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transcript sequence >TCONS_00019381 ID=TCONS_00019381|Name=TCONS_00019381|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2464bp TTGGTTGCGATTCCTTTTCTTGAGATAGAGCTATTGTATTCGTTGTATGA GGCTGGGTTGTAGTTCCGGGGATAATTATGGATGATGGTGCAGTTTGTTT GGCTTCAGATGATTAAGTTGGTTGAATTGAAAGGAATCAGTTGGTTTTTA TCCTTGCACTGCAAAAGTATGTGTGATTTTGTTGGTATTGACAACGCTAC ATTAATCAACATAGGTTGGGACTAACTGTCTAAGAAATTTCACAGCCAAC CAGATCTTAAAGAAAataacagcaacaacaacattGGAAGAAACACTAGC AGTATTAACATCAGCGACATCAACAACTTGTAGCAAGTCCAGCAATAGTA TCATCAAAACAGCCAGCAAAACTAACATCCAACCACATATGCAACATTTT TGCTAAACATTGATACTAAAACTATCAGTTGGACCTCAGACGACATCACC AACAACTTACCCCAATGGAATAAATAAATTTCCATGGCCGGTGAATCTGA AGAAAAACTAAATCAAAAAGACGAAGAACAAAAAATCGAATTGACAACAA TGACCATTAAAAACGAAGTTATTGACGATGTTTCCCCGACTGGATATCCA AGACCAGAGTCTGCGTCTCCTTCTGGTTACCCAAGACATTCATCAACATC GTATCGGAGATATCCATCAGAGAATCAAACTGCTGAAAGTCGTTCATCAC TAGAAGACTGGGATGATGAGCCTGAATCACCTTCCAGATTCCCTGCTTCT AAGGTGACACTTATAAACGAGGAGCCTGAACAGCGTGGTCAGCATTATTA TGAGAGCTATCAGACAAGACAAAGTCCTGACCCACGAAGACGCATCGATC AAGAACTAAACTTAGATGCGGACAGCCAATCACCGAAATCTCCTGGCTTT TATAGTAATGAAACTAGAAGAAGTAACCCCGATTTATCAAAATATGATCG CCAATCTTCATCGCAAAGAAGTAGTGGCTCGCCTCACGAAAGTATTGAGC ATTCAACCATAAAAAGACAATTTTCAAGACCAGATGAGTCTTTAAAACGG AACACAATTGTTGAGCCACCACCGGTAAGAGAACATCGCTTTGAAGGTGC TTATAAAACAACTGGTGGTGATGCAGCTGAAAAAGTCTGGCTATATGAAG AGAATATCAAAAAGCTTTACAATCTGGATAAGAACCCGCAACGTCAAATA TTTCTGGACGAATTTTTCAGCTATAGAAGAACTCATGGCCTTTATTGCAA GATTCCCGTTATCGCCCGAAAACCTTTAGACGTGTTTTTACTGTATAGCA TCGTTCAAAAGTACGGTGGCTTTGAACAGACGATGAAAAATAGAATGTGG AGCCAAATAGCCAGAGAATTGGAATTGCCGAGAACGATGACCAGTGGGGC GTTCACGCTGAAATTAAAGTATATTCGCCTCCTGTATCAATTCGAATGTT ACAAAGTCAAGAAACAAGTTAACAAATCAATACTATTCAATGAAGCATCC ATCTTACCAGAACAGATGTCACAGATGAATGATCACGTCCCCCAGCACCT ATCAATCCACCAGCAACAGAATCCAGCTTATAGACAACATCAACAAACAT CGAAATCATCTTCCAATGACCACCGAAGGGGAAATGATGATTATTATAGG GAACGACGTGATGAACACTCCAGAGAAAATATGATGAGAGTAAAACAAAG AGATGACCAATTCAATGAAAGACCAACTTTTTCCAAAACCGATCGGAATC GCTATTCACCACACAGAGATACTGGGGGCTCATCACCATCCTCAAACAAC GATATCGTTTTACGATCATCTACTCCACCTTCTTCCGATCGCAATCATCG GGATCACCATCGGCGTCTTCCACCTTCGATTCATAGTCGTAAAAGAGGAG TCCATGAAGAATTGGACGATGATACCGATACAGGAACATCGGGATCACAA CCTAAATCGCCTAGACTGGATACACAATCTGTGTCTAGATTTTCTGTTGA TGTTGTTGAATCTTCGAGAGATAGTATTGTGTTAAAGGTCAGAATGAACA ATGATGTTTTTGAAGGTGTTCTTGAATGCACGCAGCGGGGAGATATCAGA GATTATGCTGCTGAACAAAAAATGTAACCAAGAGAGAAAGAATATACTGC ACAGAGACTACGAAGAAAAGTGTCATCTgagtaattcatgatattcatga cgtaatattttctacggaaagaccccagtTTGTGTAAGTAGTGGCAAGTT TTGAACAACTTTTCTCTAGCTAAAACTcaccactactggcaaaaaccggg gtatttccgtagaaaacattaagtcataaatatcatgaatttgtaAATTG TACACCATGTAATAAAACTCAGACACGGTAAGAGTGATACAAGGATATTG TAAATCAAGAAGTAAACAAGGATTCTAAAATACCATTGAGTCATCGCCAA AGTATCATTAAATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000326:238634..269260+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019381 ID=TCONS_00019381|Name=TCONS_00019381|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=30627bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000326:238634..269260+ (Clytia hemisphaerica) TTGGTTGCGATTCCTTTTCTTGAGATAGAGCTATTGTATTCGTTGTATGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000326 | supercontig | sc0000326:238634..269260 + |
Blast
BLAST of TCONS_00019381 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ARI3A (AT-rich interactive domain-containing protein 3A OS=Homo sapiens GN=ARID3A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 111.694 bits (278), Expect = 2.388e-25 Identity = 45/107 (42.06%), Postives = 74/107 (69.16%), Query Frame = 1
Query: 1138 WLYEENIKKLYNLDKNPQRQIFLDEFFSYRRTHGLYC-KIPVIARKPLDVFLLYSIVQKYGGFEQTMKNRMWSQIARELELPRTMTSGAFTLKLKYIRLLYQFECYK 1455
W YEE K+LY LD +P+R+ FLD+ FS+ + G +IP++A++ LD+F+LY +V + GG + + ++W +I + L LP ++TS AFTL+ +Y++ LY +EC K
Sbjct: 223 WTYEEQFKQLYELDGDPKRKEFLDDLFSFMQKRGTPVNRIPIMAKQVLDLFMLYVLVTEKGGLVEVINKKLWREITKGLNLPTSITSAAFTLRTQYMKYLYPYECEK 329
The following BLAST results are available for this feature:
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