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transcript sequence >TCONS_00012125 ID=TCONS_00012125|Name=TCONS_00012125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4158bp TTCTAATCAATGGAAAAGTgcgaaaacacaaaaaaaaatttggaaaaaaa gaaaagttctggaaaatgatgaaaagaTGAGGATTGAAGAGAGGGGAAAG TAGTCTAGTATACTCGCAAAGTTAGTGTTATAATTAAtatggaaatcaaa aagaagaatggataatgaaaaataaaagctaaaatttttgaatttttttt cttgaagtaAAATGTGTAATATTGTGAAAGATGAGAATAAAGGGTTTTTT TGGGAGGGATGTTTTTCCCCGGGGGGAATAGATAGCCTCAGAAAATAATT TAATCTCAGGCAAATTTAAAAgaagaatttattttggaataaacatttta tttgactttgttatttggatttttaaaagAGTTTCAAATTTGAACGATTC ACCTTAAAATATTTCGGCCAAGATAATcTTAAACACAATGAAGAAATTGA TGTGAAAAACGAAGTTgatcaacaaaacaaaacgaaacaaaacgaaagtg aaagttaaAGTGATTATGTCTTCATCGACACGACTAATAATATAAAGGTT ATTCTGTTATGGTGAAATTGTAACCAATGGATTCGTCTACTTATCAATAT ATTGCCAACCCACGGACACATACACAGAAGGTTTTATCTTTAGTTGTGAA ATTATGGTTGATCGCCAACTTTGTGACTGGACCATTCGCACTGGTTTATG GTGTTGAGAATATCGCAGAATGTCCAAGCCAGCCGTGGATCCCTATTTTC CTGATGGCTCAAGGCGTCGCATCAATCATTCTTATTTCACTCATGTTGAC ATGTTTTATCAGTTGTAATGATGACGAGAAAGCGACACATTGGTTCCGCT GCAtgacattttttatcattctcgTGACACTAGCCTTGATGACATGGCAT TTTGTTGGCTCATATTGGGTATTCGGGCTATACCAACAATTACAAGTTGA CGGGTCATGCGCATCGAATTGTTATATGTTAGCTTTCGTTTTACTTGTGG TTTGCCAGATATGTTATGgtacttttgttttgttttttccatGTGTCTTG AAAGAACGCATCTGTGCATCACGTTattgaaatttggaaaagaCTTGGAT GTAAAATTAATGcagaatttatatttttcttcgcTTTAAATGAATCATAA TAGCGAGGTTATATAAATCACTACGATGGACTAAATTAGGGTAGCCTTCG TTCGCGCTTCGGAACTTTTCTACAGgtttaaggttttatttttacataag tgtttccgtttcatattagAAACATATGTCATacgcttttcttttttttt taagaatctagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaagaaatcggcc ttttgagccttaaatgcttcttacatgtttctaaactttttaacataatc agcctcatgtaAGGCTGGGTTGGAAGGTTCATAAAtgaaaccgaattaaa aaaagttattttctcattctcagcctcagcatgtttcctagatgtttctt agtttttaggctttctgagcctcatgtttcttaaaagtgtgtttcttaaa taaaaaaaaaacgtgtatcagaaCAGTgtttgcctattgttatattatgt tatgttatgttttcctttcctctttctgaccaacattgctccacatctgt gtcaattcaatgtgaaaaagcttgtaaattaaaattgatgagcaagcaaa caatatcactcttatttaaaaataaaacctttaactcaAAAGTAAGGCAG ACTTATCCCACGAAGAAATCAGAAATTAACAGATAGTAAAGCAAAGCGGA TATAGTACGCAGGCGGTAAGCATCTTGTTTTCTGATTACCCCGTAAAAAG TAATATTATTCCCATAGGAGAAAGAAGTGGGCGTGGGTATGGGTGTGTCA AAAACACTTTACCTGACACcaacaaccccccccccccccatttaaaCTTA TGTCTTTGATAACTGCTTCTTCTGCGTCTGGATTTCTGCAGAGCTTTCTT GTCTAACTGACTGACTGATAAAAAGACGTTATTACGATCAAGCGCCACCG TTCCTGTTTTTTCATGATTCATTGCGGTCGTACCTATTTCAACATCAAAG TAATTTatgaatttataaaaaatagcTTTTTGTTTCAACATTGTTTTTAT GCACAGACACAACGATACGGCAAATACAGTACAGACGGTTTatggatttc tttttttttggaatattcaCTGCACAGATGTTGTGCTTTCAGCTCTTACA Agcaacaagcaaaaaaaagtgaatatcacaaaaaatatcgctgttattgt ttttgaaaacatgtgaagcgtcttattggtcaagcgctgaaattctattc taATAttacgtgacctaggtaggatttcctacctaacctcggcacacttt tcagccaaagcacgacatctgaccctttgggctttataaatctataaaAT TTTGTCCCTGATCTGAAGAATATATCAGCCTCACaacttctatccccatt gggactcCGATAGGGATTCTAATCCCCACTATGGGAAAAATTCCAacggg gctgtgaaacaggggtacATTATCCCGAAAAACTCGTAAGGGTGCAGCAA TGCTCTCATTTTTTTGCGTATTTTTAAAAGGGGTTTAGAGAATTCTATAT TTATTTTCTCCACAATTATGAAATTTAAAAGTATTGTAAATTATAAATTG taaataacaaagaaaaaaaggaattttatcAACATAATTATACATTGCAa taaatatattataatataatattaaATTTTTCCCTCTTTATATTTCCATA ACTTTGAACATTGTCCTTATGAAAAACACTGGTCTGTAAGCattttgttt taactttttgttagctttttcttttgttattatcaaaaaatgagaattga tttcctcagtttttgatcacgttaccaagtacttAGGGATGAGtttaaaa tttaattacatgatcaaaaagtgagcataACAAACTATTTtatcaacgca agttcaagtaagaaacaatggaaagaaacgaAAGGCCTCCAGACCGggtt tttttatacggactatgcttAGAATAACGGCTTTCTTTAAAAGAATTCGC TCAATATCCCAAATAATTTCTGCTGAAAATGCAAATTTCCAATACTTGAA ACCACACAAAACAACAAATGAAATAACCCATGAAAGGTGTGTAAAAGGTG TTTCCCAGATTAAGTATCACACCAGATTGATTTTATATTGATTTCGTGGT GGCTACACCACAACACTATCCAAAAGTTTGTCTCTTTGGCATGTTTAAAT GTTAGATTTATAGATCAGAAATGAACGGAGAAACTTTTTCATACAGTATA TCGAACTCATACATTAGGAATGTcgtttgtaaaaagtttttttttaacta acTGATGAATGCTTGAAAGCGCAGGAAAagtattagaaaaaaaatttctc cgttCATTTCTGAACAATGATAACGCTCTAGGGTattaagcacacacaat ttaaAGTCAGTCATACAATAATGTTAGATTTAAATATTCTCTGTTAAGAA TTAATTTAGGGTCTAGTTCattcaatctttaaaaaaagttgaaattttag aGTTATTTGAGATTTGAGGTCTGTATATAAATGTGAaccatgaaattttt taaattgtatatatttattttgtcaaaagtcGCACCTTAAAATATCCACT ATTCATTTTATTCCACTATTCAAATTTCGTAGCTCTTAAAATTTGACAGC AGTTTCATTTCAAGGGTTCCCTCTATTCCATTCCCATCTATGATTTCAAA CTTCTTTATGATGAAAATACTGTTAGTAAACACGACCCTTCTCACAGTCC TGGTAGGGTTTTTCACCCAGTGTTGCTGACTGTAACTCAGTAGAGATTTA TATTCCCATATTCTTTAAtgacacctccttctcacagacccactggaaaa attggccgaaatatcgtccccggtggaaaatgaTCCTCTAATTATTGTCC ATACTGAATCAATTAAACCAGCCCTCACTGCAAatatattatgctatttt tcctatccccaatgaattttctgactttagaataaaagaattgaaatccc cagccataaaaaatatgggaatttCCAATCTGAGTTTATCCCCACTAATC Cgatcggg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000137:436167..444224- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012125 ID=TCONS_00012125|Name=TCONS_00012125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8058bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137:436167..444224- (Clytia hemisphaerica) TTCTAATCAATGGAAAAGTGCGAAAACACAAAAAAAAATTTGGAAAAAAA
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TTTCACGGCGTGACCAATGGGCACAAACGTCTTTTGGATGTCTAATGTAC
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TGGGGCCCCCAAAACGGGGGGAGAAACTATGAACATATTTGTGTTTTTCC
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TAGAAAAAAACTTAACTGAAACTGAAAATATTAAGCTTTAAAGATATTTT
CTCCAATATTTCGCAAAAAAAATTACAAAATTTGCCGTCTTAGCTAATTT
AGCGAAAAATTTTATATATAATGTTAATTTTTTGTTATGAACTATTATAT
CAAGCTGATAGGAATGGAATTCCAAGATTTTTTGCTGTTTCTCATTTTTA
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GACCTTTAAGATCCTATATCTTTTACCCAGCCTCTAAAGTCACAGATGTA
TCTGCATTTTCTGAACGGCATTAGGTGTAGAAAGTTTCCTATTCCCCTAT
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TAGCGAGGTTATATAAATCACTACGATGGACTAAATTAGGGTAGCCTTCG
TTCGCGCTTCGGAACTTTTCTACAGGTTTAAGGTTTTATTTTTACATAAG
TGTTTCCGTTTCATATTAGAAACATATGTCATACGCTTTTCTTTTTTTTT
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GTCAATTCAATGTGAAAAAGCTTGTAAATTAAAATTGATGAGCAAGCAAA
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GTCTAACTGACTGACTGATAAAAAGACGTTATTACGATCAAGCGCCACCG
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CGTTCATTTCTGAACAATGATAACGCTCTAGGGTATTAAGCACACACAAT
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TAAATTGTATATATTTATTTTGTCAAAAGTCGCACCTTAAAATATCCACT
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ATTGGCCGAAATATCGTCCCCGGTGGAAAATGATCCTCTAATTATTGTCC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00012125-exon-sc0000137-1575043694:443798..444224 | TCONS_00012125-exon-sc0000137-1575043694:443798..444224 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00012125-exon-sc0000137-1510915933:443798..444224 | TCONS_00012125-exon-sc0000137-1510915933:443798..444224 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012125-exon-sc0000137-1510915933:442311..442498 | TCONS_00012125-exon-sc0000137-1510915933:442311..442498 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00012125-exon-sc0000137-1491911889:436167..439624 | TCONS_00012125-exon-sc0000137-1491911889:436167..439624 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000137 | supercontig | sc0000137:436167..444224 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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