|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00013883 ID=TCONS_00013883|Name=TCONS_00013883|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1066bp tgaTAAAGTGAACATGTTTCCTAACTTAATGACCGTTAGGAATTTGTTGT CAAAATTGTCGGTACCGGGAAAAACGCCGAACACGAATCGTAAATGGTAG CTCGAAGCTGTGAGGAAGGGAGAAGTAAAATCACATTGttctaacttttt tttgcttgaatcATTATGGATGACCGTTTATTGgaAGCATCATTGTACAC AATCAAAGGTGTTGCCATATTAGACAATGATGGAGAGCGAATCATTTCAA GGtATTATGACGAAACATTCCCTACAGTTAAAGAACAGAGAGAATTTGAA AAGAACTTGTTCCAAAAAACTTCACGTCAAAATGCTGAAATTATAATGTT AGACGGATTAACGATAGTATACAGAAGCAGTgttgatttatatttctatg tCATGGGCTCCCAATACGAAAATGAGCTTATTTTGATCAGTGTATTGAAT GCATTCTTCGATGCTGTCAGTACAATGCTAAGGAAGAATGTTGAGAAGAG GTTTTTGATGGAACATTTGGATGCTGTTTTACTGGCTATTGATGAGCTTG TCGATGGAGgAGTACTGCTGGAAGCTGACACAGCAAATATTATACAGAGA GTAGCTATTAAGAATGAAGCTGATATTCCGATCACTGAACAATCTGTGTC ACAGGTACTCCAAACTGCTAAAGATCAATTGAAATGGTCATTACTAAAAT GAATTATTTATTTGGGATtgtaatttcattattttatgtGTATTTGTGCT TTTCtggtttttgtaaaatatataaatccAAAATCTTGATATTGAAAAgt tgatcattaaaatctatGCATTGTTCTCGAACGATCTATTCCTTATCCAA GATTTCGTGACATGTGGTTTTTCATGTCTAACTCTGAGGTCGAAATTtac actttttcatttttatatttaGATATTATTATGACATTATTTTTAAAGTT CAGAAATAACATACGGACAAAAAAAGACTGTTAATTCCCTGATGATTTTA CGTGTCATTTCAAAAGTCCACTTTCCCTACCAGCAGTTACAACCTTATTT TAATCAGAAAatcttg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000174:302233..319200- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00013883 ID=TCONS_00013883|Name=TCONS_00013883|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:302233..319200- (Clytia hemisphaerica) TGATAAAGTGAACATGTTTCCTAACTTAATGACCGTTAGGAATTTGTTGT
CAAAATTGTCGGTACCGGGAAAAACGCCGAACACGAATCGTAAATGGTAG
CTCGAAGCTGTGAGGAAGGGAGAAGTAAAATCACATTGTTCTAACTTTTT
TTTGCTTGAATCATTATGGATGACCGTTTATTGGTAAGTAAGATTCATTT
CAATGTTTTTATTGTTTTTCAACAAGAACTCTTCCAGCTAAACTCCTTTA
GAGAGGGTATCAGCAGCAGGCAAGTAGGGTGTCCAGTGCACGAACGCCAA
ACTTTACTTTTCACTTTCTTTCTTCCCCAGACGGTGTCAATCGAACGAAT
CGAACGCCGAATCAATCGAACGCAATTGAACGCAATCGAATAATTGCAAT
TCGATTGTCGAATCGCAATCGAATATTACCCAGGATTTACTGTTCGATTG
CTTCGATTACGTTCGATTGTATTCGATTACGTTCGATTGATTACTTACTT
CAGTATACTTCAGTTTGATTTGATGATATTCATCTGTCCAGCTCGTTGAG
CCCAACACGTATTATTTGATCGACAAGAGCATTTGATTCAGCCNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNGAGCTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTATTTTT
TACTGCTCTATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCATTTT
TTTGCAAACTAAAAAAAACTGATTTTCATCCCGCTTTTCCGGGACTTCAG
CTTAAGTGCTGGCGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAATAATGTGTTTC
CCGTAATTTTTGTATGAAGAGTTAGGTCTACACTGCATGGTATCTATAGA
CATTTCGATAATCACGGCAATCAATTTTTTTACCTGCTAAAATTCATGGA
ATTAAAAAGTGCTATCCTAAATTTACATGTTTACAGTTTAAATTTTCTTT
TGACACATTTTACTAGCAATTTCATCTTGATCTGGCTTCTTTATTTTATA
AACAAGACAATTTTTCTTAAATTTAGGAAGCATCATTGTACACAATCAAA
GGTGTTGCCATATTAGACAATGATGGAGAGCGAATCATTTCAAGGGTAAG
AACTTGAGAGAAGAATGCTTTTTTTATTGAAACTTTAAAATACATCATTT
AAAATACAGTATATCTTCTACTACTTGCTTACACAACATTTTCAAACACA
AGAAAAAACTAAATTTCTTCCCGTTCTGTGCCACCTCAAGTTTCTATTTG
AAAAAGTTCTTTTGTTTAATTATGTTTTGTCAGCAGAAAAGATGCACCTC
TTTTCCGTATCATTAAAAAGGAAATCTTTTTTCTCAGGCTTTTTACCACT
GATCAAAAAACTTTCAAAATTAATATTGAAATAATAAGCTTTTCAGTTTT
TTTTTAATAATTTTTGATAGCATCTTCAAGATATGCTTTTAAACAGTTTC
AAACTCAATTTTTTAGACTAAAGGGCTGAACCTTCTTGATAGATATTACT
ATCAACATTTTTTATATTGCTTATTTTTTATTTTAACTAATTTCATGCTG
TTACTTTATTGTTTTTGATGTTTTAGTATTATGACGAAACATTCCCTACA
GTTAAAGAACAGAGAGAATTTGAAAAGAACTTGTTCCAAAAAACTTCACG
TCAAAATGGTAAGATCTTTCATAAAAACATATCATATCAAGAAAGTGACA
AACCAGGGCAGGCAGTTTGTTTCACTTTTCAGGATAAACTTTTGAGATAT
TTTGTTGTATAAGCCGTGTTAAGTGGTGTTTGCTTTTTTTAGGTTTCCTT
GTGTCTTAGTAGAAACTGACGTGGGGAACTTTGTTTATTGCTAACTTTGT
CAGTAATAGTGTCATTTTTACAAAAGTTTCTTTTATTGTAAAGAGGAAGA
ACCAAATTAAAATTTGATACTTTCTGAATCTGGTTCAGTAGTTCAAGACT
ATAAGCCTTTAAGTCAAAATTCAATTTTGAAAAAAGTCCATATAAAAGTC
AATATTTCAAAAAGCAATTTTAGACACTTTCTAGAAAGCTGCTCAGATTT
ACTGTCCTCCTATGCCTTTCATTTATTTAAATGTTAATCAAAATGAATCG
GCTTGGATAATAAATTGGGTTGTAAAAGTGGTTAAAATATATTGTGAAAG
AACAAGTTGTATCATTTTGATACTTCTTTTGACGTATTTTTTTACTTCTT
CTATATACCTTAAAAATCCCGTTAATTTCTGTGTGACATTTATTTTAGAG
CACCTCAAAAAAACAAGATATTTGCCCACCCTTTATCTTTTGCACATCTT
GTAATGGGCATTTTCAGAGTGTCTTTGATGAAAAATATATTTAGGTAGAT
TGAAATTGAAAATATTGCTCCCTTTAAAGGGCTACTTAGACTACACAATA
TATTGACGAACAATATTCGACAATATGGTTTGCGGACCCTAATGCACGAA
AAGTAAACAACTGGTACTCTATTATAAAAAGGAATTTTCTTTCTGTAAAC
AATCCCCCTTTATTGTTGGAATATTGCAAATCAAGCTGACAATATATTGC
GGACACCTTCAATATATTGTCCACATTCAGCAATATATCATCAATATATT
GCCTGACAAGATATTTTGTAGTGTATGTAGCCCTTTAATAATTTGTGCAC
TTTTTCAAAATTAGGGCAGCAAAATTCAAATCGTAGCTGACACACAAACC
TGTACTTTTTTGTGGGTCACTATAAAGTATAACTTTTGTTTTCACATGAT
TTAAATCCTAAATATTCAATGTTATTTTTATATTTCAGCTGAAATTATAA
TGTTAGACGGATTAACGATAGTATACAGAAGCAGTGTTGATTTATATTTC
TATGTCATGGGCTCCCAATACGAAAATGAGGTAAACTTTTTTAGATTGTT
TATAATCAATTGCTTAACTTATTAATTTGTAAACTTTAATCACAATATAG
GAGATAACTGATTGTACCCCTGCAGCTATGTGTACCATCAAATTGTTGTA
TTCAGGCTGTGTATCCAGTTTAAAACCGGTGTGACACAACATGAGCGAAA
TATTTTTCCCGTTGCTTTAATTAAACCTGATTATTGTTTAGCTGTCTTAT
ATATATTATGTTTTCAAATATCCATAAACACTTCAAGAAAGAGTTTTTTG
TCAGCTGTGGATATCTTTCTCCTCCATTTTTTTGTATAAAGTTCATTTTG
AAACTAGGCAAGAAAAGTATACCAGCAAGAAAAATAAACCATCAATTTTA
TTTTAATCTTCCATTTTCCAGCTTATTTTGATCAGTGTATTGAATGCATT
CTTCGATGCTGTCAGTACAATGCTAAGGAAGAATGTTGAGAAGAGGTTTT
TGATGGAACATTTGGATGCTGTTTTACTGGCTATTGATGAGCTTGTCGAT
GGAGGGTAATAAAATCTTTTATGTATATCATCATTACAAGCCTCATGATG
ATTGATGTATCTGTTAGACTAAGGATGGTGAATATCACATTGAATGCCAT
CATTAGTGGCCCTTCGTGGAAACAATTCTTGAGCTGTCTAAAAGCTCAAG
GATTTTTCGGAGCCAGCCACTTAAAAAATTAGTTATTATTATTAATATTA
TTATCATCATTCAAATTTTCAAATAATTTCTGAATTTAAATTTAAAAACA
ATTCCAATTTCATTTTTTTTATTTGGGTGGTTTTGGGTGTAAAATCAGGG
CGGTTTGGGTTGCAGCGCTCCTAGGTTTAGATATATTGGTACAAGGCTGA
TCATTTGATACCAGTGGCTTTTAATGGGATATGGAGCTAATTAAATGATC
TGGGTAAGATGAAAGAAATTCTGAATTATTTTGTTCAAATATTTAGAGTA
CTGCTGGAAGCTGACACAGCAAATATTATACAGAGAGTAGCTATTAAGGT
AAGTGAATATAATTATGCTTATACAAAAATCTATATCGCAATATTTTAAA
CTTTATGTCTATTGGTTCTTTTTCGCATAAAATTCTCATTCGTTAACAGA
ATATTTCATGATTTATGTATTTAGAAAAATTCAAAAAAATAGAGAAAAAA
ACGTATGATTATAAAAATATTAGTCCCTTTTTATGTTTCATCTTTATTTT
ATTTAGTATTTTGAACACTTGCTCTCCTTGAGGTCAGATCTCTGATCTTT
ATATACATAAAGTGGAATGCATATTATTGAAATGGAAGTAAAAAGACTAG
AGGGCAATGAATGTTTCATGAAAAATGAAAATTTATAATTTTTTTCACTC
TCAGAATGAAGCTGATATTCCGATCACTGAACAATCTGTGTCACAGGTAT
ACTTTCTTAAAACTTTTTTTTCACTACATTTCTGGCTAGTTCGATATATA
TTTGTGATACTTTTTTATAAATACCAAAACATGTGAAAAGGGGAATAGTT
TTTGCTTTGGCTCCATGAAATTTATGCAACAAAATATCAAGCAAACAAAT
CTGACACATTTCAAGTTGAATCTTTTCGTCAACTTTTTCTTAAAAATTAC
GCAGAATCTAATAGAGTATATACAATTTTAAACCCTTGTATTTGAATTTT
GAAACAATCAAAGAGTATCAGTATTAAAACTACGTCCTATTTTCGAGAAT
ATATGCTTTAAAATTTAGAAATGTACACTTGGAATTTAAAATTAAGGCTC
ACCAGGGCTCACAAACTTTTCCACCTTGCATTCTTCCTTACCCAGTCCCT
ACACCCACCATATACACTGCACTATTCCCACCTAAATCCCAATAATTTTC
ATTTCAAACCCATATAAAAAAGGCACATAACACTCTCTTTCTCTATTTAA
TCAAATTTTTCTTCATCTAATATATATAATTTCAAAAAATTCACATTGTC
TTCCCTATTATCAGTGGTGTAACCCTTTTCTGTAATCAACTTTTTGTAGG
TGCTACGAAAAGCCAAGACGGAATTGAATAAACAATTCTTAAAAAGCTAA
CCGTTCACAATAACCATGCATGCGCATTTACTTTACACTAATTGGGTGCT
GGGTAAGAGAAGAAAAATTATTCTTTCTCTTGAATGTTTTGTTGTAAACG
TGTCTGTGTTTCAATTTCTCGACTGGGGGATTTTCCTATAAGGGAAAAGT
TACCCTTTTTATACCCCCCTTTCTCTTGAAATGACTCTTTTTTGAACGAT
TTTTTTCGTATTTTCGCTATTGCTTTGAAATGGCTGAACCATATTTATTG
TATAATAGCTCAAAACTTTTAATTTAGCCTTTCCTATTTCAAATTCTGAA
AAAGTTTAGATTTTTAACATTTTTAGTTTCTTAAGAATCTCGATTCAAAC
TTTTACATTTTTTTTGAAACACCCGATAAGCTAATTACTAAAACTGCAAA
AACATTTATTAGCAAAGTTAATATGGAAATAATAAAAAAAGAATATATAG
AAAATGTAAACTTTCTATATTTCATGAAAATGGTCCAAAACTTAGCCTTT
TCTTGAGCCCCCGCTACAATTACTGGCGGGATATATTGACAATTTTACCT
ATTTTAACGTTGCTCAGAATTTGAAGCTCTGGTAAGAATTACGATTTCAG
TATACTTCCACTTTGTCTCATCGGATATTTTTATTTGGGAGGGTTTAATT
TGCTTCAAGGGTAAAACTTAGCATTATTGTATTGGAACACTTTTAAGCTT
TTAGTCTTTTAGTCTTAAGTCAAAAGTTAAAACTCTACTTTCCAACCGTA
TTTAAAAATTGCTAGCGGTCTTAAAATTTTGAGGTTATTATTTCACTTTT
GTGCCCAAATATTTTGTCAGTGATTGTAATAAGGTAGCTTTAACCAATTT
ACCTTTGAGTTGGGTGTCGACCAAATATTTTAAATCTTCCACCCGTTGGG
CGCATCTGATTTTCCAATAATGTCTTAAGGGTGATTTTATTACTGTTTAT
CGCAACCAGTTCTGTTCCATTATAGTGTTTTGGAATTTTTCTGTATGTAG
ATGTATATTAATTTTTGTGTTTATTAATATCTCTCAATTTATATGTCAGA
AACTTCGTTGTCGTTATGCTTGAATTTTATGTTTGATTTTTTGTATTTTT
ATATCTAATTTTTTTCAACTCTTTAAACACAATTTTCTTTTGTTTATCTT
TTCCAGGTACTCCAAACTGCTAAAGATCAATTGAAATGGTCATTACTAAA
ATGAATTATTTATTTGGGATTGTAATTTCATTATTTTATGTGTATTTGTG
CTTTTCTGGTTTTTGTAAAATATATAAATCCAAAATCTTGATATTGAAAA
GTTGATCATTAAAATCTATGCATTGTTCTCGAACGATCTATTCCTTATCC
AAGATTTCGTGACATGTGGTTTTTCATGTCTAACTCTGAGGTCGAAATTT
ACACTTTTTCATTTTTATATTTAGATATTATTATGACATTATTTTTAAAG
TTCAGAAATAACATACGGACAAAAAAAGACTGTTAATTCCCTGATGATTT
TACGTGTCATTTCAAAAGTCCACTTTCCCTACCAGCAGTTACAACCTTAT
TTTAATCAGAAAATCTTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:319018..319200 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:319018..319200 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307656..307724 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307656..307724 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307093..307174 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307093..307174 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305871..305962 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305871..305962 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305346..305479 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305346..305479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304853..304904 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304853..304904 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304455..304496 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304455..304496 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:302233..302644 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:302233..302644 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:319018..319200 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:319018..319200 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307656..307724 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307656..307724 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307093..307174 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307093..307174 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305871..305962 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305871..305962 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305346..305479 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305346..305479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304853..304904 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304853..304904 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304455..304496 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304455..304496 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:302233..302644 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:302233..302644 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:319018..319200 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:319018..319200 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307656..307724 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307656..307724 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307093..307174 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307093..307174 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305871..305962 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305871..305962 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305346..305479 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305346..305479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304853..304904 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304853..304904 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304455..304496 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304455..304496 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:302233..302644 | TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:302233..302644 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000174 | supercontig | sc0000174:302233..319200 - |
Blast
BLAST of TCONS_00013883 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: COPZ1 (Coatomer subunit zeta-1 OS=Homo sapiens GN=COPZ1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 246.128 bits (627), Expect = 4.560e-80 Identity = 108/178 (60.67%), Postives = 154/178 (86.52%), Query Frame = 1
Query: 166 MDDRLLEASLYTIKGVAILDNDGERIISRYYDETFPTVKEQREFEKNLFQKTSRQNAEIIMLDGLTIVYRSSVDLYFYVMGSQYENELILISVLNAFFDAVSTMLRKNVEKRFLMEHLDAVLLAIDELVDGGVLLEADTANIIQRVAIKNEADIPITEQSVSQVLQTAKDQLKWSLLK 699
M+ +LE SLYT+K + ILDNDG+R+ ++YYD+T+P+VKEQ+ FEKN+F KT R ++EI +L+GLT+VY+SS+DLYFYV+GS YENEL+L++VLN FD++S MLRKNVEKR L+E+++ + LA+DE+VDGGV+LE+D ++ RVA++ E D+P+TEQ+VSQVLQ+AK+Q+KWSLL+
Sbjct: 1 MEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGE-DVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR 177
The following BLAST results are available for this feature:
|