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transcript sequence >TCONS_00051411 ID=TCONS_00051411|Name=TCONS_00051411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3011bp TCTTATGAGTATGGAacttttctgACAACGATTTAGTATTACTGAAGTTT TTCAAAGGAGATTGAGTCGACATCACAGGGATTCTGTCGATTCTATCGAC GAGGAACATATAccgaaaaaaatgaattccaACCGTGAAAGTCTTGATCT GGAGGAGTTTCAGTTTGATGATCCATCAAATCAGTCACAGACAGatggac AGAAGAATATCACAATGAAAGACAAAGATGAGatGCTTCAAGAACTGAAG AAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTATATGACGCAGAAGAACAG CGAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAATTGGCTGCAC TCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATCAACAAACTAGA GACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGAACGATCAAAA GAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATACACAACCTCT CTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATATCTCATTAAGT AACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCAACGTCAGCATA TTTCCATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGGCGATGGAGGTGCAGCGA GCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAATACGCCATATA AACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGCGAACCTCAAGT CGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCTCGACAACGACC AAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATTTAACAAAGAAC TACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACTATTAACCTCCCGGAAGG ACCCCCGGATATCGTCGGTGTAGTCCGACCAAATAATACAAGGACAGTAG TTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAACCGATaccgaaa aagaagaaaaagggtATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGTACAGGGAAGTC CGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGTTAAACGAGAAC CGGTCAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATGAAACATGTAGTTAAGTA AGGAATATTTGTTCGTGGTTATTGATCAAAGATGCTTGAATCTTCAATTC GAAAGAATGTCGAGCTCTCCTTCTAAAGATGGATTTGGAGAGGGCGTTAG TTGGAGTATTTTGATTATTCTGATATAGATTTTGACCTTTTGAAAGGGTA TCATTAACAGACAACTCGTATCTTCGAATGATTTTCTCATATGTTTAATC CATTGAGTTTACTGACGTGACTCACTCTATTGGAGCTTCATGTGTTTAGT TTCTTAAAGCAATGATCTCTTcttcttattttcaaataaagcagacATCG CGCGGACAAAAAGTTACAGTTCTTTGTGATAATAATATCAGTTGTGATAA TAATATGGTACATGGcgacaaaaaggaaaattttttataatgGTTGAAAT TTATGATTTGACGGTGATAGAAGTCTGGTAACGAGGCTTCTTTTCCCGTT CGCTGATTGGTTGGttgttcattattttttattgttttatttttaagaac tTTTGTGTTGGTTGATTGTAATTACCTTAACGGCCCTATTTCACGCTGGT CGTTATTATGCCAAAGCTCAATTTTTCTATGATTAGGCCGGCCTTTATTT AATTCTAATCCTGTACACCGGCCCTTGTTACGACAACGATGAAAAAATAA CGTTAATAAGGTCTGGCATAAAAAAGTCAGATAAGTTATTAGTTGTAGTC TGTTCATTATCATTCGGATAATAGTTAACAACTTTTAAGAAGTAGCAAAA CcaccattgaaaaaaaaatatgatagCGGACTATATATATGATTATAAAT TAAGCCCCATTTACATACAAACATTGTATAATAATGTAACCGATAGGGCC AAAGGTGGCCGGTAGGTGTTGACCGTACTACTGGCACTCGGCCCCATTTT AAGAATTAGCAACCTTTAAAGATTACTCTTGGGCGGAAGAGTCTATACTG AATCTCTTTGAAATGAAATAGTGTCACGAATTTTAAACTGATGCTTAGAC CAAGTCCACGCCCAAAACGTAACCCATTATTTTAATTGTTAACAATCATG TCGATGTTTTAGAgagataatttattttttagaatatttttttttcgtta ttttatGATGAATTTTATGGCATACCTTTGCAAGCAAACttggaaacatt tttttttatttttcaaaactttgataaAATCTTATAATGTAGCCCTTATA TATTCTTTTActgatgatgtaatgttttattttgttttaaatttcaatcC TCTATTTTAATAcaaacctttattatttttatatcaTATTCCACAGCTGC CGCTTCTCCCACAACCAGTAATCTTGTAGTAAATTAGTAAGTTACCAGTA AATTACCTAATTTTTAGcgaaaactaattttggcgaaaactatttttttg agagctttagaaaaaaattatgagttcTCCTACCTAGAAAATCATACTTA ATTTCGGCGAGGCGatattttttgctaattttgacGAAATTTGGTGAATT TTACCAAATTTGCAAAGATAAGTTCCCGCTAAAATCAGTTCCATTAAAGG TATTCaaaagattattttgaaattccttTATATCTTTAAGAATTCTTGAA TGATGctctgaaaaattttcttattcttCAGGAAATCCCAAAACACACTT AGTATAACTGAGTTCCCCAAAAATGAATTCTCTGAAGCAAATGTATAACT TACCCTAGTTTTTAATTTGCTAGCTCGGATAattttctttagttttattG AATAAAGGTGTATATATCTCAATAGCGGTGCCTTGTATCATAGACTTTTA TATTCGTTTTAAAACAACAAATAACAAATCAATTTGAATTGTATACAATA TAATTACCGTC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_201:390596..414766- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051411 ID=TCONS_00051411|Name=TCONS_00051411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=24171bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:390596..414766- (Clytia hemisphaerica) TCTTATGAGTATGGAACTTTTCTGGTCTGTATTTTGTGCTGTCGGATCAA
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TACATTCGTGTCGTGTACTTTGAAGAAAGAAATGCGTTTGAAATATCTTA
AAGAGAAAAGTTAAAAGGGTTCCTGCAAGGTGAATTTACTAACTTAGCGT
GGTATGCTTGGCAGGGGTTAAAGAACGGTTAAAGAACCATAACATCGTCC
CTACAGAGATTTAATTAGTTCCCATGGTTCTTGGATCGTGTAGAATTTTA
TCTTTTAGTGTTAAAGCATTGTGTGGTCGAGCCATGAAGGTAGGCTCACT
GCCACGAAGAGCAACTTTTGTCACGGAGTAAGCGGAGTTTGCAAAGGGCA
CTGTTTATTGCAACTGTTTTTTGTGTTGATTCACTACGTATACTTTTTGC
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TAAATAGTTTCTCTTAAGTTTATGGTGTGTTTGTAATTTTGTGTCTGTTA
TTTATGAACTAGACTCCCCTAGTAGAGGGTACATCAGAACGGTGAACCAA
TATTTTCTGAGCCCTTTTTTTGGAATTTCCTTACTAATTATTTTAACTTA
TCAAATGATTCAGCATTATTGAAAATATTAATATGAACTAATAAATACAA
TCACACAGTATATTGAAGATGTCGCAAACATTGCCCCGAAACCGTACGGC
GCCCCGCAGCGGCAGCCTTTCTCGTGAATTTACCATGGGAACTTTACAGA
GATCAGGAACACTTTCACGAGGGGAAAGTATCGATTCTGCAGGTGGCGAA
GGAGAAAAACAACGGGTATTTCAAATTTGTTTTATCGTTTTGTTTTATAC
TTTCCTTCTAACATAGGTATATTTGTGCTCTGAAAGCATCGAGTATATTT
GTTTGTGTTTGTTATGTCGTCAGTTTAAGATTTATTCGGTCAAAAAATTA
TAATAATTTCATATTCTATAAAGCTTGTTTTCTTTGATATATGGCCTTTT
ACACAGTACCTATTTCGTTCTTGAAAATTGAAATTCTACTTGAAATTTTC
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TTTCTGTATTAAGCCTAAAAATATTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCAT
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TAAAATGTTCATTACATTGTGGCTATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGT
TTGTTCTTATAAAAAAACATTTAGACCTTGTGACGAAATACCTTTTGATT
CGATGATGACTTTACCAAAAGCATACGTTGTTTCGAATTCGAAAAAAACA
GATCTCCTCAAAAAGATTTACTTGATGGGAAGAAAACAAGATTTAGGGTT
GACTTGTAAGAACATAAAGCGATTAAAAATGGCGGTCAAAAGAGTAAACC
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AGGTCACACGTCTTGCTAGGGCGAGAGCTTGCTTGCTTGCCTACTCAATT
TTCGCAGCATTTCATGAAAGTCTTTGCCTTGCAATATGTTGCTTCATTTG
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CACTATATTCTCTTGTGTGTTTTGATTTTGATGTTATTTTTTTGTAGGGA
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GACCTTTCATTTTGTTTGTTTAATGAAAGTTTGTTTTCAGTTTTACATTT
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AATTTCCAGTAAATATTTCATTTTAGCAGATTTTCAGGGTAGCCTTGCTT
ATTTCTAAGTAGATTTCACATAACCCTGATTTAAAGGTTTTGACTTCGTC
CCCAGGAAGAGGCTAAGAGGTTCTTTCTAGCAAACAAAGCCAAAGATGGG
AACGGGTTTTGAGTCTTTTGAATAATAATGCCTTGATACATCAAACTAGA
TGAACAGAAAATCCTTTTAATACTAAACATCTTAGACTAACGAGACAAAT
ACTCATTAGTATTCCTTTTTGAATGGAAAGCTTAAAAGTTCAAAACTATG
ATTAAATTTTGAGGGTTTTTGTTTTCATAACATTTTCTTTCTCCGGATCC
CTTTAAAAATGTCAGCTGATTGGGTTTTGGCAGTAGTAAATAGTTTCTCT
TAAGTTTATGGTGTGTTTGTAATTTTGTGTCTGTTATTTATGAACTAGAC
TCCCCTAGTAGAGGGTACATCAGAACGGTGAACCAATATTTTCTGAGCCC
TTTTTTTGGAATTTCCTTACTAATTATTTTAACTTATCAAATGATTCAGC
ATTATTGAAAATATTAATATGAACTAATAAATACAATCACACAGTATATT
GAAGATGTCGCAAACATTGCCCCGAAACCGTACGGCGCCCCGCAGCGGCA
GCCTTTCTCGTGAATTTACCATGGGAACTTTACAGAGATCAGGAACACTT
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GGTATTTCAAATTTGTTTTATCGTTTTGTTTTATACTTTCCTTCTAACAT
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TGTCGTCAGTTTAAGATTTATTCGGTCAAAAAATTATAATAATTTCATAT
TCTATAAAGCTTGTTTTCTTTGATATATGGCCTTTTACACAGTACCTATT
TCGTTCTTGAAAATTGAAATTCTACTTGAAATTTTCTTTACAACCATAAA
TTGAATAACATACAAACCGTAGTACACGTTTTTTTTTTTTTTATAAAATA
TTCAAAAATTTTTAAGCCCTTGGATGTTTTTAACTTTTTCTGTATTAAGC
CTAAAAATATTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCATTTTTGACCATTTTC
CTAAGAAAAAGAGTGTTTTAGAGTCCTCAAAGTCTTTAAAATGTTCATTA
CATTGTGGCTATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAA
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CCAAAAGCATACGTTGTTTCGAATTCGAAAAAAACAGATCTCCTCAAAAA
GATTTACTTGATGGGAAGAAAACAAGATTTAGGGTTGACTTGTAAGAACA
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TTGACTTCATAAATAAACCTGTTTGCATAAGATTTTTTTATCTGTAGTAT
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GCTAGGGCGAGAGCTTGCTTGCTTGCCTACTCAATTTTCGCAGCATTTCA
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TATTCTATAAAGCTTGTTTTCTTTGATATATGGCCTTTTACACAGTACCT
ATTTCGTTCTTGAAAATTGAAATTCTACTTGAAATTTTCTTTACAACCAT
AAATTGAATAACATACAAACCGTAGTACACGTTTTTTTTTTTTTTATAAA
ATATTCAAAAATTTTTAAGCCCTTGGATGTTTTTAACTTTTTCTGTATTA
AGCCTAAAAATATTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCATTTTTGACCATT
TTCCTAAGAAAAAGAGTGTTTTAGAGTCCTCAAAGTCTTTAAAATGTTCA
TTACATTGTGGCTATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATA
AAAAAACATTTAGACCTTGTGACGAAATACCTTTTGATTCGATGATGACT
TTACCAAAAGCATACGTTGTTTCGAATTCGAAAAAAACAGATCTCCTCAA
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TATTGTAGGTAAAACTATCTGACGGTTTGATGAACCTGCTTCTCGAAATC
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AAAGTAGGCTCATCTTTAGCAGGCTGTACATTGAACTGTAGGTCACACGT
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ACGAGGCTATATTCATCAACTTCATCCTCCAGGCTACGAATTAAAATCCA
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TTCATCTTCTCACTTTTCAAAACATTTCTTTTCATAATATAATAACTGAT
TTTTCAAAGCATTTCTTCATTTAAACAGACTTTCTGTTTGTAAAAAAGTT
GATATTTTTTGACGTTGCCTGTCTTATGACGAAGCTTTAATGTCCTCTTA
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TCTAAATGCGAAGGTTCAAGTAACAAGAAATCTTGAACAACTTTGTGTTC
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CTGATCACTCAACACTTTTCAGAAAATACATCAGCATTTTTTGACAGATT
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CTTTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATTCATTTCATCATGGATATTTTTA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_201 | supercontig | scaffold_201:390596..414766 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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