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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00016063 ID=TCONS_00016063|Name=TCONS_00016063|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2495bp acaatatctttgtttcaaaaaatgattaaaattaaaaattaaaaatggtc aaaataaaatataagtaCAGCGATTGAGATGTAAAATTCATTAGTTTATT CAACAACTGCTAGTCTTGTGGATGGTCTGAGAAGTAGTGACAAAAGTGTT TTAATaaaatcaccAAGTCAGTGAAGATGAAGAAAacagttcttcttttt ttattggtGTGCCGAGTTTTTGGTCAAAATGTTGTGAAGAAGGCATCAAT CGAGACACTGGATAATCTGGCTACTCAGATTCGAGAGAAAATCGATGGCA ATCCACGTTTAGCAGCTGGGTTTGTGCGGTTATCATTCCATGATTGTGTT GGTGAAGATCGATGTGATGGATGCATCAATTACCAGGAGCCGGACAACGC TGGTATTCCTCGTTACACAGCTGTACTAAATGATCTTTACGAGCCTGTTA AAAATGATATTACCAGAGCTGATCTTTATGCTTATGCTGGCGTTGTTGCT GCTAATTATGCTTCTTCAAGAGATGCTGTTTTCGATATGACAAAATTCAA AGTTGGACGCCACGATTGTAGTGAATCTGGTGATGAAACAGATCTAGATG AGCATTTCCCGTCCAATAACTTCCAGAATGTAGAGGAACTACATGCCTAT TTCAACAAAGAGTTTGGTCTGTCTTTACAAGAAAGTGTAGCCTTGATGGG TGCTCATAGTCTTGGTCGTATGGAAACTGCAAATTCTGGATATGAAGGAC CTTGGGTACCTGGAACTGGGCAAGATGTCTTAAACAGCGACTACTATCGT GAAGTGGTGAATGTTCCCTGGTTCCTTAAAACAATGCCAACAAATAGCGC CAAACATCAGTGGCAACGCCGAGCACCAAGTCTTGGTGTAGGGAATTCAC CTGGGCGGAATCGACAACCTGATAATGTACTTCTAAACACTGATGCTGCA CTTGCTGTTAACCTTCGATTGAACAAAGACACTGGTGCTTTTCAGGATGG AGCTGAATGTGTCATGTGTCCACCAAATGGACCACCACCACCAGGACGTA TCCCATGTTGTGATGAAGACACAGAAGGTCGTGGAAAATGTATCGAATAT GTCGATGATAATTCAGGATGGATGAAAGATTTTGAAGTTGCATTCTACAA GATGATTGATAACCCAGATGATGATCTTTCAGTACCAACAGCAGCTCCAA CAGCAGCTCCAACAGCAGCTCCAACAGCAGCTCCAACAGCAGCTCCAACA GCAGCTCCAACAGAAGCCCCCGCCCCAGCAACACGCCCACCACGTGGTGG TGGTCGTGGAGGTGGCAGAGGTGGCCGCCGCAGTGACCaaataaagaaga aagaagCTTCTGCTGAAAAGATAAATGAAGTGTTGCATGATCTTCAAGAT GTTCTAaaagaagtcaaaaaaatggtctaaaaatgaCACTACTCTAAGAA CATGATTTGTGGTATAGCATATTCAAGAAGTTTTCAGAGAAGTTAAGGAG TTggtctaaaaatagacatttgTTATGAACAGTATATATGTTTCCTCTGT AAGGGATGTGCAACTTTATATTATTTCACTTTCACTATTTTCTTTCGTTA TTGTAATTTATTTACTTATattttaatagcttttgtaAACAGCTTAACtg ataacacccccttctcacagacttgGTAGGATTTCAGCCAGTAGGGATAA GTTTAACGGACTGCACGAACTCGATGCGAATTGATATTTCCAATATTTTT ATTGCTGGAGATTTCAATTCTCTTGTTTTCAAGGCAGAAAATTTAGTGCG GATAGGAAAAAAGCATCATATTTTGCATCGAAGATTGTTTATTTCGGTTC TTTTACACCGGGGACGATGTGTTATacaattttttcagtgggaagggttc ccagtgggtctgtgagaagggagtgtctGATACTACTTAAGTTTTAATTT GTCTCATTATTTAATCATTTGATTTGTAAAAGttcattaaaaaaagtttc ttttcttttttatctaattccttatgtttcaataaattcATAAATAATTG CATCGATGAGTCCCATGGAGTCCTTTCTTCATGAAAACCAGTAAAATGTT GCTGCggcttggctgttcttatttttttggtactttgagcctcaaattgt tcttatcattttttatttacagGGTTAATTGTGGTATTTTAGgtgttata cccaatttttaccaCTTTGACCTGTAAATTgcaagaaattgagtaatttt agacccagcattgttcttaaattgttcttattttttggcaattttgagcc tcattacTCTTATAAAATGTTCatgaaagaaaaaagtgtaagTTTGAAAT ATATTGGGATCTTTGTATCTTTGGGtctttcgttgtttttttcagaatga aaaatttgagtGAGAATTGTGAGTTTGGCATTTTTCATCGGATATTTCAA ATTGCTTGGGATTTGGATTTGTGAAGAGTTTAGTGGCTTCAAGGC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000225:291356..308255- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00016063 ID=TCONS_00016063|Name=TCONS_00016063|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000225:291356..308255- (Clytia hemisphaerica) ACAATATCTTTGTTTCAAAAAATGATTAAAATTAAAAATTAAAAATGGTC
AAAATAAAATATAAGTACAGCGATTGAGATGTAAAATTCATTAGTTTATT
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GACGTTATAATTCGCTTTTGAGATTTGAGTTTTTTGAGGCAAAAAGAAAG
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AGCTTTANACAGGAGAAGTATGTTATTGTAACTAAGCTCTCCCTACGATC
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TATGAGCTCTTTTATCCATAGTTGAAATCTTATTGCCTCAAATTAGTTGA
GACGAGATTCATTGTTTCTGACATCAGTGTAAGAAAATATTTGGACTAAA
AAAAAGCCTGCAAACTGTCTGGCAATCCTTCATCAAATGATAAGATTTTT
CGATCAATGTTTTCTTTAAGGTGATCTCTATTACTTGATACTTTCCTCCA
AAATTCTCCAGCGACTTTATTTCTACAAATTGAGTCTGGAATCGTGTGTG
TTTATAAAGGACTTTCTGTTTTCTAGGTTAAGAAAATATCTTTTCGAAAC
AAAATTTAACGGATAGTGAAATGGAACATAAACTTGTTTTGTGGGGCTAA
GTTTTATTTAATTCGTGTTTATAGAAGGCTAGAATCTTCAATACTGATAG
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CGGGCGAGCTTAGAATTTATTTTGATACATTTTATACATTTGATACATTA
TACCGTTATACCATTATACCTGTGCCCAAGCTCAGGAGTTGCCATAAAGC
CATTATGTAATAACCGGGAGGGCACATTGCTATACTTTGATACATTTTAT
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TGTCCAGAAAAACGGAATTTATGGCAAAAAATAGGTTGAAATTTCATTAC
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AAACCAGCGCCTTTTCATACACCAGCTTCCATACAATATTCATTTATTAA
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TTATATCAGGGCAGTGTCTGCCATTATGCTGATACAAGCGAAAACATGTT
TTTCTTTTCCGCTTTCTGACTAATTTTGCTCCGCATACGTGTCAATCCAA
TTTGAAAAAGCTTGTGAATAGCAGACTGCTATGCAAACGTCATGATTATT
ATTTTTAACATTTGACCGAAATTCAATTCCACAATCCTCTTCATTTTGAT
TCGTAATGCGTGCAAATTATTATTTCTGTATTGTAAAAAAGTGTAATTGA
CTTTCAAAAGCAATTAATGCAAAGGATGATGGGATTAAAACTCAGATAAA
CAGTAATTTTGANCAATTAATGCAAACGATGATGGGATTAAAACTCGGAC
AAACAGTAATTTTGATGTCTATCTTTAAAATCAGTGCGGTATACTATTAA
AATTGATGAGTAAGCAAAAAATATCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTT
AAACATGATAATAACGTTATATATACTCTATACAATACATGGGAGTTGTT
TTGACCTTTTGTAATACTACTTAACCGAATTAGTCAGCCATCCGGCTGAC
AACATTACTACAACGTTTATCTAACGTTCGATTGACGCAACGTCAGATAA
GTGTTGAAACAACGTTATGTGCATGTTACTTTAGGCATACCGCACACAAG
AATGGGCGATAAAAAAGAATGACTCTTTTCGATGGTCTTTTAAATGCCTT
GCTTTTTAAGACAGATTAATATATTTTACACTTGTACTGCTAATAGCATA
AATCGTAAATGCTCCTGATTTTATTGAAGGGATGCTCTATTAGAACGTCT
GAAAGCTTTGTATAATAACCATTGCAGTAGTGACAATAGAAGTAAACAGG
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AGTATATAAGTACAGCGATTGAGATGTAAAATTCATTAGTTTCTTCAACA
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GTAAGTGAATCTTTTTGTTCTTTTTTGCTTTTGAAAGGGCGTTAACAACC
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ATGAACAAATAATTTGATTGACTACGGATTCATTCATTTTTGGCGTGTAG
GTATAGCCAGGCTGTCTTCTCGTTAACAGATTAGACGAAAAGTGAGACAC
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GCTTGTACATACCTGCTACAAATTTATTTCCTTTCAACCTTTTTTGTTTT
AATTTTTCAGAAAATCACCAAGTCAGTGAAGATGAAGAAAACAGTTCTTC
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TCAATCGAGACACTGGATAATCTGGCTACTCAGATTCGAGAGAAAATCGA
TGGCAATCCACGTTTAGCAGCTGGGTTTGTGCGGTTATCATTCCATGATT
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AACGCTGGTATTCCTCGTTACACAGCTGTACTAAATGATCTTTACGAGCC
TGTTAAAAATGATATTACCAGAGCTGATCTTTATGCTTATGCTGGCGTTG
TTGCTGCTAATTATGCTTCTTCAAGAGATGCTGTTTTCGATATGACAAAA
TTCAAAGTTGGACGCCACGATTGTAGTGAATCTGGTGATGAAACAGATCT
AGATGAGCATTTCCCGTCCAATAACTTCCAGAATGTAGAGGAACTACATG
CCTATTTCAACAAAGAGTTTGGTCTGTCTTTACAAGAAAGTGTAGCCTTG
ATGGGTGCTCATAGTCTTGGTCGTATGGAAACTGCAAATTCTGGATATGA
AGGACCTTGGGTACCTGGAACTGGGCAAGATGTCTTAAACAGCGACTACT
ATCGTGAAGTGGTGAATGTTCCCTGGTTCCTTAAAACAATGCCAACAAAT
AGCGCCAAACATCAGTGGCAACGCCGAGCACCAAGTCTTGGTGTAGGGAA
TTCACCTGGGCGGAATCGACAACCTGATAATGTACTTCTAAACACTGATG
CTGCACTTGCTGTTAACCTTCGATTGAACAAAGACACTGGTGCTTTTCAG
GATGGAGCTGAATGTGTCATGTGTCCACCAAATGGACCACCACCACCAGG
ACGTATCCCATGTTGTGATGAAGACACAGAAGGTCGTGGAAAATGTATCG
AATATGTCGATGATAATTCAGGATGGATGAAAGATTTTGAAGTTGCATTC
TACAAGATGATTGATAACCCAGATGATGATCTTTCAGTACCAACAGCAGC
TCCAACAGCAGCTCCAACAGCAGCTCCAACAGCAGCTCCAACAGCAGCTC
CAACAGCAGCTCCAACAGAAGCCCCCGCCCCAGCAACACGCCCACCACGT
GGTGGTGGTCGTGGAGGTGGCAGAGGTGGCCGCCGCAGTGACCAAATAAA
GAAGAAAGAAGCTTCTGCTGAAAAGATAAATGAAGTGTTGCATGATCTTC
AAGATGTTCTAAAAGAAGTCAAAAAAATGGTCTAAAAATGACACTACTCT
AAGAACATGATTTGTGGTATAGCATATTCAAGAAGTTTTCAGAGAAGTTA
AGGAGTTGGTCTAAAAATAGACATTTGTTATGAACAGTATATATGTTTCC
TCTGTAAGGGATGTGCAACTTTATATTATTTCACTTTCACTATTTTCTTT
CGTTATTGTAATTTATTTACTTATATTTTAATAGCTTTTGTAAACAGCTT
AACTGATAACACCCCCTTCTCACAGACTTGGTAGGATTTCAGCCAGTAGG
GATAAGTTTAACGGACTGCACGAACTCGATGCGAATTGATATTTCCAATA
TTTTTATTGCTGGAGATTTCAATTCTCTTGTTTTCAAGGCAGAAAATTTA
GTGCGGATAGGAAAAAAGCATCATATTTTGCATCGAAGATTGTTTATTTC
GGTTCTTTTACACCGGGGACGATGTGTTATACAATTTTTTCAGTGGGAAG
GGTTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGAGTGTCTGATACTACTTAAGTTTT
AATTTGTCTCATTATTTAATCATTTGATTTGTAAAAGTTCATTAAAAAAA
GTTTCTTTTCTTTTTTATCTAATTCCTTATGTTTCAATAAATTCATAAAT
AATTGCATCGATGAGTCCCATGGAGTCCTTTCTTCATGAAAACCAGTAAA
ATGTTGCTGCGGCTTGGCTGTTCTTATTTTTTTGGTACTTTGAGCCTCAA
ATTGTTCTTATCATTTTTTATTTACAGGGTTAATTGTGGTATTTTAGGTG
TTATACCCAATTTTTACCACTTTGACCTGTAAATTGCAAGAAATTGAGTA
ATTTTAGACCCAGCATTGTTCTTAAATTGTTCTTATTTTTTGGCAATTTT
GAGCCTCATTACTCTTATAAAATGTTCATGAAAGAAAAAAGTGTAAGTTT
GAAATATATTGGGATCTTTGTATCTTTGGGTCTTTCGTTGTTTTTTTCAG
AATGAAAAATTTGAGTGAGAATTGTGAGTTTGGCATTTTTCATCGGATAT
TTCAAATTGCTTGGGATTTGGATTTGTGAAGAGTTTAGTGGCTTCAAGGC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1575043694:308101..308255 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1575043694:308101..308255 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1575043694:291356..293695 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1575043694:291356..293695 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1510915933:308101..308255 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1510915933:308101..308255 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1510915933:291356..293695 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1510915933:291356..293695 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1491911889:308101..308255 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1491911889:308101..308255 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00016063-exon-sc0000225-1491911889:291356..293695 | TCONS_00016063-exon-sc0000225-1491911889:291356..293695 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000225 | supercontig | sc0000225:291356..308255 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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