TCONS_00058233 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00058233
Unique Name	TCONS_00058233
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3504

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_309:483904..506220+

transcript sequence

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CTGCTGGTTGATCATAAGGTCTtcacttttcaaaattattttgaaatatt
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CCTCATTacattatttcttattttttgtataagaaaatcTGATATTTATT
AACT

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transcript from alignment at scaffold_309:483904..506220+

Legend: exon

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>TCONS_00058233 ID=TCONS_00058233|Name=TCONS_00058233|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22317bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_309:483904..506220+ (Clytia hemisphaerica)
CTGCTGGTTGATCATAAGGTCTtcacttttcaaaattattttgaaatatt
ttttattcgatAAACATTGGTATATATTGAGCTGTGTCATTGTAAAGTGT
GACTGATTTGGATTGTATACTTCATGACTCCATCATTGTCTTTCATATTG
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TTATTTTGATCTTGTACACTTTTCTTCTTTATTGTACCAATACAATATAC
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TTgctgaattcatgatatgcaccattgcaatgtcttccgttccacccaat
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TTTTACTACTGtagtaatgtttttttttcattttatcttttcttttcttc
tctttctctcTAATTTCTTGTCTTATTTACTGGTTTTGGTCGAGGTTTTG
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CTTTTTCGCATGTTAAAATTATTTGTCAGTGACAAATAGGGAACTCCTAT
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TGGATCGAATGGAGTTCACTAGAAGTCGTATACCAGGTGATGACCTTTGT
TTACGTGACCGAAAGAGAAACGAATCGATATAGTTTGGTTTTGGGAGAGA
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TTCCTTCTTCTATCTCTGTGTGTTTTCCTTTACTGCccatctgtctgtct
gtctgtctttctttttattgattcttgATATCCCAAGAGAATCATCTACT
TAATTATCGATTACTGCTGATTGCACCAGCAGCTTCTTGTTTTCCCTTCG
ACGTCTTTTCAATGTCTGTCCTACGTTCGTGACGTTCAAAACGTTTATAC
AACATTAAATGGACGTTTATACAACATTGTATGCCGTTTGGGACATCACT
CTGGTTTGTTTACTTTGATTTCTCCAGCCATCTCTCCCAAAACCACCCTT
TCGTTTCTCACGCCCTTATGCCTCGATTATTATTCATCAATTCAGGTTAA
AGCCTATAACGCGGAACTGGCTAATCAAGTCCAAACGCTAAGCAAACGAA
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AGGTATCTAAATATGATTTTTCGTGAAATATTGATATACAACAATAGTTG
aattatattgagaattttgtgtattttaaacgtttttcaaaattttgagt
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TTGGACCTGGCATTTGGACCTTGAGAATGTAGTctcgcggtcaggcgcgt
gccactttattattcaatTATTCCTCTAAActtgattcaatttttttaat
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gTATAGGCCTAATTTTTCatccttttcttcattttatagGTTCAAAGGCT
AGCGGAGGAGAAACGTTTACTAGAAAGCTCTCTAACAGAAGTTGTCCAAG
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cttctttttaataatttgagAGCTGGGGAGAAGTGTCGCTGTCTTAATGG
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CTCCTTAAACCCCAGACGGCTCCACCGACAGCAACCAATTGAACAAATGC
CTTTACGCTTTAGAATGGTTTTCGTACAGCGTGCAAAATATTTTCGCAAA
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ggctttttggactctaaaacatccaatCTTTAGAAAATTGCACAAATATA
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TAATGCAAATAGCAAGGAACCGAGTCGAACCAATACACCGAACCTTCAGT
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gcttttttgtCACCCTCATTacattatttcttattttttgtataagaaaa
tcTGATATTTATTAACT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_036696	XLOC_036696	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_309	supercontig	scaffold_309:483904..506220 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00058233 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00058233 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00058233 (transcript) - C. hemisphaerica