TCONS_00052323 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00052323
Unique Name	TCONS_00052323
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4277

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_213:186463..202084-

transcript sequence

>TCONS_00052323 ID=TCONS_00052323|Name=TCONS_00052323|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4277bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_213:186463..202084-

Legend: exon

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>TCONS_00052323 ID=TCONS_00052323|Name=TCONS_00052323|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15622bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_213:186463..202084- (Clytia hemisphaerica)
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GTGATATCAATCTAATTTGTTGGGTACTTCTCTTAACTTTGAAAAATCAT
TAAAATTAAAAGCTAAAAAAATGAATTTTTGTGGTTTCTCAGGGTGGGTT
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ATTCTGGCTCCTTTGAGCATCAAATTTGATCTGATCCTATTCTTTTTTTA
GGGTACAAAATTAAAATTCTTAAAAATTGTTCTTTTTTTATGATCTTAAG
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TTCAAACGGGCCTTGTGAGAATGACAGAAGCCTAACCGTAGCTCGGTCTT
GTTCGGAGACCCATTTTGAAATTATTTTGACTCTTTTAATTCCTTTTAGT
CTTTATTGGCCCTGAAAATCATCAATTTTTGTGTATTTCAAGTTTTGGTG
CGAATCACAGGGGACTGATGTTTTTTACCTAAGTATTGCGCCTTGCGCAA
TAGATAACATTTTTATTCACCTTGAAGTTTTTGACTGCGCTTTTTGACGA
TCCACCCTATTTCTGTTTTGTATTCTAAGTGTTGTTTTTATCTCTTGAAT
TGTTTTGAAATTCTCTAATAATCTTTCTTATCCGATTTTGATTGTTCCGT
TTAGCCAGGATAATTAGTGTCGTGTAACAAATTATAAAAAACTGTAAAAA
CTTTCAACCGCGGTAGAAAATTTCGTTGAAAATCCTGCCGTAAAAAATCT
GAATTCAATTAGTGATAAAGAAATGCTCACTTTCTTCGTTGTGATTTACT
TCATTTTTTCGAGGTCTAAATCAGCTTCTGTGTGAATATTGAAAGTCGTT
TCATGGACAAATCAATCAATTCTACGTGTTTGATCTTGTTATGAAGCAAA
TTTGACACCAAACGTTTTTCGATAATAAACTATTCCTACTGCGTACTAAC
TTAAGATAATTGTCCTAGCAGCTTGAACTCGATACTTCTAATGATTCCAA
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CATTCCTTTGATGTATCATTATTGGAGGCAAGGAAATTCAAGGTACAATT
TAAGCGGAAATAGGATGTTCAGTTGATTTAAAACAAACCTTATTATTTTG
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CTTAAATCAAGGAACCTGTTTAAATCCCAGAATATGAGACTTTTTTTTAA
TGCAATGCATTTTTCTTAGGATAAAGAGGAACACCATCGATTCTCAGAAG
ATTTGCATCGTTACATGTTGAACAATGGAACACCGATTCTCAAGATACCA
CGTATCGGCTGTGCGCCAGGTAAGGATTGAGGAAAAGCATTTTTNAAATC
CAAAAAATCAACACTTTGTCTAGCCTGATAGCCCCTCTATACAGTATTTC
CTACATTTGAAATAGGTAACTTTTCGTTAGAGGATGAGCCTAAGCTTACA
CTTTTTTGAAATGAGTGTCGTTACTTTGAGATGGCCTTGAAAAAATACAA
TCCACAAAATGAAGGGAAAATGAAAGCAAAAAGGCCTTTAGTCTTATGTA
AGCAAAATCGTGGCGTAACTTAAAGGTGTAGCATAATTTGCATTGGCACC
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ACTTTCATTATTTTTCACAGTTCTCCTTGATCACAAATTATTTTTTCTTT
GATTTCATTTAGGATGAAGTTGTGGAAGCTAGCCGTCAAGTTGTTGTGGA
ATGTTCCAAATTTGCTGCTTGGGAGTGTACATCAAAGATTTGGCATCAAA
GCTATGGGACCACTCTGTATGATGGAGTTGAAGTGGACAAGTTAAAAGCT
CTCAGTAAAAATCAACAGAAAATCATACATAGAAATGATAACTCTCTCCG
AAAAGTGAAAATTTTGAATTTCCCGCAGTACAACCGGTACAAAACATGCA
TCAAAATGCTCAATCTTGGTGTTCCGATGACTTACTTTCAGCTTTTAGCC
AGGGGTGGTTTGGACATCAAGAATTTGAACACTTTGATTTTATTTTCTAA
GAAACAATTTGAGAAAGAGGACGTGGAAGACTACTCGCCAACACTAGACG
TACCAGGTTGGTGAACTTAGATTTCAATTCTGATACAGATCACTTGGTAA
ATACAATTTTCAAGATTTCATCTAGAGAAATTTTAAAAATGCGGAACCCT
ATTCGAGGTTATCTGATAGTCGACGTCAAACTTTTTACGACACGCTAAAG
GCTCTGAAGTTTGGGGAAATCTTTAACTAGGGGAAGGTTTTCATTATTAT
AAATTCGATCTCTTGATTACTGATAGACAACGTCCTTTTCAACTCTTTAC
CCAAGATTTTGATATCCTCATCTTGCTTTTTCATCAATTGAAAAACTTTA
CTTTTTCTGTATAGTTCCCGTATTCAAAGGTCGACCTCGAAAGCGGAAAA
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AATTGACCATAAAACGAATGGTAGAATCGGTCCTATTCTGAACAAACCGA
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TCATGAAAAAAGAGAATACACATTAAAGGTATTATTTTTTATTTTTTATT
TTGAAAGCAATCACAATACCCTAGAAATAACCACAATAATTCAAACGGGC
CTTGTGAGAACGACAGAAGCCTAACCGTAGCTCGGACTTGTTCGGAGACC
CATTTTGAAATTATGTTGACTCTTTTATTTCCTTTTGGTCTTATTTGGCC
CTGAAAATCATCAATTTTTGTGTATTTCAAGTTTTGGTGCGAATCACAGG
GGACTGATGTTTTTTACCTAAGTATTGCGCCCAATAGATAACATTTTTAT
TCACCTTGAAGTTTTTGACTGCGCTTTTTGACGATCCACCCTATTTCTGT
TTTGTATTCTAAGTGTTGTTTTTATCTCTTGAATTGTTTTGAAATTCTCT
AATAATCTTTCTTATCCGATTTTGATTGTTCCGTTTAGCCAGGATAATTA
GTGTCGTGTAACAAATTATAAAAAACTGTAAAAACTTTCAACCGCGGTAG
AAAATTTCGTTGAAAATCCTGCCGTAAAAAATCTGAATTCAATTAGTCAT
ACGAAATGCTTCTTTCTTCGTTGTGAATTACTTCATTTTTCGAGGTCTAG
AGCAGCTTCTGTGTGAATATTGAAAGTCGTTTCTTGTACAAATCAATCAA
TTCGACGTGTTTGATCTTGTCTTAGCTATGAAGCAAATTTGACACCAAAC
GTTTTTTGATAATCTTGTCAAATATAATTAAATGCCAAACCATTTCTTAC
TGCGCACTGACTTGAATTGTCCTAGCAGCTTGAACTCAATACTTCTAATG
ATTCCAGGAGAATACCCGGTTGTCTAAAGTCGTCATTCATTCCTTATGTG
CCATTATTGGAGGCAAGGAAATGCAAGGTATAATTTAAGAGGAAATAGGA
TGTTCAGTTGATTTAAAAAAAACCTTATTTTGCGAAAAATCCTTGAAACC
AGATGTTGTTTTTGTGTCGTCAATATTGCTATCTTAAATCAACCTGTTTA
AATACCAGAATATGAGACTTTTTTTTAATCCAATGAGTTTTTCTTAGGAT
AAAGAGGAACACCATCGATTCTCAGAAGATTTGCATCGTTACATGTTGAA
CAATGGAACACCGATTCTCAAGATACCACGTATCGGCTGTGCGCCAGGTA
AGGATTGAGGAAAAGCATTTTTTCGTGGTTTTCTGATTATTGCTCTGTTG
ATTATTTTTTGCAAATAATGCCTTTATTATGTAATACGATAATTGAAGTT
CTGTTGTTTAGCTTCATTTAACTTCTAATGATTTTCGAAATTAGAACACT
TGAATAATTTTGTGTCCATTTCAGATGACGATGGATGTTAGGAAAGTCTC
AAAATTTCTTTTATCCCTGTTTGACCGATTGTCGTTTGCTAAAATATTTC
TGGAATTCGAAATAAATGCTCAAATTATTTCAATTCCTTTTTTATTCTTT
TTCAAGTCAACCCATTGGTTTTGTACAGAGCTGTCATGGATAGAGGCGGA
TTTGCACAGGTGAGATAACCATCCATGATTTATTTATCGTTTAAAAAACC
TGTACGGGTCAACAATTAACGAAAACCGTGAACGTTTATACGTCTAAAGT
ATTCAATAGTGACTTCATATATTAACCCTATTGAGACCCCTGGTATGACT
GATACCTTTTGGAACAACCCGCAGATTTGACCAGCGTAATCGAGGACGGT
AAAAGTGCTGATTTACTGTCGTCTTCAGTCCGTATAACTCTATCTATCCC
TATCCGTCACAGGAAAAACGCCATACATAAACTTGAATTCTTGCAAGGCT
TATGAAAAAGTAGGTGGGAACCAATGGTGTCCCCATCGAACTTAGGAGGA
TTTTTTTTCTTGTCAAGCGCTCACCCTGGGCGCTCACTTGTTGCTATCAT
CCTCGAAGGAAGTACTTATGATTTATCATTACGTTTACATAAACCCAATT
TAAATGATTTTGTGGTCTCGATGCAATATCTAGATTTTAATTCGATTTTC
AAATCGCAATAAGTTTGGCCACTTAAACTAAACTTGAAAACGTTGGGTCT
TTCCTTTGTGACTTTCCATTGTCATCTTGTTGTCAAAATTAGAGAGTTGA
TGCGTGTTGTTGTGCTTATAAATCGCTCATATTCTGATTGCGTTGATCTT
AAGTAAGTATTCAAGCTTCATGTTTTGAACTATCGTTTAATCTGGAGAAT
TTTTTAAATTATAAGATTTTTAGCATGTAGTTTTAGAAAGCTCTACGTAC
TGGAAATATATACTCGCTACGTATAATCTTTCCATACAATATAAAGAAAC
CCGAAAACTGTGTTTGGCCGTTTACGATAGAAAAATGACGCAACCAAGAC
TTGTGTGTGTTAAAGGTTTTTCAGTGTATCATTCTTTTTTCGCAGGTAAC
ATTACATCGTAATTGGCGAGACGTATACGATTGTTTGGGCCATTCCACTA
TGATCACAAACGCTGCTACTGCTACAAGGAAGCTCTATGAACGGTAAGTA
CCGTATTACTTCAAATAAAACGCCCGCGCCCCGGGCGTTTATTAATTCAT
TTCTTTAGGAGGGGGCATCTAAAAGGAGGGAGAGTTTATTAAATAATCTA
TAATGAAGGTCACTTTTAAATGAAGTGTGAGTTCGAATCATAAGTTAGAG
ATGAAAAACAGGTCAAAACCAGTTTGAATTCAAAAAGAATACAATTGTTA
TCATATATCTAAAGTTTCTCTTATTATAATTCCTTACATCTACTTGTATC
AAATAAACTCCCCTCCTGGAGGGGAGGTGTTTATTTGAGGGGGCGTTTAT
TGAAAATTATCTCTCAAAAGAGGGGCGTTTAAAATTTGGGATCGTTTATA
CGAAGTAATACAGTACTAAAGCAATTGCCTATACAATCAAATCTCGTTAA
TTCAAACTCTATCATACCCATTTATCTTTGATTCGAACTAAAATATTGGT
AAACATTTTCCCTCAGCTGGGAAACCGTATTCGAAAATATTTTCTATGTT
GAATCTTTTTCTTATTCGAGGAAATGTTCCCTTTTAATCTTTAGAATGTT
GCTTCCCTACGAGAACCACATGCGTAGTAACCCTGGGAACCCTGGGAAAA
GAATCAGTGACAAACGCGCTCACCAAGCCACCCTACCAAAATTCAGTTCC
AATGATCTTATACGACCTCGAGAACATTTTGAACACAAGAATCCTGAGCA
ACAGACACACAGACAACAGCAACAACCTATCGTTATCGCACCAAAAGTCC
CGCATGTTAATAGTATGCCACAAAACGCAGTTAACAGTGCGGAAAATCTC
TCTATTTCCTTAATGATGTCCAAACAACGTGGTCGCCCGTCTAAGAAATT
CCGTAACCAAATCGAAAAATTACGGTCTCGTCAAACGATGCAACTCAACG
AAGAACAGCAACACGCCCCGATGTTTGCAGGTAAAACCGCGCGCCTACCA
CCCCGCAAACAACCCTGGGTTAATGAACTTAACGTTGATATTGCTTCGCG
TCAGCACACGGAAGTGCCAATGTCTTCAAACCCCGCATTTCGCAATAAAG
ATAAAGAAAGGCGGTTAAGTGATAGCTCAGATATAGAGCTTATTTCTCCG
CGTCGGGGCACGGAGATCCACTCGCCGCTTCGCCAGGGACGCCGAATATA
CCCTTCAACTAAAGATTCAGTGGGTACCTCGTCAAGTGGAACGAACGGGT
TTGTTCCGGACGCTTTTGTATCAAATGTACACAACTCTACGGATAAAGAG
CAGCCTAATTCACAGAAAAAAGGTCAATGCGAGTTCAAAATTCAATCAGT
GCGTAGCTTAGCAACAGTTGACGAAAACAAGCCTTCATCTTCACAGCAAC
CGAATGAAGCAGCCTCTTCAGGCACCACCCAGTATGTTCATTATCCTTAC
AGTACAACGAACACTTATGAATATATTCCAACCAAATTCTATTCTCTAAG
TGGTTCCAATAAACTGGTACCCATTAACGCTCTACCTGTTGGAAACTCGG
GAAAACAACCTACTCAGAAAGCAATGTTCCGCGATGCTGGATTTTCGATG
CGGACTTTTCGACACGATCAATCTGCAGACAACACTTCGTACAAAATCAA
ATCGACTGCTCTTAAAAATCACGAACCTTACATAATACATCACCCTTCGC
ATTTGAATAGAGGTTACCGTGAAATTCCGGGACAATATCCAGTTATTTAC
ACGCATCAGCCGGGTGTGAGAACCACTGGGAAAAGTGAGCGCTCTACAAA
TTACGTAAGGCAAGATATGCGGTACGTCACGAGTGCTCCCGTTGACTATA
GCCCACCAAATGGTACTCTTGTTTACGGTCGTGTGCAACCGCGCTACGAA
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TGGACGTGGACGACCGCCGTCACGCCCATCCTCGTCTACAACTTACGTTA
AATACATCGATCCGCCGGCACAATCAGTTCAAAAGTGGCCTGCTGGTACA
GAGCTATTGAAAGTTAAAGCCCATGTTAATATGTGATTTGTCCATTTTGA
ATAGGTCGATGAAAATGTTTTATTTAGTGCTTTGTTTGTTTGTTCAGAAT
ATCTCTCGTAGTTTTGATTTTTCGAAATTTTTTAATTTTTTATGTAATAC
TTTTTACTTCGCTTGAATGATCAGGAACAAATGCTTTCTCCTTCAGATGC
TTCTATATTTCGCCTGATTGGTAGTCTGAATCGCAGACCTCTATAGACAA
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CCTAATGTGCCTCGCCTCTGTTTTTGACCATCAATAAGCCTTCTTTTGTC
TATATACTTAGCTTTTCAAAGTAATATTGTTGCCTGTTTGGTCGATTGGA
TGAAAGGTTAAACCTTTAAGTTAAGGCTTTTTTTTTCACTACAAATTAAT
CGAAAGCGGTTTAAGTCATTTTTTAAAATGGATTGTAAAAAAAACCTCGA
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TTCTAAACTTTTTTGGGAAAATCATCCTGAAATATTCTTACAGCATTCTT
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CAATTGAAAATGCTCTAAAAATGACATTCTTAGCTTGAGTAGCAAAATTC
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GCCCTCAAGGGGCGTTTTCACCAACGCCGTCTCTTTCTAGCAAGCATTCT
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ACTTTTGTCCGGTGAAAACTTGAGATGGCTTGTTGAGTAAATGTAACGAA
GCACTTTCCCTGCTCTCTTTTATTTGTCACTTGTTTTATTTTCTCATAAT
CAGTAGCATTCAATGACTAGAGAAACATTTAGTGGTATTTTAAACCTAGA
TCTTGAGCTATTTTGTCACTCC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_033089	XLOC_033089	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_213	supercontig	scaffold_213:186463..202084 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	2.32596e-05	0.269835	1.11263e-09	5.19817e-07	1.40365e-08	5.0967e-07	1.05869e-09	5.08496e-08	0.000257053	1.54966e-10	1.89953	0.00017164	6.76076e-06	0.00634907	7.89426e-11	2.87738e-05	2.52283	0.000807837	4.75139e-07	3.51184e-07	0.000235089	0	2.0501e-10	1.60865e-07	0.580673	0	0	5.28597e-05	1.30076e-09

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00052323 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00052323 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00052323 (transcript) - C. hemisphaerica