TCONS_00019759 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00019759
Unique NameTCONS_00019759
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1408

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00019759 ID=TCONS_00019759|Name=TCONS_00019759|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1408bp
ATGAGTGTAGTGGGTTGTTGTCGATGGCTGAGTTGGATGAGTATAGTGAG
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GTAGTGAGTTGTCGTGGTTGATTTTGTTGTTGTAGGATGAGTTGTAGGAT
GAGTTGTT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000335:269208..270671-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00019759 ID=TCONS_00019759|Name=TCONS_00019759|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000335:269208..270671- (Clytia hemisphaerica)
ATGAGTGTAGTGGGTTGTTGTCGATGGCTGAGTTGGATGAGTATAGTGAG
TTGTTGATTTAGTTGTTGGTTGGGTAGAATGGGTTGTGGTTGTTGGGTTT
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ATGAGTGTAGTGAGTTGTCGTGGTTGATTTTGTTGTTGTAGGATGAGTTG
TAGGATGAGTTGTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_011106XLOC_011106Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1575043694:269722..270671TCONS_00019759-exon-sc0000335-1575043694:269722..270671Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1575043694:269208..269665TCONS_00019759-exon-sc0000335-1575043694:269208..269665Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1510915933:269722..270671TCONS_00019759-exon-sc0000335-1510915933:269722..270671Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1510915933:269208..269665TCONS_00019759-exon-sc0000335-1510915933:269208..269665Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1491911889:269722..270671TCONS_00019759-exon-sc0000335-1491911889:269722..270671Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019759-exon-sc0000335-1491911889:269208..269665TCONS_00019759-exon-sc0000335-1491911889:269208..269665Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000335supercontigsc0000335:269208..270671 -
Expression

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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00019759 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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