TCONS_00013877 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00013877
Unique Name	TCONS_00013877
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2051

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000174:232561..244324-

transcript sequence

>TCONS_00013877 ID=TCONS_00013877|Name=TCONS_00013877|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2051bp
CTTCAATAGcggtaaaaaatctttgtttatgtttctcGATTTCTCTTTCA
CGATTGCTAGATTTTTATTGTGATTTGTTGACACATGAAACTTGATTCAT
AAATACTTCAGTAAGAAATTTCTGTTGTATCAATTCGTTATTGAACGCTG
AATCAAAGATCTTAAAGGATTTCATACTGACAGATTGATCATGGAACCCA
AATGGCGGATTATCTCACTCTCCCTAATGGCAGTCACTCTTGTTCTCCTT
GTGGCGGCCACCATGTCCACCAATTGGCGGGAGGATCATGAAGGGCGTAT
TGATGTTTTCATAACACACGGATTGTGGAGAATTTGTAGGGATATCAAAT
TCGGTGCAACCTTGGATCATAAATGCATGGCCTCACTTGCTAACAATGCT
CCCGACTGGTTCCAAACTGTACGCGCTTTCATGTTATTGACTTGTCTCGT
TGTGTTGATTGCTTTTGCATACGCCGTCAAATTGATCTATCAATTACCTG
TTATCAAGCACAGAAACCAAAAAGCATCCGTATCGCTTGCTTTACCAGCA
ATCTTGATGTTTGTAGCAGCTGTGACTGGTTTGATTGGTGTCACCACATT
CTCTGTCGCCACTCATATGGATCAAGGCTTGTATTTCCCAGAATCCCTCC
CACCAACTTGGGGTAACAGTTGGGCTATGGTCTGGGCAAAACGAAACAGT
TTACCATCTGACCGCCCTGAAGAAAAAGCCATGGAAATGACATACGGTTA
TTCATACGCCCTTGGATGGTTAGGCGTTCTTTCAACCACCGCCTCCTTTG
TTGTCAATTTAGTTGCCAGCGGTAAACAGTAAACAAAAAACATGACGACT
TTGTCTAAATACACCATATGTTATATTTGGATTGTAATTGTTAAAAGAAG
GTACCTGTCAGGAAAGATATACTCCGAACCCTGGCACTATTAAAACTGGT
GCAAGGAATGAAGAGCAAAAACTATTTAGCTCCTTCATAATGTTTTGATA
AATAAACATTACTACGGTATATCAATGAACGAAGTTTTGAGCAGACCTCT
GAGTAATCATTAAGGCCGTCagaatttttaacataattaacAGCAGGGGC
TATGCTTTGAAAACAGagtttaaatgaaaattgcattttcatttgcattt
ttattttaaagcatcttgatatttttttcatcaagAATGAGAAAGGGTTC
AAAGAATTTAAATCGAAAATTGTTTTGCTTATAAGTCTAATATCAGTAAC
GGCTAAAAACAAATAATTGTCTGTTAGAtgatttaaaaaagtattttttt
atgtGCATACCTTTTACTACTATAATTTAATTATAATCATTTTATGAAAT
AGTGATTCCAATCGATCGGTATGTTATTTAGGTTTAAAATTCTTTTTAGG
ggataataaatttattttgtagttttttttcaCATCTGTCTTTAGGGAAC
TGTTGATTCTTTCTCAGGAGAGCGCCATGGTATTTTCGAGGAATTTATAT
CTAGTCTTTAGAGGGTAttgggctttttcagaaaaaaactgtaTATCCCC
TTTAGAGGAAGTCCATTTCCGTTCTAAGGGGGGTATGTCTTGGAATTCCA
TTGGgatatacaaaaatctgtcaaagtAGTTGGAATTTCATGGAGGTAAC
TAATATTATAAATCCTacaaaaattcggaattccaaaGGGGTTTAAACAT
AAAACTGCCTGGAATTCCAACATTTCCATCAACAAAAGTTTGggcctcct
caacagggggtatacgtttTTTCCTGAAAAGCCCATTCTACAAAGGTTCA
CCCTAAAGAATCTTCGGGGACTAATTTTTACTAAACTAAGCTTTTTATTT
AGTGACACAACTATCGTTTTCTTAATtcgtaattattttttttttctaag
aaatccaaacccaaaaaacttttaataattaatatttgtatttataaata
aaattgatgatttttattgatttgtAATAATTGTGTTTATAGATGTTCTA
TCAAAGATTTTCACTTTCAATTGAGAATAACTAAAAATTATATGTctcaa
a

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000174:232561..244324-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00013877 ID=TCONS_00013877|Name=TCONS_00013877|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:232561..244324- (Clytia hemisphaerica)
CTTCAATAGCGGTAAAAAATCTTTGTTTATGTTTCTCGATTTCTCTTTCA
CGATTGCTAGATTTTTATTGTGATTTGTTGACACATGAAACTTGATTCAT
AAATACTTCAGTAAGAAATTTCTGTTGTATCAATTCGTTATTGAACGCTG
AATCAAAGATCTTAAAGGATTTCATACTGACAGTAAGGCTTTATTACTTT
CTTCAATTTTATTTCATCATTATTGCATTTTCACTCAAGCATCATATCAA
GATTGAAGGGGCTGTATAAACTCTAGATCACTTGTTTTTTATCCTTTTAT
CATTGATTTTAGTTTATAATCTAAAAGTTTTTGATAGAGCTTGAAGTTAC
TCTTGTGACTGTCAAGTAAAAAGAAGAATTTACCTTCGGACAAATTTTGT
CTGTTGTTTTACAGTATAATGTTTCACAAAAAGTTTTGGTATGGTTTTAA
ACTGAGAGGTTAATAATGGATTTTCTGGCACGTTTTGGGAGGGTTGATTG
GTTTGTTTACTTTTAAATGAGTCACTCAAAATGGTGTCTTATCTTTGTTA
GTAACTATATGATTACAAGTACAACATAACATGCATCCCATCATGCTATT
CCAAGGGAGAGCGAGAGAGTGGTATACTGCCAGCGCGAGCATAGCAAAAA
AGCAAAAAAATTATTTATACCAGTGTTTTACCATTAAACCATTTTACTAG
CTCAAGCAATCTTTAAGAAAGTTGACCTTTTCCATAGACAAGATGCTGTC
CTGTGTGAAAATAGAGCTACGAGTCCTGATCCTTTATCACTTTATCCCTG
TCCTGTGATTAATGATAATAAGAAGCTTAAACCTGACATATACTACCAGT
CGTATAAAAAAAACAAAGGAAAGTCACATGAAAGTTTGACAATTTTTTGC
TAGGCAACTTAAGATAATGTTGCCCTAGATTCATGCTTTTCTTAGACTAT
TGATAAAAAGTCATTATATATGTTTATAATCTCCAATATGGTTTTTCTCG
TAAAAGGGTTTTAGCATCATTAAAGGGTATAATTAATGGTTAATCAAGGA
AGTAAAGTGGACGAAACTAAACACTAATGCCTATCAAAAATGAAGGTAAT
TATGAAATGAAAATACTTATTTGGACATACTGCGTTTTTAATTATTTTTG
AAGTGTTTTTTTCTTTGAATTTCCTGTTAACAATTGAGCTTTTGAAGTAT
CGTTTTCTTTTCTTTTCTTCGTGATTTGGATTTGATGCTTGCTATTAAAC
CTTCTTGGATTAGACTTTCACAAGAATTTTTTTCTTCTTCATATAATATA
ATACATAACAAGGTAAGAAAGTAAGAAAAACATGTTGCTTCAAATTGTGT
TTTATTATTATTTAGGTAGTTTTGCAATTATGCCAAATATTGAAAGTAGG
GTAAAACCTTTATATTAATAGCCTACTACAATTTTTATGAATATTTATGA
TTTAATTATTTATAGAATTTAAGCTTTTTGGATTAGGGAGACAATTCTTT
TTTAATAACTTATTCTAATCATCTTTCCTCTTTTTCAGAAATTTTTCTCA
TATTACCACCCAAGATTTGAGGGTTTTTTAAAACTTTTCAGTCCTTCAAC
GGTAGTGCTTCTTTCCCAGAGCAAAAATAAATTTGACTTTTTCAACTTTC
TCACTCAGGACTGAATAGCTTTTAAAAGTATAAGAATCTGGTCTCTTAAA
ATTTTATCCATTTAATTGTTGAGCGTACCTAGTCAAGGATTGTAAAAGAA
CAGAAGACTTTTTTTGGAAATTAAAACACAAAAGTGTCAAGAAATATCCA
AAGAAATTTTTTATCAATGTAAAAATTTTCAAGAAAGCAGTACCTTTCTG
ATAATTTTAACAACCAGGACCATATCCTTTGGGTCAAGAAAGAATTGATA
AGCTCAAAACTCCAATAATAAGATAAAAAAGCATTAGAAGTTTCTGAACA
ATTTTTATAAACACATGATGGAAATAAGAAGGGTACAGATCAACCCCAGC
CCAGTGCCGTGGGACTGAAAGGTTTAATACAATCCCTTAAAATTAAGTTC
CGAAAAACCACCCATTTGAAACCTTCAGTCCACAAACATTAGCTCCCTTA
AAGGTTTTGATATTGTTGCTTACTGTACTCGTCAATTTCAACTTTAACTT
ATAAGCTTTTTCACATAGAGTTGACACGAATGTGGAACAAGATTGGTCAT
TTTTAAAAGTAAAATAAATTGTTTATTCAGTACAAAATCTAAGACAAACT
GTTTAATATTAATAATAGGAGACACTGGCCTAATATAAGATATACAATAT
CCATCTAATATGAAACAGGAATACTTATGTAAAACTAAAACCTTTAGTAA
AGGTATTATCTTTCTGGACTAGCTGAAATGTAGAATGCTCAATGTCTTGT
TGTCATTGTCATAAAGTGTAGAGGGTTAGCCCCCAGCAATTTTCAGGGGG
GGGGCTAATTAAAAAAGAAATGTTCTTAAGAGTTGGGAAAGCTAAAGTGA
TTTTAATCTTAAGGGCATAACGTATAAATTAGAGATCTGATACAATTTAC
TTTTCAAGTATTGAAATTTGAAAATTATTATCAATCAGCTTAGCTTTCAG
TTCCATTTCTCGAAAACATATAACCTCGCTGCTGATTGAGAATCTATTAA
TAATTTGTTTGATTATAATTGTGAGAAAAGTCATAAGTCCTCTCAAATAT
CACAAAATGGCCCATAATTTTTTGCGTTGATTGTTTAATTTCCAAGAAAA
TTCCAAAGTATATATATATGTGAAGAAATAAGAATTTCTGTCCAACTATA
TTCACTCAGGAGATCTGGATGGCAGAGCAGCATATGTAATTTTCATCTTT
ATTGGGACTCATCAGTGCTGCGTACTGCATATGATTCAATAAAGAATTCT
TTAGGGAATTTCCCTTATGTCTACTATTTCTCTCAGTTTGAACCACAAGC
AATTTTGTGGTTAAGAGATGCTTTTTAAATTAATCTGGTCAGCCAGGGTG
CAGTATGCAGCACTGATGAGTCCTAATAAAGAAGAAATGCATATGCTGAT
CTGCCACCCTCTCCTGAGTGAATATATTTGGACAGAAATTTTTATATATG
TATGAAAATTTGGAGAACTTAGTCTTAAGGTAAGAACTATCAACATTATT
TAAATTATATACTAGCAATTTTTCATACAGTCATACACTGACCAGCTAAC
TGAACTAACATGGTAACAAATATCACAAAATGTTGTTACATTTCCTACTT
GTAGCAGTGTTGTAGTAATGTTGTCAAAAAATTAATCTCATTAAAAACCA
TGTTTTCGCTCAACACTTCCTCCTCCGCTAAAGTTTTTTTTAATGAAATT
TTCATTAAGACTTAATTATAAAAATGTTGCATTTCTTTCNAACCATGTTT
TCGCTTAACACTTCCTCCTCCGCTAAAGTTTTTTTATTTTCATTAAAACT
TATATAATTATAAAAATGTTGCATTTCTTTCCAGTATGAATGTTGTTCTC
TCTCCAATCTTGTAGAGAAATGAGATTTCTTTAATAAAGATGGAATTCCA
ATTGCTTTTAGATTATGCATATTATCAATGCATAACTGAAAGGCTAACTG
TCAAAGAATAAAACTGACAAAAAGATTACTAGCTGTATAATGTTCTTTGA
AAACAATAAGTCACTCATGTTAAACTGTTTCCCTTGAAAGAATTTCCTGC
TGATTTTTGAGAGTTAAGAATAAAAATTTTCCACATACTGTCATGAAAAG
GTAAAAGTATCACAGAAATTCTTTAAAAAAGAACAATAAATAACACTGGT
GATAAAATCTCAAGAAGGATGGTTTTTTCGATGTGCTTTCGAAGATATAC
AGTAGTTACAGTAAACTTGAAATAGAGTTGAGATAATATAACAAAAAGGC
TAGGTACCTTATAATATTCTGTACAGTTTGTATAAAGACATAGTAATAAA
TGATTGATTCTATTCATTGTAGTATATTAATTCAGAGCTATATGCTATGC
TGTGCTATGTTTTTCTCTTTAAAAGAAAAAGATTAATATGTTCAATTATC
ACGTCACACTATGTGAGATGTGTTCTTTGAATGGAGTCACTCATTAGAAC
ATGGTTTAGGATTAAATACTAGCTTGATTGATATAGGAAAAATGTTTTTA
TTATTACTCGTTTTGATGTAGGTTGGGTTGCATTTGAGAGTTCAAAGACC
AACAATGTTGATTTTATTCTTTTGCAGAAAGGAATGTAGGTGGTCCTGTA
TGGTCCAGTGAAGAATTTGTTTATGTAATAATTAAATAACGAGTGCTCCT
TATTTACTTACCAAAGTTAATTGGTGCTTAAGGTTAATTATTTTTTTTTG
TGTTTCAGTTCTGTAGCGAAAAATTGCTCTTTGATTAGTAATATGCATTT
TGAAGCAGTAAGTTTTATGAATAAGCATTGCTATGATGGTATGGTAGGGG
AGTAAAGCTATGGCATTATTCGAGGAAGTTTTATATATTAGTTTGTGTTG
TTGTTTTTTTTACTATTGAAATTTGTATTTTTTGTTGTTGTTTTTGTTTA
AGTTAGAACTTTTTTGAAATCTTTGTAGTCTTTAGAGAAGTTGAGGAGTT
GAACAACACCTTTTTGATACAGTATCAATGAAGGTTGGAAATCAGTCTAA
CTAATTGGATAGTCTGGCTATCAAAATCGAAATTTGTTACATTCAGAGAC
GTTGATATAATAATGCTTTTTACAGATACCTTAAAATTTGAAACCTAGAA
AACATTTTTACCGTTATAGGTATATAGTCTGTTTATGATTCTTTCGATAG
CTATTTGGTGTATTTTATTGTTGTTAAAACGTGTCAATGAATTAGTGCTT
TTATACAGGATAATCTTTATTAGCCTTTTTAAAACCTTATTTTATGAGCC
TAAAAGTGTACAACAAAATAGTTACTTTAATAGTAATAGTAATTTTAATA
GAAATTTTAATGTCGAAGTTTTATGATTTTGTCTTTAGTCAGATCTTTTG
AAATGTTTTATTGGTATTACAACGTCTCTACTAAGTAGACTTGACAATTT
ATTTTTTGAAGTTACTAGTTCCTAAAGTTATTCGTTATAACATAGACAAT
GATATTTTCAAAAGTTTGTTTTTAAGGAGTAAGAATAAAATTTTACAAGA
TAAATCCTTTTTTGGTAAATTTTCGTTTAGATAAACCACGGAGTAAAAGA
TGAAGACTTAAATAATTTATTACAGTATCTTTAAGACGCCATGGTTGAAT
TTCTCCTATTGTAAAAAAAAATTAGAGAAGGCAAAAAACAAGAAAATTCA
AATAAGCTTAGATTGACTTTATATTCTGAGAGAAAAGGGATAAACTTAAG
TTTGTATTTAGTGCCTCGTGTAAATCCTTATTATGATTTTACAGCAATGT
TATATATTCGTTGATGGAGAATGACCTATTGATTTTTTTTAAATAAAATG
TTATTCTGATAGTGTTTTACTTTTTGAAGTAGAAGAAGTTGAAATTTTGT
TGTAAGTTAGAAGAAGGAGAAAAGAGGGCTAGCTTTGTCGAAGAAAAGTT
TTTGAAGCTTCTAGTTTTTACTAAATCTAAAATAGTTTTTTTTCTTCGAA
CTTTTAGAATCTTTGTCAACATTTTTAGTTAGTACTTTGTTGTTTTTTTA
AGTGTAGTCATAATTATTTTGAGTTTAATGAATTTAGATTCTGAAATTAC
TAACACTTCTTAAGAAAGCACATTGGAAGAACCATCCAAACCAAAGAACA
ATGGCTAGCCAAGGAAATGAACAGCTCATCGCGGGCAATAAACGAACTTA
CTCTGTCAACCCTAAGAGTTTTCGAAAAGGTAAAATTGAATTTGGATCCA
AGGACACTATATCATACATATGAATATTATTCATGATATTCATGACGTAA
TGTTTTCTACGGAAAGACCCTGTTTTTGTATAGTTTAAATTTGAATTGAG
AAGGTTCGTCCACCCCCCTGTATGGAAACTTTATGGAACTGCCAGCGCAT
TGGGTTTTGTTTTTAAGGAAATTTGAAGAATTTTTAAAGACTTTTCTAAA
AAAACCTATGCTATGACTGAGCTAATGTTTTATTTCAATTTTGTTTTTCA
ATTGAAGGTACACTGCTCAAAATATTACATTTTGTTTATACACCTTTTCT
ACCGTAGCCGCCAATTATTGCCGCGCGGGCATTTTTTGTCCGTTCTACCA
CCCTAAAATTAAACTGTCCTAGTATTTTTTTCGCACCTATAGCTAATAGA
AAAAGGTGTAAAAAAAGGATTGTATCGAGTTCAGGGGGACAAATCAATAA
TAAAGTGGCACACGCCTGACTGCGCGAATACGGTCGAAAAGGTGTATTGA
ATGCTGTTTCTTTTAATGCTTATCATGTAGATCATCTCGTTGGTGACTTA
CTAATGAAAAAACTACATAGCTTTGTCGGTTCTTTACTCATCACACCACT
CATGTTATTAATGACAATTTAATTAGTTTTTTAATGACCCTTTTTATAAC
ATCATCTTTGTTTTGTGTAGGTTGGTTGAAAAGCATATAGTGTATTTTTG
GCAGTTTTAATCTTCGTGCGATAATGTTACTTTTCACTAATTGCAAGATT
TTGTAATTTCTCGACCACAATCATTGCAACAGAACAAAGTCATATAATGT
TAACTTTTGCCTTTATGCCTTATCAAAATGGATAAAACGCATATGTACCT
AAATTATTTTGAACAAAGATCGTTAACTCCCTGGATATCCGATATCCTCA
ACAGGGGGAGGGAGGACTATTTCTGGAAAAAGCCCAATGCTACTACTCAA
ATGAACAGGATTTCTCCAACCTTTTTCTTAGATTCTCAAAACAAACACAC
GTGTGATGAAGATAGCCTTATATTGCTCAAAATGGGTGGGGGGGTTAAAT
GTAGAAAACATACACGCTGAAGCTCTGGAGGTTGGAAAATTTTTCGAAGG
TTTAGATTACGGAATTTTGCAAGATCGCGTCAAGGATTTTGCAGTGGGAG
GTCTGGTAACCCAGTCCTCGTTTTTAGGGATTAGCGAGTCCAACCGAAAA
TTTTTTAGCTTTACGCGCAAGGGCAGTTGAACCCGACTAGGGATGCAGCA
TATCAAAGGTCGACTATCATTCCTCTCCGATGGGAAATTGGCCCGCTCCT
TTATAGCTTTAGCGTGGACGGCAGCCAATCCGAAATTTGAATATCAGATA
AAAGCTCCTCACAAGGAAGGGCGGATAGAAAAAAAATTCTCCACCATAAA
TTTTCTTGGATCAAGAACATGTAAAAAGTATTACGGTAGCAGACGGCTTA
GAGGGAAAGAACGCCTTATCAACCCCGGTTGGCTTTCCAGGTGACTGGTA
ACGAATTCTATCGGCGCGCGGCATTTCTAGACTGTCACTAAAGCAAATCA
CGCTAATTTCCGCCGAAACTCTACTCTATATGAGAGATTTTCTTTGAATC
TCGGAGGTAGAGTTCAAGCTTTTTTAAGTATCAAAATAGTTTAACTGAAT
TGACGTTCGTTACCAGTTTCCTAAAAACCTAATCAGGCCGCTAAAAGTTG
ATACATGTACATGTATTTTTTTAATAAGTGTCAGTAGCGTAGAATTTTGG
AGCTTTTATGACACAGTAATTATGTTGTTATATTATGAATAGATAATTAC
AGTGTCATAAAAATCTGCTCTCCTACACAAATTTTGTGTCCCTCCTGTCT
AAGCTACTGAGTGTCTACCCTATACCAGGCTCACGTTATACTTACCATGC
TATTGTCCTTAAACAATAGAGCCATTTTTTTGGTACGAAACACTGAGCCT
GTAGTACTTATAAACGCTATGCTTTTAAAAAACATAAGTGTATACATAAC
ATTAAAAGAAAACGTAAAATATAAAAGCAGCAAATTTATAGAACAAAAAA
ACTTTAGAACATTACATTAAAGATGTATTTTTTTCTGTTATTCGAGCACT
TATTTATCATTAAACATTTCTTTACTTTTCATTAGGATTGATCATGGAAC
CCAAATGGCGGATTATCTCACTCTCCCTAATGGCAGTCACTCTTGTTCTC
CTTGTGGCGGCCACCATGTCCACCAATTGGCGGGAGGATCATGAAGGGCG
TATTGATGTTTTCATAACACACGGATTGTGGAGAATTTGTAGGGATATCA
AATTCGGTGCAACCTTGGATCATAAATGCATGGCCTCACTTGCTAACAAT
GCTCCCGGTTAGTTGTTTTTAACGATGAACCAAAAGCCTCAATAGACATT
TTCATGAATTATGTCACGACCATCACTTTCCTCGTATTCAAACAATTGCC
ATGGTGATTATGTCCCTTGATACATTAAATGATTTTTATGAATAGAAAGT
AGTTTTAATAAAATCAGCTGGGAGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAA
AGTGATGTCCGTGGTGTAATTTATGAAAAGGTTTATTGCAGAGTGGACTG
GTGTTTTAAGTGAATTTCTTGATGTCACTAAAACTGAAGAATTTACAGGA
AATTAAGTTAGATTTAACTCCATCGTGTGTAGCCCCAGCTTGAAGGTATT
TATTGTATCATTTCTTCCTGTTTTTCAACAGAATTCTTTCGAACTGATTT
TCCACAGTTCAAAGCTACGTCGAAAAATATTTGGTAGACCAAAAATACAG
GTCGATGCAATTTCGATATTTTCTTAATACACATTTTCGACTGTAGCCGC
CAATTGCCGCGCGGGAATTTTTTGTCCGTTTTACCACCCTAAAACCGTCC
CAATCTTTTTTTCGCACCTATAGACAATAGAAAAAGGTGTAAAGAAAGGA
TTGGATCTAGTTTAGAGGGATAATTAGAAAATAAAGTGGCATCTGCCCTG
ACTACGGTCGAATAGGTGTATAAAAGCAAATTCTTGGAAATCAACCTTCG
CAATGAATTATAAAAAAATTAAAAAATTATAAATAGAACAAAAAAGTTTG
GGTAACGACCAATATATATATATCTATCTTCTTTTGTGTTTAGTTAAAAT
AATTATCATAATATATATAGGTCACTTTATGCTTTCTATTTTTAGATAGA
TACGAGATTTTACCATGAATCACTGTATAATTTCGTCATTTTTGTTTACA
GACTGGTTCCAAACTGTACGCGCTTTCATGTTATTGACTTGTCTCGTTGT
GTTGATTGCTTTTGCATACGCCGTCAAATTGATCTATCAATTACCTGTTA
TCAAGCACAGAAACCAAAAAGCATCCGTATCGCTTGCTTTACCAGCAATC
TTGATGTTTGTAGCAGGTAAGGTCTTTTTTGTTTTGTTTTTCAATTCAAA
AATCTTTCAGGCGTCTGCAAAATGTTGATGTAGAGTATTGGGGATGAGAG
CTCTGTGTAGTTTTTCAACAGGAAACAGGGTTTTTGAACCATGATCAACT
TCTGGCCAACTTCTCATCGAGGGGGGAGGGGGGTGGTTAGTCCAACAATG
TCCTACCAACGCCAAGACAGATTTTTACTCTTCTCGTCGTCCTGCTCACA
AATTTGTTTTCCTGTTGTTTTGATCTAAGGGACTTTAATCTGTTTTATTT
TGGTTATGCCTAGATATCATGTAACTCATATAAAGTTTTACTGGACATTA
CCCAACCTTTTGTTTATACTCTCGGGTACCTAATTGCCAGAGGCCCCGCT
AATTAGCCTTCTTTTCGAAAACTTTCCACCCAGGACAATTTTATTCCAAC
CCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCGCTTATTAATTTTTGAGATTTT
TTCCAACCCCCCTGCTTATTCCGAACCCTATTATTAACCCGGCTATTAGG
TACCCGAGAGTACTTAGATGATAAAGATATATCATGTATTTCATATATAC
AGTTTTACTGGGCATTACCCAACCTTAGGGTTTTAATTGCGTTTTTCTGA
TAATGTTTTATATTTACTTCATTTTAGCTGTGACTGGTTTGATTGGTGTC
ACCACATTCTCTGTCGCCACTCATATGGATCAAGGCTTGTATTTCCCAGA
ATCCCTCCCACCAACTTGGGGTAACAGTTGGGCTATGGTGAGTATATACA
ATTCAATTTTACAAGTGATCTAACTGAGAATTAAGATAAATCTTAGCTAT
TCAAATTTCAGAAATATTTTAGAAAATATCGTATTGTCTTACTGATTTGA
ACTTCTGCTATTCGAAATTCCCCTGATATGTGATCAAATTAGATTTTAAG
TTCGATCTCGACAATATCTATAGTTAACATGCAGCTCTGCAAAGTATTTG
TTTCAATTCTTTAAAACATTCTATTTTTTCCATTTTCAATAGGTCTGGGC
AAAACGAAACAGTTTACCATCTGACCGCCCTGAAGAAAAAGCCATGGAAA
TGACATACGGTTATTCATACGCCCTTGGATGGTTAGGCGTTCTTTCAACC
ACCGCCTCCTTTGTTGTCAATTTAGTTGCCAGCGGTAAACAGTAAACAAA
AAACATGACGACTTTGTCTAAATACACCATATGTTATATTTGGATTGTAA
TTGTTAAAAGAAGGTACCTGTCAGGAAAGATATACTCCGAACCCTGGCAC
TATTAAAACTGGTGCAAGGAATGAAGAGCAAAAACTATTTAGCTCCTTCA
TAATGTTTTGATAAATAAACATTACTACGGTATATCAATGAACGAAGTTT
TGAGCAGACCTCTGAGTAATCATTAAGGCCGTCAGAATTTTTAACATAAT
TAACAGCAGGGGCTATGCTTTGAAAACAGAGTTTAAATGAAAATTGCATT
TTCATTTGCATTTTTATTTTAAAGCATCTTGATATTTTTTTCATCAAGAA
TGAGAAAGGGTTCAAAGAATTTAAATCGAAAATTGTTTTGCTTATAAGTC
TAATATCAGTAACGGCTAAAAACAAATAATTGTCTGTTAGATGATTTAAA
AAAGTATTTTTTTATGTGCATACCTTTTACTACTATAATTTAATTATAAT
CATTTTATGAAATAGTGATTCCAATCGATCGGTATGTTATTTAGGTTTAA
AATTCTTTTTAGGGGATAATAAATTTATTTTGTAGTTTTTTTTCACATCT
GTCTTTAGGGAACTGTTGATTCTTTCTCAGGAGAGCGCCATGGTATTTTC
GAGGAATTTATATCTAGTCTTTAGAGGGTATTGGGCTTTTTCAGAAAAAA
ACTGTATATCCCCTTTAGAGGAAGTCCATTTCCGTTCTAAGGGGGGTATG
TCTTGGAATTCCATTGGGATATACAAAAATCTGTCAAAGTAGTTGGAATT
TCATGGAGGTAACTAATATTATAAATCCTACAAAAATTCGGAATTCCAAA
GGGGTTTAAACATAAAACTGCCTGGAATTCCAACATTTCCATCAACAAAA
GTTTGGGCCTCCTCAACAGGGGGTATACGTTTTTTCCTGAAAAGCCCATT
CTACAAAGGTTCACCCTAAAGAATCTTCGGGGACTAATTTTTACTAAACT
AAGCTTTTTATTTAGTGACACAACTATCGTTTTCTTAATTCGTAATTATT
TTTTTTTTCTAAGAAATCCAAACCCAAAAAACTTTTAATAATTAATATTT
GTATTTATAAATAAAATTGATGATTTTTATTGATTTGTAATAATTGTGTT
TATAGATGTTCTATCAAAGATTTTCACTTTCAATTGAGAATAACTAAAAA
TTATATGTCTCAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_007748	XLOC_007748	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000174	supercontig	sc0000174:232561..244324 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.95219	5.30715	13.0039	15.6043	139.768	120.284	45.6395	47.9062	49.4502	47.9054	55.0161	46.2317	28.1185	23.681	31.0992	30.1281	15.0251	23.7394	37.8439	33.843	23.8633	27.2098	11.3552	16.6491	4.99469	2.32316	11.5065	6.43419	68.3209	71.6393

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00013877 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00013877 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00013877 (transcript) - C. hemisphaerica