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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00059133 ID=TCONS_00059133|Name=TCONS_00059133|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3269bp
gttcttcttttatttttagtgcttaaagaaaaagaatttaagGAATACTT
TTATGGGTTAAAATTATGTGTGGAGATAATGGAGCAGCCCCTTTCGTCCC
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TTGTACTAAATATCCAGATCCAAATAAAACTTGCAATGCATGGAAGCCTT
TTGATACACCGAATAGTAAAGAAATATTTGGACTGTTAGACTGTGCTTTC
TTGATGTCCTATGCATTATCTATGTTTGTCAGTGGCTACATTGCTGAGCA
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TTACTTGCATGTTCGGAATGGCATTTTACTGGCAGATTCATCAGCTCTCT
TACTTCTTTTTGGTTCAAATTCTTACTGGAATCACACAATCAACAGGTTG
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GTTTTGTCATGGGAATATGGAATACACACGTATCCGTCGGCAATATTATA
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TCTTGGTGCCCGAGCCTTCTTTTGTAGACATGGAGGATGAGAACAAAAAA
GATGATGATTTGTCACAATCTGGTTCTGCAAACTTTAAACGTAAACATGA
GCGGTCGAATCTGGTCAGTCCGAATCCTTGGTCTTCTATCGATGAAGACG
ACCTGACAGCACACGAGCCACAACCTATCGGACTCTGGGGTGCTTTACGT
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TTGGAGGGGTACAGTATGATGATGCTAAGGCTGCAGACTGGGCCATCCTT
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cCGCTGTTCTCCTAATGAGACAATTTATCACTGAAGTCAATCAGTTTCGG
CAAAAACGACAGATTGCCAATTCGGTAGTCGACCCAGATGAAAATAAACC
TTTGATTTGAGATTATTGACGATTAAATTTTAGATACATTTAttgtcaac
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GACTATTACATTAtgtgaaaaattttccgaagGTCAAACCAAATTTGgat
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GATGattatgaatatttttattttagctttTGTTTAGAAAGAGCCTCGTA
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TTGCTCAACTTTCAAATTAATCGCACTAATCAAGTATCAAATTGGCAAGT
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tatctttttaatttttttagcgaTTATGATAAATGTTGAGTGCTAATCTT
GTAGATGATAAGTAATCATATTCCTTCTAtaattttgcgcaattttttcT
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GCAGAAATCATTAACAATTTCGGACCTACGGGAAAATTaagacccacgaa
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AGTTAGTCAAAGCTTGTATTTCAAAAAGTATTAGTTTGTATTGAAAATGA
TATATTAATTTATGTAATT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_318:27593..32092- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00059133 ID=TCONS_00059133|Name=TCONS_00059133|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4500bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_318:27593..32092- (Clytia hemisphaerica)
GTTCTTCTTTTATTTTTAGTGCTTAAAGAAAAAGAATTTAAGGAATACTT
TTATGGGTTAAAATTATGTGTGGAGATAATGGAGCAGCCCCTTTCGTCCC
TGTCTACAAAAAACTACTCAAAAAATGGTTGCCCAAAAACAAACGATTAT
TCTATCAAGGTGTTGTATTGATTTTAACCTATATTACATACACATGTTAC
CATTGTGCTAAACGTCCTGTTAGTGTGGTGAAAGGTGAATTAGCACCAAA
TTGTACTAAATATCCAGATCCAAATAAAACTTGCAATGCATGGAAGCCTT
TTGATACACCGAATAGTAAAGAAATATTTGGACTGTTAGACTGTGCTTTC
TTGATGTCCTATGCATTATCTATGTTTGTCAGTGGCTACATTGCTGAGCA
TACAAATATGAGAATTTATTTAGCTTCTGGTATGATTACGACTGGTTTGT
TTACTTGCATGTTCGGAATGGCATTTTACTGGCAGATTCATCAGCTCTCT
TACTTCTTTTTGGTTCAAATTCTTACTGGAATCACACAATCAACAGGTAA
TATATTACCTTGTTTTTTATTTCGCTCTTATATAAGCCAGGTAAATTTTT
TCTTAACGATGTTTGAAAGGGGTAGTCTAGTTTAACACGTTATCCTTTTT
TCAGTTTTCATCCACAAAGCGGGTCAGGACTCTAAAAAGTGATTTGATTG
TTATCATTCTGAAAATGTGAAAACAACCTCTATGAGTGGACACAGATTTT
GCGCGCTTTGATTCCAAGTAATTTGATTGACAAAATGAAAAAAGAAACAT
ACTATGGTGAAAGCACCTAACTTCATAAGGTCATGGATGTTAAGCATTGT
CTGGTCAGGATAGTGCTTGGATGGGGGACTGCCTGGGTACTTCCGGTTTT
GTGGAATTTTTTCCAAGGATTCAATTGGCGCGTAAGTGGAAGCCCAAGAA
CAAAACTACGCCTCGTTAAAAAATTGCAAAACCAAACAAAAATATCTTCA
AATTATAAACCAAAATACTCTACAGAAGAAATCGTCATCGATTGGGCACT
AACAGATGATGATGAATGATTCATTTTTCAAATAGGCAGTCGAACTCTAT
TAGCTTTAAAAAGCTAGTACAGATTTGTACACATTTTTCTACATTCTTTC
GAATGTATATATACATTAAAACTAACACATAACATTAACATTAATTGATA
AAAATGACGTCATTTTAATCTTTGCTGTCAAACAAAGCTAGGGTGTGCTT
GTTGACATGTCGACATTTGGACACTAGGTCTGATCAACTAGCATCAAAAA
GCAATTTTCCAATTCCCAAATAAAGTAAACTAGAGCTGATTTAGGTAAAA
AGTACAAATCCCAATAAGAGTAAGAGTAATACTGTAATGATTTTTTTGCA
GGAAACTCATTTCAACTTATTCACAGATATTTCTAATCTCAGAATAATCA
TAAAAAACTAGCTATATTTATGCTTAACGTGCAAAATAAGCTTAACATGA
GGATAATCTGCTCTCTATCGTATATAGAGAGGAAATTTGATTGATTGTGG
CATACTCGATAAAATTCTTACTGAGCGTTTCCACAGATTTAATTTCGAAG
AAAGCTGAACTGTAGTACTCACAGTAGCATCCATACTCATTAAATATTCG
TTTTCTCTTTAGAATTTTGTGATGACCATGAAACAAACCCAATAAATCTA
TTGAGCTACTTTATTAGACTAAATTGGTATTTTAAATTGAGCATGATAAT
AAATTAAATCACTTTTTCACTCTACAGGTTGGCCATGTGTCGTTGAAGCT
GTTGGATCGTGGTTTCCCGAGGGTCGCAGAGGTTTTGTCATGGGAATATG
GAATACACACGTATCCGTCGGCAATATTATAGGGTCTGCAATCGCCGCCT
CTTTCGTCAAAAGCGCCTGGGGATTATCATTCATCATCCCAGGAGCAATG
ATAGCGGTCATGGGTGTGTTGAATATTGTTTTCTTGGTGCCCGAGCCTTC
TTTTGTAGACATGGAGGATGAGAACAAAAAAGATGATGATTTGTCACAAT
CTGGTTCTGCAAACTTTAAACGTAAACATGAGCGGTCGAATCTGGTCAGT
CCGAATCCTTGGTCTTCTATCGATGAAGACGACCTGACAGCACACGAGCC
ACAACCTATCGGACTCTGGGGTGCTTTACGTATTCCTGGAGTCATTGAGT
ACTCCTTATGCCTATTTTTCGCCAAACTGGTAAGCTATACTTTCTTATTT
TGGTTGCCCCTTTACATTACCAATATCACTATTGGAGGGGTACAGTATGA
TGATGCTAAGGCTGCAGACTGGGCCATCCTTTTCGATGTTGGAGGCGCTT
TAGGAGGGATCACTGCTGGGTTTTTAGTTGACCGAACTAAAGCCCCAGGT
ATTATCAATGTTAGTATGTTGGTTTTGGCAGCTCCTTGCTTATTCTTGTT
TAAATTCCATGGTGAATCAAAATTATCTTTGTTTATTTTCTACATGATTT
TATCTGGCTTTTTTGTTAATGGTCCTTATGCTTTGATAACTACCGCTGTG
TCGGCAAGCCTTGGCACACACGAATGCTTACGAGGAAATACGAAAGCAAT
GGCTGTTGTAACCTCTATTATTGATGCTACTGGGTCACTAGGCGCTGCTG
TAGGACCGTTAATGGCAGGTGTCATTTCAGCACACTCGTGGGATGACGTC
TTCTATATGTTGATTGCTTGTGACGTCATTGCCGCTGTTCTCCTAATGAG
ACAATTTATCACTGAAGTCAATCAGTTTCGGCAAAAACGACAGATTGCCA
ATTCGGTAGTCGACCCAGATGAAAATAAACCTTTGATTTGAGATTATTGA
CGATTAAATTTTAGATACATTTATTGTCAACATGAAAAATATGAGCAATC
TGACTGGCTAAAAACGCGTACATAAATGCTGTATTTCATATTGTACCGTA
CAAATACAAGACCGCGTTCGAAAAAGGGGTCTGGTAAGCGAGAGATCATA
TTTTGTACTTACTTTTGCATCTTATCCCAAAATTTATTCTCAAGAATGTT
TTCTTTTTTCCTCTCAATACTCACAAAAGTTGTCAATAGAATGTTTTGAT
ATTTTAATGACCATTCGAATCATTTCTGAAGAGTCGAATGTTGATTTCAC
CAAAATACACGAAGTGAAAAAAAAGATAAAAAAAGAGACACAAATGGAGA
GGCTAAAGTTTGTTGATATTTTTCAAGTTGACAATAAACTAGTTATCACA
CTTTACTCGTACAATATTGGATATAATTTATAATAATATAAGAGTTTTCT
ATATTTTCTATTTTTCTATAAATATGACGAAAAATCTGAACTCGAAAAAT
ATATCCCATATTCTACTCTGTACCGTGTGATGACTATTACATTATGTGAA
AAATTTTCCGAAGGTCAAACCAAATTTGGATATTTTAGAATAACTTTTAT
TTTATTTCAAGATCTGGTAACAAATAAATCGGTGGGTTTTGCGATGAATA
TCTTTATCAGTATCTTAGGCGTTACAACGTGCATACTTTCATACCGTGGG
GGGGGGGTAAGTAGGCGAACAGGGAATTTCTGATGATTATGAATATTTTT
ATTTTAGCTTTTGTTTAGAAAGAGCCTCGTATGTTATATGTATGGATTAG
CTTTATAAAGCTAATTCTTTTTTGAGGTTGACTTTAATTGAATTAAGAAT
GTTCCGTATTAACGGCTAACTTTCCAAAAGATTGCTCAACTTTCAAATTA
ATCGCACTAATCAAGTATCAAATTGGCAAGTAGTGCTCAAAAACGAATTG
ATGTTGAGTAAATTTTTGAAAGTACGGCAGTTATCTTTTTAATTTTTTTA
GCGATTATGATAAATGTTGAGTGCTAATCTTGTAGATGATAAGTAATCAT
ATTCCTTCTATAATTTTGCGCAATTTTTTCTCAGCATCTCTTCAAATTAA
GGGTGCTAAATTACGTGGGTTACGTGCGTGTCGTGGGTTCGTGGGTCCGT
GTTAAAATGTCTCGTGGGTTTGTGGCAAAAAGCAGAAATCATTAACAATT
TCGGACCTACGGGAAAATTAAGACCCACGAACCCACGAGCATTAATGATC
CACGAACCCACATGAATTTCTTTTGGACCCACGGCCAGGCATATTTCCAG
GCGTTTTCTGCTACCGGATAACGGTAGGTCAAGGGTGGTCGGTAAAGTTA
GGTAGAAAATCCAGGGGGGTCCTAAAATTTTTAAAAAAATAATCCAGGGG
TTCACGCTTCCCAAAAAAGACCTCTAAACACTGGGGGTACAAATTTTTCT
GGAATAGCCCATTTATAACATTATAGGGAGTCAACTCACAGTATTTTCCA
TTGGGTTTTTAAGTCGAGGGTGCTGCTTTTTTTTAATTTTCTTTTGTGTA
TTAGAAACCATGTTTTATGAATTTAATGTGTAGTTAGTCAAAGCTTGTAT
TTCAAAAAGTATTAGTTTGTATTGAAAATGATATATTAATTTATGTAATT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1575043694:31547..32092 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1575043694:31547..32092 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1575043694:27593..30315 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1575043694:27593..30315 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1510915933:31547..32092 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1510915933:31547..32092 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1510915933:27593..30315 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1510915933:27593..30315 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1491911889:31547..32092 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1491911889:31547..32092 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1491911889:27593..30315 | TCONS_00059133-exon-scaffold_318-1491911889:27593..30315 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_318 | supercontig | scaffold_318:27593..32092 - |
Blast
BLAST of TCONS_00059133 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: G6PT3 (Glucose-6-phosphate exchanger SLC37A2 OS=Homo sapiens GN=SLC37A2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 434.491 bits (1116), Expect = 1.023e-139 Identity = 228/480 (47.50%), Postives = 315/480 (65.62%), Query Frame = 3
Query: 150 FYQGVVLILTYITYTCYHCAKRPVSVVKGELAPNCTKYPDP-NKTCN-------AWKPFDTPNSKEIFGLLDCAFLMSYALSMFVSGYIAEHTNMRIYLASGMITTGLFTCMFGMAFYWQIHQLSYFFLVQILTGITQSTGWPCVVEAVGSWFPEGRRGFVMGIWNTHVSVGNIIGSAIAASFVKSAWGLSFIIPGAMIAVMGVLNIVFLVPEPSFVDMEDENKKDDDLSQSGSANFKRKHERSNLVSPNPWSSIDEDDLT---------AHEPQPIGLWGALRIPGVIEYSLCLFFAKLVSYTFLFWLPLYITNITIGGVQYDDAKAADWAILFDVGGALGGITAGFLVDRTKAPGIINVSMLVLAAPCLFLFKFHGESKLSLFIFYMILSGFFVNGPYALITTAVSASLGTHECLRGNTKAMAVVTSIIDATGSLGAAVGPLMAGVISAHSWDDVFYMLIACDVIAAVLLMRQFITEV 1538
+++G++L+LT++ Y CYH +++P+S+VK L NC++ P N T + +W PFD N KE+ G +D AFL++YA+ MF+SG E +R YL++GM+ +GLFT +FG+ ++W IH+L YF ++Q+ G+ Q+TGWP VV VG+WF +G+RGF+MGIWN+H SVGNI+GS IA +V WGLSFI+PG + AVMGV+ +FL+ P VD + + N + N SP SI E L EP I +GALRIPGV+E+SLCL FAKLVSYTFL+WLPLYI N+ + +A D + LFDVGG +GGI AG + D T ML+LAAP +FL+ + G+ ++ I +I+ G VNGPYALITTAVSA LGTH+ L+GN KA++ VT+IID TGS+GAA+GPL+AG+IS W++VFYMLI+ DV+A +LL R E+
Sbjct: 20 WFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKPINDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYYLSAGMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGKRGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDVDCAPPQHHGEP-----AENQDNPEDPGN--SP---CSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPGVVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVA----HFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRLVYKEI 485
The following BLAST results are available for this feature:
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