCATTTGCGAGCAG
TTTAACAGTTTTCTGCAGTGCATCAAGACATCAGGGAAACTGATGACACA
GGAGCATTTCACCTTTTATGTCCAATTTTTCATTTACCAATGGAATCTGG
CTCGAAAAGACTCGTTTGCAAAAAGAATTGCTGTTGCAATCGCCTGCACC
AGATAAAGTTATTTTTATAGCTACATTCCTTGTAAAACAATTATTTTTAT
AGCTACATTCCTTGTATCCTTGTAAAACAGTTATTTTTATAGCTACATTC
ATTGTAAAACAGTTATTTTTGAATCTACTTTAATGTCAAAAATTTTCGCG
GTCAGAAAATCTTTGTTATTTCGCGAGAATTTTATTTCGCGCATTTGACT
TAATGAAATATTTCGCGTTGTGTGTCATTTTCGAATCATGAAGAAAAAGT
TTTTGCCTGGTTTTTCTTATAAAGTGGAAAGTGAAAGTATTTGTTTTTGC
TCTTTTTTTTATTTTTTCAAAATATTATCACCACATGTTCTATACATGCA
ATCAAATAGTAATTTAGTACTTTAAGATGGGTGTCAACTGAAAAAAAAAT
AAGTTCGTCGCAAATACCTGTTAACAAAAGATAAATCCAGACATATGTAT
GGAATTAAAAATCTATTGTTGTCTTTTACGGCAAATTAGAAATAATAAAC
GATATATGGAATGAAAACGTTTTTCATTTTTCATCGCTTATTTTTTTCGC
CCTATCGCAAATAAAACAATAGGTTTTTAATTTCAGACGTACATGTTTTT
TTTTATAATCATACAAAAATCCGAAAACAGGCTCAGAGATGCTTAGGTCG
AAAGCTTAATAAGGCTGAAAAATGCTTGAGGGAATGCTTAAATCTAAAGC
ATAAATTTAGGGAAATACTAAAAATCCGTAAAATTCCAGCCAAAAAAAGC
CGAAATCAGGAAAAAAACATTTTTCGTAGGCTCAAGTAATGCTTGCTATA
TGCTTAATTTTTCCCCTTATCTGAGCCTAGATATGCTTATAAGTGCAATG
CTTATAAAAAAAAGTTTATCGTCGCTTTAAGTTCTCTTATATTGGTAGTA
TTGGACATAAGGCACTCTTATTTTACAGCGACGATATAAGGGTGGAAATA
AGAGTGCCTCATGTCAAATACTACAAACATGAGAATACTTGAACTGCTAT
TTCCTCAAGATGTCAAAAATGGACATAAGGCACTCTTATTTTACAGCGAC
GATATATGTCTGGATTTATTTTTGGCGACAAACAAATTCGCGACGATCTT
ATTTTTCCGATAGACACCAAGCTTTAGTGATCTAAAGACTTTCGCGAGTC
AGCAATATTTACTTTTTTCGTGACCAGTTAGTTTCGCGAATCGAAGCAAA
TTCCTTAAAATCGCAGGAATTTCAAGCTGCAAAACTTTTGACGTCAAAGT
AAATCCCATGTAAGACAGTTTCTATTATAAACAGT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_037876	XLOC_037876	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_337	supercontig	scaffold_337:77645..87579 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.273641	0.412375	0.224828	0.220678	0	0	0	0	0	0.562822	0.0675174	0	0	0.0986795	0	0.686187	0	0	0.319774	0.313029	0	0.312563	0.106874	0.139835	1.20267e-07	2.8926e-05	0	0.43549

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060207 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060207 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
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Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00060207 (transcript) - C. hemisphaerica