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transcript sequence >TCONS_00018333 ID=TCONS_00018333|Name=TCONS_00018333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=834bp ttCCCACACGGTGGTCTTCCGATGGTGCAATTGTCACGTGACAGCTTTTA ATGTTCCGATTGGTTTGATATAATAAGAACTTCGTCACCAGTTACGCAAT GTGTTCAATAGGGGATTAATGAGGTCCTTCTCTGCGTTTGACCATGGAGC CTCAAATAAGGAGAAGTAATGAATGGCCAAATTCAATAATTCAAGTAGGG TTTTCAAATTCCGAGTGTTGGGGAAAACGAAAGCGGACGAAACGAAGATC ACGTCATTATCAGACCTGCTCCATTCATCCACAGAAGAGTTGGAACAATA CACCAACTTCTTATCATTGATGCCGATGAGGAAAGACACCAAAGTACAAG AATATGTGCCATCAGAGTTCCAGGAACTCACTCGGGAAGAACGAGAAGAT TGGTTGGAATTACAGTGCGTTCTATTCGAAGAAGAAACTCGATCCTCACT CGATACAAACAACGAAAACGATAATTTTATCGATGATTTCGGAAGATATT TGAAGAAAGTGACGAGACGCTGGGCTTCTTGGAATCACAGAAGTTTTGGA TCCATCAGTTCCATCGATCAAGTCAAGGAGCTGGTCGATTGGGAAGAGCA AACACAACAGAAGTTTCCCACAACAAGTCAACAACAACAGTCCATCACCA CAAACAACACGTCAGACACATCTTCCAACGAAAACAATCCATTGAAACGC TTTACACAATACTGTGAGCGCTCAAAGAACTTgttacacatttttcgaat cgATATTTATAGACCGTTATGTGATTATTTTAAAGACGTCGAAGACGAGG TTCCTAAATCTGTGGAAAGGATCGTCCAAAAGTG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000297:9992..25207+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018333 ID=TCONS_00018333|Name=TCONS_00018333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15216bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000297:9992..25207+ (Clytia hemisphaerica) ttCCCACACGGTGGTCTTCCGATGGTGCAATTGTCACGTGACAGCTTTTA
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GTTTCGTTAAATAATTGACTACAATTCAGAAAAAGACGTTAATTGAACGT
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CAAGTCAAGGAGCTGGTCGATTGGGAAGAGCAAACACAACAGAAGTTTCC
CACAACAAGTCAACAACAACAGTCCATCACCACAAACAACACGTCAGACA
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CGCTCAAAGAACTTgttacacatttttcgaatcgATATTTATAGACCGTT
ATGTGATTATTTTAAAGACGTCGAAGACGAGGTTCCTAAATCTGTGGAAA
GGATCGTCCAAAAGTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:9992..10114 | TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:9992..10114 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:9992..10114 | TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:9992..10114 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:9992..10114 | TCONS_00018333-exon-sc0000297-1575043694:9992..10114 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11207..11243 | TCONS_00018333-exon-sc0000297-1491911889:11207..11243 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11207..11243 | TCONS_00018333-exon-sc0000297-1510915933:11207..11243 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000297 | supercontig | sc0000297:9992..25207 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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