TCONS_00054827 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00054827
Unique Name	TCONS_00054827
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4604

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_245:578896..602450-

transcript sequence

>TCONS_00054827 ID=TCONS_00054827|Name=TCONS_00054827|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4604bp
attttttagggAGAATAGAACTGATAGAACAGAATTGAAAACCATAAAAA
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atcaccCACAGGAAGGGAAGAATTCTCAAGAGAAGACATCAAATGTATCA
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TCGATGGAATTGTACGACAGATGAGGACCATGGGTTCAAACTTTTTGGCA
CTGGAATGGCGAGAGCATCTCGTGAATCTGCCATTATGATTGCAATGACA
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GTTAAATTCACCGAACTATTGTAATTATGATACCAGTACTGGGAGTCTGG
GTACGAAAGGACGTTTTTGTAACCGTTGCGGGAACGGCGTTGGCAGTTGT
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GTGAAGAGAAACTGGTTATGTATAGATGCAAATGATAGATGACCCTTAGT
GTTAATGTAGTCGGAATCCAGCGCCAGTCGATGTCCAGTTGGTCGTCTGA
TTTTAGACCCTTATTGGTCTTTATTTTAGCCGACAGTATCTGCACTGGTC
CTAAACAAATTTCTGTTGAACAGTTAAAAAATCATAATGTTAAAAGAACA
AAGAAGACATCTAACAAGTACTTAGACTGTCAACAAGTGACAAGTGTTAC
CGTTCTAACGGACTATGCTAAAAAATCTACTCAACCTTTTTAAGTCCTAT
TCCTGAGCACTAGTGAGTTTATTTGGCTTAATTATAATTTTGAGACCAGA
TTTATAAAAGTTAAGCAAACTTTTTGAAAGTGGTCGTATCACGGTATTCT
TAAC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_245:578896..602450-

Legend: exon

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>TCONS_00054827 ID=TCONS_00054827|Name=TCONS_00054827|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23555bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_245:578896..602450- (Clytia hemisphaerica)
ATTTTTTAGGGAGAATAGAACTGATAGAACAGAATTGAAAACCATAAAAA
ATGGGTATTGATGCTTTGGAAAGATTTACAAAATTATCTGAAAAATTGAA
ATCACCCACAGGAAGGTAACCATAAAATCAAACTCTAGATGTCTAAAATG
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AATGTAGAGTAGGAAAAATTACACGGACTAGCAATCTTTTACTAGCAAAA
AGTATAAGCATATCTAAAAACACCTCAAAATTACCTATGTTTTTATAACT
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AATCCAATTTTTTCAGTCTTTAAATTAGATCCTTTATAATGTAAATTACT
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AAGTTCAATAAATTGCTGGTATTTCATATTAAAGGTTTTGTTTTTAAATA
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TATTGAATCGACACAGATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGAGGAAAAGA
AAGCATTTTTTTGCCTATATCAGCATAATATAACAATAGGCAGACACTGT
CCTAATATGAAATATATTTCTGATATGAAACGGGAACACTTATGTAAAAA
TAAAACCTTTAATGTATAATGCTTGTACATAGATAGACAGCCTCTGCCAA
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CTGAAACTTGCATATGAGCTCTTACGCTGTTTGAGAAATTCTTGTGTTCA
TTCCTGTAAAAATCAAAACCTTATTGTGTTAGTGGCTTGTCTTTTTACTT
TTCTGTTTCCTTTTTACTCTTAAGTCCTTACAAAGATGAGACGAAAGCAA
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ATGTTTTGTTTTATAGAAATGCGGATGTTCTCTCAACATTTGGCAGTTTT
GTGGAAATACTGATGTCTCCTGAAACTTCAAGAGCTGTCAAAAACAAAGG
TTCATATTAAAATACGCAATCCCAGAAAACGTTGTGCAGGGTTATTTGAG
TGATATGGTCCATTAAGATCATTTTTAAGAAGTTTAGTAGTGAGGTCTGT
TAGGACATAAAAACGTAAGAGTACTTCAGAACTTAATTTTAAACAGTAAC
AGTAAATCTTGTCACCTGGCCACCTGTCAGATGGCATTATCATGTGGTTG
TGCAAAAAAATATTTTTTTGCAAATATTCAAAATCCGGTGGTCCTGGCAG
AAAGAACACATGACATTCTGATGAAAGTGCCTTCAAAATATTGCTATCAA
AGGTTATGAAGGTTAAAGGTTTTTGATGACGTCATTATAAGCCTTTCCAG
ACAAACATTGGAAAGCAAGTCGACCAAATTTGATGTTTTTTGGACCTACC
TCCGGGTACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTGTGTCCGTTCGTCC
GTCTGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCATTAGTTTTTCCTGATTTT
TGGCACAAAGATGCAAAATGGCAATGCCCAAAATGTGACAGAGCCCGATT
TTCGAAAAAAAAATATATTTGGGCAAATTAAAATAGGGTTTTTTGGACTT
TATGCAAAATTCTGTCATTACTTTTTTGTGATTTTTTGTACAAAGATGGA
GGGCAAGATTCTCTAAAGAATGGCTGAGGTGAAGTGGTTTTTCCCGGAAA
ATTCGGAATTTCGTATTTTGAGGAAATTCCAGATTTTTAAGGAAATTTTT
TTTGGGCAAATTTGAGCCAAAAACTGCTTAAAAATAGGCTTTTTTGGGCC
TGAATGGTTTAAGTGATTTTCGTATTTGGGGAAATTCCTTTTTACCATTT
TACATTATTCAACACACAAGCTTTATTTTTCCATTCTGAATTTGTACAAT
TATTGTCACTTTTTTCTTATTTTCATCTGATGTTAATCATTAGGTAGGTC
CATTCAGCATGTTGCTTGTTATAATTGAATTGAAAGCTTCAAATCCTACT
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AAAGAAACACAGAATACAACAGATTGAGTTTCTTTAGACATTTAAAAGCC
TTCTCATGTTGTTAAGTTCCCACCATCAAAAGGAACGTCAAATGCTGACT
TTTTTCGGTGAACCCCTTGATTTTCATTGTCATTCTTTAAACTTGAGAGT
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TATTTTTAAACTATGATTCTAAACTGCTATCTATTCCTCAGATTTGTACC
AGAAACTGACATCAGTATCAATCCAATTCATTGGAAATCTTGTGGTTCAA
AATAAACGTAGTCAAGATGCTGTATGGAAAACTGCTTTCCCAAAGCTCTT
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GGTTGAGTATCAATTACATAACACCTCATTTACTTTCTTATTATTTGCAG
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TTGTCTATAATTGTGTTCGTAGCAGGTGACTTTTCAATTTGATTCTCGAT
TTCTTCTTATTCTTGTTGTTATTCTTACTTTTTCAATGTTCCATTGTGTA
AAATTTGGTTCTTAAGTCTCGGTTATAACTCCTTCGAAGCGAATGAAGGA
GAATCTGTATTATTGTGATTTACACAGAGAGAGCATGAAACTCTTGTCAT
AGAAATATATGATTTATGATTTTAGTGGAAGCTCTATCTTTTTGTGTTAA
TTTGTTCACCAAACAAATAATGATATAATTTACACTGACACTGACAAAGA
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AAATGAGTTCAATAGTTTTCAATGAAATGTTTTTTCTCAAAGAACGGAGA
TTTACAATACAAGTGATGAATATTGGTTTATGATTTCAATACTTGAATAT
TGCACTGAATATGAAGATGCAGAATGGGGGTAAGGGACTAAGAACTAAAT
TGACAATTTACTGATGCAAGTCAGTTTTTATATTTGTATACCTTAATATT
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TTAAATGAAAATATCATATCAATAGTTTGAAGGTTTTTTTAATTACTGTA
GCAGCATTTAGGTTTTATATTTGCTACAGCATAATTCTCAATGAAATCAA
ATTTTCTTCTTTTGTCAGGTTGTTGATTATGGAATGGATCATTTCTTCGC
CATCTTTTATGAAGTTTTATAAAGAATTACAAGATTATCCAGCTTTGAGG
TTCGATTATTTGAAATGTGGACTTTCAATATTTATTTACCATGTCTTTTA
AACTCGGAACTTTACTACCTATATAAACTTTTAATAATTTTAAGTTTTCG
TTGAGATTAAGTTACAAATCTCCAGGAGTTTGGTTAAAAATCAGGGAGGG
AGGTAGGAGATTCCAACTCTAAATGATAATGGAGTTAATTTTCATTGTTG
ATCTATCTGTGTTGATTTCATTTGCTGTTATGGTTATGGATCTTAAGTCC
GCTATTTTCCCTGTTTTTAAAGTAATTTAAAATGTTTGATTTCTTATTTT
TTCAAGGTGTTCACTGTTGGAATTTGCTTCTGTTCAACTGTCAAGTTTGT
ATCACATTTATTTTTATTTTACATTGTGAAATTTGCTAAACCCTTTTTCC
CATCATCGTCGTGTTATTGCTTAGTAAATAATACAAAACTGTGTAAAAAG
GTCTTGGAGGGGTAGTAAGACATTCTAAGAGTCTTTAACATAGTATTTTT
TCGATTTCATTTTTCAGTTGTGACTTCAATGATGCTTTTCTTCCTTTTGC
TCTTCTAATTGCTTCACAATTATCTGTTCTTTTGAGGTCAACCGTTTTTT
GGTTATCTTTTTAGCTGACAATTCAACATTTTCGGGTATCGAAGAGGAAT
TTATGTTGTATCTTTGTGATGAATTCTCAACCAAATCAACATGTATCTTG
AGATTGGCGTCCGCTCTTTCACCTGAGCTGGAAGAGGTTCACATCTTGGT
TTCCATAATGGTCGAATTACATTTTGGAGATCCTTTTTATACACGTGTAT
TTTATAAGAACGAGTAAAGGCTCTTTATCCTCGTTGTTCTTACATGGTTT
CATCATTCTTCTTTCATCCTCTAATTTGCTTAAAATTCAGATATTCTTGG
CTCAAATTTGTTCTTAAATTTCGAGCCTCTTATAAAATTGTCTAAGAAAA
CAATGTAATTAAAAGGGATAATCAGAAGTTTTGAAATATTCGGCATGTAG
ATTCCTTGAATAGTTCTAAGCAAAATTCCCAAATATTTTTGGTCAAATGT
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ACAATACAACTTGAGATTTCAAATTGTGATATCTCAACTTTGGAAAAAAG
TGAGATATTATATTATTTTTAGAGGTTTTACCCAGGACCATTGGAAATTT
CTGTAGATCAAATATCTCGAAACGATCTGATTATCCCTTTAGCACTCTGT
CCGTTTAGTTTCTTCTCTTATACATTACCTTTTTTGTTAATTTCAACAAT
CTTTAGGAAGCTGGCTTACTACTAAAAGTGTTACGTTTACTGTCAATAAC
AACATCGTGTTTTGATAAATATCAAAAAGTACGACATCATCAAAATTTGC
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TTAAGCCCGATAAATTTGTCACATACTTGAACTTTCCTCCTGTTAAGGCC
CATGCTGGGCTAGAAAATGATTCATTTAGAAACAGGAAAAATAATGACCA
AAGGAGAATTTCAAAAAATTTTGTTTCAACCCTAAATACATATTGGATTC
GCACCATCATAAGAGTCTCACTTTTTTTAGGTCGGATCTATTTTCAAAAG
ACGAATAGAAAATAGTGGATTAAGATTTCTCCATGACATATTCAGTTATC
GAAATTCCTAGGATGCTAACATCGTCAACGAATTGATTTGGTTCAATTGA
CCTTTAAAGCCCTTGAAAAAAATCATATAATAATGAAATAAGCCAAAATT
GTTTACTTGAAAGAAATTGAAAAGTTACATTATGTCGGAAAATGATAATT
TTGTCTGTTTCCATGGCTGTAGGAGTTTTTATATGTATATGTATTCGCAT
ACGGCTAGTTTCTTGTATTTTTCAAGGAAAATCGACCAACACAGTTTTTT
ATATTTTCGAACGAAAGAAATACATAACATGACTTGTCAATTAATTGTTT
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AGAGCTTCCATTAAAGAATATATTTCCTTGACAAGTTAAAAATTGTACAT
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TTTAAAGTTTTTTAATAGATATTTATTAACGTGTCTGCAGGTTGAAATCA
GTTCAGTTCTCTTGTTGATTAGTTTTTGTTTTGACGTAATGATATGGTAT
TTTTCCGTTAAACATAAATTGCAAATTTTACCACCATTGTTGTATGAGCG
TGCTCGGTCAATTATCTTCCAGTGGAGCGTAAAGGGGGTGTTTTGATTTT
GGAGACTCCACACGTATTTTGACAGTTCTGTTGAGCTTGCCTTGTCTTCG
TGACGAAACGTGAAGTTATGTTGATACCAACGTGTTTTAAAAGAATTTCC
CGTTAGCCCAATGTAGTTGACTCCTTCTTCATTCTCTTGAGATTTTACGG
TACACTGGTATATTACTTGTTTTTCTAAGCATTTATCGTTAAGTGGGCAA
GAGTTCTTTTTGCGACAACATGACTTAAATATCTTTCAAGAAAATTATTT
GAAGCAATTTCTGCTACTTTCACCAAACTAATTTTTCAAGAAAAGTAAAA
AATGGTAGGGTTATTTTGAAAGCTAATCGAAATGAAACTGCCATTTTTTC
AATCTAGTGGCAAGGAAAGAAGATCTTGCATTGCTAAAATTTACCACGAT
CAAAATATCTTGTAAAACTACTCTAATGCTAGAAGTAGTTTAAGTCATCT
TGGCTAGCCATCGTGGGCAGACATTCGAGGGTAACTTGAAAATTTTAAAA
TTAGATATTACAAAATGAAAAAAAAAGAAAAAGAGAATGAGTGCCCAAAT
TTCAAAGCGCTCATGAAAATGTTCAAAAATGAAGATTAGAAAAAGGAAAA
AAAAACATGTTTTCACGGCTTTTCAATTTAAGGCTGAAAATTGACTAATT
GAAAGATCGAAAACGAATCGCCATCCTTAAAAATTGCTAGCGAAAAAACG
TCATGCGAGAATTGGGGAGTTCCGATTTCAGCGTATTATGATAAAGAAGA
CCATCTATAATACCCGTTACTTCCAGCATTTTATGGCTTCAAGTTAACTG
AAGTCTTTTTACTCTAGTGTATATTACTAAACTGATTGCAAAAATCGACA
AGGAACCTCCTATCACCTTAAAAACGCTTTCTCGACTTTTTAATAACATG
TTTTCTAATCTTTCAATTTCTAGAGTATTCTATATTTCAAAACATTCTGT
GAATAATGACATCATGGGCACGAGTCATCAAAGACCATATAATCTGTGTT
TGTTTTAATCCTGTTTGAAGGGATCAGATAGTTGTCGCGCTTTTTAAACT
TAATTATGATTCTTGTTAAGATTTCCCCCTTATGAACCCTTAGATTAAAA
TTTAACTGGATTTCTATGGAAGCTTCTAAAATGACCGCAATTTGAGTCTC
GATCAGAGATCAGTTTCAATTAAAATTCTATCCAAATTTTGATTGATAGG
CTTAAAGTCTTATTATATTACTAATATGTAAATGTAAATTTTCAAAAGTA
TCTTAGGCCTTTTAGGTACCATATCATATTTATTATCCTTGTCAAAAGCT
TACCATAAAGTCCGATATGCATACTTTTAATAAAACAGAAAAACTTTTTC
TTTCATCCAGGCAATGACTCGTTTAAGTATCACACTCTTTTCGAACAACG
ATTAAATTTACGTTCAGATGTTTTGGGAATATAAATAATAAAGTTTTTCT
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TTACATTATATTACTGTTCACACTGTCTCCCAAGCGGTTTTCGTGATGGC
GTGATAGGGACTTTTCCTACGTGATTACGTGATTTGGAAATATTTTCTTC
GTGATTGCGTGATCAGAGGTCAAAGCGTGATCGTGATTTGAAAGATTTTT
GAGCCCTGATGCGTGATTTGGACTTTTTCAAAGGGATGCGTGATTATCCA
ATTTTTTACTGATTTTTGTGATCGTGATTGAAGACAAAAAATTGCGTGAT
GTCTTGATCAAACTTACCGCCCAGTCATACTGTAACAATGCCCACTTTGA
GACCTTATCAGTACCTCAATTTTCGTTTCAATTGAATACTCATAATTACG
GGTGTAATGTATTTCTTGATAACGGTAATTAACAAGTTGATTCATGATCC
ATTAAACTTCAATGTTAATTGTTCATTTGAGTTTTTATCGGATTACAATT
AATTGTTACCAAATTTTATTATGATAAGGTTGTAGTATCTCTTTTTCGCA
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GAAGGGACGTTATTTTTTGCTACAATCACCTTCATGATATATGGCAAAAA
TGAGGAATTCCCTCATAACTTTAAAACCGTATGTGGTTTTTAAGTGCTTT
AAAAGTACGGTTGGAAAGTATAGTTTTAACACTGAGTTTCAACATTAGAC
TTGAGACTTAGGATCTGAGGATCTAAATTCTCAAAAATGTTCCAACATGA
ATGAGAATACAGCCTGGTAGCCACTTAATCCCTCCTAACTCGAAAAATCC
AATGAAACAAAGTGGAAATACTGAAATTGCAATCCTCGCCCGAGCTTTAA
ATTTTGAAAAACGTTAAAATACATACCCAAAATTGCTAATATATTTCGGT
ACTGATTGTAACTACCAACTCTAATTTTGGAAAACTTTTGAAATTCTACA
TTTATCTTGGACTTATTTTTTTATATTCCCATATTTCCCTTATTCTCTGA
AACTTCTTTTTCAGCCGTGCTCAAACAGAAACAAATTGCAAATGAGGGGA
AGAAGAATGAGAAGTCAAAAGAGCAATTACCTAAAGAACACCCTATTGTG
GCATTCGAAAAGGATTTAGTGCGAGTCATTTCAAACATGGCATACAGAAA
CCTAAACATTCAGAATCAGGTAATTAAACATACCCCTTTTCGTTTTAAAC
CCTTTCATCTTAAGATTACGTCATATTATTGCACACCATTTTAATTAGTA
GTGTGACGTCAATCCTTTGATGTCATTCTGTTTGTGTTACCTTAGTAATA
AATTAGGCTCAAGTGTGAGTCAGTGTGAGAACTCCATTGTGACGGCTTCT
CGTCAGGCCTTTTTCCTGATTAAAATCAAAGTTTTCAAAAGTGTCCCTCC
CTCTAGCACACGTCGTTCCCCCACCATATCAGCAAGATATCGTCAATCAT
TCCCTTTGAATGTAAACAAATTAATTATTATCTCCACCATACAGATAATA
AGGAAACCCAGAAACATTCATAATTTAAATAAATTCATTATAAAGACTTT
GTTTACGTCCTTATAAAGCCAGTCAAAGCCAACGGCTTTCCATTAAAGTC
TGATAAAGATAAGTATTAAGATCCTGAAGCTGTTTCCTGTAGTTGGCTTT
TACTTGCACTCCTTAAGGCCGCCTGCGGTAATGAAAGAATTATAAAAGAT
TTGGCTTAAAATTCCGGAAGATAAAGCTTTTATATGCTTGCTTCTTCGTT
CCATCATATCATAAGCTTTCGTTTAATTGTCAAAGAACCTTAAGTCGTTA
TAAAGTAATTTTCTAATTATCAAATTGTTTATAAGAACGTGACAAGCATT
TCTTTAAATTGATAAAATAATTTGAAAAACATTAAACTTTTAGGTTTAGT
GTTGCATTAATCGAAAACTTTTGACATTGTTTAAGTCTTAATTTTTCAAA
ATGTTTCCCCCCATCAATCTTTGGAGCAATCGAAAGTATACCTTGCAGTG
ACGTAAATCATTATCGCATCTTGTTTATTCTTACAAGACGAGTATTATTC
TCTCTGCGGACTACTAATTAGCCTTTTGGCATTCTTGTTTGTTATGATTT
TGAATTTCCCGCATCAGAGACTTTTTCGGCACGACAAGATGACGTTTCGT
AATCTAGATAAGTTCTTTGTTATTGTGTGTAGTACTCCCTCGATGAAGAT
ATAAATAAACTAGACTCATGCAGCACACTTCCGCTATTATGTATAATTAC
TCTTAATAGATTTGATGTAGGAAATCTTCTAAGCCCTACCACCAAGAAAC
TCTTTTTTTTCTCTTGGTAAAAATAATTTGAAATTTTGAAAGATCAAGTA
TTTATGTTTGCCCTTAGTTTGGTAAGAGGTTCTTTAAAGAATGATATTAT
CCAACTAGAAGAATCTCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCACCT
AACGTTATATGGACGTTGTGAACGTTGGATAAACGTCGAAAAAACGTTGT
GTGCCAGCTGGGATGTCACAGCAACATAGCCATAATCTTTGCTTGTAAAC
TAAAGTGATACGAGAAGAGATACTACATTAATCATAATCTTTTAACGAAG
ATTAAACTTTCTGAGAGAAAAAGACAAATTAAAACAGGGTCTTAACGGTA
TCTTCAAAACCGAAAGAACTTAACGTGATCAGACAGATAGATTTTCTCAT
CCATGCCCAATCAATCATTTCATTTGATTTGGACCTTTTGTATTTCACCT
GTACATCTTTGTTACACAATTTTTTTTATAAGCCACTCCAATTTTCGGCT
CAGGGCTGAGGTTGCTTAGCATTCTAGCTAAATTCCTGAAAAATTTGCTA
TGACCACCCTTGATATTATACCATGTTTATGCTTATTGGGTCGAGGGCTA
CCATTTATCATGGTTAGATTATCTAAAAAGCTTCTACTTTAGGAGATAAA
AGTAAAAAGGTTTGGCTAATTTCAGGGTTGGAGGGTTAATGAAAAAAATA
CGAAGTGATTATTCTTATAGCTTCCTCTTCTTCATTTGTAGACCAGTGTG
GTCGTGTTACAAAAATACAGAATGTTTGTAGGAAAAAAATAAGATCTAGC
TGAAACTTTCTCCAGACCTTCTCTATAGGATGCTTATACCTCAGGAAAAA
ATCCCCATAAAATCCCACTGGTGGAACATCCCTTTTTTGGGCAATTTCTA
TTTTCCCCAGGCAAAATCCTAAGGGCGAAATTTTTTGAAAATTTCAAACT
TATTTTCAGACAATATCATGTATACCATTCGAATGCTCTCGAAAAACTAT
ATAGAAGACTTTTAAACGGTTATAGCCGATTTCCTTACCTAACTCGAGAT
ATTTCATGCGCAAGTTCCACTTTTCGCCACATTTTGGTCTAAAATTGACC
ATAAATAGCATCTTCTGATAATGTCTGAAAATGAGTTTGAAACTTTCAAA
AAATTTCGCCCTTAGAGTTTTGCCTGGGGTAAAAAGAAATGTCCCAAAAA
AGGGATATCCCACCAGTGGGATTTTAGGGGATTTTTTCCTTAGGCATAAC
CATCCTATAGAGAAGGTCTGGAGAAAGTTTCAGCTAGATCTTATTCTTTT
TCCCGTTAAAACTATGCTAAACGACCCCACTAGACAGCTTGCAGATCTAT
TCGGTAAACGATTACCAATTCTTACATCTTCTTAGCCCAATAGTCTAATT
TCCCAATCCTTGGGTTCGGCATCAAATTTAAAGAAATAACTTTGTAACAA
ATTCAGCAACCTGAATTTTTTGTTTCAAAAAGCAATTGAGATCTCCACCT
AAAAATTGTCAATTATAGTAGGGTCACTTTAACTCGAACCTCTATATGCT
CGAGTGTCTCAAGTTTTCTGAGTGTTCGAGTTATAGAGACTCAACTGTAT
TATCATTGAAAGTTCTTTTTTAAACGATTTTCAAATCAATGTTCAATCTC
TGGTCAACTTTTATGCTGGACATATTTTGAATATAGGTTTGATCAAATTT
CCTCTCCTGAACTTATTTTAATGGAGTGTTGATCAAAGTTCGCCTTCCAT
TCATTCTTTTGTGGTGCAGTACTCATATTTTCACACGCTCATATTTTGCA
CATCATTTTCCATAAACTTTATTCTAGGCATTCTTACTGAAGGGAATATC
AATGCTGACGAAAGCTTCCACTTTCTAAAACTTGCTTCAGTAGAGTGAAC
TATTAGATAATCGAAATCATTTGAAATACTAAACTAAAAGTAGTAGAAAA
TCCTTAACATTCAAAATACAGTTGACGCTCTCTAATTCAACGTTCTACTA
TTCGATACGCTCCATTATTCGATAATATTGAAAGTCACCGTTAACAAGAA
ACTCTCATTAACGACGCTCTACTATTCCATACGCTCTCTTTTTCGATGAA
AATCCGATTCCCCTCAAAAATCCGATTCCCCTTGAAAATCGAATCGGAGA
GCGTCAACTGTATCCCGAAATTACCCAAAAATATTTTGATTCTTTTAAGT
CCGAACACTTCAGTGTGATCTCTTCACGACATTTCTTTTCAATATGTCTT
CAATAATTCTCACTTCCTTCCTCACTTCAGATACGAAACGCCGGTGGCAT
CGAAGTGCTTTTGAATGCATGCAATATTGATGACTCAAATCCATGTATCT
ATTTTTTCCCCCCCCCCCCCCTAACACAGTTTGAAATTTCTCCTTTATAA
AAAGATGACGGTTCCAACCGTGGGAAATCATAGTTGCATTTTCGTCAAAA
TTGTGTAAAATCTTTTATTCACTAAAGAGGGACACATTTTGTTCGAAATT
AACTGCTGCTAGCCCCGGAGGGGGAGTACTTGGGCAAAAAGGGATACGGG
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CACTATCACATTCATTCAACGTGTTATATGTGTATTGAAACAAGTTGACC
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CAGGGACTAGCTTCAAATGAATTCTTAAAAGATAATAAAATCGATTGCCG
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GGCGACATATTTTCTCCTTTTTATTCCCTGGTTTCTTTATCCTCCTCTGC
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AATATACTTGAAATATTTCGAAGAGAAAATTTCCCAGTACATTGACGATT
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GCTAGACCGTACTGGAAAAACTTTACCAACTTTTGAATTTGGACTTCAGG
GTATAATTTTACTTTTTAATTTTTGAAAAGTGTTTCTAAGAACTTTAATC
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CAAGTCTTGAGTTCTGACAACCTTGTCTTTACAAAGCTTACTATAGAGGG
TGAGATTAACGTTTAGTTGATGGAGTTATTCCTTGTTCATTAGCATGACT
TCGTGATTCCTTTTTGGGGCGACATATTTTCTCCTTTTTATTCCCTGGTT
TCTTTATCCTCCTCTGCATCACGTTCATATGTTAAATGCTCATTAAGAGA
TCACGTGACTGGTTTGAAATATACTTGAAATATTTCGGAGGAGAAAAATT
CCCAGTACATTGACAATTTTTTGTAACAATTGATCCATGTCTTGTTATGT
AGTCTGCTTAACAAGTGATAACTTATTATGATATATCCTTCTCACATTAA
AAAAAAAAGCTAGATCGTACTGGAAAAACTTTACCAACTTTTGAATTTGG
ACTTTAGGATATAATTTTACTTTTTAATTTTTGAAAAGTGTTTCTAAGAA
CTTTAATCTATTCAACCAAGAAGGCTCCAAATGTGAGCGAGGTGTACAGA
GTTAAGCTAGAGGTTCATGAAAATTGAACTAGACTAAGCGGTATTTGCAA
TCTGTATCAAAGTCAAATCACAATAAAGAACGAAAAGACAAGAGGCTTAA
TTGTACCGACTCTTCAAGCTAATTAGTATAGCACAAATTTGATGAACGTA
TTAGAAAAATATAAAAAATCCCATTCTAATGTACAATAGACATGATATAT
TTGAAAGAATGAAAGAAGAAAGAAAAAAAAATTATGTGAATTCAATTTGT
GGTCACCAGTCCAGCGTGCCTTTTTGAAACGTCCATAAAATGTACATAAA
ATGTCCCAACTTTGTAACTTTATTCAAAAGACGTCACTTTTTTGTCGGCT
AGATTCGAGAAAAAAAAATAGTCACCCCAAAGGGATGAGAAATAATAGCC
TTCTTTAATGTCACACAGGGGTTTTAATTTCATTGGCATTATTTAGCACC
TATCTATCAGAGGTAATTTCTGTGTTGATGTACACGAGAGAGTATCAGTC
AAAGGCATATACGTAGAACCGAACAATATTTTTATCTTAACGTTTAGTAT
TGTATTTTTTATCGAATGACTTTTTTACTTCTGGACTAACGAAAGTTCGG
GCCGCAGTGACGATATCGGACCACCGTGGATGAGATTCTCCGTTTTATTA
GATGGTAAAATTAACCTTGTTGTTTTTATGTGATATACGAGGATTGTCGG
TGTTTTGTTTGTGAGTGTGTTTTCTTAATTTGTTGACGAAAAGAATTCTT
GAAAAATTCTTGAAAAGACATTGTCATCCATCATCGATTGAAAAATCTTG
GAACTCTTGGAGTCATATATAAAGGAGATAAAAAAAGGATTGTTATAGAA
GCTTAAAGGAAATATCCTGCCGTTTTTTGCAAATAAAGGGATTTACAAGA
AGCGCGACCCGATTGTTGATTATCCATATTCTGAAAAAATTATCCGCACA
CAAATAACAAAAATAAATCAATCAATAGATGAAGGCGATCAGCCATCCTG
TATAGTTGATTGTGAGAACGAGTGCATTTGAAGAGACTTAGATCACAAAT
AATTTTTGTTCTTGAATAGAGAGGACCCTTATATATCAACGGTTCGTTGA
TTGGAAGTATCATTTTCCAAGGATGTAGTATTTGGTGATCGGTCAATTTT
AAGTTTTATTTTTTCGGTTTTCATTCCGAGATGTGGTTTACGTTTTCGCT
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TCGAAAGTTTACCGTAAGTATTTCCAAAACCTCGAGAAATATTTTCATAA
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CTAATTGACTGTTGATAACTTTTTAAAACTTTTCAAAGCGCACGTAATAT
CAGGCCGACCTCTAATTTTTCGGGAGATTTTATCACTTTGTAAGCTACTT
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AAAAAATCATTTTCATGTCTCGTAGAGTTAAGCACTAATTTATTTGATCT
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ATTCGATAACTGGATTTAGTACTTCATTAGAGTTGACGCTGGACGGTCAG
CAACGGCTTGGCGATTATTAAAAAAGATAGAAAAGAAAGAAAAAAGAGAC
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ATACTTGCATGTTTTTTGTTACATTCGCATCTAGAACAATGGTGGCAAAA
GAGATCGCTGATATCTTTTGCGAAAATGAACTCAAAAAATATGGCATGGA
AAAGAACACACAATTCATGGATTTATGCCGCGGTGCACCCATCCCATTTT
TACACGGCGTAGAAGGTTTTAAGAGAGGATTGGAGCATTGTAAAGAGAAT
TTCAAATGCCATCGATGGAATTGTACGACAGATGAGGACCATGGGTTCAA
ACTTTTTGGCACTGGAATGGCGAGAGGTACCGATTCTTTATTCAATTTAA
TTCCTTGAGAAATCTTCTTATTTTAAAATTTATAGTTTTCTTCCAAAATC
CGATTTTACGTCTGTCGCGTGATCGGGGAAAATGGGTTATCACGCAACTT
TCTAGTCAAGTAATGATTTATATAGGCTAGAAAAATTTCTGTTGGATTTT
TTTTTCTCAATCTATACTTATATATCATTTTTTGTTTACAAGTGCAGTTT
CTACGTTATTTTCAATGTCTGATTTTTGTCGTCGGCTATTACCATTTAGC
AGTTGCATGAAAATTGACCTTCATTCCTTTGTACACATTGTTTAGATGGA
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TCATACAACCTTCCTTAACATAAATAAGCACCCTTCCATAACTTACGTAA
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TCACGGATTCCGAATTGAATCGTTTGCTTTCCGGAAGCAATCATCATTTC
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ATATAAATCATCACCGATGAGTTTTTAAGTTTGTATGCCCTTTTACATGG
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GGGGCTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNACCTAGTTTCCCATCCAATTTTTCTTTCGTTTCCCA
TCACGCCATCTTTTGCTATATTTTTCTAATGTGATTGTTTTGATTTACAG
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ATATAGACAGTATCATTCCATAAGCATCATTAATTGGAAAGGTGGTCATA
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TGTCACGGTCGAGCGTTCAGCAACGCCCGCCAAAGACGATTTAATATACT
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TGTTAATGTAGTCGGAATCCAGCGCCAGTCGATGTCCAGTTGGTCGTCTG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_034538	XLOC_034538	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00054827 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: WNT2 (Protein Wnt-2 OS=Homo sapiens GN=WNT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 159.073 bits (401), Expect = 2.104e-41
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Query: 3312 LCRGAPIPFLHGVEGFKRGLEHCKENFKCHRWNCTT-DEDHGFKLFGTGMARASRESAIMIAMTSAGIVEHVTNQYDSGKRDRVRVSRDDCIKINSRRPRHPEEYVSVHDCNADVVKGEIQAQKMMTTWIQGLKANEKEMKMNEHNAAVGRMAVRVNMRKICKCVGLSGACNARLCFQRMKQLDVSTKWLRHRYDNAQKVQASKRAKRDGTRPLVTVERSATPAKDDLIYLLNSPNYCNYDTSTGSLGTKGRFCNRCGNGVGSCDQLCCGRGHQEYQVTRTKACNCSLVE-FQMDCQQCEEKLVMYRCK 4232
            LC   P       +G       C+  F+ HRWNC T D DH   LFG  + R+SRESA + A++SAG+V  +T     G+   V+    D  K+ S   +  +       C+ ++  G   A+  +    +  K  +    MN HN   GR AV+  +++ CKC G+SG+C  R C+  M     +  +L  +Y+ A +V  ++    DGT   V  ER   P K+DL+Y  NSP+YC  D   GSLGT GR CN    G+ SC+ +CCGRG+    VTR   C C       + CQ C E L ++ CK
Sbjct:   54 LCHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDH--SLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVVFAITRACSQGE---VKSCSCDPKKMGS--AKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDA--KERKGKDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQ----DGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHTCK 349

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00054827 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00054827 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
WNT2	2.104e-41	34.63	Protein Wnt-2 OS=Homo sapiens GN=WNT2 PE=2 SV=1	[more]

You are here

TCONS_00054827 (transcript) - C. hemisphaerica