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transcript sequence >TCONS_00047915 ID=TCONS_00047915|Name=TCONS_00047915|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4236bp TGAATTAATTAGAATACTTTTTGGTTTTTTCTCTGTGTGTGGGATGATAT GAGCATCCAAAAAGGCTTAACTGCCGCCTTCCGCATTTCAACAAATGGGA TTACATATGGCTTCTGATCATGGTAATATGACGTTGTGGTTGAAAATCAC TTTACTGGTATTAAACTTGGCAAACTCAATCCTACACGGAGTTGGAATCT ACCTCCTTGTTACGTTATTCCCACAATCCAGGTTCAAGATTCAACAACGG TATCTGATCCACTTGAGTGTATGTGAATTCACCATAAATACTTTAGAAGT CATCAACATCTTGAATGGATTTGTGGAATACAGCCCTGATGTACAGTCTA AAGTGGATGAAGTTTTTCATTACGTTCTCATTATACAATTCACTGGTGTA TCACTTGTTTTCTACTTGGATATGATCTATTTGACTTTGGACAGACTTTT CGAGATTGTGTTGAACATCAAATATCCTGTATACTGGAGTGAAGAAAAAG CAAGGAATCTGTTGATAGTCACGTGGATTATATCCGGATTAANCGAAGAA AAAGCAAGGAATCTGTTAATAGTCACGTGGATTATATCTGGATTAATCAC CGTTGCAATTTGTGTTGCCCGTGGATTAGTTGGATGGGCTTGGGAGCCTG TTATTTTCACATATTTCTTTCCAACAATGGAGTTTCTATTCGTCATCCTT GCCATTACAACctacattttcatcttcaagaAATACAAAATCACCAGAAT CTCACCAGCACCTAACTTGGAGATTCTGAAACTTTCACCGAAGACCAGGA AAAGACGACGCAGCTCTTTCTACATCTTCCGTAGATCGAAATTCTTTATT CCAGTTCTACTGATCTTGACTTTCATGGTTTTTATGGTTGGTGCAGATCT GACGTTACTTTTTGTCGGGGTCATTCAAGGTAATGACAGCCTTGAGTTGA GAACAGCTGTTTTTATCTCTTACGCTATATCTAATCTATTCGACGCATGG ATCTATATCTTCCTTCAAAAAGACGTCAAGAGACTTTTGTACAAGAAACT GGGACTAGTTTCAGCATCCAATCAGAACACAGCTGAGACATCATTCCAGC TTCCTGCAGGCAAACGATATAGTGTCAACTTCCCATCAGTTTATAATGGT CGAGTTAATTCGACACCTGTTGCCAGCCCTGTTGCTAGCCCAATAATGAC AAATAGGACTGCTAAAAGACACAAAGCTGATCATTTGGAGATACCCAGTT GATTGGATGTTAAAAATTCTTGTACGTTTTGAAAGAAAGGAATATTTGCT TAACAAACGATGTGAAAAAAAGAACTGAATCTAAAACTTTGCagtataaa attgaaaaatgaagtacTGACTCTGATATGACGGTGATTGTCCATTTTCT ATGAATTAAGGATAAACCTCTAGCTTCTTATACCTTAaggaaacttattt tggcggaaactaattttggcgaattcggcgaatttagaaaaattcatcat tcgccaaaattaaaaattttcaggatttttgcaGCTCGTCAAAATATACC CGCCaaaaaaaagttcccttaaggtacctgTGGGACTATAACATTGATTA TTGCTTGCGTTGAGCATGCCCTTATTTGAGACGTGATTGTGGTGCTAACC TTTATATATTTCATTATTTGGGTAGCCTATAATAGATGCCACGACTTTTT TTCTGCGCAGTAACGTCTATTCTACTTTGCGGCTATTTCGAATGTTTGGA ACATAACATTACCCgttatttgattttattatttaggTAGCTTTTACTGG ATAAAAAATATACTGACATACGCGGACGTTTTATGTCAGCGTGGTAGCCT CAGACTTAGCCTGGTTTTCTTAGTATACCATAATTTGTAAATCTTAGCCT TAATGTTAATGATGTGATATCTTAAAtaaatagaatttcattttatattt tacaatataAGAACAAGCAATCTAGCATATTCTAATATTTCAATACTTAT CCAATGAGGAAAGTTTTTGCAATTTGTGCAACATATAGGATCCACTAGAA CACTAATATTATAGTTTGATGATGGGGTAGTTTGCAAGATCTAGGGTTAG CTCAAACAATTCATttagattttgttaaaaataagaCGATTGAAACTCCA AAAATGACAAGAATATGTACATCGATAAAAGCcaacaaaaaaaatacatt aTTCGATAAAATCTACATCctgatattttaaattcctaGTTAAATTTCTA TTTACAAGAGCTGTGTGCTCATGAGCGGTCTCCAAATATCAAACTGTTCA CCAGGAGGCTAATCCATTCAGCTTTTTTATACAGAAAGTTGCATTGTGGA GCATTAAAGATATCCAGTTGAGATTATCAAAACTGAGAAAAATTCGCGTT cctttaaaatgtcattttacaATTGACAATTACAAGTAACGAGAATTTTG TTGCAATTGTATCTCTGGCCTCTTCTTTTAAGACGGACTTACATCCTATT CAACCTTCCTAGGGAATAGAAAAGTTTTAAACTTTCTGTAATAATTTCGT TTGACGTCAACACAATTTTCACTATTACAAAATCCTCAAAGTCTTCGTGA AAATTACGATTTGAATGTATCTTTTGCAACAGTTCTTGCAGCTGCTCTCG TGTGAGGTAGATACTTCATGGTGTCGCACTTCACAAATCCCCAAACTCAG AGTTATCCTCTTTGCCTTCTTTCTCTCGCTAAACCAATTCAAGAGATTTT TAATATATCATTCATTTGTCACCAGCTTTTTGTAAGAAGATACTTTCTTC ACCACATGGAGAAGATCCACCTTTTTCAGAAGTTGAAGCTGTGGAAACAG ATTCCTGTGTTCTAAGTTGAGAAGCTTTTCTTCTGTTCCTCATATATTCA ATAAAAGATGGTGTCAAAGCACCGACCAATATTCCAACCACAAAGAACAA AACCACCAAGACTGGTACTAGAATTTCCCAATTAACTTTACCATCACTAT TATACTCATCTGAGACTTGGGGTTGTTTAACCTGTCTCCTTTCAATACAG CGATTAATTCTCTCATCTCTATCCTTACAGATCTGATCGTCATTTGAACA AACTTCCACTTTGAAGAACATGTGTTNCACTTTACCATTACTATTATACT CATCTGAGACTTGGGGTTGTTTAACCTGTCTCCTTTCAATACAGCGATTA ATTCTCTCATCTCTATCCTTGCAGATCTGATCGTCATTTGAACAAACTTC CACTTTGAAGAACATGTGTTTAGTGGAGGCTGAACCACTATCAACTCCTA GACTAGCTTCAGTGCCGTTGCTGGTTGTATAGAAGTAATAAGTATGTCCA GCCTTAAATTCCGGTTGGCTTGATGATGCCCGAATCGGGGAAAACTGGAT TCGATATTTATCAATGACAGATAGTTGTAGACCATTTTGGCCCAATGTTT TATGTTCACGACATATGAAAATTGTGTCAGCCTCTTTATTTCCTGTACGT TTTTTGCGCTCTTTGAATAGTTCTTTATCCTCAGTCATTAAAAGATTATA GTTGTATTTCGACTTCGATCTACTCATCTTGTCCAAGATAGCGTTATTTA AGTCACGATTTGGGCAGATAACGTTCATTGTATCAAACTCTTTAACATAG ATAGTTGTAGAAACTGGAAGACATTTCTTCGTATTAAACATTGGCTCGTC CGGATGCCAATAAACGTCCGGTAATTGAATATTCTTTTGAAAAGTGTCCG TAATGAAGGTGGTGAGGGATAACGTGTAGAATACTATCAACTTCATAATG ATCATCAAATTTGCTCACTCAGCTATCGctcctttctttcttttgaatca atccaaatatttcttttattaaTTCAAATTTTGTCGCACTAGCATTCAAG GTATCAAAACCAGGAAATCTAGACGGATGGTGCGTTCCAATATTAACGTC TGCTATTTCTCGGAgctgatttctcgtgtactTTTGTCTTCCCTCTCtgg atcaaaaactgagcaaaaacCAAGAAATTCCTGATCAAAACCAATTCTTT TTCAGTATTGtggatataatatttcataAGTATCAGAAGGTTATCATGTC TATAACTTGTCCATTCGCATGACACAATTTGTTGTTTTCTCTGTGTTTGT TATCCTGAAAAATTCAAATAGAGAAAATAATTTAATCTGAAATATGACAA CTTTGGCAGCCTTTTAACACTCTTGGGAGGTATAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_139:322513..331964- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00047915 ID=TCONS_00047915|Name=TCONS_00047915|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9452bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_139:322513..331964- (Clytia hemisphaerica) TGAATTAATTAGAATACTTTTTGGTTTTTTCTCTGTGTGTGGGATGATAT
GAGCATCCAAAAAGGTAAGATTTTCACTTTAGACTACGGGTGCTTTTACT
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AG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1575043694:331901..331964 | TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1575043694:331901..331964 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1510915933:322513..326684 | TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1510915933:322513..326684 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1491911889:331901..331964 | TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1491911889:331901..331964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1491911889:322513..326684 | TCONS_00047915-exon-scaffold_139-1491911889:322513..326684 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_139 | supercontig | scaffold_139:322513..331964 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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