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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00059814 ID=TCONS_00059814|Name=TCONS_00059814|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3434bp TTGATAACCAAAAAAAGGAACActgaaaagtttttatttgttGTACCTTT CTTTTCAAAGAGAAAGTCGCTCTAAGTAAGGactattttacaaaatatta tcACAAAATTATCTATTCCGTAATAATAACAACACAGTGTCTGGTTCAGG GTATGACAACCTTTTTCACAGACCAACTGGGACCCCTTCTCATCAAATAA ACCAAACCTCGCTTCAAAATATTATTCCATTTGTCCTATCCCctctgaat tttctgacttgaaaaaaatggattttaaacATAGTGATTTAAACCCCCGG CCATAAAAACATATGGGAatatatcaatccccatcgagtttcagttcgtt atttttacccccactggctagAAAactcctaccgggtctgtgagaaggcg TGTTGTATGAGGAAAATCAGGCTGTTATCTACTGTCGATGAAAAGTATAT ACTCCCGATATCAAATTGCTCAAATTACACTCTCAAAATACACTCCTCTA CTCATAAAAGGAGCTACAAACCAACATTGCTAAAATAGTAGGGAGAAATT AAGCAATTAAAAATAGTGTTGTTTTGTTCAGCCAAAAGCAGCtattttcc acttttttcactttttgaagcttgatatctcgagttaggtagaGAAATCA Cccatactcgcaatatatctctaatcttaatttttttagagctttccaaa aatatacaacaggtctctcttttctcaagctaaaatatttattaaatttt gaccctatgatttttgcctgggactgtcatatttgtccgaaaatcacacc aaaatatccaaaaaaaattggcacctatgttattttgattcccttacctt tccaaaaaatgtaaaacaagtgctttgaccgaGAGGAAGTTGTGACTTGG AttgtgaagaaaaaaatagatGTACTTTAgccatttctaaaaaatctaaa atttcgttttttcaaaaaatctaaaattccgcaaaaataatcaaaaagta TGAATGTTACGATATTTAAACTACGGAAGGCAAAACATTTTTCAGCCTTG AGCAAAATGAGAGAAATATCTTCGTTACTTGTTAACACATCAACTGTCAA TAGCATCTCTTTCAGCGATAAGTGTAAACGctttgctttcttttttttcc tatTTGTAGTgtctaaatttgaaataaaaatagtgTTTTAAGACACCACT GAATAACCTATTGTTCAATTTACACAATTTCAATAATGCACCCCAAATCT ACCAAGTATTTAATTTGTAAGTGGATGAGAAATAAAGTCATTTTAAGCTG AATGTAacatattttttggaatttaacTAAATATCTCCTCAGGAACATAT TCAGTAGTTGTGGTCGTGCttgttgttgtagttgtagGTGTGGTCGTTGT GGTTGTAGGAGTGGTCGttgtggtcgttgttgtagtcGGAGTGGTTGTTG TGGTTGTAGGAGTGGTCGTTTTCGTTGTTgtaggagtggtcgttgtagtA GTTGGAGTAGTCGTTGTCGTTGTAGGAGTGGTCATTGTAGTTGTAGGTGT GTTCTTTGTTGTAGTTGTAGTTGTAggtgtggttgttgttgttggagtgg tcgttgtggttgtaggagtggtcgttgtagttgtaggagtggtcgttgta gtagttggagtggtcgttgttgttgttgtaggagtggtcgttgtaggtgt ggtcgttgttgtagttggagtggtcgttgtggttgtaggagtggtcgttg tagtagttggagtggtcgttgtagtagttggagtggtcgttgtagtagtt ggagtggtcgttgtagtagttggagtggtcgttgtagtAGTTGGAGTAGT CGTTGTCGTTgtaggagtggtcgttgtagttgtagttgtaggagtggtcg ttgtagtagttggagtggtcgttgtagtagttggagtggtcgttgtagtA GTTGTAGTTGTAggtgtggttgttgttgttgtagttgtaggtgtggttgt tgttgttgtaggaGTGGTCGTGGTAGTAGTTGGAGTAGTCGTTGTAGTAG TTGGAGTAGTCGTTGTCGTTgtaggagtggtcgttgtagttgtagttata ggagtggtcgttgtagtagttggagtggtcgttgtagtAGTTGGAGTGGT CGTAGTAGTTGTAGGTGTGGTCGTAGTTGTAGGAGTGGTCGCTGTAGTAG TTGTAGTTGTAggtgtggttgttgttgttgtagttgtagGTGTGGTCGTT GTAGTTGTAGGTGTGGTCGTTGTCGTTTTTGTTGTAGGAGTGGAAGTTGT TGTAGTTGTAGAAGTGGGAGTGGTCGTTGTAGTAGTTTGAGTGGTCGTTG TAGTAGTttgagtggtcgttgttgttgtaggCCTGGTCGTtggagtggtc gttgtagttGTGGTCGTTTTCTTTATCAAACACTCGTCATTTCGACAATA CCTAGCGTAGTAACAATATTGATTGCAATAGTCTGCCACAATTCTATCTC GATAAAGCCCACGGTCAATGTAACGAGAATTAGGACCTGTCCAGCTCCAT TTACATAAGCATTCACCAGTAGTCAAACATTGACCTTTACCAAACAAATG ACATTTAACGTTGCATTTCTTTTTCGGTTTCGGCGTAACCACGCTTACAC ATTTAGGGTTTCGATACCACCTGTTGTAGTGACAGGATGTCGTACAATAA TCAGCTGTGATGCGGTTTCGATTCGTACCTTTGTTAACATATTGTGAATT AGGACCCGTACATTTCCATCTGCATAAGCAGCGACCGTTCGGTAAACACC GGCCGTACGCTTTATTGTTTTTTTCGCATCTAGAATGACATTTGGTTGAT GGAGCTTTGGTTGTTGTCGTTGTagtggtggtcgttgtcgtCGTGGGTTT TGAAGTTGTCGAAAGAAAGGGTGTACAGACACGTGACCACGAAGGCGTGT AGTGACATGGTACTCGACAATGATCTGCTTTAACTCTCTTATCTAGTGAC CCTCCAGTGAGAGATACTGCATTAGGTCCAGTCCATCCCCACCAACATAG GCAACGACCATCAGGTTGACAGACACCAGTACCTGGTGTAGGATGCTCAC AGCGTTGGTCGCAGTGTCTCCTGACTCTGCCTCGATGACTGCCAACAACT TGACGTGTTCTATATCTCCTTGACGAGTGACCATAGCTATGGTATCTTGC CAAAACTATACCAATGCATAATGCAAAGATAATTGTGATTAAGGTCGACT ggttcatttttgaaatcagcCACGACAATGTCTTGATTTAAAGtgacaag taaaaaaaattctgaattcTCCCTTTAAAATCCAACAGTTTTGTAAACCG CTTGTAGTTCTTGTGAACCTCTTGTGAACCTTCTTTTCAGCTAGTCAAAT ACGGAAATGaagtgattttgaaaaatgtccaaat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_331:669273..672820+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00059814 ID=TCONS_00059814|Name=TCONS_00059814|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3548bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_331:669273..672820+ (Clytia hemisphaerica) TTGATAACCAAAAAAAGGAACActgaaaagtttttatttgttGTACCTTT
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TCAGCTAGTCAAATACGGAAATGaagtgattttgaaaaatgtccaaat
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1491911889:669273..671511 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1491911889:669273..671511 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1510915933:669273..671511 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1510915933:669273..671511 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1575043694:669273..671511 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1575043694:669273..671511 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1491911889:671626..672820 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1491911889:671626..672820 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1510915933:671626..672820 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1510915933:671626..672820 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1575043694:671626..672820 | TCONS_00059814-exon-scaffold_331-1575043694:671626..672820 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_331 | supercontig | scaffold_331:669273..672820 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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