TCONS_00052764 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00052764
Unique NameTCONS_00052764
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length226

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00052764 ID=TCONS_00052764|Name=TCONS_00052764|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=226bp
ATGGCTCTTTTCAAGATTCATTCTTCATTGCTAGTCACGAAGAAGATGCA
AAAGTATCATACAATATCTTACAAAAACCTGAtggaacttttgaaaaaat
caaatcagcAAGAATATTCAAGGTTTTCAGCAACAAGAATGCGATGTTAT
GCAGCATATCTTACATGTGTTTTGGATTTAATGTCACTGGTTTCAATGAA
CTGTACCCTCTTTGGGTCTCCACCAG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_22:23019..41183-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00052764 ID=TCONS_00052764|Name=TCONS_00052764|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18165bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_22:23019..41183- (Clytia hemisphaerica)
ATGGCTCTTTTCAAGATTCATTCTTCATTGCTAGTCACGAAGAAGATGCA AAAGTATCATACAATATCTTACAAAAACCTGATGGAACTTTTGAAAAAAT CAAATCAGCAAGAATATTCAAGGTTTTCAGGTAAATTAAATGATGGTGAA TCTTACAGCCCCGGTGAAAATTTTTCCTTAAGTGGTGATATCGAAATCCA TTCCAAGCTCAAAAGGTGTTGTGAGGATGGTCTCGGGGATGCTTTATTTA AAGAGTGTCATTTTTGCCATCAAATCTAAATTTTCGTTAATGAAATTATT CCAGCAACAAGAATGCGATGTTATGCAGCATATCTTACATGTGTTTTGGA TTTAATGTCACTGGTTTCAATGAACTGTACCCTCTGTGGGCCTCCACCAG CACTGATTATAGTAAGTAGCATTTGGTGTTAATTTTATACCGATATTAAA GAATATCATTGAACATATCTCCTACCATTTTGCTACACAGCATTTTTAAG CAAAAGAAAGATTAACTTTCTCCTCATTAGGTGCAACGCAAGCACAAATC TTTAGGAATTCTTTGTTTATTCTGATTTGTCAGCATAGAGGCGTGTCTCC TTTTTATATCATAAAAACGATTATTTTTAATATACTGGATGCAATCGACC ATTGCATAAAAAGATGCACAAGGCTAATAAAAGTGTAAATTTGTGTTTCT TAGCACCTCAAGATATCTTTAAAGGGGAAAATTTGTAAAATTTGAGTTAG GGAGAGCTTTCTCTCTTTTGTGAAAATCTTTACCCCAGCTCCCTTTGCAG TACTCTGTACCAAAGTGTATCTCATGTTTATCGCTTTGTAGTACACTCTG CGCATTGTCTGTTTGATAAAAGATTTCCGTACGGAGACCTCTGCAATGAA GTATGATTTATAAATAGCAACACTTCTCTCATCGTCTCTCCTCTCTCCTC TCTCATCTCCGCACTCCATCGCAGCGGTCGGTTTGAAAAGTCTCAAATGA AAAAAGACAATGACAACAGACCCTCTACGGCAAGGAATTTTGAAATTTGT CGTAGATACTGGGTCTGTGTGCAGACAACCTTTGCAGTTGACCAGAAAAC TTTTTTTCGCCGGGAAAAATCTCGTTATTATCTAAAAATCGTGTGTCAAT TTCATCAGACTCAATTTTCCTTGTAAATTATGGAACACCAGCTGCCAAAA GTGTTCAACAATTGTACCACGTGGCAGCTGTGGCGTTCCATAGTAAATTA CATTGAAAAAATGTTATACTCAACATGACTAAGTTATTTTCTCTACTTCT TTTTTCAGACGGTTTAGGGTTTACAGTAAAAGAAGTTGGAGAATCTTTGA TGATCGCTTGCATTCCACTGATCTTCTTACTCATCATCATCATATCCAAG GTGAACACTAGTTTAGTAATAAAATGGACTCTCCATAACTCGAACACGCA CGGAGAATTCAATTCAAATTAAGGAAATTTCGAGTTATGGAGTAAAGTTT TTAAGAGTATTGTTAACTGAAAGGACTTTAAAAACTGTTCGAGTTAAGGA TTNGTGGAGTCTCCATAACTCGAACACGCATGGGGAATGCAATTCGAATT AAGGAAATTTTGAGTTATAGAGTAAAGTTTATAAGGCATTGTTGACTGAA GGGACTTTAAAAATTGTTCGAGTTAAGGAAATATTCGAGTTATACAGGCT TCAGTTAAAGAGATTCCACTGTATTTTAAACGATGAATTATCTTTGACTC ATATCAAGAGCCACAAAGACGTGGATAATGATTTTTTTTCTAAAAATGAT CGAAAATAAGAGTGTGTTCACTTTAAGCTTTAGTTAATAGTTTATTGCCC TCTTCTTAAGGGTTTGTTGAGCTTTTTGAAGATTTATTTATTTACTTTAT TTACTATCTTCTATTCGATGGTCAATAATCTTGATACTTTTCTCACTTTT CCAGTTGTCGCAAAGATTTGGCATGAAAAAGGTACGGCTTTTAACTGAAT ATAACTTCAGTAGTTTGTTATCAAACTAAGATCGAGGTACCCGCATATGT GTTGGCTGAAAATTACTTAGAAGACTTTATTCACGAATTAGGGTGAAGTA TTTTCAATCCTTTTTCGCCAAAATCATGGTTTCTGGATATGTGATATAAT TTTATGATTTTATTTTTAGATGTATATGGGAAGCCTGGCTATCCAATCAG TGCTAGTTGTCATTTTTCCAACAATCAAATATGTTCCGGGTACTTGGGTA CTGTCAATGGAGTCGCAGTTGCTTTCATGAATATTTCAAGGTAAGATTTT TGGAAGCGCTTAAACAAATATTTGAAAGACTGGTGCAAGGAAAAGTAGCT CTATGACTATGATTGTAGGTGAGCGGATACTTAGTAAATTCAGTAAATTA GCTTGAAAATATCCAAGGATGAAAGCAACTAAATTATTCTATTCCAGAAA ATCGTATATTTCTAGTGTCTTCATCAGGACAAAGTAAAATCTTTGGGTGA TCGCACCATACCACTAGATATCAAAACATGTACAATTTGGTGTTTAGAGT TGACACTCTTCAATTGGCCGCACTGCAAATTTTTTTCCCGACATGGACAG GAGTATCATCGACGGTCGGGATTATCTCATCTTGACGGTCGGGAGTATCA TCGACGGTCGGGAGTATCTCATCTTGACGTTCGGGAGTATCATCGACGGT CGGGATTATCTCATCTTGACGGTCGGGAGTATCATCGACGGTCGGGAGTA TCTCATCTTGACGTTCGGGAGTATCATCGACGGTCGGGAGTATCTCATCT TGACGGTTGGGAGTATCATCGACGAGCGGGAGTATCTTAAACTTATCTTA AACCTTGAAATGTCGACCCGACCGGGGTTTGAACCCAACAAATGAAAGAG TTTCTGATCAGAAACCCAGCGCGCTATCCGTTGAGCCACACTCGCACAGC ACAACACATAATTTGGAAATACTTATAGAATGACAAAAAAGACGTAGGTA ATGTTATTATGATATGGGTAAAATTGTCCCTTTTTTACACTGACTGAAAT TCGAGACGTTACTAGCAACCCTGCGGGGCCCAAGGCGCCGAGTATGCACC CGGCACAGTGACAAGCCGTTACTAGCAACCCTGACCTAAGCAATTCCAAA CAACAAAACCAAACAACAAAGATGAGATACTCCCGACCGTCAATGATACT CCCGTCCGTGTACGGAAAAATAGTTTGCGGCCGCACTACTATTCAATACG CACCATTGATCAAAAATATTGAAAGTCACCGTCAACTAACAACTTTCCAC GCTCTACAATTCGAATCCAATACCGCTTGAAAATCAAATTAAACGCGTCA GCAGCTCTTTATTTATTCAAGATTGAGTTACCTCTCAATTACCAAAGGGT TTAAATCCCTTTAAGACCTTCAACTGTTTGTCTATGAATTAGACTAAACT TTGTATATATTCTCCACTGGGAATCAATTGCTATAGTAATGTTTTAGCAA ACGTTTCTCGTGATGTAATTTATGAAAAGGTCTATTTAGCTTGAGCAGTA ATTTTATTCATTTTTATCTTATCTATTTTCTTCACATTTTATTATTTTCA GCGCTGTTGCACCATATGCCTACGGGACAATGTATTCGTGTTCGTTGCGT AACATCAAAGGAATCACCAAAAACACCGATCCACTGGGATTCTCCTTCGA TCCACATTTTCCGTATATCGTTATGTCTGTTGTTTCTCTCGTCGTACTAG CACTTGTATATTTTGTTAAAGAAATTGAATTTTCCGATGATGACGAGAAA AGTACCGACTATGCATCGACGGCAACGTCATCTTCTTCATCGATAACGTC GTCGTTGGATTCGACGCCGATAAAGAATTCAGCACCACTAGATAACAGTT ACGAAAACTCGCTGAAAACAGAGAAATCTAGACTTATCGTTTGATTGACG ACCATATTTTACAGGGAGAGTTGTTCAACCTATCGTGTGCGCTATCAAAA TAAAGTCTCTGAAAAGTCTATCACACATACAAAATTTAAAGATTGTACTC TTACGTGAAAATCCCTACATTGAGGGTCGACTCAGACTGCAGCTTTGGTA ATGGTTTTTAATGTGATGGCATCACTGATCTTTATAAAGTGACTATTAAG CTATACATCCGCCATCTTTGATCGGAATTTTTAGGATGGTATCTTAATAG GGGGCACTACTAGTGAGTTTTCTCTGTCTCACTAACTCGCCAAGCAATAG CAAACACTGAGTCAGGGTAGCAAGCGATTTCGATTTTTACTTGTGATAAA CATTTAAGTCTAGTCTATAGAGTATATGATTTCGATGCAGACAATATCAC ATGTAATACAATACGCACTAATTATCATTTCCTAATGTACTCCAATTACA ATAAATACCGGATTAGATTTTTGAATTTAGTCTTATCAGACGAGAGAGCT TACTCCTTTTCAGAGTAGATATATCAAAATATCTTACAAAATATGACTCT TTGAAATTTACTTGTTAATCCTTAGATCATTCTTTTGTTTTTTTTCATAT GCAAAGAATCTTTAGGGAATCTAAAAATCCCTCATCTGTATCTCAGGATT GGGTATTCCTATTAACTTTGACCGGTGATAGATATAAACAAATGAATATG GTTTGCAAACTTTTAAGTCTAGCCACTTGTTTGGTTGGGTATTTTACAAA ACCAGAATCTCATAACAGTTTAAAGAATGCATTAGTTGATTGACTTGGCA TACTTGAGGATTACTTAATTTTTTCACAGACCAGACTGTAAAATACACGC CCTCTTTGAATGATCTTTTAATTGCCATTGGCCATATACGACGAAATGTA TGAAGTTGGCTGATTGCATAGTTGATATTTCACAGACCGTCTAATATTTT ACCTTAAATCATCGATGCTTAAATGCTAAATACACCTTTTCGACCGTAGC CGCCAATTGACGCGTGGGTATTTTTTGTCTGCTTTATCCCACTAAAACCT AGGCTTCTCCATTAACCCGACCTCGACCTCGAGGTCGACATATTCATTAT TCTTATAAAAAAGCGTGTGTATTCCATCCCACCCCCTGCTTGTCCGCTCA ACTTTTATATTAAAAAAAAAACACTGCCAAAAAAACTGTTTTTTACCCAG AGTCGGCTTTTTATTGTATTTTGGTCGAGGGTCGGCTTTTTTCCAAGGAT CAAGGGTCGGCCTTTTTCAAGGGTCAGGGTTGAGGTCGAGGTCGGGTTCA TGGAGATTGCCCTTCTGCTCATCCTCTAGCGAAAAAAGTTTCTTATAGAG GCTGCTTAATACTCGGTAAATCTTCTTTCCCACAAAATGCCGCTTCTCGC CGAAATTCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGACATTTTGTTCGT TTTGAACGAATGTAGAAAAGATACAGTAACAGGTCTTGACAGGTATGTGG TTATTTTAGAAGCTTATGATAGGGAAAGATTGTTATTGTAAGTATCCAAT AGTAATATCATTTTGTGGCTTTATCTCTTTTCAGAGAGCCTTCTTCCCTT TTACTTTGTGTCTACTAAGTTGTTTGAAAAAGTCCAGCAGCAGATTCTGT TATTCTTTGTTTTGTTAAACTTTGAGACAGGGAGGGGAAGTATGTTGGAA TCAGTTTTATTGATAAAACCCTTTATTTCTCATTTAACTAACCTGAAGAG GTTCTTTAGACTTTAGAAACAAATAGTTATAGTCTCGGGGGAGTCTCGGT AATAGTGAAATTTTCTTTCAAAGTTTTTGAGAAATTCAAATTCGTTAACT CAAAGCTCTTACCCTGAGTATCAGAGGTTAAGTTTTCAAAGAATATATTA ACCTCTGAAGACAAATAATAGAAATTTTATCGCGCATGTGTCAATCTAAT CAATGTAGAAAAAATCGAGGGGTAAATCACTTCGAAAAAAGCGTACGAAA TGATTTTTGAGTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTTGTGATTTT TTTGTGATTTTTTGATTTTTCTGTGATTTTTTTGTGATTTTGTGATTTTT TTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTTTGTGATTTCTTTTTGATTT TTTGATTTTTTTCTGTGATTTTTTTGTCCTTTCTTTTTGATTTTTTGATT TTTTTCTGTGATTTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTGAT TTTTTGTGATTTTTTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTTGATTTTTTTGTGA TTTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTTGTGAT TTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTTGTGATTT TTTTGTGATTTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTTATTTTTCTGTGATTTT TTTGTGATTTTTTGATTATTTTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTT CTGTGATTTCTTTTTGATTTTTTGATTTTTGTCTGTGATTTTTTTGTGAT TTCTTTTTGATTTGTTGATTTTTTTCTGTGATTTTTTTATTTTTTTGTGA TTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTCTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTTAT TTTTCTGTGATTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTCTGTGATTTTTTTGTGA TTTTTTGATTTTTTTGTGATTTTTTTGTGATTTTTTGATTTTTTTGTGNN AATCAAAGATGAAGAGCAAATATTACCATATTAATGTCTAGCAGACTGTA TCTGTATGCAGTTTACTATTTACGAATTCCCCAGAAACCTCCAAGTGTAG TTGAAATGAGTTTATTTCGAAAGAAATCTTTGACATGATCCCCAAATGTA TAACAGTAATTACTAAACTTTTAATTATGAAAATGTCACTTTAATTGAAT CGAAATAATAGACAGACTTTATGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGCTCTAATATCAAAAC ATTCGAAAATAAAAAAACATTCGAAAATAGAAAAAAATCATTCGAAAATA AAAGAAACATTCGAAAATGCGTGCCTGTGGCAAAATGGAATCCGTCTGGC ACTGGAATGTCTTCACTTTGATTTCTTTTGTTTATCTTTTAACTCGCATT CGAGTTCCCATAAAACTTAGTAACTCGCCAAATAGCACGAGTCGGCCACC ATAAGAGCCACCGTAGCAGGAAACCAATCCATACACTATTAAGCAGACCT ATAGGAAGTATAGGTCTGCGAATCAGACTAACTAAAACCGTCCCAGTCCT TTTTTCATAGACAATAGAAAATGTGTAAAAAAAGGATTGGATCAGGTTTA GTGGGATAAAACGGACAAAAAAATGCCCGCGCGGCAATTGGTGGCTACAG TCGAAAATGTGTATTTAGGCAGACCAAAAATTTCGACTACGAGCTTCTAT CATCAAGACGTAGACGATGCTATCCGAAAGAAAGGTCCAAATTTCAAGTC AATAAAATTTCTCGATTTTGAAATTAAAACAATTTAAATTTAAATCAAGC ATAAGTGGTAAAAATCTACCCTTCACCCTTNTTTTGAAATTAAAACAATT TAAATTTAAATCAAGCATAAGTGGTAAAAATCTACCCTTCACCCTTAAAG CGCTATATTTGAATGTATTTTTGGCTGAAAAATTCGCAGTTAAATTTGCA ATTGCAAAAATTGAACTTTTTTTCTACTTATACTGCAACGTTTATTTCTA CACCAGTGGTAGTTCAACCTTAGGATAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAGCTATAGGTATGGGAAT TAATTCAATAACCAAATTCCTTTGCCGACGAGCATTTTGAACTTCTTTGC TGAAAATTGAAGTTAAGTTAAAATAAAGCTTTAACTTTCCATTTGCCTAT GACCTAGATCAGGGGTAGAAACCAATTAAGTAGTCAGACGGCTGAGAAGT AAGTGTGAGTCGGTAGATATAAGTTTGGCATGACATTATGGCTAATCCTC GAATAATAAGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAAT GCTATCAATTCTAGCCATTGGTAACTTCGTAAAACGTGTTATTAGTAGTG CCTCCTTTACAGAAACTCCAAGCAGGATCTTTTTACTAGCCAATTATGGT GCCAAAAGTGATTTCCTGATAACTTCAAAAGTCTTGCCTTCTTCCCAAGA TTTGACCAGCTATCTGTACATCTGATGCTCTACTTGTGATAAGGACTCGA TAAAAACATACACACCCTAGGCACAATATAGTAACTAACAAAAAGAACAT ATAATAGAAAATAAAATACTATTTTATAAACTATTTAGATATTATACCTA AATATATCGCAGACGATATGAAATACTTAATATGCATTTTAACTTGCCTC TGGTTTGCAACATGAGGCGTCCATACAGCCTTGTTGACAGGCTATGTAAA GCATCTAATCAATGCCGACTGTTTATTATGCCCGATCACGATCCTTCTTT ATGCTTCTACCTATCTAAAACTGGATCATTCTCAACTTGCCGCTCACTGC AACTAGGATACATATCCTTCTCCAAATTAACCTTTGTCAGTCGACTGATA GAGAACTTCCGTATATAGTTGTGTAATACAATATCTAAATTAATATAAAT AAATGCCGTAGAAACCGACTCTAATTTGACGTGCACTGTCTGTGTACAAC CTTGCCTAGGTTGACACCAGCCTTCAAGCCAAGAAGATCACTCTGCTGTT TTTCAATTTTTCAATCAACCGGGTCGCAGATTTTTGGTAACGTAAAATAA AATAAAATATTCCGGTTTTGTGTTTGATTATTACATCGAGTTGAGGATAA GTTTATGCTTATAAAAAGTTGAAAATTTTGTTTGTAAACTATCTGAAGTA AAAAAGTAAAAGAATTTGTTCTCTTCTTTATCGTGTTTTATAAGCGTAAG CGCTGTCCAAGAAAAGAATTCACAATTCACTGCAAATATTAAATCTTATA AAAGAGAGCAGCTGTGCCTTAGAAGAGTAACCTAGATTAAGTGANNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCGTGTTTTATAAGCGTAAGCGCTGTCC AAGAAAAGAATTCACAATTCACTGCAAATATTAAATCTTATAAAAGAGAG CAGCTGTGCCTTAGAAGAGTAACAGTAACCTAGATTAAGTGAATGGGCCT TTTGTTTAAGCTAAGAAATTTTAAAAGCAAAAGAGAGAATTTTGAAATAA TTGATGTTACGTTTCGTAGAGAAAAATTTGTGTTTTTATGGTGTTTTTAC TTTTTGTTTTGATTTCATCTTCAACGGCCAAAATGATAATAAAAATTTTC CTGTTTTTGCGAGCCCCTTGCGCAACACCGAAAACCTAATTCCAAAAGAA AATATGTTAAACCAAATTCAATCCAATACGCAAACAATCAAAATCTTGTA GAGTTCATAACAATCATATTGCAAGTTTTTTGTCCTTCTTCTTCCACTTC GCTGCAAGCAACCGAGCCTTATGATAGCCAAAGACACTACAATAAGCTAT TACAGCCTCAATGACCCCAAATGTCCAGCGACAATCCCTAAACGACCAGC GGCAATCACCTTGGCCAACCTCCCCAAAACCAGCAACAATCACCTTGGCC AACCTCCCCAAAACCAGCGACAATCACCTTGGCCAACCTCCCAAAACCAG CGACAATCACCTTGGCCAACATCCCCAAAACCACCGACAATCACCTTGGC CAACATCTCCAAAAAACCAGCCACAATCACCCAAGCCANNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTGACAAAATGTTTCTCTATGCCCT CAAGATTTCATTTATGCATAAAACTCAAAAAGTTGAAATTTTGCGATAGA ACCCTTTTAATCTAAGGTCGCGTGATGGTAAGGGGGCAAACCCTTAGGAC CCGTGACATTTTTTATGCGACGCAATCAGATCTGGTTCCATTCAGGGAAT AAAGTATTATCAAAAAGTTTTTTGCGGGGGGGTGTGGGGTTTGCTAAGGC CTGAGAAAATGACTGTGACTCTACTGACGTCACAGATAACTAATTCTTAA TCAAAATCCCAAAACGTTCTCTTTTGAGGGAAGCGGCTGAGCTAATTAAC TCATTATCATTAGCTTGAATACACGTTTTTTTATAAGAATATCGTCTATA AGAATATCAGAGTGAAAATTGGCTAAATCGTAAGAATACCCTAAGAATAC CCTTTAGGGTGAATTTCACAGAATTTGATAAGAATACAGCATTTTGTATT TGGTTAACAGAAAAAACTGCTTCCTTTGTTAGAGATAAAATTGAAGCTTT AAGGAAGAATGTAATTTTAACCCGAATCAAAAATCCAAAACTCTCAAATT GATAATTTATCATGATTGTAAAAGAGTCAAGTCTAAAAAAGTAAGAATAC ATTAAGAATATTTTACCCTCAATTTTGGCACTTTCTTAAGAATATTTGAC CCTCATCCAAAGTACACTATTCTTATAAAAAAAAGCGTGTAGTTAACTTC AAAAGGAGGGATATCCTTTCAGAGCATCTGTAGTAGCCAGGCTCTGCTCG GAGGTTAATTTTAATCGATTCTAATCACATTCTTATATTTATCATTTATC ATATTTACCTTTTTACCATAGCAATTTAGATGAGAAAGAGGATATTCGCT TCTTAGCTAGCGGTGGTGAAGAAAAAAAGTACAACAATGAAGATGGGCAT GGCTCTCTTCAAGATGCATTCTTTATTGCTAGTCACGAAGAAGATGCAAA AGTATCATACAATATCTTACAAAAACCTGATGGAACTTTTGAAAAAATCA AATCAGCAAGAATATTTAAGGTTTTCAGGTAAATTAAATGATGGTGGATC TCACAGCCCCGGTGAAAATTTTTCCTTAAGTGGTGATATCGAAATCCATT GTCCCAAGCTCAAAAGGTGTTGTAAGGATGGTCTCGGGGATGCTTTATTT AAGGAGTGTCATTTTTGCCCTCCAATCTAAAATAGGATTGAAATCAAGTC ATTTTCGCAGTTGGGCTGAACTGGTAGGGTATTTCCCACCAAGGACGCGT TGTTAACCAGATTTTCCAGTGGTGTGAGGGATCCAGGGGAGTCTGTGATA CAGGGATATTTTGTAAATTTCCGTCAAATGAAATAATACCTTGTTGCCCA AGTTAGGTTTTGATTAAGGAATTACTTCCACCTTCTATAGCACTATACTA GAGACTTAGTCCCCTTTAGTTGAATAGCAGCTTAAGTCAAAAAGATTTTC GTTAATGAAATCATTCCAGCAACAAGAATGCGATGTTATGCAGCATATCT TACATGTGTTTTGGATTTAATGTCACTGGTTTCAATGAACTGTACCCTCT TTGGGTCTCCACCAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033358XLOC_033358Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1575043694:41054..41183TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1575043694:41054..41183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1575043694:23019..23114TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1575043694:23019..23114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1510915933:41054..41183TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1510915933:41054..41183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1510915933:23019..23114TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1510915933:23019..23114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1491911889:41054..41183TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1491911889:41054..41183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1491911889:23019..23114TCONS_00052764-exon-scaffold_22-1491911889:23019..23114Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_22supercontigscaffold_22:23019..41183 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.81351 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0943576 0 0 0 0 0 0.968779 0 0 0 0.211014 8.22346 0 0 0 0 5.26198 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00052764 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top