TCONS_00046592 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00046592
Unique NameTCONS_00046592
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length7690

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00046592 ID=TCONS_00046592|Name=TCONS_00046592|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7690bp
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CGAAGAGACTTTAATAATGTAAAATTTCCCCTACCTTATTGGAGATTGTT
GTCGTTTTGCTTGTTTCACTTCTTCGTTTAATTGGTGGATTTCATCAAGT
TGGTCTTGATATCGTTCATAATTTCTGGCAATCTCTTTTTCCAGTTGATC
CACCTGCATGGTGAGAGCTTCAACTTGCTCATTCAAATCCTGGTTCATTA
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GCAATCTTTTGGTCACGTGAATCCTCgagatttttcatctttttaatcaa
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ATGAACTTTTACATTGTTCTAACGAATCCTCAAgagttttgatcttttta
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GGTCGATGAATTTTCATATTGTTCTAAGGAATCCTCAagatttttgatct
ttttaatcatcattttgattttgttgtcaCGGGACTCTAGACCTTCGCTC
TGATTGGCTGATGAACTTTCACATTGTTCTAATAAATCCTCAagattttt
gatctttttagTCAACATATTGATTTTATTGTCACGAGACTCTAGACCTT
CGCTCTGACTGGCTGATGAATTTTCACATTGTTCTAATGAATCCTCAAGA
TTTTTGATCTTTTTAATCAACATTTTGATTTTTTTGTCACGTGACTCTAG
ACCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAACTTTCACATTGTTCTAATGAATCCT
CAAGATTTTTGATCTTTTTAGTCAACATATTGATTTTATTGTCACGAGAC
TCTAGACCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAATTTTCACATTGTTCTAATGA
ATCCTCAAGATTTTTGATCTTTTTAATCAACATTTTGATTTGGTTATCAC
GTGATTCTAATCCCTCGCTCTGGTTGGCTGACGAAATTTCACACTCTTCC
AATGAGCTTTCAAGATTTTTTATCTTTTTATGCATTATTCGAATTTGGTT
GTCACGCGATTCAATATCTTGACTCTGATTGATCGAAATCTCTTCTTGTT
TTTCGAGCAGAATTTTGAATTCTCTGACTTTTTCGTTCAGGGACGAAATT
CTTTGATCACGTGACTGAATATCTTGATTCAGATTGGTTGATGAATTTTT
GTATTTTTCCAAAGAGTTTTCAAGATCTCTTATTGTTTTATTCATTATTC
GAATTTGGTTGTCACGTGATTCAATCTCTTGACTCTGATTGGCTGAAATT
TCTTCTTGTTGCTTAAGGATGACCTTCAGCTCTTTCAATTTTTCATTCAA
TGACGTAATCCTTTGGTCACGTGTTATTACATCTTGTTCGTGATTGGTGG
AAATTTCTTGAACATTCTCAGTGTTGGTATTGTTCAGTTTCTCAATCTCC
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ATTGGTAGAGAGCTCTTCTGTTGTTTCCTTGTTTTGAGAATTCAGTTTTT
CGATTTCATGTTTCAGGGTGTTTATATGTTGATCACGTGTCTCCAACTCA
GTTTGGTGATTTGCTGAAAGCTGACGAACTGCTTGCTCATTGGTTAAATT
ATTTTGCAAAGCTTCTTTTAAGCTTTCAACACGATCTTCCAAAGAAGAAA
TCATCTTATCACGGAATTCAATTTCTCTTTCAAAAGCCGCTTTTTCTGCT
CgttcatttttcaaacttttcaaattttgaacttGACTTTGAagattgaa
tattttttcatcaCGTGATTTCAATTCAGAGTTTTGATTGGCTAATAGGT
CCTCTACCTCATCATCTGGGACACTTTCGACAATCTTATCTCTGAGTCCA
TCCACCTGTTTCTTCAAGTCCATAACCATAAGATCACGTGACTTTAATTG
GGAAACGTGTTTATTGATCAATGAATCAATTGCAGATTGTGGAATCGAGT
TCACTTCCAGCGTTATGTTCTCATGCTTCAGTTGGTCGACTTGTTTTACT
AAATTGTTCTTCTCCTTATCCAAAGTTTGCATtttatttgaataattttc
caTGAAGTGATTCAACTCTTGTTTATAATCTTCAACCACGTCACCTGAAG
CCGAATAGACTTTCTCCTTCAGTTCTGCATTCTCACGCTTAAGCGCTTGG
ATGGTGATCGATTTCAATTGCAGTTCATTTTCATGAATGGAAGCCATCTT
GTCTAAGTCTCGTTGTGAAACTTGTAAAGCCTCGTTCTCATCCACACTct
gcctcgttttcaaattcaacataCTATTATGTAGTTTTCGGATTTCCATA
TTTAAGATATTGATGCGTTTATCTTTCTTTCGTATTTCAGTTTGATGTTC
CAACAGGGTGCGGTTAATTTCTTCACTTTTATCGGCCAACTGGGTCTGAA
TAGATTCGGACAGTTCTGTCAATTTGAATTCTAAATCTTCATTTTGGCGC
TTAAGTCTTTCTTGTTGTTCTTCTGAAAAACGGAACTGTTTATTCAAaca
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TTAAAGATAATTCATCTCGTTCTTGCCTGAGTGAAGAGTTCTCTTCTCCC
ATTTCGGACACTTTTTGTTCGCTTTCTTTGAAATGTGAAGCATCATGCTT
AACACGCAGGTAATCTTTCTCAACGGCTCGTAATTTCTCTTTCAGTTTTG
TGTTGTGGTAAGTGAgatcagattttgaatttttcaagtcTTGAATTCGC
TCTTCGATCTGTACAACGTATCCTGATTGGCTGTTGTTTTCCTTACGCAG
CGAGCGCAATTCCTCTGCTTGTTGAGTTAGACTAAGTGCCATTTCTTCAT
TCTCCTTCTTTAGTTTCTCATTGATAAGAACTATTTCAGTTTTCTTGCTT
CTGAATTTCTCATTTTCTTCTCGTGTCAACTTTTCGCTTGTTTCTAATTG
CACCATTTTGACGTTTCTTGCAAGGTCAGCATTTTTGATTTGGTGTTGTA
AATCCTCATTCAGTCGAGTAAGCTCACCATGTTTTTGTGCCCAGACTGCT
AGAGTCTTGGCATGTTCAATCTCCATGCTTTCATTTTTGGTTCTCTCCTC
TTGCACCTGCTCGCATAGCTTCTTTTCCATCTGAGCTCGTTTTTCCATTA
ATGCTTGCGCTTCGCGTGTCATTTTACTACACTTCTCTTGATAAATGATA
GACTGAATTTCAGCATCGTGGATTTTGTTTTTACAAATATCTAGCTCTGA
AACAAGGCTTCTTCTCTCATTTTGCCAATCTAGTCCACCGTCTTGTTTCT
CGGTTTGTAATTGTTTTGATATTCTAAGTTGTTCGTGAAGATTTTCACGG
ACGTTCGTAATTTCACTTTTATAATAAGTGATTTCCTTTCGAAAATCATC
AAACTTCGTTTTCGCTTCTTTGGTATGCTGGTCAGCTTGCTCTGTCAGGA
AAGTGACTTgcgatttcaaattttccttttctttgttCAAACTTTTGACA
GTGGTTTCTAGCTTGAAAATTGCTTCCCCTGATTTCCTTTTCTCAGAACT
TTCACCGGATAAGATTTCATCTAGGTTCTCGTTCAGTTCTTTATTTAGAC
GAGTCAATTTCTCGACCTCACTTTTCAAATTACGATTTGAAGCTTGGATA
TCGGTAGAATTTCTCAAATCTCgtttcaaaatatcaatttgAGTTTGATA
GTCTGTGGAAGTGTCTCTCAACACTTGTTCCGCGTCATGTTGGTATTGTG
TTTCTTTCTGACGAAATTGGCGCTCCATATCGTTTCTCCTTTTCTCGCAG
TGGCCGTGCTCTTTCTTCAAAAATTCATATTGTCCGTTCAGCTCGAACTT
TTCGTCTTGAGATTTCTCCAGTTCTCGATGGAAGCTTTCCAATTCCATTT
GATGAATCTTTTTATCTGCATTAGAGCGTTGTTCTAGCCTAGTATGGTCT
TGAAGCAAGCATTGATGTTTCTTTTCAAGCAGAAGGAATTTTTCACTGAC
CATCAATTTGTCTCTCTCTTCTTTTTCCAGATCGCCCCTCAACTCGTCAA
TTCTcagattgaaattttttctcaaatcttcAACTTCTAGACCTTGTAAT
TTCATTTTATTGATCTTATCATCTCTCTGCTTTAACAGATTCTCAGACTT
GCTCAACTTATTGGTACTTTCCTTTAACGCTATCTTGTAATTGTTTTCAT
TTGCTAAAAGCTCTTCAATCCTTGATTTGAAAGATTGCGTCTTTTCTCGA
AGGACATTTTTTAGCTCAATAAAGGAAGCCTGTGACGCATCACGCTCAAC
TTTGAATTTATCACAATTTGCTTGAAGGTCTCTAATCTCCAACGTGAGCT
GGTCTTTCCTGTTCTCCAAAATGTGATTGTTGTCATGAAAACTCCGTGAT
TCACTTTTCAAAATGCGTGTCTGCTCCTCCAAATGTCTCAGTGTATCTTT
CTTGTCTTGCAATTCCTTTTTGGCTTGCAGCAACTTGTCTTCAAAGTGTT
TCTTACAGTCTTTAGACTCTTGGCGAACCCTGTCGCACATATCTTGTAAT
GACTTTGTTTCTTTCTTGAACTCATTCACTCTTTTCTCTCGTTGCTGCAA
CCTGGACATTAACCCATCCTTCTCTTGTGATAGTCTTTGTAATTCTGCTT
CAGAAGCGCTCGCATGTTTCTTGAATTCCATTTTGCTTTCACGTCGTAAT
TTANTTCTCAGACTTGCTCAACTTATTGGTACTTTCCTTTAACGCTATCT
TGTAATTGTTTTCATTTGCTAAAAGCTCTTCAATCCTTGATTTGAAAGAT
TGCGTCTTTTCTCGAAGGACATTTTTTAGCTCAATAAAGGAAGCCTGTGA
CGCATCACGCTCAACTTTGAATTTATCACAATTTGCTTGAAGCTCTCTAA
TCTCCGACGTGAGCTGGTCTTTCCTGTTCTCTAAAATGTGATTGTTGTCA
TGAAAACTCCGTGATTCACTTTTCAAAATGCGTATCTGCTCCTCCAAATG
TCTCAGTGTATCTTTTTTGTCTTGCAATTCCTTTTTGGCTTGCAGCAACT
TGTCTTCAAAGTGTTTTTTACAGTCTCTAGACTCTTGGCGAACCCTGTCG
CACATATCTTGTAATGACTTTGTTTCTTTCTTGAACTCATTCACTCTTTT
CTCTCGTTGCTGCAACCTGGACATTAACCCATCCTTCTCTTGTGATAGTC
TTTGTAATTCCGCTTCAGAAGCGCTCGCATGTTTCTTGAATTCCATTTTG
CTTTCACGTCGTAATTTACCCACCACTTCTTCGAAGTTCGCTTCAGCGTT
CGTCTTCAACTTCTTCATTTCTTTCAATTGTGTTTGAAGTTTTTCGATGG
AAACATTTTTCTCTTTAACCTGTTTCTTCAACtctatcttctgattggct
aCTTGTTTTAACAAAGAGCTTTTCTTCTCTTGTTCATTTAACCAATTAGA
ATTCGTTTGGCAAGCGCTATTAACAGTCATTGGATGAGGTGTCTGTATGC
CTTTATTCTCATTCCCAGACCTTTCACCACTGACATTGGACTCCTGCAAC
CACTTGCTGACTTTCAAATTGCTTTCCATATTTTTAACTTTGACTACATT
TTCTTCTTCCTTCGTTTTTGCGTTTTTGAAAGAAGTCCATAACGAGTTCC
AAACCCCTTGATTTTCTTCTGTTTCTTTCACCTGCGGTGTCTCTATCACT
GTTTGACACAATTCTTCAGTGTTTCTGAGATCGTCACTCGACTCGGCAGC
CAAAGTATCTAATGTATCGCACTTTTTCAAAAACGATTTTATACTGCTCA
ATTTTCTTCCAGGTACCGCTTGTTGTAGAAGGTGAGCTGTTGAAGCACTA
GCCTGGTCGGTAtcagattttgattttttcaatttagaaACACTACTTTG
TAGTTCAGTATTTAGTCCGATGAGAGATCTCAATGTGTTTGCATCCAGTA
CTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACCGTTACTGTGG
AGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGTTTGCATCCAG
TACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACCGTTACTGT
GGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGTTTGCATCC
AGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACCGTTACT
GTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGTTTGCAT
CCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACCGTTA
CTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGTTTGC
ATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACCGT
TACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGTTT
GCATCGAGCAGTTTAGAGCCAccttttgtagattttctttGGTTGACTTC
TTGTGTTTCTGTTGAAAGTTTTGGATTGGAAACCTTTTGTTGGACTGTAT
CTGGATGGAATAACAGGCTCATTGTGTTGGGGCCCAATAGTCTGGAACAA
GATTTAGTTGGATTTGGAACATGTCTAGTTGACCTTCTTTTACTATTGGC
TCCCTTCCCTTTAGTGAGAAGGTGTGACGTTGAAACACTTTTCATGTTCA
CTTCAGTGTTACTTTGAAGATCAGTATCCGATTGAAGTAATGCGTTCATA
GTACTGGCGCTTATCAATTGAGAAGAAGTCCTTTTTGATTTTGGCCCTCT
ATGGATTATTGTTGTAGTCGAATCGTTATCTAACTCAATATCGGTATCAG
ACTGAAGCAATGCATTCATAGTACTTGCACTAAGCAACTGTGCACTGGTC
CTTGATGACTTTTCTTTACCAGGTTCTTGCCCTTGTGTTACTAGGTGTCC
AGATAAGAGGCTGGTGTTACTATATAGATCTGTATTTGAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_114:15902..23801-

Legend: exon
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>TCONS_00046592 ID=TCONS_00046592|Name=TCONS_00046592|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7900bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_114:15902..23801- (Clytia hemisphaerica)
ATCTCTCCCACAAGACTCGACCGATTACCGATTTCGTTTACATTGGCATT
CGAAGAGACTTTAATAATGTAAAATTTCCCCTACCTTATTGGAGATTGTT
GTCGTTTTGCTTGTTTCACTTCTTCGTTTAATTGGTGGATTTCATCAAGT
TGGTCTTGATATCGTTCATAATTTCTGGCAATCTCTTTTTCCAGTTGATC
CACCTGCATGGTGAGAGCTTCAACTTGCTCATTCAAATCCTGGTTCATTA
CTTTACACTGGGCTAGCTCTTTACCGGCCTGGGTTCGAGTTTGCTCTCTA
ATAGCCTCTCTAAGTTTTTTCTCAAGCTCTTCAATCTTCCTTTGATTGTC
TGAATCGTCTCTTTCTAATTCTTGAATCTCATTGGTCAATCGTCGAACCT
TTTCATCGCGTGATTTCAAATCTCTTTTCTGATTGGCTAACATCTCTTCA
ACCTCGTTTTGGTGCTCATCTAATTGTTTTCTCAGTGACGTGATCAGTTT
ATCACGTGACTTCAAATCACCACTTTGATTGGATGAGACCTCTTTCGATT
CTTTAATGGAATTTTTTAATTGGTCAATTTTGGCTTTCAACAATTTGATT
TCATGATCGCGTATTTGAAGATCTTGTTCTTGTGAAACTGATGTGTTTCC
ATTCTCACTGAGAGAGTTTTCCAGCCCTCTGATCTTTTCGTTCAATAGCG
CAATCTTTTCCTCTCGCAATTTTAAATCCTCCTTCTGATTGGTCGAAAGA
TTCTCATAATCTTTGAGAGAAGTTTCTAACTTTCTGATTTTCTCACTCAT
ACATTTCCTTTCAGATTCAAGTTTTTCATCAATTTCCACTGATACACCTT
CTTGCTCTTTTAACGAAGTTCTTAACCGTTTAATTTCATTGTTTAATGAT
GCAATCTTTTGGTCACGTGAATCCTCGAGATTTTTCATCTTTTTAATCAA
CATTTTGATTTTGTTGTCACGTGACTCTAGACCTTCCCTCTGATTGGTTG
ATGAACTTTTACATTGTTCTAACGAATCCTCAAGAGTTTTGATCTTTTTA
ATCAACATTTTGATTTTGTTGTCACGTGACTCTAGACCTTCGCTCTGATT
GGTCGATGAATTTTCATATTGTTCTAAGGAATCCTCAAGATTTTTGATCT
TTTTAATCATCATTTTGATTTTGTTGTCACGGGACTCTAGACCTTCGCTC
TGATTGGCTGATGAACTTTCACATTGTTCTAATAAATCCTCAAGATTTTT
GATCTTTTTAGTCAACATATTGATTTTATTGTCACGAGACTCTAGACCTT
CGCTCTGACTGGCTGATGAATTTTCACATTGTTCTAATGAATCCTCAAGA
TTTTTGATCTTTTTAATCAACATTTTGATTTTTTTGTCACGTGACTCTAG
ACCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAACTTTCACATTGTTCTAATGAATCCT
CAAGATTTTTGATCTTTTTAGTCAACATATTGATTTTATTGTCACGAGAC
TCTAGACCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAATTTTCACATTGTTCTAATGA
ATCCTCAAGATTTTTGATCTTTTTAATCAACATTTTGATTTTATTGTCAC
GAGACTCTAGACCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAACTTTCACATTGTTCT
AATGAATCCTCAAGATTTTTGATCTTTTTAATCAACATATTGATTTTATT
GTCACGAGACTCTAGATCTTCGCTCTGATTGGCTGATGAATTTTCACATT
GTTCTAATGAATTCTCAAGATTTTTGATATTTTTGATCAACATTTTGATT
TGGTTATCACGTGATTCTAATCCCTCGCTCTGGTTGGCTGACGAAATTTC
ACACTCTTCCAATGAGCTTTCAAGATTTTTTATCTTTTTATGCATTATTC
GAATTTGGTTGTCACGCGATTCAATATCTTGACTCTGATTGATCGAAATC
TCTTCTTGTTTTTCGAGCAGAATTTTGAATTCTCTGACTTTTTCGTTCAG
GGACGAAATTCTTTGATCACGTGACTGAATATCTTGATTCAGATTGGTTG
ATGAATTTTTGTATTTTTCCAAAGAGTTTTCAAGATCTCTTATTGTTTTA
TTCATTATTCGAATTTGGTTGTCACGTGATTCAATCTCTTGACTCTGATT
GGCTGAAATTTCTTCTTGTTGCTTAAGGATGACCTTCAGCTCTTTCAATT
TTTCATTCAATGACGTAATCCTTTGGTCACGTGTTATTACATCTTGTTCG
TGATTGGTGGAAATTTCTTGAACATTCTCAGTGTTGGTATTGTTCAGTTT
CTCAATCTCCTTTCTCAATGACGTAATCTTTTGATCACGTGAAGAGATTT
TTGTCTTGTAATTGGTAGAGAGCTCTTCTGTTGTTTCCTTGTTTTGAGAA
TTCAGTTTTTCGATTTCATGTTTCAGGGTGTTTATATGTTGATCACGTGT
CTCCAACTCAGTTTGGTGATTTGCTGAAAGCTGACGAACTGCTTGCTCAT
TGGTTAAATTATTTTGCAAAGCTTCTTTTAAGCTTTCAACACGATCTTCC
AAAGAAGAAATCATCTTATCACGGAATTCAATTTCTCTTTCAAAAGCCGC
TTTTTCTGCTCGTTCATTTTTCAAACTTTTCAAATTTTGAACTTGACTTT
GAAGATTGAATATTTTTTCATCACGTGATTTCAATTCAGAGTTTTGATTG
GCTAATAGGTCCTCTACCTCATCATCTGGGACACTTTCGACAATCTTATC
TCTGAGTCCATCCACCTGTTTCTTCAAGTCCATAACCATAAGATCACGTG
ACTTTAATTGGGAAACGTGTTTATTGATCAATGAATCAATTGCAGATTGT
GGAATCGAGTTCACTTCCAGCGTTATGTTCTCATGCTTCAGTTGGTCGAC
TTGTTTTACTAAATTGTTCTTCTCCTTATCCAAAGTTTGCATTTTATTTG
AATAATTTTCCATGAAGTGATTCAACTCTTGTTTATAATCTTCAACCACG
TCACCTGAAGCCGAATAGACTTTCTCCTTCAGTTCTGCATTCTCACGCTT
AAGCGCTTGGATGGTGATCGATTTCAATTGCAGTTCATTTTCATGAATGG
AAGCCATCTTGTCTAAGTCTCGTTGTGAAACTTGTAAAGCCTCGTTCTCA
TCCACACTCTGCCTCGTTTTCAAATTCAACATACTATTATGTAGTTTTCG
GATTTCCATATTTAAGATATTGATGCGTTTATCTTTCTTTCGTATTTCAG
TTTGATGTTCCAACAGGGTGCGGTTAATTTCTTCACTTTTATCGGCCAAC
TGGGTCTGAATAGATTCGGACAGTTCTGTCAATTTGAATTCTAAATCTTC
ATTTTGGCGCTTAAGTCTTTCTTGTTGTTCTTCTGAAAAACGGAACTGTT
TATTCAAACATTTCTTTTCCTTTTCTAACAATTCCAGATTTGTGCGACTT
TTCTTAGCTTTTAAAGATAATTCATCTCGTTCTTGCCTGAGTGAAGAGTT
CTCTTCTCCCATTTCGGACACTTTTTGTTCGCTTTCTTTGAAATGTGAAG
CATCATGCTTAACACGCAGGTAATCTTTCTCAACGGCTCGTAATTTCTCT
TTCAGTTTTGTGTTGTGGTAAGTGAGATCAGATTTTGAATTTTTCAAGTC
TTGAATTCGCTCTTCGATCTGTACAACGTATCCTGATTGGCTGTTGTTTT
CCTTACGCAGCGAGCGCAATTCCTCTGCTTGTTGAGTTAGACTAAGTGCC
ATTTCTTCATTCTCCTTCTTTAGTTTCTCATTGATAAGAACTATTTCAGT
TTTCTTGCTTCTGAATTTCTCATTTTCTTCTCGTGTCAACTTTTCGCTTG
TTTCTAATTGCACCATTTTGACGTTTCTTGCAAGGTCAGCATTTTTGATT
TGGTGTTGTAAATCCTCATTCAGTCGAGTAAGCTCACCATGTTTTTGTGC
CCAGACTGCTAGAGTCTTGGCATGTTCAATCTCCATGCTTTCATTTTTGG
TTCTCTCCTCTTGCACCTGCTCGCATAGCTTCTTTTCCATCTGAGCTCGT
TTTTCCATTAATGCTTGCGCTTCGCGTGTCATTTTACTACACTTCTCTTG
ATAAATGATAGACTGAATTTCAGCATCGTGGATTTTGTTTTTACAAATAT
CTAGCTCTGAAACAAGGCTTCTTCTCTCATTTTGCCAATCTAGTCCACCG
TCTTGTTTCTCGGTTTGTAATTGTTTTGATATTCTAAGTTGTTCGTGAAG
ATTTTCACGGACGTTCGTAATTTCACTTTTATAATAAGTGATTTCCTTTC
GAAAATCATCAAACTTCGTTTTCGCTTCTTTGGTATGCTGGTCAGCTTGC
TCTGTCAGGAAAGTGACTTGCGATTTCAAATTTTCCTTTTCTTTGTTCAA
ACTTTTGACAGTGGTTTCTAGCTTGAAAATTGCTTCCCCTGATTTCCTTT
TCTCAGAACTTTCACCGGATAAGATTTCATCTAGGTTCTCGTTCAGTTCT
TTATTTAGACGAGTCAATTTCTCGACCTCACTTTTCAAATTACGATTTGA
AGCTTGGATATCGGTAGAATTTCTCAAATCTCGTTTCAAAATATCAATTT
GAGTTTGATAGTCTGTGGAAGTGTCTCTCAACACTTGTTCCGCGTCATGT
TGGTATTGTGTTTCTTTCTGACGAAATTGGCGCTCCATATCGTTTCTCCT
TTTCTCGCAGTGGCCGTGCTCTTTCTTCAAAAATTCATATTGTCCGTTCA
GCTCGAACTTTTCGTCTTGAGATTTCTCCAGTTCTCGATGGAAGCTTTCC
AATTCCATTTGATGAATCTTTTTATCTGCATTAGAGCGTTGTTCTAGCCT
AGTATGGTCTTGAAGCAAGCATTGATGTTTCTTTTCAAGCAGAAGGAATT
TTTCACTGACCATCAATTTGTCTCTCTCTTCTTTTTCCAGATCGCCCCTC
AACTCGTCAATTCTCAGATTGAAATTTTTTCTCAAATCTTCAACTTCTAG
ACCTTGTAATTTCATTTTATTGATCTTATCATCTCTCTGCTTTAACAGAT
TCTCAGACTTGCTCAACTTATTGGTACTTTCCTTTAACGCTATCTTGTAA
TTGTTTTCATTTGCTAAAAGCTCTTCAATCCTTGATTTGAAAGATTGCGT
CTTTTCTCGAAGGACATTTTTTAGCTCAATAAAGGAAGCCTGTGACGCAT
CACGCTCAACTTTGAATTTATCACAATTTGCTTGAAGGTCTCTAATCTCC
AACGTGAGCTGGTCTTTCCTGTTCTCCAAAATGTGATTGTTGTCATGAAA
ACTCCGTGATTCACTTTTCAAAATGCGTGTCTGCTCCTCCAAATGTCTCA
GTGTATCTTTCTTGTCTTGCAATTCCTTTTTGGCTTGCAGCAACTTGTCT
TCAAAGTGTTTCTTACAGTCTTTAGACTCTTGGCGAACCCTGTCGCACAT
ATCTTGTAATGACTTTGTTTCTTTCTTGAACTCATTCACTCTTTTCTCTC
GTTGCTGCAACCTGGACATTAACCCATCCTTCTCTTGTGATAGTCTTTGT
AATTCTGCTTCAGAAGCGCTCGCATGTTTCTTGAATTCCATTTTGCTTTC
ACGTCGTAATTTANTTCTCAGACTTGCTCAACTTATTGGTACTTTCCTTT
AACGCTATCTTGTAATTGTTTTCATTTGCTAAAAGCTCTTCAATCCTTGA
TTTGAAAGATTGCGTCTTTTCTCGAAGGACATTTTTTAGCTCAATAAAGG
AAGCCTGTGACGCATCACGCTCAACTTTGAATTTATCACAATTTGCTTGA
AGCTCTCTAATCTCCGACGTGAGCTGGTCTTTCCTGTTCTCTAAAATGTG
ATTGTTGTCATGAAAACTCCGTGATTCACTTTTCAAAATGCGTATCTGCT
CCTCCAAATGTCTCAGTGTATCTTTTTTGTCTTGCAATTCCTTTTTGGCT
TGCAGCAACTTGTCTTCAAAGTGTTTTTTACAGTCTCTAGACTCTTGGCG
AACCCTGTCGCACATATCTTGTAATGACTTTGTTTCTTTCTTGAACTCAT
TCACTCTTTTCTCTCGTTGCTGCAACCTGGACATTAACCCATCCTTCTCT
TGTGATAGTCTTTGTAATTCCGCTTCAGAAGCGCTCGCATGTTTCTTGAA
TTCCATTTTGCTTTCACGTCGTAATTTACCCACCACTTCTTCGAAGTTCG
CTTCAGCGTTCGTCTTCAACTTCTTCATTTCTTTCAATTGTGTTTGAAGT
TTTTCGATGGAAACATTTTTCTCTTTAACCTGTTTCTTCAACTCTATCTT
CTGATTGGCTACTTGTTTTAACAAAGAGCTTTTCTTCTCTTGTTCATTTA
ACCAATTAGAATTCGTTTGGCAAGCGCTATTAACAGTCATTGGATGAGGT
GTCTGTATGCCTTTATTCTCATTCCCAGACCTTTCACCACTGACATTGGA
CTCCTGCAACCACTTGCTGACTTTCAAATTGCTTTCCATATTTTTAACTT
TGACTACATTTTCTTCTTCCTTCGTTTTTGCGTTTTTGAAAGAAGTCCAT
AACGAGTTCCAAACCCCTTGATTTTCTTCTGTTTCTTTCACCTGCGGTGT
CTCTATCACTGTTTGACACAATTCTTCAGTGTTTCTGAGATCGTCACTCG
ACTCGGCAGCCAAAGTATCTAATGTATCGCACTTTTTCAAAAACGATTTT
ATACTGCTCAATTTTCTTCCAGGTACCGCTTGTTGTAGAAGGTGAGCTGT
TGAAGCACTAGCCTGGTCGGTATCAGATTTTGATTTTTTCAATTTAGAAA
CACTACTTTGTAGTTCAGTATTTAGTCCGATGAGAGATCTCAATGTGTTT
GCATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCACC
GTTACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGTGT
TTGCATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTCCA
CCGTTACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAATGT
GTTTGCATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTTTC
CACCGTTACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCAAT
GTGTTTGCATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGTTT
TCCACCGTTACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACTCA
ATGTGTTTGCATCCAGTACTTGAGAGCCATCCATTGTTGAGCAACTAGGT
TTTCCACCGTTACTGTGGAGGTCTGTGTTGGAGGATTTGATTACAGCACT
CAATGTGTTTGCATCGAGCAGTTTAGAGCCACCTTTTGTAGATTTTCTTT
GGTTGACTTCTTGTGTTTCTGTTGAAAGTTTTGGATTGGAAACCTTTTGT
TGGACTGTATCTGGATGGAATAACAGGCTCATTGTGTTGGGGCCCAATAG
TCTGGAACAAGATTTAGTTGGATTTGGAACATGTCTAGTTGACCTTCTTT
TACTATTGGCTCCCTTCCCTTTAGTGAGAAGGTGTGACGTTGAAACACTT
TTCATGTTCACTTCAGTGTTACTTTGAAGATCAGTATCCGATTGAAGTAA
TGCGTTCATAGTACTGGCGCTTATCAATTGAGAAGAAGTCCTTTTTGATT
TTGGCCCTCTATGGATTATTGTTGTAGTCGAATCGTTATCTAACTCAATA
TCGGTATCAGACTGAAGCAATGCATTCATAGTACTTGCACTAAGCAACTG
TGCACTGGTCCTTGATGACTTTTCTTTACCAGGTTCTTGCCCTTGTGTTA
CTAGGTGTCCAGATAAGAGGCTGGTGTTACTATATAGATCTGTATTTGAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_029736XLOC_029736Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1575043694:22221..23801TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1575043694:22221..23801Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1575043694:15902..22010TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1575043694:15902..22010Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1510915933:22221..23801TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1510915933:22221..23801Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1510915933:15902..22010TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1510915933:15902..22010Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1491911889:22221..23801TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1491911889:22221..23801Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1491911889:15902..22010TCONS_00046592-exon-scaffold_114-1491911889:15902..22010Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_114supercontigscaffold_114:15902..23801 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0569086	0	1.42091e-06	0	0	1.56743e-05	0	6.42518e-06	2.03382e-06	0	0	5.15343e-06	0	0	0	0	0	0	0	1.51436e-05	1.04161e-05	6.58528e-06	1.82689e-05	2.96088e-06	0	0	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00046592 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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