TCONS_00059339 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00059339
Unique Name	TCONS_00059339
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3366

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_326:232166..256910+

transcript sequence

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transcript from alignment at scaffold_326:232166..256910+

Legend: exon

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>TCONS_00059339 ID=TCONS_00059339|Name=TCONS_00059339|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=24745bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_326:232166..256910+ (Clytia hemisphaerica)
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TCATTCGACAGTTTCATTATGCTGTTTATCAtaaattgaatatgtttcat
ATTTTGACTGGTAAATAGTTGGGAAATTATAGaattatcaattttttcaa
aaacaacatAATTGTGTATGCAGATGAATTTAATATCATTCTAACAGTAA
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TGTGCTTTAACAACTAGTGTTTTCTTTTGTACCGTTCTTTAAACATTGCC
TTAAATCTATTTTGTGATCTCTAGCAAGGGGTCAAATGTTGTTGGAtcct
ttttgtgtgtttttaaaAGCCTTACAATCATCACAAACAAGCGAATCGTT
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aaacaagGTGCAGGGATTACGTGACTAAATTTGTTCAGAATTCGTTTtac
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CATTTGGAACGATACTTTTCGGCTGGATATGTAACTTTTTGTGAGGacct
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ATATGGGTGTTGGCTTTTTTTTGATACATATTGATATTAgataatatttc
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GTGAAAACCTGCTTTTTTAGAAGAAAATAATACATATTCTACTAAgtata
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AGATTGTCTAAACGAGGCAACAAAAAATCACCTCCAGGTtctttacaatc
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ctataatcgtgtataaaattcccattCAAGatttaccccaaatttggggt
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00059339 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: RAI14 (Ankycorbin OS=Homo sapiens GN=RAI14 PE=1 SV=2)

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Query:  198 DEWTKYDERLIDAAYKSDRERIKETIRKKGASPVKVSRDGQTALHISVKKGMLDCVEFMLAENPDLSTIDLQGRTVYHIAASKGDPVMLKKLLDYSRWCLEVKDTKEMTALHYAVASGENECVKLLINNNSPVDLRDGEGRTPLLTAIMNGYEKIAMTLVLHGVDVNAPDYKERTPIFMACIQGMRDVVALLISKGADSKLVDAEG 815
            +EW K D+RL+ A    D E++   + KKGAS  K   +G+TA H++  KG ++C+  M+    D++  D  G +  H+AA       ++KLL  S+   E  D+   TALHYA A G  + V++L  + SP++L+D +G  PLL A+ NG+ +I   L+ HG DVN+ +   RT + +AC  G  + V  LI KGAD  LVD+ G
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The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00059339 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00059339 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
RAI14	3.043e-38	38.35	Ankycorbin OS=Homo sapiens GN=RAI14 PE=1 SV=2	[more]

You are here

TCONS_00059339 (transcript) - C. hemisphaerica