TCONS_00010545 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00010545
Unique Name	TCONS_00010545
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5460

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000107:138740..162284-

transcript sequence

>TCONS_00010545 ID=TCONS_00010545|Name=TCONS_00010545|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5460bp
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CTCCTTTACAGCCTAGTTTGTTTTACAATTTGCAGCGGTCGAAATTAAGT
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GATTCCCAGCTAATTCATTCATCTGGCGTGACTTAGTTCCTGAGTTCAAA
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CCAACCTTCAAAAAGATTATGCCTTACCTGTTAACATACCCTATCTACAA
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ACATAATTTTAGATGGACGCATGAGTGGCGTAAGTAgggtttttgtttga
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TTTTCTTGTTTTAATATAGGCTTAGGATCCCATAAATTATCTATTCAAAA
ACCGATGGTCGCATAATTTGAACAACATCGTAGACTGTCCTGACCCGTTC
TTCCTTATTAAGATTTCATTATAAATATAGATCATTATAGATCGATCAGA
GCTCTCCCTATACTTTCGTCGAATTCTTCAATAgattttttttacgtttt
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ttacTCGCTTTGAAATTCTCTGTCTAACACCCCCCTGACTAAAAGTAAAA
TGCTCCCCAG

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transcript from alignment at sc0000107:138740..162284-

Legend: exon

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>TCONS_00010545 ID=TCONS_00010545|Name=TCONS_00010545|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23545bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107:138740..162284- (Clytia hemisphaerica)
TAGATGTTTAATAACGAAAATTAACAAAATTAGATGAGAAAACAATGACA
TGATGAACAATAACAATAAACTTGCAAACAAAAATTCTAAAGACAGGACA
AGGTCCCCAACAACTCCAAAAGCAACAGGTATTTTCTCTTTTTATTAAAT
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ATAAAGGCAATTCAAAACCAGTTACTAAAAAATATTCTAGCCAAATAACA
TTTCAAAAGTGTTCTTGCTGTTTCTTCACCACCAGGGTTGAAATTGTAAT
TATCTTTCAAAAAAGGGCACAGGAAATATAAATTACAGGTTCTAAATTAT
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TCAAAAAGGAATGTAAACTGCCATAATTTGTCCAAAGATCCTGAAAAATA
CTGGAACGAGACTTGTTGTTAACAAGGCTTTCTTTTTTGTTGAAAAGATA
TCTAAGATAATTGTGACTTTTTTGAGACAGATTTCTTTTTGCTATTGTTT
CCCTGGAGCCCCATCAGAAATGGGCTTTTCCAGAAAAAAACCGTGCACCC
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ATCATTCCCCTTGGAATTCCGCTTATTTTTGACGGATTTTCGTCTACCCT
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AACATTATACTAGCTATGACATAAGGGGTAAGATGTTGAAAATGGTTGAA
ATATTGTCCAAAAAATGAATTTTTATTTTTGGTTACACTTCTCATGGATT
TTTAAGTTAAACTTATTTCTTATTTGCAATATATATTGGACAGGAAAATT
TGCAAATTTTATTTATTATGACTTCAGTGAGTAACTAGTGACCTCCCTTT
ACCCTGGCCTCCACTTGTTACATACGGTTTATAGTCGTTTTGAATAAAGC
AACGTACAATTCATTTATTATTTTTCATTTCAGCCATAACAACCTATTGC
GCAGTTAGTCTTGATAGTAAGATCTTTTAGCTTTGTTTATTCAAGCTCTT
TGTTTATTTTGTATTATTATAGTGTCTAGTGAAGTTATTTTTCAGTTTTA
ACAGCTTATTCAGATCACCTAAAATGGAGCCATTTTCATTTTAAAGCCCT
GAGTTCTAATCTGAATGAAGGGTTTTATCACAACATACAACCTGACCTTT
AAAAAATAATGAGTGACATTAAAGTTGGCACATGCTTCAGGTTAATTGAT
TGACCCTCCAGTCAGCCCTAATAATTTAAAAAGAAATCTAATCAGTCTAT
ACTTTTGTTTTCTCTTTTAGAAAGAGGGAAAAAAGGGAAGTCTGTGGAAA
ATACTGCTGGTGATGTATCAGATGAATTAGAAAATATTGAAAGTTGTGTG
AACGTCCGCGGTGAAAATGATGAATTGAAAATTAATCAAACTTATCTACA
AAGTGTATAATAACTTTTTTGTCTAAATCTACTAAGATTCTTATATTTTA
TTTCCCCCCTAGTAGGCAATGTGCTCAACCTCCTATTTTCTAAGAAGCCG
CCTCGGACCTACGTCAGGGTGAAATTCAGTTATTTTTTTCTCACGTTTTG
CCAAAAAGCTATAGAAGATTCTTCTCGAGCTAAAAACCAATTAAAACATG
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AGTCTGAACTTTTTAACTGAAAATATAATACCCATTTTAGAACCATTCAC
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GTGAATTTATCCCATCAACCACCACCTATGTTCAGCAGATGCTTTGGTCG
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TGGGCAAATCCCCGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTCAAAATTTTAATTTT
TGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGGC
AGGCTGCATATAGTATCATATGTTCTTGGGGGCTGAAATTTTGCGCACTT
GATCCTTGGGCAAATCCCAGGGAGTGGTTTTTTCATTTTTTCAAAATTCT
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TGGGGCAGGCTGCATATAGTATCATATGTTCTTGGGGGCTGAAATTTTGC
GCACTTGATCCTTGGGCAAATCCCAGGGAGTGGTTTTTTCATTTTTTCAA
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TTTTGCGCACTTGATCCTTGGGCAAATCCCAGGGAGTGGTTTTTTCATTT
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AGGCTAAAACTTTGGGGCAGGCTGCATATAGTATCATATGTTCTTGGGGG
CTGAAATTTTGCGCACTTGATCCTTGGGCAAATCCCAGGGAGTGGTTTTT
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GTTTTTTCATTTTTTCAAAATTCTAATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGATT
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TGTTCTTGGGGGCTGAAATTTTGCGCACTTGATCCTTGGGCAAATCCCAG
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GATTTTTGTGTGAATTTGATTTACCAAATCAGTGGATCTCACCCGATTTC
ACAAGTCATTGGTGGTTTCACCCAATATTGTGAGATTTCTTTTTGCCAAA
ATTAGAATAAGGTATCGACTATGCATTTCGTACAGGAGGGCTCAATTCCT
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TGATTTTTGTCTGTTCAGATATGCATAAGGTTAAAATTTCTCCTTCTTCC
TATTTATAAACATCATTACAAAATATTCCACCATTATAGATCGAGTTGGA
AGTGAATTTTGGAAACAAGCTGAAGAAATTGGTGGCAATCAAGGAGTTAG
GTAATGTTTTTTCTAATGATGATAATATTTAAGAATCTTTGTTCAATTTC
TATGCTCCTTGGGCAGTGATACATGGGTTCTGTTTGTTGTTTTGTTGAAA
ATAAAAAACGTTAAAAAACTCTGTTCATTCACCATTTAAAATTGATTGCT
ATATCTTCCTTTCAGTGTAACACTCAGTGAAACAGAAAAGGGCAATGTTC
CCTCTATCGAACATGTCGGTCATCCAGCCAACATCAAATCAGAGATGGGA
AATACATGGTCAGCAACCCATCGAATGAAAAATGTACATTTCAACTGGTG
GAATTCATCATATTTAAATGAGAGAAGAGAATATCTGAAAGATGTGATGG
ATGAATTAGATCCACATAAACCTGTAAGAGAACCTAGCTTCGAAATCCAT
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ATTTCTTCCTGCTAATTTTTACAAAGGTTTATACCCGCGTATCTTAAACA
GTGAAAAAAGCAACGTTTTGGTTGGACAAGATTATAAAAGTTACATTTAT
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TTAGGAAAATTTTTTCTTTGGTCAAAGGAATTGTTACCGCTCCTGATTTT
GTTTATCTGTAACATGTGTATTTGTGTCTCGTTACAGTATATGGACGGCT
TGGAAGTGATTGGTCATGGTTTACAACTACCACAGAATGTTCGAATGAAC
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CGTCATTGATGATGAAGAAGTTGTGGATGGGGACTTTCAAGATGATTGTG
ATGTGAGAAATATTGAAGGGGAACGACGGTAAATTGAAGGCTTTTTAATT
TCACTATTCACTGAATACACCTTTCAACCCTTCAAAAAGCGTGAGTAGAC
CTGGGTTTGAGTTTACCAGTAAGGATTGCAATGATGTCTGAATTCTATGT
TTATGAGTAAATCAACGCAATGACTTCAGACATTTGACATAAATCCTGGA
GGCTGGGTTTCCCAGGAAAGATGTCAATATTTTTCGTCATCTCTTTCCTA
AATTTTGTTAAATGGGGCTATGTGAATATGGTTTTTGTAACAATGAGCGA
ACGTTGGAACTTTTGATCTAACTGGACTTTGATAATAATACAATAAAGCT
ATAGCATTAATTTGTAATACATTGATTTTCATTATAGTGATCCACTTTCC
TGTTACGATGACGTCATTCCAGAGCCTATCTTTGGTCCATCACTTCTCAT
TAATGGACAACCAGCTTCGTGGGAAGGCTCTCCTGTGGAAGATTGTAACA
GGTTGGTATTTATTTAAAAAGTAGTAAAACTGCCAAAAGGGACATAGAAA
TAGGTATAGGAGAAATAGGTATAGGCCAGACCCGATCAATCGAACTTGTC
GAACCAATCGAACAATCAAACTAATCGAACTCCATCGAACGATTAAAGTT
CGATTAAAAAAATTAATCGAACTCTAAGATTTTTTAAAAGATTGTGAGTG
TTCGATTAAATTCGATCAATCAATGGGTTTCAGTTCGATCAGTTCGATAA
ACCAATTTTGTTCGACAAGTTTGTGCTGCTCCGCCACCGTATATTATCTT
CTTTTCAAAGCCAAATTCGGAATGTAAGTCGGGAAATTACTTCCGATAAC
GGATTACACACTTTCCCTGTATCCTTTTAGCGCCAGAGGCGGTTTGTTGG
GGTGTAGTATTCCGCCACTCGGCCGCGCGCGAAATCGCAACAGATGGGCT
ACGGACTTTATTCCGGATAGACAAATATCCAGGTACAATAAACGTCAAGC
TGTTAAGTCCGGGAACTGTCGAAATGGCAATCGCGTGCCAGGACAAAGTT
TTTGCAAACGAGGGTAGATAAGAGGATTTAATATCATGGAACTAATCGAA
CTTTTTACTGACCGAACTAATCGAACTGCTATTGCTTCAAAAATTGCGAG
TGTTCGATTAGGTTCGATTAATTTTTTTAATCGAACCTTAATCGTTTGAT
GGAGTTCGATTAGTTCGACTGTTCGATTGGCTCGACAAGTTCGATTGATC
GGGTCTGGTATAGGAGAGCATGTTTTTATGATAATTTACAGTGCTGCTAG
CTGTGGTTTTCGGATGATGGGTATTTATCTCTTTAAAACCTATTTTTGGG
AAATTTTCCTATTGTACTTATCTTGGAAATGAATTATGCCATATATTTTT
AGCACCGCCTCAAAGCTCTTCCCAATCTTGTCTGACTTTTTAAATTATGT
CCGTAATAGAAAGTATTCGCAGCCCAAATTATTGTGCTGTGAAAAAATAC
CAGTTAAGACAGCCGACTTTTGTGCTCCCCTTCCTTTACTTGTTAGATTA
GGCTGAATGCTGGCAAACAACATTTTCGCATGGAATGTATTAAAAAAGTC
GTTTTCAACGACTTGACAATGTTATAAATTAAAAGTCATTGTATTGATTT
AGCAAGATGTTGTTGTAATGATTTTAGACTTTTCTTCGCAATTAGAAAAG
AAGAGTAGAAAGTCTGGTGTCTACATTATCGCGGTTGAAAAAGAGTTCCA
GAAGATTGCTTTCCGCGGGAATTAATTTTCGCGTTTTTGCTGTATATGGG
ATACATTTCTTTGCTTTGATGAAAAATGGTCAAATTTGTAACTCTTGCTT
TTCTATTTGCGAATAAAAGTCTAATATACTAGAATTAAGACTGTTTATAT
ATCTTCAAACCAAAAACTTCATCTTATTCGTATATCTGTTGTTTTTTTTC
AGTCAAGTTGGCGTCGAGACAAGATTGTCATTTGAAGCGAACATCGGTGA
ATTGGGTGAATCGGTTATAGCGCTGACTAATGATGGAACAACTGTACTCA
AGTTCTCATGGAAGGTAAGGATGAGATATTCCTTTTTGCTATATTTTTCA
CCCATGAGATACCCATCATACAACCTATAGTACTTTCTGCTGCACTAATT
TGTCAAAAGGAAAAAAAAGTAAATCCCCCGGTAGGTACTAGGGTTGCGAG
CTGACGGGGAGGGGGGGTGCCGCCCGACTTTCGAATTATGGACCCTTACC
GGGACTAAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAATTTTGTGAACTTTACGAACCT
TATCGGGACAAATTTGACCAAAATTCGATCTTTCCGTAATAAAAAGTACT
GCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCC
CCCCGGAGGTAAATCCATTGACGCAAGGATTGAAAAAAGATGAAATGCAC
TCAACTTTATTATGATGTAATTCATTCTCAAATTAAAAAAGAACTAGCCG
TATGCGCAGCGTGTCCCAATCCAGTGAATCACTACACATCTACATCTAAA
AAATTCTAACGGAAGAAAGATAGCCTCCGATTGATGATTAGATTTTGATT
TTAGGAAATAAAGGAATAAAAAGATAACACTGCATTGTAATTTTTAACCA
CAATTAAATAAATGGCTTGGCAAAAGTATATTTCAGATCTTCTTAGCCAT
CGCGTGGTTGGACATTCGAGGGTGACTTTGAAAGACTTTTGAAAGTGATA
GGGAGCTATGGCGCGCCAAAGCGGAAATAAATACTATCTTTCATTTCGCG
GCACCATCTTTCATTTCGCGGCACTATCTTTCATTTCGCGACACTATCTT
TCATCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCGACACTATCTTTCATTTCGCG
ACACTATCTTTCATTTCGCGACACTATCTTTCATTTCGCGACACTATTTT
TCATCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCG
ACACTATCTTTTATTTCACGACACATTTCGCGACACTATCTTTATTAAAA
CGACACTATCTTTTTTAAAACGATACTATCTTTTTTTAAACGATACTATC
TTTCCAAAAAAACATTATCTTAATTGAAACGATACTATCTTTTTTACGGG
ATACTATCTTTTTTTATGGAAGCCGAGAAGTGCCATCGACAAAAAATATT
TCATTTTAGAAAAATAAATTTAAATCTATAAAAAAAATATTTAGTTTTAG
AAAAAAGTATTCAATCTTAGTAACAAAAATTAAAATTAGAAAAGTTATCA
AGTTAGAGAAAAAAATTTAATTTTAGAAAAAAAAATTCATACATTTCTTG
AAGAGTTATTTAGTTAAGAACATTGAGTAGTTATGCTTATAAAAAGGGTA
ATAAAAAGAGTTTGTTATGTAGATTAATTTTTGTTACCGAAATCTAACTC
AACCGTTACCTATGATATGATACTCTACTTTTTTATGCAAAAAATCAGAA
AACATTTTACCTACTGTACTATATTCAATATTGAGCAAATCCTCGTTTTT
GGCCCAAATTTGCCCAAAATAATTTTTTTTTCTTCAACAAAATTTGGTTC
TGTCAACTTTGCATTATTTGTGGATTGACATCTATGTGCAAAAAATCATC
TGATGGTCTTCACAAAGTCACAAATCCAGGAAGCATAGAAACGAAAGTTG
CAAGTGTGCACGGGAGGAATCGGGCCAAAAAAGTTTTTCTCTTTTAGAAT
TTTTTTTTCGAATCGGGCAAAAAAAATTTCTCTTTTTTCTCTAAAACTAA
ATTTGTCTCTAAATGTAATTTTTTTTTTTAAATGAAATATTTTTTGTCGA
TGGCACTTCTCGACTTCCACAATAAAGATAGTATCCTGTAAAAAAGATAG
TATCGTTTCAATTAAGATAATGTTTTTTTGGGAAAATAGTGTCGCGAAAT
GAAAGATATTGTCGCGAAATGAAAGGTAGTTTCACGAAATGAAAGATAAT
GTCGTGAAATGAAAGATAGTGTCGCGAAATGGAAGATAGTATTTATTTCC
GCTTTGGCGCGCCATAGGGAGCCGCTATTGTTAACAGAAAGTTTTAAAGA
GCATCTGAATAAGAATTCTTTAAAATGACAAAATAAAATTGGGAAGAAGG
TTGATTTTAACCCATCAAGCTCCAAACTTGGTGAATAGAAAATAGTATCT
TGGGGTCTCAATGTTAGTCTAGTGGTAGGAAATCTGAAAATATGATGGTT
CAACGCCATGAAGAGGAGGCTTTGTAGAGCTTTGTTAGATTTTCGAAAAC
TTTTTACAAAACGTTGTAAACACACACGTTTAAGCGTATTAATATATAGA
TTGAATGATTGATTGATTATAAAAGTTTGATTATTCTCGCTTGCTTTATT
TATCGAGAATGGCTGCTTTTCCGGTCCACGATGACCAGAACTTCTAAACC
CAGGGCTTTACTTGAGCAAATCTTCTCGCACTCTTTTGTAAAAATTTTTA
CATAATTTGTTTAATAGTAACTACTTTAGTGAATTAGTGAAATAAAGATT
TACGAAACTACAGTACAGTCAACTCAATCGAATTCGAACTTCTATTATTC
GAATCTTTTTATAATTCGAACTAATGTATTGGTCCCCTCAGCTGGAAAGT
GGTTTTGTACTCTCTGTAATTCGAATCTTTCTCTAATTCGAAGAACATAT
TCGGTCCCATGAAGATCGAATTAGAGAGAGAGTCACCTGTATGTTTTCAT
CGCTCTGGTGCATCGAAATGGTTGTAAAGTTGCCACCAAAGTATCATCAC
TTTGCACAAGTTTTGTTTACCAACCTGTGATATTTTTTTTTCAAATGATA
TATAATTTATTTATCATCTCTCTCTATATATAGAAACTTCCAAAGTATGA
TCCGTTTGGTTTGAAGAAAGGAAAACCCCTTGAACGATTCTACTTCGATA
TCAGAGATGGTAAGGTCTTTGCGTTGGTGATATGCTATTGGTTAAAGTAT
GTTTCGTTGTCCACCCTGAGAGTAAGTAAACAGGGAGCAGATAAAGATCA
GAAAACTACTTTGTGTAGGCTAATTCTTCATCAATTTAACTATCATATAA
CTTATGATATCATATTTTATGATCTGCCCCAAACTCTATTCACAAAATCA
AATTATAACATGTAATAGAGAATTCAACATGTAATAAATGTTTCATACCT
TGTGTGGTGAAATCAATAGCTTCTTTTATATGACGTAACAAATTTGTGAG
TAATTCATTTTGAATTTGACCCACAGCTTAAAAAAAATTGTCGAAATTTG
TTTAGTGAAATAAATCTATTTTGGACAGAAATCCCTGCAACAACACCGAC
TTACTAATTTCCAGTAACCCTTGTCAATCTTACTACATCATTCCTTGGGG
GGGGTGGTACTTAAACAAAAATGGGTGCTGGGTATGTGCGGACGGTAAGG
GTCGGTTTTTTCACCTTCCAAAGTCTCTCTAAGGATCGGAAAAATCAGAA
AGTTTTCTCTCGAAGGGTCAGGAAATTTTTTTGATTTCGAGAGAAAAATT
GTAAAAAAGTCTCTCCCTAAGGGTACCACTATTTTCAAAAATCGAAGAAA
ATTTTTCAAAAAATCTCTCTAAGGGTCACCTTTTCGGCAAAAATCAGTCT
CTCTAAAGGTCGGTTTTCGGAGGTCTCGTCCGCACATTCCTCTCATCTGC
CAACCCTAGTACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCC
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TTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCAGACCCCCCCCCCCCCCCCGGAACTTCAATACA
TAAAATTATTATTGTGGACCTCAGACACTTTCGCTTCAAAATTTGTAACG
GTCTCTTGGGATTGGGAAAACATTAAATGCTCAGTTGTCGAAGCAGTTTA
AATCGAAAAACGAGTTGATTTTAGGTATCTTGAGAAGAAGGTATTCTCGT
ACATTTCTTAGTTTCCCACGTTTGCTGGGACATCTCTTTCCAAATGAACA
GGCTCAATTTGCAATCCTCAGGACGTCAGAACGCATAAATAGTAGTGAGG
TCATTGCCCTGACCAGACGATTGCTAAGCGCCTTCAAAAGCAACTAAAAA
CATATGTATCAGAACCAGAGGTTAATCCAAGGCCATTCCGATAGAGGTTG
CATTTTATTTAGTGAAAAAAGTGATTTTCTTTTTCACCACAGAATTGGTT
ATTTATCAGTCTTCCCTATCTTTTTCTCTAGGAATTATTCTACCTGGCCA
AACGATCAGTATTCCGGCGGTGTTTAAGTCTTCCAACGCTGGTATCTTCA
CTGAACAATGGTGCTTGGAAACACATCCTACATTGTGTGCTGGACGACGC
TTGCTGGTCACCTTACACGGTGTTGCAACCCAACTGACCAATATGGACGA
GCACAGAAGAATTCTAGAGGTAAGTTAGACAGGAGACCCGTCCTGTATTT
TTATAATCTGATGTATACAGGACGGGTATGACCTGTGAGGCACAAATCTG
CCTCAAAATATTTACAGTGGGTAATTCGAATTTAGCGCTGTCCTCACTTA
CTAAAATAAAAACCAAGTTTCGGAAGTTGCGCTTTCTCTAAGAATGTGTG
AGTCACACATTGGTCACTGACCAGCAAAAGAATAACAAAATTAGGATCTA
GGAAATTCAAACTGTCAGCCCATACCATGCTATATATTTCGTATATAAAA
TTAGAAATCATAGCATGGATCTCCAGGCTAGAGGTAAGTGGGAACAACAA
TAGTCGACTAATCTAAGGTGTCAGAGCCACAAAACAGGGATTCCTGGTTC
GAATTCCTGCTACTAAAAGTTCTAAATTACTGAAAAGTTTCGATTACAAA
GTAAAATTCTGCGACCGCAGTCGGAGGCGACTCGGAGGCTCCTCTTTCGA
TAGTTATCAACCCGAAGGTAGTGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGAATT
GCTCCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTTATTGCTGAGCATCAAGCCAAAT
CAAGCAGAGAGGCATCAAGTACCAATTTGGGAATCTTTAGTATGGCCTGG
CTGGGGGTTGAACCCACAAACTTGCGCACCGTAGCCGGATGCTCTACCAC
TGCACTACGGTCGCTTTACACAATATATTTTACAGCGGGAGTTCTGCTAA
CCCTACTTTTCATTCTTATTTGTGAGATTGCTAGGTTTAGCCACGTTCTT
TTTAATTTACACATTACGACATTTGAACCCGACTTGGATATCAAAGGTCG
AATACAATTCCCCTCCAATAGGAATTTGACCAACGCCTTTAGAGCTGTAG
ATTTAAGGCGAGCGCCGTACCGCCACCGAAGTAAAAGATAGAGAAAGCTG
CGATAGCGCTATTAAAAGAAAGAAAGCACCCCTGTTAGGTTATTTGCGTA
AGGAAAAGTTCTATAAAAAGATAAACTGTTATAAAATAAAATTTCGATTC
AATCTTATGTAAGATTGTTGTTGAAGTTGTTGAAGAATGACGTCATTTTA
AAAATGCTTCTAAAGTAATATCATAGTTGATTTATTATTCTGGAGACGAC
TTTTAATTGCGGTTTTGCAAAAGAAAAACATTTCCAGACTTTTTTCAGAG
AGCTCTAGGTCAAAGTGATTTTGTGACTTAAATTCACGTGTTAGCATTAC
ATAATATCGGATTACTAATACAAGGTTGTAAATTTTTTTCAAAAAAGTTT
GACTAGGTCACAGAGAGATGTTTTTATAAGAAATTACAGATTCTTGAACA
TAGAAATTGTGCATTGGGGCATGCACTTTAGACAAAGTATCGAAGCTTTT
TAAAGTAAATCGACAATAGTCACAATAGTGTGTGCTAAAAAGTTGTTTTA
CATGCGGCTCTTCGGAAAAGGGATTTTTTAATTTGAGGTCAAACTTCTTG
AATATGAGAACTCATTCGTGTTCTTATAACAAAAACTATAAAAAGAACAA
CAGAGGGAGAAACCCTATTGGTAACTTTTAAGGTTACCATAGCAATACCA
TTTCATTGACGATTGAGTTAAGCTTTCCTTCAATCTTAACTTGCATAAAT
TACATTGTTGAATAGCTTTTTTCAAATTATGGAAGTTGGTTATGATTATC
TCTCTCTACTTTATTTCTCATATTTAGTTTCTTGTATTCTTTGCTCGAAG
ACACATTTAAAGAGCTTCATTCTTAACTCTGAATACGTGTCGAATGTGTC
TGGAGACAGGCTTGTTAAATTTTACGGATTTCCTATTAGAAACATTTTGA
GAGTCGTAGCTTATCGAAGTTTTGCGTTTAGTACTTTAGCTCTAGTTACT
GTTAGTATAATAGCATTCTATCAGTAATAACAGCAAGTTAGTTTTACTTT
AGGTGTACAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTCGCGATTTTCGCGAATTCC
GGCTCTTTTCGCGAACAGTAAATGTCTTTAAAAATTCTAGGAAGGGTCAT
TCGCGAAAGTTTATGTCCGCGAAAAATTCTTGACAAAATAGAAAATCTGT
TAAACTTCAAACTTTGATTAAAATGTAGCTTTTATGGCTTTTTTTAGCCT
GCTAAAAGACTAACTAGCTGGGCCAATATGTAAGTCAAAGGATAAATGTT
TCAAGCCAAACCTAGAACTATTTGTCCTTCTAAGCTATTTTTTCATGTGA
AAATTCTCAATTTTACGTCTTGATTCGCGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAA
TATCTTTCCGTTAAATTCGCAAAAGTAAATGTCGTGAATTTCGCGATTTT
TCTTCCTCGTGAAAGTTTCTGTTCGCGAAAGTTTGTACGCCTGAAGTAAT
TGAAGATTTCTGGCATTTTTTATTAAGAACTCTAGTAGGTTTGTGTAAAT
AAAACTCTGGGGGGGGGCAGCTGGGCAAAAGGACCGACGGGTATGTGCGG
GTCCTAAGGGTACCTTTTCCAATATGTTTAAAAAAATGTCGGAAAAACTA
AAGATGCACTGTAAGGGTAGAAATCTCAGAAAATTCTTGAAAAATCGAGA
TATTTTGCCCAAAAATGCTAGAATTTTGACCATTTTTTGCACGAAAGGGA
TCGAAAATTTGGGGGAAAATGCACTCTAAGGGTATGATTTTCACTGATTT
TTTGCTGCACTGTAAGGGTGCAATTTTAAAAGCCAATTTTTGGCCCGCAC
ATACCGTCAGTCTGCAAACCCAGTGCCCCCCGGGATAAAACTGAACTTTT
TTATATTTGTCACAAATATTTATTTTAAAATAGAATATTGAAATATTAAA
CTACAGTTATTAAAACAAAGAAACTTTGATTTTCTCCATAATGTATCCAT
AACTTCATATAAACTTTTTTTTTTCAGGAGGAATATGTACGCCGCCAAAA
CATCCAGATGGCGGCCAGGATTGTCCAGGAGNCTTTTTTTCTTCAGGAGG
AATATGTACGCCGCCAAAACATCCAGATGGCGGCCAGGATTGTCCAGGAG
ATGGTCAGGGGTGTAAGCACGCCACCGAGGAGCCCGTCTCCACCACCCCT
ATTAACGGTAATGTTCAAAATCATTGTAATTTTAATCAGTTTTTGGAAAT
CCATGGCGAAAAACCTCTGTTATATTCACTTTTTGAACCAAATGCAACCG
TACAGTGTTGAATATGGTAGAAGATCGACTGAAATCGTCAGCTCAAATCG
TTGATTATTAAAAAATTCGTTGTATTGATGTCAAATCAAGCATTGTACAT
TCTCGTACTCAGTATAGTATCGGCTTTTCACTGAAAGAAGGAATTTCAGC
AAAAGATTTGGGAATAACCCCGACCCTAGCGTTAGAAAATGATAGCTTTT
GATGTTAAGCCCTCTATTCTCGAAATGCAAAATAGAAAAACTATTGTCTA
GACTAGAATTTCACCAATTTTTACTCCTTAGGAAGAAGAAGAATTCAATG
AGAGAAATCTGAACGTAAGATATTTAAACTTTTGTAAAATTTTTACAATT
GCATTTATTCATACTTGATTTTTGACTCAAATATTCCACGTCATGGCTTT
CTATTTTGTCCCATATGAGACCACCCATAAAAAAGCACTCGAGATATTTT
CACTGTTGATTGCCCTAAGATCTCTTCGAATTGTTGTGAATGTCAGTGCA
ATGTGCAAAACAACAACATAGAGTTGTGGTGACTCGACAACATCCTCTCC
TTCCATTGTTGTGGTCTTGTACCTTTTTCACACAATCAACGAAACATGTG
CAAAGATTAACTGATTGTTTTCCTAACAAAAGCACCTTCAATGAACACGC
TTACTAGTCTCGAATTTTTCCATATTTTTGAGGTTTTTTCTTCCGGTGCA
GTGATTCCTGACTTTAGGTTAGAGCCTATTTTCACTAGTGAAGGGTCTTA
TCTTGTCTGTTCTTCTAACCAATGATATATGCTACAAAGCTAACACGAGC
CTTTATTTCTAGAATACTTATACCCCTGCTTCTTACCCCTGTTTCCCATT
TTAGTTACATTACAACAAGTCGGCTGCTGAAGACATGAAGAAGTTCTTCG
TTGAACTCAATCCCCGTGAGAATTGGGATCTTTCCATCATGACCATGCTC
AAAGTATGTTTTTGTTTTTGACGTACCTTCCTCCCTACCCTCCTCATCTC
TATTCTTTGACTGTGTTTTGCGTCTCACTTTGACGAAAGCTTAATAAGCC
TCTATATGGTTTGAGGCCGGGTAACTCGGTAGAGCGTACACCTTTCAACC
CAAAAAGTTGTGGGTTTGATTCCCGGTCACCGTCAACTCGGCGAATGAGT
AGTTTGGATTGGGTAATCTGATATCTAGGTGGTGAGTTACTGGGATCTGA
GAGTAGGTGTAGCGCTCCACCTCAGCATTTGATCTCCCAGGGCTAGCGCA
AACAGAAAAAGGAGATAGACTGCCTCACTTCCAGCTCTTCCGACAACCAA
TATTTCCTTACTTATATGGTTTGATTAGATCTTGTTTCTCCCGGCGACTT
CATTCATTCATTCATTCATTCATTCATACATTCATTCTAAGAATATCGAG
AACCTTGAGGAAGCGGATGTTATAAATGACGGCGAAGAAGAGAAGGATGT
AGAAGAGACAAAAGAAGAAGCACTAAACCGTTTAAACAAAGAGCTGGTTT
CATTTAACCATCCTGTACGCAAACCTGCTCATCGAAATACCTATGATAAG
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TAAATTTATCGTTATCGTATTCTGTTACCCTCAAAAAGCACAAATTTGGC
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CCTTCTGCGATGACTCTCTTTTTCTCTTTCTTTGTATGCTCTTTAATTCT
TCCAACATTCACATTAAATTATATACTGCGTGAAGCATTTTGGAGTATTC
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CAATTTGACATTTTTATCTTACTAGCTATAAGGTGATCTGTGAAGCAGTC
GACAGATTCGTGTTACAGACCATGACCTCAAGACACCAACTTGGAATGCC
TGAAAAAGAAATATACGTCAAACAAGAAAGTATGCTTTTAACCGAGTCAC
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GAAGTCTTCGAGTTAGTAGGGGAAGGAATTTGTAATAGTAATGATATGAC
ATTGAAATTGTGGGCAAATAATAAGGATCTCTCCTTGAAAGAGGTAAAAA
AGAAGGACATCTTAGCTTAATTTCGTGAAATTAGGGATTAATACCCCGAC
TTCAAACTCTCAAGACTTGTTTTCATTTTTTCAGTACCCGTGCACAGAGG
GAAAAGCAGAAAAGTAGTGGATACACAGAAGAATACACGTAACGATGCCA
AGAGTCCAAACAAAAAGAAAGAGGACGCTGGAAAAGCCAGAACACCCAAT
GCTAAAGAGAAAAAACAAGGTAAAGTGGGAGCAATTCTCCAGTGTATGAT
CTCATTTGATATCGGAAAATATTCTCTCTGTGGTTTGTTAAATTTTAAAA
GTTTCTATAAAGGTCGATTTTCGAACTATGATCTAGACATAATTCTCATC
TCGCAAACTTAATTCCCTCCTTCTCGATACTACACTTCTAAGCCTTGGAG
AATTTCTTTTACACATTATTTATGAATGATTGTCTCATTTCAGCTGAGCC
ACTTCTAATTGCCAAAGAAGAATCAGCAGTGATACAAGAAACTAAAGACA
ATACGGTGAAGATTGATATTTTCTTCTTAACTTTCTACATTGCCAGAGAA
GCTTCATTAACATGATATGTAAAATTGTTAGTAGGATAATGTTACTATCA
AACAGCGGACTTTCGCTAATTCGATTTTCTATTATTCGAACTATTTCTCG
GTTCCTGTCAAGGGGAAACCCTCGTAAAATACTTTCTATAATTTGAACAA
ATTAGACTCCCCGCTCGAGTCCGAATTAATTAAAACTGTAATTTGCCCAT
TTTTAAGAATGCTTGTTTAAATTGTGTGAAGTAGATATCTGTTCTTTCAA
AAATAAATTCAACCTCTGGATATTGTAGTATTGTCCTTTTCAGACGCTCT
GTTGAATTGTTATCAACCCGACAATTATTTCCTTTTGCTTCTCATCGGCT
TTTTCAATTACCATTTACACATGAAACAAGAATCTTTCAATTTTTGGTTT
CTCTCTCTCTCTTTATTATAGAACACAGCGGCATTTGTTGTTAATGAGAC
TCAACATGCTAATTATAATAAATATATGGACAAAATGTACAGCCAGGTAA
GATCATTATATGTGAATGTGTCTGTTGACAAAACTGATAATGGGAGGACG
TCCAAATAAGAGGTTACTTCTCTGAACTGTTGTTCTCGTTCTCAATGAGG
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CTTGTGAAGTTATGTAACAGAGAGACCACTATTAATTTCTGAGCATTAAA
ATAATGGCTTTTTTTGTTTACGTTCCACTTTATGCCTTCTTCTCTTTACC
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GTTTACTCTCTGTTGCTATACTGTATTTATTAAGCCCAAACTACATTAGC
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CTAGTAGATCAATGTGAAACATTGTAGAACTGTCATGGTTTACAAAATGA
CTATTCTTGTATGTTCTGAATGTTATCAATACTTATTGAATAAGGTTGCT
GGTTTGTTTTTTTTCAATTGTTAGGTGTACAGTTGTCTGCAGGACTTGGC
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GACGCATGAGTGGCGTAAGTAGGGTTTTTGTTTGAAATGTTTTTGAATCG
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ATGATCTGGAAGTCTATCTGTCAAGAATATGTTCAAATAAGCCGATCATC
GGTTCTTTAGATGATATTATTTTGGATACTAGACCTTTTCATAAATTACT
TTACGAACATCACTTGCTTCGTTTTGAAATTATTGATTAAATCCCAGCGG
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AGATTTTCACCACAGCCTGTATAACAGACTGTCGGCTCTTTAGACGATTT
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CAAGAAGAAAAAACGTTTGTTTTCCTTTAATCGCATTTTCTTGTTTTAAT
ATAGGCTTAGGATCCCATAAATTATCTATTCAAAAACCGATGGTCGCATA
ATTTGAACAACATCGTAGACTGTCCTGACCCGTTCTTCCTTATTAAGATT
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TTCTCTGTCTAACACCCCCCTGACTAAAAGTAAAATGCTCCCCAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005912	XLOC_005912	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000107	supercontig	sc0000107:138740..162284 -

Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00010545 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: MEST (Mesoderm-specific transcript homolog protein OS=Homo sapiens GN=MEST PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 224.172 bits (570), Expect = 9.665e-64
Identity = 115/305 (37.70%), Postives = 186/305 (60.98%), Query Frame = 3

Query: 3456 PLPNLSPQVRDWFNKGQIFKYNDTFDIFYYDS-GVNTENKDGPILLVIHGFPANSFIWRDLVPEFKTKFSRVVIPDLMGLGFSDKPIGYRYTMMEQSRMLVQLLTQLNLTD--IHVVAHDYGVSIGQELIHQVNQG-SPEIMVKSICFLNGGLVPSRHNILFIQKLFS-SPTFKKIMPYLLTYPIYKNRLSSIFGPHTRPSDTQLEDIWAIMLHKNGHIAIPDIFTYLFERKANEMRWLSALQETKVPVHLVYGPEDPVNTPDGFLKTYKELIPNSSVTVLDN-VGHYPQVEDPDGFIASYMRFL 4352
            P P LSP +  W + G+ F Y     IFY DS GV    +   I++++HGFP +S+ W  +      +F RV+  D +G GFSDKP  + Y++ EQ+ ++  LL  L L +  I++++HDYG  + QEL+++  Q  S  + +KS+C  NGG+ P  H  L +QKL         I+  L+ + ++   L+ +FGP+TRPS+++L D+WA + + +G++ I  +  Y+ +RK    RW+ AL    +P+H +YGP DPVN    FL+ Y++ +P S+V++LD+ + HYPQ+EDP GF+ +YM F+
Sbjct:   32 PPPQLSPALHSWKSSGKFFTYKG-LRIFYQDSVGVVGSPE---IVVLLHGFPTSSYDWYKIWEGLTLRFHRVIALDFLGFGFSDKPRPHHYSIFEQASIVEALLRHLGLQNRRINLLSHDYGDIVAQELLYRYKQNRSGRLTIKSLCLSNGGIFPETHRPLLLQKLLKDGGVLSPILTRLMNFFVFSRGLTPVFGPYTRPSESELWDMWAGIRNNDGNLVIDSLLQYINQRKKFRRRWVGALASVTIPIHFIYGPLDPVNPYPEFLELYRKTLPRSTVSILDDHISHYPQLEDPMGFLNAYMGFI 332

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00010545 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00010545 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MEST	9.665e-64	37.70	Mesoderm-specific transcript homolog protein OS=Ho...	[more]

You are here

TCONS_00010545 (transcript) - C. hemisphaerica