XLOC_036696 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036696
Unique NameXLOC_036696
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_309:483904..506220+

Legend: gene
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TTGTTCATGAAATAATCTTTACTTCTTCCGCCTCTACAGTTTGACATGGC TTCACTGATCGATCAACAATTGACGTCACAAATCAAGAACGAACAAAAAC GTTCGAGAAAGCGAACAAACAGTGGTAGTCAACAGCAAcagcagcaacaa caacaaaaagtcaAGTCTTACTTAACCAGATTCTTTTCAAGGAAAAATAG TAATGCAAATAGCAAGGAACCGAGTCGAACCAATACACCGAACCTTCAGT CCCCTGTTCCACCAAAATAAAAGCTTGAGCTGGATGTTATGATGGAGAAT GACTGCTACCGTTTTAAAGAAGTTTGGTTCTTGTTCTATGGTGACAGATC ACACGGGAGAGAAAAATCGCTCGCTTGTCGATAAAACTGTATCGACGGAT AATGCTTCGAGCAAAATAGATGGTATGTTGGTTGGAATATCCATTCGTTG AGGATTCCGTTCTGCAGGCGGATAAAGGCTTTTCTCTAAACCTATACAGA ACCGAAAGAATATGGTATTTTTGGCAAATAAAAAGGATTTTCTCATGATG AAAACAATCATGTAAGGACGTAACAAAGACAACCAGGGTTGGTAAAAATC ACACGTCATTGCTTGTTGACATCTTTTTAACGTCTTGTTGACATCCCTTG ACGTTTGGATATTGTTACCTTCAAATAGCACCATTAAATTATAAAGggaa agtgaaaattttgaaagatgacATTTTTAAAATGACATTGAATATCTTTT GCCTGAAAAGTCAGATCAGTGAAAAGCGAAAACAAAAATGACAATGGAAA AGACATTGAGAAGGAGCTAGATGCCCGcttgaaaagtttaaaaatgtata aagttttaattttttgaatattcaTCAGTTCTATTAAAATTATGTCGCCG GTGAACCTTAATCTAGGTACCCAAACTCGAACTCAGTCTTATAGCtcgct ttttgataattctggATAGCACTCACGAAAGTTTGCAAAGTGGTGCAAtg ggctctgggtacgagattgtcAGGGTAGCTTACCTGATAAAGGAGGGGTG ATACCCCATTTGTAATAAAAAAGTTAGAATTCCAACAATCAAAGACTGTT TGATTTTCTCTGAAATTTTGATTCTACACACACATATACTGTATATTGTT TGACCAGATTAAATTTTGACTTGAGTTTTAACGCTTTTAAGTTCGTTGCG TTCCTTCATTCCCCAACTATCAAGAATAATGTTTGAGTCATCAAATTTGC TAGGAAAATTGTTTTAGGCTACATACattttttattggaaaaattatttg gttttttgtaaatatgaaatacgaaaaaattgtatttattgaattttatt gcttttttgtCACCCTCATTacattatttcttattttttgtataagaaaa tcTGATATTTATTAACT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00058234TCONS_00058234Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00058242TCONS_00058242Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00058244TCONS_00058244Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058245TCONS_00058245Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058246TCONS_00058246Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058247TCONS_00058247Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058248TCONS_00058248Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058240-proteinTCONS_00058240-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_309supercontigscaffold_309:483904..506220 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CCDC64BPREDICTED: bicaudal D-related protein 2 isoform X1 Homo Sapiens
CCDC64PREDICTED: bicaudal D-related protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.3 6.38 2.36 1.39 48.83 34.99 65.51 68.24 43.39 59.34 33.25 36.7 67.69 45.6 30.63 33.19 30.19 30.47 48.74 81.41 31.03 32.99 15.86 24.03 32.91 37.78 123.28 148.9 7.55 6.85