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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00016875 ID=TCONS_00016875|Name=TCONS_00016875|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5022bp ACTTCAGTTTGTTGTGTGCTAACTGATTCAGTACCTTCAGTCTCCGTTTG TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG CGTTGCTGTAtcgtcatttttttctgtttgaatgtttGTTGTCGCAGATA TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG TTGAGTAGAaacatcttttgttttaagcTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG TTGGTTTTTGGGTCGACAATGCAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTT TTTCCTTCGGTACTTGAAACACTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGT TGTGGTGATCTGTTGAGTAATGACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTG TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT GGTTCTGGAGTGGTTCTTGTTTCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGT CACATAGACAGTAACATCCTCTGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTG TTGTTTGAGAGACTGTTGCAACTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGT TCTGTAACGACCTCAACAGTTTGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGT AGTAGTCGGTGCTGGTACTTGAGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTT CTGGTTGCTGTGTAGTAGCTGATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTT TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT TGGCGAGTNGCTTCAGGTTGTTGTGTAGTCTTTACAACTTCTGTAATTCC GTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTGGAGCTACGGTCGTTTCTACGG CTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGAAGTGTTTTAAGTGTTTCGGTA ACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAGTGTTGTCGATGCTGTCGTGGT TGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGTTATCTTCTCCTTCAACAATAA CAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTGGAAGTACGTGGTTCTTTCGTT ACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTATTTGGTTACAATTGGCCCCTCGGT TGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTTGCGTTACAGACTCTTGAGTTG TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTG AATCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTG GGCTCTTGCGTTGAAACCGATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATT TGTTGAAACTTGCTCTAAAGGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTG TAGTGCTTGTGACAGATGCTGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCG GTTCTCTCTTCTAAGTCTCCAGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTT TGCTTTCATGGTGATTGGCTTTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGC TGGTAGATTTTGGAGATTCAGTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGT GTGGTAGTGGAAATAGAACCCTCAACAAAATctgttgtttgttttgattc tgtTGATACTTCTGGTGAACTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTT CAATCTTGTCTTTAGTTGTGGTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATT TCGTCGGTTGGTGAATCTGTCGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGAT CACTAAAGGAGTATGGGGACCTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTG GTGAATCAGTAGTGGTTTGAGCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTC TTAAAGTCTGGTTCTTGAGTTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGAC AACTTTAGCGTCTGGGCCTTCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGT CCTCAGTTGTTGAAACTCGGCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGT TGTTGCTGTGTTGTTGGTGTTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTC GACATCATGTGTTGTGTAAGATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGA TTGGATCTGTAATCAGGTCTTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCT TGAGTTGTGGAGACATACTCAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGT CTGTCGTTTTTGCTCAGTTGTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATC GTACAGATTCAGTTGACTGTTCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAA GAGGTCTTTGTGCTTAGTGATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGT TGTCTTGGCAACTTCTTCGGTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTG GTTCATCTGTTTCGAGACCTTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCT TCCGTCGTAGGTTTCAATGTTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGA AGCGACAGTAGTGGCAACCTTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGG TGAAAAAGTTGTTTGAGTTTCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCA CATTTTTGTGTCTCCACATTGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCA TTGTCCAGTATTCTTAGGCATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATA ggacgccattttgttttggtgTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCA CTTTTGCAGCCTGGGCGCGCAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACA TGATTTTGGACACATGGTACCCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACC CTGGGGATGCGTACTCCAAGCATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTT GATTTGTATTGATCAACTGGTC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000253:124445..131647- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00016875 ID=TCONS_00016875|Name=TCONS_00016875|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7203bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253:124445..131647- (Clytia hemisphaerica) ACTTCAGTTTGTTGTGTGCTAACTGATTCAGTACCTTCAGTCTCCGTTTG
TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT
GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA
GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT
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TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA
GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC
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ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT
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GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA
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GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT
GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT
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GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG
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ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT
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TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT
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TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT
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CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA
CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT
GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG
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CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT
TGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGTAGTAGTCGGTGCTGGTACTTG
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ATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTTTGCTGAGTAGTCATGACTTCA
GTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGTTGGCGAGTCTGTTTGTTCTGT
GACTGTCTCCTGTGTGGTGACAATTTCTGTCTTTTCCGTTTGAGGCGCTT
GGGTCGTAGCAGATTCGGTAATGTCGGTAACATCTGTGATTGATTGAGTT
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TTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTTTTGTGTTGTAACTGAA
TCAGTTTGTTTAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTT
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CTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTA
ACTAAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGT
TTGTTGAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTGGGTTG
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ATCAGTTTGTTGAGTTGCAAGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTT
GGGTTGCAGGTTTTTGTGTTGTAACAGAATCAGTTTGTTGAGTTGCAGGC
TCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGT
AACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAG
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GCAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAGATCC
TGGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTTTCTG
TCGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGTGACA
ATTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTTGAGT
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TGAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAACAAC
GTCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTCTGTT
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TGAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTTGCTC
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ATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTCTAAA
GGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAGATGC
TGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAGTCTC
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CTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAGTTGT
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TTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGGGCCT
TCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAACTCG
GCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTTGGTG
TTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGTGTAA
GATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCAGGTC
TTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACATACT
CAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTCAGTT
GTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTGACTG
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ATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTCTTCG
GTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGAGACC
TTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTCAATG
TTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGCAACC
TTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTGAGTT
TCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCCACAT
TGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTTAGGC
ATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAGGACGCCATTTTGTTTTGG
TGTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGGCGCG
CAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACATGGTA
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GTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00016875-exon-sc0000253-1575043694:128364..131647 | TCONS_00016875-exon-sc0000253-1575043694:128364..131647 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00016875-exon-sc0000253-1510915933:124445..126182 | TCONS_00016875-exon-sc0000253-1510915933:124445..126182 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016875-exon-sc0000253-1491911889:128364..131647 | TCONS_00016875-exon-sc0000253-1491911889:128364..131647 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016875-exon-sc0000253-1491911889:124445..126182 | TCONS_00016875-exon-sc0000253-1491911889:124445..126182 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000253 | supercontig | sc0000253:124445..131647 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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