|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00059358 ID=TCONS_00059358|Name=TCONS_00059358|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1533bp TTTCGAATGTAAATAAAGTCGAGGTCGCTATGTACATTTTTGTCGGTTCC GTAAAGTTTGTCagtcaaaccaaaacaaaaaagatggCGGCCAAAATGCT AGCGAAACTTCCAAAACTTGAACAACTTTCACCACTTGTGATACGAGTTT TAGGATGTAATCCTGGACATATGACATTGCAGGGAACCAATACTTACCTA GTAGGCTCTGGAAAAAGGAAAATTCTGATTGATACTGGTGAAGAGAACAA CTTAGACTACATTTCCAATTTGAAAGATgctttgaaaaagtttcaatgTT CCATTCAAGAAGTTATCCTAACACACTGGCACCATGACCATGTAGGTGGA CTTGAAAACGTGATCAAACATAAACTGATACCAGCTGATTCAAGTTTACT ATCAAAGTTCATAAGACCTGGATACACCGAGAAAATCCCCTTCGATGGAG AATATCTAGAATACACGTATGTTAAGGATGGTCATATTTTCACCACAGAT GGAGCGACTATTCGTGCAGTTTTTACACCAGGTCATACTTCAGACCATAT GTCATTGTttcttgaagaagaaaatgcgATTTTTTCTGGTGATTGTATTT TGGGTGAAAATATTTTCTGACCTTCACACTTACATGAATTCGCTGGAACG ATTAAGAGCGTTGAATCCTGGTGTCATTTACCCAGCACATGGTTCCCTCA TCAATGATGGGCATACCAAAATTGTAGACTATATTAACCACAGGAACGCC CGAGAAAAACAAATCTATGATGTTTTGCTGGAACACAGTGATTCTTCGCT CACATCCCTCGATATTGTCAAGCAAGTTTACCTAGGCTTAGCGGAGCAAC TGATACCGGCTGCCATGAATAATGTGGAACTACATCTCaagaaattagaa aaagaaGGGAAAATATCCCAAGTAAACGATGAAATGTGGACGAAGGCTAA GCTGTAATAATAAAGGAGAAGATTTGGAATTATCCGGCGCCTTAACCTGA TTTTTCGCTTGACTGGAACTAAAGTCGGAGAATTATTTTTCACTGGAAAC CTGGATAGATGCTAGGAATTTCGATCCCGAAAAGTTACATTGCCATAAGA TATTGGATGATGAGTACACTTTTTCAGCTGTTGATGATTTTTTCATCGAA TTGATAGTAAGTGGGAGTTCAATTAAATGAACTGAAGTTAAATTGGATAT ACTTCTTGGGTTACTTAAAAAGGATTATTTTCGCGGTTTCGTTTTCTCAA GTTTTGGATGTGGTATGACATTTTCAGGTGCAGGCCTGTTTTcaagctta tttgcttcaaatcCACGggaaatttttctaagaaaaaaccTAATTCGCAA CATTTAAATCTACGATATATGggaatatttagatttttttgtagATAGAT AAATTTATAAcagaaattttatgatttttataatttttaaaagaagaatt ttcgaaacattaaaaCATGGAGGTGTTTTCTGTAATTGTTCTTATGTGCC AAAAGTTTGCCATCAGCACCTCGAACAGCAgcc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_326:367944..385205- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00059358 ID=TCONS_00059358|Name=TCONS_00059358|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17262bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_326:367944..385205- (Clytia hemisphaerica) TTTCGAATGTAAATAAAGTCGAGGTCGCTATGTACATTTTTGTCGGTTCC
GTAAAGTTTGTCAGTCAAACCAAAACAAAAAAGATGGCGGCCAAAATGCT
AGCGAAACTTCCAAAACTTGAACAACTTTCACCACTTGTGATACGAGTTT
TAGGATGTAATCCTGGACATATGACATTGCAGGGAACCAATACTTACCTA
GTAGGCTCTGGAAAAAGGTAATCTTTTCTTATTTATTGTTTTTAGCTTTT
GAGCTTAGAGTCAGTTCGCCAGTGCACGAACAGCCCCAGTGCACGCGAAC
GAGCGTCTTTGAACTTGAAAAAAACAACCAAAAACAAACTTCTATAGAAC
TTCCTTTGTGCAGCAGAATCCTCAAACTATTCCTTGCAATCTTTCCAAAA
ATTAAAATAAACGGAGCACTAGAACAACACCAAACCGATTTTGAACGAGA
CCAAGTAAAAAAATCACGAAATTCAGCTGATCGTGACCGTGAGAGAAAAT
GTTTCTTATAAGAAAATTTGCACAAGAAGAGTTCTGAAAATGACTTTCCT
CTTTTAAAAACCTTTTATCTTCCATCACACAAAATTTCATTGAAACATAT
GTTAGCTCATTAATTCAAAATCAATAGAAACCAGGGGGGGGATCAGGGTN
GGGGGGGTCAGGGTCCAGGATACCAACCCAGGGCCCAAAAACCTGACTTT
TCGAGATTTGAAAGTAGTAGACACCACCACCCCCTAAATTGGTATCAATA
CCAACTCGAAAACTCTAATTTTCTGAAAAAGGGGGGACCCACCCCCTAAA
TTGGTATCAATACGAACTTGAAAATCCTGATTTTTCTGAAAAAGGGGGAT
CCANGGGTATGTGCGGCGGTTAAGGGTATGTTTTTCAAAATATCAGAAAT
GCACTGTAAAGGTGGACTTTTGATAAATGCACTGGATGGGTGGAAAATTC
AGCAAATCTAGGAAAAATTGCAAATTTTGGCTGAAAATCTTGATTTTTTT
GCTCTAAAAGAGTTTAAAATATGAAAAAAATGCACTGTAAGGGTATGAAT
TTCACCGATTTTTTTCTGCACTGTATGGGTGCGATTCTAAAAAGCCATTT
TCTTTGCCGCACTGCCGTCAGTTGGTAAACCCACTGCCCCCGGGCTAGTT
GATAAACTAGACTAGATAAAAGACTCATTGTATTAGGCACGCCTTGAGTC
TTTGTAACATAGCCTGACATAGCCTGTATGATGAACGTTATGTACAGAAA
AATTTTATCACAACTAAAAATTCACGACTTGATTCAGTTTGTTCAACTCT
AGTTTTGAATGAATTTTGGTTGATTGAAAGGATTGAGAAAAGCAAAAGTT
AAATAAGAATTTAATTTCAATTATAGAATGAAGAATGCTTTTATATGGAA
TCAGGGTAGTGTAAACGATTCAAATAAGTTTTTATACTTACATTATACAA
CATTTTAAGTCAGATACTAATTTCAAATTCAGCAAAAATTAAAAAAAGGG
GGACCCAACCTCTCATTTTGGTATCGATACCAACTGAAAGATTCCCTAAT
TTTCAAAAAAAGGGGACCCCACCCCCTTATTTTGGTATCGATACCAACTT
GACTTTTTGAAATTTGAAAAAAAAAATTGACACCACCCCCCGGCCCTGGG
TTTGGTATCTGGATCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACACTA
GCGTCCCGCCAAAGGGTAGAAAAAGATTAATGCTGCGAAAGCGCTATATC
AGCTATATCGTTAACCTCTGAATCTCAAGCAAAAAAATGCGCCGCAAAAC
TTCTAAAGGGATTCATTAAAAAATAGCCCGCTGCTTTTTAATGAAATTAA
CGTTCTCAAAAACTATGAGAAATTGTCTAAAATTTGAGCCATAGATGAAA
AAATTTGAGCCTTAAGCCAACTTTGAGAACTAATTTGAAGGATCAACTTC
CCAAGAAAATATCTACGACGGAGACAGAACCCACTTAGATCCGTGCACTG
CCGGATAGGCTATTTCCCGGAAATTTTGCCGGACCTCAAACACTGACCCA
TTTACTTGTGCAGAATTGTTTTTACTTTGGCGTATAAACAAGGCCTTAAA
AGTCGAAGCGCTTTCTCGGGAATTGAATTGAATGACAAATTTTGGTTGGT
TGATTTTGTTTCAAATTTTCAAGTTTTAATTAATTGTCTTGCGAACTTGA
TTCAGGTAACTCTCATCCTTGTTGTTGCAAATCCATCCTGTAGATGACTG
ATGTTGTTTTTTCTGAAAGCTTGATTTCCTAGTGTGACTAACTGGAAGAT
ATAGCTTCCTCATGTCAAATAATTTACTCTCACACTTCACCAAGTGTACA
ACTTCTATGTGTTCACTCAAGCCACTGAAAACTTGGCAATCCTAGTGATG
TACAGACAACCTAATGACAAGAGCAATGGGAATCCTTCAACAGTAAAATA
TTTTCAAACACCATTGAAAGGTGTAAAACTTGCCCTTTCAGCCCTGGAAC
CTACCCCTAATATAATTTTTGGTGGGGATTTTAACCTTCCAAAGTCAACA
TGGCCAGATGGACTACCCAAACCTGGATGCTCACTGGAAGAAAGGTCAAT
GATAAATGACCTGAATCAACTTTGTAACAAGATGTTTTATGTCCCAGTAT
GTTTGCCAACCTACACATAAAGATGGGAACATCCTCAACCTTGTTTTCAC
AAACAATGAAGATCTTATTCATGACTACACAGTTATACCAGTATTACAGA
GTACATACTAATGTTCCACAAAATGATGATGACAAACCAGAACCTCATTC
AAAATTCAATGCATTGAATTTTTTCTTACATGAAATTGAATAGAAAAAGC
TGAAAAATGACCTGAATCAAATTAAATGGAATGACAAACTAAGCAATGAT
AATCCACAAGAAATCCTATAGATATTCAACCAAATTTGCCTGGACAAATG
TGAAAGTCACATTCCAGCTCGAACAACCAAGGATACCAAGAAAAAGTCTA
AAATTGATAGATATCGCCGTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNTATAAAACTTTTTCTCTTGACTTTCACTTGGTCAGAAATTGCAATT
AATAGGCCCGTGACTAACGGACACAAAAATTAACATCTAAAATGGGACAC
TTTTACAATCAGCTGTAAAGTGCTGTTCCTAAAGCTACAGGTTGGGTTTT
TTGCTTAAATTCACAAGAGGAAAGGTTGAATTTTATGTTTCAAAATTAAT
TTTGAAAAAAAAATGTCAAAGTAAGAAAATATGACAAAAATTGGGTAAAA
AATGCTGTGACTAACGGACATTTAAAAACGTGACTAACGGACAAAATGGT
TTTTTAATGATTCTGACGAGGCAATCCAACCATTCCTATATTTGGTGCTT
TTGGAGTGAAATGTTATATCAATAGAATGACAAAAGCCTGAAAGAATAGA
AGAATTCTTATTTTTCTCTGTGTGGTACCATTCCTATCAAGTTCATAGAT
CTCGAAAATTTGAAAATTTTGAAATATAAAGATCTGTTGAGTTTTTATGG
GTGTTTTTTGCACTGCATTGTTTCTTTGTTGAATCAGGACAAAGACAGAC
AAATTGGGTAAGGGTATTTTATTTATTTACTTGTGAAAAGGATTATTCTC
CCTATTATGACAACTAGTCCGTTAGTCACGAAAAAATAAAATGCACACAC
AAAGAAAGGATTGACTATTTAACATATATCTATGGGGTGAAATGGGTAAA
TATAGTCAAAATAGCTTTAATAAGAACAAAATACATGGTTTTTTAAGCGA
GTGCCGTCTATTATATTCTCCGAACTCTGAATTTTNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNTATTTGTTAATCCCATTGGGAGATAGGCGGTTAGGTGGCGGGCGTTCT
CTAATTCTCCAATTGGCGTCTGGTCATTTTGAATGAAAACAAAAAAGTTA
AAAAGGACATGCTATCAGTGAAAGTTATTGTGACATGTTATGACAGAAAG
TATGACTGATAAACTTGGTGGAGTTATCAAAACAAATTTTTAGTCTGAGC
AGCCCTAAAAAAGGATTTCTACTAGGGTTTCTAACAGTGTAGCAGGGGTT
ATCCAGGCAATTACAGTCAACTGCTCTAACTTTGGACTATCTGATAAAAC
ATGGAACAGCAATTCGGCTACCATTTCACCTAACCTCCAAAGTAACCGAT
CAAAGACCGACCGTCAAAGAGATTTAACAGTAAGTGGAAATACAGGCCAG
ATATCAACAATTTCATGTTTCGACCAATCTTCCCAAGTTAGAGCTGTTGA
CGGTACAAGGGGTTGTTTGCAGTTATAATCTGTTTCAAAAGCATATGTGC
TCTAAGATACAATGTATAGCAATGTGTGCTCTAAGATATGTAGATTTGGA
TTTGAAACAATGCCTATATCATACCCTGTTTCAGGTTTTCCAGGCTAATG
TCTCTCCAAAACATGTTTTTTTTTTCAGNATACTCTGTTTCAGGTTTTCC
AGGCTAATGTCTCTCCAAAACATGTTTTTTTTCACATTAAAGATGTAGGA
AATAGATGTTAGTTTATTTTGATTTTCTTTCATCTCTTTATAAAGGAAAA
TTCTGATTGATACTGGTGAAGAGAACAACTTAGACTACATTTCCAATTTG
AAAGATGCTTTGAAAAAGTTTCAATGTTCCATTCAAGAAGTTATCCTAAC
ACACTGGCACCATGACCATGTAGGTGGACTTGAAAACGTGATCAAACATA
AACTGATACCAGGTTAGTGGAGTCTACTGACTGATCTTTTAACTACTTGG
CTGGATAGTCTACCAATATGTTTAGATTATGTATGTTTAAAATTAGGCTT
GAACATACCTATCAAATAGCAAAAAGATCAGACTTATTAAAGGAACAGTT
AGCTCTTTATGTTTTTTTTTTATTATCGCAAGCCTCTTTCTGTGTAGCCA
GTGTTTTTACCTAAAATGAAGACGTTTTGACGTTAGTGTTAGAAAGTTTT
TGCGAATCAGGCAAATTGTAAAATTTTCCCAAATTTACCAAAATTACTTC
CCATCAAATTGAATTCTTTTGGTCATTCACTAAAGTTAATTTGCACCAAA
TTTAATTCCCCTTCAATACACGTATTTCCTATTAGCAGATTCATGTAAAA
AAGTCACGAAACAACGTAGTGTAGAGTAAAGTTCTGATTGGCTGCATATT
ACACACATAAGCATACTTTTTTCAAAATGTCCAAAGTATGAGGTAATCTT
TGCATGTCTCAGCCAGCCCAGCCAAGTCTCAGAGTTTTACTCGACGTTTT
TTCGTGACTTTTTTATATTAATCTGCTAATAGGAAATACGTGTATTGGAT
GGGAATTAGATTTATAGTTCCATTATCAAAGTGCCACAAACATCATAATC
GTCTGTGATCGCCGATTTTTCCAGTCCCGTACCGGTAGCTCTAGGCCAAG
GAAGGCCACAACCCATGTGGCCCCCTTTTTTACCTCGTCTGAATAAAAAG
TCCAGATTCTTTTTTAGTTTTGCCACATATATCTGAAATCTGAAATAATA
GCTTTTGATGGGTTAATATTGCGATTTGTTATTTTCTATTAATTTCTCTT
ATTAGCTGATTCAAGTTTACTATCAAAGTTCATAAGACCTGGATACACCG
AGAAAATCCCCTTCGATGGAGAATATCTAGAATACACGTATGTTAAGGAT
GGTCATATTTTCACCACAGATGGAGCGACTATTCGTGCAGTTTTTACACC
AGGTCATACTTCAGACCATATGTCATTGTTTCTTGAAGAAGAAAATGCGA
TTTTTTCTGGTGATTGTATTTTGGGTGAAAGTACGGCAGTGAGTTATTGA
TTTGATGTAGTAAATTACAAAAAGTTCATGTAGACCCACCCCAACGTTTC
ATAGTCGTACATTATTTTTCAATGATACTCTCGGCCTTTTCCAGATAAAA
GTTTTAAGTGGGTGTTGCGGATATAGGACCTTCAGGGGAATGTTTATACA
TCAAAAGGGCTGGATATGCAGGGGTGCTAGTCAAAAAACAAGATCATTAT
TAGTAAGCCTAAATATATAAGCAAGGGTCAAGATTTAATAATTAACCCTA
TGAAATAACAAACTCTTGAGATTGTCCATAAACTGATATCCTCATCACCC
TGAACATTTATTTTTTATCCGGAAAAGCCCATTCACCCCTCCCTTTTTTC
CATCTATTTATTATTCTTAAAGAAAGGGACAGTTTCACTTTTAATTTTAA
CTTATTCATACGTCTTATTAAACGTAACTTAACTAACTAACTTTAGAACG
CCATAACTTCCTATTATCATTTCAACGTTAGTGGCTACACCAGTAACAAA
CCTTTAACATTAAGACATTTTTTCTCATTCTCCTTGTTACAGATATTTTC
TGACCTTCACACTTACATGAATTCGCTGGAACGATTAAGAGCGTTGAATC
CTGGTGTCATTTACCCAGCACATGGTTCCCTCATCAATGATGGGCATACC
AAAATTGTAGACTATATTAACCACAGGAACGCCCGAGAAAAACAAGTGAG
CATTTCCCTAGTGTGTTTTATTAACCGCTATAGATACTTTCCCAATAAGA
AACTTTTGCGTCATACACGTTTTTTATAAGAACATTCAAACTTTTGGAAG
CCTTCCGTTTTAACTTTTAGATTTAAGCCTAAAAATGATCTTAAATGATT
GCTCCATTTTGTGAGTATTTTTATCCGCAAAGCTTTAAAATGTTCTTAAC
TTGTTCCGAAAATTTTAGCAATGGAAGCCTATTCTTCTTAGAAAAACCTT
TAGGATTAGTGTAAACCTAGATTCTTTTTGATTGGAAGATGAAACTTGTG
GCATATGCCGACATCTGGCAAATAGGTCGAACCTTAAAAAATACGAACGG
CAGTTAAGGGGTTAAAGTTACACTCTACTTTTAGATCTATGATGTTTTGC
TGGAACACAGTGATTCTTCGCTCACATCCCTCGATATTGTCAAGCAAGTT
TACCTAGTAAGTGAACTTTCAGTTGTTACCTTAATTTGTTTTAGTTTAGC
TTTTCAGTTATATACTAATCTCCTAACAGATAATTCATTCTACACGTACC
AAGCTTTGCTCTAAAGGGTTATAACGTGACGATCTGAATTGGTTATTCAG
CGAAAACAATCAAAACTGCNGTTATTCAGCGAAAACAAGCGTTGCTTTTT
GCTTGAAAGTGAAAGTGAAAGTGTTTAGGTTTTTAGGATTTCTTTTTGAT
TTTGGTGCGATTGTTTTGCTTTAGCCAATCACCGGCTCAAAAGCTCATTT
AATATTCATCCGAAACCTGGATGAAAAAGATCAAAACGGTGTTTCAAGCT
GGACAGATTCTCTTACGGAGCCATGTCCTTTAGTGTGAATACGTGCCATG
CGTGGAGTATCAGAATCTGCTCGGAGAAAATTTTGAATGAATAATAGTGG
TTCATCGTATCAGACCCATTTAGAAGGCCATGTATCAGACCCATTACTTC
ATATCAATCAATCTACAATCTTCAATTCTTATCCTGACTAAAGAAAAAGT
CCGGTTCTCTTTTCTTTTTTCCACGAAAGTGTTATCTCAATATAAAGGAG
CTCGTTGTTAAAAAAAAAAGTAAACAAGACGATCCTTAAACCCGGCATGG
TTCTAGGTTTACGAGATGACGGGTATGTCCGTCAAAGCCAAAGTTTGAAA
ATCGACCCTTGGAGAGACTGATTTTCGAAAATGTTGTCCATTTTTTGACG
CTTTTGTCAACCCTTAATTTTAGTCCAAATTTCAAGAATTTGTGGCCGGG
TAGCTCATTCGGTAGAGCTTTCGCCTTACAATCTAACGTTTGTGGGTTCG
ATCCCCGGTCACCGCCAACTCAGCGGATGAGTAGCTTAGATTGGGTAATC
TGATCTAGGCGGTAAGTTACTGGAAGCTGGGAGTAGGTGTGGCGCTCCAC
CTCAGCATTCGATCTCCCAGGTCTAGCGCAAATAGAAAAGGGGATAGACT
CCCTCACTCCCGGCTCCACCGACAGCCACCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNTTTTAGGGCTTAGCGGAGCAACTGATACCGGCTGCCATGAATA
ATGTGGAACTACATCTCAAGAAATTAGAAAAAGAAGGGAAAATATCCCAA
GTAAACGATGAAATGTGGACGAAGGCTAAGCTGTAATAATAAAGGAGAAG
ATTTGGAATTATCCGGCGCCTTAACCTGATTTTTCGCTTGACTGGAACTA
AAGTCGGAGAATTATTTTTCACTGGAAACCTGGATAGATGCTAGGAATTT
CGATCCCGAAAAGTTACATTGCCATAAGATATTGGATGATGAGTACACTT
TTTCAGCTGTTGATGATTTTTTCATCGAATTGATAGTAAGTGGGAGTTCA
ATTAAATGAACTGAAGTTAAATTGGATATACTTCTTGGGTTACTTAAAAA
GGATTATTTTCGCGGTTTCGTTTTCTCAAGTTTTGGATGTGGTATGACAT
TTTCAGGTGCAGGCCTGTTTTCAAGCTTATTTGCTTCAAATCCACGGGAA
ATTTTTCTAAGAAAAAACCTAATTCGCAACATTTAAATCTACGATATATG
GGAATATTTAGATTTTTTTGTAGATAGATAAATTTATAACAGAAATTTTA
TGATTTTTATAATTTTTAAAAGAAGAATTTTCGAAACATTAAAACATGGA
GGTGTTTTCTGTAATTGTTCTTATGTGCCAAAAGTTTGCCATCAGCACCT
CGAACAGCAGCC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:384989..385205 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:384989..385205 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:375494..375660 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:375494..375660 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:374426..374650 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:374426..374650 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:373711..373863 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:373711..373863 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:373250..373321 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:373250..373321 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:367944..368642 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1575043694:367944..368642 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:384989..385205 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:384989..385205 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:375494..375660 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:375494..375660 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:374426..374650 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:374426..374650 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:373711..373863 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:373711..373863 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:373250..373321 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:373250..373321 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:367944..368642 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1510915933:367944..368642 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:384989..385205 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:384989..385205 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:375494..375660 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:375494..375660 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:374426..374650 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:374426..374650 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:373711..373863 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:373711..373863 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:373250..373321 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:373250..373321 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:367944..368642 | TCONS_00059358-exon-scaffold_326-1491911889:367944..368642 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_326 | supercontig | scaffold_326:367944..385205 - |
Blast
BLAST of TCONS_00059358 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: LACB2 (Endoribonuclease LACTB2 OS=Homo sapiens GN=LACTB2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 193.356 bits (490), Expect = 1.111e-56 Identity = 98/182 (53.85%), Postives = 130/182 (71.43%), Query Frame = 3
Query: 120 EQLSPLVIRVLGCNPGHMTLQGTNTYLVGSGKRKILIDTGEENNLDYISNLKDALKKFQCSIQEVILTHWHHDHVGGLENVIKHKLIPADSS-LLSKFIRPGYTEKIPFDGEYLEYTYVKDGHIFTTDGATIRAVFTPGHTSDHMSLFLEEENAIFSGDCILGENIF*PSHLHEFAGTIKSV 662
E+LS V+RVLGCNPG MTLQGTNTYLVG+G R+ILIDTGE +YIS LK AL +F +IQE+++THWH DH GG+ ++ K I D++ + K R E+I +GE +Y Y+KDG + T+GAT+R ++TPGHT DHM+L LEEENAIFSGDCILGE L+++ ++K +
Sbjct: 9 ERLSNRVVRVLGCNPGPMTLQGTNTYLVGTGPRRILIDTGEPAIPEYISCLKQALTEFNTAIQEIVVTHWHRDHSGGIGDICKS--INNDTTYCIKKLPRNPQREEIIGNGEQ-QYVYLKDGDVIKTEGATLRVLYTPGHTDDHMALLLEEENAIFSGDCILGEGTTVFEDLYDYMNSLKEL 187
The following BLAST results are available for this feature:
|