XLOC_034538 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034538
Unique NameXLOC_034538
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_245:578896..603830-

Legend: gene
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>XLOC_034538 ID=XLOC_034538|Name=XLOC_034538|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24935bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_245:578896..603830- (Clytia hemisphaerica)
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TGTATTCTTTCTCCTTGGTCTTTCTCAGTTATACTTGCATGTTTTTTGTT ACATTCGCATCTAGAACAATGGTGGCAAAAGAGATCGCTGATATCTTTTG CGAAAATGAACTCAAAAAATATGGCATGGAAAAGAACACACAATTCATGG ATTTATGCCGCGGTGCACCCATCCCATTTTTACACGGCGTAGAAGGTTTT AAGAGAGGATTGGAGCATTGTAAAGAGAATTTCAAATGCCATCGATGGAA TTGTACGACAGATGAGGACCATGGGTTCAAACTTTTTGGCACTGGAATGG CGAGAGGTACCGATTCTTTATTCAATTTAATTCCTTGAGAAATCTTCTTA TTTTAAAATTTATAGTTTTCTTCCAAAATCCGATTTTACGTCTGTCGCGT GATCGGGGAAAATGGGTTATCACGCAACTTTCTAGTCAAGTAATGATTTA TATAGGCTAGAAAAATTTCTGTTGGATTTTTTTTTCTCAATCTATACTTA TATATCATTTTTTGTTTACAAGTGCAGTTTCTACGTTATTTTCAATGTCT GATTTTTGTCGTCGGCTATTACCATTTAGCAGTTGCATGAAAATTGACCT TCATTCCTTTGTACACATTGTTTAGATGGATTTCGGTCAAACATTTCGGA CCTTCATGTGAGATTTGTCTTTGATATAATGGAAAATAGATTTGATTTCT GCAATTATACTGACTGAGTTGGAAAATATGTAATCTCAAATTCTTCTAAC ACACATCATGTTTTTTCAGACATCGTTGTATCATACAACCTTCCTTAACA TAAATAAGCACCCTTCCATAACTTACGTAAACAGATCTAAAACGTATTAT AATAAAATAATACGTCTAACTTTTCTTTATCCTCTCATCACTAGCATACT ACTACAACAAGTCCCTCTTACTCTTTGATCTCACGGATTCCGAATTGAAT CGTTTGCTTTCCGGAAGCAATCATCATTTCTCCTTCATGTCAAGATAAAT ATAGAACGCGCGCCCGCCCGCCACTGAACTACCAACTGTATGCAGTTTTC TTTTAAAAGAATGCCAAGAAGATATTTGTATTTTAAGATCGTTTGATTAT TAGCAGTACAGGTAAAGGAACTGGCATTTCATATAAATCATCACCGATGA GTTTTTAAGTTTGTATGCCCTTTTACATGGTATCAGCCCCCCCCAGAAAT TTGAAGGGCACCTAGGCCAGGTTAGTAGAGGGGGCTAANNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCTAG TTTCCCATCCAATTTTTCTTTCGTTTCCCATCACGCCATCTTTTGCTATA TTTTTCTAATGTGATTGTTTTGATTTACAGCCGCCATCTTTATATCATAA CAACGAAGCTTATCAGCAGGTGTTCATGCGTGAGCATGATTTTAGGAATG ACAAAAGAACAAAAAGTGTCAATTCAAAGAAATTATCTGCTGAATAGGGG TACCTAACTCAAAGCAATTTTTCAAGGGGACCTAAATTGCTGGGGGCACC ATGCTCAATGGGGGCACCTGAAAAGTGGGCTGAAACCATGCCTTTTACCC CAGGATAGTTGACCAAACCTCCAGCTCAGGAGCTTCAATTTGTGAAAAAT GTCAAGAGATCTTCTAGCATTTAAAAACGTGTTCAAGAGTGGATAATGAA CCGAGTTAACCTTTTTCATTAATGTTTTCTATATAGACAGTATCATTCCA TAAGCATCATTAATTGGAAAGGTGGTCATATCTAATTTGCTCGTCATCCT AGAAAAGGTGGGGTGAGAGTTTATTCTTAATGTTTCAAACACCGTTATTT TCAACCTATTATATCACTCTTTACATATAATGATCTCTTTGTGTCATACC GAATTCATGCTACACTCAGCATAGCTAGCATGCTAGACGACTAATTCAGA CATAACAGTAGAAAATAAGCAAAAAGTAATGGAATTCTCGAGTCAATTCT TCTTCAGGTCTATTCTTTTACATGGACTGCAGTCTCGAGCAGAACCCTTG ACTTTCAACAGGTTAGAAATTTGACATTTATATTTTTTGTTTGATATTTT CCTGAACGTATGGTTCGTATTTGTCGCTTAATCTTTGTAGTATGACCCAA TGAAATAGAAGCCTGAAGGGCTAAAAGCGAATCTTTAACCTTTCTCAGGC AAAAAAAAGTGAAGCCTTTAAAATGTAAGCCGTATTTTTTATGACGGATT GAATCTAGTGATTTCTTTGTTTTTGAGTGGTACATTTTTGAAAATCTGGC GGTAAATTTTACTTTCAATACGGCAATTTTGTGAAATCCACGTGGACTGC GATAGGCCACAACTTAGGTAGGATTTAATGGCTTAAAATCCTTCCTAGGA GATTCACTTCTAGCCTTTCGGGCTTCTATTTCATTGGTATGACCACCTGG GAAGATTTGAATTCATCTATTTTTACTTTGGCTTTTGTAACGTCATTGGA GCGTCTTGATTGATTATGTCCATAAAACAGCAGTGAGACGTAGGCGAAAT TGATTTCATCATTCACAAAATTGCCCATGTCAGCATGTTCTCTCTTTTTC TTCTTCTTTTGTTGTTGTCAAGAGAGGTTTTAAGTTTGGAGACGCTCTGT AAAAGGTGTACTAAGCTATCTAAATTGTTTGTCAATAATTAGATTAACGT AATCATTTAATCCCTAATTGAGATAGGAATGTTTATTTTCATAACGCGTG GTGACGAATGAATGGATTGTCTTGTGATAAGTTATGAGGGATATGCCGAG TTATGGGGGATATGCTGAGTTTTAAACTCGTTATCGGACACACTGACGAA GACTTTTGAAAATTAGTTTGGGAGTTGTAGGGTTCTAACCTGAACAATAT TATGTAAAAAGTTCGTCCCCTCAGATTATCTGATATGATTTTGATCAGTG TATATTTCATGGTATCCTTGTCAAGGGATTATGTTTCGACGACAGTTCTT CAAGGAGTGGTGTCATCAATCTATGATCGAATTAACAAAGGTCCAATGAT CTTAATCACTCCTTTTCATTGTAGTATCTAGGTGTCTAGGTACTTAGTTA CTGAATCTAACTTGTTTGTTAGGAACTGCTCTTCAAAATTTGAACTATTC CATTTAAAGATCTTTTTAAATATTCTGTAATCTTGCAAGATACTGGGTGT CCCAGAAAAAAAAGAATAATTTTCTCGAGTTCTATTGACTGTTAAACAAT CAATCCTTTTTGGCTTTGGAAAGACAAAGGATTAACTTGAATTATAAGGG GCCATTTGTCAGATTTAGTTAACTAGATCAAAAAGTATTGTCCAAATGTT AAAACATTACTTTTCAAAAAAGTTAAAAAAGGCGAAAAACGAGGGTATTA AATTCCCTCGGGGTATTTATTTCTGAGACGCCCGGTATTTTCACTTAAAT TTCTTCTGACCTTCCATCTTTTTGCTTATCTTTTGGAAGATGTATCTGGA AGCAATAGGAAACAACAAAACGCGGTCACTATTTCGGTATCAATATAACA CTCTTTGCAAACCACAAGACAAACCTGGAAAACCACAGAAAGAACATCCC GTCCAAACTCACTTTGGAAACTTTTTTTATATAAACAGGAAGTAGAAGAG AATTCTTCGCTAATTATTTCATTTTGAAAATGATCCGGTATTTGGTTGAG CTATTATTAATGCGTAATATCTTTGCGGTTTTTTGGTTATGCTTGCGGCA CTTGGTTTGGCTATAATTATATCAAAAAATGGCTGCTATCCACTTTAGGG TGCTCGATGATAAAAAATTATAAGTGAGATTCGTTCGCGATTTAAGATTG ATTGGTTATCTTTATTAAACAAATTAGTCAAGCTTAATTGGTCCTTACGA TTGCTAAATTTAGCTCTATCTGATTGATTGATTTTCTTTATATAGAAGCT TTTGATCATGGCGAATAGAATGCTTCTTTAATTTTTCATTCCGCTATTTT GGTACAATCTGCCAATAAGCCATTTGCCTGTTTTCTAAATAACTTACTAA ACATTTACAATCGGAGCTTTTTCATGCTCCTTTTGCGGGCTTCCTGTACT GGAAAACTGCATTATATACATTGATTATTTAAAAAAATAAGGTTATGCTA TATATGAAATCTGGTTTCCTTCGTTATTCCTAGAATAACGAAAGACTCTC ATTCCAAAAAGGTTCATTCTTGTACAATTTTTTCATCACATTTCCAGCAT CTCGTGAATCTGCCATTATGATTGCAATGACATCAGCGGGTATTGTTGAA CATGTGACTAACCAATACGATAGCGGGAAAAGAGACCGCGTCAGAGTATC ACGTGATGATTGTATCAAGATAAACTCACGGCGGCCGAGACATCCAGAAG AATACGTCAGTGTACATGATTGCAATGCAGACGTAGTGAAAGGAGAAATT CAAGCGCAGAAAATGATGACGACATGGATTCAAGGTTTGAAAGCGAACGA GAAAGAAATGAAAATGAATGAACACAATGCTGCTGTTGGCAGAATGGTAA GACGCTGAAAAATTTATTTTGTCGTGATATTCTAGAAACCCTTATTTAAA TTTAAATTTGAGGAAAATTTCATAAAATTTGCCGCTTCTGACAGAAACCA GCGTTTTTCCGTAGAAAACATTACGTAATGAATACCGTGAATTCATGCTT CCCATAGCTTTTTTATTGACTGCCATCTTATAAATTCTTTCGATTCTTTC GTGGTACGCTATCTGAATTATAATCAAGCGAATTGATTGACAAGGTACGC GTTTAGCAAGCACCCTAAGGTTTATTTCTTGAAAGGAATATAATAAAAAA TGTTGAAAGTTTTTTTCTGTTTTCTGTCCTTGATAATTTGATCGTAAGCT AAGACAGAGATTCCACATCGTTTAGTTGATGAGCTTTGAACGATTTTCAT TATCATTCATTTTTTCGTAATAAAGCTCACATTTCTGTACTTATTTGATC GGTCGGCCAATTGCGCTGCGTCTATTGTGAGTGTTAATGAAGTATGATGA CTTGTGGTCTAACCACCTCGTAAATTCATGCCATGTTCGCGTTCTACGTT TTCTGGCATGTATTAATCATCTTGAAATATTTGCAATTTTTTCTTATTAT CGAGGCTAAGTAAACCGGTATAATCGTAACGACAAACGGTGGAAAATGTA ATAAGCTAGTTCCATGGCGTTCTAAATCTACAGGCCTAACAAGCGTGCGG CGACTTCGATATTGTGGGGGCTCAATTTTTCGAAGTCGTTGCATTGACGC TAGTACAAAATGTACCGCGGAGCAAGAATTTCAGTGTAAAGAAATGGATT TTGTTTTGTTTTAGTGACCTTTCCCAAGCCTAAGCGTTAACCTAGGTTTG AGTCACAGGCACAAATTAGATCTCCATCCTAAGATTTTTGAATATTTATA GGCACCTGTCCATTCAGTATTGAAGTCAAGATTTAGATATTCTGCCTCAG CTATGCCTCACACTCATAAACTTAATATTTGCAAAAAGTGATTCTAAGGG ATTCATTTATTTTGAATGATGATCTATGTGATTCGTTCTTCAATTAAACT TTCCAAAATTTCACTAAAATCCACCAGGAAATTTAGATTTAAAATGCCAT GCGCTAGTTCCAATCAATTTTTTTACATATTTGCACAAGCCTATTTATCA CATTCTTCATCCATACGCACGAATAACCTTTATGTTATCTAGTTCCCAGG ATCATCTATAAAATTCTTTAGAATTGGACCTTCAATAATATAGTAGATTT TTGTTCACTATAATTTTCTAATCAAGCTCACTTTTATTTCGTTAGGCTGT CAGAGTGAACATGCGAAAAATCTGCAAATGTGTCGGTCTATCTGGAGCTT GCAACGCCCGGTTATGTTTCCAACGAATGAAACAATTAGACGTCAGTACA AAGTGGCTACGTCATAGATACGACAACGCACAAAAAGTACAAGCATCTAA ACGTGCCAAACGTGACGGTACGCGGCCGCTTGTCACGGTCGAGCGTTCAG CAACGCCCGCCAAAGACGATTTAATATACTTGTTAAATTCACCGAACTAT TGTAATTATGATACCAGTACTGGGAGTCTGGGTACGAAAGGACGTTTTTG TAACCGTTGCGGGAACGGCGTTGGCAGTTGTGATCAACTCTGTTGTGGAA GAGGACATCAAGAGTACCAGGTGACGAGAACTAAAGCATGTAATTGTTCT TTGGTTGAATTCCAAATGGATTGTCAGCAATGTGAAGAGAAACTGGTTAT GTATAGATGCAAATGATAGATGACCCTTAGTGTTAATGTAGTCGGAATCC AGCGCCAGTCGATGTCCAGTTGGTCGTCTGATTTTAGACCCTTATTGGTC TTTATTTTAGCCGACAGTATCTGCACTGGTCCTAAACAAATTTCTGTTGA ACAGTTAAAAAATCATAATGTTAAAAGAACAAAGAAGACATCTAACAAGT ACTTAGACTGTCAACAAGTGACAAGTGTTACCGTTCTAACGGACTATGCT AAAAAATCTACTCAACCTTTTTAAGTCCTATTCCTGAGCACTAGTGAGTT TATTTGGCTTAATTATAATTTTGAGACCAGATTTATAAAAGTTAAGCAAA CTTTTTGAAAGTGGTCGTATCACGGTATTCTTAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054829TCONS_00054829Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054828TCONS_00054828Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054827TCONS_00054827Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054826TCONS_00054826Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054828-proteinTCONS_00054828-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_245supercontigscaffold_245:578896..603830 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ATXN10ataxin-10 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
155.83 156.24 61.68 49.72 66.81 52.15 55.33 51.82 64.15 55.09 58.54 54.59 58.9 55.13 54.24 53.89 67.54 77.07 78.78 89.88 66.11 66.27 105.14 98.71 53.11 55.58 53.48 43.27 63.21 56.42