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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021040 ID=TCONS_00021040|Name=TCONS_00021040|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4219bp TTTTCTTTGAGTGGAATACAAGGAATGGAATATTGCAGGAGAgcattttt taaatgtttacagTTTATTGGATAAATGGTcttaattcgaattacagaag atTTCCAAAACGGtgaaggttcgaattagagagatttaTTCGGAGTTACT TGAGAGGAAATGAAATGTTAAAGAAATGTGTCACTGAATCGCATAATAGC TATTTGCAGGAAATTCAACTTTTATGATTATcggattgaaaaatttaaca CAAAGAGGATGAAGAAGTAGACTAAGTCGGCGAATAAGCGTATGATCCTG GTTGAAGACGACGTTCGTGTAAAGGTTTGTGTTGTGGAGAACGGGTGTAG CAAAGTACACGTATAACGCACCACTTGGCAGTTGGTATGGTTTTGTTGTG GCTTCGCTTTTCGCTCCCTGCCGCCTGCCGCCGTCTGGCCTGGATGGAAC CCAAAGAtgaaagaagccattgtagtgcaatgtttacatttttggaaagt tctaAAATGGTAGAAGAAGCTCTGTAAATAAAAATTAGACTCTTTTACGT GTTGTGTCGTTCACCACGTTGAGTTGAATTGGTTGGTTATATTTTAAAGG CTTGATTCATACTTTTGCTTTGATACATTTGATTCTCAATATCAACGTCA TACTTTGAAGTTCTGTTTATCCTCTCAGTTAGTATATTTTAAGTTCACCT CTGATTGGATATATAAACACTGCCTCGAAAGACAACAGGAAACATATGAT TATGAATGAAGGGTAGTGTTTTATAGGTAGTAGAACCTAGAGGTGccttg tttttcatttgtttcatacTTCAATTGGTAATTTTAGTGATTGCTAAAGT ATTTGGAGAAGCATTTGCTCTCTGACTGGATGAGGTGCTCTGCATTGTGG TGGTGGCGCACAAAcaatttttagtaaaaaaaccATTCCTTTCATCTTTT AGtgaatagaaaaagaaagtagcATTACATGAATCAAAATGACAGAAATG GTTATCATGCCAACAGATGAACGTATCCCACCGATGGGATCAGAAGCTGC AGATACACACTTCAATGAAACTGCTGCATACGATCCTAAATTAAATACAA GAGACTTATCACATAATAATAACAAACAATGTATTCCTCATTACGAACAT TGGAAGGACAGCTTACCAGATCTATTAGATGACACAGAaggatataaatt attttacgAATTTCTAGAGCAAGATAAAAGTATCACGTTATTTGAATGTT GGTATTGCTGCAATCAATATCGTAACTTGCCACCAACTAGAACTAGTGCC AAAGACATTTATCATAGATTTGTAAAGAAAAAGGACCCACATATTCCAAT TTCTGAtcaagcaagaaataatttggtATTGAGGATAAAGGCTAACGATA TTACAGAAAAAATTTATGAGGAAATTGAAAAGGAAGTTTACACTAATTTA AGGGACAtttgttatccaaaatttttaaaatcagactGTTTTAATCAATA TTGCGAAAGTTCTGGTCAAATGCGGTATGCAGAATATAATACCGATTATG GAAAGCCATCAACAAAATATAGTGGAGTCCTTGATCACATTGACAAGCAT GACCAGTATCAACCTCAATCAAGATCAGAtTATGAAAGGCAGTATGAATG CGCCCGTCATCCACACCACGATCGAGTTCACGGACCCTCATCCAATTATG ACGATCATCATAGCATGCCGTCAGATTATGATCGTAGCTCTATAACAGAT TCCAAAACTTCCATggGATCAAGTAGTCGACACGGTAGACCGTCTCGAGG TCACAATCGCGATTACGATGGACCAATGGACGTTAACAATTTCAAGCCGC GTACGCAGCGAATCAATCAAGATCGCATGAAACCGATGAAACCGACAGAC TTTGCTGCACTTTTGAcgcaaaaacttgaaaaagtttTGATCGACCGAAC TAGAGATGGCCATGATAATTCGTCACACCATTCTCATGGTGACTCAATGG ATCTGTCTTCAATGAAACATCATCTACCAGGTGGACACAACAGTCGAGTA CCACCCCACCATCAACCTCACATACACGATTTCGATGGCCAGAGTGAGAG TGACGCCCAATCTTGGGTGCTCTCTGACCGGCCAAGCGTCGCCGGACAAT CATCACATAGTGGCTCACACAGTggtattttaatgaaaaataaagcaaaa gaaCTCAGAGATAAAATTCATCATCATATTCGAAGTGACTTGAAAGAATG TCGTTGTGCTGAGTGCCGCCTCACGCCCTCCGTACATTCGGGCGGTCGTC ACGAACACGATTCGCATGCACGACACGGTGGCTCAGAACATGGTTTTTAT CCACACAGTAGTAATAGTAACTCTTATAATTATTCCAATGATACAATACA AGACCGATACAATACAATGTCGTCATCATCTCACCATCGTGGTTCCTCGC GCACGCGTGAAACGCACCCGCATCCAGATGCTGCACCACCATTAGACACT AGTAAAATTTATTCTTGGATGGAGAAAAACGAACGTTACCAACATCAAAA ATCGTACCCAGACCCCTCCCCGTCACCTTCTTTACGTCGAAAGAAAGCAC CTATACAATATAACACAAGTAGGTCACAGAACTCTCAACAGCCTATTGCG CAAGATACGGGCATGCCGTTATTACCACAACCTGACCCAGACAATGTTTT ACAAGAGGTTAAACGGAAACTGGAAGAACCCTCACGATCACAACAAAATC ATCACCGATCTTCaagacaacaacaacaatatcATACGCCCCATTATGAG GGCGGATACCACCCTCATCACGATAATCAATCAATGGCTTCTGCTCCTTG GTCGATGTCTGATAACTCTTCAATTATTTCTTATAACCCTTCACAAGTTT CTACCGTACCTTCATCTGCGTCTAGATTATGGAACGCTCAAGGTTATTAC AAAGATGCCGGTAGTGAAGTCAGAGACGATCGTTGCACGCCTAGCGAAGT TCACTCGCAAGCAGCTTCTAAACACAGCGGTCCGCGTAGCGTGACACGTA GTGATCATATGAGCGCTGCACGCAGTGATCATCACAGTGACGTAAGATCA CAATCGACGGGAATTAGTTACGGCAGTGACGGTAGTAAAGGACGTTCTTC TTCttctaaaaataaaactgtTATCACGTATTATTACGGTAGTGAACCTA TCCCGTACCGTATTAGCGTTCCGACTACGGAGGTTACGTTGTCACAATTC AAACTCGAAACCAAACGTGGTAATTATCGCTTTTTTTTCAAGACTGTTTC CAGTGTCGATGGTGAGGTTGTTTGGGAAGAATTCAAAAACGATGATGATG TCCTACCTAAATTTAATGATAAAATTGTTGGCAAAGTCGATAAGATCTAA TTGACTTTGGTTTTTGGATTTATTTGTTGTTATTGTTTGGATTATTTCTC TTAATGATAATCATGACGGAATTGTTGTTAATGTGGACCAAGTTTTGATT CTACCATAATGAACTTATaatatttatgacgtaatgttttaaacAGAAGC ACCCTAAAAGACCAAACAGCCGGTCTAATTTTGAATTAAACAATAAACTA GGCCCTGGCTATTTTGGGTGCTTGCGTCTGAAAAATTCCGACATGAATGA TTGATCATGAATTGATAAATgcgttgtttttttatatagaTCCTCGTGTT aatgattacgtcatgaatattattGTCCGCTTGGTTATATTATCactgtc ttttttttttcaaatttatgctCTGCATTTAAAACTTTATCACTATTTAT ATTTTGCCAATTCTTCTACCCCTGTTTGATACCCCTAAatatttgttcaa ttttttaccTTCCTCGTACAGGTTCGGGAatcgaaattcattttgacaaa tttgaactttttgccaAGTGTCAAGATATTCTTTCCTTGCTTACTCTTGG CTTTACCTTTCCAACTTTCTTCCTTTTTCCTTTTATATTCCttcctaaat tttttaaaatagatattttacaattttctccCTTTAAGTTAATATACAAT ATACTGAAaagagttttattttttactagATTTATCTTACTACCCCATGA TTGTATGATATTTTAAGATAAACCCCGAAATATACCCCTTTATAATTACA CCCCAATATtgtgaaaaaatgaaataatatcaaaaaatacaacaaaagga aaaatgtgaaaattaacaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000377:136245..149964+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021040 ID=TCONS_00021040|Name=TCONS_00021040|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13720bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:136245..149964+ (Clytia hemisphaerica) TTTTCTTTGAGTGGAATACAAGGAATGGAATATTGCAGGAGAgcattttt
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TaatgattacgtcatgaatattattGTCCGCTTGGTTATATTATCactgt
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TATTTTGCCAATTCTTCTACCCCTGTTTGATACCCCTAAatatttgttca
attttttaccTTCCTCGTACAGGTTCGGGAatcgaaattcattttgacaa
atttgaactttttgccaAGTGTCAAGATATTCTTTCCTTGCTTACTCTTG
GCTTTACCTTTCCAACTTTCTTCCTTTTTCCTTTTATATTCCttcctaaa
ttttttaaaatagatattttacaattttctccCTTTAAGTTAATATACAA
TATACTGAAaagagttttattttttactagATTTATCTTACTACCCCATG
ATTGTATGATATTTTAAGATAAACCCCGAAATATACCCCTTTATAATTAC
ACCCCAATATtgtgaaaaaatgaaataatatcaaaaaatacaacaaaagg
aaaaatgtgaaaattaacaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:136245..136534 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:136245..136534 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:136245..136534 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:136245..136534 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:136245..136534 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:136245..136534 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:137069..137161 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:137069..137161 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:137069..137161 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:137069..137161 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:137069..137161 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:137069..137161 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:143838..143972 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:143838..143972 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:143838..143972 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:143838..143972 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:147718..149964 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1491911889:147718..149964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:147718..149964 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1510915933:147718..149964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:147718..149964 | TCONS_00021040-exon-sc0000377-1575043694:147718..149964 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000377 | supercontig | sc0000377:136245..149964 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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