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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00045879 ID=TCONS_00045879|Name=TCONS_00045879|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4184bp
GAAGATGTTGGCTTGGTCAAAGCTCCCAGAATTTGTGAAATGATCCGAGA
GGAGTCGGGTTATGGATTCAATCTTCACGGAGAAAAAGGAGTTATTGGTC
AATACATAAGTGCAATCGACCCAGGAAGCGCAGCTGAGAAGTCTGGATTA
TGTGTTGGTGATCGCGTTGTCGAAGTCAATGAAGTCAATGTTGAAGCAAT
GTCTCATGGAGAAGTGGTCCAACAAATCCGCACTGATCCTAAAAAAGCTA
TTCTTTTGGTAGTGGATAAAATCACTGATAACTATTTGAAAAAGATTAAC
AGACCTGTTACATCTGCCCTTGCCACTTATACTACTGTTCATGAAATTAC
AATAGAAGAAGCTGAGAAATTACAGGAGTTGAGACTCCAAGCtgaacaac
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gttgaagatgaaaatgttgaATTACAAGATTCAGATTCGTTACCATCAAA
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AAATTTCATCTGTCCCAGGAGACATTGAATCTCCACCTCTAAATTCACAT
ACATCAATCTCACCAGAACCAGAAGAGCCTACTAATCAAGATCCACCACC
TGAAGAATCCCAACCTGAAGAATCCCAACCTGATGAAAACATATCACAAC
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AATATATCACAACCAGAAGATCCAGATTATGCAATTCTAGAATCACCTCC
ACCAGAAAAGAGATCTGTGATAGAGTCTCCGGCAGAAAAGGGATCTGTGA
TAGAAGCACCGCAAGATGAATCAACAATGCCAGATTCTCCTCAACCAGAA
CAAGAATCTGCAGAGCCTGTTGTNCAACAATGCTAGATTCTCCTCAACCA
GAACGAGAATCTGCAGAGCCTGTTGTTCCGATTGAGCAACAATTTAGTGT
TCTTGAAGGAAAGAGCAAAAAGCAACCACCAATCGATACAAAAGTTGTTG
AAAAGGATTCTAATAAAGAATCTAAGAAGGACTCTTTTAAAAAGATGTTT
ATGAAAACACCGAAACGTAAAGAAGTCAAACAGAATTCTGATTGGAGATC
AAAATTGGATGAATTTAATAATTTGTAGAAATGTTGGTATGTGTGGCTTT
CCAAATAATTTAGATCTAGAGAAAAGTCTTGATTATTAGATGATGTAAGA
TTCAAAAGGCAAGATTACTACAAAAttggaatatctttttttgagaTATC
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tttatctttttaatactattttttagacttttaaTTAACACTAGGTTTGA
AGGTGTAGACCCTTACATTATAATGTGGGGTCAATTATTTGGAAAGAGAA
GGAATTGTAGCAATTGAATAAAATGCTGTCAAAATGGTCAATGTGCTATG
TAGTAgttaaaatttgtgatttttgtttGACATTTCTTGACTTTCAAAGT
CTGTAAAAACTGTTTTTTCTGTCAACACGTAAATTATTAGCAATCTTAAA
ATCTTAGCATTAACTCTTTTCTTTAGAACAAATTTAGAAATTAGAATTta
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gcttaaatctaaaccttaaatttaaggaaatactgaaaatccgtaaaatt
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gtaatgcttgccatatgcttaattttttcccatatctgagcctagatatg
cttataagtgcaatgcttataaaaaaaaaacatgtactcaaAATAAGCCT
AAACCAAACGGACTGACACAAAATGTCAAAACAGCATAATATCTAACGTC
CATTAAAACGTTaaatgaatgttgaaacaacgttatgttcTGAAGTCAAT
TCGCTttagtgtgcactctttttcgCGACCATACAAAAACCATGTTAGCG
TAAAGGCTGATTCCTTTCAAGCGGTTTCCATAATGGTAGAAAAAAAGATT
GCACGCATTAAATAGCGAATGGTGGACTTCAGGTTAGAATGAAGTGGTCG
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TTTTAATTTCGTAGTTTTACATAGTTTTCATTTTAAAGGTTTAAAATCTA
GGGATAGATCTAATCTTCAAAATTTACTAGAAATCTTTTCATTCTAACAT
GTTTGCCAAATTACTGATAATTAGTATGTACGAATAGATGTCAGCTTGTT
GTTAACAGATCTATCAAATCTCTTATCAGCACATGTTTTTAAATGTGTTT
ATTAGCATTATGTCATACTTGTCATCAGTAATATTTTTCACAGGGAAGTT
TCTACTATCTCATTAATTATCgatcaaagagattttttttcaaggtaCAT
GAAAAAGATGGTAAAATACTTCTGTTTGACAAGAATAAGCGAGAAGAATA
GTTTTTAAGAACACGAACGAGGCTCAAAAGCGCcaagaaataagaacaat
ttgaggacAATCCTGAGCCTTGAATGATTGATTCTTAAGAAAATCTAAAC
TTAGTAGAATGAGTTAAGACTACCTCAAATCACCCTTAATATAAGAGAAT
GCTGAGTAAAATtcgaggctcaaagtgccaattTTTGAAGACCTTAGCAC
GTGAAGCTATATATATGCTTTAGATATAGATAAAGCCATTTTATGTTTTA
TCCaagataatatttttaaaaccaATACTATATTGTTTAGCCAATGTATG
ATAATTTTAAAAATGGCaactaatttttaattttccattATTCTGCTATT
TAGACTCGGTAAAAATTTTAATGCGGGGGTaacttttctttaattttcaa
tttttatgttttaaaggTAATTCATTTATATTATAGGAAAATATTATTCC
ACGAAATTTTATATCATATAGATCAACAGTTATATTATAATACATCTTTC
AATTATTCGACTTTTAAAAATCTATTGAATCTTTTCTTACGAAGTAACAT
GTAGCACTTAACTCCAGTCCCTTAATTGAGTTCATAATTTTATCAGAGCT
TTAAGAATTTTGctacaatcggcgccgaaatatttggcaaaaaaggggaa
ttctcttaaaactttaaaaccgcaagtgatttttaagtgctttgaagtac
agttcggaagtagagttttaattCTGAGTATTGAAATTAGACTTAAGAGT
TTGGACCTTAGGATTTCAGgttctaaaagctcaaaaatgttccaataagg
cagAGAATATAGTCTGGAAGCCACtcctaaattgaaaaattccGATGAAG
CAAAGTGGAAATACTGAACCTGCAATTCTCGCTTtgacctttaaattctg
aaaaacgttaaaataccaaaaatggtcaatatTTTTCGGTGCTGATTGTA
GCTACAAGCCCAATCTAACAAAAGGTATCTATCAAAcctttaaacttttt
tactgGGGCCATTCCCTTTCATGcaagaaaaatttccagaaaaaaattca
gGGGGTAATTACATGTGGCTTGAAAAGGTTAGTCCATCCCTCTTATGAAT
ACTAAATGGAGTAGGACCCCTCACGAGActagtctgtacacaaacccgat
atctacggctaatttcaaaattcattgcactaggctacgataatcgtgag
atacactctggtacagattATCACGAGACCATCTCTTCTAATTTTTGGTT
TCGTCACGATTGCGAAAATTTCCTGATCCCGCATCATGCAAGAAAGAAGC
CTCATCAGTCACGCTAATCGCCCTGGGATGGGAGCGATTGTATACATCTT
AATTACCTATTACTTCATTCTTGAATGATAAGagattttgtaaataaaat
ttttcttttgattatttcactacaaaaatcaaaatatatacattttaaTA
CTTTATAATATCTTCATAAAagtggaaaaaaataataacatcttTGTCAT
AAGTTATATATTGTACATGATTGTTTCGAAAATGTCTATTTGGGATACCA
ATTTGGGACACCTTTTTGATTTCAGAGTCACCCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_102:232213..243922- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00045879 ID=TCONS_00045879|Name=TCONS_00045879|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11710bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_102:232213..243922- (Clytia hemisphaerica)
GAAGATGTTGGCTTGGTCAAAGCTCCCAGAATTTGTGAAATGATCCGAGA
GGAGTCGGGTTATGGATTCAATCTTCACGGAGAAAAAGGAGTTATTGGTC
AATACATAAGTGCAATCGACCCAGGTATATAACATTTTTGGACTGACAAG
GATATGTAGGGGGTGACAAATCTTGTTTCTGAACCTTTAGGATGACTGAA
CTTTTTGATANATTGTAGTGGTCCAAAGCCTGTAAAAGAAATGAGCAAAT
GATAATCAAAGAGACAAATTATTGTTTATACAAACTGATTTATAATGATT
TTGTATAACAACATCCAAAACTTTTAAAGCTTTCGGATGTTTTAAACATA
CTCCTATTTTCACCATTTCCTGGGTAATTTTGCCCATTTTCCTACGAAAT
TGGGTGTTTTAGACTCTGCCTAATGTTCTTAACTTGTTCTTAATATTTTG
GTCATCGAAGCCTTATGTTAGAGGAGTTTTTTTATAAAAAAACGTGTGAA
CTACTCCAGTCACGTCTTCACAAAATGTTATAACCTCGATGATCATTTTT
CCTTTACCACAGTTTCCAACTTACTATGGCATCATCACCAACCCCATGAA
CCTCTCCAACATTATGCGCAAGCTCGATGGCTTACAATACGATAACGTNC
GATCGGAAATTTGATACTGATTAATTTTGAGATACAAAGTTGGGTCTGAA
AACTTTCCTATCTCGAGATATAAATCACTTTCGTTTTCTCAGGTTTGGTT
GCAGTTGTAGGGNGATAACGTCATGTCGTTCATTGATGACGTCAATCTCA
TCTTTGAAAACTGTGAAAAGTTCTACAAGGTACTTTTATTGTTGTTGTTA
TTATTGTTGTTTTTTGATATCTTCTTATTCAAATTTTTCATTAACTCTCA
GCAACAAAATTGCCTGTATAAAGACCCAATTTATACATAGAGTTCAAAAT
TCATTAGCGTAGAGTACAACGTACTTGAGTTCAGTTGTTTTAAGTATGTA
CTAAATTATTGTTTTGCCTGCAATTTGGTNAATGTGTATTTTACAGACCA
GAGTACAATTTTTTTACCGTCGAAAAAAGATCTTTTTCTCTCAAAATTGG
TCTTTTTGTCTGAAATGAATTAGTGAAATGATGCTTCAGGTTTAGAGCCA
CTCGACTCCTCATATTCTACTCAGAGAGATACCTGGGGAATATATAAGGG
CTAAATGTGTCTGGTCAGCACTTTACAAGCATGTTTTTTTGGTAAGATTT
GATCCAAAAAACGGTAAAACTTACAAGCTATTACTCAAATATTTGACNAT
AAGAATACAGTCATTTTGTATTTGGTTAATAGAAAAAAACTGCTTCCTTT
GTTAGACTTGAATTTAAACTTTGAGGCAGAAATGTAATTTTAGCTTCAAA
TGTTCATTCAACTCTCAAATTGATCATTTTCTCATGTTTGTAAAAAATTC
AAGTCAGAAAAAGTAAGAATACGTTAAGAATATTTCACCCTTAATTTGGC
AACTTCTTAAGAATACCTGATNTTGAACCTTATTCTTTAGTTTGACACAT
GCAAAGAATCAAGAATACATGTAAATCGATGTGTGTATTTTACAGACCAG
AATTAAGTGCTTCTTTGAGACTTCGGGAAGTGCTTNACCCTCATCCAAAG
TACACTATTCTTATATAAAAAAGCGTGTATGTAATTCAGAGCACTTACAT
TTTTGTGAAAAATAATTTCATTGATCTCTTTTTGATTCTCTTGATTCGTG
AGATACTAAAAATCCTTCTTGTCACTACGTGTAATTCATTTGATGATGGG
CTACTGAACATTTTCGTTCTCATTATCATTTTTCGTTTTCATTATCATTT
TCAGGAGACGGACAACGAAGTCAAAGAATGCGGAGCTCGTCTTAAGAAGA
AATTCACAGAATTATTGACACATCATTTGCCTGGTATTGCCTCCTAAACG
AGGAGAGTCTTTTTTTCATCTTTAAGTGAGATATTTGCTAATCAAAGTGC
TGGTATATTATACTCTGGCTTCCCTAATTCCCACAAGTTTTCAATTCCTA
TCTTCTCTTGTCAACTCAGTCACTGAAGTCCATTCGCTTTAAGTGAGCAT
GTAGAAACCACGTCAGTGTAATTAGAGTAATTCCCTTGAGGGTGGTTTTC
ACCTTGTAGCAAAAAAGTGCACACTTAAAGTGAATAGACCTTAGTACCAA
GTCCCACCTTTCCCAATTTTCAACCCAGAGCAACATCCATTAAGGCCCCA
CGCATCTTTCTTGGCAAGACTTTCGACTCTCCTTTTTGCTTGATGTGGAA
GTCTTTGGGTGGCAAATTCATATTCAAGACCTGCCTTTTTTTTACTGCTG
CCCTTATTTTTATTATTCTGTAGTATATAATATTCTTCAGTGTTCCATTA
TTTTATTTTTGGCAAACAGTGCGTCTTCATTTTTTAACTATCCTTATTAT
TTTGTGTATATTACGGTGGATTTCATATTAGAATATATTATATTAGATAA
GAAACAAATGACAAATTCGTTCTCATTCGCCTTCCCCGAAGCGAAATAAA
TATTGACCAAACAAATTTGCAAAATCATGAAAAGTTAAGCCTTAGCTTTT
ATGAGGCTTCTGACTTCCTTTTTCCTGTAAAAAATGAATAACGGGCTTTT
ATCTTACCGTCGGCAAAAAAGTGACGAAAAGATAGTTTAGCAAGTGGAAT
TTTTTTGGCCGACAATTGTTTTTACAAAATGATTTTCGATAAAATATCTT
CTCTGAAAACAATAGCTGTATGGTTAGTTTATGGCCCTGTGGGGGTCGAA
TTATATGAGTTCTACAAACCCTGTAAGCAGAGACTCGATTGCTGTTTTAT
GGTTTTTGTACCCCAGTGTGGGACTTTGGAGGGTGTTGAAACCCNTAAAA
TGGGTGAAGATGTTGGCTTGGTCAAAGCTCCCAGAATTTGTGAAATGATC
CGAGAGGAGTCGGGTTATGGATTCAATCTTCACGGAGAAAAAGGAGTTAT
TGGTCAATACATAAGTGCAATCGACCCAGGTATATAACATTTTTGGACTG
ACAAGGATATGTAGGGGGTGACAGATCTTGTTTCTGAACCTTTAGGATGA
CTGAACTTTTTGATATTTTAATACTTCCAAATAAATTTATATGGTTATAT
GGGCTACCAGAATTCAACATAATTGCAAACTTAGTCTCAAGTTTCATTAA
TTTATTGGCTTTTTCTCAAAAAACGTGTTTTTTTCATGTTGTTTTTTTTG
ACGTTACAGGTCTGTAATTTTCTGTAAGGAGCTTGCAATATGAAAGATTA
TTGTTTTCTGTTTAGCCCTTTTACTAATGTATCTGGAAATGCATATTAAC
ACTTAGTTTCCCATAAGGAGTATAACTGACACTGCATTTTATGAANNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCC
CAGAAGCTTAAAATATTCTTATTACCATAAGGAACAAGAAAAACCCCAAG
AAAGTTAGTCCACCAAATGGATAAGATACTTCCCGGCTCGTACCTGTATA
TTTTAATACTTCCAAATAAATTTACCAAAGCCAAAGCAAAGGCAAGGGAG
AGGGTTATCATATCCGAGAAAGTGCAAAAATTAGGCACATGCAATATTTC
AAATAGACGATTTTAAATACTATGTCTATTTCCAACATTTGTGTGTTCAT
TAAGTCTGCTAAATGACCTGCCCTACGTCAGCTTGGTAAAATCCGTGTGT
TTTCATATGTAAACAAAAGTACTTACACATAGTTGTGACGTCGAAAAAGT
CAAGGCTAGAGACAAAACGCTGAATGACGGAATGCCGGAACCGGAATAGC
TGTTCCGGCCGGAATAGCTATTCCGCGGAATATGATTTTTTTTTATATTT
TGTATTCCGCGGAATATGACTTTTTTTATTCCGCAGAATATGATTTTACT
TATATCATGGATTTATCATAGAACNAATTAAGTAGTACAGTTAGGAACAT
TTGGCGAGTTCCTGTACGCGACCGCAATCAAAAAAATCATAAAAAAATTG
TGTTTGTGTCTTTTTTTTGCCTAGATGATATAGCAAACATAGTAAGTATA
TATAAGTAGATTGTGCCTTTAATTGGCTGTAAAAAAATTATGCGTCGGTA
GAAATTTCTTCAACTTTCAACAATGATAGAACACACCTATTTAAAAAAAA
TTAACCAGCGCATTTTTTATCTTTCTACTTCTTCATCTTCCATGAAGCTC
TTAAAGTTAAATAGAANTCCGCAGTAATGACACATTATTGTTCACCCTCC
TCCATTCACTAATAATCTTTCGTAAATTTTGTTATTGCATTTTTCATCAA
AACACAGCTCTATACAATTCCCAAATGAGACTTAAACATCTCTCAAGAGA
GTCAAATGCATCAAATTGATTGCTAATGATATGTCGTTATGATNACATCA
ATTGTTTTCTAAAACAATGGAAAGACAATAGTTCGCTCTCCACCGTTTTA
TTTGATGTTTATCCAGAGTTCTATGATAAATCCATGCTTATATCTTTTCC
TCCATAATCACCTACAAGGTGATTATGAGGGCTGTAGTAGAGGCCTCAAT
TGGTCCAACCAGGGAACTTCGCCTGACTGCTTAGTCGGCCTTGAGCAAGG
TATAAATAGCCAGAAAAAGTCCCTGAAAAAGCACTCCATGGCCTCCATAC
ATGCTCCACATCCACGNTTGGCTGGTCATATTGGGCGTTTTGGCGTTACC
ACCTCGAAGTGGGCGCCTTCGTCATTCCGCAACTCTGTCTACCATTTTAA
ATGAGTTAAAAATAGATCCAAAAGGGTGCCCTCATCAAGAAAGATCATTT
GCTTTGGTCTCCGGCTTTGGGAAGCAGTAATGTTTTATGATTGTTTTCGA
TAGAAAATGGTAAGAAACTTAAGTTTACAAGTGTCATTCTGTTTTTCCTG
GCTGATAGAATGGCAGGATCCTGGATGGTTTCCCTAACTGTAGTATATAT
AACGAATCAATCGTAACAGGCATAGCAGGTTTTGTTTTCCCAGAGGAGAA
CTAAAAATGACACATCACATTTAATGCGTGAGTGACTTTTTTAAGCTAAA
TATTTCACATTTCTTTACATAATGGACATAATTCTGTAACTTTTTTGTTA
CATTGTTTTAATTGATTTTCAGTTCATTTACTCCCAAGATAATTACTTTG
CACTTTTAACAACTTTCAAATCAGCAATCACTGTTTGTTACAATTCATTG
CACATCGTGTCTTTTAGACGATTCCTATTTCAGATAACTTGAGCTCCACC
GCAGATGATTGAAAAAGTCAATTCTTCAGGTGCTTCAACTTCACAAACTT
CGCCAATCCTGGTGGTGATAAGATTTATATGAGAGTAATCGTCACAAAAA
GCGCGAATAACTTATTGAAAAATAGAGATTCCCAAGATTGGCGACGGCAT
CTTAAATCTTGGTTAAAGAAAATCTCTTTGAACTTTCTTTTTTTTCTTTT
GTTAATTGCTTGCCTCATTGATGACTTGCAAGGTATTTATCAGGCCATAT
TTTAGAAAGTCAAGGCAGCGTCCGTTGGTGGCCAAAAAAGGCACTTTTTC
CAGTGTTTTCCACTAAAAAGGCTTTTTTTACCAGTATTTTAGTCATTTCA
AGAGGGGCAGCGCCCGATAACCAGACGCTTAAAGGGCATGAAAAATGGCC
TGTTTCTCATAATGAAAACACACAGATTTTACGAAGCTGTACGTGCCCTC
ATTCGTTTGACGTGCCTTTGTGGTGGCCCTACGTTCCTTACTTACCTACG
TGCTTGCGTGCCTGGCGTGCTCGCATGCTCACGTGTCTACGCGCCCTCCG
AAATTTGACGTGGTTTACGTGCCCGAAGTTTTGACGTGTGCTCAAATTTT
GACGTGCCCTCGAATTTCGGCATGCCCTTAAATTTCAATGTACCCTCAAA
TTTTGACGTGCCTTGCTTAAGTATTGACGTGCCTTCAAATTTTTACATGT
TCTGGAAATCAAAAATTTGAGGGCACGTCAAAATTTGAGGGCACATGAAA
ACTTGAGGGCACGTCAAAACCTGAGGGCACGTCACAATTCGAGGGCACAT
CAAAATTTGATATGAAGGCACGTCAAATTTCGGAGGGAACGTAAGCACGC
AAGCCAATAGGCACGTAAGGCACAAAGGCACGTAGGGCACAAAGGCACTG
ATAAAAATGAGGGCACGTGGGCACGTAGAGCACGTCATTTTAACAGACTC
ATGTTCATTGCAGGAAATTGTTATTTTTGTTATAAAAGTTATTATGCAAA
ATATATAATCGGTTGGTCTAAAAATATTCTTCCAATATGGGGGTAACCTC
GGAAAAATTATTATATGATTATATGATTATATAACGTTATCATTATAAAA
GTCTATGCTGGAGTAATTACCGTGAGATTGGGTAACTTGCATCAGTGGAG
GCTAACATGCATAGCCCTCAAATGAAAGACCTGGTTGGTCATTAAAATAC
AAAGTTAAATCAAAACAAAAATGGTATCAGTAGAGCTGCGAGCGGAGCTG
CATAGTTCATTTGTTTTGAAATTTTGCTGCTTTGATTGGTCAGTCATTTG
ATGGCTGTGCAAGTTTCCCTCCACTGATGCAAGATACCCGACTTAACGGT
AGTTATTCAAAAGACTGTTGTTGACTATAATTATTGTACTGTTGCAAATA
TATAAACGACAGCCTACGTTAGCTTTGGCCAGGATGGAACAATCTCTCCA
CCCCACAAGGCCTACTTAGGTTTGTGAGAGATTATCTCATTCCAGACCTC
CCTAATTTCTTGCTTCTTTCTTCTTTTTGACTCAGACTCCTCTAACAGAA
AACTTCCTTTCATGAAGACTAAATTTAATAACAGTGCTTGAAAATAATCT
ACAATATATATGTAAGCCCCGCTTTTTAAACTAACCCCCTTCCTTCCTAT
CTCCACCCTTTTTCATGAAAATTTCTGATCCCCCTTCTTTATTCTCTTGG
AAGGAATCGTCTGAACTATGATGGGAAAGATAAAAGAGAAAAGACTAGCC
TAGTTTCTAATCCTGATATCCTTTTGATACACCCTGAGAGCTGATAGTAA
AGCTAGGCTAGACTTACCTCTTTTCTCCTTCCCATTTTAACAATAGACCT
TTTGCTAGGATATCATGTTGAATTATTAAAAACTCCAGCATCAAAACAAT
GATAAGAAAATACACACTTGAAATAATTATGCATTAAAAATGTGCCATTG
TTTTAATAATGATGGAGTTTTTAATTATTTAACATGACATCCTAACCTGC
AAAAGGTTACATACCTATATAAAATGCTTACATTAGTGGACACATAAAAC
ACATTAACAGAATTATTCCCCATTCAATATTTATATTGAAATCTGCAATA
AAAATGAAAATTGTCTCTTCTAATCAGTGCTTCCGTTAGGCACTCCATGG
GAAAGTCTTTTTTTAATTTCAACCAATGAGATTGCCACATATGATGATGA
AGGTTAACAACTAGCCCTAATTTTGGCGCTACGGCTTTTGCGTTTTTGGC
AGAAACTCACTATTTTAATTTTATATGCAGAATTCTGTGATATGATAAAT
GTAGTGCTAGAAGCCACACAAGGGTGTAATATCTTGCCTCTAATTTTCAG
GAAGCGCAGCTGAGAAGTCTGGATTATGTGTTGGTGATCGCGTTGTCGAA
GTCAATGAAGTCAATGTTGAAGCAATGTCTCATGGAGAAGTGGTCCAACA
AATCCGCACTGATCCTAAAAAAGCTATTCTTTTGGTAGTGGATAAAATCA
CTGATAACTATTTGAAAAAGATTAACAGACCTGTTACATCTGCCCTTGCC
ACTTATACTACTGTTCATGAAATTACAATAGAAGAAGCTGAGAAATTACA
GGAGTTGAGACTCCAAGCTGAACAACAACAAAATGTTACTGATGATGCTG
ATGATGATGGTAATACGCAATTGAGTGTTGAAGATGAAAATGTTGAATTA
CAAGATTCAGATTCGTTACCATCAAATGGTGAAGAGCCAGAAAATGAGGC
CCCTGGAGACACACCTGAGTCAGAGAAAATTTCATCTGTCCCAGGAGACA
TTGAATCTCCACCTCTAAATTCACATACATCAATCTCACCAGAACCAGAA
GAGCCTACTAATCAAGATCCACCACCTGAAGAATCCCAACCTGAAGAATC
CCAACCTGATGAAAACATATCACAACCTGATGAAAACATATCACAACCAG
ATGAAAATATATCACAACTAGATGAAAATATATCACAACCAGAAGATCCA
GATTATGCAATTCTAGAATCACCTCCACCAGAAAAGAGATCTGTGATAGA
GTCTCCGGCAGAAAAGGGATCTGTGATAGAAGCACCGCAAGATGAATCAA
CAATGCCAGATTCTCCTCAACCAGAACAAGAATCTGCAGAGCCTGTTGTN
CAACAATGCTAGATTCTCCTCAACCAGAACGAGAATCTGCAGAGCCTGTT
GTTCCGATTGAGCAACAATTTAGTGTTCTTGAAGGAAAGAGCAAAAAGCA
ACCACCAATCGATACAAAAGTTGTTGAAAAGGATTCTAATAAAGAATCTA
AGAAGGACTCTTTTAAAAAGATGTTTATGAAAACACCGAAACGTAAAGAA
GTCAAACAGAATTCTGATTGGAGATCAAAATTGGATGAATTTAATAATTT
GTAGAAATGTTGGTATGTGTGGCTTTCCAAATAATTTAGATCTAGAGAAA
AGTCTTGATTATTAGATGATGTAAGATTCAAAAGGCAAGATTACTACAAA
ATTGGAATATCTTTTTTTGAGATATCACTGTATTTGCTAACAGTTAGATT
CATGGAATATAATATCAAAGAACTAATTTATCTTTTTAATACTATTTTTT
AGACTTTTAATTAACACTAGGTTTGAAGGTGTAGACCCTTACATTATAAT
GTGGGGTCAATTATTTGGAAAGAGAAGGAATTGTAGCAATTGAATAAAAT
GCTGTCAAAATGGTCAATGTGCTATGTAGTAGTTAAAATTTGTGATTTTT
GTTTGACATTTCTTGACTTTCAAAGTCTGTAAAAACTGTTTTTTCTGTCA
ACACGTAAATTATTAGCAATCTTAAAATCTTAGCATTAACTCTTTTCTTT
AGAACAAATTTAGAAATTAGAATTTAAATACTTGTTTTTTTATTTATAAG
CATACAAAAATTTGAAAACAGGCTCCGAAATGCTCAGGTCGAAAGCTTAA
AAAGGCTGAAAAATGCTTGAGGGGATGCTTAAATCTAAACCTTAAATTTA
AGGAAATACTGAAAATCCGTAAAATTCGAGCCAAAAAAAGCTAAAATCAG
GAAAAAAACATTTTTCGTAGGCTCAAGTAATGCTTGCCATATGCTTAATT
TTTTCCCATATCTGAGCCTAGATATGCTTATAAGTGCAATGCTTATAAAA
AAAAAACATGTACTCAAAATAAGCCTAAACCAAACGGACTGACACAAAAT
GTCAAAACAGCATAATATCTAACGTCCATTAAAACGTTAAATGAATGTTG
AAACAACGTTATGTTCTGAAGTCAATTCGCTTTAGTGTGCACTCTTTTTC
GCGACCATACAAAAACCATGTTAGCGTAAAGGCTGATTCCTTTCAAGCGG
TTTCCATAATGGTAGAAAAAAAGATTGCACGCATTAAATAGCGAATGGTG
GACTTCAGGTTAGAATGAAGTGGTCGTTAAAGCAATACTTGGCCTGAGAT
TTGCCTTTAGTCATATTAATTTTACGTTTTAATTTCGTAGTTTTACATAG
TTTTCATTTTAAAGGTTTAAAATCTAGGGATAGATCTAATCTTCAAAATT
TACTAGAAATCTTTTCATTCTAACATGTTTGCCAAATTACTGATAATTAG
TATGTACGAATAGATGTCAGCTTGTTGTTAACAGATCTATCAAATCTCTT
ATCAGCACATGTTTTTAAATGTGTTTATTAGCATTATGTCATACTTGTCA
TCAGTAATATTTTTCACAGGGAAGTTTCTACTATCTCATTAATTATCGAT
CAAAGAGATTTTTTTTCAAGGTACATGAAAAAGATGGTAAAATACTTCTG
TTTGACAAGAATAAGCGAGAAGAATAGTTTTTAAGAACACGAACGAGGCT
CAAAAGCGCCAAGAAATAAGAACAATTTGAGGACAATCCTGAGCCTTGAA
TGATTGATTCTTAAGAAAATCTAAACTTAGTAGAATGAGTTAAGACTACC
TCAAATCACCCTTAATATAAGAGAATGCTGAGTAAAATTCGAGGCTCAAA
GTGCCAATTTTTGAAGACCTTAGCACGTGAAGCTATATATATGCTTTAGA
TATAGATAAAGCCATTTTATGTTTTATCCAAGATAATATTTTTAAAACCA
ATACTATATTGTTTAGCCAATGTATGATAATTTTAAAAATGGCAACTAAT
TTTTAATTTTCCATTATTCTGCTATTTAGACTCGGTAAAAATTTTAATGC
GGGGGTAACTTTTCTTTAATTTTCAATTTTTATGTTTTAAAGGTAATTCA
TTTATATTATAGGAAAATATTATTCCACGAAATTTTATATCATATAGATC
AACAGTTATATTATAATACATCTTTCAATTATTCGACTTTTAAAAATCTA
TTGAATCTTTTCTTACGAAGTAACATGTAGCACTTAACTCCAGTCCCTTA
ATTGAGTTCATAATTTTATCAGAGCTTTAAGAATTTTGCTACAATCGGCG
CCGAAATATTTGGCAAAAAAGGGGAATTCTCTTAAAACTTTAAAACCGCA
AGTGATTTTTAAGTGCTTTGAAGTACAGTTCGGAAGTAGAGTTTTAATTC
TGAGTATTGAAATTAGACTTAAGAGTTTGGACCTTAGGATTTCAGGTTCT
AAAAGCTCAAAAATGTTCCAATAAGGCAGAGAATATAGTCTGGAAGCCAC
TCCTAAATTGAAAAATTCCGATGAAGCAAAGTGGAAATACTGAACCTGCA
ATTCTCGCTTTGACCTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATACCAAAAATG
GTCAATATTTTTCGGTGCTGATTGTAGCTACAAGCCCAATCTAACAAAAG
GTATCTATCAAACCTTTAAACTTTTTTACTGGGGCCATTCCCTTTCATGC
AAGAAAAATTTCCAGAAAAAAATTCAGGGGGTAATTACATGTGGCTTGAA
AAGGTTAGTCCATCCCTCTTATGAATACTAAATGGAGTAGGACCCCTCAC
GAGACTAGTCTGTACACAAACCCGATATCTACGGCTAATTTCAAAATTCA
TTGCACTAGGCTACGATAATCGTGAGATACACTCTGGTACAGATTATCAC
GAGACCATCTCTTCTAATTTTTGGTTTCGTCACGATTGCGAAAATTTCCT
GATCCCGCATCATGCAAGAAAGAAGCCTCATCAGTCACGCTAATCGCCCT
GGGATGGGAGCGATTGTATACATCTTAATTACCTATTACTTCATTCTTGA
ATGATAAGAGATTTTGTAAATAAAATTTTTCTTTTGATTATTTCACTACA
AAAATCAAAATATATACATTTTAATACTTTATAATATCTTCATAAAAGTG
GAAAAAAATAATAACATCTTTGTCATAAGTTATATATTGTACATGATTGT
TTCGAAAATGTCTATTTGGGATACCAATTTGGGACACCTTTTTGATTTCA
GAGTCACCCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1575043694:243799..243922 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1575043694:243799..243922 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1575043694:232213..236272 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1575043694:232213..236272 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1510915933:243799..243922 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1510915933:243799..243922 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1510915933:232213..236272 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1510915933:232213..236272 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1491911889:243799..243922 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1491911889:243799..243922 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1491911889:232213..236272 | TCONS_00045879-exon-scaffold_102-1491911889:232213..236272 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_102 | supercontig | scaffold_102:232213..243922 - |
Blast
BLAST of TCONS_00045879 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NHRF2 (Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 OS=Homo sapiens GN=SLC9A3R2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 87.8113 bits (216), Expect = 2.989e-18 Identity = 50/100 (50.00%), Postives = 68/100 (68.00%), Query Frame = 1
Query: 25 PRICEMIREESGYGFNLHGEKGVIGQYISAIDPGSAAEKSGLCVGDRXXXXXXXXXXAMSHGEVVQQIRTDPKKAILLVVDKITDNYLKKINRPVTSALA 324
PR+C ++R E GYGF+LHGEKG GQ+I ++PGS AE + L GDR+VEVN VNVE +H +VVQ+I+ + LLVVD+ TD L++ T +A
Sbjct: 9 PRLCRLVRGEQGYGFHLHGEKGRRGQFIRRVEPGSPAEAAALRAGDRLVEVNGVNVEGETHHQVVQRIKAVEGQTRLLVVDQETDEELRRRQLTCTEEMA 108 HSP 2 Score: 80.8777 bits (198), Expect = 5.100e-16 Identity = 45/92 (48.91%), Postives = 60/92 (65.22%), Query Frame = 1
Query: 25 PRICEMIREESGYGFNLHGEKGVIGQYISAIDPGSAAEKSGLCVGDRXXXXXXXXXXAMSHGEVVQQIRTDPKKAILLVVDKITDNYLKKIN 300
PR+C + + GYGFNLH +K GQYI ++DPGS A +SGL DR++EVN NVE + H EVV I+ +A LLVVD TD + K++
Sbjct: 149 PRLCHLRKGPQGYGFNLHSDKSRPGQYIRSVDPGSPAARSGLRAQDRLIEVNGQNVEGLRHAEVVASIKAREDEARLLVVDPETDEHFKRLR 240
The following BLAST results are available for this feature:
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