TCONS_00010544 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00010544
Unique Name	TCONS_00010544
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5454

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000107:138740..162281-

transcript sequence

>TCONS_00010544 ID=TCONS_00010544|Name=TCONS_00010544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5454bp
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TAAGAGCAGAGATTTTCACCACAGCCTGTATAACAGACTGTCGGCTCTTT
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TGTTTTAATATAGGCTTAGGATCCCATAAATTATCTATTCAAAAACCGAT
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ATTAAGATTTCATTATAAATATAGATCATTATAGATCGATCAGAGCTCTC
CCTATACTTTCGTCGAATTCTTCAATAgattttttttacgtttttacgaA
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CCAG

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transcript from alignment at sc0000107:138740..162281-

Legend: exon

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>TCONS_00010544 ID=TCONS_00010544|Name=TCONS_00010544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23542bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107:138740..162281- (Clytia hemisphaerica)
ATGTTTAATAACGAAAATTAACAAAATTAGATGAGAAAACAATGACATGA
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TCCCCAACAACTCCAAAAGCAACAGGTATTTTCTCTTTTTATTAAATCAA
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CTTTCAAAAAAGGGCACAGGAAATATAAATTACAGGTTCTAAATTATGCA
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AAGATAATTGTGACTTTTTTGAGACAGATTTCTTTTTGCTATTGTTTCCC
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GTTGAGGAGGTCCAACCTTTTGTGACCTACCCCCTTGGAATTCCAGGCAA
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ATTATACTAGCTATGACATAAGGGGTAAGATGTTGAAAATGGTTGAAATA
TTGTCCAAAAAATGAATTTTTATTTTTGGTTACACTTCTCATGGATTTTT
AAGTTAAACTTATTTCTTATTTGCAATATATATTGGACAGGAAAATTTGC
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GTACAATTCATTTATTATTTTTCATTTCAGCCATAACAACCTATTGCGCA
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CTGCTGGTGATGTATCAGATGAATTAGAAAATATTGAAAGTTGTGTGAAC
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AAAAGCTATAGAAGATTCTTCTCGAGCTAAAAACCAATTAAAACATGTTT
CTCTGCTGTTAAAAATTATTTCAAGGAAAATATTTTTCATCCAATAGAGT
CTGAACTTTTTAACTGAAAATATAATACCCATTTTAGAACCATTCACCGC
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GGCAGGCTGCATATAGTATCATATGTTCTTGGGGGCTGAAATTTTGCGCA
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CTTTGGGGCAGGCTGCATATAGTATCATATGTTCTTGGGGGCTGAAATTT
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GAATTTTGGAAACAAGCTGAAGAAATTGGTGGCAATCAAGGAGTTAGGTA
ATGTTTTTTCTAATGATGATAATATTTAAGAATCTTTGTTCAATTTCTAT
GCTCCTTGGGCAGTGATACATGGGTTCTGTTTGTTGTTTTGTTGAAAATA
AAAAACGTTAAAAAACTCTGTTCATTCACCATTTAAAATTGATTGCTATA
TCTTCCTTTCAGTGTAACACTCAGTGAAACAGAAAAGGGCAATGTTCCCT
CTATCGAACATGTCGGTCATCCAGCCAACATCAAATCAGAGATGGGAAAT
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TTCATCATATTTAAATGAGAGAAGAGAATATCTGAAAGATGTGATGGATG
AATTAGATCCACATAAACCTGTAAGAGAACCTAGCTTCGAAATCCATCCT
TCTCCATTCTCCTATTTCATGATATGCAACTTTGCAATTTCTTCCAAATT
TCTTCCTGCTAATTTTTACAAAGGTTTATACCCGCGTATCTTAAACAGTG
AAAAAAGCAACGTTTTGGTTGGACAAGATTATAAAAGTTACATTTATTGT
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GGAAAATTTTTTCTTTGGTCAAAGGAATTGTTACCGCTCCTGATTTTGTT
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AAGTGATTGGTCATGGTTTACAACTACCACAGAATGTTCGAATGAACCAA
GGAGATGCGCTGGCATGTTTCGGTAATAATGAGCACTTGGATGAAGACGT
CATTGATGATGAAGAAGTTGTGGATGGGGACTTTCAAGATGATTGTGATG
TGAGAAATATTGAAGGGGAACGACGGTAAATTGAAGGCTTTTTAATTTCA
CTATTCACTGAATACACCTTTCAACCCTTCAAAAAGCGTGAGTAGACCTG
GGTTTGAGTTTACCAGTAAGGATTGCAATGATGTCTGAATTCTATGTTTA
TGAGTAAATCAACGCAATGACTTCAGACATTTGACATAAATCCTGGAGGC
TGGGTTTCCCAGGAAAGATGTCAATATTTTTCGTCATCTCTTTCCTAAAT
TTTGTTAAATGGGGCTATGTGAATATGGTTTTTGTAACAATGAGCGAACG
TTGGAACTTTTGATCTAACTGGACTTTGATAATAATACAATAAAGCTATA
GCATTAATTTGTAATACATTGATTTTCATTATAGTGATCCACTTTCCTGT
TACGATGACGTCATTCCAGAGCCTATCTTTGGTCCATCACTTCTCATTAA
TGGACAACCAGCTTCGTGGGAAGGCTCTCCTGTGGAAGATTGTAACAGGT
TGGTATTTATTTAAAAAGTAGTAAAACTGCCAAAAGGGACATAGAAATAG
GTATAGGAGAAATAGGTATAGGCCAGACCCGATCAATCGAACTTGTCGAA
CCAATCGAACAATCAAACTAATCGAACTCCATCGAACGATTAAAGTTCGA
TTAAAAAAATTAATCGAACTCTAAGATTTTTTAAAAGATTGTGAGTGTTC
GATTAAATTCGATCAATCAATGGGTTTCAGTTCGATCAGTTCGATAAACC
AATTTTGTTCGACAAGTTTGTGCTGCTCCGCCACCGTATATTATCTTCTT
TTCAAAGCCAAATTCGGAATGTAAGTCGGGAAATTACTTCCGATAACGGA
TTACACACTTTCCCTGTATCCTTTTAGCGCCAGAGGCGGTTTGTTGGGGT
GTAGTATTCCGCCACTCGGCCGCGCGCGAAATCGCAACAGATGGGCTACG
GACTTTATTCCGGATAGACAAATATCCAGGTACAATAAACGTCAAGCTGT
TAAGTCCGGGAACTGTCGAAATGGCAATCGCGTGCCAGGACAAAGTTTTT
GCAAACGAGGGTAGATAAGAGGATTTAATATCATGGAACTAATCGAACTT
TTTACTGACCGAACTAATCGAACTGCTATTGCTTCAAAAATTGCGAGTGT
TCGATTAGGTTCGATTAATTTTTTTAATCGAACCTTAATCGTTTGATGGA
GTTCGATTAGTTCGACTGTTCGATTGGCTCGACAAGTTCGATTGATCGGG
TCTGGTATAGGAGAGCATGTTTTTATGATAATTTACAGTGCTGCTAGCTG
TGGTTTTCGGATGATGGGTATTTATCTCTTTAAAACCTATTTTTGGGAAA
TTTTCCTATTGTACTTATCTTGGAAATGAATTATGCCATATATTTTTAGC
ACCGCCTCAAAGCTCTTCCCAATCTTGTCTGACTTTTTAAATTATGTCCG
TAATAGAAAGTATTCGCAGCCCAAATTATTGTGCTGTGAAAAAATACCAG
TTAAGACAGCCGACTTTTGTGCTCCCCTTCCTTTACTTGTTAGATTAGGC
TGAATGCTGGCAAACAACATTTTCGCATGGAATGTATTAAAAAAGTCGTT
TTCAACGACTTGACAATGTTATAAATTAAAAGTCATTGTATTGATTTAGC
AAGATGTTGTTGTAATGATTTTAGACTTTTCTTCGCAATTAGAAAAGAAG
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GATTGCTTTCCGCGGGAATTAATTTTCGCGTTTTTGCTGTATATGGGATA
CATTTCTTTGCTTTGATGAAAAATGGTCAAATTTGTAACTCTTGCTTTTC
TATTTGCGAATAAAAGTCTAATATACTAGAATTAAGACTGTTTATATATC
TTCAAACCAAAAACTTCATCTTATTCGTATATCTGTTGTTTTTTTTCAGT
CAAGTTGGCGTCGAGACAAGATTGTCATTTGAAGCGAACATCGGTGAATT
GGGTGAATCGGTTATAGCGCTGACTAATGATGGAACAACTGTACTCAAGT
TCTCATGGAAGGTAAGGATGAGATATTCCTTTTTGCTATATTTTTCACCC
ATGAGATACCCATCATACAACCTATAGTACTTTCTGCTGCACTAATTTGT
CAAAAGGAAAAAAAAGTAAATCCCCCGGTAGGTACTAGGGTTGCGAGCTG
ACGGGGAGGGGGGGTGCCGCCCGACTTTCGAATTATGGACCCTTACCGGG
ACTAAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAATTTTGTGAACTTTACGAACCTTAT
CGGGACAAATTTGACCAAAATTCGATCTTTCCGTAATAAAAAGTACTGCC
CCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCCC
CGGAGGTAAATCCATTGACGCAAGGATTGAAAAAAGATGAAATGCACTCA
ACTTTATTATGATGTAATTCATTCTCAAATTAAAAAAGAACTAGCCGTAT
GCGCAGCGTGTCCCAATCCAGTGAATCACTACACATCTACATCTAAAAAA
TTCTAACGGAAGAAAGATAGCCTCCGATTGATGATTAGATTTTGATTTTA
GGAAATAAAGGAATAAAAAGATAACACTGCATTGTAATTTTTAACCACAA
TTAAATAAATGGCTTGGCAAAAGTATATTTCAGATCTTCTTAGCCATCGC
GTGGTTGGACATTCGAGGGTGACTTTGAAAGACTTTTGAAAGTGATAGGG
AGCTATGGCGCGCCAAAGCGGAAATAAATACTATCTTTCATTTCGCGGCA
CCATCTTTCATTTCGCGGCACTATCTTTCATTTCGCGACACTATCTTTCA
TCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCGACACTATCTTTCATTTCGCGACA
CTATCTTTCATTTCGCGACACTATCTTTCATTTCGCGACACTATTTTTCA
TCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCGACACTATCTTTCATCTCGCGACA
CTATCTTTTATTTCACGACACATTTCGCGACACTATCTTTATTAAAACGA
CACTATCTTTTTTAAAACGATACTATCTTTTTTTAAACGATACTATCTTT
CCAAAAAAACATTATCTTAATTGAAACGATACTATCTTTTTTACGGGATA
CTATCTTTTTTTATGGAAGCCGAGAAGTGCCATCGACAAAAAATATTTCA
TTTTAGAAAAATAAATTTAAATCTATAAAAAAAATATTTAGTTTTAGAAA
AAAGTATTCAATCTTAGTAACAAAAATTAAAATTAGAAAAGTTATCAAGT
TAGAGAAAAAAATTTAATTTTAGAAAAAAAAATTCATACATTTCTTGAAG
AGTTATTTAGTTAAGAACATTGAGTAGTTATGCTTATAAAAAGGGTAATA
AAAAGAGTTTGTTATGTAGATTAATTTTTGTTACCGAAATCTAACTCAAC
CGTTACCTATGATATGATACTCTACTTTTTTATGCAAAAAATCAGAAAAC
ATTTTACCTACTGTACTATATTCAATATTGAGCAAATCCTCGTTTTTGGC
CCAAATTTGCCCAAAATAATTTTTTTTTCTTCAACAAAATTTGGTTCTGT
CAACTTTGCATTATTTGTGGATTGACATCTATGTGCAAAAAATCATCTGA
TGGTCTTCACAAAGTCACAAATCCAGGAAGCATAGAAACGAAAGTTGCAA
GTGTGCACGGGAGGAATCGGGCCAAAAAAGTTTTTCTCTTTTAGAATTTT
TTTTTCGAATCGGGCAAAAAAAATTTCTCTTTTTTCTCTAAAACTAAATT
TGTCTCTAAATGTAATTTTTTTTTTTAAATGAAATATTTTTTGTCGATGG
CACTTCTCGACTTCCACAATAAAGATAGTATCCTGTAAAAAAGATAGTAT
CGTTTCAATTAAGATAATGTTTTTTTGGGAAAATAGTGTCGCGAAATGAA
AGATATTGTCGCGAAATGAAAGGTAGTTTCACGAAATGAAAGATAATGTC
GTGAAATGAAAGATAGTGTCGCGAAATGGAAGATAGTATTTATTTCCGCT
TTGGCGCGCCATAGGGAGCCGCTATTGTTAACAGAAAGTTTTAAAGAGCA
TCTGAATAAGAATTCTTTAAAATGACAAAATAAAATTGGGAAGAAGGTTG
ATTTTAACCCATCAAGCTCCAAACTTGGTGAATAGAAAATAGTATCTTGG
GGTCTCAATGTTAGTCTAGTGGTAGGAAATCTGAAAATATGATGGTTCAA
CGCCATGAAGAGGAGGCTTTGTAGAGCTTTGTTAGATTTTCGAAAACTTT
TTACAAAACGTTGTAAACACACACGTTTAAGCGTATTAATATATAGATTG
AATGATTGATTGATTATAAAAGTTTGATTATTCTCGCTTGCTTTATTTAT
CGAGAATGGCTGCTTTTCCGGTCCACGATGACCAGAACTTCTAAACCCAG
GGCTTTACTTGAGCAAATCTTCTCGCACTCTTTTGTAAAAATTTTTACAT
AATTTGTTTAATAGTAACTACTTTAGTGAATTAGTGAAATAAAGATTTAC
GAAACTACAGTACAGTCAACTCAATCGAATTCGAACTTCTATTATTCGAA
TCTTTTTATAATTCGAACTAATGTATTGGTCCCCTCAGCTGGAAAGTGGT
TTTGTACTCTCTGTAATTCGAATCTTTCTCTAATTCGAAGAACATATTCG
GTCCCATGAAGATCGAATTAGAGAGAGAGTCACCTGTATGTTTTCATCGC
TCTGGTGCATCGAAATGGTTGTAAAGTTGCCACCAAAGTATCATCACTTT
GCACAAGTTTTGTTTACCAACCTGTGATATTTTTTTTTCAAATGATATAT
AATTTATTTATCATCTCTCTCTATATATAGAAACTTCCAAAGTATGATCC
GTTTGGTTTGAAGAAAGGAAAACCCCTTGAACGATTCTACTTCGATATCA
GAGATGGTAAGGTCTTTGCGTTGGTGATATGCTATTGGTTAAAGTATGTT
TCGTTGTCCACCCTGAGAGTAAGTAAACAGGGAGCAGATAAAGATCAGAA
AACTACTTTGTGTAGGCTAATTCTTCATCAATTTAACTATCATATAACTT
ATGATATCATATTTTATGATCTGCCCCAAACTCTATTCACAAAATCAAAT
TATAACATGTAATAGAGAATTCAACATGTAATAAATGTTTCATACCTTGT
GTGGTGAAATCAATAGCTTCTTTTATATGACGTAACAAATTTGTGAGTAA
TTCATTTTGAATTTGACCCACAGCTTAAAAAAAATTGTCGAAATTTGTTT
AGTGAAATAAATCTATTTTGGACAGAAATCCCTGCAACAACACCGACTTA
CTAATTTCCAGTAACCCTTGTCAATCTTACTACATCATTCCTTGGGGGGG
GTGGTACTTAAACAAAAATGGGTGCTGGGTATGTGCGGACGGTAAGGGTC
GGTTTTTTCACCTTCCAAAGTCTCTCTAAGGATCGGAAAAATCAGAAAGT
TTTCTCTCGAAGGGTCAGGAAATTTTTTTGATTTCGAGAGAAAAATTGTA
AAAAAGTCTCTCCCTAAGGGTACCACTATTTTCAAAAATCGAAGAAAATT
TTTCAAAAAATCTCTCTAAGGGTCACCTTTTCGGCAAAAATCAGTCTCTC
TAAAGGTCGGTTTTCGGAGGTCTCGTCCGCACATTCCTCTCATCTGCCAA
CCCTAGTACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA
ATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCAGACCCCCCCCCCCCCCCCGGAACTTCAATACATAA
AATTATTATTGTGGACCTCAGACACTTTCGCTTCAAAATTTGTAACGGTC
TCTTGGGATTGGGAAAACATTAAATGCTCAGTTGTCGAAGCAGTTTAAAT
CGAAAAACGAGTTGATTTTAGGTATCTTGAGAAGAAGGTATTCTCGTACA
TTTCTTAGTTTCCCACGTTTGCTGGGACATCTCTTTCCAAATGAACAGGC
TCAATTTGCAATCCTCAGGACGTCAGAACGCATAAATAGTAGTGAGGTCA
TTGCCCTGACCAGACGATTGCTAAGCGCCTTCAAAAGCAACTAAAAACAT
ATGTATCAGAACCAGAGGTTAATCCAAGGCCATTCCGATAGAGGTTGCAT
TTTATTTAGTGAAAAAAGTGATTTTCTTTTTCACCACAGAATTGGTTATT
TATCAGTCTTCCCTATCTTTTTCTCTAGGAATTATTCTACCTGGCCAAAC
GATCAGTATTCCGGCGGTGTTTAAGTCTTCCAACGCTGGTATCTTCACTG
AACAATGGTGCTTGGAAACACATCCTACATTGTGTGCTGGACGACGCTTG
CTGGTCACCTTACACGGTGTTGCAACCCAACTGACCAATATGGACGAGCA
CAGAAGAATTCTAGAGGTAAGTTAGACAGGAGACCCGTCCTGTATTTTTA
TAATCTGATGTATACAGGACGGGTATGACCTGTGAGGCACAAATCTGCCT
CAAAATATTTACAGTGGGTAATTCGAATTTAGCGCTGTCCTCACTTACTA
AAATAAAAACCAAGTTTCGGAAGTTGCGCTTTCTCTAAGAATGTGTGAGT
CACACATTGGTCACTGACCAGCAAAAGAATAACAAAATTAGGATCTAGGA
AATTCAAACTGTCAGCCCATACCATGCTATATATTTCGTATATAAAATTA
GAAATCATAGCATGGATCTCCAGGCTAGAGGTAAGTGGGAACAACAATAG
TCGACTAATCTAAGGTGTCAGAGCCACAAAACAGGGATTCCTGGTTCGAA
TTCCTGCTACTAAAAGTTCTAAATTACTGAAAAGTTTCGATTACAAAGTA
AAATTCTGCGACCGCAGTCGGAGGCGACTCGGAGGCTCCTCTTTCGATAG
TTATCAACCCGAAGGTAGTGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGAATTGCT
CCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTTATTGCTGAGCATCAAGCCAAATCAA
GCAGAGAGGCATCAAGTACCAATTTGGGAATCTTTAGTATGGCCTGGCTG
GGGGTTGAACCCACAAACTTGCGCACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGC
ACTACGGTCGCTTTACACAATATATTTTACAGCGGGAGTTCTGCTAACCC
TACTTTTCATTCTTATTTGTGAGATTGCTAGGTTTAGCCACGTTCTTTTT
AATTTACACATTACGACATTTGAACCCGACTTGGATATCAAAGGTCGAAT
ACAATTCCCCTCCAATAGGAATTTGACCAACGCCTTTAGAGCTGTAGATT
TAAGGCGAGCGCCGTACCGCCACCGAAGTAAAAGATAGAGAAAGCTGCGA
TAGCGCTATTAAAAGAAAGAAAGCACCCCTGTTAGGTTATTTGCGTAAGG
AAAAGTTCTATAAAAAGATAAACTGTTATAAAATAAAATTTCGATTCAAT
CTTATGTAAGATTGTTGTTGAAGTTGTTGAAGAATGACGTCATTTTAAAA
ATGCTTCTAAAGTAATATCATAGTTGATTTATTATTCTGGAGACGACTTT
TAATTGCGGTTTTGCAAAAGAAAAACATTTCCAGACTTTTTTCAGAGAGC
TCTAGGTCAAAGTGATTTTGTGACTTAAATTCACGTGTTAGCATTACATA
ATATCGGATTACTAATACAAGGTTGTAAATTTTTTTCAAAAAAGTTTGAC
TAGGTCACAGAGAGATGTTTTTATAAGAAATTACAGATTCTTGAACATAG
AAATTGTGCATTGGGGCATGCACTTTAGACAAAGTATCGAAGCTTTTTAA
AGTAAATCGACAATAGTCACAATAGTGTGTGCTAAAAAGTTGTTTTACAT
GCGGCTCTTCGGAAAAGGGATTTTTTAATTTGAGGTCAAACTTCTTGAAT
ATGAGAACTCATTCGTGTTCTTATAACAAAAACTATAAAAAGAACAACAG
AGGGAGAAACCCTATTGGTAACTTTTAAGGTTACCATAGCAATACCATTT
CATTGACGATTGAGTTAAGCTTTCCTTCAATCTTAACTTGCATAAATTAC
ATTGTTGAATAGCTTTTTTCAAATTATGGAAGTTGGTTATGATTATCTCT
CTCTACTTTATTTCTCATATTTAGTTTCTTGTATTCTTTGCTCGAAGACA
CATTTAAAGAGCTTCATTCTTAACTCTGAATACGTGTCGAATGTGTCTGG
AGACAGGCTTGTTAAATTTTACGGATTTCCTATTAGAAACATTTTGAGAG
TCGTAGCTTATCGAAGTTTTGCGTTTAGTACTTTAGCTCTAGTTACTGTT
AGTATAATAGCATTCTATCAGTAATAACAGCAAGTTAGTTTTACTTTAGG
TGTACAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTCGCGATTTTCGCGAATTCCGGC
TCTTTTCGCGAACAGTAAATGTCTTTAAAAATTCTAGGAAGGGTCATTCG
CGAAAGTTTATGTCCGCGAAAAATTCTTGACAAAATAGAAAATCTGTTAA
ACTTCAAACTTTGATTAAAATGTAGCTTTTATGGCTTTTTTTAGCCTGCT
AAAAGACTAACTAGCTGGGCCAATATGTAAGTCAAAGGATAAATGTTTCA
AGCCAAACCTAGAACTATTTGTCCTTCTAAGCTATTTTTTCATGTGAAAA
TTCTCAATTTTACGTCTTGATTCGCGAAAGTTTATGCTCGCGAAAAATAT
CTTTCCGTTAAATTCGCAAAAGTAAATGTCGTGAATTTCGCGATTTTTCT
TCCTCGTGAAAGTTTCTGTTCGCGAAAGTTTGTACGCCTGAAGTAATTGA
AGATTTCTGGCATTTTTTATTAAGAACTCTAGTAGGTTTGTGTAAATAAA
ACTCTGGGGGGGGGCAGCTGGGCAAAAGGACCGACGGGTATGTGCGGGTC
CTAAGGGTACCTTTTCCAATATGTTTAAAAAAATGTCGGAAAAACTAAAG
ATGCACTGTAAGGGTAGAAATCTCAGAAAATTCTTGAAAAATCGAGATAT
TTTGCCCAAAAATGCTAGAATTTTGACCATTTTTTGCACGAAAGGGATCG
AAAATTTGGGGGAAAATGCACTCTAAGGGTATGATTTTCACTGATTTTTT
GCTGCACTGTAAGGGTGCAATTTTAAAAGCCAATTTTTGGCCCGCACATA
CCGTCAGTCTGCAAACCCAGTGCCCCCCGGGATAAAACTGAACTTTTTTA
TATTTGTCACAAATATTTATTTTAAAATAGAATATTGAAATATTAAACTA
CAGTTATTAAAACAAAGAAACTTTGATTTTCTCCATAATGTATCCATAAC
TTCATATAAACTTTTTTTTTTCAGGAGGAATATGTACGCCGCCAAAACAT
CCAGATGGCGGCCAGGATTGTCCAGGAGNCTTTTTTTCTTCAGGAGGAAT
ATGTACGCCGCCAAAACATCCAGATGGCGGCCAGGATTGTCCAGGAGATG
GTCAGGGGTGTAAGCACGCCACCGAGGAGCCCGTCTCCACCACCCCTATT
AACGGTAATGTTCAAAATCATTGTAATTTTAATCAGTTTTTGGAAATCCA
TGGCGAAAAACCTCTGTTATATTCACTTTTTGAACCAAATGCAACCGTAC
AGTGTTGAATATGGTAGAAGATCGACTGAAATCGTCAGCTCAAATCGTTG
ATTATTAAAAAATTCGTTGTATTGATGTCAAATCAAGCATTGTACATTCT
CGTACTCAGTATAGTATCGGCTTTTCACTGAAAGAAGGAATTTCAGCAAA
AGATTTGGGAATAACCCCGACCCTAGCGTTAGAAAATGATAGCTTTTGAT
GTTAAGCCCTCTATTCTCGAAATGCAAAATAGAAAAACTATTGTCTAGAC
TAGAATTTCACCAATTTTTACTCCTTAGGAAGAAGAAGAATTCAATGAGA
GAAATCTGAACGTAAGATATTTAAACTTTTGTAAAATTTTTACAATTGCA
TTTATTCATACTTGATTTTTGACTCAAATATTCCACGTCATGGCTTTCTA
TTTTGTCCCATATGAGACCACCCATAAAAAAGCACTCGAGATATTTTCAC
TGTTGATTGCCCTAAGATCTCTTCGAATTGTTGTGAATGTCAGTGCAATG
TGCAAAACAACAACATAGAGTTGTGGTGACTCGACAACATCCTCTCCTTC
CATTGTTGTGGTCTTGTACCTTTTTCACACAATCAACGAAACATGTGCAA
AGATTAACTGATTGTTTTCCTAACAAAAGCACCTTCAATGAACACGCTTA
CTAGTCTCGAATTTTTCCATATTTTTGAGGTTTTTTCTTCCGGTGCAGTG
ATTCCTGACTTTAGGTTAGAGCCTATTTTCACTAGTGAAGGGTCTTATCT
TGTCTGTTCTTCTAACCAATGATATATGCTACAAAGCTAACACGAGCCTT
TATTTCTAGAATACTTATACCCCTGCTTCTTACCCCTGTTTCCCATTTTA
GTTACATTACAACAAGTCGGCTGCTGAAGACATGAAGAAGTTCTTCGTTG
AACTCAATCCCCGTGAGAATTGGGATCTTTCCATCATGACCATGCTCAAA
GTATGTTTTTGTTTTTGACGTACCTTCCTCCCTACCCTCCTCATCTCTAT
TCTTTGACTGTGTTTTGCGTCTCACTTTGACGAAAGCTTAATAAGCCTCT
ATATGGTTTGAGGCCGGGTAACTCGGTAGAGCGTACACCTTTCAACCCAA
AAAGTTGTGGGTTTGATTCCCGGTCACCGTCAACTCGGCGAATGAGTAGT
TTGGATTGGGTAATCTGATATCTAGGTGGTGAGTTACTGGGATCTGAGAG
TAGGTGTAGCGCTCCACCTCAGCATTTGATCTCCCAGGGCTAGCGCAAAC
AGAAAAAGGAGATAGACTGCCTCACTTCCAGCTCTTCCGACAACCAATAT
TTCCTTACTTATATGGTTTGATTAGATCTTGTTTCTCCCGGCGACTTCAT
TCATTCATTCATTCATTCATTCATACATTCATTCTAAGAATATCGAGAAC
CTTGAGGAAGCGGATGTTATAAATGACGGCGAAGAAGAGAAGGATGTAGA
AGAGACAAAAGAAGAAGCACTAAACCGTTTAAACAAAGAGCTGGTTTCAT
TTAACCATCCTGTACGCAAACCTGCTCATCGAAATACCTATGATAAGTGG
TAAGCTCAACTATGAAGTTTAAACAATTCTGAAAGGGCTAGATAGGAATC
TTCAATCTTTCACAGACGTAAGAAAATTGTGAAGCTCTAAGATTAGCACC
ATAAAGCTTTTTTTAAGCTCGATGAGATCTACTCTACGAAGCGAGGGGAT
GTGCCGATAAGGCAAGTTTCGAAATAATGACTCGTGAGAGTAGAAAATAA
ATTTATCGTTATCGTATTCTGTTACCCTCAAAAAGCACAAATTTGGCGTA
AAAGCTATCAATTGCAAGAAACACTATTAGATCTATCAGGGTGCTAGCCT
TCTGCGATGACTCTCTTTTTCTCTTTCTTTGTATGCTCTTTAATTCTTCC
AACATTCACATTAAATTATATACTGCGTGAAGCATTTTGGAGTATTCTAG
ACTTTGTTATGGTCGAGAAGGAAAAGGAATGGGATTTATTCATTGTTCAA
TTTGACATTTTTATCTTACTAGCTATAAGGTGATCTGTGAAGCAGTCGAC
AGATTCGTGTTACAGACCATGACCTCAAGACACCAACTTGGAATGCCTGA
AAAAGAAATATACGTCAAACAAGAAAGTATGCTTTTAACCGAGTCACTTC
TTGAAGCAAACCAAAATGGATTCTTTTTTTTTTGAAGTTTTGGTCTGGAA
GTCTTCGAGTTAGTAGGGGAAGGAATTTGTAATAGTAATGATATGACATT
GAAATTGTGGGCAAATAATAAGGATCTCTCCTTGAAAGAGGTAAAAAAGA
AGGACATCTTAGCTTAATTTCGTGAAATTAGGGATTAATACCCCGACTTC
AAACTCTCAAGACTTGTTTTCATTTTTTCAGTACCCGTGCACAGAGGGAA
AAGCAGAAAAGTAGTGGATACACAGAAGAATACACGTAACGATGCCAAGA
GTCCAAACAAAAAGAAAGAGGACGCTGGAAAAGCCAGAACACCCAATGCT
AAAGAGAAAAAACAAGGTAAAGTGGGAGCAATTCTCCAGTGTATGATCTC
ATTTGATATCGGAAAATATTCTCTCTGTGGTTTGTTAAATTTTAAAAGTT
TCTATAAAGGTCGATTTTCGAACTATGATCTAGACATAATTCTCATCTCG
CAAACTTAATTCCCTCCTTCTCGATACTACACTTCTAAGCCTTGGAGAAT
TTCTTTTACACATTATTTATGAATGATTGTCTCATTTCAGCTGAGCCACT
TCTAATTGCCAAAGAAGAATCAGCAGTGATACAAGAAACTAAAGACAATA
CGGTGAAGATTGATATTTTCTTCTTAACTTTCTACATTGCCAGAGAAGCT
TCATTAACATGATATGTAAAATTGTTAGTAGGATAATGTTACTATCAAAC
AGCGGACTTTCGCTAATTCGATTTTCTATTATTCGAACTATTTCTCGGTT
CCTGTCAAGGGGAAACCCTCGTAAAATACTTTCTATAATTTGAACAAATT
AGACTCCCCGCTCGAGTCCGAATTAATTAAAACTGTAATTTGCCCATTTT
TAAGAATGCTTGTTTAAATTGTGTGAAGTAGATATCTGTTCTTTCAAAAA
TAAATTCAACCTCTGGATATTGTAGTATTGTCCTTTTCAGACGCTCTGTT
GAATTGTTATCAACCCGACAATTATTTCCTTTTGCTTCTCATCGGCTTTT
TCAATTACCATTTACACATGAAACAAGAATCTTTCAATTTTTGGTTTCTC
TCTCTCTCTTTATTATAGAACACAGCGGCATTTGTTGTTAATGAGACTCA
ACATGCTAATTATAATAAATATATGGACAAAATGTACAGCCAGGTAAGAT
CATTATATGTGAATGTGTCTGTTGACAAAACTGATAATGGGAGGACGTCC
AAATAAGAGGTTACTTCTCTGAACTGTTGTTCTCGTTCTCAATGAGGATA
AGATTTTAGATCCCAAGAAAATTTATTATTTTATATTTGGCCTTCATCTT
GTGAAGTTATGTAACAGAGAGACCACTATTAATTTCTGAGCATTAAAATA
ATGGCTTTTTTTGTTTACGTTCCACTTTATGCCTTCTTCTCTTTACCTTG
TTTTGTTTGTGAGAGATTTCTAAATATAAGCAACAGTTTAATAAAGTGTT
TACTCTCTGTTGCTATACTGTATTTATTAAGCCCAAACTACATTAGCAGC
TAGTTAGTGTTTTGTATGTTTTATTTGTTTGATGTTTGTTATCCAAGCTA
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TTCTTGTATGTTCTGAATGTTATCAATACTTATTGAATAAGGTTGCTGGT
TTGTTTTTTTTCAATTGTTAGGTGTACAGTTGTCTGCAGGACTTGGCAGA
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TTTTAACTATAGCTTATTTTTGTATATGGTTTGATTAATATATATTGGGT
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GCAATTTATATAAGGTTTGAATGATGTTTTTGTTATCTTTCTTTTATTAG
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TATTTTGATATGTTTGGTGTTATACTATCTAAATAAACCTTTACCGAATT
TATCGCCACAAGTGAGAGATTGGTTTAACAAGGGACAAATCTTCAAATAT
AATGATACTTTTGATATCTTTTATTATGATAGTGGAGTTAATACTGAAAA
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TCATCTGGCGTGACTTAGTTCCTGAGTTCAAAACTAAATTCTCTCGAGTT
GTTATCCCCGATTTAATGGGATTGGGTTTCAGTGATAAACCGATCGGATA
TCGGTACACAATGATGGAACAATCACGGATGCTGGTGCAATTGTTGACAC
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ATAGGTCAAGAATTGATACACCAAGTGAACCAGGGTTCACCAGAAATCAT
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CCATTATGCTACACAAAAACGGACATATTGCTATACCTGATATTTTCACA
TATCTCTTTGAGCGAAAAGCAAACGAGATGAGATGGTTAAGTGCTTTACA
AGAAACCAAAGTCCCAGTGCATTTAGTGTACGGGCCTGAAGACCCAGTTA
ATACACCTGATGGTTTTCTGAAAACATACAAAGAGTTGATACCGAATTCT
TCGGTCACCGTTTTAGATAATGTCGGACATTATCCTCAAGTGGAGGACCC
TGACGGTTTTATTGCATCCTATATGCGATTTTTAAAGAAAGTAAGGATGT
AAGAATTTAGGTGTTGTTTTTTTTATATTTTATATTATTTTAGCACCAGA
CAGTTTTAAGCCGATGCTAATGGGCAGATAATCAATCTTTTTTTTGTAAA
ATGAATCGAAATGTTTCGATTATCTGCTTTGTACATAATTTTAGATGGAC
GCATGAGTGGCGTAAGTAGGGTTTTTGTTTGAAATGTTTTTGAATCGAAG
TCCAAATGAAGGCATTCCTACCTTTATCATAGTTCGTATGAAAAAATATG
ATCTGGAAGTCTATCTGTCAAGAATATGTTCAAATAAGCCGATCATCGGT
TCTTTAGATGATATTATTTTGGATACTAGACCTTTTCATAAATTACTTTA
CGAACATCACTTGCTTCGTTTTGAAATTATTGATTAAATCCCAGCGGATT
TTATTAAAACAACTTCCTATTCATAAAAAAAATCAGTCTCTAGAGACATA
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GGCTTCTGAGATTTCCAAGATTCATTAAAGCGCATGTGTAAGAGCAGAGA
TTTTCACCACAGCCTGTATAACAGACTGTCGGCTCTTTAGACGATTTCAA
ACCAAACATTATCCCGATTCTTCATATCTTTTTCTTCGAAGTTGAAATTA
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GAAGAAAAAACGTTTGTTTTCCTTTAATCGCATTTTCTTGTTTTAATATA
GGCTTAGGATCCCATAAATTATCTATTCAAAAACCGATGGTCGCATAATT
TGAACAACATCGTAGACTGTCCTGACCCGTTCTTCCTTATTAAGATTTCA
TTATAAATATAGATCATTATAGATCGATCAGAGCTCTCCCTATACTTTCG
TCGAATTCTTCAATAGATTTTTTTTACGTTTTTACGAATCATGTTGTATA
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TCTGTCTAACACCCCCCTGACTAAAAGTAAAATGCTCCCCAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005912	XLOC_005912	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000107	supercontig	sc0000107:138740..162281 -

Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00010544 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: MEST (Mesoderm-specific transcript homolog protein OS=Homo sapiens GN=MEST PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 224.172 bits (570), Expect = 9.639e-64
Identity = 115/305 (37.70%), Postives = 186/305 (60.98%), Query Frame = 3

Query: 3450 PLPNLSPQVRDWFNKGQIFKYNDTFDIFYYDS-GVNTENKDGPILLVIHGFPANSFIWRDLVPEFKTKFSRVVIPDLMGLGFSDKPIGYRYTMMEQSRMLVQLLTQLNLTD--IHVVAHDYGVSIGQELIHQVNQG-SPEIMVKSICFLNGGLVPSRHNILFIQKLFS-SPTFKKIMPYLLTYPIYKNRLSSIFGPHTRPSDTQLEDIWAIMLHKNGHIAIPDIFTYLFERKANEMRWLSALQETKVPVHLVYGPEDPVNTPDGFLKTYKELIPNSSVTVLDN-VGHYPQVEDPDGFIASYMRFL 4346
            P P LSP +  W + G+ F Y     IFY DS GV    +   I++++HGFP +S+ W  +      +F RV+  D +G GFSDKP  + Y++ EQ+ ++  LL  L L +  I++++HDYG  + QEL+++  Q  S  + +KS+C  NGG+ P  H  L +QKL         I+  L+ + ++   L+ +FGP+TRPS+++L D+WA + + +G++ I  +  Y+ +RK    RW+ AL    +P+H +YGP DPVN    FL+ Y++ +P S+V++LD+ + HYPQ+EDP GF+ +YM F+
Sbjct:   32 PPPQLSPALHSWKSSGKFFTYKG-LRIFYQDSVGVVGSPE---IVVLLHGFPTSSYDWYKIWEGLTLRFHRVIALDFLGFGFSDKPRPHHYSIFEQASIVEALLRHLGLQNRRINLLSHDYGDIVAQELLYRYKQNRSGRLTIKSLCLSNGGIFPETHRPLLLQKLLKDGGVLSPILTRLMNFFVFSRGLTPVFGPYTRPSESELWDMWAGIRNNDGNLVIDSLLQYINQRKKFRRRWVGALASVTIPIHFIYGPLDPVNPYPEFLELYRKTLPRSTVSILDDHISHYPQLEDPMGFLNAYMGFI 332

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00010544 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00010544 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MEST	9.639e-64	37.70	Mesoderm-specific transcript homolog protein OS=Ho...	[more]

You are here

TCONS_00010544 (transcript) - C. hemisphaerica