TCONS_00013883 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00013883
Unique NameTCONS_00013883
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1066

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00013883 ID=TCONS_00013883|Name=TCONS_00013883|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1066bp
tgaTAAAGTGAACATGTTTCCTAACTTAATGACCGTTAGGAATTTGTTGT
CAAAATTGTCGGTACCGGGAAAAACGCCGAACACGAATCGTAAATGGTAG
CTCGAAGCTGTGAGGAAGGGAGAAGTAAAATCACATTGttctaacttttt
tttgcttgaatcATTATGGATGACCGTTTATTGgaAGCATCATTGTACAC
AATCAAAGGTGTTGCCATATTAGACAATGATGGAGAGCGAATCATTTCAA
GGtATTATGACGAAACATTCCCTACAGTTAAAGAACAGAGAGAATTTGAA
AAGAACTTGTTCCAAAAAACTTCACGTCAAAATGCTGAAATTATAATGTT
AGACGGATTAACGATAGTATACAGAAGCAGTgttgatttatatttctatg
tCATGGGCTCCCAATACGAAAATGAGCTTATTTTGATCAGTGTATTGAAT
GCATTCTTCGATGCTGTCAGTACAATGCTAAGGAAGAATGTTGAGAAGAG
GTTTTTGATGGAACATTTGGATGCTGTTTTACTGGCTATTGATGAGCTTG
TCGATGGAGgAGTACTGCTGGAAGCTGACACAGCAAATATTATACAGAGA
GTAGCTATTAAGAATGAAGCTGATATTCCGATCACTGAACAATCTGTGTC
ACAGGTACTCCAAACTGCTAAAGATCAATTGAAATGGTCATTACTAAAAT
GAATTATTTATTTGGGATtgtaatttcattattttatgtGTATTTGTGCT
TTTCtggtttttgtaaaatatataaatccAAAATCTTGATATTGAAAAgt
tgatcattaaaatctatGCATTGTTCTCGAACGATCTATTCCTTATCCAA
GATTTCGTGACATGTGGTTTTTCATGTCTAACTCTGAGGTCGAAATTtac
actttttcatttttatatttaGATATTATTATGACATTATTTTTAAAGTT
CAGAAATAACATACGGACAAAAAAAGACTGTTAATTCCCTGATGATTTTA
CGTGTCATTTCAAAAGTCCACTTTCCCTACCAGCAGTTACAACCTTATTT
TAATCAGAAAatcttg
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000174:302233..319200-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00013883 ID=TCONS_00013883|Name=TCONS_00013883|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:302233..319200- (Clytia hemisphaerica)
TGATAAAGTGAACATGTTTCCTAACTTAATGACCGTTAGGAATTTGTTGT CAAAATTGTCGGTACCGGGAAAAACGCCGAACACGAATCGTAAATGGTAG CTCGAAGCTGTGAGGAAGGGAGAAGTAAAATCACATTGTTCTAACTTTTT TTTGCTTGAATCATTATGGATGACCGTTTATTGGTAAGTAAGATTCATTT CAATGTTTTTATTGTTTTTCAACAAGAACTCTTCCAGCTAAACTCCTTTA GAGAGGGTATCAGCAGCAGGCAAGTAGGGTGTCCAGTGCACGAACGCCAA ACTTTACTTTTCACTTTCTTTCTTCCCCAGACGGTGTCAATCGAACGAAT CGAACGCCGAATCAATCGAACGCAATTGAACGCAATCGAATAATTGCAAT TCGATTGTCGAATCGCAATCGAATATTACCCAGGATTTACTGTTCGATTG CTTCGATTACGTTCGATTGTATTCGATTACGTTCGATTGATTACTTACTT CAGTATACTTCAGTTTGATTTGATGATATTCATCTGTCCAGCTCGTTGAG CCCAACACGTATTATTTGATCGACAAGAGCATTTGATTCAGCCNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNGAGCTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTATTTTT TACTGCTCTATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCATTTT TTTGCAAACTAAAAAAAACTGATTTTCATCCCGCTTTTCCGGGACTTCAG CTTAAGTGCTGGCGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAATAATGTGTTTC CCGTAATTTTTGTATGAAGAGTTAGGTCTACACTGCATGGTATCTATAGA CATTTCGATAATCACGGCAATCAATTTTTTTACCTGCTAAAATTCATGGA ATTAAAAAGTGCTATCCTAAATTTACATGTTTACAGTTTAAATTTTCTTT TGACACATTTTACTAGCAATTTCATCTTGATCTGGCTTCTTTATTTTATA AACAAGACAATTTTTCTTAAATTTAGGAAGCATCATTGTACACAATCAAA GGTGTTGCCATATTAGACAATGATGGAGAGCGAATCATTTCAAGGGTAAG AACTTGAGAGAAGAATGCTTTTTTTATTGAAACTTTAAAATACATCATTT AAAATACAGTATATCTTCTACTACTTGCTTACACAACATTTTCAAACACA AGAAAAAACTAAATTTCTTCCCGTTCTGTGCCACCTCAAGTTTCTATTTG AAAAAGTTCTTTTGTTTAATTATGTTTTGTCAGCAGAAAAGATGCACCTC TTTTCCGTATCATTAAAAAGGAAATCTTTTTTCTCAGGCTTTTTACCACT GATCAAAAAACTTTCAAAATTAATATTGAAATAATAAGCTTTTCAGTTTT TTTTTAATAATTTTTGATAGCATCTTCAAGATATGCTTTTAAACAGTTTC AAACTCAATTTTTTAGACTAAAGGGCTGAACCTTCTTGATAGATATTACT ATCAACATTTTTTATATTGCTTATTTTTTATTTTAACTAATTTCATGCTG TTACTTTATTGTTTTTGATGTTTTAGTATTATGACGAAACATTCCCTACA GTTAAAGAACAGAGAGAATTTGAAAAGAACTTGTTCCAAAAAACTTCACG TCAAAATGGTAAGATCTTTCATAAAAACATATCATATCAAGAAAGTGACA AACCAGGGCAGGCAGTTTGTTTCACTTTTCAGGATAAACTTTTGAGATAT TTTGTTGTATAAGCCGTGTTAAGTGGTGTTTGCTTTTTTTAGGTTTCCTT GTGTCTTAGTAGAAACTGACGTGGGGAACTTTGTTTATTGCTAACTTTGT CAGTAATAGTGTCATTTTTACAAAAGTTTCTTTTATTGTAAAGAGGAAGA ACCAAATTAAAATTTGATACTTTCTGAATCTGGTTCAGTAGTTCAAGACT ATAAGCCTTTAAGTCAAAATTCAATTTTGAAAAAAGTCCATATAAAAGTC AATATTTCAAAAAGCAATTTTAGACACTTTCTAGAAAGCTGCTCAGATTT ACTGTCCTCCTATGCCTTTCATTTATTTAAATGTTAATCAAAATGAATCG GCTTGGATAATAAATTGGGTTGTAAAAGTGGTTAAAATATATTGTGAAAG AACAAGTTGTATCATTTTGATACTTCTTTTGACGTATTTTTTTACTTCTT CTATATACCTTAAAAATCCCGTTAATTTCTGTGTGACATTTATTTTAGAG CACCTCAAAAAAACAAGATATTTGCCCACCCTTTATCTTTTGCACATCTT GTAATGGGCATTTTCAGAGTGTCTTTGATGAAAAATATATTTAGGTAGAT TGAAATTGAAAATATTGCTCCCTTTAAAGGGCTACTTAGACTACACAATA TATTGACGAACAATATTCGACAATATGGTTTGCGGACCCTAATGCACGAA AAGTAAACAACTGGTACTCTATTATAAAAAGGAATTTTCTTTCTGTAAAC AATCCCCCTTTATTGTTGGAATATTGCAAATCAAGCTGACAATATATTGC GGACACCTTCAATATATTGTCCACATTCAGCAATATATCATCAATATATT GCCTGACAAGATATTTTGTAGTGTATGTAGCCCTTTAATAATTTGTGCAC TTTTTCAAAATTAGGGCAGCAAAATTCAAATCGTAGCTGACACACAAACC TGTACTTTTTTGTGGGTCACTATAAAGTATAACTTTTGTTTTCACATGAT TTAAATCCTAAATATTCAATGTTATTTTTATATTTCAGCTGAAATTATAA TGTTAGACGGATTAACGATAGTATACAGAAGCAGTGTTGATTTATATTTC TATGTCATGGGCTCCCAATACGAAAATGAGGTAAACTTTTTTAGATTGTT TATAATCAATTGCTTAACTTATTAATTTGTAAACTTTAATCACAATATAG GAGATAACTGATTGTACCCCTGCAGCTATGTGTACCATCAAATTGTTGTA TTCAGGCTGTGTATCCAGTTTAAAACCGGTGTGACACAACATGAGCGAAA TATTTTTCCCGTTGCTTTAATTAAACCTGATTATTGTTTAGCTGTCTTAT ATATATTATGTTTTCAAATATCCATAAACACTTCAAGAAAGAGTTTTTTG TCAGCTGTGGATATCTTTCTCCTCCATTTTTTTGTATAAAGTTCATTTTG AAACTAGGCAAGAAAAGTATACCAGCAAGAAAAATAAACCATCAATTTTA TTTTAATCTTCCATTTTCCAGCTTATTTTGATCAGTGTATTGAATGCATT CTTCGATGCTGTCAGTACAATGCTAAGGAAGAATGTTGAGAAGAGGTTTT TGATGGAACATTTGGATGCTGTTTTACTGGCTATTGATGAGCTTGTCGAT GGAGGGTAATAAAATCTTTTATGTATATCATCATTACAAGCCTCATGATG ATTGATGTATCTGTTAGACTAAGGATGGTGAATATCACATTGAATGCCAT CATTAGTGGCCCTTCGTGGAAACAATTCTTGAGCTGTCTAAAAGCTCAAG GATTTTTCGGAGCCAGCCACTTAAAAAATTAGTTATTATTATTAATATTA TTATCATCATTCAAATTTTCAAATAATTTCTGAATTTAAATTTAAAAACA ATTCCAATTTCATTTTTTTTATTTGGGTGGTTTTGGGTGTAAAATCAGGG CGGTTTGGGTTGCAGCGCTCCTAGGTTTAGATATATTGGTACAAGGCTGA TCATTTGATACCAGTGGCTTTTAATGGGATATGGAGCTAATTAAATGATC TGGGTAAGATGAAAGAAATTCTGAATTATTTTGTTCAAATATTTAGAGTA CTGCTGGAAGCTGACACAGCAAATATTATACAGAGAGTAGCTATTAAGGT AAGTGAATATAATTATGCTTATACAAAAATCTATATCGCAATATTTTAAA CTTTATGTCTATTGGTTCTTTTTCGCATAAAATTCTCATTCGTTAACAGA ATATTTCATGATTTATGTATTTAGAAAAATTCAAAAAAATAGAGAAAAAA ACGTATGATTATAAAAATATTAGTCCCTTTTTATGTTTCATCTTTATTTT ATTTAGTATTTTGAACACTTGCTCTCCTTGAGGTCAGATCTCTGATCTTT ATATACATAAAGTGGAATGCATATTATTGAAATGGAAGTAAAAAGACTAG AGGGCAATGAATGTTTCATGAAAAATGAAAATTTATAATTTTTTTCACTC TCAGAATGAAGCTGATATTCCGATCACTGAACAATCTGTGTCACAGGTAT ACTTTCTTAAAACTTTTTTTTCACTACATTTCTGGCTAGTTCGATATATA TTTGTGATACTTTTTTATAAATACCAAAACATGTGAAAAGGGGAATAGTT TTTGCTTTGGCTCCATGAAATTTATGCAACAAAATATCAAGCAAACAAAT CTGACACATTTCAAGTTGAATCTTTTCGTCAACTTTTTCTTAAAAATTAC GCAGAATCTAATAGAGTATATACAATTTTAAACCCTTGTATTTGAATTTT GAAACAATCAAAGAGTATCAGTATTAAAACTACGTCCTATTTTCGAGAAT ATATGCTTTAAAATTTAGAAATGTACACTTGGAATTTAAAATTAAGGCTC ACCAGGGCTCACAAACTTTTCCACCTTGCATTCTTCCTTACCCAGTCCCT ACACCCACCATATACACTGCACTATTCCCACCTAAATCCCAATAATTTTC ATTTCAAACCCATATAAAAAAGGCACATAACACTCTCTTTCTCTATTTAA TCAAATTTTTCTTCATCTAATATATATAATTTCAAAAAATTCACATTGTC TTCCCTATTATCAGTGGTGTAACCCTTTTCTGTAATCAACTTTTTGTAGG TGCTACGAAAAGCCAAGACGGAATTGAATAAACAATTCTTAAAAAGCTAA CCGTTCACAATAACCATGCATGCGCATTTACTTTACACTAATTGGGTGCT GGGTAAGAGAAGAAAAATTATTCTTTCTCTTGAATGTTTTGTTGTAAACG TGTCTGTGTTTCAATTTCTCGACTGGGGGATTTTCCTATAAGGGAAAAGT TACCCTTTTTATACCCCCCTTTCTCTTGAAATGACTCTTTTTTGAACGAT TTTTTTCGTATTTTCGCTATTGCTTTGAAATGGCTGAACCATATTTATTG TATAATAGCTCAAAACTTTTAATTTAGCCTTTCCTATTTCAAATTCTGAA AAAGTTTAGATTTTTAACATTTTTAGTTTCTTAAGAATCTCGATTCAAAC TTTTACATTTTTTTTGAAACACCCGATAAGCTAATTACTAAAACTGCAAA AACATTTATTAGCAAAGTTAATATGGAAATAATAAAAAAAGAATATATAG AAAATGTAAACTTTCTATATTTCATGAAAATGGTCCAAAACTTAGCCTTT TCTTGAGCCCCCGCTACAATTACTGGCGGGATATATTGACAATTTTACCT ATTTTAACGTTGCTCAGAATTTGAAGCTCTGGTAAGAATTACGATTTCAG TATACTTCCACTTTGTCTCATCGGATATTTTTATTTGGGAGGGTTTAATT TGCTTCAAGGGTAAAACTTAGCATTATTGTATTGGAACACTTTTAAGCTT TTAGTCTTTTAGTCTTAAGTCAAAAGTTAAAACTCTACTTTCCAACCGTA TTTAAAAATTGCTAGCGGTCTTAAAATTTTGAGGTTATTATTTCACTTTT GTGCCCAAATATTTTGTCAGTGATTGTAATAAGGTAGCTTTAACCAATTT ACCTTTGAGTTGGGTGTCGACCAAATATTTTAAATCTTCCACCCGTTGGG CGCATCTGATTTTCCAATAATGTCTTAAGGGTGATTTTATTACTGTTTAT CGCAACCAGTTCTGTTCCATTATAGTGTTTTGGAATTTTTCTGTATGTAG ATGTATATTAATTTTTGTGTTTATTAATATCTCTCAATTTATATGTCAGA AACTTCGTTGTCGTTATGCTTGAATTTTATGTTTGATTTTTTGTATTTTT ATATCTAATTTTTTTCAACTCTTTAAACACAATTTTCTTTTGTTTATCTT TTCCAGGTACTCCAAACTGCTAAAGATCAATTGAAATGGTCATTACTAAA ATGAATTATTTATTTGGGATTGTAATTTCATTATTTTATGTGTATTTGTG CTTTTCTGGTTTTTGTAAAATATATAAATCCAAAATCTTGATATTGAAAA GTTGATCATTAAAATCTATGCATTGTTCTCGAACGATCTATTCCTTATCC AAGATTTCGTGACATGTGGTTTTTCATGTCTAACTCTGAGGTCGAAATTT ACACTTTTTCATTTTTATATTTAGATATTATTATGACATTATTTTTAAAG TTCAGAAATAACATACGGACAAAAAAAGACTGTTAATTCCCTGATGATTT TACGTGTCATTTCAAAAGTCCACTTTCCCTACCAGCAGTTACAACCTTAT TTTAATCAGAAAATCTTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007751XLOC_007751Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:319018..319200TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:319018..319200Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307656..307724TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307656..307724Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307093..307174TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:307093..307174Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305871..305962TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305871..305962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305346..305479TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:305346..305479Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304853..304904TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304853..304904Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304455..304496TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:304455..304496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:302233..302644TCONS_00013883-exon-sc0000174-1575043694:302233..302644Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:319018..319200TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:319018..319200Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307656..307724TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307656..307724Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307093..307174TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:307093..307174Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305871..305962TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305871..305962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305346..305479TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:305346..305479Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304853..304904TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304853..304904Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304455..304496TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:304455..304496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:302233..302644TCONS_00013883-exon-sc0000174-1510915933:302233..302644Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:319018..319200TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:319018..319200Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307656..307724TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307656..307724Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307093..307174TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:307093..307174Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305871..305962TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305871..305962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305346..305479TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:305346..305479Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304853..304904TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304853..304904Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304455..304496TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:304455..304496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:302233..302644TCONS_00013883-exon-sc0000174-1491911889:302233..302644Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000174supercontigsc0000174:302233..319200 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
105.891 99.578 95.7219 96.834 30.9539 18.4022 28.4493 28.9069 38.2655 31.7287 38.3941 35.2578 27.9988 33.2842 46.0041 37.1752 70.3585 68.8999 24.094 36.6883 67.0584 63.0687 61.2262 64.5775 44.7529 46.7497 64.2542 49.156 109.702 77.6287
Blast
BLAST of TCONS_00013883 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: COPZ1 (Coatomer subunit zeta-1 OS=Homo sapiens GN=COPZ1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 246.128 bits (627), Expect = 4.560e-80
Identity = 108/178 (60.67%), Postives = 154/178 (86.52%), Query Frame = 1
Query:  166 MDDRLLEASLYTIKGVAILDNDGERIISRYYDETFPTVKEQREFEKNLFQKTSRQNAEIIMLDGLTIVYRSSVDLYFYVMGSQYENELILISVLNAFFDAVSTMLRKNVEKRFLMEHLDAVLLAIDELVDGGVLLEADTANIIQRVAIKNEADIPITEQSVSQVLQTAKDQLKWSLLK 699
            M+  +LE SLYT+K + ILDNDG+R+ ++YYD+T+P+VKEQ+ FEKN+F KT R ++EI +L+GLT+VY+SS+DLYFYV+GS YENEL+L++VLN  FD++S MLRKNVEKR L+E+++ + LA+DE+VDGGV+LE+D   ++ RVA++ E D+P+TEQ+VSQVLQ+AK+Q+KWSLL+
Sbjct:    1 MEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGE-DVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR 177          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00013883 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
COPZ14.560e-8060.67Coatomer subunit zeta-1 OS=Homo sapiens GN=COPZ1 P... [more]
back to top