XLOC_029317 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029317
Unique NameXLOC_029317
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_102:232213..243922-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029317 ID=XLOC_029317|Name=XLOC_029317|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11710bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_102:232213..243922- (Clytia hemisphaerica)
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AGTTATTCAAAAGACTGTTGTTGACTATAATTATTGTACTGTTGCAAATA TATAAACGACAGCCTACGTTAGCTTTGGCCAGGATGGAACAATCTCTCCA CCCCACAAGGCCTACTTAGGTTTGTGAGAGATTATCTCATTCCAGACCTC CCTAATTTCTTGCTTCTTTCTTCTTTTTGACTCAGACTCCTCTAACAGAA AACTTCCTTTCATGAAGACTAAATTTAATAACAGTGCTTGAAAATAATCT ACAATATATATGTAAGCCCCGCTTTTTAAACTAACCCCCTTCCTTCCTAT CTCCACCCTTTTTCATGAAAATTTCTGATCCCCCTTCTTTATTCTCTTGG AAGGAATCGTCTGAACTATGATGGGAAAGATAAAAGAGAAAAGACTAGCC TAGTTTCTAATCCTGATATCCTTTTGATACACCCTGAGAGCTGATAGTAA AGCTAGGCTAGACTTACCTCTTTTCTCCTTCCCATTTTAACAATAGACCT TTTGCTAGGATATCATGTTGAATTATTAAAAACTCCAGCATCAAAACAAT GATAAGAAAATACACACTTGAAATAATTATGCATTAAAAATGTGCCATTG TTTTAATAATGATGGAGTTTTTAATTATTTAACATGACATCCTAACCTGC AAAAGGTTACATACCTATATAAAATGCTTACATTAGTGGACACATAAAAC ACATTAACAGAATTATTCCCCATTCAATATTTATATTGAAATCTGCAATA AAAATGAAAATTGTCTCTTCTAATCAGTGCTTCCGTTAGGCACTCCATGG GAAAGTCTTTTTTTAATTTCAACCAATGAGATTGCCACATATGATGATGA AGGTTAACAACTAGCCCTAATTTTGGCGCTACGGCTTTTGCGTTTTTGGC AGAAACTCACTATTTTAATTTTATATGCAGAATTCTGTGATATGATAAAT GTAGTGCTAGAAGCCACACAAGGGTGTAATATCTTGCCTCTAATTTTCAG GAAGCGCAGCTGAGAAGTCTGGATTATGTGTTGGTGATCGCGTTGTCGAA GTCAATGAAGTCAATGTTGAAGCAATGTCTCATGGAGAAGTGGTCCAACA AATCCGCACTGATCCTAAAAAAGCTATTCTTTTGGTAGTGGATAAAATCA CTGATAACTATTTGAAAAAGATTAACAGACCTGTTACATCTGCCCTTGCC ACTTATACTACTGTTCATGAAATTACAATAGAAGAAGCTGAGAAATTACA GGAGTTGAGACTCCAAGCTGAACAACAACAAAATGTTACTGATGATGCTG ATGATGATGGTAATACGCAATTGAGTGTTGAAGATGAAAATGTTGAATTA CAAGATTCAGATTCGTTACCATCAAATGGTGAAGAGCCAGAAAATGAGGC CCCTGGAGACACACCTGAGTCAGAGAAAATTTCATCTGTCCCAGGAGACA TTGAATCTCCACCTCTAAATTCACATACATCAATCTCACCAGAACCAGAA GAGCCTACTAATCAAGATCCACCACCTGAAGAATCCCAACCTGAAGAATC CCAACCTGATGAAAACATATCACAACCTGATGAAAACATATCACAACCAG ATGAAAATATATCACAACTAGATGAAAATATATCACAACCAGAAGATCCA GATTATGCAATTCTAGAATCACCTCCACCAGAAAAGAGATCTGTGATAGA GTCTCCGGCAGAAAAGGGATCTGTGATAGAAGCACCGCAAGATGAATCAA CAATGCCAGATTCTCCTCAACCAGAACAAGAATCTGCAGAGCCTGTTGTN CAACAATGCTAGATTCTCCTCAACCAGAACGAGAATCTGCAGAGCCTGTT GTTCCGATTGAGCAACAATTTAGTGTTCTTGAAGGAAAGAGCAAAAAGCA ACCACCAATCGATACAAAAGTTGTTGAAAAGGATTCTAATAAAGAATCTA AGAAGGACTCTTTTAAAAAGATGTTTATGAAAACACCGAAACGTAAAGAA GTCAAACAGAATTCTGATTGGAGATCAAAATTGGATGAATTTAATAATTT GTAGAAATGTTGGTATGTGTGGCTTTCCAAATAATTTAGATCTAGAGAAA AGTCTTGATTATTAGATGATGTAAGATTCAAAAGGCAAGATTACTACAAA ATTGGAATATCTTTTTTTGAGATATCACTGTATTTGCTAACAGTTAGATT CATGGAATATAATATCAAAGAACTAATTTATCTTTTTAATACTATTTTTT AGACTTTTAATTAACACTAGGTTTGAAGGTGTAGACCCTTACATTATAAT GTGGGGTCAATTATTTGGAAAGAGAAGGAATTGTAGCAATTGAATAAAAT GCTGTCAAAATGGTCAATGTGCTATGTAGTAGTTAAAATTTGTGATTTTT GTTTGACATTTCTTGACTTTCAAAGTCTGTAAAAACTGTTTTTTCTGTCA ACACGTAAATTATTAGCAATCTTAAAATCTTAGCATTAACTCTTTTCTTT AGAACAAATTTAGAAATTAGAATTTAAATACTTGTTTTTTTATTTATAAG CATACAAAAATTTGAAAACAGGCTCCGAAATGCTCAGGTCGAAAGCTTAA AAAGGCTGAAAAATGCTTGAGGGGATGCTTAAATCTAAACCTTAAATTTA AGGAAATACTGAAAATCCGTAAAATTCGAGCCAAAAAAAGCTAAAATCAG GAAAAAAACATTTTTCGTAGGCTCAAGTAATGCTTGCCATATGCTTAATT TTTTCCCATATCTGAGCCTAGATATGCTTATAAGTGCAATGCTTATAAAA AAAAAACATGTACTCAAAATAAGCCTAAACCAAACGGACTGACACAAAAT GTCAAAACAGCATAATATCTAACGTCCATTAAAACGTTAAATGAATGTTG AAACAACGTTATGTTCTGAAGTCAATTCGCTTTAGTGTGCACTCTTTTTC GCGACCATACAAAAACCATGTTAGCGTAAAGGCTGATTCCTTTCAAGCGG TTTCCATAATGGTAGAAAAAAAGATTGCACGCATTAAATAGCGAATGGTG GACTTCAGGTTAGAATGAAGTGGTCGTTAAAGCAATACTTGGCCTGAGAT TTGCCTTTAGTCATATTAATTTTACGTTTTAATTTCGTAGTTTTACATAG TTTTCATTTTAAAGGTTTAAAATCTAGGGATAGATCTAATCTTCAAAATT TACTAGAAATCTTTTCATTCTAACATGTTTGCCAAATTACTGATAATTAG TATGTACGAATAGATGTCAGCTTGTTGTTAACAGATCTATCAAATCTCTT ATCAGCACATGTTTTTAAATGTGTTTATTAGCATTATGTCATACTTGTCA TCAGTAATATTTTTCACAGGGAAGTTTCTACTATCTCATTAATTATCGAT CAAAGAGATTTTTTTTCAAGGTACATGAAAAAGATGGTAAAATACTTCTG TTTGACAAGAATAAGCGAGAAGAATAGTTTTTAAGAACACGAACGAGGCT CAAAAGCGCCAAGAAATAAGAACAATTTGAGGACAATCCTGAGCCTTGAA TGATTGATTCTTAAGAAAATCTAAACTTAGTAGAATGAGTTAAGACTACC TCAAATCACCCTTAATATAAGAGAATGCTGAGTAAAATTCGAGGCTCAAA GTGCCAATTTTTGAAGACCTTAGCACGTGAAGCTATATATATGCTTTAGA TATAGATAAAGCCATTTTATGTTTTATCCAAGATAATATTTTTAAAACCA ATACTATATTGTTTAGCCAATGTATGATAATTTTAAAAATGGCAACTAAT TTTTAATTTTCCATTATTCTGCTATTTAGACTCGGTAAAAATTTTAATGC GGGGGTAACTTTTCTTTAATTTTCAATTTTTATGTTTTAAAGGTAATTCA TTTATATTATAGGAAAATATTATTCCACGAAATTTTATATCATATAGATC AACAGTTATATTATAATACATCTTTCAATTATTCGACTTTTAAAAATCTA TTGAATCTTTTCTTACGAAGTAACATGTAGCACTTAACTCCAGTCCCTTA ATTGAGTTCATAATTTTATCAGAGCTTTAAGAATTTTGCTACAATCGGCG CCGAAATATTTGGCAAAAAAGGGGAATTCTCTTAAAACTTTAAAACCGCA AGTGATTTTTAAGTGCTTTGAAGTACAGTTCGGAAGTAGAGTTTTAATTC TGAGTATTGAAATTAGACTTAAGAGTTTGGACCTTAGGATTTCAGGTTCT AAAAGCTCAAAAATGTTCCAATAAGGCAGAGAATATAGTCTGGAAGCCAC TCCTAAATTGAAAAATTCCGATGAAGCAAAGTGGAAATACTGAACCTGCA ATTCTCGCTTTGACCTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATACCAAAAATG GTCAATATTTTTCGGTGCTGATTGTAGCTACAAGCCCAATCTAACAAAAG GTATCTATCAAACCTTTAAACTTTTTTACTGGGGCCATTCCCTTTCATGC AAGAAAAATTTCCAGAAAAAAATTCAGGGGGTAATTACATGTGGCTTGAA AAGGTTAGTCCATCCCTCTTATGAATACTAAATGGAGTAGGACCCCTCAC GAGACTAGTCTGTACACAAACCCGATATCTACGGCTAATTTCAAAATTCA TTGCACTAGGCTACGATAATCGTGAGATACACTCTGGTACAGATTATCAC GAGACCATCTCTTCTAATTTTTGGTTTCGTCACGATTGCGAAAATTTCCT GATCCCGCATCATGCAAGAAAGAAGCCTCATCAGTCACGCTAATCGCCCT GGGATGGGAGCGATTGTATACATCTTAATTACCTATTACTTCATTCTTGA ATGATAAGAGATTTTGTAAATAAAATTTTTCTTTTGATTATTTCACTACA AAAATCAAAATATATACATTTTAATACTTTATAATATCTTCATAAAAGTG GAAAAAAATAATAACATCTTTGTCATAAGTTATATATTGTACATGATTGT TTCGAAAATGTCTATTTGGGATACCAATTTGGGACACCTTTTTGATTTCA GAGTCACCCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00045879TCONS_00045879Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00045878TCONS_00045878Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00045878-proteinTCONS_00045878-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_102supercontigscaffold_102:232213..243922 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.35 0.5 0.2 0.5 29.67 20.53 13.12 13.48 9.16 9.46 7.64 5.54 5.1 4.86 4.72 5.64 6.41 5.22 3.34 4.45 6.95 7.01 4.16 4.55 5.43 5.77 14.06 11.21 16.67 14.15