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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00056093 ID=TCONS_00056093|Name=TCONS_00056093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9750bp GGTTCATACCATGGTTCATAAaatgaatattgaaaattgagatATCTCGC ACATGCGCATTAAGATTTCTTATTAGTAGAAATAAAACTAAACTTTGTGA GCTAATCAGTTGTGATaaacttcttttgtttttgttctatATCTATCAAT CAAAGTAATTATTACTTCACATTTTATATGAGATTGTTTACAAATCAGGG GGGTCATTATTGGCCAGGTATTTGAAAACCTATAGACCAATAGGAAGGCC TAAaactaaaagcctggagctgtctattgtgtagactagattGTTGTTGA AGTGgacttttttcaataatttgatttgcttgatattttaaatttaaaat gtttGATGACTGGACCCAATTTTTACATTATCAATTAAGCATTATCATTA TCACAAAACTGGTTGAATGAAACCAAGAAAACACTAAGACAGTTGAATTT TGTGGGATTTTTATCTTAatacttttttgtattttaggCAATGGAATCTC CATTTGAAAATCTTGTTGCTTGGTTCCatgaaaatctttctaaaaaacCT GATAATTTATTATCTCTTGATGAATTGGTGGAATCTTACTCAAAATATGC CTATTTAGATCATTTGGATAAATCCTCTTTTTTAATTGCTTTAAAAGATA TGTTCAAATCTCTCAGCATTAACCCTGAGTTTGTGAGGAAAAAGAAGAGA GGTCTACGATTTACTGCCTTAGAAGGgtttgaatttgagaaagaaatGAG TTTACCTAGTGAAAAAGgcacaaaaaaatcatcaacaaTTTATAGCGGTa gtgttgaaaattttaatgaggCAAACCAGCAATCACATCACATTTCTGTT 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TCTTCTAGGTCATTAGCGCACCTTtgttacaaaattttttttggatggaT GGAGGATTGTTCAATTTATCAACCTGACATATAGTGAAAAAACATAAGAA TGGCCGAAAACCTAGAAAATCAAATGGGTCAAATGCTTGAGCAGATGCGC TCAATGGATGAAGAAATTCAGTCGCTGAAAAtacaaAATGCCAAAAGTTC TGATCAATCTGAGGAAGTGGAGGCCAAAGATACGACTGGAGAGAAGTCAG CAGaggagaaatcaaaaaaaaaacagaacggtaaattttttaattagaac tttttatatttttagtcAAACAGTACacttttatatatttctagaaAGCT protein sequence of TCONS_00056093-protein >TCONS_00056093-protein ID=TCONS_00056093-protein|Name=TCONS_00056093-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1938bp
MESPFENLVAWFHENLSKKPDNLLSLDELVESYSKYAYLDHLDKSSFLIA LKDMFKSLSINPEFVRKKKRGLRFTALEGFEFEKEMSLPSEKGTKKSSTI YSGSVENFNEANQQSHHISVITHSKSLELFSDSMGVDMPVDQSITLNSSV LCSDEQNNSNIEVHENDNNSSNDFEDGFEDLIQNQNRTSSPTTKQDEKSL EVLTKNESKSKKTLLEFFEKKQTETSYNDKKAAVTYLPKNFKFREESKES PYYNNLIFSRHFQNYKSATIVNLPSPHDSFEKILEKSFEVTHDQSNEIKG LVNRARKTTNLFEQKLKAFLCSSFTPISVGNVAASVFNYLTEGDLIPQFT VLGSKTSCFKCEVCEIYNEHLKMSGKQSSAKGLGKLSGFRQVYEHAITNH HKTVLYWIGKEIKTVVPQKKTDLIMTEFYKDTSGKKTSLQPCYHIWDKEL VDRYKDKNSIHTKSTQTLFNEKKIWKNCATIQGHEKCFDYSNWKLKHLQE FRDLCEESAKSSKVVFVPGKTQTPIKTDGSLKSLDPPCLLVSEPFGKHPY TCNNCESHKGYLIALLNTGVRKAALLLSEPRIGRQGFRKDYATKTETKEH LNKLETENKELKKTIKKMKRTNFEKKSWENILFESCDDNDITKLAVDMVS LFQQHDAKNSIQFEVCRNLIGKLKSKNNHRYVDIVKDIGSNLINHLGQHE YSLFQNIFGLPGKTCAKDHVKTSNLKIGLNDFFETAEMIYEGGPVIDSTD EARILRYISPVLNEEGKIELVGESFDPDCDLWGNCNVLLENIISDPSFPD EFSALKSHVDSVIDTNKLSKDAAVHNFSALSGVYSKPLVYLVWPTPNKGY QGKHLLKIWDVVRSKCFFDETTGNLKNNPVKLVGHATDSAGFQLAAAVSL MSPNPELLKLKVKYLTLGIGATKFAAPYLGPLPSISYLDYDHCLRLFLKC LKYQTLDLDLFPSSSSSYRASIDHLKELKEFCDESGYKLGFSNNDLLFSV YFDQNVDAALKIFKESVADQLEINIVGSKGTVLYIRAVIALFKPFLEPSS NPLDMQCSISKGITVLRIWKKIIQLKDKRVHAVRSAATDPSKRGKFVTYG CNQTAEILFAAATYHMLAMFSHFKDLTPSVLSPFKSGTKTTERLISDLQG KTNALQSLDAQPVLSDLVNKLSKVQSNHTTEDRLKGAGATKQNTTSRRRL QDKLAQVTMSPYKYPATYDEFCKSLIAAYEKGKSEGIELYRKFCPEGIAF IESNAKSKDFAFLCFDEKVPEENQFKGFVDEEYSLKMLRDIKPAEYLSKK TNEKEKKISDFFVAEKDEEATALLDDLEEKAEKETDFKTFDLELTSNNKS ESDKWYLTKLEGGKMTKIHVRTALKIFTPREYVSRERSRRHIASNFLPGK AAIDPKHDVIAFRFVIANVAGQIVVSKVASIKKNGFSVPSAASDDDSVRC RLIPLKETEEGSFIFDFPEALVITSELKASHILEEIAMKPVNENESKKSF QILPHFKKRLTDRRNELNESNDFAVAKQVSKSLVPLEFQEVENITERKLD PKSHEYLYHVKFKNSEETAWLNYSCFDRPVRYSNRSGITTPLFADVTKMN DQEGGQGKKRQISLETSISCKPSKIKKTEESVSIETTPKTETAPKNGKRK KEKGKRATTVQKGKPLSKIIDLTVPEKKKKVTNTSRTRAAKRLAMFEMPK AKLTETNWLNDEIMLEAITLLRKNFPQLKGLQDTLFCTKISDNVKNNLKA VSVDYDTIQIHHVRANHWVLSMGRDGKVFVYDSIYLQADANLQRQLCQIY QYYVCDGYLEVTFPKVLKQNGSNDCGLFCLAYAVDIANGVLPDNECYLQN EFRNHLKMCLDVNDMERFPRNNIDHLDNMNFKAGSSVTIPIFCDCMTPGT DEMVKCYFCNEKYHTRCLAKIENIDIEEEMFECHNCKM Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_267:405665..416473- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00056093 ID=TCONS_00056093|Name=TCONS_00056093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10809bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_267:405665..416473- (Clytia hemisphaerica) GGTTCATACCATGGTTCATAAAATGAATATTGAAAATTGAGATATCTCGC
ACATGCGCATTAAGATTTCTTATTAGTAGAAATAAAACTAAACTTTGTGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
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Term | Definition |
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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