|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00011934 ID=TCONS_00011934|Name=TCONS_00011934|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4546bp GAAGCATCTCTGAAGGTTGGCTTATGCAATAAAAGAGACAAGTAACGGTC ACGGCATCGATTTATTTTGTACACCAGACTCAATGACAATCACTTTGGAA ATGAATATCGATCCAAAAGTATATAGCACCTCAATCGTCAAATTCGAAAA TACTAATTGTACGGCAACAACAAATGGAACACATTTCTTTATTACGTCAC AATTTAACGAATGTAACACACAAATCGGGGAAACAGTAGATGATATCGTG TTCTCAAATCGGGTTATTGTGGACCCGAATAATTTAAAACCGGACGCGAT CATTCAGCGGTTGGAACATACTGAACATATTTATCCAGTCAATTGCTTGT TGAGGAAGGAAAATGTGGTGGTAACAAATACAGGATATAACCTTACAGGT GACGGATGGGAAGAATGGGGAGCGTGGTCAGAATGCACCAAAACTTGCGG AGGAGGAACAACAACTAGGAAGAGAGATTGCCGTGTATCGCGTAGAGATG ATCTAAATTGTCCAGGATTGGAGGTCGAAGTTGCCCATTGTAATAATGTC ACTTGCCCATTGACATGCGACGATATagaatgtgattttttcaatcaTGA AGAATGCGAACCACATTATATCTTTCAAAATGCAACGTGTGAATGTATGA AAGGCTGGTATGAACTGGATGACGGTACATGTGACACAGAAGAGAAAATA GTTGGAGTACAAATCACCTTGGGATCTGATTTTCAAGATGAATTTGTGTC ATTTAAATCGAACATTACATCAGACTTTAAATCGAGAATCGAAACACAAT TTACCCTACAACTGGGGCTTGTACCACCAGAACGTTTTATGGTTACCGAA TTTTCCGCGGGTAGTGTGATTGTGGACGGCCTGGTCATTCTTCCTCGAAA CACaacagaaaacaaaacaacaattcAAGAAAAACTGGTGACTGAGTTAC AAACGAACACGACCGGTTTATTGGAAGAATTTAATGTCACTAAAATTAAT AAAGTTAATGaaaCCTACATTTGCGAGCTTGAATCAGACACATGCAACCG AACGCGATCAAACTGCACTGATACACCAGACCTCTTAACTCATTATCAAT GTGATTGTTTTGAAGGCTACATCAACAAAACCGTGTATATCTGTCAAGAT TATTGTGAATATGGTATCGACACGTGTAACAATATATCAACTGTGTGTAG AGGAACACCAGGGGTCGGTCGCCATTATGAATGTGATTGTGCTTTTGGTT TCGAGCGGTTAGATAATAGTACTGATACATGTACACCAATGCCTCGACCA TGTGATAATTCAACAATGAACACGTGTAATAATTCAACATCAACGTGCAT CAATACCTTTACGGCACCCATCTATTATAACTGTGCTTGTAACGATGGTT ACCTGAAGTTTAACAACACTGTTGATCAATGTTTGGATTATTGCGTCTCA AATAACGATACTTGTGATGATAACACGACAATGTGTCGCGCAACACCCGG CGACGGACGTCATTATGAATGTGACTGCAAATATAAACACGTAAGGCTAG ACAACAACACTGACGCCTGCACACTAGCCGATACTCCATGTGCTTGGGGA AATGATACTTGTGATAAAGATATATCAACATGTATCGATACTTACACGCA TCCAAACTACTTTGACTGTAACTGTTCAGCCGGATATGTCAAACAAAATC ATACGACATGTTTCGACTTTTGCGTTGATAACTCCGACACATGTAACGAC ACATCAACGACGTGTTTGGCGACACCTGGTAAAGGGCGGCATTACGAATG TCCTTGTAAACATGGATTTGAGAGACTCGATAACAACACGGACTCATGTA CACCGATGCCAAGACCTTGTGATACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACA CGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTTCAACTGCTC GTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCAGTTGATGATTGTCAAG ACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGT GAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGG TTTCGAGAGATTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGAC CTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATAAAACTTCATCCAACTGTACA AACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAATTGTACCTGTGAAGCTGGTTA TTTGAAGTTTAACAGCTCCTTGGATCAATGTCATGAGTATTGTCGTATTG AGGCTGATACCTGCAATACAACCTCTACAACTTGTATGTCTACTCCTGGC AAAGGACGACACTACGAATGTCCATGTAAACATGGCTTTGAGAGACTCGA CAACAACATGGACAAATGTACGCCGATGCCAAGACCTTGTGACACAGGGA AAGATACTTGTAACAAGACAAGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCT CCGGTTTACTTCAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAA CTCCGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCA ACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGTAAAGGACGACATTAT GAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGATTAGATAACAACACAGACAG TTGCACACCAATGCCGAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATA TGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTACAAC TGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAGGAGGCTCACTCGATAAGTG TTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACCTGCAACACAACTTCCACCA CTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATACTTCGAATGTCCATGTAAA TTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCC AAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACTACATCAACCT GTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTATAACTGTTCTTGCAGTGAT GGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACAAATGTTTGGATCATTGTCA ATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCTTCGATTTGTGTGGCAACTC CTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCGTGTAGATTTGGTTTTGAGAGA CTCGATAACAACATGGACAAATGTACACCGATGCCCAGACCTTGTGACAC AGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACACTTTGA CAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTC AACAACTCAGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTC CTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGAC ATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACA GACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTG CAACATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATT ACAACTGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAGGAGGCTCACTCGAT AAGTGTTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACCTGCAACACAACTTC CACCACTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATACTTCGAATGTCCAT GTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCA ATGCCAAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACTACATC AACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTATAACTGTTCTTGCA GTGATGGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACAAATGTTTGGATCAT TGTCAATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCTTCGATTTGTGTGGC AACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCGTGTAGATTTGGTTTTG AGAGACTCGATAACAACATGGACAAATGTACACCGATGCCCAGACCTTGT GACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACAC TTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCA AATTCAACAACTCCGTTGATCAGTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCT GATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGG ACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTTGAGAGGTTAGATAACA ACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGAT ACTTGCAATAAAACTTCATCTAACTGTACCAACAGCTTCGAAGCTCCTTT CTACTACAATTGTACCTGTGAAGATGGTTATTTGAAGTTTAACANN Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000134:162539..180347+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00011934 ID=TCONS_00011934|Name=TCONS_00011934|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134:162539..180347+ (Clytia hemisphaerica) GAAGCATCTCTGAAGGTTGGCTTATGCAATAAAAGAGACAAGTAACGGTA
AAATTCGGTCCCATGAATATTTGATACTttgcagaccggtctgtaaaata
cacgtcaACAACACTGGAGTGTTCAAAATTTCAGTTCGGTCACGTgcgtg
gttggtattttacagacattttcctttgatttttggTCCGAATTTACTCA
AGCTGGGTTAAATTTCTCTGCACTGTGAGGGTCTAATTTAAAGGCTAATT
TTGGGCTTCTTATAGGGTCCTTTTTAAATTAACTACCTCCCCCCGTCTCT
GAGGAAAGGGTTGGAAGATCTGGTCCACGCATATTCTCCAACCTTAGTTC
CCCTCCCCAGTTAAGGGCTCAAGGGTTATCTGAGGAACTCAATCTAAAAG
TACCTCAAAAAATAGGATCTTTTCATCATCACTAACTAAAACAAAGTTCG
ACTATCCTGATTATTGATCGAACGTTCATCCGATTTTACAAGGCTGTAGA
TAATAATTCTATGGATAATGTAAATTCTAGTCCAATACTTTAAAGTCTAA
TTACTTTAAAAATCTATtaagggggggtttcatggttggcggaggagcgg
aatcggcccttttttcggacggagtggcggaatttggcgaaaatttagac
ggaattacagAAATTGGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgaaattgggttctctga
cggagacggaaaattagacaattttagtgcagaaaaacggaatttagcaa
aaaaatttgcggaatttcggaattggtaaaagattttcgacaaaaatatt
gcNTGAGGAAAGGGTTGGAAGATCTGGTCCACGCATATTCTCCAACCTTA
GTTCCCCTCCCCAGTTAAGGGCTCAAGGGTTATCTGAGGAACTCAATCTA
AAAGTACCTCAAAAAATAGGATCTTTTCTTCATCACTAACTGATACAAAG
TTCGACTATCTTGATTATTGATCGAACGTTCATCCGATTTTACAAGGCTC
TAGATAATAATTCTATGGATAATGTAAATTCTAGTCCAATACTTTAAAGT
CTAATTACTTTAAAAATCTATTAAATATTGCATAGCATTCGCAATGAGGT
GCTAAACCACCTTAACATGTTTCGACAAATCCAAGATAATTATATCATTG
CAGAGATCTCATTGAGGTCAGATTTGCATACAGTCTGTAGCAAATGGCAA
CAATAAGCAAAATAATGCTCTGCTCTTTAAATATGGAgtccaaaaacaaa
actttgatAACGGATGTATCGTTCACTTTctattcaagattttttatatg
GGTTATATTCCACCTTTTGGCTGTGCCctctcaaaatttgaaacataAGA
CCAAAGTTCCAGTTAAGTTAAGGCCAAAGATTATTTCCGTATCTTTAATA
AGTATTTACTCGTATTCACGCATTCTTACTAGAGTCATTTGTAAGTTTAT
CACGGTTTATCAAGAAAAAGCACTTATTTGAGAAAATACGACAATAagat
aatatttcaaatttggtATCACTTCCCTTACTACAAGCTTGCGAAAATAC
GTCAAACATTGCCGACGTTGTATAAACGTCGCAACAATGTTGTGTGTCAG
CTGCGATCGGTATAATAACTCTTTTTCTTGATGAAGAATTCAAATTACTG
TTAGCTTTTCCCGGAAACAGATTTGAGTCATCTAAATCCGAATTGACAGG
AATTGAAGGAGGAGCAAAGTAAATGAcgaaatcaattttcttgattCACA
ATTGAAATGAAATAGATCAATGGAACCAAACTTTCCGTTTTCCACAAGAC
ATCTCATTTACGAGTACAATTTTGTGAACTGTAATGTCGGTTAACCTTTA
TGATAAATACGGTCATGTTTTAAATCAATCATTGAATGAAACAAACTACA
AGCCCGAGAGGGGATAAAATCACCTAATTTATACTTGAGACACTGCACGG
GGCCCTCTtcactggcggatttaagacaatagtgCAAGTATATTGGAAAC
ATGTGAAGGAGTGCAACGTTCGTTAattgacaatgaaattacaattacaa
atttcTCCCCCTGATAAGTTCGAAATGGTCTAAAACCGCTTTGCTCTTAC
ACCCCTTTCCTACTGGCATTCATTATCGACTATTAGGACCCGTCTAAGAT
ATTGATTTGTGAACTGTTGAATATATTCTTCAACCTTTCCAGGCTAGAAA
AAGACACGGAAAAAGCAAAACCTTCAATCGCATTGTTGACAGCAGATTTG
ATCTTGCGGTTTCTTTGTACTCGGACGGCACATTTATCAAAATCTACagg
taaattttactttcaatccatcGTTTGTATGAAAATCACGCGTACCGCTC
AATTTATATCATTCCGTTCCTATATAGGAGATTCTTTTACTCCACTCAAA
AAAAAGTTATCTACCTTATCGGCCTTTTTTACACCGGCCTTTATTGGCGT
TACTTTTGGGCTCGcggcgtaataagggccagcgtaaaaagggccaagat
tttgtaattttaacctaaaagcggcattaattttttatcattatttctca
atttaaagaattttaggtatataaataagtttgcgtttatcgacccagtg
atatttatattggaagtttatcgtggcttggatcacgagatttacgcttg
gctacgtttcgagagattcttctcccatcatcgggcaatgtGAAAAAAAG
AGACGATTCATTCCTTAAAGGATGAGAATCATATTAACAGCATTTAgcgg
aattttcaacagttatTAACGGCCTtgattggcgtaagcccaaaattagg
ctgtggcgtaataagtgCCAGCGTAAAAGGgaccggcgttaaattagggc
cagcgtaaaaagggccgataagttaatttgataaaaaatatcaGATATAC
CTGAAGccttcgagcatcttcctaATTAAATTTTCACTAAGGGAAGCATC
TGTGGGGGAGGGGGCGTTCTCGTGGCTAATATCATATATTGCCGACTAGC
TGGGtcgatttgattttttttatgtcatagaaaaatttattccatcgatt
aaagagattcaaaagtatacacgcagttgaaattctgcatttcagcattg
aaaaatgttgataaatgCATTGCAAGCttatgaaaaaattaaagaaaaca
attctTTTATGAATTAcaagtaatgttcaagctctataaATTCTGTTAGC
TaggtaattcaaagaaataaaattgtgacggaatattgtccGATTTTTCA
TACGaaatttgaaatacaggcggcaacaaAGCTCGCTTCAGAGACACAAT
TTAAGATTGAAGTCCCAGTCGTTTATGCGAGAACTTATTAGGCTAAAAAA
GGAGGAAAAAGggtgtttttagaaaaaatcgGGCCGAATTGAAAGTGAAT
TAACTTTAGCGAATGACCaaataatttgaatttcttctCTATACTCAAAT
GGACAAAATTATTACATGGCTAGAGGAGAGTATATGTGTTGATCAAACTC
CTTCAAGGGTGTTTAGAATTCGCCAACGGATTAACGATTGCGTGCGAAGT
ATTTAATAAGGCGTGCTGCGCTTATTGAAATAAATCtattttgctttctt
tttatgacgattttgaatttttttgcgtttAGAAAAGAGATATTCAGTTG
AGTCAATTATAGAAAGTATCAAgagtatttttttgtaagaattacAAGTT
GCTCAACAAATCCGAAGAGTTTGACCCAAAGTCAAAATACCCCTTCAAAG
GACACCAACACAATGTCATCTCTTTGAGAATCAGAACACACCGTACCTAt
acatttttgatcaaaatcgATTATTTTATCTGCAGCAAAACATTTTTAGC
GCATTTCCGGGAACTATCCGCTGCTACCGGCCATACCAGCCAAGAATAAA
TGCGAATATGCGTGaaaaatacatcttttcgaccgtagtcgggCAGACAG
CTGCGTGTCATTTGATTATTTAATTGTCCCCTTAAAATAGATCCAAtcat
ttttgacacattttattttctatgaattttgggcaaaaagactgggacgg
tttcagggtggtaaaacggacaaaaaaatgcccgcgcggcgattggcggc
tacggttgaaaaggtgtatacaaTATGGGggagaaaatatttcttttagc
atTACTACTTAAATCATCATAAAAATgacgagcaaaaaaaaaagcaacaa
aagaaaaatcgtcaataatttgttttccttttgtAATAGAAAAGGACACA
TTAATACTGTTTAAGCTTCTATTGAACCAATGCCCAGAGNAAAAGAAAAA
TCATCAataatttgttttccttttgtAATAGAAAAGGACACATTAATACT
GTTTAAGCTTCTATTGAACCAATGCCCAGAGCAATTTCACTtgcttttca
aatcaaatacaCAATGtcattttataagaatgattttataagaacaatag
tgtcaattttgatcaaaacctaagaacaaatcaAGAATAGTCCGAGGCCC
GGATTCGGCAAATGACTCAGAAAATACCGTTTTTAAGTCATTTTCAAGGC
ccttgaatgaaaaaaatagaaGCATATGTATTATTAATATCTTTGGAAGA
ATTCAGAATGAAAATAGGAATAGGTtaggttcttataaaatgtcAAATTG
TGTAGGCCCATTTTATATGCTAggtaaaagaattttttgtcAAGCACGCA
GCAGGCTTAGAGAATGGTGCATGAGTAATAACTTCGATTCTCTGACTCAA
TTGCTTTGTTACAAAAAGAACAGTAACAGTAGCGAaccaaatagaataaa
aattgatatagtttttttgttgaatttcgttGAGACACtgtttttttatc
tattttggtTGACTTTCGATCACCTGGTAAAAAGTTGTCCCTGGTATCGT
CGGGACAGATCTTTTGGTGttggtaatttttttctggataaTAATATGTG
GATAAGTTAATGTTATACCGTTGAATTTTAACAATCTAATATTTGTTATT
TTGTCATTCATTTACCGTCGAATGCTGAAATGAAATTGGCCCTGTTTATT
TGTTTTCTTGTGGCCAccataatttcaaaatgtaagtattttttCGTTGG
TTTTTCtaggagatttaaaaaaaaaatgtgaatttaCCGCAATAATCCAT
AAAAGACaagatttgattttcaaacGTAAACGCAAgtaaaataaatcaga
aaaatgAATCTTGAATAAGTTAAAAATGAAGGAACAGGGATGTGCGTTTT
ATAATAAAAGCTATAAAATTTCGGCTAAATTTCAGGGGTTCTTGTTTTTA
CAAAGAATTTAGGTTGTTTTAACCCCCTGTTCCAGTGACAATTTCAATTT
GCAGGGAAGTACCAGGAAACTAAataaatttcatccaaaaaagGCATTTT
GGCCTTATGTTCATCAAGTTGTCTTACATATCTAAAATTGTATTTCATGG
CTAGACTACTGGCCTTACACGTTACTCGCCaactatttttttcttaatat
cAACATTAATTCACAGCTCGGAAAGAGTAAAATGTTGATAGCTTCCTCTG
TTTAATaagttttttcattaaatttgtaATAAAATTCATCTAAAATCCTA
AAGTCAATGCAATTTTTATATTcttagaaattaaatttttcatagaaTCA
AGACTTCGTAAATAAAGTTTCAGCCtgataaaaaattttgttaGTTTTGG
CACTTTAAAGTATTATTGCATAGAAAAACCTCAAAATAAGATCATTACAA
ACTTAGCTTGAAAAATCGTCTTAAATTCACCAAAAATAAGATTAAGATGA
CTTAAGGGTATCAGAACAAAAAACTCAACTAATCTTCTGTCATTTTGATG
GATCTATCCAAAAAGGGGTAATCAAAACTTGCATTGcaaatcaaaacttt
tattatgTATCTCTCTGGAAGGCTTTGCATGTTGAAAAcgctattttttt
ataagaacaatgttgAGTCCAGAATGACTAAATTTCAGGCAAATTGAtgg
tcaaagtaataaaaataggGTACATAGCCTAAAAGTCTAAAAAGCCTCAG
TATGCTCTAAATGTACGAACAggataaaaacaatttgaagCTTATAGTGT
CAGGACAGTATTAAAAGAACAAAAGTAGTTGAGTCTCCCAAAAAATTGTA
CTCGTTTTAATAAAAAGAGAGTTTTTTAAGAGTGCTTGTTAAACTTAGAG
AGATTATTTCCCCAAATTTAAGCCAAATTTTTAGTCCAAATCTCAAGAAT
TTATATGACCCTTCGAGGGAAGActcgatttttgattttcttaagTTTGG
GGGTACAGAGACTTACAGAGACTCTTTTCAATGGTTTCCGTgcccctttg
agggactttcgagtgtgtgaaaaagggaccatTTTGGCTcatcgcacata
cccggcacccattttgcctaagtatctCCCGgtgatattcttaaaaattg
aaatgaaaaaggaaggaaaaaaagtgaacataggatctgaaaattttatt
ttcacttatttGAAATcgtagatttttctttttttccagatAAAATATTA
CATACCCCAAATAAGAATactggataaaaatttctagaaTCAATATCGTC
CAAATGGACTGAGGGTCccaattgaaactttcttcagcAAATGTACCGTA
AAAAATGAATCCTAAATACAAATTTGCTCAACAGtttctactttttcaaa
ttttccacaAAAGCGCACCCGGTGAATACTGTAACTGATTTTAATTGTTA
TCGTATTTTGTGAGGAAAAATACATATAGAATATTCCAGATTCTATAACA
CTTAGCTTAGCCTGGAGCATAGAAGGCAAAGGTACATTACaatcattgac
ttccaagcccgaagggctagttagactcgagactcctggatgagaaataa
agcaacttatttcccatccagaacgcccgcgcgtggtctttacacaaacg
ccggattgaaagtaaaatctatcgatATATTTCAACGAATACAGTCATCA
AAAACAAAGGACCCGCTAGATACAATCTTTTGTCGTGATTCCGGCGCGTT
CCAGGCGccttctggatgggaaataaatagcttcactttttcttgcctgg
aaaaggttagagattctactctactcttgtctcccgaatagacgggggga
gagtccgaataagcaggggggtaggaaattttctaaattctagtAAGcag
gggggatggaataagagggggggggggggtaatttgaagacatatttttt
taactgatatcaatttcaacaaaaaaaaaagaaactttaacaaatgaaca
cgtaaaataagaaccaatactaacaaaaaggaaaatttaaacaagtttaa
ggtctatctacacggtaataaaatatcaaattattcaaatttaattagca
ggggggtcttaataagagcggggggctggattatttttctcttatcaatt
agcggggggacgtctattcgggagacaagagtagcccttcaggctttaaa
ctcaatgatcaCAATGTGTACACTTTATTTGTAAGAACTTGTAAATTTTT
GATGATGCTCTTCTTtatttggcactttgagcctaaaaTAATTCTTATCT
TGTTCTCATTTTCAGGGTAAAACTTAAATGTTTTAAGATGTAAGTAGCCT
TTTTCCAGACTAACTCTGAACcattattttcttaaaattccgCTATTCCG
GGCTCAGCATTGTTTTTAGGTTGTTCTCGTTTTTAGTCACTTTGAGcctc
ttgttcttataaaaataatgtaGCTAGTAGAATAAAAGTATTGTGCCCTA
AGCACAGAACTGATACGAATTCACTTATACAACATGcatttcaatagacc
ttttcataaattacgtcacgagcatcacttgcctcgtgttccaacaatta
ccatggtgattatatcccttgagacattaaatgatctttttatgaataga
aagcagttttaataaaatccgttgggagttaatcaccatggcaataattt
caaaaaagggCAAGtaatgttcgtgacgtaatttatgaaaaggtctattt
attaATAATCGACCCATTTATCGGGTAACAAGATAACccgttttttcaat
tttacggATGAAAAGAGAAAATCTCAACCTTGCGTGTTGTCTTATCATCA
TAATATAAGGGATGTAaaatgtcatcaaaatttcagTCTTTTAAATAAGT
TTCCTAACAATAAATGGCTAACATCTGCTTTCATGGGGGGGGgatgaaaa
atagaaattaaagaaaatctAATTCAATACTTCAAATGAGCTAGTATTCC
AAGAGCAAGCTATACTAAAGTCTatttctggctgaactttgctttttaat
accttatcggggaaaatttcgtcgggaaaaacttggccgaaatttcgtca
cttttccccgacgaagttttccttGATAAGGTAAttgattttcgaatttt
tttaaaagccgTAAATAATCCGCTCAAAGTTatctttcaaacaaaatatt
acttttttaatcatatttACGAACTTTCAAAAGCAATGTATCAAAATTTG
TGGACTGCCAAATTAAATGTCATGTTTGGAACAGATTTTAAATGTAAACG
TTCACTATGCACGgacaatattttctttgaatgcattacacgcttctttt
ttatataagaatggcgcttttcatttcatcatgggttttttttttttttt
ttttttttgatattcttacggtattcttaggttaagatcgaaatttgcCC
TAGATTTAACATGTAATACAAACCTGAAGAATATTGAGCGTTACTGGGAT
GTTATTGACAATTCACAGGtgaaaatgccttaaaatggcattcttaggtt
cagttgctaaattccatgatggtgatattcttaccatattcttatttttg
gccattttcatcatgggtattcttatttttaaaaagcgtGTACATTTAAT
ACCTCTCTTTACTTTAAAAAGCCATTTATCAAAATGATAAGAAGTTTAGG
ATTCAAAataacctctataactcgaactcgATAACTGAAACATCTCGAAC
AAATTAGTGTTCCCCATTCGTGTTTAAGGTTATGGGGACTCCACTGAAAA
GgtcctttttttattgaaagggaTTTCACATGGGACCCTCTTCGTAATGA
GAATTCAGGGTTTTAAACTGCTTGCGTCCTAAATCGGATTCGGGCTCCTT
ATACAAACTTTTCTTATAAGATAGTTGTTTTCCCATACCACCTTCCACCA
TGGATATTCTTATGATATAAATATTCCTGAAATCTTCTAAACGGTGTTCC
ATACCCAGCTTAAATTTACAATGTAATACAGTCGACTTTCggtaattcga
actcgaacaggGAATcctatttgttcgaattacagagagattcgaattat
agaaagtatatcaAGAAAGTTTCNACGAACGGGGAATcctatttgttcga
attacagagagattcgaattatagaaagtatatcaAGAAAGTTTCTCGTT
GACGGGGACTGAAAgcaggttcgaattatagaaatatttaAATAATGAAG
TTCGAATAGATGAAAGTTTTCTGTACTTTACTTCAAGTAAAATATAGCAT
TTTCAGGTTGATTCTATGATGTTGATgttgatattcttagcatattctta
atttttgaccaattttattATGAACATTCTTAtagagtatattcttataa
caaGGCGTGAAGTAGCTGAGGTTTTTTAGAGatctgtgattcagactaaa
AGGGTTTCTTCTGTTACGCAAGCAAATTGCGCCGTCAAAAATGGTGCGTT
TCCCCGGTCTGTTCAATAAACACTTGACTCGTATAATATTTTCTTGTTCT
CGTGTAAAAGTATcatgaaaaaaatgtataatatgACTCATTCGGTATAT
TACACCATAATGTTATGATCTGACAAAAAAACGTAATAGCTTAATATCTA
TTATCAATTGTAACAATGTTATACAAAATAAGTTGTTTTAATTAGACCCG
CTGAgtcaaataaaatcaaaatgagaaTTCCATAgagtattaaaaaaaat
atactgTAAAAATGGTGCAAAACTTGGTTTTTATGTAACCCACAAGCTTT
GTAAAACTTGAGAGAAATAGAACTCCACTCCCAGGtgtcttaaaggtttt
attcttacataagtgttcccgtttcatatcagacacatatttcatatcag
gacagagTCTTCTTATTGTttatgttatgctgatataggcaagaaaatgt
tttcttttcctattttgatcaatcttgctccacatctgtgtcaatccaat
gtgaaaaggcctgtaaatcaaaattgatgagtaagcaaacgataaaACCC
TAACCGACGAGATAGCTTATCGGATTATCCAGGCCCAGCGGAAGCAGGGA
GATTGGGAAGACTTCAGCTTCCctacttttgagcaaatgagatttttttt
tctcgaattcctagcaaattttatctcattttgagccttcagcctcccca
cttttacggttttTCCACCGGTTCTGTTATCGCAAAAGTTAAAAATCTAA
ACTGATTCTATCTACCCGTTTTCAGGTCACGGCATCGATTTATTTTGTAC
ACCAGACTCAATGACAATCACTTTGGAAATGAATATCGATCCAAAAGTAT
ATAGCACCTCAATCGTCAAATTCGAAAATACTAATTGTACGGCAACAACA
AATGGAACACATTTCTTTATTACGTCACAATTTAACGAATGTAACACACA
AATCGGGGAAACAGTAGATGATATCGTGTTCTCAAATCGGGTTATTGTGG
ACCCGAATAATTTAAAACCGGACGCGATCATTCAGCGGTTGGAACATACT
GAACATATTTATCCAGTCAATTGCTTGTTGAGGAAGGAAAATGTGGTGGT
AACAAATACAGGATATAACCTTACAGGTAAGACAGTCTTGGATATCCCGC
GATTACAGTTCAAAGACAAAAATGTAAACTGCATAACACCTGGGTGCGTG
GTAAATGTTATCTGTAAAacaatactctcgggtacctagtTTCCAAGGTA
CTTTAAAGACATTCTTATCCCAACTACTGCATCAAATTTTTTAAGTAATA
ATAAATAAGCCGTAGTAATTTGTGCTTAGTTTCGGAGGTTTTTATTCATC
CaaatttttaggctgaaaagttcttaaaatatttttaatacgACAGTTAT
ATTCTTTGTAACCTTAAGCACTTTTTACACACCAGTCGTTATAAGCTCCG
TTATTTTTGGCTTTGACGGATTAAAAACCGACGTAATACAACGAGTGTAT
AATATCATTTTTGAATCTGAggctaaaattgttcttaatttgttcttatt
agGTGACGGATGGGAAGAATGGGGAGCGTGGTCAGAATGCACCAAAACTT
GCGGAGGAGGAACAACAACTAGGAAGAGAGATTGCCGTGTATCGCGTAGA
GATGATCTAAATTGTCCAGGATTGGAGGTCGAAGTTGCCCATTGTAATAA
TGTCACTTGCCCATTGAGTAAGTGTCCACTTTATTCAGAATTTTTTGACT
ATCTCTTTCCCGCTTAGATCTTCACAGGGCAAAGAAATATCTTTGAATAA
GAATGATTCGAATTACGGAGATTTTTTATATGGATTTCAAGCTGAGGGGA
CCAACGCTTtagatcgaattaaagagaggtTTGAATTCTAGAAGTTCAAA
TTAAAGAAGAGGACTGTACAGCTTTGAGGCTGTTACAGGAACAATCGAAT
CACTGATCCAATACCAAATACTACAGTTTTTTTAATTACTGTTCATAATG
CCTGGAACCTTACGAAATTGTTCGTAAAGGGATAAGCtaataaaaagtaa
aacttaGCTCAAAGATTGCTCCCAGTCCCATGGTCCTTAGTAAACACATT
CTGAGGAACATATGACTATCTAAAATCACAAATTTCNCACAccgttggaa
aggaaatttcagaCCGAACAACTTTTCTGCTTACGAGAAACGATgaaaat
gtactcaatgtgactcaaaatgaaaaatgatgacgtcatcattttcactg
ttttaattttttctctaaCCATATACACGAGACGTGTATCATATGAAACA
GGAATCTGAAATGAAATCTCTAACTTTTTTTGACTCGccaatttcgccaa
aattagttctcgtcaaaataagttcccttaataTTAATGAAATTAATTCC
ATTTTCTCCCATACAGCATGCGACGATATagaatgtgattttttcaatca
TGAAGAATGCGAACCACATTATATCTTTCAAAATGCAACGTGTGAATGTA
TGAAAGGCTGGTATGAACTGGATGACGGTACATGTGACACAGAAGAGAAA
ATAGTTGGAGTACAAATCACCTTGGGATCTGATTTTCAAGATGAATTTGT
GTCATTTAAATCGAACATTACATCAGACTTTAAATCGAGGTAAATAGCAT
ATAattaaaatctgttctgttCGTGGCCCTTCGTGGAAATAATTCCTCAG
CTGTCTAAAAGCTGTTGAATTTTTCGAAGCATGCCACGTAAAATATTTgg
tattgttattattattattattaaaatctTAGGATGCCATTTTGGGGACC
ACCGAAAACCGACCcatagagagactgatttttgctgaaaaggtgaccct
tagagagactttttgaaatgttttttttcgatttttgaaaaaagtcatac
ccttagagactttattacaattttttctctggaaatcaaaaaatttccta
aaaatcctgaattttcagacccttagagagactaatttaaaactttctga
tttttccaacccttagagagactttgaaaggtcaACGAGGCCCACGATTA
TCAAAATTGCTTCGACAATTTGAAAGAAAGTATCAAATTTAGACTAGATG
CTCTTTAGACCTTAGAATTGATATTAGAATATGTGAcctattttttgatt
tgaaagcgTAAAAAGGGtctattttgaaagtaaaaatttcGAGCCCATTT
TAGGTATATAGGAGACTTTAAGGCGAGTATAACCGATTTCGGAATTGAGT
GGGAGTTAAACCTAATGTCGAAAATTTAAAACCTCATCTTACTCATAACA
TTTCCTTTTGTGTTACCTTTAAAACAACAACTTTTCATTCTCACTTTTAT
AGAATCGAAACACAATTTACCCTACAACTGGGGCTTGTACCACCAGAACG
TTTTATGGTTACCGAATTTTCCGCGGGTAGTGTGATTGTGGACGGCCTGG
TCATTCTTCCTCGAAACACaacagaaaacaaaacaacaattcAAGAAAAA
CTGGTGACTGAGTTACAAACGAACACGACCGGTTTATTGGAAGAATTTAA
TGTCACTAAAATTAATAAAGTTAATGGTGAGTTTCTCGTTAGTTtcatga
ggcccccccagcggtttgcgtgatggcgtaaccgggacttttttcttgcg
tgatggcgtgattagagattttttttggcgtgatggcgtgatcaagattt
ttggCGTTATGCGtaatagggcaaaaatttgatgcgtgatgcgtgatttg
ggctattaaatcgctattttttgcgtgatgacaaattttagcgattttcg
taatgcgtgatggagaaaatttttttgcgtgatggcgtgattaggggtgc
cgctgggggccTCTTTAATAGATATCATATATACAACACTACAATCAAGG
CCATAATATTTGACAAATCTTATAgtcacaaacaatttggaagcggTCTA
AGTTAGGTTGGATTGAAGTATTATGACAcataaagcctaaaaatgtcctt
aaattgttcttaatgttctggccatcgaagccttattttcttacatagtt
tattcttataaaaaatgcataTTTCTTCATCAGAATCTAATCTGTAGTCC
ctcttattttttctttggaaactcaaaatttttgagCGAACAACCAAACC
ATGTCCAAATGATGCACTGATACGTCCGTCAGAATTTAAAGATTCTggtt
ttaaataagagtgatgcTATCGTTTGCTtcctcatcaattttaatttata
agctTTTTAAGGAGCAATATTGgctagaaagaggaaaaaaagattatttt
gtttatgcagcacaatataacaatagggagacaccgtcctgatatgaaat
atgtgtctgatatgaaacgggaacaattaccatgcaaaaaaaaaacaact
ttaatctccatttttgattttagaaaCCTACATTTGCGAGCTTGAATCAG
ACACATGCAACCGAACGCGATCAAACTGCACTGATACACCAGACCTCTTA
ACTCATTATCAATGTGATTGTTTTGAAGGCTACATCAACAAAACCGTGTA
TATCTGTCAAGATTATTGTGAATATGGTATCGACACGTGTAACAATATAT
CAACTGTGTGTAGAGGAACACCAGGGGTCGGTCGCCATTATGAATGTGAT
TGTGCTTTTGGTTTCGAGCGGTTAGATAATAGTACTGATACATGTACACC
AATGCCTCGACCATGTGATAATTCAACAATGAACACGTGTAATAATTCAA
CATCAACGTGCATCAATACCTTTACGGCACCCATCTATTATAACTGTGCT
TGTAACGATGGTTACCTGAAGTTTAACAACACTGTTGATCAATGTTTGGA
TTATTGCGTCTCAAATAACGATACTTGTGATGATAACACGACAATGTGTC
GCGCAACACCCGGCGACGGACGTCATTATGAATGTGACTGCAAATATAAA
CACGTAAGGCTAGACAACAACACTGACGCCTGCACACTAGCCGATACTCC
ATGTGCTTGGGGAAATGATACTTGTGATAAAGATATATCAACATGTATCG
ATACTTACACGCATCCAAACTACTTTGACTGTAACTGTTCAGCCGGATAT
GTCAAACAAAATCATACGACATGTTTCGACTTTTGCGTTGATAACTCCGA
CACATGTAACGACACATCAACGACGTGTTTGGCGACACCTGGTAAAGGGC
GGCATTACGAATGTCCTTGTAAACATGGATTTGAGAGACTCGATAACAAC
ACGGACTCATGTACACCGATGCCAAGACCTTGTGATACAGGGAAAGATAC
TTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTT
ACTTCAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCAGTT
GATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAAC
TTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTC
CATGTAAATTTGGTTTCGAGAGATTAGATAACAACACAGACAGTTGCACA
CCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATAAAACTTC
ATCCAACTGTACAAACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAATTGTACCT
GTGAAGCTGGTTATTTGAAGTTTAACAGCTCCTTGGATCAATGTCATGAG
TATTGTCGTATTGAGGCTGATACCTGCAATACAACCTCTACAACTTGTAT
GTCTACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCATGTAAACATGGCT
TTGAGAGACTCGACAACAACATGGACAAATGTACGCCGATGCCAAGACCT
TGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACAAGATCCAATTGCACAAA
CACTTTGACAGCTCCGGTTTACTTCAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATC
TCAAATTCAACAACTCCGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAA
GCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGTAA
AGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGATTAGATA
ACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCGAGACCTTGCGACACAGGGAAA
GATACTTGCAATATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCC
TGACTATTACAACTGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAGGAGGCT
CACTCGATAAGTGTTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACCTGCAAC
ACAACTTCCACCACTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATACTTCGA
ATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTT
GCACACCAATGCCAAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGCAACATG
ACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTATAACTG
TTCTTGCAGTGATGGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACAAATGTT
TGGATCATTGTCAATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCTTCGATT
TGTGTGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCGTGTAGATT
TGGTTTTGAGAGACTCGATAACAACATGGACAAATGTACACCGATGCCCA
GACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGC
ACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGG
TTATCTCAAATTCAACAACTCAGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATA
TTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCT
GGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTT
AGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAG
GGAAAGATACTTGCAACATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACA
AACCCTGACTATTACAACTGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAGG
AGGCTCACTCGATAAGTGTTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACCT
GCAACACAACTTCCACCACTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATAC
TTCGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGA
CAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGCA
ACATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTAT
AACTGTTCTTGCAGTGATGGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACAA
ATGTTTGGATCATTGTCAATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCTT
CGATTTGTGTGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCGTGT
AGATTTGGTTTTGAGAGACTCGATAACAACATGGACAAATGTACACCGAT
GCCCAGACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCCA
ATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGT
GATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCCGTTGATCAGTGTCAAGACTACTG
TCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAA
CTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTTGAG
AGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGA
CACAGGGAAAGATACTTGCAATAAAACTTCATCTAACTGTACCAACAGCT
TCGAAGCTCCTTTCTACTACAATTGTACCTGTGAAGATGGTTATTTGAAG
TTTAACANN
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:162539..162585 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:162539..162585 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:162539..162585 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:162539..162585 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:162539..162585 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:162539..162585 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:173164..173514 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:173164..173514 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:173164..173514 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:173941..174105 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:173941..174105 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:173941..174105 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:174805..175027 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:174805..175027 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:174805..175027 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:175741..175964 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:175741..175964 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:175741..175964 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:176812..180347 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1491911889:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:176812..180347 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1510915933:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:176812..180347 | TCONS_00011934-exon-sc0000134-1575043694:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000134 | supercontig | sc0000134:162539..180347 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|