TCONS_00018333 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00018333
Unique NameTCONS_00018333
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length834

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00018333 ID=TCONS_00018333|Name=TCONS_00018333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=834bp
ttCCCACACGGTGGTCTTCCGATGGTGCAATTGTCACGTGACAGCTTTTA
ATGTTCCGATTGGTTTGATATAATAAGAACTTCGTCACCAGTTACGCAAT
GTGTTCAATAGGGGATTAATGAGGTCCTTCTCTGCGTTTGACCATGGAGC
CTCAAATAAGGAGAAGTAATGAATGGCCAAATTCAATAATTCAAGTAGGG
TTTTCAAATTCCGAGTGTTGGGGAAAACGAAAGCGGACGAAACGAAGATC
ACGTCATTATCAGACCTGCTCCATTCATCCACAGAAGAGTTGGAACAATA
CACCAACTTCTTATCATTGATGCCGATGAGGAAAGACACCAAAGTACAAG
AATATGTGCCATCAGAGTTCCAGGAACTCACTCGGGAAGAACGAGAAGAT
TGGTTGGAATTACAGTGCGTTCTATTCGAAGAAGAAACTCGATCCTCACT
CGATACAAACAACGAAAACGATAATTTTATCGATGATTTCGGAAGATATT
TGAAGAAAGTGACGAGACGCTGGGCTTCTTGGAATCACAGAAGTTTTGGA
TCCATCAGTTCCATCGATCAAGTCAAGGAGCTGGTCGATTGGGAAGAGCA
AACACAACAGAAGTTTCCCACAACAAGTCAACAACAACAGTCCATCACCA
CAAACAACACGTCAGACACATCTTCCAACGAAAACAATCCATTGAAACGC
TTTACACAATACTGTGAGCGCTCAAAGAACTTgttacacatttttcgaat
cgATATTTATAGACCGTTATGTGATTATTTTAAAGACGTCGAAGACGAGG
TTCCTAAATCTGTGGAAAGGATCGTCCAAAAGTG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000297:9992..25207+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00018333 ID=TCONS_00018333|Name=TCONS_00018333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15216bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000297:9992..25207+ (Clytia hemisphaerica)
ttCCCACACGGTGGTCTTCCGATGGTGCAATTGTCACGTGACAGCTTTTA ATGTTCCGATTGGTTTGATATAATAAGAACTTCGTCACCAGTTACGCAAT GTGTTCAATAGGGGATTAATGAGGTAATATCTTCTTGGCAAAGAAAGGGA CGAAAATAACTTTATCCTCTTTGTGTGGTCCACTTCTATGATTAATAAGG AAATTTTGCCAACAACAATCAATAGTTTTTTTGGTAACTGTTACGGGAGT ATGCTTACGTTTCCACAATTTAATCGCCTAGCGTGCTTTACTTTCCAttt gaatttgataaaaaacgGCTTTAGAGCGTTCACTCGAGCTTAACTCGCAA TCAACTTTCATCATGATTCACATCTCCTAGCATTTTGGCTGTGTGTTGGC AATTATTGCACcattttacaaaatatcttCCGACATTTAACTTCGTATCC TTTTTAACCAGTGTCTAACTAATGGACCACACATGGTAGAGTTTTGCCTA TTTCCATCACTAATTTACACTAATTGTCATCGTGTGCTTGCCACGTGTTT CATTTATTAGTTTCAATTAATACCTTGCCAAGATGGCACGCCTTGATACG AAAGGGTAGAATATCGAATTTGATTTCCTGAGCCTATCAACTGTCAATTC TTGAAATAAACAAGTCAAGATTAAAGTGAAAGACCTGAAAAAGTGATTCA ACCCCTGTTCGCTATTTCAGTAACAAACAGGGGTCAAATTCTGGTTTTTC CCGGTGTTTCCCAAAAGGAAAAATAATACGCAATCTGGACTTAAAATCTA TTTATCTTTTATCCATTGTCAAAAACATATAATAAGGCCAATTGGAGACT GAGCTTCGGATTAAGGGACTGTCTTTTTCTCCTTATCCGAAGAAAACCtt ttaaaagtaaattttttaaaaaaatttgaacatcCTGGGTGGTACTCACA GCGATGCGAAAACAAATCAGAAATTACAGGAACTGCTTCTAAAACTGTCT AGACTATAATTAGTAGAAAATAGAAAGGCCACCAAAGAAGAATGAAAATG GAAATCTATCTTGAAAATTGCTGCGTCATTATCTCGTTTTACTTTTCTTT CAGTCTTTATGATTTTATTAATTAGTTTAGAGGTTGATCGATATTCTTTT GTTTCTCAGTATCGCACATTCTTTGAGTTTGCCGACCACCTAATTCACTT GTAATTTTCTTTTAGGTCCTTCTCTGCGTTTGACCATGGAGCCTCAAATA AGGTAAGTGCTCTCATTAATTCATCATGGATGTGAAACCATGGTTTTCCA GTTTCGATTAAAAACTTCATTGGCACACCTTTTAAATGTCACTACATTCT GCACCTTGTAGAATTAGAAGGATTATAATTTATGCTTGTTTTATGACTTT GCAGTGTTTTTTTGGCGGTAATTAGTTCATTTTACCAATTTCTATTTAGG ATtgcagaaaagaattttttacaATCTACTCAATTCTTCTACCTTTGTCT TGGGAAAAGATTTTCGTTACTTTGATGGAATAAAACTGTGTAAAAGGACT TTTCGAATTTTGGGGCTTGATTTCCTGGTTttaacccactggaaaattta ccaaaatttgcATTTCTAAATTAAAGATCGAGCTTTTATCCATTGAACAG GAGAAGTAATGAATGGCCAAATTCAATAATTCAAGTAGGGTTTTCAAATT CCGAGTGTTGGGGAAAACGAAAGCGGACGAAACGAAGATCACGTCATTAT CAGGTAACGTTCATCTTATATTCTGGGAGAGAATCAATTTTGTGTTAGAA CTTAAGGACAAATTAATGACCATCTTAAgcatccccttctcacaaaccag gtaggattttttcatcCAGTGAGCGTAAAAATAACGGATCAAAACTCgat tgggattgatattcctatgtTTTTACTGCTGAGGATTTGAATTCCACTGT TTTCGAGCCAgtaaattcagtggggatggaaaaaatggcataatattttt cagtgaggattggtttatttgattattttcagtagggacaaaaattggag tataattttccaccggggacgatattttggccaattatttcaattttttg tgagaaggggtcccagtggatCTGCAAGAAAGAggtgttcttaaattttc aaaaatgttgaaaattatgAATTGATTTAGCCTCTGAAACGAGGACTATT ATTAATtacgaaaagaaaatttttgagaacATTCTTGTTGTGAAATCGTG AAAACATAAGAACGCATATTTACTGGTTCTGGTTAAAGAAAAGATTGCAT TTCTAATCGCAACTTGTAGGATTGTTTTGTTCGGTCAAAATGTCAAGCAC GTGATGATCGGGTTTTAAAATTCGAGTGTGATTCGATTTCCTTGGGGTTT TGTTCGACAATCGTAAATATTTTACTGCTCCCGATTGTAAatccttttgt tttcatttttcaaaatattattccGTTTACTTCGTTGCATCTCTTCCAAA GAAAATCTTTAGTCGTGGTGGAATTGAAATTAGGGAAGAACTGAGAGAGA GAATTTGCAGTCATCTCGACAAACATTTATGCACTTACCCCTAGCTGCTT TCTCGAGAAAATACTATCTGCTCTCTGATCTTAATGAGTtgacagaagca gccaccggcGAAAGATTCACAAATGTTCTTTTTCCAACTAACAGGAAAGA TTttcgaatttcaaaaacaaattccCCAAATAAACGAGAACTAGGCTTGA GTTAGCTTGAATTGCTACAAAAACAGGTCGTTTTTTTTCAGTCAAGTAAA GATAAAACGATAACATCTATATAGAACGGAATCTTCTGAAGAAAAATTTT CCTGCTCgaccaaaattgaaaaagaataaaatttcAAAGAGCCGATGAAC CTCTTGTTTCATTTAGAACACATCTAAATTCCAGGTAAGGTAAATTTTAC TTGAGAAGAGATCTACACTTTCCAGTTgaccaaattttcagttttcgtTA GTTCAGATCCCCATTCCCAAGAGGAGCATGTGTCCAGAATAAATTATTCT AAAGAACCCTCTCGGTTGATGCTTTCGAACTGGGCAACTATGAAAgtatt tttaaatgatttcagaaaaaaatattgaaatattgatTGATATCCCCGGT GATATTAAATAAGGAGGttaggaaaaaaattattttcaaaccaCAATAGA ATGACACTGTCCACTtgcaatattgttttttttttaagattctttTTGCA AATCTTCAGGCCGCACACCTAGATACCAGATTAGGTACACGGTCCGTTTT TTAGCTTCAGTagtatccaaaaaaaaaaaaaaaatagagaatCACAAAGA AGTCTCCAATACACAGGTTGtcaaattaaagtctgaagacaaatcacgct tttactcgaaatttttatgtgcttgttacatgacatttatttctgattgg ttttaaTAAAGTTATCATCTGTAAGCtttaaagcaagtaacatgggaata aaatcacgcgAACTTTCTctagtaatcacatgttttgactgcattgatat aattttgcaacccgtgtattcaaaatttctgattttGAGTCGAGAATtaa gaataattttgaaaagcttcagaaagttttggaaaaaactaTTCCAGAAT TTTCATTGCCACCATTTTCCAATGGTTTAAAATGAGTAAAAGAAGTATAC CAAATAGTTTAAAAGTAAAATAACTCTGAAGAACGAGTTACTACCCGATA GCGATACTACTCCCCCCGCACAAGTTTTCAAGATATGATTTAGCAACGGG TTTCTTTTGATCGATAGCCGCAATTAGTGTAAACAactaaattttgtttt cttctgtACTTTGtggctttctttgtttttttttcaatccacCGCAACTG TGGTGGGTGGCACGCCATTGCGGAAAATAAAACATCTCTATATCTCAACA ACCCTCCCCCCCCTGTTTCAGACCATCGACTAGATTTAGTGGTCAGGCTT TCAGTGAGTGAATCATTAAGTAAGTCTGCTGACTAAGTCACGTGCTAATT AGTTCATCTTTTACTCCCTCCTTCTCTCCCTCTCTTGTGTGTTGACTTTC CGATGACCAATATNCTGAGGAACGAGTTACTACCCGATAGCGATACTACT CCCCTGCGCAATTTTTCAAGATATGATTTAGCAACGGGTTTCTTTTGATT GATAGCCGCAATAAGTGTAAACAACAAGATTTTGTTTTCTTCTATACTTT GtggctttctttgttttgttttttttaatccacCGCAACCGTGGTGGGTG GCACGCCATTGCGGAAAATAAAACATCTCTATATCTCAACACCCCCCCTT GTATCATAAATACATCTAGTCGATGGTCCATCAGCGGCAGGTCAAACTTT TCACTAAAAGTTTGACCTGCCGCCGATATTTCTTTGCGCCAATGGACCAT CGACTAGATTTAGTGGTCAGGCTTTCAGTGAGTGAATCATTAAGTCTGCT GACTAAGTCACGTGCTAATTAGTTCATCTTTTACTCCCTCCTTCTCTCCG TCTCTTGTGTGTTGACTATCTTTCCGATGACCAATATAAGAAGAATGATA TGAAAATGGCGACATTTTTGGTGGTCAAACTTTATGTAATCGCTCCACGG ACCACAAATAAAGCTTCTTTCTTTCTCTCTCTTTCTTGATATTGGCTACT CCACTCTCATATTTACCACTGCTTTAATTGTTTAATGACCTacaactttg ttttgtttttcgttcttttttcttgTTATAAAACAGTAACGAGCTGCGTT TTCTCGGACAATTTGATCTATATGATACGGACGTTTAAGGTGACGGACAG GCCTTTTTCAGATGGTGTGGCGGAATTCGACGAAATTTCCGAGTCAGGTC TAATGTTGGAGACGGATAATTGGGCTGATTTAGTTCGGAAAAACGGAATT CGGCAAACTATCGGTCGAAATGTCATAAATGGGagtacattaaaggaaga aattttggcgggaggAAAATTTAgcggatttggtcaaaatccgccaaatt aagttcccgccaaatttaagttgCTCTATTTTGCTATTTCAGACTTTAAA ACAGGTGTTTCCTTTTTTTAATGgtgttttttggacaaaaagaCCTttgt ccgccaaattaaattccctctgaaaaaacttattcggccatctgccaaat taaattcccgccaaaatttcttcctttaatgtattcGAAGTTGAATTGAA ATCCTGAATTTTCGACAGAAATCTAgaattttaaggaaattttcggttac ggaggtttgttttttgtttaaactGTTTGACGGAATTTCAGGAGAAAAAA ATGACGGAATAGCAGAATCGGGTACCCCCCCCTTAAACCTCCCCGCCTCA CTCCAATGGGAGCAATGACATTGCATTTATCTACACGAAGAGACCTCCAA CAAAGATTTGATGACGTCCGTCTGTTTTCATAGTCTTGCAGGATGAAGGT GTTAAGGATTTGTTAGCAATAAAGAATGAATTAAGCTTTCCTTTCGCACC TACGCATAGCTGATCTTTTACCGGCTTGAAGATAGATTAACCATCTGTCA AACGAGCTTCCATCTTATTACACGGGCTTAAACGTTGATGGACACAGCAG TTATTTGGAAAtccaacttcaaaagatgtgaATCTGATTTTGAGGGCATT AGTTACCTAAACTGATCATTTCATGGCAGGATCTATTCTGAAATAAAGCG GaacttttcttctttgtttGAGACCAACTTAATTATTGTGTTTCGTCCAA GCTCGAGCCCAGTCCTTTTGTTCGCTTTTTCATGATACTGATGGTACTCA CGAAAGgcctcattgagtttaaagcccgaagggctagagtaatATACCAT AATCATGaagacggattgtatctagcggttcctttgtttttgagggcgtt ctggatgggaaatcaGTGGTTTCATTTGTCATCCatgagtctcgagtcta gcccttcgggcttagaagTCAATGGTTACGCCATGTCAAAAAATTTAGTT ATCAGTTGAAAAATTCTAATGAAGAGACGTGCAAAAAGGCACGACTCATT ATTCCAATTAGAATACGAGTAAGCGACCACACACTTGGAGACAAAAGCTT TGTCATTAAactaattactgctttcagtcgGCTTTCAGCTTTTACTTATT TGGAAGGGAAGTCGTTTAGTGTAAGGAGACGAATTAATTACAAACTCTAA GTGGGTGACATGCTATGAAACTAAATGTTCTTCCTTCTTTCTTGTAAAAG AAAAGTCCCTTATTTTGCTTTCTATCTGAATAACACGATTTTGGTCTATA TTGACCGTACTTAGGGTTTCAGGGGTGTTCAATTTCCTAACCCCAGCAAT TCAATCCCCGTTTATTaagatttaaaaataattttgtagtATGTATATGA TGGGCTAATGGAATTTGATCACGGATCAACCTGTTCCTGTAGTGcgacat ccaaaaattttgaagccttggaatgttcttaactttttgagttttaagta taatattgttcttattttcgccatttacCATTTAACATTTccgaaaagcc ttaaaatgtatcttaacttgttcttgacattttgtccatcgaagccttat gttcttattagtttgttcttataaaaaaacgtgtaatcgaTTTGACATGA GCAGTTTTTTTTCGATTCGGGTCATGTATTATTTTCCGATTAATTGACga cgaaaataaaaacattataattGGTCACTTcttgttttcgaaaatcaaaa aaaaacaatcttcccatttttttttcactcctACTTGGTTGTTTACAACG CCTCAaaactttctctaatttgattttcaatcaaggagaattgaattttc atcgaataatggagcgtataaAATAGAAGAGTGTCGTtaatgagagtttc ttgttgacggtgactttcaatattatcgaataatagtAGAACATCGCATt cgagagtgtcaactgtattaTTTTTGTGACGCGTATCCAACTTTCGCTAA TAGGGGCTTTAAACTATTGAAATGTAACCTACGAAGTCTCTTATCTGAAG AATTTCTTGTCCACGAGGATGTAGTTTTTCAAGGACTattctcaggtgcc taataaacatCCTATGCTGCTGACATCCATTAACGGATTCGTTCTCCTtt actacctgtggttttgtagaggtctgctaTTCAGACTATAAACACCCCTG TTTGTTAACTTATTAGCagccccgcttattaatttgttaaaagaaattat ttcttgttTTGCTCTCTCATTAGCTAACTTTTTTCTATCCACTCCATTTT AGGAGATTAGGTACGATTTAGTTCCAATCTTCCtttaattatcattaaat ttgacatttttattaCGTAGGCACTTGACGGCTATAGATTAAAAGCAATG ATTCATTTTTAACTTTCTGtttaaaaatcgcaaaaaaacaGATTAAAGTA CGTGCTACAGCAAACCACTTCGTCATCATGACATTGTCTAAAATTCCTCA ACAATCATCAACTACCATGGAAACGTTATTGGCAAGATCACGAAACTTCT TTTTGTATTCACTTTGCAATATTGCTGTGCAATGGTGGTCTTTCACGAAC GGAAACTTCGTgtcaagaacaaactatataagaacattttaacaaGGCGG ACcccaaaacacccaatttcaaaaattgtgaatgttcttacaaaaaatgt gTAACAACATAGGTCTTTGATAAAATAATTTATCGAAATCTAATTGCGct gaaatgttaaaaaagaattaGCAGATAAATTCCGCGAATATTTTGGCGCC GTGATGACGCATTTGTTTCCTCGTTTGTTGATCGGTTCGCTGGTTGTCCC TGGTAATTTTGATATTGATATTCATGGATCTGATATGAGTATTCATTAAA TGAGTGGATGATGGGAAATTTTTTCGATCAGTTGAAAATATTAGGTTCGA TTANGATCAGAATATTCATTAAAGGAGTGGCTGATGGGAAATTATTTCGA TAACTACTTGAATATATTAGGTTCGATTTTCCAATTCTTCTTTGTAATTA TCATTCAATCACTAACGGTGTCATTTCTGTAACTTGGTGCCGCCATCTAA CGAGCTCTTTAAACAAAGCACGCCTACCTCCAAGTCGTgtaatttctatt tttgaatgttATCCCAATATCCTAGATGAGGTACTTGATGGCCAATCAAT TTCAAGTTGAGTAGTTGCGGAGGAGAGTCCGTTAATAAAAGGTGAGCGCT CCCTTGCCTGTTAAGGATTTAGCCGCTTTCCGTTGTTGAAGTTTCTTTCT CCTTTGAATTAGATTGTGGACTTCTATTTTTAACTTGAAGTATGTACGAA CACAATACTGAAAACACTCAAGTTGTGGACTTTCTATATTAGGTATGAAG ACAATATTGAAAAACACTTTTCAATCATCAACATTGAAAAATCGATTGAA AATAAACGTTCATTTTGTATGAGTTTTCTTTTAACATGGATGGCTTGAAT GTCCCCACCTAAATGAAGGGCGGGgtctaaaaatctttttgactgaaGAG TAGGCAACTTTTTTGTATGAACCCCACCCTATCCTCAGTGATGCAATGTC TTAACTTTTTCGTCGCCTTTAGAGTGTTTCCTCTACAAAATCAAATTGAA ACCGATTTTTTCGTGATAGTGCGATAGCGATTGATTTTTAGCAAGGACAA CACTGCTTGACCATAAATTCTTATTTTCCATCCATTGCAAGGAGTTCACT TTATTCgaaatatttgattatttttcgaTTGAAAAAATCAGTGGCCACAC ACTACTGTCATAAGGCAAATCTTCATTTGCTCTTTCTTTGATGCAACTTC ATTTTTTCGGAAAGCAAAGAACTATTTTTCAATGACAAGAAATGACAAAA GCTTGGTaggctttttcttttaaaaacacaTAATGTTTTCGAGTGAAGAG TACGATATAGTATAGTTCGAAGGAGAAAGCATTTTCGTTGATCCAACTTT CTCAGTCAAAAAGAAAGGTCTCAAAGTGAGTTTCCGAGAAAATTTGGGTT AATTTATGACGCTTTTGTTTGGATTTTATGAAAGTAacgttttgatattt tcttacAGATGAAACGACTCTTTGATTGTTTCCTCATTAACATGAAGGAG GCATTTCATGATCAGAAACAAATCACTGTGTGTGTTTTCTTTCGTCAGAA TGTTTTCTCTCTTTCAGCACCGTGTCATCAAAccttatttcttttttgta agaaaactcTCAATAATATATTTTGTTCGGTGGTCTTTCGAACGCCTTCG TCGTCACAGGCCTAAAATCTCGAACTATTTGCTGCATGTAGATATTTTCC TCAGAATATCAGAACTAAAATGAATAGTTCTTTTGTGGATAACTATAGTT TTGCATTTATTAGAAAATGTGTATTGCAATGTTCTTGTGTGAGAAAGGAA AGTGATTAAAAAAGGACTGGGGAAGGgtattgattgaaaaattaacataC AATTAAGTAATTTAAAAGAAGCTTGATAAGAGGATGTTATTTTGTATTAA GATGTAGAACAAGACGTAATCTTTCACATCGCACATAATCGTTTTAACAT TTcaagacacacacacacacacacagtcATCATTGGAGTTTCGAAACTGA ATGTTAGGATACTATAAAGCACTAGAATCGAAGACATCGTACATAGTATA AAGGGGTTTGATATGCTGAAGATTTGATTGGTTGACAACGAAATATTGAC AAGATGGTGAATATGAACCTGGTGATGAGTTCTTCACATCGTTCCTCATC AACTCCTTCTTCTTCGTCAGCTGCAAGTCAATCTTCTTTCTCCGGTAAGC TCCCTTGTTTGGCTGACACGCTATTTCTTGACCCTCCATCCCGCAATCAN AATCACTGTGTGTGTTTTCTTTCGTCAGAATGTTTTCTCTCTTTCAGCAC CGTGTCATCAAAccttatttcttttttgtaagaaaactcTCATAATATAT TTTGTTCGGTGGTCTTTCGAACGCCTTCGTCGTCACAGGCCTAAAATCTC GAAATATTTGCTGCATGTAGATTTTTTCGTCAGAATATCAGAACTAAAAT GAATAGTTCTTTTGTGGATAACTATAGTTTTGCATTTATTAGAAAATGTG TATTGCAATGTTCTTGTGTGAGAAAGGAAAGTGATTAAAAAAGGACTGGG GAAGGgtattgattgaaaaattaacataCAATTAAGTAATTTAAAAGAAG CTTGATAAGAGGATGTTATTTTGTATTAAGATGTAGAACAAGACGTAATC TTTCACATCGCACATAATCGTTTTAACATTTcaagacacacacacacaca cacagtcATCATTGGAGTTTCGAAACTGAATGTTAGGATACTATAAAGCA CTAGAATCGAAGACATCGTACATAGTATAAAGGGGTTTGATATGCTGAAG ATTTGATTGGTTGACAACGAAATATTGACAAGATGGTGAATATGAACCTG GTGATGAGTTCTTCACATCGTTCCTCATCAACTCCTTCTTCTTCGTCAGC TGCAAGTCAATCTTCTTTCTCCGGTAAGCTCCCTTGTTTGGCTGACACGC TATTTCTTGACCCTCCATCCCGCAAtcaagatcaaaacaaacatacaATC GTGGATATAAATTGTGAGGCAAAAAGAAATTCCCATGCATTCTCTCCTTG GGATGGTAGGACGGCCGTGTACACTGAAAAATGCAAATGGGGGAAAGGGC TGTATGTGTTTTCTACATGTTTACTGCAAATTCCTGTGTTTGTCTCAAAC ATTTTTGTCCACGATTGTACAGTTTTGTTTTATCGTTTCATTTCTTCAAA GTCGATTTTGATTTGACTCGCGTACGTTGTCCTTTGTCCTTTGCTCTGAC CGTAACTGTACATGCTCAAAGAACTTAGACTGATAACAAAAGCCCCTTTC CCTCAGGATGGTAGGGACCAAAATGGTATCCATTCATTTGTTCATTTGTT CGTTGGCTGGAAAGTACAAGGATTGCCTATGGTGTGTTCAATAAAGGCGA CTACTGAGAACTCGATTTTTGAGGGGGTTCATAAATCAAGCTTGTGATTT CTTGTTGAGGAAGAACAATGGTAtgcttttttaaagaaggcaGGGAAGAC AGGGAGTAGTGGGTGGCTCATGTTCTCCTACAATAACGAAGGCTATGATT TGATTGGTTGGATTAGCTTTTTAATGGAAAGATTTCCGTTCTTCCgaacc aaaataaaaaaccgGTTTCAAAAGATTGAAATGAAAAGGatattcctttt cttcttcgttgccttcgtttaaagttttttgatatgAACTGCATTTTGAT GACACCTCTTTCTGTTTGCGCCGTCGGTCCCAAATTAAggatttgaattg attttttgtcATGTTGTGTGTACCCAAGTCTTACTGGAGTCCTTTGAGAC TTATATTCTCCCTACCCATGCTTTTTCTCAAAACttcgtgtttttatttt tatttcgattttgtttttatttatctcCATGCTTTATAAATCgttctttt attcaaaaaattggGCTCGAAGACCTTTTCCTcccttttttatgaatttt tttgattttttatttaagaaagtCTCTATTAAACTTTTGGCTTAAGGGAG CTTGTTTTAGTGGAGCTATTGATGAAGGAGACTCGAACTTTCAATGATTA TCAATAGCTGTTTCTTTATAAAGAATCTGCTAAGATTTATCTTTTTAACC ctttttaacaaaatatttttatatatttttgttttgtttttctctgtGCA GATGTTGATGAATTTAGGGACCCCCCAAAAATGAGATTAGTCCTTCTTGT TGCCATGGGAACGAAATATCAACCGTTTTGTCTATCACTAAAGAAAGTTT CTTCACTCTTTTAGTCTTTACATAATTCTTCTTAAGATTGGAAGCGTTTT ATAAATGAGGATTTGGCGGCTGAATGAAATAAGTTGCACTGTTCAGAAAT AGGTTGTTAAAATTATTTCAGAGGTTTCCCGTGTTTATTTTGgagaataa tgaaaaaaattaattgtatTGAgtattaaatttggcggatacATTTATTT GTTTTGACGAGAATAAATTTGGACACATTTTGTTGACGAACTTACACCCC TGTCTAGCTTTACACTTTTCACTTTGATAATCTGCTATCGTTTAAAAAAA CCCTTTTCGAAATTTGAGCCTCTCGTTAGTTTACCTTTAAGGTTTCGCCA AAATGGAGCCTATTCTGCGTTTGGAAATTATtcatataaaaaacgaaaaa ataaaatgacaaatttgTTCTAAATACCAAGCAATGGGGAAATAATTTTC TGAACTGTCACAACCCCTGAGCTTGAATTTCAATTGCTTCGACTTCAGCA TAATGAAAATCCATTTTTGCTAAAAactgtaaaaaatatacagatGGAGT TTAATTCCCATCTTTCAGAGGGTGTGAGTTCggggtggcactttaatgag tGACTATGACGTTGTTATAACAACAATTTGTAATTGTATAACATGATTAA TTAAGTCTTTTCATAAATagcttttttgaagaaaagaataGCAACATTTT TTTTCGTGTAACGACTTTGTCAATGTAATTGCTTTCATCCTTGAATCTTT ATCTTGAATTTGTTGACCTTCCTTTTGATTCATTAATTTTCTTTGTGATG ATCCTTTACAAGAATTatcttcattaatttttcttctcgtttcttgtTTA ATTTTGATCAACTTGCCACAGTACTTCTcgatattttttgataaattttc ttgaattttttaagGTATGAATCAGGGTATTTCCACATGTGGGCTTGAAA GTTTTGACtctcttcaatattttttagtgGTCAGCTATTGTTTTAATCCT GGGACATATTCTTATCCGAACGTATGTCCCAGTTCATTGTTTctttatta tttcaaaaagGATCTCAAGAAAGTGTCAACTCAGCATAAATTATTGCGAA AATTATTAGTTGATCTAATTGAAGTAACTTGGTTGATTACCATACGTTAA ACGACTTCAATTTCGTAATTTAAAATGCTTCAACGAAAAAGTTTTCTTCA GAGAGAGAGAACGCATTCAGGGAGTTTATAATAAACATCGTTTATCTTCA TCAACTTTCTTCAGACCTGCTCCATTCATCCACAGAAGAGTTGGAACAAT ACACCAACTTCTTATCATTGATGCCGATGAGGAAAGACACCAAAGTACAA GAATATGTGGTAAGCTCTCGTTTCCAGCCCCTTAGCTCGCCTGTTAATGA TTTTGTACAcgctttataagaatatactttataagaatatttacgATGGA ATTGGCcaacaaattaagaatatggtaagaataccaCTATCATGGTAAAA TTTGGCAATTGGaactaagaatgccatttttaaggCATTTTACCCTTAAA TTGTCAATTATTACCCAGAAATGGTGAAAGGTTtgacaaaaataccaaat ttgggATTGGATCCAAgtctaagaatactgtaagaatctTTCAGGATGGT TTTcccgaaaaagttaagaatattcatgatgaattgaaaaaaaataccat tcttataaaaaaatattgcaattataagtGTTTTGAAAAGGGTGATTGAT AACAAGAGCAACTTCTCTACTGTCGACTATACAAAATTGTTgtcaaaaac aatattttgccttttgctattttttctcGCCTTCTTTTTGAACCTTTACC CCTTAGATGAGCCTCCACACAAAAAGCTCCTTGCAGTTGTCTGTTCGAAG CAGTCTCATGAGTGTCATCATTAATTACGATTAGTCATAACTAACCTTGC TTTCCTGGTACGAGCTGTCTTCTCTCGCACTGTGGTATTGGACTTCGGAA AAGATAATACTGTAGcatcttttcattttctttctaaTAACTGAAATCGA ACTTAGTTTTTCATCTTTTGCTTCAGCCATCAGAGTTCCAGGAACTCACT CGGGAAGAACGAGAAGATTGGTTGGAATTACAGTGCGTTCTATTCGAAGA AGAAACTCGATCCTCACTCGATACAAACAACGAAAACGATAATTTTATCG ATGATTTCGGAAGATATTTGAAGAAAGTGACGAGACGCTGGGCTTCTTGG AATCACAGAAGTTTTGGATCCATCAGTTCCATCGAGTAAGTTTCTCACTC TTTCGAAAAATCAATCATGTAACCTAAcgaagtttttttgtttttctttg catgGTAGTGGGGCCACAGATGAGGTAATACCCCATCATACCTTTGACTT CTATTCTATTTTTAACGACATGCTTATATTTTATTGATCGaatgattaca cgtttttttataatgaacctTATCTTGGCTCCGAGCCCAGACttccttat ttttccagagaatttcagcctcaaggCTGCTAAGATTGGACTGGTTTGTT GTTTCGTTAAATAATTGACTACAATTCAGAAAAAGACGTTAATTGAACGT TGTTTCATCAATATTTATAAAGTTTAACTCGTACTATtcctgaaataatt tttttgattcttagcctgagcagttccttaacaattccttatttttcaga ccattttcagcctcaggTTTTTTATAAACGTGTTcgttatataaaaaaac gtgtatagttTGTATCATCCCACAACACCAAATAACTGGTCCACTATAAT TGTCTTTCTACCAAATGCTTAcaccaaagaagaaaaaaatgacgtGTATA GAAAATTGCCGTGTATAGAAAATTGCCATACAATTATGAAATTGATAATT gcctcaaaagaaaaaaacctgCAATTATTAAGAAATAACATCTTCTCACA AATATACAACAttgattttgattaatttttcatctCTTTTTACCAACAGT CAAGTCAAGGAGCTGGTCGATTGGGAAGAGCAAACACAACAGAAGTTTCC CACAACAAGTCAACAACAACAGTCCATCACCACAAACAACACGTCAGACA CATCTTCCAACGAAAACAATCCATTGAAACGCTTTACACAATACTGTGAG CGCTCAAAGAACTTgttacacatttttcgaatcgATATTTATAGACCGTT ATGTGATTATTTTAAAGACGTCGAAGACGAGGTTCCTAAATCTGTGGAAA GGATCGTCCAAAAGTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010297XLOC_010297Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:9992..10114TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:9992..10114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:9992..10114TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:9992..10114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:9992..10114TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:9992..10114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11207..11243TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11207..11243Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11207..11243TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11207..11243Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:11207..11243TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:11207..11243Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11642..11744TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11642..11744Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11642..11744TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11642..11744Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:11642..11744TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:11642..11744Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:23206..23300TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:23206..23300Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:23206..23300TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:23206..23300Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:23206..23300TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:23206..23300Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:24018..24226TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:24018..24226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:24018..24226TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:24018..24226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:24018..24226TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:24018..24226Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:24941..25207TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:24941..25207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:24941..25207TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:24941..25207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:24941..25207TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:24941..25207Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000297supercontigsc0000297:9992..25207 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.000118873 0.165905 0 0 8.20931e-07 0 0.926248 0 0 0 0 1.96221e-08 0 0 1.04967 0 3.27487e-09 1.00684 0 0 0 0 0.00968408 0.727069 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00018333 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top