|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00058073 ID=TCONS_00058073|Name=TCONS_00058073|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4325bp
aaataatttctcaataacaaaataatgaacatttttaatgaaaaatgctc
aaaaagaaaatgaataaaagaagaagaagaaaaagaaaagtaaagaccTG
GGAAGACTTCATAATGGGATCAACTGAGTTTTGACAGTGATGATTTCTTT
GATGGATTAATAACGTGATGGTTTAAAATGGACCCCAAAAGAGGAACTAC
TTTCATTGATATCAATGTAATATCGCGTGGATATCACTTATTTAGCATTG
ACGATTTTAAACGAAATCGCCGAGGATGAGCGCAAATCAGAAGAAAGTCT
TGTTTTCGGCCATATTGTTGTTCATGTACGTAAACATCACTAACAGTGTC
GGTGAAAACACCCATTGGAACACCACAAAGCCTCAAGCAGCTCCCTTGGT
CGAATTCTTTTACTGGAACGTAGACCCTTTCTTTCATGTCACGCGAAACT
TCAGCAAAACTCACGGAATCTTACATGAAAGCTTCAAGAAAGCTGCCATC
TATTGTAATAAAGCCATCACAGGATTCGAATTGGACCTAAATTGCGACCC
TCATTCTATGACGGGGTCGACTCCTAAGCGCCATTTCGTCCGGTACCAGA
AGACAGCAATCGGACATCAGCCTTTTCATGCAATTCTTTTCGATTCCAAT
CGCACCAACCTGTTACATTATCAACGACCTAAATATCATCCGGAATGCTC
GAAACCCGTACTGCAAATGTGGGCTACCATATATACGGACAAGTCAAAAG
AATGGTTTAGTAACCATCTGAAAGATCTAACTATGTATCAACTTATGGTG
TCGAAGAAAGTGGCCGTTATCATGCCAAGAGACAAGATCGACATCACATA
TAAAGTGTTGAAAGGAATCAAAAGTTGTACGGAACCTTTACTCCTCTCCA
TTATATTCTCTCTCATCTTcggaatttttttatggttttgCGAACATCGT
TATAACGAAGATATTGACCGAGATTTCTTCAAAGGTGCTCCCGACTCAAT
GTGGTGCAGTTTTGTTTCCATGACAACAGTTGGCTATGGTGACATCTATC
CTTGTACCATCATTGGGCGTGTTTCGATGATAATTTGGGTCACTGTGGGT
CTTGTTATGATTGCTGTAATGTGCGGGACTGTTTTTGATACCCTTGGTAA
TGCGCCGGAGATATACGGGAAACGAATCGCTGTTATCCCTAACACGGCGG
TGGAAAAGTTTGCAAAGTCAAACTTAAACGGTGTTATTGTACCTGGTCCA
ACTTACCGTGATTTGTATTCGAAAGTTCAAGAAGGAATTGCTGACGCAGC
TCTTGTCAGCAGTGACGTTTACGTTGCGTATCAACGTGAATTCCGTAGCC
ACGACAAACATGACGTTAAATTACACGTCGTTCAAGAATTTGAGGTTGAC
CAGCCCGTATTTGTAGCAACGGATTTACGTAACAAAACGGAGAGTATGGA
CAAATTGTACAAATGTCTTGTGAAAGAgaacgaaaatttaattttccacA
TTCCATCGGTTCAACAACCACTACAAGTCCGTATCGATTCAATCGATTTC
TCGAACTTTGATCGAGTTTATTTGTACCTTTTCATTGCGATTTTGGTTTG
TTTTCTCTTATGTGCTTCTCTACATatcaaaaatgtgaaaatgaaCGTGA
AGAATTCTATCAATAACAACAAACCGATTCCTCTGAAAGAAGTGTTGGAA
AGAAATTggaaattagataaaaattaatTCATGGAATTTACTGCAGAACT
TTCTTTGCATATAATTTAATgaataagaaaatgaagacttttgcgaagag
gAGTACTTCAATTTTCAGCGAAGAAATTTGAACGATAATTACTCTTGACA
GAATAAATTACCAAACAACTTGGAAAAGGCAGCCTTTTGTTAGAAGTGTC
AAGGAACCCAAaataaaaatcaccaaaaaatgttctaatcatggtcagag
cccttaaatttcatttccaaataagCAAGTCTACTAACTCCGATTTCAAA
CTAGCAATCGGCTTTTTCGAGTGCGATTTTGTTGGTTAAGTACGTTTTGT
TTTATGCgggtaaattaattttttttgtcatatttataaCTTTGTAGAGT
ATAATTATATTTAAAGCAATATCTGAAACCAATacatggaaaagaaaaat
ggagatttgaattttctgatactttcaAGGCACCAGCCCAAATTTTCACT
TTCGTGATTTGTGAAATTCCCGCTAATTTTTCCCAGTACATTAAACTCTA
TCGAAAGTTAACATTTTGTTCCtcttttttttcagtacatTCAAATAAAG
ACAATATAATAAAAGAATCGGacaagatgacgtcattgttcTTCGGCACC
GTCATACTTGTCATCACCGTGTTACAGATGCACGAAATCAAAGCTGGAGG
AAATAATCACTCACAAGGTGAATCGAAAGATAATGGAcatcataaaaaag
tcattACGCATCTAATGACCATGTATTATTGGGATGCACCACCCTTGATT
CATGGCGGAAATGCGAGCGATCCGGACAAAATTCACGGAATCATCCCGGA
CATTATGGAGGAGATTGAAGGACGTTGTATTGTGTCTTCGGAGTATGATC
ATGTCCGGCTTTTGACCTACATCAAGGTCTCATCCGAGGAAGCACTTTTT
AACAAAATGATGAATCGTGGAAAGAATGAATCGTTCGAGGATACCATTTG
GGGTCCCGTGTTGACACGCAAGATGGCGGACGATCGTGTCGTGTCTTTCT
TAGCGGAGAACGAAATTGTTCCACAAATGTTGTTGAATACTGATGGTGTA
GCGGTTGTGGTTCGAGAGCATGAGCTTTTGCTGTTGAATAAAATAGGAAG
GTCGCTCTATGAGATGAGATTTATGTATCTATTGTTTCTTCTCACGTGTG
TTTTAGCTGGCCTCGTATTTTGGCTTATTGACACATCCTGGCAACCACAG
ATTGGGTTCTTTGAAGGTATAGCTTTGAGCATTTGGTGGGCATTCATAAC
CATGACAACTGTAGGTTATGGTGACGTCACACCACAAACAAAGCTTGGAC
GGTTATTTGCTACAGGGTGGATGTATTACGCTCTGATTGTTTACGCTACC
ATAACAGGACTGGtatctactttcgttttcgatgattttttgtTCGACAT
CTCGAACAAGAATATTGCTGTTCTTGCAAATTCTTACGAAGCTTGGTTCG
GAGAGAAAACTTTTGATACGAACAACATCCCTTACGGGACATACGGGGAG
ATTTTATACGCCGTTAAAagtgatcaaaatatttttgcaggTCTCATTCT
ATCTGAAATGGCTGCTTGGAGACAAAAAGAGCTTCACAAATTAGGACTTC
GTATCGTAGCAACGTACCCCACAACCGTTACTGCTTTCCTCATGGAAAAA
GAGGAAACTTTGAACAAGCACCATCCGGCTGTAAATGGTAGCAACCACCA
TAATGACGCCATGCGAGTCAAATGCAAAGAACACGCTTATGAATACATAT
ACAAATTAAGCGTCAAAGGGAATTATAAAAGAACTTTACAGAAGACTGTT
CTCATGATTCACGATTGGAAAGGCCTTTTCACTGCGGGCTTCAATCATTA
CTATATCAGTGTATGTGTGTTGTTAGCCACAATCCTCTTTGCTGTTCTCT
ATAATTTCATGTGCTCGCTAGAGAGAAagaaaaccaaaccaaacaaaagc
GATGAGAATGGCAACGTCCAGGAGATGATTATATgatgaaagtcaatttt
ctttttgatttatgGAGTAGATAcgagaaaactttttcgagttgaGTGCA
CACTTGAGTGAATGAATATTTAATACTCGTTCACTGAGATAAGCAAGATG
GTGTACTCCAACGATCTCGAACTAATGAACTAATGAATGACTAATGTGAA
CAATAGGTAATAATAACAATAGAACAAATAGATAAAAGCCTGAAGTTGTA
AGCCATAAACTGGGATCCAAAGTGAACTAttctcaaaaatctaaaataaa
atagcatttattctaaaattttattatttaattttaatttgataaatttt
ataaccTATGTacaattaattaattttaatttgatCATGAATTTAAAGGT
GCAAggatattttgtattttctaagatatttaataatatttaaaatcacT
TTAGGAAAATTCTCCTAGAatttgttaaatgttaaatcatAGAACTTATT
ACAGTGAAGCCTCTTTAACTCgagcctccataactcgaataagTACGGAA
GGGACCGTAGAAATGGTTTATAAATCTTATAccgtaactcgaaatttcct
taactcgaagaaATTTATGTTCCCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_305:22301..34874+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00058073 ID=TCONS_00058073|Name=TCONS_00058073|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12574bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_305:22301..34874+ (Clytia hemisphaerica)
aaataatttctcaataacaaaataatgaacatttttaatgaaaaatgctc
aaaaagaaaatgaataaaagaagaagaagaaaaagaaaagtaaagaccTG
GGAAGACTTCATAATGGGATCAACTGAGTTTTGACAGTGATGATTTCTTT
GATGGATTAATAACGTGATGGTTTAAAATGGACCCCAAAAGAGGAACTAC
TTTCATTGATATCAAGTAAGTACTTTTAATCTCCTTTTATTTTGACTATA
GtttgttttttcatatttttcttcatttaaataTATAGTTTGATTTGCTA
TGGAGGAGTGATGTTATTTCACTGTGTTCCTGGAACTGATGGTAATATTT
CCAAGGCCGTATTTCCAAGGCTACGACACACAGATTACGGCAATAAAGCa
tttctttaaagatatttttatctttACCGATTTTGAAGTTTGCCTTGTAT
TACaattattcagtcacaactaaCCATCAAGTTTATCCTAATGACTGAAT
TAAACTAGCTTAGCTGCCTAGCCTACATAAAGCGAATAGATTCGAGAAAT
GTCAAAATATGTAGATAATGGTTTTAGCTGGTTTTAGCTCCATAAACACG
AAATGATGCTCTTTGGTCGGTGTAAGTTTACTTCAAATCATCCGAGATTA
TAATGCCACCAAACATTTGCTAGGTTCTGGAAttcatttaattattttac
tGTTGTTTAGAGATCTCAAAATGTATTCAGAAATTTAATGCTTGGGTCAA
TACCTAGCTTTCTTCCCCTTGGGTCATGAATAATCGAATGATTAGAATTA
AGACCACTCCCTCAACAAACAGTACGTCTAAAAAAGTTTAACCCAGATGG
TTTGTTTTCATGAATAGTGTTTCAGCGATGGTTTGCACATAAAAACATCT
CGTAACTTAAGATATTTTATCGAAGTTCGTAACCACTTTCTGAAATTCTT
TTATTCATCATGGAGGAATAAATCAAAAGTCTGACTTTAAGGATATTTTC
TTGGACCAATGATTGaacgatgaaaagaaaaactagaattcttttcagca
aaagtctcattaaattttttagagacatcttttttttttaatgtagtACA
AGGTGCCTCCAGAAAACTCTTTTGATAGTTCATCTTTTGAAGTCTCTCGC
CTTAAAATTCCAAGAACAATTTTCTCAATCTGGTCAAAGCTCTtagaaaa
taagaataaaatcgAGATCACACTAATTCATAATTGGGACATTATGCAAG
GAACTTTTTTGCATATTATTAATGAGGAAAGCCAACAAGAGAACTCGTAC
TTAAAAAAACGGCGAATAATTTTAATATACATTTGTATGAAAACCTTACT
GCGATAAGCTCTCCAAGCAAACCTAGCATATTCACAGTAGTGCAAAGAAA
TTTGACAACAAATCGCTATCTTGCGGAGGGAGTTTACTATGAGGATTATA
TCGACAAGATAGAAGGATTAAGTACCAGTTTTCTAGTTTTCTTTCTCTTG
TTTCTCCAGTTTGTGAAAAGGTTTATACAGTAGGTTTGTTGTATGGATTT
CATACAGTTTTGGATTTGACTTTGTTTGGATTGGTTAGAAGAATTGATAT
TATGcttatttttgctttctttgtcTGATTTGCAGACCTATATACACCCT
TTAATCACTTTGTATAAACACATCCTATAAGAGGGTATCCCTTTTTTAAC
gtgtttttggactttttcaaaagtgAATTTAGACTtgaaaagcttataac
ttgacaaACACTGTACCAATTTTTAAAAGCTAtatgccaaattttaagtt
tgcctttcctcttgaaagtttaaaaaataatatagtATTTGTGACGTATT
TTGGACACAGTTAACCTATGTACTTTTTCTGGGTCACTCGGTAGTACTAA
TTAATATTATGTAAATTTGTGCAAAAAGTTTCATCAGTTTCACCTAGTCT
CATCGCATACTGTACTTTTTTAAGAGAGATATTCAACCCtgaagaagaaa
gtgaaaattcGTGCTAATATAATTTAttaaataaatttatataatttgtt
aAATAAATTTACCCGTTTTTTAACTATTTAGTAAGCAATTTGGTTTCATT
AACAATGGGGGGGGGGAGAGTAAAATTTTTGCTTGTATTGGAAACCAACC
ACGCAAGAGGTGTGCAACATAAATCtaagttatttttcaaatctgtATTC
GAATATTTACAAGATTTGATTTGATGATAGGTTCACCTGATAAATAGTTT
CCTTTTGAGTAACGAGGCTCTGCTAGATATGTATTACTGCGCTATGATcg
aaattttgcggtaaagttcatgaaaagatatttgaccttatttatgtttt
ttttagtCAAGAAGCTACTACACTCTATTTTCAACTGTATTTTTCTGAAC
TTCCAATCTCCGCAGTCTTATTGttgaaaattatataaaatgaaaaatat
ttaaaatagataaaatctGGAAACAAAGGTTATGATAGAGTCTGGAAAac
taattttctgatttttgtttgATATAAGATAACGCTAAGCTGGAGAAAAG
ATTAGTTGATTTTTGTTGTTCAAGCTGGTCGCTCCTTCCTCGctagaggg
gggggggggggttatttTCTATAATTTTGGAAATGTGGATTGATAATATT
ggataacaaaaaaaatttttttttccctttttttttttttttttcaagct
ggTCGCTCCTTCCTCGctagaggggggggggggggttatttTCTATAATT
TTGGAAATGTGGATTGATAATATTggataacaaaaaaaatttttttttcc
ctttttttttttttttttcaagctggTCGCTCCTTCCTCGctagaggggg
ggggggggtgttaaCTTCTATAATTTTGGAAATGTGGATTGATAATATTG
GATAACGGAACAAATTTTGATTATACAAATCAAAATGTTATTTGGAATTC
TTTTGTTCTTTATGTCTTTTATTTATAGTCTTTTATTTGTGACAATATTC
AGTTAACCTTCGCTAATTTGAACTCCAACGAAAAGTCTGTTAATTACAGA
GATACTCGAATCACAAGGAAATTATTTGAGAGGATTCCCTCGCCTGTGTG
AAGTCGAAAAGTctgatttgttcgaattacagagagattcgaataatagg
cAGTTATTTACGAAGATTCGCCCTTGACGGAAAATGAGAAttagttcaaa
ttatagaaagattcgaataattaAACTTTGATTTAGCGAGATTCCACTGT
ATAAATCAATGAAGTCTGCGTTGCAGAATAAAagataaatgaaaatttag
tttCCTAGACAACTAAAATCCGTCCCATTTTGATACATtgcttttgaaag
aaaaataataattgaatGTAATAATTTGGATCTTCAGGGAtcttcagaaa
aataaaaaacattaatttttcataCTGACAGCTTTTCAAGCCGTCTAGGC
AGTCTTTAGTAAAAAGGTTTTGCTAAAAAtgctttcgaaaattttgaaaa
ttgaagagGAAAATtgaggttgaaaaaaaaatttttactcCACAAAAAAC
TTCTAATTTTAATACGAAACTCCCGAAAAACtattgtaaattttgaaaat
tacaacatttgaataaaaagttgaaaatttttaaacttgTTCAGAAAAGT
TTTATCGTCGCAGAAAAGGAAAGAACctaaaaaaacagcaaaaaattacT
TGGTGTGTTTTATTGTTGTTCCATCGGAAAATgtgaaatttcattatttt
tctttccagGTACTTCATCGGAAAATGTTTCAAATCTATTTTAACTTAAT
ATAAAAAAAGCTATGTTAAAATAAAAGGATAGAATTGGATATTTTTTAGT
GCTATAAAGGACCGGCTCCACTTTTCGAGGAAaacttccacgctattggt
caaaagaaaaatgaagcaactccattggtgcggtctgacgtaacggttga
aaaaagttaaaatgtgttttttttttagcgCACGCTACATTTTattgacg
taatcttttttccaagcaaaaaggatatAAACcgaaaagtgcgatcgcag
cgcgcgcaagtggagaccggccttaatgaTCTGTTTTCTTACTTAACTCT
TTCAGCGTTAAAATGAAAGAAGGTGTCAGGAGCGCCAGGTCTCCCCTGGC
AACCATTGCCACCATCAAAATAATAAAGATTTGATTGATCGCCAGGTTTC
CCTGATTTTATCGGTTAAAATTGTAAATTCTTTCAATGTCATCTGCACTA
TTGGAGATAACATCTgtggttttatcttcaaaatcTTATAAACCAGTAAT
TTCATTAGAATTCTTTCGAGAGTATTTTTACCTGATATGAAAATGTCTAG
ACAATGGGATTACATTAGCTAAAGGCTTGATGAATGTTACatttagtttg
attttttgtcaaaggTACTAGAGATAACTTTAGGtaataaaactttgaaa
tagtTCTATGTGAGCCTGTTTGGCCCTCTGAACCCATTTCTAAGAAGTGG
GTGCCAGTTGATAGAAAAGGTTTCAAAATGTTTGAGACTGGTGGGGTATA
GATCACATCTCCACCAGAACCTGGCAGATTTCAGTTTACAACAGTTTTGT
GTTTTGTAAGTTTGTTGCCATACACCCCTGTCAACACCCTAAGCGTGAAA
GGAGGGCTTACCAGGGAGGAAAGACATAAACATTATGTATCTATGAGAAC
ATCAATCCAAACAACTTTATTCTCGAGGTCCCTAATAAAAGGGAAGGTCC
GAAAAAAAGGAGGAGgccgaaattttttcaaaatctaaaaaaaggggggg
tccgaaattgTACTTTTTAAAACCCCATAATAAGGCtaaggctatttaga
gcagTTCAATTTGTGATGgctgaaaacattttcaaaaataaatatacggG
TCGCGTTCTAATAATAGCGAGGGGGGGAGATCTGAAATCTTGCAAAGCGG
ACGAGTGGAGCGGACGTTTATTCGGGACGTTAGATTAAGCGACAAATCCT
TGCTGGTAAACTCTGTCGAGGCTTGATACATGTATTCACTCTGTGGTCAC
CGCCAATCGCTAGTATCAACACTTGTCTCCGATGCTATCATTTCTCTATG
TTGAATATACCTCTGTCTATACACCAGGTAGCCAACCACGAAGATTGTAA
TCGCCCATATCATACCAAGGCTACCAAAAACTATAGTATATACATTATTT
TTGCATTCGCTCTCTGCCGTTTCCGCTTTTCTACCACTTTCACCTACTTT
GATGCTTGGTTGGTTTAGAATCACAGATGAATCCATTGCTGGAGATGGAT
TGATATTCATAGTGTTCAAGGTGCAAGTGGTTGGACTCTCACTTTCTTGG
CAGTAAGAGTTGTTGACACACGTGACATTCTCAATCTTGTGAATAATTCC
ATCTTTAATACAATCGAAAGTAACTAAGGTGTTGTTGATTGCTCTTTGAG
ATTCACAACAGCATAGTCTGTCGGTAATCCGGTTGAAATAGACGGTACTG
TCTGATGTCAAACTGTCAAAAGCTCCTGGTAGAAACTTCATAATATCCTG
ATCCTCGAGATTAAGGTATCTAATGCTAACACCAGCCAGTGTATATTTAG
TGATTTGTTTCAAGTTGTTACCTCTTATGAATAGATATTCAAAATATGTT
ATGTTTGCAAAGGCGTTGTCATCTATACACAAACTTGCACCGTTTTGAAG
AAACTGGTCGCCTAGGTTCAGTTTATCCAACATCGGTAAACCAGCGAATG
TCTTGTTAGTTATATGTCTAAGTTGATTTGTGCCTAAATTCAAATCATTG
AGTTTTGGGTATTTCGAAAAAGCGCCATCTTCAATGTAGTTTATCCAGTT
GCTGCTAAGATCTAAAATCTCAAGGTTCGGTAAATCAGGTAAATCGTCTT
TTGTAATTGTTCGAATGATATTGCCAGCCAGATTCAATTGTGTAATATTT
TCATTGAAGTCTTTAGGGATGAATTCGATCCGCCGAATATCGCATAACGC
CATTTTACCAAAACAACCATAACAAACGACAGGGCATTGTGATTTTGATT
TGTTCATCAACAGGAGCACGAATGAAAGTTGGACCAACAAAATACTTGAA
TTGGACATGTCTCCTTGGTTGATTTAGAAGGTCCTGGaattgaataaaat
ttaaatcttaaaaCGGTAGTCCAATTCGCACTAGAGGGGCTAATGATAGA
GAGAGTCTCTTTATCTATATTCCTGAAATATTACCTTTTTCTTCGTTGAT
TTAGAATCTCCTCATATCCATCCCTAGCCGGTGACCTCAAATGGCTTTAA
CTATTTCATTTAGATTTATTCACAGTTTTTGAAGCAAAGGGAGTTCAATT
AgctcggtcagtaaaaagttggATTACTGCAATAacgtttctagaggggt
caagaccccctccttaggtaagaggaccccccccccttaagtgctaaccc
cccTTCAGTGGTGATAGAATTTATCAAAATACATGATTTCAACCCATCAC
AAATCTTACCTGTTAGATTATTGTTAAAATTCTACTTCTTTGAAACCTTC
GTCTTCCTTCTCCTTTTCTTTCTCTGAGTTTTTCCTTTCAAGTGGTTTCT
CATCAGCTATGGTTAAATCCACAATTATGTGatccaaaatccaaaaactC
AAACAAAAAAGAATCATGACTCGAAAACCCGACTTCCAGTGCAGATTGAT
CAAATTACGCTCAGAATTATTTTCTCCCCTCGAATAACTGAAATGAAGAC
ATTGTAACGTCAAACCGACACTGGaataaattgacgtcaaaaagattTCA
TTTTTCAGCAGGTGACCACACCCCTTTTTGAGATGGCCTTTCAATCAGAG
TTCAGCATATTATTTGTATCGTTCATAATGCACTCAGAATATCTGTCTTC
TTGTAAAGAATTTAACTTCTTTCTTGATCAGTTAATGCTCAGACCTAAAC
AGAACCCTTGCTACCCAAACTACCAATGGTAGTTTGTGTCTGAGTTGACA
AAAGCTAGTATGGACATTCATTTGGTCTTATCACCTTTTTGTGGGTTCTG
GACTTATGATTACACCTTTAAGCTTAAggggtttttaaaaatttggggAT
TTGTTGTTTgctgtagaaaagtgctaccaaggggtatttcgggtcccata
tcttctgaaggcctttttgtttgccttgaaactTGACAGCCTTCTttacc
taaggttgaactaccactggtggaAAAATGAACGTTGTAGATAGCATTAG
tagaaaaaagctcaatttttttaatcgcaaatttaaccgctaaaaatagC
GAATGTTTCAAccaaaaattcattcaaatatGACGCTTTTGGTTCTCTTa
aacaagaaaaacatttccataattgtatttgactatcagaagttacagac
attcttgtttccattggcaattaaagtctatttcaaattagctggcagtg
ttctttcaaacctcaataacttttgatagagtttGAATTAGTTANNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNtttggtgtgtttcgcggaatttaatttcgcgaattacgccctaattc
gcgaaattaaattccgcgaaaatttcttccgcgaaaatttcttctcgcga
aaatttcttcccttaaggtaactaTGGCACAATTATTagagaagttgatt
ttcttcttcttcatttccaGTCTTCATTTCTGATCTTTTTTGAGATCCCA
CTCCattttgtcttttcaacgagcacaaaattgctacttaattcaaattc
tatcaaaagttatttaggtttgaaaaaacactgccagctactttgaaata
gactttataTCTGGATACACTTTAAACATACACACACAGGAAATTTTCTA
CTTGTAATCGTGTTCTGACacatgaatgtttttttttgggacaccaTGTA
GTGTATAAGGTTTAAATTAGGGAGGGTAAGAGCATTGCAAAGTAACGAAG
AGACGGAAATATTACGAAATATTATGTGGACATTATTAGGAATTTTCTTT
ACATTAAACTactgtttaaaataaaatagatATAAAGTTGTCAAGCAACG
CAGTAAGATCAATATACTATTCTAAACTATTTTACCAAATATATGAATAA
TTTACACAAATATGGTGCCCCTTTTCAATGGCAATATTGTTATGTCATTT
AAAAAACACTCAGCAGGTCATTCAAGTAAACCAACTTCCCTGATATTAAT
TTTCAAGTCACTATTATTTGGAAGTTTGCTGgaaaaccaaagaaaagttG
ATCGTTTCTGCagttttttcttcttaattttaaTTTCGTTTTATCTTAAT
TTCTTCTCTTTCAGTGTAATATCGCGTGGATATCACTTATTTAGCATTGA
CGATTTTAAACGAAATCGCCGAGGATGAGCGCAAATCAGAAGAAAGTCTT
GTTTTCGGCCATATTGTTGTTCATGTACGTAAACATCACTAACAGTGTCG
GTGAAAACACCCATTGGAACACCACAAAGCCTCAAGCAGCTCCCTTGGTC
GAATTCTTTTACTGGAACGTAGACCCTTTCTTTCATGTCACGCGAAACTT
CAGCAAAACTCACGGAATCTTACATGAAAGCTTCAAGAAAGCTGCCATCT
ATTGTAATAAAGCCATCACAGGATTCGAATTGGACCTAAATTGCGACCCT
CATTCTATGACGGGGTCGACTCCTAAGCGCCATTTCGTCCGGTACCAGAA
GACAGCAATCGGACATCAGCCTTTTCATGCAATTCTTTTCGATTCCAATC
GCACCAACCTGTTACATTATCAACGACCTAAATATCATCCGGAATGCTCG
AAACCCGTACTGCAAATGTGGGCTACCATATATACGGACAAGTCAAAAGA
ATGGTTTAGTAACCATCTGAAAGATCTAACTATGTATCAACTTATGGTGT
CGAAGAAAGTGGCCGTTATCATGCCAAGAGACAAGATCGACATCACATAT
AAAGTGTTGAAAGGAATCAAAAGTTGTACGGAACCTTTACTCCTCTCCAT
TATATTCTCTCTCATCTTcggaatttttttatggttttgCGAACATCGTT
ATAACGAAGATATTGACCGAGATTTCTTCAAAGGTGCTCCCGACTCAATG
TGGTGCAGTTTTGTTTCCATGACAACAGTTGGCTATGGTGACATCTATCC
TTGTACCATCATTGGGCGTGTTTCGATGATAATTTGGGTCACTGTGGGTC
TTGTTATGATTGCTGTAATGTGCGGGACTGTTTTTGATACCCTTGGTAAT
GCGCCGGAGATATACGGGAAACGAATCGCTGTTATCCCTAACACGGCGGT
GGAAAAGTTTGCAAAGTCAAACTTAAACGGTGTTATTGTACCTGGTCCAA
CTTACCGTGATTTGTATTCGAAAGTTCAAGAAGGAATTGCTGACGCAGCT
CTTGTCAGCAGTGACGTTTACGTTGCGTATCAACGTGAATTCCGTAGCCA
CGACAAACATGACGTTAAATTACACGTCGTTCAAGAATTTGAGGTTGACC
AGCCCGTATTTGTAGCAACGGATTTACGTAACAAAACGGAGAGTATGGAC
AAATTGTACAAATGTCTTGTGAAAGAgaacgaaaatttaattttccacAT
TCCATCGGTTCAACAACCACTACAAGTCCGTATCGATTCAATCGATTTCT
CGAACTTTGATCGAGTTTATTTGTACCTTTTCATTGCGATTTTGGTTTGT
TTTCTCTTATGTGCTTCTCTACATatcaaaaatgtgaaaatgaaCGTGAA
GAATTCTATCAATAACAACAAACCGATTCCTCTGAAAGAAGTGTTGGAAA
GAAATTggaaattagataaaaattaatTCATGGAATTTACTGCAGAACTT
TCTTTGCATATAATTTAATgaataagaaaatgaagacttttgcgaagagg
AGTACTTCAATTTTCAGCGAAGAAATTTGAACGATAATTACTCTTGACAG
AATAAATTACCAAACAACTTGGAAAAGGCAGCCTTTTGTTAGAAGTGTCA
AGGAACCCAAaataaaaatcaccaaaaaatgttctaatcatggtcagagc
ccttaaatttcatttccaaataagCAAGTCTACTAACTCCGATTTCAAAC
TAGCAATCGGCTTTTTCGAGTGCGATTTTGTTGGTTAAGTACGTTTTGTT
TTATGCgggtaaattaattttttttgtcatatttataaCTTTGTAGAGTA
TAATTATATTTAAAGCAATATCTGAAACCAATacatggaaaagaaaaatg
gagatttgaattttctgatactttcaAGGCACCAGCCCAAATTTTCACTT
TCGTGATTTGTGAAATTCCCGCTAATTTTTCCCAGTACATTAAACTCTAT
CGAAAGTTAACATTTTGTTCCtcttttttttcagtacatTCAAATAAAGA
CAATATAATAAAAGAATCGGacaagatgacgtcattgttcTTCGGCACCG
TCATACTTGTCATCACCGTGTTACAGATGCACGAAATCAAAGCTGGAGGA
AATAATCACTCACAAGGTGAATCGAAAGATAATGGAcatcataaaaaagt
cattACGCATCTAATGACCATGTATTATTGGGATGCACCACCCTTGATTC
ATGGCGGAAATGCGAGCGATCCGGACAAAATTCACGGAATCATCCCGGAC
ATTATGGAGGAGATTGAAGGACGTTGTATTGTGTCTTCGGAGTATGATCA
TGTCCGGCTTTTGACCTACATCAAGGTCTCATCCGAGGAAGCACTTTTTA
ACAAAATGATGAATCGTGGAAAGAATGAATCGTTCGAGGATACCATTTGG
GGTCCCGTGTTGACACGCAAGATGGCGGACGATCGTGTCGTGTCTTTCTT
AGCGGAGAACGAAATTGTTCCACAAATGTTGTTGAATACTGATGGTGTAG
CGGTTGTGGTTCGAGAGCATGAGCTTTTGCTGTTGAATAAAATAGGAAGG
TCGCTCTATGAGATGAGATTTATGTATCTATTGTTTCTTCTCACGTGTGT
TTTAGCTGGCCTCGTATTTTGGCTTATTGACACATCCTGGCAACCACAGA
TTGGGTTCTTTGAAGGTATAGCTTTGAGCATTTGGTGGGCATTCATAACC
ATGACAACTGTAGGTTATGGTGACGTCACACCACAAACAAAGCTTGGACG
GTTATTTGCTACAGGGTGGATGTATTACGCTCTGATTGTTTACGCTACCA
TAACAGGACTGGtatctactttcgttttcgatgattttttgtTCGACATC
TCGAACAAGAATATTGCTGTTCTTGCAAATTCTTACGAAGCTTGGTTCGG
AGAGAAAACTTTTGATACGAACAACATCCCTTACGGGACATACGGGGAGA
TTTTATACGCCGTTAAAagtgatcaaaatatttttgcaggTCTCATTCTA
TCTGAAATGGCTGCTTGGAGACAAAAAGAGCTTCACAAATTAGGACTTCG
TATCGTAGCAACGTACCCCACAACCGTTACTGCTTTCCTCATGGAAAAAG
AGGAAACTTTGAACAAGCACCATCCGGCTGTAAATGGTAGCAACCACCAT
AATGACGCCATGCGAGTCAAATGCAAAGAACACGCTTATGAATACATATA
CAAATTAAGCGTCAAAGGGAATTATAAAAGAACTTTACAGAAGACTGTTC
TCATGATTCACGATTGGAAAGGCCTTTTCACTGCGGGCTTCAATCATTAC
TATATCAGTGTATGTGTGTTGTTAGCCACAATCCTCTTTGCTGTTCTCTA
TAATTTCATGTGCTCGCTAGAGAGAAagaaaaccaaaccaaacaaaagcG
ATGAGAATGGCAACGTCCAGGAGATGATTATATgatgaaagtcaattttc
tttttgatttatgGAGTAGATAcgagaaaactttttcgagttgaGTGCAC
ACTTGAGTGAATGAATATTTAATACTCGTTCACTGAGATAAGCAAGATGG
TGTACTCCAACGATCTCGAACTAATGAACTAATGAATGACTAATGTGAAC
AATAGGTAATAATAACAATAGAACAAATAGATAAAAGCCTGAAGTTGTAA
GCCATAAACTGGGATCCAAAGTGAACTAttctcaaaaatctaaaataaaa
tagcatttattctaaaattttattatttaattttaatttgataaatttta
taaccTATGTacaattaattaattttaatttgatCATGAATTTAAAGGTG
CAAggatattttgtattttctaagatatttaataatatttaaaatcacTT
TAGGAAAATTCTCCTAGAatttgttaaatgttaaatcatAGAACTTATTA
CAGTGAAGCCTCTTTAACTCgagcctccataactcgaataagTACGGAAG
GGACCGTAGAAATGGTTTATAAATCTTATAccgtaactcgaaatttcctt
aactcgaagaaATTTATGTTCCCC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1491911889:22301..22515 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1491911889:22301..22515 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1510915933:22301..22515 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1510915933:22301..22515 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1575043694:22301..22515 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1575043694:22301..22515 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1491911889:30765..34874 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1491911889:30765..34874 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1510915933:30765..34874 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1510915933:30765..34874 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1575043694:30765..34874 | TCONS_00058073-exon-scaffold_305-1575043694:30765..34874 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_305 | supercontig | scaffold_305:22301..34874 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
